BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G18790.1 Length=3996 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg480851 jgi|Araly1|480851|fgenesh2_kg.3__3552__AT2G18790.1 6078 0.0 > Ahg480851 jgi|Araly1|480851|fgenesh2_kg.3__3552__AT2G18790.1 Length=3848 Score = 6078 bits (3291), Expect = 0.0 Identities = 3598/3747 (96%), Gaps = 17/3747 (0%) Strand=Plus/Plus Query 225 CGGTGGCCGTGGCGGTGGCCGTGGCGGAGAAGAAGAACCGTCGTCAAGTCACACTCCTAA 284 ||||| | | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 114 CGGTGTCGGCGGTGGTGGCCGTGGCGGAGAAGCAGAACCGTCGTCAAGTCACACTACTAA 173 Query 285 TAACCGAAGAGGAGGAGAACAAGCTCAATCGTCGGGAACGAAATCTCTCAGACCAAGAAG 344 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | Sbjct 174 TAACCGAAGAGGAGGAGAACAAGCTCAATCTTCAGGAACAAAATCTCTCAGACC----A- 228 Query 345 CAACACTGAATCAATGAGCAAAGCAATTCAACAGTACACCGTCGACGCAAGACTCCACGC 404 | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 229 C--GA--GAATCAATGAGCAAAGCAATTCAACAGTACACCGTCGACGCAAGACTCCACGC 284 Query 405 CGTTTTCGAACAATCCGGCGAATCAGGGAAATCATTCGACTACTCACAATCACTCAAAAC 464 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 285 CGTTTTCGAACAATCCGGCGAATCAGGGAAATCATTCGACTACTCACAATCACTCAAAAC 344 Query 465 GACGACGTACGGTTCCTCTGTACCTGAGCAACAGATCACAGCTTATCTCTCTCGAATCCA 524 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 345 GACGACGTACGGTTCCTCTGTACCTGAGCAACAGATCACTGCTTATCTCTCTCGAATCCA 404 Query 525 GCGAGGTGGTTACATTCAGCCTTTCGGATGTATGATCGCCGTCGATGAATCCAGTTTCCG 584 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 405 GCGAGGTGGTTACATTCAGCCTTTCGGATGTATGATCGCCGTCGATGAATCAAGTTTTCG 464 Query 585 GATCATCGGTTACAGTGAAAACGCCAGAGAAATGTTAGGGATTATGCCTCAATCTGTTCC 644 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 465 AATCATCGGTTACAGCGAAAACGCCAGAGAAATGTTAGGGCTTATGCCTCAATCTGTTCC 524 Query 645 TACTCTTGAGAAACCTGAGATTCTAGCTATGGGAACTGATGTGAGATCTTTGTTCACTTC 704 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 525 TACTCTTGAGAAACCTGAGATTCTAGCTATGGGAACTGATGTGAGATCTTTGTTCACTTC 584 Query 705 TTCGAGCTCGATTCTACTCGAGCGTGCTTTCGTTGCTCGAGAGATTACCTTGTTAAATCC 764 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 585 TTCGAGCTCGATTTTACTCGAGCGTGCTTTCGTTGCTCGAGAGATTACCTTGTTGAATCC 644 Query 765 GGTTTGGATCCATTCCAAGAATACTGGTAAACCGTTTTACGCCATTCTTCATAGGATTGA 824 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 645 TGTTTGGATCCATTCCAAGAATACTGGTAAACCGTTTTACGCCATTCTTCATAGGATTGA 704 Query 825 TGTTGGTGTTGTTATTGATTTAGAGCCAGCTAGAACTGAAGATCCTGCGCTTTCTATTGC 884 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 705 TGTTGGTGTTGTTATTGATTTAGAGCCAGCTAGAACTGAAGATCCTGCGCTTTCTATTGC 764 Query 885 TGGTGCTGTTCAATCGCAGAAACTCGCGGTTCGTGCGATTTCTCAGTTACAGGCTCTTCC 944 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct 765 TGGTGCGGTTCAATCGCAGAAACTCGCGGTTCGTGCGATTTCGCAGTTACAGTCTCTTCC 824 Query 945 TGGTGGAGATATTAAGCTTTTGTGTGACACTGTCGTGGAAAGTGTGAGGGACTTGACTGG 1004 || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 825 CGGGGGTGATATTAAGCTTTTGTGTGATACTGTTGTGGAAAGTGTGAGGGACTTGACTGG 884 Query 1005 TTATGATCGTGTTATGGTTTATAAGTTTCATGAAGATGAGCATGGAGAAGTTGTAGCTGA 1064 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 885 GTATGATCGTGTTATGGTTTATAAGTTTCATGAAGATGAGCATGGAGAAGTTGTAGCTGA 944 Query 1065 GAGTAAACGAGATGATTTAGAGCCTTATATTGGACTGCATTATCCTGCTACTGATATTCC 1124 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 945 GAGTAAGCGAGATGATTTAGAGCCTTATATTGGACTGCATTATCCTGCTACTGATCTTCC 1004 Query 1125 TCAAGCGTCAAGGTTCTTGTTTAAGCAGAACCGTGTCCGAATGATAGTAGATTGCAATGC 1184 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1005 TCAAGCGTCACGGTTCTTGTTTAAGCAGAACCGTGTCCGAATGATAGTAGATTGCAATGC 1064 Query 1185 CACACCTGTTCTTGTGGTCCAGGACGATAGGCTAACTCAGTCTATGTGCTTGGTTGGTTC 1244 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1065 CACACCCGTTCTTGTGGTCCAGGACGATAGGCTAACTCAATCTATGTGCTTGGTTGGTTC 1124 Query 1245 TACTCTTAGGGCTCCTCATGGTTGTCACTCTCAGTATATGGCTAACATGGGATCTATTGC 1304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1125 TACTCTTAGGGCTCCTCATGGTTGTCACTCTCAGTATATGGCTAACATGGGATCTATTGC 1184 Query 1305 GTCTTTAGCAATGGCGGTTATAATCAATGGAAATGAAGATGATGGGAGCAATGTAGCTAG 1364 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1185 TTCTTTAGCTATGGCGGTTATAATAAATGGAAATGAAGAAGATGGGAGCAATGTAGCTAG 1244 Query 1365 TGGAAGAAGCTCGATGAGGCTTTGGGGTTTGGTTGTTTGCCATCACACTTCTTCTCGCTG 1424 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1245 TGGGAGAAGCTCGATGAGGCTTTGGGGTTTGGTCGTTTGCCATCACACTTCTTCTCGCTG 1304 Query 1425 CATACCGTTTCCGCTAAGGTATGCTTGTGAGTTTTTGATGCAGGCTTTCGGTTTACAGTT 1484 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1305 TATACCGTTTCCGCTAAGGTATGCTTGTGAGTTTTTGATGCAGGCTTTCGGTTTACAGTT 1364 Query 1485 AAACATGGAATTGCAGTTAGCTTTGCAAATGTCAGAGAAACGCGTTTTGAGAACGCAGAC 1544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1365 AAACATGGAATTGCAGTTAGCTTTGCAAATGTCAGAGAAACGCGTTTTGAGAACGCAGAC 1424 Query 1545 ACTGTTATGTGATATGCTTCTGCGTGACTCGCCTGCTGGAATTGTTACACAGAGTCCCAG 1604 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1425 GCTGTTATGCGATATGCTTCTGCGTGACTCGCCTGCTGGAATTGTTACACAGAGTCCTAG 1484 Query 1605 TATCATGGACTTAGTGAAATGTGACGGTGCAGCATTTCTTTACCACGGGAAGTATTACCC 1664 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1485 TATCATGGACTTAGTTAAATGTGACGGTGCAGCATTTCTTTACCACGGGAAGTATTACCC 1544 Query 1665 GTTGGGTGTTGCTCCTAGTGAAGTTCAGATAAAAGATGTTGTGGAGTGGTTGCTTGCGAA 1724 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1545 GTTGGGTGTTGCTCCTAGTGAAGTTCAGATAAAAGATGTTGTGGAGTGGTTGCTTGCGAA 1604 Query 1725 TCATGCGGATTCAACCGGATTAAGCACTGATAGTTTAGGCGATGCGGGGTATCCCGGTGC 1784 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1605 TCACGCGGATTCAACTGGATTAAGCACTGATAGCTTAGGCGATGCGGGGTATCCTGGTGC 1664 Query 1785 AGCTGCGTTAGGGGATGCTGTGTGCGGTATGGCAGTTGCATATATCACAAAAAGAGACTT 1844 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1665 AGCTGCGTTAGGGGATGCTGTGTGCGGTATGGCAGTTGCATATATCACAAAAAGAGACTT 1724 Query 1845 TCTTTTTTGGTTTCGATCTCACACTGCGAAAGAAATCAAATGGGGAGGCGCTAAGCATCA 1904 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1725 TCTTTTTTGGTTTCGATCTCACACTGCGAAAGAAATCAAATGGGGAGGCGCGAAGCATCA 1784 Query 1905 TCCGGAGGATAAAGATGATGGGCAACGAATGCATCCTCGTTCGTCCTTTCAGGCTTTTCT 1964 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1785 TCCCGAGGATAAAGATGATGGGCAACGAATGCATCCTCGTTTGTCCTTTCAGGCTTTTCT 1844 Query 1965 TGAAGTTGTTAAGAGCCGGAGTCAGCCATGGGAAACTGCGGAAATGGATGCGATTCACTC 2024 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1845 TGAAGTTGTTAAGAGCCGGAGTCAGCCATGGGAAACTGCGGAAATGGATGCGATACACTC 1904 Query 2025 GCTCCAGCTTATTCTGAGAGACTCTTTTAAAGAATCTGAGGCGGCTATGAACTCTAAAGT 2084 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1905 GCTCCAGCTTATTCTGAGAGACTCTTTTAAAGAATCTGAGGCGGCTATGAACTCTAAAGC 1964 Query 2085 TGTGGATGGTGTGGTTCAGCCATGTAGGGATATGGCGGGGGAACAGGGGATTGATGAGTT 2144 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct 1965 TGTGGATGGTGCGGTTCAGCCATGTAGGGATATGGCGGGAGAGCAGGGGATTGATGAGTT 2024 Query 2145 AGGTGCAGTTGCAAGAGAGATGGTTAGGCTCATTGAGACTGCAACTGTTCCTATATTCGC 2204 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2025 AGGTGCAGTTGCAAGAGAGATGGTTAGGCTCATTGAGACCGCAACTGTTCCTATATTCGC 2084 Query 2205 TGTGGATGCCGGAGGCTGCATCAATGGATGGAACGCTAAGATTGCAGAGTTGACAGGTCT 2264 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2085 TGTGGATGCCGGAGGCTGCATCAATGGATGGAACGCTAAGATTGCAGAGTTGACAGGTCT 2144 Query 2265 CTCAGTTGAAGAAGCTATGGGGAAGTCTCTGGTTTCTGATTTAATATACAAAGAGAATGA 2324 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| Sbjct 2145 CTCAGTTGAAGAAGCTATGGGAAAGTCTCTGGTTTCTGATCTGATATACAAAGAGAATGA 2204 Query 2325 AGCAACTGTCAATAAGCTTCTTTCTCGTGCTTTGAGAGGGGACGAGGAAAAGAATGTGGA 2384 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2205 AGAAACTGTCAATAAGCTTCTTTCTCGTGCTTTGAGAGGGGACGAGGAAAAGAATGTGGA 2264 Query 2385 GGTTAAGCTGAAAACTTTCAGCCCCGAACTACAAGGGAAAGCAGTTTTTGTGGTTGTGAA 2444 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct 2265 GGTTAAGCTGAAAACTTTCAGCCCCGAACTTCAAGGGAACGCGGTTTTTGTGGTTGTGAA 2324 Query 2445 TGCTTGTTCCAGCAAGGACTACTTGAACAACATTGTCGGCGTTTGTTTTGTTGGACAAGA 2504 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || Sbjct 2325 TGCTTGTTCCAGCAAAGACTACTTGAACAACATTGTCGGCGTCTGCTTTGTTGGACAGGA 2384 Query 2505 CGTTACTAGTCAGAAAATCGTAATGGATAAGTTCATCAACATACAAGGAGATTACAAGGC 2564 ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2385 CGTTACTGGTCAGAAGATAGTAATGGATAAGTTCATCAACATACAAGGAGATTACAAGGC 2444 Query 2565 TATTGTACATAGCCCAAACCCTCTAATCCCGCCAATTTTTGCTGCTGACGAGAACACGTG 2624 |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2445 TATTGTCCATAGCCCAAACCCGCTAATCCCGCCAATTTTTGCTGCTGATGAGAACACGTG 2504 Query 2625 CTGCCTGGAATGGAACATGGCGATGGAAAAGCTTACGGGTTGGTCTCGCAGTGAAGTGAT 2684 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2505 CTGCCTGGAATGGAACATGGCGATGGAAAAGCTTACGGGTTGGTCTCGTAGTGAAGTGAT 2564 Query 2685 TGGGAAAATGATTGTCGGGGAAGTGTTTGGGAGCTGTTGCATGCTAAAGGGTCCTGATGC 2744 |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2565 TGGGAAAATGCTTGTCGGGGAAGTGTTTGGTAGCTGTTGCATGCTAAAGGGTCCTGATGC 2624 Query 2745 TTTAACCAAGTTCATGATTGTATTGCATAATGCGATTGGTGGCCAAGATACGGATAAGTT 2804 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2625 TTTAACCAAGTTCATGATTGTATTGCATAATGCGATTGGTGGCCAAGAGACGGATAAGTT 2684 Query 2805 CCCTTTCCCATTCTTTGACCGCAATGGGAAGTTTGTTCAGGCTCTATTGACTGCAAACAA 2864 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2685 CCCTTTTCCGTTCTTTGACCGCAATGGGAAGTTTGTTCAGGCTCTATTGACTGCAAACAA 2744 Query 2865 GCGGGTTAGCCTCGAGGGAAAGGTTATTGGGGCTTTCTGTTTCTTGCAAATCCCGAGCCC 2924 |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || Sbjct 2745 GCGGGTCAGCCTCGACGGAAAGGTTATTGGGGCATTCTGTTTCTTGCAGATCCCGAGTCC 2804 Query 2925 TGAGCTGCAGCAAGCTTTAGCAGTCCAACGGAGGCAGGACACAGAGTGTTTCACGAAGGC 2984 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2805 TGAGCTGCAGCAAGCTTTAGCAGTCCAACGGAGGCAGGACACAGAGTGTTTCACGAAGGC 2864 Query 2985 AAAAGAGTTGGCTTATATTTGTCAGGTGATAAAGAATCCTTTGAGCGGTATGCGTTTCGC 3044 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2865 AAAAGAGTTAGCTTATATTTGTCAGGTGATAAAGAATCCTTTGAGCGGTATGCGTTTCTC 2924 Query 3045 AAACTCATTGTTGGAGGCCACAGACTTGAACGAGGACCAGAAGCAGTTACTTGAAACAAG 3104 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2925 AAACTCACTGTTGGAGGCCACAGACTTGAACGAGGACCAGAAGCAGTTACTTGAAACAAG 2984 Query 3105 TGTTTCTTGCGAGAAACAGATCTCAAGGATCGTCGGGGACATGGATCTTGAAAGCATTGA 3164 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2985 TGTTTCTTGCGAGAAACAGATCTCAAGGATTGTCGGTGACATGGATCTTGAAAGCATTGA 3044 Query 3165 AGACGGTTCATTTGTGCTAAAGAGGGAAGAGTTTTTCCTTGGAAGTGTCATAAACGCGAT 3224 ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3045 AGACGGTTCGTTTGAGCTAAAGAGGGCGGAGTTTTTCCTCGGAAGTGTCATAAACGCGAT 3104 Query 3225 TGTAAGTCAAGCGATGTTCTTATTAAGGGACAGAGGTCTTCAGCTGATCCGTGACATTCC 3284 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3105 TGTAAGCCAAGCGATGTTCTTATTAAGGGACAGAGGTCTTCAGCTGATCCGTGACATTCC 3164 Query 3285 CGAAGAGATCAAATCAATAGAGGTTTTTGGAGACCAGATAAGGATTCAACAGCTCCTGGC 3344 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3165 CGAAGAGATCAAATCAATAGTTGTTTTTGGAGACCAGATAAGGATTCAACAGCTCCTGGC 3224 Query 3345 TGAGTTTCTGCTGAGTATAATCCGGTATGCACCATCTCAAGAGTGGGTGGAGATCCATTT 3404 |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3225 TGAGTTTCTGCTGACTATAATTCGGTATGCTCCATCTCAAGAGTGGGTGGAGATCCATTT 3284 Query 3405 AAGCCAACTTTCAAAGCAAATGGCTGATGGATTCGCCGCCATCCGCACAGAATTCAGAAT 3464 ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3285 AAGCCAAGTTTCAAAACAAGCGGCTGATGGATTCACCGCTATCCGCACAGAATTCAGAAT 3344 Query 3465 GGCGTGTCCAGGTGAAGGTCTGCCTCCAGAGCTAGTCCGAGACATGTTCCATAGCAGCAG 3524 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3345 GGCGTGTCCAGGTGAAGGTCTGCCTCCAGAGCTAGTCCGAGACATGTTCCATAGTAGCAG 3404 Query 3525 GTGGACAAGCCCTGAAGGTTTAGGTCTAAGCGTATGTCGAAAGATTTTAAAGCTAATGAA 3584 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct 3405 GTGGACAAGCCCTGAAGGATTAGGTCTAAGCGTATGTCGAAAGATTCTAAAGCTCATGAA 3464 Query 3585 CGGTGAGGTTCAATACATCCGAGAATCAGAACGGTCCTATTTCCTCATCATTCTGGAACT 3644 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3465 CGGTGAGGTTCAATACATCCGAGAATCAGAACGGTCTTATTTCCTCATCATTCTCGAACT 3524 Query 3645 CCCTGTACCTCGAAAGCGACCATTGTCAACTGCTAGTGGAAGTGGTGACATGATGCTGAT 3704 |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| Sbjct 3525 ACCTGTACCTCGAAAACGCCCATTGTCAACCGCTAGTGGCAGCAGTGACATGATGTTGAT 3584 Query 3705 GATGCCATATTAGTCA-CACTT-CAGTTGGTATGAGAGTTTGTATCATTGTATGAGTGTT 3762 |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct 3585 GATGCCATATTAGTCAACATTTTCAGTTGGTATGAGAGTTTGTATCATTGTACGTGTGTT 3644 Query 3763 TGTGTGTCTAACGACGTCGGAGGAGGATAGAAAGttttttttttGTTTCCGGTGAGATTA 3822 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3645 TGTGTGTCTAACGACGTCTGAGGAGGATAGAAAGTTTTTTA---GTTTCCGGTGAGATTA 3701 Query 3823 GTAGAGAAGAGGGAGATTATTTGCGTTCAGCTCAGCTCGCCGGaaaaaaaaCGTAACAGT 3882 |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3702 GTAGAGAAGAGGGAGATTGTTTGCGTTCAGCTCAGGTCGCCGGGAAAAAAACGTAACAGT 3761 Query 3883 AGTTGTAGAGAATTTCAAGACTT-TT--GTTTGTGCTGTGTAAATTGACAACTCCGAGAG 3939 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3762 AGTTGTAGAGAATTTCAAGACTTCTTTTGTTTGTGCTGTGTAAATTGATAACTCCGAGAG 3821 Query 3940 AAACAAAACAATGAGATAAGAAGAGAG 3966 |||||||| ||||||| |||||||||| Sbjct 3822 AAACAAAAGAATGAGAAAAGAAGAGAG 3848 Score = 108 bits (58), Expect = 4e-22 Identities = 93/109 (85%), Gaps = 6/109 (6%) Strand=Plus/Plus Query 13 TTATTGGTTTCTCCACTTATCTCCGATCTCAATTCTCCCCATTTTCTTCTTCCTCAAGTT 72 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | || || || ||| || Sbjct 1 TTATTGGTTTCTCCACTTATCTCCGATCCCAATTTTCTTC-TTC-CTAAA-CC-CAAATT 56 Query 73 CAAAAT-TCTTGAGAATTTAGCTCTACCAGAATTCGTCTCCGATAACTA 120 |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 57 CAAA-TCTCTTGAGAATTTAGCTCTACCGGAATTCGTCTCCGATAACTA 104 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 151050507237 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5