BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G26080.1 Length=3504 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg481465 jgi|Araly1|481465|fgenesh2_kg.4__525__AT2G26080.1 5090 0.0 Ahg491390 jgi|Araly1|491390|fgenesh2_kg.7__823__AT4G33010.1 3145 0.0 > Ahg481465 jgi|Araly1|481465|fgenesh2_kg.4__525__AT2G26080.1 Length=3453 Score = 5090 bits (2756), Expect = 0.0 Identities = 3081/3239 (95%), Gaps = 18/3239 (1%) Strand=Plus/Plus Query 5 CTCTCTCAGATTTGCATTTGtttttttttGGTTTGGTTATGGAGCGTGCAAGGAGACTTG 64 |||||||||||||||| | |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 CTCTCTCAGATTTGCA--T-TTTTTTCTT-CTTT-GTTATGGAGCGTGCAAGGAGACTTG 55 Query 65 CTTACAGAGGGATCGTGAAACGTCTCGTCAACGAGACAAAACGCCACCGTAACGGCGAAT 124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 56 CTTACAGAGGGATCGTGAAACGTCTCGTCAACGAGACAAAACGCCACCGTAACGGCCAAT 115 Query 125 CCTC-TCTTCTTCCGACGACGACTGTTACTCCCTCAAGGTATGTCTCCTCCGTCTCCTCC 183 |||| || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 116 CCTCTTC-TCTCCCGGCGACGACGGTTACTCCCTCAAGGTATGTCTCCTCCGTCTCCTCC 174 Query 184 TTTCTCCATCGCCGTCGTGATGTCTCTGGATCGGCTTTTACCACCTCCGGTAGAAATCAA 243 |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 175 TTTCTCCATCACCGTCGTGATGTCTCTGGATCGACTTTCACCACCTCCGGTAGAAATCAA 234 Query 244 CACCAGACACGATCGATCTCCGTCGATGCGTTGAAGCCAAGCGACACTTTCCCGCGCCGG 303 || | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 235 CA--A-ACACGATCAATCTCCGTCGATGCGTTAAAGCCAAGCGACACTTTCCCGCGCCGT 291 Query 304 CACAACTCAGCAACACCGGATGAACAAGCTCAGATGGCGAATTACTGCGGATTCGATAAT 363 |||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 292 CACAACTCTGCTACACCGGAGGAACAAACACAGATGGCGAATTACTGCGGATTCGATCAT 351 Query 364 CTCAACACGTTGATTGATTCGACTGTTCCGAAATCGATTCGGTTAGATTCGATGAAGTTT 423 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 352 CTCAACACGTTGATTGATTCAACTGTTCCGAAATCGATTCGGTTAGATTCGATGAAGTTC 411 Query 424 TCCGGGATATTTGATGAAGGATTAACGGAGAGTCAAATGATTGAGCATATGAGTGATTTA 483 || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 412 TCTGGGAAATTTGATGAAGGATTAACAGAGAGTCAGATGATTGAGCATATGAGTGATTTA 471 Query 484 GCTTCGAAGAACAAAGTTTTCAAATCGTTCATTGGTATGGGATACTATAACACTCATGTT 543 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 472 GCTTCGAAGAACAAAGTTTTCAAATCATTCATTGGTATGGGATACTATAACACTCATGTT 531 Query 544 CCTCCTGTGATTTTGCGTAATATAATGGAGAATCCTGCTTGGTATACTCAATATACTCCT 603 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 532 CCTCCTGTGATTTTGCGTAATATTATGGAGAATCCTGCTTGGTATACTCAATATACTCCT 591 Query 604 TATCAAGCTGAGATTTCTCAAGGAAGACTCGAATCTCTGCTCAATTACCAGACGGTTATT 663 |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 592 TATCAAGCTGAGATTTCTCAAGGAAGGCTTGAATCTTTGCTCAATTACCAGACGGTTATT 651 Query 664 ACTGATCTCACCGGTCTACCGATGTCGAACGCTTCGTTGCTCGATGAAGGTACGGCGGCG 723 |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 652 ACTGATCTTACCGGTTTACCGATGTCGAACGCTTCGTTGCTCGATGAAGGTACGGCGGCT 711 Query 724 GCGGAAGCAATGGCGATGTGTAATAATATTC-TAAAGGGGAAGAAGAAGACGTTTGTTAT 782 |||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 712 GCGGAAGCGATGGCTATGTGTAATAATA-TCTTAAAGGGGAAGAAGAAGACGTTTGTTAT 770 Query 783 TGCTAGTAATTGTCATCCTCAGACTATTGATGTTTGCAAGACGAGAGCGGATGGTTTCGA 842 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 771 TGCTAGTAATTGTCATCCTCAGACGATTGATGTTTGCAAGACTAGAGCGGATGGTTTCGA 830 Query 843 TTTGAAAGTTGTGACGGTTGATATTAAGGATGTGGATTATAGCTCTGGTGATGTGTGTGG 902 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 831 TTTGAAAGTTGTGACGGTTGATCTTAAGGATGTGGATTATAGCTCGGGGGATGTGTGTGG 890 Query 903 AGTGTTGGTTCAGTATCCGGGGACTGAAGGGGAGGTGTTGGATTATGGTGAGTTTGTTAA 962 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 891 AGTGTTGGTTCAGTATCCGGGGACTGAAGGTGAAGTGTTGGATTATGGTGAGTTTGTTAA 950 Query 963 GAATGCTCATGCTAATGGTGTTAAGGTTGTTATGGCTACGGATTTGTTGGCTTTGACGAT 1022 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 951 GAATGCTCATGCTAATGGTGTTAAGGTTGTGATGGCTACGGATTTGTTGGCTTTGACAAT 1010 Query 1023 GTTGAAACCGCCGGGTGAGTTTGGGGCGGATATTGTTGTTGGGTCGGGTCAGAGGTTTGG 1082 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1011 GTTGAAACCGCCGGGGGAGTTTGGGGCTGATATTGTCGTTGGGTCGGGTCAGAGGTTTGG 1070 Query 1083 TGTTCCGATGGGTTATGGTGGTCCTCATGCTGCTTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAA 1142 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1071 TGTTCCCATGGGTTATGGTGGTCCTCATGCTGCTTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAA 1130 Query 1143 GAGAATGATGCCTGGGAGGATTATTGGTGTTAGTGTTGATTCTTCCGGGAAGCAAGCTTT 1202 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1131 GAGAATGATGCCTGGGAGAATTATTGGTGTTAGTGTTGATTCTTCCGGGAAGCAAGCTTT 1190 Query 1203 GCGTATGGCTATGCAGACTAGGGAACAGCATATCCGCAGGGATAAAGCTACCAGCAACAT 1262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1191 GCGTATGGCTATGCAGACTAGGGAACAGCATATCCGTAGGGATAAAGCTACCAGCAACAT 1250 Query 1263 CTGTACCGCTCAGGCCTTGCTTGCAAATATGACTGCTATGTATGCTGTTTACCATGGACC 1322 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| Sbjct 1251 CTGTACCGCTCAGGCATTGCTTGCAAACATGACTGCCATGTATGCTGTCTATCATGGACC 1310 Query 1323 AGAAGGCTTAAAATCTATTGCACAACGGGTTCATGGTCTCGCTGGTGTATTTGCCTTAGG 1382 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| Sbjct 1311 AGAAGGCTTAAAATCTATTGCACAACGGGTTCATGGTCTAGCTGGTGTATTTACTTTAGG 1370 Query 1383 ATTGAAGAAACTGGGAACTGCACAAGTCCAAGATCTTCCCTTCTTTGACACTGTCAAAGT 1442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1371 ATTGAAGAAACTGGGAACTGCACAAGTCCAAGATCTTCCCTTCTTTGACACTGTCAAAGT 1430 Query 1443 TACATG-TTCAGATGCAAC-TGCAATTTTTGATGTGGCAGCCAAGAAGGAGATCAATTTG 1500 ||| | ||| ||||| || ||||||| |||||| ||| ||||| || |||||||||||| Sbjct 1431 TAC-GGTTTCGGATGC-ACATGCAATTGTTGATGCGGCTGCCAAAAAAGAGATCAATTTG 1488 Query 1501 CGTCTTGTGGACTCCAACACTATTACTGTTGC-TTTCGATGAAACAACCACCTTGGATGA 1559 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1489 CGTCTTGTGGACTCCAACACTATTACTGTTGCGTTT-GATGAAACAACCACCTTGGATGA 1547 Query 1560 TGTCGATAAACTTTTTGAAGTTTTTGCTTCGGGCAAGCCCGTTCAATTCACGGCTGAGTC 1619 |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1548 TGTCGACAAACTTTTTGAAGTTTTTGCTTCCGGCAGGCCGGTTCAATTCACGGCTGAGTC 1607 Query 1620 TCTTGCACCGGAGTTTAACAATGCTATTCCCTCTAGCCTAACAAGAGAGAGCCCTTATCT 1679 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct 1608 TCTCGCACCGGAGTTTAACAATGCTATTCCTTCTAGCTTAACAAGACAGAGCCCTTATCT 1667 Query 1680 GACCCATCCAATCTTCAACATGTACCACACGGAGCATGAGTTGCTTAGGTACATCCACAA 1739 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1668 GACCCACCCAATCTTCAACATGTACCACACGGAGCATGAGTTACTTAGGTACATCCACAA 1727 Query 1740 GTTACAAAATAAAGATCTATCATTGTGCCACAGCATGATTCCACTTGGATCTTGTACGAT 1799 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || Sbjct 1728 GTTACAAAATAAAGATCTATCATTGTGCCACAGCATGATTCCACTAGGATCATGTACAAT 1787 Query 1800 GAAATTGAATGCCACCACTGAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACCAACATGCA 1859 ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1788 GAAATTGAATGCCACGACCGAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACCAACATGCA 1847 Query 1860 CCCTTTTGCTCCTGTTGAACAAGCCCAAGGTTATCAGGAAATGTTTACGAATTTGGGTGA 1919 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct 1848 CCCTTTTGCTCCTGTAGAACAAGCCCAAGGTTATCAGGAAATGTTTACAAACTTGGGTGA 1907 Query 1920 GCTCTTATGTACGATCACTGGATTCGACTCTTTCTCATTGCAACCTAATGCCGGTGCTGC 1979 |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1908 GCTCTTGTGTACTATCACTGGGTTCGACTCTTTCTCATTGCAACCTAATGCCGGTGCTGC 1967 Query 1980 TGGCGAGTACGCCGGGCTCATGGTTATCCGTGCATATCATATGTCAAGAGGCGATCATCA 2039 ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1968 TGGCGAGTATGCCGGGCTCATGGTTATTCGTGCATATCATATGTCAAGAGGAGATCATCA 2027 Query 2040 CAGAAATGTGTGCATCATACCTGTTTCTGCACACGGGACAAACCCTGCTAGTGCTGCCAT 2099 | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2028 CCGAAATGTATGCATCATACCTGTTTCTGCACACGGGACAAACCCTGCTAGTGCTGCTAT 2087 Query 2100 GTGCGGAATGAAAATTGTTGCCGTTGGAACTGATGCCAAAGGAAACATTAACATCGAAGA 2159 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2088 GTGCGGAATGAAAATTGTTGCCGTTGGAACTGATGCCAAGGGAAACATTAACATCGAAGA 2147 Query 2160 GTTGAGGAACGCCGCCGAAGCCAACAAGGACAACTTGGCTGCTCTTATGGTTACATACCC 2219 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2148 GTTGAGGAAAGCCGCCGAAGCCAACAAGGACAACTTGGCTGCTCTTATGGTTACATACCC 2207 Query 2220 TTCCACCCATGGAGTCTACGAAGAGGGTATCGACGAGATCTGCAACATAATTCATGAAAA 2279 || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2208 GTCAACCCATGGAGTTTATGAAGAGGGTATCGATGAGATTTGCAACATAATTCATGAAAA 2267 Query 2280 TGGAGGCCAAGTTTATATGGATGGTGCTAATATGAATGCACAGGTGGGTTTGACAAGCCC 2339 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2268 TGGAGGCCAAGTTTATATGGACGGTGCTAATATGAATGCACAGGTGGGGTTGACAAGCCC 2327 Query 2340 TGGTTTTATTGGAGCGGATGTTTGCCATCTCAATCTCCACAAGACCTTCTGTATCCCTCA 2399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2328 TGGTTTTATTGGAGCGGATGTTTGCCATCTCAATCTCCACAAAACCTTCTGTATCCCTCA 2387 Query 2400 CGGAGGTGGAGGTCCCGGAATGGGCCCTATCGGTGTGAAGCAACATTTGGCTCCATTCCT 2459 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2388 CGGAGGTGGAGGTCCCGGTATGGGCCCTATCGGTGTGAAGCAACATTTGGCTCCATTCCT 2447 Query 2460 ACCTTCTCACCCAGTGATACCTACCGGTGGTATCCCTGAACCCGAGCAGACATCACCGCT 2519 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2448 ACCTTCTCACCCTGTGATACCTACCGGTGGTATCCCTGAACCCGAGCAGACATCACCGTT 2507 Query 2520 GGGAACCATTTCTGCAGCACCATGGGGGTCTGCGCTTATCTTGCCAATCTCGTATACTTA 2579 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || Sbjct 2508 GGGAACCATTTCTGCAGCACCATGGGGGTCTGCGCTAATCTTGCCCATCTCTTATACATA 2567 Query 2580 CATTGCCATGATGGGATCTGGAGGACTCACCGATGCCTCAAAGATTGCAATTTTGAACGC 2639 ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 2568 CATTGCCATGATGGGATCTGGGGGACTCACAGACGCCTCAAAGATCGCAATTTTGAATGC 2627 Query 2640 TAACTACATGGCAAAGCGTCTGGAGAGCCACTACCCAGTTCTTTTCCGTGGTGTCAATGG 2699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2628 TAACTACATGGCAAAGCGTCTGGAGAGCCACTACCCAGTTCTATTCCGTGGTGTCAATGG 2687 Query 2700 AACAGTCGCTCACGAATTCATCATTGACTTGAGAGGATTCAAGAACACTGCTGGAATTGA 2759 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2688 AACAGTCGCTCACGAATTCATCATTGACTTGAGAGGATTCAAGAACACTGCTGGAATTGA 2747 Query 2760 ACCAGAGGATGTGGCCAAACGATTGATGGATTATGGTTTCCATGGACCGACAATGTCTTG 2819 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2748 ACCAGAGGATGTGGCCAAACGGCTGATGGATTATGGGTTCCATGGACCGACAATGTCTTG 2807 Query 2820 GCCTGTCCCTGGAACGCTTATGATCGAGCCAACCGAAAGCGAAAGCAAGGCTGAGTTAGA 2879 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2808 GCCTGTCCCTGGAACACTTATGATCGAGCCAACCGAAAGCGAAAGCAAGGCTGAGTTAGA 2867 Query 2880 TAGGTTCTGTGATGCTCTCATCTCGATCAGGGAAGAGATTTCACAGATTGAGAAAGGAAA 2939 ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2868 TAGGTTCTGTGATGCTCTCATCTCGATCAGGGACGAAATTTCCCAGATTGAGAAAGGAAA 2927 Query 2940 CGCAGATCCAAACAACAACGTTCTGAAGGGTGCTCCACATCCTCCGTCATTGCTAATGGC 2999 ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 2928 CGCAGATCCTAACAACAACGTTCTCAAGGGAGCTCCACATCCTCCTTCATTGCTGATGGC 2987 Query 3000 AGATACATGGAAAAAGCCGTATTCACGGGAATACGCAGCCTTCCCCGCTCCATGGCTCCG 3059 ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2988 AGACACATGGAAAAAGCCGTATTCCCGTGAATACGCAGCCTTCCCCGCTCCATGGCTCCG 3047 Query 3060 CTCCTCCAAGTTCTGGCCCACTACAGGGCGAGTGGACAACGTGTATGGAGACCGTAATCT 3119 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3048 CTCCTCCAAGTTCTGGCCCACTACAGGGCGCGTGGACAACGTGTATGGAGACCGTAATCT 3107 Query 3120 GGTGTGCACTCTCCAACCGGCGAACGAAGAACAGGCTGCAGCTGCAGTGTCTGCTTAAAT 3179 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3108 GGTGTGTACTCTCCAACCGGCGAACGAAGAACAGGCTGCAGCCGCAGTGTCTGCTTAAAT 3167 Query 3180 GAAGCCACTATGAAGCGATTCGCACTCGCACCAAAACCCACAATGGGGCGATTCGGACT 3238 |||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| Sbjct 3168 TAAGCCACTATAAAGCGATTTGCACTCGCACCAGAAGCCACAATGAAGCGATTCGGACT 3226 Score = 327 bits (177), Expect = 2e-88 Identities = 212/229 (93%), Gaps = 1/229 (0%) Strand=Plus/Plus Query 3272 TTTACTTCTCTTCCCAGCCTCATCATCACTTTCACTTTCACTTCCTGTACAATGTACATA 3331 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3226 TTTACTTCTCTTCCCAGTCTCATCATCACTTTCACTTTCATTTCCTGTACAATGTACATA 3285 Query 3332 CGTAGTCCTAAGTTCTTCCCTCATTTATTTAATAAAATACATTTCTTTATGTTCCACTTT 3391 |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||| Sbjct 3286 CGTAGTCCTAAGTTCT-CCCTCATTTATCTAATAATTTACATTTCTATATATTCCACTTT 3344 Query 3392 CTTATACGTATAACATTCCATTTGGATGATGTGATCACCATCGTGGTTATATTTATGCCA 3451 ||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3345 CTTTTACTTTTAACATTCGATTCGGATGATGTGATCACCATCGTGGTTATATTTATGACA 3404 Query 3452 TATGATCTCTTTGAAAAAAGTTTGAATTCTTAGGATATTTATTGTTTCA 3500 |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3405 TATGGTCTCTTTGGAAAAAGTTTGAATTCTTAGGATATTTGTTGTTTCA 3453 > Ahg491390 jgi|Araly1|491390|fgenesh2_kg.7__823__AT4G33010.1 Length=3427 Score = 3145 bits (1703), Expect = 0.0 Identities = 2695/3168 (85%), Gaps = 91/3168 (3%) Strand=Plus/Plus Query 43 ATGGAGCGTGCAAGGAGACTTGCTTACAGAGGGATCGTGAAACGTCTCGTCAACGAGACA 102 |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||| Sbjct 144 ATGGAGCGCGCAAGGAGACTTGCTTACAGAGGAATCGTCAGACGTCTCGTTAACGACACA 203 Query 103 AAACGCCACCGTAACGGC-G-AA-TCCTC-TCTTCTTCCGACGACGACTGTTACTCCCTC 158 ||||| ||||||||| || | || |||| ||| || | | | || | |||| | Sbjct 204 AAACGACACCGTAAC-GCTGAAACACCTCACCTTGTT-C--C-TC-AC-G---CTCCGGC 253 Query 159 AAGGTATGTCTCCTC-CGTCTCCTCC-TTTCTCCATCG--CCGTCGTGATGTCTC-TGGA 213 |||||||||||||| | | ||| || ||||| | ||| || || || || | | | Sbjct 254 GAGGTATGTCTCCTCTC-TTTCC-CCTTTTCT-C-TCGACCCATC--GA--TC-CGTCAA 304 Query 214 T-CGGCTTTTACCACCTCCGGTAGAAATCAACACCAGACACGATCGATCTCCGTCGATGC 272 | | || | | | | | || | || || || || || ||||||||||||||||| Sbjct 305 TCCCGC---GGCGGCTTTC-G-AG-AGGCACCAGCAAACGCGTTCGATCTCCGTCGATGC 358 Query 273 GT-TGAAGCCAAGCGACACTTTCCCGCGCCGGCACAACTCAGCAACACCGGATGAACAAG 331 | | || || |||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| || |||||| Sbjct 359 -TCTTAAACCCGGCGATACTTTCCCGCGTCGTCATAACTCTGCAACACCAGAAGAACAAT 417 Query 332 CTCAGATGGC-GAATTACTGCGGATTCGATAATCTC-A-ACACGTTGATTGATTCGACTG 388 | || ||||| |||| ||| || || || || || | ||| | || ||| | || | Sbjct 418 CCCACATGGCTAAATT-CTGTGGCTTTGACCATATCGATTCAC--TCATCGATGCTACGG 474 Query 389 TTCCGAAATCGATTCGGTTAGATTCGATGAAGTTTTCCGGGATATTTGATGAAGGATTAA 448 | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| || | ||| |||| Sbjct 475 TGCCCAAATCGATTCGATTAGATTCGATGAAGTTCTCC---AAATTCGACGGAGGCTTAA 531 Query 449 CGGAGAGTCAAATGATTGAGCATATGAG-TGATTTAGCTTCGAAGAACAAAGTTTTCAAA 507 | ||||| || |||||||| || ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct 532 CCGAGAGCCAGATGATTGACCACATG-GTTGATTTAGCTTCCAAGAACAAGGTTTTCAAA 590 Query 508 TCGTTCATTGGTATGGGATACTATAACACTCATGTTCCTCCTGTGATTTTGCGTAATATA 567 || || || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||| | |||||||| Sbjct 591 TCCTTTATCGGGATGGGTTACTACAACACGCATGTCCCTACTGTCATTCTCCGTAATATC 650 Query 568 ATGGAGAATCCTGCTTGGTATACTCAATATACTCCTTATCAAGCTGAGATTTCTCAAGGA 627 ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 651 ATGGAGAATCCAGCTTGGTACACTCAATACACTCCTTATCAAGCTGAGATCTCTCAGGGT 710 Query 628 AGACTCGAATCTCTGCTCAATTACCAGACGGTTATTACTGATCTCACCGGTCTACCGATG 687 | |||||||| |||||||||| ||||||||| || || |||||||| || || || ||| Sbjct 711 CGTCTCGAATCGCTGCTCAATTTCCAGACGGTGATCACCGATCTCACGGGGCTTCCTATG 770 Query 688 TCGAACGCTTCG-TTGCTCGATGAAGGTACGGCGGCGGCGGAAGCAATGGCGATGTGTAA 746 ||||| || ||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| Sbjct 771 TCGAATGCGTCGCTT-CTGGATGAAGGGACCGCTGCTGCGGAGGCAATGGCCATGTGTAA 829 Query 747 TAATATTCTAAAGGGGAAGAAGAAGACGTTTGTTATTGCTAGTAATTGTCATCCTCAGAC 806 || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 830 CAACATTCTTAAGGGTAAAAAGAAGACCTTTGTGATTGCTAGTAACTGTCACCCTCAGAC 889 Query 807 TATTGATGTTTGCAAGACGAGAGCGGAT-GGTTTCGATTTGAAAGTTGTGACGGTTGATA 865 |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||| || | |||| Sbjct 890 TATTGATGTTTGTAAGACTAGAGCTGATGGGTTT-GATTTGAAAGTTGTTACCGCTGATC 948 Query 866 TTAAGGATGTGGATTATAGCTCTGGTGATGTGTGTGGAG-TGTTGGTTCAGTATCCGGGG 924 |||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| | | || ||||||||||| || Sbjct 949 TTAAGGATATAGATTACAGCTCTGGTGATGTTTGTGGGGTTCTT-GTTCAGTATCCTGGT 1007 Query 925 ACTGAAGGGGAGGTGTTGGATTATGGTGAGTTTGTTAAGAATGCTCATGCTAATGGTGTT 984 |||||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1008 ACTGAAGGTGAAGTCTTGGATTATGCTGAGTTTGTCAAGAATGCTCATGCTAATGGTGTT 1067 Query 985 AAGGTTGTTATGGCTACGGATTTGTTGGCTTTGACGATGTTGAAACCGCC-GGGTGAGTT 1043 |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| || || Sbjct 1068 AAGGTTGTTATGGCTACGGATTTGCTGGCTTTGACCATGTTGAAACCCCCTGGG-GAATT 1126 Query 1044 TGGGGCGGATATTGTTGTTGGGTCGGGTCAGAGGTTTGGTGTTCCGATGGGTTATGGTGG 1103 ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 1127 TGGGGCGGATATTGTTGTTGGTTCAGCTCAAAGGTTTGGTGTTCCCATGGGTTATGGAGG 1186 Query 1104 TCCTCATGCTGCTTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAAGAGAATGATGCCTGGGAGGAT 1163 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1187 CCCTCATGCTGCGTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAAGAGAATGATGCCTGGGAGGAT 1246 Query 1164 TATTGGTGTTAGTGTTGATTCTTCCGGGAAGCAAGCTTTGCGTATGGCTATGCAGACTAG 1223 ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1247 TATTGGTATTAGTGTTGATTCTTCAGGAAAGCAAGCTCTGCGTATGGCTATGCAGACTAG 1306 Query 1224 GGAACAGCATATCCGCAGGGATAAAGCTACCAGCAACATCTGTACCGCTCAGGCCTTGCT 1283 ||| |||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| Sbjct 1307 GGAGCAGCATATTAGGAGGGACAAAGCCACTAGCAACATCTGTACTGCTCAAGCGTTGCT 1366 Query 1284 TGCAAATATGACTGCTATGTATGCTGTTTACCATGGACCAGAAGG-CTTAAAATCTATTG 1342 ||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| Sbjct 1367 TGCCAACATGGCTGCCATGTATGCTGTTTACCATGGACCTGCAGGTCT-AAAATCTATTG 1425 Query 1343 CACAACGGGTTCATGGTCTCGCTGGTGTATTTGCCTTAGGATTGAAGAAACT-GGGAACT 1401 | || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| || ||||| || ||| | Sbjct 1426 CCCAGCGTGTTCATGGTCTTGCTGGCATATTTTCCTTAGGGTTAAAGAAGCTTGGGGTC- 1484 Query 1402 GCACAAGTCCAAGATCTTCCCTTCTTTGACACTGTCAAAGTTACA-TGTTCAGATGCA-A 1459 ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| |||||| | Sbjct 1485 GCAGAAGTCCAAGAACTTCCCTTCTTTGACACTGTAAAAATTA-AGTGTTCGGATGCACA 1543 Query 1460 CTGCAATTTTTGATGTGGCAGCCAAGAAG-GAGATCAATTTGCGTCTTGTGGACTCCAAC 1518 ||||||| ||||| || |||| ||| || || ||| ||||| |||||||||| ||| Sbjct 1544 -TGCAATTGCTGATGCAGCTTCCAA-AAGTGAAATTAATCTGCGTGTTGTGGACTC-AAC 1600 Query 1519 -ACTATTACTG-TTGCTTTCGATGAAACAACCACCTTGGATGATGTCGATAAACTTTTTG 1576 |||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1601 CACTATTACTGCTTCCTTT-GACGAAACAACCACCTTGGATGATGTCGACAAACTTTTCA 1659 Query 1577 AAGTTTTTGCTTCGGGCAAGCCCGTTCAATTCACGGCTGAGTCTCTTGCACCGGAGTTTA 1636 ||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||| || Sbjct 1660 AAGTTTTTGCTTCTGGCAAGCCTGTTCCATTTACGGCTGAATCTCTAGCACCCGAGGTTC 1719 Query 1637 ACAATGCTATTCCCTCTAGCCTAACAAGAGAGAGCCCTTATCTGACCCATCCAATCTTCA 1696 | ||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| Sbjct 1720 AGAATTCCATTCCTTCTAGCCTAACAAGAGAGAGTCCTTATCTTACCCACCCAATCTTCA 1779 Query 1697 ACATGTACCACACGGAGCATGAGTTGCTTAGGTACATCCACAAGTTACAAAATAAAGATC 1756 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct 1780 ACATGTACCACACAGAGCATGAGTTGCTTAGGTACATCCACAAGTTACAGTCTAAGGATC 1839 Query 1757 TATCATTGTGCCACAGCATGATTCCACTTGG-ATCTTGTACGATGAAATTGAATGCCACC 1815 ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||| || Sbjct 1840 TATCACTGTGCCACAGCATGATTCCA-TTGGGATCTTGTACGATGAAACTAAATGCGACA 1898 Query 1816 ACTGAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACCAACATGCACCCTTTTGCTCCTGTT 1875 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| Sbjct 1899 ACTGAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACCGACATTCACCCATTTGCTCCTGTT 1958 Query 1876 GAACAAGCCCAAGGTTATCAGGAAATGTTTACGAA--TTTGGGTGAGCTCTTATGTACGA 1933 |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| | Sbjct 1959 GAACAAGCACAAGGTTATCAGGAAATGTT--CGAAAATTTGGGTGACCTCTTGTGTACAA 2016 Query 1934 TCACTGGATTCGACTCTTTCTCATTGCAACCTAATGCCGGTGCTGCTGGCGAGTACGCCG 1993 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | Sbjct 2017 TCACTGGGTTTGACTCTTTCTCATTGCAACCTAATGCTGGTGCTGCTGGTGAGTATGCTG 2076 Query 1994 GGCTCATGGTTATCCGTGCATATCATATGTCAAGAGGCGATCATCACAGAAATGTGTGCA 2053 |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | Sbjct 2077 GGCTTATGGTTATCCGCGCATATCACATGTCAAGAGGAGATCATCACCGAAATGTGTGTA 2136 Query 2054 TCATACCTGTTTCTGCACACGGGACAAACCCTGCTAGTGCTGCCATGTGCGGAATGAAAA 2113 |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| Sbjct 2137 TCATACCTGTCTCTGCACATGGGACAAACCCTGCAAGTGCTGCTATGTGCGGTATGAAAA 2196 Query 2114 TTGTTGCCGTTGGAACTGATGCCAAAGGAAACATTAACATCGAAGAGTTGAGGAACGCCG 2173 || || | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||| || || | Sbjct 2197 TTATTACGGTTGGAACTGATGCTAAGGGAAACATCAACATCGAGGAGGTGAGAAAAGCTG 2256 Query 2174 CCGAAGCCAACAAGGACAACTTGGCTGCTCTTATGGTTACATACCCTTCCACCCATGGAG 2233 | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 2257 CAGAAGCCAACAAAGACAACTTAGCCGCTCTTATGGTTACATACCCTTCAACTCATGGAG 2316 Query 2234 TCTACGAAGAGGGTATCGACGAGATCTGCAACATAATTCATGAAAATGGAGGCCAAGTTT 2293 |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | Sbjct 2317 TCTATGAAGAGGGTATCGACGAGATTTGCAACATAATACATGAAAATGGAGGTCAAGTGT 2376 Query 2294 ATATGGATGGTGCTAATATGAATGCACAGGTGGGTTTGACAAGCCCTGGTTTTATTGGAG 2353 | ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2377 ACATGGATGGTGCGAACATGAATGCACAGGTTGGCTTGACGAGCCCTGGTTTTATTGGAG 2436 Query 2354 CGGATGTTTGCCATCTCAATCTCCACAAGACCTTCTGTATCCCTCACGGAGGTGGAGGTC 2413 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| Sbjct 2437 CGGATGTGTGCCATCTCAATCTCCACAAGACCTTCTGTATTCCTCATGGAGGTGGTGGTC 2496 Query 2414 CCGGAATGGG-CCCTATCGGTGTGAAGCAA-CATTTGGCTCCATTCCTACCTTCTCACCC 2471 | || ||||| ||| || ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| Sbjct 2497 CTGGTATGGGTCCC-ATTGGTGTGAAG-AATCATTTGGCACCATTTCTTCCTTCTCACCC 2554 Query 2472 AGTGATACCTACCGGTGGTATCCCTG-AACCCGAGCAGACATCACCGCTGGGAACCATTT 2530 ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||| | || | || | Sbjct 2555 CGTGATACCTACTGGTGGAATCCC-GCAACCCGAGAAGACAGCACCGTTAGGTGCAATAT 2613 Query 2531 CTGCAGCACCATGGGGGTCTGCGCTTATCTTGCCAATCTCGTATACTTACATTGCCATGA 2590 | || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 2614 CCGCTGCACCATGGGGATCTGCGCTTATCTTACCAATATCTTATACTTACATTGCCATGA 2673 Query 2591 TGGGATCTGGAGGACTCACCGATGCCTCAAAGATTGCAATTTTGAACGCTAACTACATGG 2650 |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| Sbjct 2674 TGGGATCTGGTGGACTCACTGATGCCTCTAAGATTGCAATTTTGAATGCCAATTACATGG 2733 Query 2651 CAAAGCGTCTGGAGAGCCACTACCCAGTTCTTTTCCGTGGTGTCAATGGAACAGTCGCTC 2710 ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | Sbjct 2734 CAAAGCGCCTAGAGAAACACTACCCAGTTCTTTTCCGTGGTGTTAATGGAACAGTAGCAC 2793 Query 2711 ACGAATTCATCATTGACTTGAGAGGATTCAAGAACACTGCTGGAATTGAACCAGAGGATG 2770 ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2794 ACGAATTCATCATAGACTTAAGAGGCTTCAAGAGCACTGCTGGAATAGAACCAGAGGATG 2853 Query 2771 TGGCCAAACGATTGATGGATTATGGTTTCCATGGACCGACAATGTCTTGGCCTGTCCCTG 2830 |||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2854 TGGCGAAACGGCTAATGGACTATGGATTCCATGGACCCACAATGTCTTGGCCTGTCCCTG 2913 Query 2831 GAACGCTTATGATCGAGCCAACCGAAAGCGAAAGCAAGGCTGAGTTAGATAGGTTCTGTG 2890 |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||| | Sbjct 2914 GAACTCTTATGATTGAGCCAACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAGCTAGACAGGTTCTGCG 2973 Query 2891 ATGCTCTCATCTCGATCAGGGAAGAGATTTCACAGATTGAGAAAGGAAACGCAGAT--CC 2948 |||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| || Sbjct 2974 ATGCTCTCATTTCAATCAGGGAAGAAATTGCACAGATTGAAAAAGGAAATGCAGATGTCC 3033 Query 2949 AAACAACAACGTTCTGAAGGGTGCTCCACATCCTCCGTCATTGCTAATGGCAGATACATG 3008 | | | |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| Sbjct 3034 AGA-A-CAACGTCCTTAAGGGAGCTCCACATCCTCCATCGTTGCTAATGGCAGACACATG 3091 Query 3009 GAAAAAGCCGTATTCACGGGAATACGCAGCCTTCCCCGCTCCATGGCTCCGCTC-CTCCA 3067 ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| || || |||||||| | ||| | Sbjct 3092 GAAAAAGCCGTATTCTCGAGAGTACGCTGCTTTCCCTGCCCCGTGGCTCCG-TAACTCAA 3150 Query 3068 AGTTCTGGCCCACTACAGGGCGAGTGGACAACGTGTATGGAGACCGTAATCTGGTGTGCA 3127 ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| | || |||||||||| Sbjct 3151 AGTTCTGGCCCACCACAGGGCGTGTGGACAATGTATATGGAGACAGGAAACTGGTGTGCA 3210 Query 3128 CTCTCCAACCGGCGAACGAAGAACAGGCTGCAGCTGCAGTGTCTGCTT 3175 |||||| || | | |||||||| | |||||||||||| ||||||| Sbjct 3211 CTCTCCTCCCAGAG---GAAGAACAAGTTGCAGCTGCAGTATCTGCTT 3255 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 132326181321 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5