BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G26910.1 Length=4575 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg481566 jgi|Araly1|481566|fgenesh2_kg.4__626__AT2G26910.1 7236 0.0 > Ahg481566 jgi|Araly1|481566|fgenesh2_kg.4__626__AT2G26910.1 Length=4567 Score = 7236 bits (3918), Expect = 0.0 Identities = 4374/4591 (95%), Gaps = 43/4591 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTGGAACTCGGCGGAGAACGCATTCTCGCGTTCGACGTCGTTTAAAGACGAAATCGAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGTGGAACTCGGCGGAGAACGCATTCTCGCGTTCGACGTCGTTTAAAGACGAAATCGAA 60 Query 61 GACGAAGAAGAGCTTCGTTGGGCAGCTTTACAACGTCTTCCAACTTATTCACGAATCCGC 120 ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GACGAAGAAGAGCTTCGTTGGGCGGCGTTACAACGTCTTCCAACTTATTCACGAATCCGC 120 Query 121 CGCGGGATTTTCAGAGATATGGTTGGTGAGCCTAAAGAGATCCAAATTGGTAACCTAGAA 180 || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 121 CGTGGTATTTTCAGAGATATGGTTGGTGAGCCTAAAGAGATCCAAATTGGTAACCTTGAA 180 Query 181 GCTAGCGAACAACGTCTTCTTCTCGACCGTCTTGTGAATTCCGTTGAAAATGATCCTGAA 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || Sbjct 181 GCTAGCGAACAACGTCTTCTTCTCGACCGTCTTGTGAATTCCGTCGAAAATGATCCTCAA 240 Query 241 CAGTTCTTCGCTCGTGTTAGGAAGAGATTCGACGCTGTGGATTTGAAATTTCCGAAGATT 300 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct 241 CAGTTCTTCGCTCGCGTTAGGAAGAGATTCGACGCTGTGGATTTGAAGTTTCCGAAAATC 300 Query 301 GAAGTTCGATTTCAGAATCTGATGGTAGAATCATTTGTTCATGTTGGAAGCAGAGCATTA 360 |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GAAGTTCGATTTCAGAATCTTATGGTGGAATCATTTGTTCATGTTGGAAGCAGAGCATTA 360 Query 361 CCAACAATTCCCAATTTCATCATTAACATGGCAGAAGGTTTGTTGAGGAACATTCATGTG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CCAACAATTCCCAATTTCATCATTAACATGGCAGAAGGTTTGTTGAGGAACATTCATGTG 420 Query 421 ATTGGTGGAAAAAGGAA-CAAATTAACGATTTTAGATGGTATCAGTGGTGTTATTAGACC 479 ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 421 ATTGGTGGAAAAA-GAAGCAAATTAACGATTTTAGATGGTATCAGTGGAATTATTAGACC 479 Query 480 TTCAAGATTGACACTACTACTAGGTCCTCCAAGTTCAGGGAAGACAACATTACTCTTAGC 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 TTCAAGATTGACACTACTACTAGGTCCTCCAAGTTCAGGGAAGACAACATTACTCTTAGC 539 Query 540 TTTAGCTGGACGTCTTGGAACTAATCTTCAGACATCAGGGAAAATAACGTACAATGGCTA 599 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || Sbjct 540 TTTAGCTGGACGCCTTGGAACTAATCTTCAGACATCTGGGAAAATAACATACAATGGTTA 599 Query 600 CGATCTCAAAGAGATAATCGCGCCAAGGACGTCCGCATATGTGAGCCAACAGGATTGGCA 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 CGATCTCAAAGAGATAATCGCGCCAAGGACGTCCGCGTATGTGAGCCAACAGGATTGGCA 659 Query 660 TGTGGCGGAGATGACAGTGAGGCAGACTCTTGAGTTTGCTGGTCGTTGTCAAGGTGTTGG 719 |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 TGTGGCGGAGATGACAGTTCGGCAGACTCTCGAGTTTGCTGGTCGTTGTCAAGGTGTTGG 719 Query 720 ATTCAAATATGATATGCTTTTGGAGTTAGCAAGAAGGGAAAAGCTTGCAGGAATTGTACC 779 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 720 ATTCAAATATGATATGCTTTTGGAGTTAGCAAGAAGGGAAAAGCTTGCAGGAATAGTACC 779 Query 780 TGATGAAGATCTTGATATATTTATGAAGTCTTTAGCTCTCGGGGGA-ATGGAGACAAGCC 838 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| Sbjct 780 TGATGAAGATCTTGATATATTTATGAAGTCTTTAGCTCTCGGAGGACA-GGAGACAAGCC 838 Query 839 TCGTCGTGGAGTATGTTATGAAGATTCTAGGATTGGACACATGTGCGGACACATTGGTTG 898 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | Sbjct 839 TCGTCGTGGAGTATGTTATGAAGATTCTAGGGTTGGACTCATGCGCGGACACATTGGTCG 898 Query 899 GAGATGAGATGATTAAAGGAATTTCAGGGGGACAGAAGAAACGGCTAACAACAGGGGAAC 958 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct 899 GAGATGAGATGATTAAAGGAATTTCAGGGGGACAGAAGAAACGACTCACAACAGGGGAAC 958 Query 959 TATTAGTTGGTCCAGCAAGAGTCCTTTTCATGGATGAAATATCAAATGGTTTAGATAGTT 1018 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 959 TATTAGTTGGTCCAGCAAGGGTCCTTTTCATGGATGAAATATCGAATGGTTTAGATAGTT 1018 Query 1019 CGACGACTCATCAGATTATAATGTATATGAGGCATTCTACTCATGCGCTCGAAGGAACCA 1078 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1019 CGACGACTCATCAGATTATCATGTATATGAGGCATTCTACTCATGCACTCGAAGGAACCA 1078 Query 1079 CCGTCATTTCTTTACTCCAACCGTCTCCCGAGACTTACGAGTTGTTTGATGATGTTATCC 1138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1079 CCGTCATTTCTTTACTCCAACCGTCTCCCGAGACTTACGAGTTGTTTGATGATGTTATCC 1138 Query 1139 TTATGTCTGAGGGACAGATTATATACCAGGGACCTCGTGACGAGGTTCTTGATTTCTTTT 1198 | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1139 TAATGTCTGAAGGACAGATTATATACCAGGGACCTCGCGACGAGGTTCTTGATTTCTTTT 1198 Query 1199 CTTCGTTGGGATTTACTTGCCCTGATAGAAAAAATGTTGCAGATTTCTTGCAAGAGGTCA 1258 | || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1199 CATCATTGGGATTTAGTTGCCCTGAGAGAAAAAATGTTGCAGATTTCTTGCAAGAGGTCA 1258 Query 1259 CCTCAAAGAAAGATCAGCAGCAGTACTGGTCAGTCCCTTTCCGGCCTTATCGCTATGTAC 1318 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1259 CTTCAAAGAAGGATCAGCAGCAGTACTGGTCAGTCCCTTTCCGGCCTTATCGATATGTAC 1318 Query 1319 CTCCTGGAAAATTTGCTGAAGCTTTCCGTTCATATCCAACTGGTAAGAAGTTGGCaaaaa 1378 | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1319 CGCCTGGAAAGTTTGCTGAAGCTTTTCGTTCATATCCAACTGGTAAGAAGTTGGCAAAGA 1378 Query 1379 aaCTTGAGGTTCCATTTGATAAACGGTTCAATCATTCAGCCGCGTTATCGACATCCCAAT 1438 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 1379 AACTTGAGGTTCCATTTGATAAACGGTTCAATCATTCAGCTGCGTTATCGACATCTCAAT 1438 Query 1439 ATGGTGTTAAGAAGAGTGAACTTCTCAAGATCAACTTTGCCTGGCAGAAGCAACTGATGA 1498 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1439 ACGGTGTTAAGAAGAGTGAACTTCTCAAGATCAACTTTTCCTGGCAGAAGCAACTGATGA 1498 Query 1499 AGCAAAATGCATTTATTTATGTGTTCAAGTTTGTTCAGCTTCTTTTAGTTGCTTTGATCA 1558 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1499 AGCAAAATGCATTTATTTATGTGTTCAAGTTCGTTCAGCTTCTTTTAGTTGCCTTGATCA 1558 Query 1559 CGATGACTGTCTTTTGCCGAACAACAATGCATCACAACACTATTGATGATGGCAACATAT 1618 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1559 CGATGACAGTCTTTTGCCGGACAACAATGCATCACAACACTATTGATGATGGCAACATAT 1618 Query 1619 ATCTTGGGTCACTTTACTTTTCCATGGTCATCATTCTCTTTAACGGATTCACCGAGGTTC 1678 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1619 ATCTTGGGTCACTTTACTTTTCCATGGTTATCATTCTCTTTAACGGATTCACCGAGGTTC 1678 Query 1679 CAATGCTAGTAGCCAAACTTCCCGTTCTTTATAAGCACAGAGACTTGCATTTTTACCCAA 1738 |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1679 CAATGCTAGTAGCCAAGCTTCCCGTCCTTTATAAGCATAGAGACTTGCATTTTTACCCAA 1738 Query 1739 GCTGGGCTTATACATTACCTTCCTGGCTTTTGAGTATCCCTACTTCAATAATAGAATCTG 1798 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1739 GCTGGGCTTATACATTACCTTCCTGGCTTTTGAGTATCCCTACTTCAATAATTGAATCTG 1798 Query 1799 CCACATGGGTGGCAGTAACATATTATACAATTGGATATGATCCTTTGTTCTCAAGGTTTC 1858 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1799 CGACATGGGTGGCAGTAACATATTATACAATTGGATATGATCCTTTGTTCTCAAGGTTTC 1858 Query 1859 TTCAGCAGTTCTTGCTGTATTTCTCTCTGCATCAGATGTCGTTGGGTCTTTTCCGCGTAA 1918 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct 1859 TTCAGCAGTTCCTGCTGTATTTCTCTCTGCATCAGATGTCGTTGGGTCTTTTCCGTGTGA 1918 Query 1919 TGGGTTCTTTAGGCCGACATATGATAGTTGCCAATACGTTTGGGTCCTTTGCAATGCTTG 1978 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1919 TGGGTTCTTTAGGCCGGCATATGATAGTTGCCAATACGTTTGGGTCCTTTGCAATGCTGG 1978 Query 1979 TGGTCATGACTCTTGGAGGATTTATAATTTCCAGAGATAGCATACCAAGCTGGTGGATAT 2038 ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct 1979 TGGTCATGATTCTTGGAGGCTTTATAATTTCCAGAGAAAGCATACCAAGCTGGTGGATCT 2038 Query 2039 GGGGTTACTGGATTTCTCCATTGATGTATGCTCAAAACGCAGCTTCTGTGAATGAGTTCC 2098 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2039 GGGGTTACTGGATTTCTCCTTTGATGTATGCTCAAAATGCAGCTTCTGTGAATGAGTTCC 2098 Query 2099 TTGGTCATAATTGGCAAAAGACTGCTGGGAATCACACTAGCGACTCTCTTGGTTTGGCAT 2158 |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| Sbjct 2099 TTGGCCATAATTGGCAAAAGAGTGCTGGGAATCACACAAGCGACTCTATTGGTTTGGCAT 2158 Query 2159 TGCTGAAAGAAAGAAGTTTGTTCTCTGGGAACTACTGGTATTGGATCGGTGTCGCTGCCT 2218 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2159 TGCTGAAAGAAAGAAGTTTGTTCTCTGGGAACTACTGGTATTGGATCGGTGTCGCTGCCT 2218 Query 2219 TGCTTGGATACACAGTTCTTTTTAATATACTATTTACGCTGTTTTTAGCTCACCTCAACC 2278 |||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2219 TGCTTGGATACACAGTTCTTTTCAATTTGCTCTTTACGCTGTTTTTAGCTCACCTCAACC 2278 Query 2279 CATGGGGTAAGTTTCAAGCCGTTGTATCCagagaagagttagacgagagagaaaagaaaa 2338 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2279 CTTGGGGTAAGTTTCAAGCTGTTGTATCCAGAGAAGAGTTGGACGAGAGAGAAAAGAAAA 2338 Query 2339 gaaaagGCGATGAGTTTGTTGTGGAACTAAGAGAGTACTTGCAGCATTCAGGCTCAATAC 2398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2339 GAAAAGGCGATGAGTTTGTTGTGGAACTAAGAGAGTACTTGCAGCATTCAGGCTCAATAC 2398 Query 2399 ATGGAAAATATTTCAAGAATCGAGGCATGGTTCTCCCATTTCAACCACTATCTCTGTCTT 2458 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 2399 ATGGAAAATATTTCAAGAATCGAGGCATGGTTCTTCCGTTTCAACCACTATCTCTGTCTT 2458 Query 2459 TCAGCAATATCAACTACTATGTGGATGTTCCTTTGGGACTAAAAGAACAAGGGATACTAG 2518 || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2459 TCTGCAATATCAACTACTATGTGGATGTTCCATTGGGACTAAAAGAACAAGGGATACTAG 2518 Query 2519 AAGATAGGTTGCAGCTACTTGTGAATATTACTGGAGCTTTTAGACCTGGTGTGCTTACAG 2578 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2519 AAGATAGGTTGCAGCTACTTGTGAATATTACTGGAGCTTTTAGACCAGGTGTGCTTACAG 2578 Query 2579 CATTAGTGGGAGTAAGTGGTGCCGGTAAAACAACGCTCATGGATGTTTTAGCTGGAAGAA 2638 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2579 CATTAGTAGGAGTAAGTGGTGCCGGTAAAACAACGCTCATGGATGTTTTAGCTGGAAGAA 2638 Query 2639 AAACCGGAGGAACTATAGAAGGCGATGTGTACATATCTGGTTTTCCTAAAAGACAGGAAA 2698 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct 2639 AAACCGGAGGAACTATAGAAGGCGATGTGTACATATCTGGTTTTCCCAAAAGGCAGGAAA 2698 Query 2699 CGTTTGCAAGAATTTCTGGTTATTGTGAGCAGAATGATGTTCACTCTCCATGCCTAACTG 2758 ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2699 CGTTTGCTAGAATTTCAGGTTATTGTGAGCAGAACGATGTTCATTCTCCATGCCTAACTG 2758 Query 2759 TTGTTGAATCTCTACTTTTCTCGGCGTGCCTTCGTTTACCAGCAGACATTGACTCAGAGA 2818 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2759 TTGTTGAATCTCTACTTTTCTCGGCGTGCCTTCGTTTACCAGCAGACATTGACTCAGAGA 2818 Query 2819 CACAAAGGGCGTTTGTTCATGAGGTGATGGAGCTAGTGGAGCTGACCTCTTTAAGCGGGG 2878 |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 2819 CACAAAGGGCATTTGTCCATGAGGTGATGGAGCTAGTGGAGCTGACCTCATTGAGCGGGG 2878 Query 2879 CATTAGTCGGTCTTCCTGGAGTTGATGGCTTATCAACTGAACAGAGGAAACGGTTAACAA 2938 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct 2879 CATTGGTCGGTCTTCCTGGAGTTGATGGCTTATCAACTGAACAGAGGAAAAGATTAACAA 2938 Query 2939 TTGCTGTCGAGCTAGTTGCAAACCCTTCTATAGTATTCATGGATGAGCCAACTTCAGGAT 2998 |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2939 TTGCCGTTGAGCTAGTTGCAAACCCTTCTATAGTATTCATGGATGAGCCAACTTCAGGAT 2998 Query 2999 TGGATGCACGGGCGGCCGCCATTGTGATGAGGACTGTAAGAAATATTGTTAACACAGGGC 3058 |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2999 TGGATGCACGTGCTGCCGCCATTGTGATGAGGACTGTAAGAAATATTGTTAACACCGGGC 3058 Query 3059 GAACCATTGTCTGCACGATTCATCAGCCTAGCATTGATATTTTTGAGTCATTTGACGAGC 3118 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3059 GAACCATCGTCTGCACGATTCATCAGCCTAGCATTGATATTTTTGAGTCATTTGACGAGC 3118 Query 3119 TTTTGTTCATGAAACGTGGTGGAGAACTCATATATGCCGGTCCACTTGGCCAGAAGTCTT 3178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | Sbjct 3119 TTTTGTTCATGAAACGTGGTGGAGAACTCATATATGCCGGTCCACTCGGTCAGAAATCAT 3178 Query 3179 GTGAGCTTATCAAGTATTTCGAGTCAATTGAAGGGGTGCAAAAGATCAAACCTGGCCATA 3238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3179 GTGAGCTTATCAAGTATTTCGAGTCAATTGAAGGGGTGCAAAAGATCAGACCTGGCCATA 3238 Query 3239 ATCCGGCAGCATGGATGCTTGATGTCACTGCTTCTACCGAGGAACACCGGCTTGGAGTTG 3298 |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3239 ATCCGGCAGCATGGATGCTTGACGTCACTTCTTCGACCGAGGAACACCGGCTTGGTGTTG 3298 Query 3299 ATTTTGCTGAAATTTACAGGAACTCAAATCTTTGTCAACGCAACAAGGAGCTGATCGAAG 3358 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3299 ATTTTGCTGAAATTTACAGGAACTCAAATCTGTGTCAACGCAACAAGGAGCTGATCGAAC 3358 Query 3359 TACTCAGCAAGCCAAGTAACATTGCAAAAGAAATCGAGTTTCCAACCAGATACTCTCAGT 3418 | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3359 TCCTCAGTAAGCCAAGTAGTATTGCAAAAGAAATCGAGTTTCCGACCAGATACTCTCAGT 3418 Query 3419 CACTGTATAGTCAGTTTGTTGCTTGCCTGTGGAAACAAAACCTATCATATTGGCGAAACC 3478 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3419 CACTGTATAGTCAGTTTGTTGCTTGCCTGTGGAAACAAAACCTATCATATTGGCGAAACC 3478 Query 3479 CACAATACACTGCAGTTCGATTCTTCTACACCGTGGTTATCTCGCTGATGCTTGGAACAA 3538 | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3479 CGCAATACACTGCAGTTCGCTTCTTCTACACCGTGGTTATCTCGCTGATGCTTGGAACAA 3538 Query 3539 TATGTTGGAAATTTGGCTCCAAAAGGGACACTCAACAACAGTTATTTAATGCAATGGGAT 3598 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3539 TATGTTGGAAATTTGGCTCTAAAAGGGACACCCAACAACAGTTATTTAATGCAATGGGAT 3598 Query 3599 CGATGTACGCTGCGGTTCTCTTCATTGGAATCACCAATGCAACCGCTGCACAGCCCGTTG 3658 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3599 CGATGTATGCTGCGGTTCTCTTCATTGGAATCACCAATGCAACCGCTGCGCAGCCCGTTG 3658 Query 3659 TTTCCATAGAAAGATTTGTTTCATACCGCGAGAGAGCAGCGGGAATGTACTCGGCACTTC 3718 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3659 TTTCCATAGAAAGATTTGTTTCATATCGCGAAAGAGCAGCGGGAATGTACTCAGCACTTC 3718 Query 3719 CCTTTGCATTTGCACAGGTGTTTATAGAATTTCCATACGTGTTAGCACAATCCACAATAT 3778 | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3719 CTTTTGCATTTGCACAGGTGTTTATAGAGTTTCCATACGTGCTAGCACAATCCACAATAT 3778 Query 3779 ACAGCACCATATTCTATGCAATGGCCGCGTTCGAATGGTCCGCGGTGAAGTTCTTGTGGT 3838 |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3779 ACAGCAGCATATTCTATGCGATGGCCGCGTTCGAATGGTCCGCGGTGAAGTTCTTGTGGT 3838 Query 3839 ACTTATTCTTCATGTACTTTTCGATAATGTACTTCACCTTCTACGGGATGATGACGACAG 3898 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct 3839 ACCTATTCTTCATGTACTTTTCGATAATGTACTTCACCTTCTACGGAATGATGACAACAG 3898 Query 3899 CAATCACCCCAAACCACAATGTCGCCTCGATTATAGCAGCACCTTTCTACATGCTCTGGA 3958 |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3899 CAATTACCCCAAACCACAACGTCGCCTCAATCATAGCAGCCCCTTTCTACATGCTCTGGA 3958 Query 3959 ATCT-TTTCAGTGGCTTCATGATCCCATACAAGAGGATTCCTCTGTGGTGGAGATGGTAC 4017 | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3959 ACCTCTTT-AGTGGCTTCATGATCCCATACAAGAGGATTCCGCTGTGGTGGAGATGGTAC 4017 Query 4018 TACTGGGCAAACCCGGTGGCTTGGACACTGTACGGTCTATTGGTGTCTCAGTACGGTGAT 4077 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4018 TACTGGGCAAACCCGGTGGCATGGACATTGTACGGTCTATTGGTGTCTCAGTACGGTGAT 4077 Query 4078 GATGAAAGATCGGTGAAGCTATCGGACGGTATCCATCAGGTGATGGTGAAACAACTGCTT 4137 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4078 GATGAGAGATCAGTGAAGCTATCGGACGGTATCCATCAGGTGATGGTGAAACAACTACTT 4137 Query 4138 GAGGATGTGATGGGATATAAACATGACTTCTTAGGTGTCTCAGCTATTATGGTTGTCGCC 4197 ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 4138 GAGGATGTGATGGGATACAAACATGACTTCTTGGGTGTCTCAGCTATTATGGTCGTCGCC 4197 Query 4198 TTTTGCGTCTTCTTCTCCCTTGTGTTTGCATTCGCCATTAAAGCTTTCAATTTCCAGAGA 4257 |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 4198 TTTTGCGTTTTCTTCTCCCTTGTCTTTGCTTTCGCCATTAAAGCCTTCAATTTCCAGAGA 4257 Query 4258 AGATGATGGATTGATTACCACTTACCAACTCTCATATTCATATATACACGTATACAA-CA 4316 ||||||| | ||||| | | | | || || |||||||||||||||||| || Sbjct 4258 AGATGAT---T-GATTA----T--C-A--T---AT-TT-ATATATACACGTATACAAACA 4299 Query 4317 ATCATCTATTGTTT-ATTTGTATATTGGGGCTTTTATACCCAAGAAGGCAGGGGACTGCC 4375 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct 4300 C-CATCTATTGTTTTATTTGTATATTGGGGCTTTTATAACCAAAAAGGCAGGGGACTGCC 4358 Query 4376 TATTCTTCCTCTGTCATTACATGTATGGGATCAATAAAAGCTTGTGTTGTGTTTTATGTT 4435 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4359 TATTCTTCCTCTGCCATTACATGTATGGGATCAATAAAAGCTTGTGTTGTGTTTTATGTT 4418 Query 4436 CCTTG-TCATTTTTTCTGAGAAATGTGTATT-G-----GTCATCTATAACAATCACTGAT 4488 |||| ||||||| || | |||||||||| | |||||||||||||||||||||| Sbjct 4419 CCTTAATCATTTTCTC--ATAAATGTGTATGAGTCAATGTCATCTATAACAATCACTGAT 4476 Query 4489 CATGAACCAGTACTGTAATAGAGATAT--ATCTCTAGTTTACTGGTTG--T-ACACATCT 4543 |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||| Sbjct 4477 CATGAACCGGTACTGTAATAGAGAGATGTATCTCTAGTTTACTGTTTGAATTACACATCT 4536 Query 4544 TTGCTAGTA--TATATTTGGCCAAGTGCATA 4572 ||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct 4537 TTGCTAGTAACTATATTTGGCCACGTGCATA 4567 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 173085842004 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5