BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G30110.1 Length=3626 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg481921 jgi|Araly1|481921|fgenesh2_kg.4__981__AT2G30110.1 5782 0.0 Ahg359413 jgi|Araly1|359413|fgenesh1_pg.C_scaffold_201000003 1858 0.0 > Ahg481921 jgi|Araly1|481921|fgenesh2_kg.4__981__AT2G30110.1 Length=3632 Score = 5782 bits (3131), Expect = 0.0 Identities = 3478/3640 (96%), Gaps = 45/3640 (1%) Strand=Plus/Plus Query 8 GAGATTTCTGCAAAATTCGTCACTTCAATTTCAATTTTCAGATCTCAAAAACTTTTTCTC 67 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1 GAGATTTTTGCAAAATTCGTCACTTCAATTTCAATTTTCAGATCTCAAACTTTTTTTCTC 60 Query 68 TTTTCCGATTCCAATCTTCTCTCGTCTGCTTTCCTCAAAGGTTTTTTCATCACTTTATGC 127 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TTTTCCGATTCCAATCTTCTCTCGTCTGCTTTCCTCAAAGGTTTTTTCATCACTTTATGC 120 Query 128 TTCACAAGCGAGCTAGTGAAGCTAACGATAAGAACGATAATACCATCATCGGTTCCGATT 187 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 121 TTCACAAGCGAGCTAGTGAAGCTAACGATAAGAACGATAATAGCATCATCGGTTCCGATT 180 Query 188 TAGCATCATCTAAGAAACGCCGTATCGATTTCACTGA---ATCTTCGTCTGATAAGT-CT 243 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | Sbjct 181 TAGCATCATCTAAGAAACGCCGTATCGATATCACTGATTCTTCTTCGTCTGATAA-TAAG 239 Query 244 TCTTCGATT-TTAGCTTCT-G--GTAGTAGCAG--G-GGTTTTCACGGCGATAGCGTCGT 296 ||||||||| || |||||| | ||||||| || | || ||||||||||||||||||| Sbjct 240 TCTTCGATTGTT-GCTTCTGGTAGTAGTAGTAGTAGCGGATTTCACGGCGATAGCGTCGC 298 Query 297 TCAGCAAATCGACATGGCTTTTGGTAATTCGAACCGTCAGGAGATTGATGAAGATCTGCA 356 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 299 TCACCAAATCGACATGGCTTTTGGTAATTCGAACCGTCAGGAGATTGATGAAGATCTGCA 358 Query 357 CAGTCGCCAGCTCGCCGTCTATGGTCGTGAGACTATGAGGCGTCTCTTTGCTTCCAATGT 416 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 359 TAGTCGGCAGCTCGCCGTCTATGGTCGTGAGACTATGAGGCGTCTCTTTGCTTCGAATGT 418 Query 417 TCTCATCTCGGGGATGCACGGTCTTGGTGCCGAGATTGCCAAGAATCTTATACTTGCTGG 476 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 419 TCTCATCTCGGGGATGCACGGGCTTGGTGCCGAGATTGCCAAGAATCTTATTCTTGCTGG 478 Query 477 TGTGAAGTCTGTGACCTTGCATGATGAAAGAGTTGTAGAGCTATGGGACTTATCAAGCAA 536 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 479 TGTGAAGTCTGTGACCTTGCATGATGAAAGAGTTGTAGAGCTATGGGACTTATCTAGCAA 538 Query 537 CTTTGTTTTCTCGGAGGATGATGTTGGCAAGAATAGAGCAGATGCTTCTGTTCAGAAGTT 596 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 539 CTTTGTTTTCTCGGAGGATGATGTTGGCAAGAATAGAGCGGATGCTTCTGTTCAGAAGTT 598 Query 597 ACAGGATCTTAACAATGCTGTGGTTGTCTCTAGCTTGACCAAAAGCTTAAAC-AAAGAGG 655 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct 599 ACAGGATCTTAACAATGCTGTGGTTGTCTCTAGCTTGACCAAAAGCTT-AACTAAAGAGG 657 Query 656 ATCTTTCTGGCTTCCAGGTTGTTGTATTCTCTGACATAAGCATGGAAAGAGCAATCGAAT 715 |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 658 ATCTTTCTGGTTTCCAGGTTGTTGTTTTCTCTGACATAAGCATGGAAAGAGCAATCGAAT 717 Query 716 TTGATGACTATTGTCACAGCCATCAGCCTCCTATCGCTTTTGTCAAGGCTGATGTCAGGG 775 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct 718 TTGATGACTATTGTCACAGCCATCAGCCTCCTATCGCTTTTGTCAAAGCTGACGTCAGGG 777 Query 776 GTCTTTTCGGCTCTGTCTTTTGTGATTTTGGGCCTGAATTTGCGGTTCTTGATGTTGATG 835 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 778 GTCTTTTCGGCTCTGTCTTTTGTGATTTTGGGCCTGAATTTGCGGTTCTTGATGTTGATG 837 Query 836 GAGAGGAACCCCATACAGGCATCATTGCGTCTATCTCTAATGAGAACCAGGCATTTATTT 895 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 838 GAGAGGAACCCCATACAGGCATCATTGCGTCTATCTCTAATGAGAACCAGGCATTTATTT 897 Query 896 CCTGTGTCGACGATGAGAGGCTTGAGTTTGAAGATGGTGACCTAGTTGTTTTCTCAGAAG 955 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 CCTGTGTCGACGATGAGAGGCTTGAATTTGAAGATGGTGACCTAGTTGTTTTCTCAGAAG 957 Query 956 TTGAGGGTATGACAGAATTGAATGATGGGAAACCAAGGAAGATAAAAAGTACACGGCCAT 1015 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 958 TTGAGGGCATGACAGAATTGAATGATGGGAAACCAAGGAAGATAAAAAGTGCACGGCCAT 1017 Query 1016 ATTCATTCACCCTTGATGAGGACACTACTAACTATGGAACATATGTGAAGGGTGGTATTG 1075 ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1018 ATTCATTCATTCTTGATGAGGACACTTCAAACTATGGAACATATGTGAAGGGTGGTATTG 1077 Query 1076 TCACTCAAGTGAAACAGCCAAAGTTACTGAATTTCAAGCCATTGAGGGAAGCGCTTAAGG 1135 ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | Sbjct 1078 TCACTCAAGTGAAACAGCCTAAGTTGCTGAATTTCAAGCCACTGAGGGAAGCACTTAAAG 1137 Query 1136 ATCCAGGGGATTTTCTATTTAGTGATTTCTCTAAGTTTGATCGGCCTCCACTCCTTCACT 1195 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| Sbjct 1138 ATCCAGGGGATTTTCTATTTAGTGATTTCTCTAAGTTTGACCGCCCTCCACTTCTTCACT 1197 Query 1196 TAGCATTCCAGGCACTTGATCATTTTAAAGCTGAAGCTGGCAGATTTCCTGTTGCTGGCT 1255 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1198 TAGCATTCCAGGCACTTGATCATTTTAAAGCTGAAGCTGGCAGATTTCCTGTTGCTGGCT 1257 Query 1256 CAGAAGAGGACGCTCAGAAGCTTATATCGATTGCCACAGCCATCAATACCGGGCAGGGTG 1315 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1258 CAGAAGAGGACGCTCAGAAGCTTATATCGATTGCCACAGCCATCAATACCGGGCAGGGTG 1317 Query 1316 ATTTAAAGGTGGAGAATGTTGATCAGAAGCTTCTAAGACACTTTTCCTTTGGAGCCAAGG 1375 |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1318 ATTTAAAGGTGGAGAATGTTGACCAGAAGCTTCTACGACACTTTTCCTTTGGAGCCAAGG 1377 Query 1376 CTGTCCTGAATCCTATGGCTGCAATGTTTGGCGGTATTGTTGGACAGGAGGTTGTTAAAG 1435 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1378 CTGTCCTGAATCCCATGGCTGCAATGTTTGGCGGTATTGTTGGACAGGAGGTTGTTAAAG 1437 Query 1436 CTTGCTCTGGAAAATTTCATCCTCTCTTCCAGTTTTTCTACTTTGATTCAGTGGAGTCAC 1495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1438 CTTGCTCTGGAAAATTTCATCCTCTCTTCCAGTTTTTCTACTTTGATTCAGTGGAGTCAC 1497 Query 1496 TCCCCTCTGAACCTGTGGACTCGAGTGACTTTGCACCAAGAAACAGCCGGTATGATGCCC 1555 | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1498 TACCCACTGAACCTCTGGACTCGAGTGACTTTGCACCAAGAAACAGCCGGTATGATGCCC 1557 Query 1556 AAATATCTGTATTTGGGGCCAAGTTCCAGAAGAAACTTGAAGATGCTAAAGTTTTCACAG 1615 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1558 AAATATCTGTATTTGGGGCCAAGTTCCAGAAGAAACTTGAAGATGCTAAAGTTTTCACAG 1617 Query 1616 TAGGGTCTGGTGCTCTTGGCTGTGAGTTCTTGAAAAATTTGGCTCTGATGGGGGTTTCTT 1675 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1618 TAGGGTCTGGTGCTCTTGGCTGTGAGTTCTTGAAAAATATGGCTCTGATGGGGGTTTCTT 1677 Query 1676 GTGGAAGCCAAGGGAAGCTGACAGTGACAGATGATGATATCATTGAGAAGAGTAACCTCA 1735 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct 1678 GTGGAAGCCAAGGGAAGCTGACAGTGACAGATGATGATATAATCGAGAAGAGTAACCTCA 1737 Query 1736 GTCGTCAATTTCTGTTCCGTGACTGGAACATTGGACAGGCTAAATCCACAGTTGCTGCTT 1795 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1738 GTCGTCAATTTCTGTTCCGTGACTGGAACATCGGACAGGCTAAATCCACAGTTGCTGCTT 1797 Query 1796 CGGCTGCTGCTGTTATAAATCCTCGCTTCAACATTGAGGCCCTGCAAAACCGTGTTGGCG 1855 |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1798 CGGCTGCTGCTGCTATAAATCCCCGCTTCAACATTGAGGCCCTGCAAAACCGTGTTGGCG 1857 Query 1856 CGGAGACTGAGAATGTATTTGACGATGCCTTCTGGGAGAACTTAACTGTTGTCGTCAATG 1915 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1858 CTGAGACTGAGAATGTATTTGACGATGCCTTCTGGGAGAACTTAACTGTTGTCGTCAATG 1917 Query 1916 CACTGGATAATGTTAATGCGAGGCTCTATGTTGATTCGAGGTGCTTGTATTTCCAGAAGC 1975 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1918 CACTGGATAATGTCAATGCGAGGCTCTATGTTGATTCGAGGTGCTTGTATTTCCAGAAGC 1977 Query 1976 CTCTCCTTGAGTCTGGAACTCTTGGTACAAAGTGCAACACACAG-TCGGTTATCCCACAT 2034 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| Sbjct 1978 CTCTCCTTGAGTCTGGAACTCTTGGTGCAAAGTGCAACACACAGAT-GGTTATCCCACAT 2036 Query 2035 CTAACTGAAAATTACGGTGCCTCAAGGGACCCACCAGAGAAACAGGCCCCCATGTGTACA 2094 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2037 CTAACTGAAAATTACGGTGCCTCAAGGGACCCACCAGAGAAACAAGCCCCCATGTGTACA 2096 Query 2095 GTGCATTCCTTCCCGCATAACATTGATCACTGTTTAACTTGGGCTCGCTCTGAGTTTGAG 2154 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2097 GTGCATTCGTTTCCGCATAACATTGATCACTGTTTAACTTGGGCTCGCTCTGAGTTTGAG 2156 Query 2155 GGTCTGCTGGAGAAGACTCCCGCTGAAGTGAATGCATATCTTTCTAGCCCAGTTGAGTAC 2214 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2157 GGTCTGCTGGAGAAGACTCCTGCTGAAGTGAATGCATATCTCTCTAGCCCAGTTGAGTAC 2216 Query 2215 ACTAACTCAATGATGAGTGCTGGTGATGCTCAGGCGAGGGACACATTGGAGAGGATTGTT 2274 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || Sbjct 2217 ACTAACTCAATGATGAGTGCTGGTGATGCTCAGGCGAGGGAGACATTGGAGAGGATTCTT 2276 Query 2275 GAGTGCCTTGAAAAGGAGAAGTGTGAGACCTTCCAAGACTGCTTAACCTGGGCACGACTG 2334 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2277 GAGTGCCTTGACAAGGAGAAGTGTGAGACCTTCCAAGACTGCTTAACCTGGGCTCGACTG 2336 Query 2335 AGGTTTGAGGATTACTTTGTGAACCGTGTCAAGCAATTGATATACACATTTCCTGAAGAT 2394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2337 AGGTTTGAGGATTACTTTGTGAACCGTGTCAAGCAATTGATATACACATTTCCTGAAGAT 2396 Query 2395 GCTGCGACTAGTACCGGAGCTCCATTCTGGTCTGCTCCAAAAAGATTCCCTCGTCCACTC 2454 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2397 GCTGCGACTAGTACCGGATCTCCATTCTGGTCTGCTCCGAAAAGATTCCCTCGTCCACTC 2456 Query 2455 CAGTACTCGTCGTCCGACCCAAGTCTCCTTAACTTTATCACAGCGACTGCTATTTTACGA 2514 ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| Sbjct 2457 CAGTACTCGTCTTCTGACCCAAGTCTCCTTAACTTTATCACAGCAACTGCTATTCTACGA 2516 Query 2515 GCAGAGACATTTGGGATCCCGATACCTGAGTGGACTAAGAACCCAAAGGAAGCAGCAGAA 2574 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2517 GCAGAGACATTTGGGATCCCAATACCTGAGTGGACCAAGAACCCAAAGGAAGCAGCCGAA 2576 Query 2575 GCTGTTGACAGAGTGATAGTCCCAGACTTTGAGCCAAGGCAAGATGCAAAGATTGTGACT 2634 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2577 GCTGTGGACAGAGTGATAGTCCCAGACTTTGAGCCAAGGAAAGATGCAAAGATTGTGACT 2636 Query 2635 GATGAGAAAGCTACCACTTTAACCACTGCTTCGGTGGACGACGCTGCAGTCATCGACGAT 2694 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| Sbjct 2637 GATGAGAAAGCCACCACTTTAACCACTGCTTCGGTGGACGATGCTGCAGTCATCAACGAT 2696 Query 2695 CTCATTGCTAAGATCGACCAGTGTAGGCATAACTTGTCGCCAGACTTCAGGATGAAACCT 2754 ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2697 CTCATTGCTAAGATCGAGCAGTGTAGGCGTAACTTGTCTCCAGACTTCAGGATGAAACCA 2756 Query 2755 ATTCAGTTCGAAAAGGATGATGATACAAACTATCACATGGATGTGATAGCAGGACTAGCC 2814 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct 2757 ATTCAGTTTGAAAAGGATGATGATACAAACTATCACATGGACGTGATAGCGGGACTAGCC 2816 Query 2815 AACATGAGGGCGAGAAATTACAGCATCCCTGAAGTGGACAAGCTGAAAGCAAAGTTCATA 2874 |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2817 AACATGAGGGCGAGGAATTACACCATTCCTGAAGTCGACAAGCTGAAAGCAAAGTTCATC 2876 Query 2875 GCAGGGAGAATCATCCCAGCCATTGCGACTTCAACAGCCATGGCTACTGGGCTGGTCTGC 2934 ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2877 GCAGGTAGAATCATTCCAGCCATTGCAACTTCAACAGCCATGGCTACTGGGCTGGTCTGC 2936 Query 2935 CTCGAGCTGTACAAGGTCCTTGATGGAGGACATAAAGTGGAAG-CTTACAGAAACACATT 2993 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| Sbjct 2937 CTCGAGCTGTACAAGGTCCTTGATGGAGGACACAAAGTGGAAGACT-ACAGAAACACATT 2995 Query 2994 TGCCAACCTGGCACTTCCACTATTCTCCATGGCTGAACCACTTCCACCAAAGGTGGTGAA 3053 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2996 TGCCAACCTGGCACTTCCACTCTTCTCCATGGCTGAACCAGTTCCACCAAAGGTGGTGAA 3055 Query 3054 GCACCGTGACATGGCTTGGACAGTTTGGGACAGATGGGTTCTCAAGGGAAACCCAACTCT 3113 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3056 GCACCGTGACATGGCTTGGACCGTTTGGGACAGATGGGTTCTCAAGGGAAACCCGACTCT 3115 Query 3114 TCGTGAGGTGTTGCAGTGGCTGGAGGACAAAGGGCTTAGCGCATACAGCATCTCTTGTGG 3173 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3116 TCGTGAGGTGTTACAGTGGCTGGAGGACAAAGGGCTTAGCGCATACAGCATCTCGTGTGG 3175 Query 3174 AAGCTGTCTTCTGTTCAACAGTATGTTCACAAGGCACAAGGAGAGGATGGACAAGAAGGT 3233 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3176 AAGCTGTCTTCTGTTCAACAGTATGTTCCCAAGGCACAAGGAGAGGATGGACAAGAAGGT 3235 Query 3234 TGTGGATCTCGCTCGGGATGTTGCGAAAGTCGAGTTACCGCCTTATCGCAACCATCTTGA 3293 ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| Sbjct 3236 TGTGGATCTTGCTCGGGATATCGCGAAAGTCGAGTTACCACCTTACCGCCACCATCTTGA 3295 Query 3294 TGTAGTGGTGGCTTGTGAGGATGAAGATGACAATGACGTCGATATTCCTCTCGTCTCTAT 3353 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3296 TGTAGTGGTGGCTTGTGAGGATGAAGATGACAATGACGTCGATATTCCTCTCGTCTCTAT 3355 Query 3354 CTACTTCAGGTGAAAAGTTTCGA--GA------GA-A---TGAA-GAAAGATGAAACTCT 3400 ||||||||||||| || |||||| || || | |||| ||||||| ||||||| Sbjct 3356 CTACTTCAGGTGAGAATTTTCGAACGAAAAACAGACAGAATGAAAGAAAGATTAAACTCT 3415 Query 3401 TGAGAGCAAATTTGTGTGTTTT-GTCTCTGCATCTGCCCTACGTTATTATCTTTTGGATG 3459 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| Sbjct 3416 TGAGAGCAAATTTGTGTGTTTTTGTCTCTGCATCTGCCCTACGT-ATTTTCTTT-GGATG 3473 Query 3460 CTTGTGGGTGAGATAACTGATTTTTAC-TTGAGGGGGATAGAGACTCATTTTATC-TCTC 3517 |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct 3474 CTTGTGGGTGAGATGACTGATTTTTAAATTGCGGGGGATAGAGACCCATTTTATCATCTC 3533 Query 3518 TCGTTCTATTT-TAGTCTTTCTTTCTATGTACAATTGCTGAATGTGTGGTTTACACACCC 3576 ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| Sbjct 3534 TCGTTCTATTTATAGTCTTTCTTTCTATGTATAATTGCTGA-TGTGTGTTTTACACACCC 3592 Query 3577 GTTACCTTCTA----AACATG-TT-CTATCAAACAAATCT 3610 |||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| Sbjct 3593 GTTACCATCTATCTGAACATGCTTTCTATCAAACAAATCT 3632 > Ahg359413 jgi|Araly1|359413|fgenesh1_pg.C_scaffold_201000003 Length=1494 Score = 1858 bits (1006), Expect = 0.0 Identities = 1057/1082 (98%), Gaps = 2/1082 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1258 GAAGAGGACGCTCAGAAGCTTATATCGATTGCCACAGCCATCAATACCGGGCAGGGTGAT 1317 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 385 GAAGAGGACGCTCAGAAGCTTATATCGATTGCCACAGCCATCAATACCGGGCAGGGTGAT 444 Query 1318 TTAAAGGTGGAGAATGTTGATCAGAAGCTTCTAAGACACTTTTCCTTTGGAGCCAAGGCT 1377 |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 445 TTAAAGGTGGAGAATGTTGACCAGAAGCTTCTACGACACTTTTCCTTTGGAGCCAAGGCT 504 Query 1378 GTCCTGAATCCTATGGCTGCAATGTTTGGCGGTATTGTTGGACAGGAGGTTGTTAAAGCT 1437 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 505 GTCCTGAATCCCATGGCTGCAATGTTTGGCGGTATTGTTGGACAGGAGGTTGTTAAAGCT 564 Query 1438 TGCTCTGGAAAATTTCATCCTCTCTTCCAGTTTTTCTACTTTGATTCAGTGGAGTCACTC 1497 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 565 TGCTCTGGAAAATTTCATCCTCTCTTCCAGTTTTTCTACTTTGATTCAGTGGAGTCACTA 624 Query 1498 CCCTCTGAACCTGTGGACTCGAGTGACTTTGCACCAAGAAACAGCCGGTATGATGCCCAA 1557 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 625 CCCACTGAACCTCTGGACTCGAGTGACTTTGCACCAAGAAACAGCCGGTATGATGCCCAA 684 Query 1558 ATATCTGTATTTGGGGCCAAGTTCCAGAAGAAACTTGAAGATGCTAAAGTTTTCACAGTA 1617 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 685 ATATCTGTATTTGGGGCCAAGTTCCAGAAGAAACTTGAAGATGCTAAAGTTTTCACAGTA 744 Query 1618 GGGTCTGGTGCTCTTGGCTGTGAGTTCTTGAAAAATTTGGCTCTGATGGGGGTTTCTTGT 1677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 745 GGGTCTGGTGCTCTTGGCTGTGAGTTCTTGAAAAATATGGCTCTGATGGGGGTTTCTTGT 804 Query 1678 GGAAGCCAAGGGAAGCTGACAGTGACAGATGATGATATCATTGAGAAGAGTAACCTCAGT 1737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 805 GGAAGCCAAGGGAAGCTGACAGTGACAGATGATGATATAATTGAGAAGAGTAACCTCAGT 864 Query 1738 CGTCAATTTCTGTTCCGTGACTGGAACATTGGACAGGCTAAATCCACAGTTGCTGCTTCG 1797 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 865 CGTCAATTTCTGTTCCGTGACTGGAACATCGGACAGGCTAAATCCACAGTTGCTGCTTCG 924 Query 1798 GCTGCTGCTGTTATAAATCCTCGCTTCAACATTGAGGCCCTGCAAAACCGTGTTGGCGCG 1857 |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 925 GCTGCTGCTGCTATAAATCCCCGCTTCAACATTGAGGCCCTGCAAAACCGTGTTGGCGCT 984 Query 1858 GAGACTGAGAATGTATTTGACGATGCCTTCTGGGAGAACTTAACTGTTGTCGTCAATGCA 1917 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 985 GAGACTGAGAATGTATTTGATGATGCCTTCTGGGAGAACTTAACTGTTGTCGTCAATGCA 1044 Query 1918 CTGGATAATGTTAATGCGAGGCTCTATGTTGATTCGAGGTGCTTGTATTTCCAGAAGCCT 1977 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1045 CTGGATAATGTCAATGCGAGGCTCTATGTTGATTCGAGGTGCTTGTATTTCCAGAAGCCT 1104 Query 1978 CTCCTTGAGTCTGGAACTCTTGGTACAAAGTGCAACACACAG-TCGGTTATCCCACATCT 2036 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct 1105 CTCCTTGAGTCTGGAACTCTTGGTGCAAAGTGCAACACACAGAT-GGTTATCCCACATCT 1163 Query 2037 AACTGAAAATTACGGTGCCTCAAGGGACCCACCAGAGAAACAGGCCCCCATGTGTACAGT 2096 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1164 AACTGAAAATTACGGTGCCTCAAGGGACCCACCAGAGAAACAAGCCCCCATGTGTACAGT 1223 Query 2097 GCATTCCTTCCCGCATAACATTGATCACTGTTTAACTTGGGCTCGCTCTGAGTTTGAGGG 2156 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1224 GCATTCGTTTCCGCATAACATTGATCACTGTTTAACTTGGGCTCGCTCTGAGTTTGAGGG 1283 Query 2157 TCTGCTGGAGAAGACTCCCGCTGAAGTGAATGCATATCTTTCTAGCCCAGTTGAGTACAC 2216 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1284 TCTGCTGGAGAAGACTCCCGCTGAAGTGAACGCATATCTCTCTAGCCCAGTTGAGTACAC 1343 Query 2217 TAACTCAATGATGAGTGCTGGTGATGCTCAGGCGAGGGACACATTGGAGAGGATTGTTGA 2276 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1344 TAACTCAATGATGAGTGCTGGTGATGCTCAGGCGAGGGACACATTGGAGAGGATTGTTGA 1403 Query 2277 GTGCCTTGAAAAGGAGAAGTGTGAGACCTTCCAAGACTGCTTAACCTGGGCACGACTGAG 2336 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct 1404 GTGCCTTGACAAGGAGAAGTGTGAGACCTTCCAAGACTGCTTAACCTGGGCTCGATTGAG 1463 Query 2337 GT 2338 || Sbjct 1464 GT 1465 Score = 507 bits (274), Expect = 3e-142 Identities = 336/363 (93%), Gaps = 16/363 (4%) Strand=Plus/Plus Query 106 AGGTTTTTTCATCACTTTATGCTTCACAAGCGAGCTAGTGAAGCTAACGATAAGAACGAT 165 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 25 AGGTTTTTTCATCACTTTATGCTTCACAAGCGAGCTAGTGAAGCTAACGATAAGAACGAT 84 Query 166 AATACCATCATCGGTTCCGATTTAGCATCATCTAAGAAACGCCGTATCGATTTCACTGA- 224 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 85 AATAGCATCATCGGTTCCGATTTAGCATCATCTAAGAAACGCCGTATCGATATCACTGAT 144 Query 225 --ATCTTCGTCTGATAAGT-CTTCTTCGATT-TTAGCTTC---T-G--GTAGTAGCAG-- 272 |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | | ||||||| || Sbjct 145 TCTTCTTCGTCTGATAA-TAAGTCTTCGATTGTT-GCTTCTGGTAGTAGTAGTAGTAGTA 202 Query 273 G-GGTTTTCACGGCGATAGCGTCGTTCAGCAAATCGACATGGCTTTTGGTAATTCGAACC 331 | || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 203 GCGGATTTCACGGCGATAGCGTCGCTCACCAAATCGACATGGCTTTTGGTAATTCGAACC 262 Query 332 GTCAGGAGATTGATGAAGATCTGCACAGTCGCCAGCTCGCCGTCTATGGTCGTGAGACTA 391 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 263 GTCAGGAGATTGATGAAGATCTGCATAGTCGGCAGCTCGCCGTCTATGGTCGTGAGACTA 322 Query 392 TGAGGCGTCTCTTTGCTTCCAATGTTCTCATCTCGGGGATGCACGGTCTTGGTGCCGAGA 451 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 323 TGAGGCGTCTCTTTGCTTCCAATGTTCTCATCTCGGGGATGCACGGTCTTGGTGCCGAGA 382 Query 452 TTG 454 ||| Sbjct 383 TTG 385 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 136969205227 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5