BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G30950.1 Length=2337 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg482018 jgi|Araly1|482018|fgenesh2_kg.4__1078__AT2G30950.1 3738 0.0 Ahg910330 jgi|Araly1|910330|Al_scaffold_0001_584 2217 0.0 > Ahg482018 jgi|Araly1|482018|fgenesh2_kg.4__1078__AT2G30950.1 Length=2279 Score = 3738 bits (2024), Expect = 0.0 Identities = 2198/2283 (96%), Gaps = 8/2283 (0%) Strand=Plus/Plus Query 14 TCTTTCTCTCCATCCTCCATATTTGCAGAGCTCGAGATTCTCCTTCCCTATACAACTCTC 73 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1 TCTTTCTCTCCATCTTCCATATTTGCAGAGCTCGAGATTCTCCTTCCTTATACAACTCTC 60 Query 74 ATCTGTAATCGATACAGATGGCAGCTTCATCAGCTTGTCTTGTGGGAAATGGTTTGTCAG 133 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 61 ATCTGTAATCGATACAGATGGCAGCTTCATCAGCTTGTCTTGTGGGAAATGGATTGTCAG 120 Query 134 TGAACACAACAACCAAACAGAGGTTAAGTAAACATTTTTCCGGCAGACAGACAAGCTTTT 193 |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| Sbjct 121 TGAACACAACGACCAAACAGAGGTTAAGTAAAAACTTTTCCAGCAGACAGACAAACTTTT 180 Query 194 CTTCAGTGATTAGGACATCTAAGGTTAATGTAGTGAAGGCTTCTTTGGATGGgaagaaga 253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 181 CTTCAGTGATTAGGACATCTAAGGTTAATGTAGTGAAGGCTTCTTTGGATGTGAAGAAGA 240 Query 254 agcaagaaggaagaagagaTTTTCTCAAAATCTTGTTAGGAAATGCTGGGGTCGGTTTGG 313 | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 241 AACATGAAGGAAGAAGAGATTTTCTTAAAATCTTGTTAGGAAATGCCGGGGTCGGTTTGG 300 Query 314 TTGCAAGTGGGAAAGCAAATGCTGATGAACAAG-GTGTTTCTTCGTCGAGGATGTCGTAT 372 |||||||||||||||||||| | || ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 301 TTGCAAGTGGGAAAGCAAATTCAGAGGAACAAGCG-GTTTCGTCGTCTAGGATGTCGTAT 359 Query 373 TCTAGGTTTCTAGAGTACTTGGATAAGGATAGGGTGAATAAAGTTGATTTGTATGAGAAT 432 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 TCTAGGTTTCTAGAGTATTTGGATAAGGATAGGGTGAATAAAGTTGATTTGTATGAGAAT 419 Query 433 GGGACTATAGCTATTGTGGAAGCTGTTTCTCCTGAATTGGGTAACCGGGTTGAGAGAGTA 492 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || Sbjct 420 GGGACTATAGCTATTGTGGAAGCTGTTTCTCCTGAGTTGGGTAACCGGGTTGAGCGTGTT 479 Query 493 CGTGTTCAGCTACCGGGTTTAAGTCAAGAGCTTCTACAGAAGCTTAGGGCTAAGAATATT 552 ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct 480 CGTGTTCAGCTACCGGGATTAAGTCAGGAGCTTCTCCAGAAGCTTAGGGCCAAGAATATT 539 Query 553 GATTTTGCAGCACATAATGCTCAGGAAGATCAAGGTTCTGTGTTATTCAACTTGATTGGT 612 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 GATTTTGCAGCACATAATGCTCAGGAAGACCAAGGTTCTGTGTTATTCAACTTGATTGGT 599 Query 613 AATCTTGCTTTCCCGGCGCTTTTGATTGGTGGTTTGTTCCTTCTTTCGAGACGGTCTGGT 672 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 600 AATCTTGCTTTCCCGTTGCTTTTGATTGGTGGTTTGTTCCTTCTTTCGAGACGCTCTGGT 659 Query 673 GGTGGAATGGGTGGACCTGGTGGTCCTGGTAACCCACTTCAGTTTGGTCAGTCCAAAGCA 732 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 GGTGGAATGGGTGGACCTGGTGGTCCTGGTAACCCACTTCAGTTTGGTCAGTCCAAAGCA 719 Query 733 AAGTTCCAAATGGAACCTAACACTGGTGTAACATTTGATGATGTTGCTGGAGTTGATGAA 792 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 AAGTTCCAAATGGAACCTAACACTGGTGTAACATTTGATGATGTTGCTGGAGTTGATGAA 779 Query 793 GCAAAGCAAGATTTCATGGAAGTGGTGGAGTTTTTGAAGAAACCTGAGAGATTCACTGCG 852 |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 780 GCAAAGCAGGATTTCATGGAAGTGGTGGAGTTTCTGAAGAAACCCGAGAGATTCACTGCG 839 Query 853 GTTGGTGCCAAGATCCCGAAAGGTGTTCTTCTTATTGGTCCTCCTGGTACCGGGAAAACC 912 |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct 840 GTTGGTGCCAAGATTCCGAAAGGTGTTCTCCTTATTGGTCCCCCTGGTACTGGGAAAACC 899 Query 913 CTTTTGGCAAAAGCCATTGCTGGTGAAGCTGGTGTGCCTTTCTTCTCCATCTCTGGTTCT 972 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 CTTTTGGCAAAAGCCATTGCTGGTGAAGCTGGTGTGCCTTTCTTCTCCATCTCTGGTTCT 959 Query 973 GAGTTTGTTGAGATGTTTGTCGGTGTTGGTGCCTCGAGAGTCCGTGATCTTTTCAAGAAA 1032 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 960 GAGTTTGTTGAGATGTTTGTCGGTGTTGGTGCCTCAAGAGTCCGTGATCTTTTCAAGAAA 1019 Query 1033 GCCAAGGAGAACGCTCCTTGCATTGTCTTTGTAGATGAAATAGATGCTGTTGGTAGGCAA 1092 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1020 GCCAAGGAGAACGCTCCTTGCATTGTCTTTGTAGATGAAATAGATGCTGTTGGTAGGCAA 1079 Query 1093 AGAGGAACCGGAATTGGTGGAGGTAATGATGAAAGAGAACAGACCCTCAATCAGCTCCTA 1152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1080 AGAGGAACCGGAATTGGTGGAGGTAATGATGAAAGAGAACAGACCCTCAATCAGCTCCTA 1139 Query 1153 ACTGAGATGGATGGTTTTGAAGGTAACACTGGTGTTATCGTAGTTGCTGCAACCAATAGA 1212 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1140 ACTGAGATGGATGGTTTTGAAGGTAACACTGGTGTTATCGTAGTTGCTGCAACCAATAGA 1199 Query 1213 GCAGACATTCTTGACTCTGCTTTGTTGAGGCCAGGACGGTTTGACCGGCAGGTAAGTGTT 1272 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1200 GCAGACATTCTTGATTCTGCTTTGTTGAGGCCAGGACGGTTTGACCGGCAGGTAAGTGTT 1259 Query 1273 GACGTTCCTGACGTTAAGGGGAGAACAGATATTCTCAAGGTTCATGCCGGCAATAAGAAG 1332 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1260 GACGTTCCAGACGTTAAGGGGAGAACAGATATTCTCAAGGTTCATGCCGGTAATAAGAAG 1319 Query 1333 TTCGACAATGATGTTTCACTTGAAATAATAGCAATGAGAACACCTGGATTTAGCGGAGCA 1392 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1320 TTCGACAATGATGTCTCACTTGAAATAATAGCAATGAGAACACCCGGATTTAGCGGAGCA 1379 Query 1393 GATCTCGCTAACCTCTTGAATGAGGCTGCTATATTGGCCGGAAGGCGAGCACGGACATCG 1452 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct 1380 GATCTCGCTAACCTCTTGAATGAAGCTGCTATATTGGCCGGAAGGCGAGCGCGGACGTCG 1439 Query 1453 ATATCATCTAAAGAGATTGATGACTCCATTGATAGAATCGTTGCTGGCATGGAAGGAACA 1512 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1440 ATATCATCTAAAGAGATTGATGACTCCATTGATAGAATAGTTGCTGGCATGGAAGGAACA 1499 Query 1513 GTGATGACCGATGGCAAGAGCAAAAGCTTGGTAGCTTACCATGAAGTTGGTCATGCAGTG 1572 ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1500 GTGATGACCGACGGGAAGAGCAAAAGCTTGGTTGCTTACCATGAAGTTGGTCATGCAGTG 1559 Query 1573 TGTGGAACATTGACTCCAGGACATGATGCTGTGCAAAAGGTAACGTTGATACCAAGAGGC 1632 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1560 TGTGGAACATTGACTCCAGGACATGATGCTGTGCAAAAGGTAACGTTGATACCAAGAGGC 1619 Query 1633 CAAGCAAGAGGTCTGACTTGGTTCATTCCATCAGATGACCCGACACTCATCTCCAAGCAG 1692 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1620 CAAGCAAGAGGTCTGACTTGGTTCATTCCGTCAGATGACCCGACACTCATCTCCAAGCAA 1679 Query 1693 CAACTCTTTGCAAGAATTGTTGGTGGACTCGGTGGTAGGGCCGCTGAAGAAATCATCTTT 1752 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 1680 CAACTCTTTGCAAGAATTGTTGGTGGACTCGGTGGTCGAGCCGCTGAAGAAATCATCTTT 1739 Query 1753 GGTGATTCC-GAGGTGACTACTGGCGCAGTTGGTGACTTACAACAGATCACCGGTTTGGC 1811 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1740 GGTGAG-CCTGAGGTGACTACTGGCGCAGTTGGTGACTTGCAACAGATCACCGGTTTGGC 1798 Query 1812 TAGACAGATGGTAACAACATTTGGAATGTCTGATATTGGACCATGGTCTTTGATGGATTC 1871 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1799 TAGACAGATGGTAACAACATTTGGAATGTCTGATATTGGACCATGGTCGTTGATGGATTC 1858 Query 1872 TTCGGCACAAAGCGATGTCATCATGAGAATGATGGCAAGAAACTCCATGTCTGAGAAGCT 1931 || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1859 ATCAGCACAAAGTGATGTCATCATGAGAATGATGGCAAGAAACTCCATGTCTGAGAAGCT 1918 Query 1932 TGCAGAAGACATTGATTCTGCGGTGAAGAAACTATCAGACAGTGCATATGAGATAGCTCT 1991 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1919 TGCAGAAGACATTGATTCTGCAGTGAAGAAACTATCCGACAGTGCATATGAGATAGCTCT 1978 Query 1992 AAGCCACATAAAGAACAATCGTGAAGCCATGGATAAGCTCGTTGAAGTGCTTCTCGAGAA 2051 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1979 AAGCCACATAAGGAACAATCGTGAAGCCATGGATAAGCTCGTTGAAGTGCTTCTCGAGAA 2038 Query 2052 AGAAACTATTGGCGGTGACGAATTCAGGGCAATTCTTTCCGAGTTTACTGAGATCCCCCC 2111 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || Sbjct 2039 AGAAACAATTGGCGGTGACGAATTCAGGGCAATTCTTTCTGAGTTTACTGAAATCCCACC 2098 Query 2112 GGAAAACCGAGTTCCTTCTTCAACAACGA-CAACTCCAGCATCAGCACCAACACCAGCTG 2170 ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2099 AGAAAATCGGGTTCCTTCTTCAACAAC-ATCAACTCCAGCATCAGCACCAACACCAGCTT 2157 Query 2171 CTGTCTAAGTAATCAATCTGTATACTTGTGATACTTATAATTTTTCTGTAAATTTATCT- 2229 | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2158 CCGTCTAAGTAAGAAATTTGTATACTTGTGATACTTATAATTTTTCTGTAAATTTATCTG 2217 Query 2230 TCAAACTTACACTCTAGAAATGTGATACTATCTCAAAATTTAGTAACAAGTAAATGTTTA 2289 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | Sbjct 2218 TCAAACTTACACTCTAGAAATGTGATACTATCTCAAAATTTAGTAGCAAGTAAATGTT-A 2276 Query 2290 AAA 2292 ||| Sbjct 2277 AAA 2279 > Ahg910330 jgi|Araly1|910330|Al_scaffold_0001_584 Length=2058 Score = 2217 bits (1200), Expect = 0.0 Identities = 1719/1966 (87%), Gaps = 50/1966 (3%) Strand=Plus/Plus Query 200 TGATTAGGACATCTAAGGTTA-ATGTAGTGAAGGCTTCTTTGGATGGgaagaagaagcaa 258 ||| |||| ||||||| | || | || |||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct 81 TGA-TAGGGCATCTAAAGCTACA-GTTGTGAAGGCTTCTTTGGAT--G-AGAAGAAGCAT 135 Query 259 gaaggaagaagagaTTTTC-TCAAAATCTTGTTAGGAAA---T---GCTGGGGTCGGTTT 311 ||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| | ||||| || ||||| Sbjct 136 GAAGGAAGAAGAG-GTTTCTTCAAACTCTTACTAGGAAACGCTGCAGCTGGAGTGGGTTT 194 Query 312 GGTTGCAAGTGGGAAA-GCAAATGCTGATG----A--ACAAGGTGTTTCTTCGTCGAGGA 364 | |||||||| ||||| |||||||| || | | |||||| |||||||| || |||| Sbjct 195 GCTTGCAAGT-GGAAACGCAAATGCAGACGAACAAGGACAAGGGGTTTCTTCTTCTAGGA 253 Query 365 TGTCGTATTCTAGGTTTCTAGAGTACTTGGATAA-GGATAGGG-TGAATAAAGTTGATTT 422 |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || | ||||| ||||| Sbjct 254 TGTCTTATTCTAGGTTTCTAGAGTATTTGGATAAGGGA-AGGGTTG-AGAAAGTAGATTT 311 Query 423 GTATGAGAATGGGACTATAGCTATTGTGGAAGCTGTTTCTCCTGAATTGGGTAACCGGGT 482 ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | Sbjct 312 GTATGAGAATGGGACTATAGCTATTGTTGAGGCTGTTTCTCCTGAGTTGGGTAACCGGAT 371 Query 483 TGAGAGAGTACGTGTTCAGCTACCGGGTTTAAGTCAAGAGCTTCTACAGAAGCTT-AGGG 541 | || | |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||| || |||| Sbjct 372 TCAGCGTGTACGTGTGCAGCTACCTGGATTGAGTCAGGAGCTTCTCCAGAAG-TTGAGGG 430 Query 542 CTAAGAATATTGATTTTGCAGCACATAATGCTCAGGAAGATCAAGGTTCTGTGTTA-TTC 600 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || Sbjct 431 CAAAGAATATTGATTTTGCAGCACATAATGCTCAGGAAGACCAAGGTTCTCCGATACTT- 489 Query 601 AACTTGATTGGTAATCTTGCTTTCCCGGCGCTTTTGATTGGTGGTTTGTTCCTTCTTTCG 660 ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct 490 AACTTGATTGGGAATCTTGCATTCCCGGTTATTTTGATTGGCGGTTTGTTCCTTCTATCG 549 Query 661 AGACGGT-CTGGTGGTGGAATGGGTGGACCTGGTGGTCCTGG-TAACCCACTTCAGTTTG 718 ||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| || ||| Sbjct 550 AGAAGGTCCT-CTGGTGGAATGGGTGGCCCTGGTGGTCCTGGCT-TCCCACTCCAAATTG 607 Query 719 GTCAGTCCAAAGCAAAGTTCCAAATGGAACCTAACACTGGTGTAACATTTGATGATGTTG 778 ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 608 GTCAGTCGAAAGCAAAGTTTCAGATGGAACCAAACACTGGTGTAACTTTTGATGATGTTG 667 Query 779 CTGGAGTTGATGAAGCAAAGCAAGATTTCATGGAAGTGGTGGAGTTTTTGAAGAAACCTG 838 ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| Sbjct 668 CTGGAGTCGACGAAGCCAAGCAGGATTTCATGGAAGTGGTGGAGTTTCTGAAGAAGCCTG 727 Query 839 AGAGATTCACTGCGGTTGGTGCCAAGATCCCGAAAGGTGTTCTTCTTATTGGTCCTCCTG 898 |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| Sbjct 728 AGAGGTTCACTGCAGTTGGTGCCCGGATCCCCAAAGGTGTTCTCCTTGTTGGTCCTCCTG 787 Query 899 GTACCGGGAAAACCCTTTTGGCAAAAGCCATTGCTGGTGAAGCTGGTGTGCCTTTCTTCT 958 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | Sbjct 788 GTACTGGGAAAACCCTGCTGGCAAAAGCCATTGCTGGTGAAGCCGGTGTGCCCTTCTTTT 847 Query 959 CCATCTCTGGTTCTGAGTTTGTTGAGATGTTTGTCGGTGTTGGTGCCTCGAGAGTCCGTG 1018 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | Sbjct 848 CCATCTCGGGTTCTGAGTTTGTTGAGATGTTTGTCGGTGTTGGTGCCTCAAGAGTCCGCG 907 Query 1019 ATCTTTTCAAGAAAGCCAAGGAGAACGCTCCTTGCATTGTCTTT-GTAGATGAAATAGAT 1077 |||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||| || |||||||||||| Sbjct 908 ATCTTTTCAAAAAAGCCAAAGAAAATGCTCCATGCATTGT-TTTCGTGGATGAAATAGAT 966 Query 1078 GCTGTTGGTAGGCAAAGAGGAACCGGAATTGGTGGAGGTAATGATGAAAGAGAACAGACC 1137 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 967 GCTGTTGGTAGGCAAAGAGGAACTGGAATTGGTGGAGGTAATGATGAAAGAGAACAGACC 1026 Query 1138 CTCAATCAGCTCCTAACTGAGATGGATGGTTTTGAAGGTAACACTGGTGTTATCGTAGTT 1197 || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1027 CTTAATCAGCTCCTGACTGAGATGGATGGTTTTGAGGGTAACACTGGTGTTATCGTAGTG 1086 Query 1198 GCTGCAACCAATAGAGCAGACATTCTTGACTCTGCTTTGTTGAGGCCAGGACGGTTTGAC 1257 ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| Sbjct 1087 GCTGCAACCAACAGAGCAGACATTCTTGACTCCGCTTTGCTAAGGCCAGGACGGTTTGAC 1146 Query 1258 CGGCAGGTAAGTGTTGACGTTCCTGACGTTAAGGGGAGAACAGATATTCTCAAGGTTCA- 1316 ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1147 CGGCAGGTATCTGTTGACGTTCCAGACGTTAAGGGAAGAACAGATATACTCAAGGTTCAC 1206 Query 1317 TGCCGGCAATAAGAAGTTCGACAA-TGATGTTTCACTTGAAATAATAGCAATGAGAACAC 1375 | |||| |||||||| || || || || ||||||||||||| ||||||| |||||||| | Sbjct 1207 T-CCGGGAATAAGAAATTTGA-AAGTGGTGTTTCACTTGAAGTAATAGCCATGAGAACGC 1264 Query 1376 CTGGATTTAGCGGAGCAGATCTCGCTAACCTCTTGAATGAGGCTGCTATATTGGCCGGAA 1435 |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 1265 CTGGATTTAGCGGAGCTGATCTTGCAAACCTCTTGAACGAGGCTGCCATATTGGCCGGCC 1324 Query 1436 GGCGAGCACGGACAT-CGATATCATCTAAAGAGATTGATGACTCCATTGATAGAATCGTT 1494 | || | | ||| | | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || Sbjct 1325 GTCGTGGAAAGAC-TGCTATATCATCAAAAGAGATCGATGACTCAATTGATAGAATTGTA 1383 Query 1495 GCTGGCATGGAAGGAACAGTGATGACCGATGGCAAGAGCAAAAGCTTGGTAGCTTACCAT 1554 |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1384 GCTGGCATGGAAGGAACAGTCATGACAGATGGGAAGAGCAAAAGCTTGGTTGCTTACCAT 1443 Query 1555 GAAGTTGGTCATGCAGTGTGTGGAACATTGACTCCAGGACATGATGCTGTGCAAAAGGTA 1614 |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1444 GAAGTTGGCCATGCCGTATGTGGAACATTGACTCCAGGACATGATGCTGTCCAAAAGGTC 1503 Query 1615 ACGTTGATACCAAGAGGCCAAGCAAGAGGTCTGACTTGGTTCATTCCATCAGATGACCCG 1674 || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1504 ACATTGATACCACGAGGCCAGGCAAGAGGTCTGACTTGGTTCATTCCCTCAGATGACCCA 1563 Query 1675 ACACTCATCTCCAAGCAGCAACTCTTTGCAAGAATTGTTGGTGGACTCGGTGGTAGGGCC 1734 || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1564 ACTCTAATCTCCAAACAGCAGCTCTTTGCAAGAATTGTTGGTGGACTCGGTGGTAGAGCC 1623 Query 1735 GCTGAAGAAATCATCTTTGGTGATTCCGAGGTGACTACTGGCGCAGTTGGTGACTTACAA 1794 ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| Sbjct 1624 GCTGAAGAAGTCATCTTTGGTGAGCCCGAGGTGACTACTGGTGCAGTTAGTGACTTACAA 1683 Query 1795 CAGATCACCGGTTTGGCTA-GACAGATGGTAACAACATTTGGAATGTCTGATATTGGACC 1853 ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| Sbjct 1684 CAGATCACCGGTTTGGCTAAG-CAGATGGTGACAACATTTGGGATGTCTGAAATTGGACC 1742 Query 1854 ATGGTCTTTGATGGATTCTTCGGCACAAAGCGATGTCATCATGAGAATGATGGCAAGAAA 1913 |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 1743 ATGGTCGCTAATGGATTCATCGGCTCAAAGCGATGTCATTATGAGGATGATGGCAAGAAA 1802 Query 1914 CTCCATGTCTGAGAAGCTTGCAGAA-GACATTGATTCTGCGGTGAAGAAACTATCAGACA 1972 ||| |||||||||||||||||| || || || ||| | |||||||||| | ||||||||| Sbjct 1803 CTCAATGTCTGAGAAGCTTGCA-AATGATATCGATACAGCGGTGAAGACATTATCAGACA 1861 Query 1973 GTGCATATGAGATAGCTCTAAGCCACATAAAGAA-CAATCGTGAAGCCATGGATAAGCTC 2031 ||||| ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||| | Sbjct 1862 AAGCATACGAGATAGCTTTAAGCCACATTA-GAAACAATCGTGAAGCAATGGACAAGATT 1920 Query 2032 GTTGAAGTGCTTCTCGAGAAAGAAACTATTGGC-GGTGACGAATTCAGGGCAATTCTTTC 2090 |||||| | ||||| |||||||| || || | | || || |||||| | ||| | || || Sbjct 1921 GTTGAAATACTTCTTGAGAAAGAGACAAT-GTCAGGCGATGAATTCCGAGCAGTCCTATC 1979 Query 2091 CGAGTTTACTGAGATCCCCCCGGAAAACCGAGTTCCTTCTTCAACA 2136 || || || || ||||| || |||||||| ||| ||||||||||| Sbjct 1980 TGAATTCACAGAAATCCCACCTGAAAACCGTGTTGCTTCTTCAACA 2025 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 88026556195 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5