BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT2G31970.1

Length=4371
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg344958 jgi|Araly1|344958|fgenesh1_pg.C_scaffold_4001300          2769    0.0  
  Ahg952500 jgi|Araly1|952500|scaffold_8000008.1                      1050    0.0  
  Ahg339096 jgi|Araly1|339096|fgenesh1_pg.C_scaffold_2001195           313    9e-84


> Ahg344958 jgi|Araly1|344958|fgenesh1_pg.C_scaffold_4001300
Length=3705

 Score = 2769 bits (1499),  Expect = 0.0
 Identities = 1615/1673 (97%), Gaps = 0/1673 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  167   ATGAGTACGGTCGATAAAATGTTGATCAAGGGTATAAGAAGCTTCGACCCAGAAAATAAG  226
             ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1     ATGAGTACGGTCGATAAAATGCTGATCAAGGGCATCAGAAGCTTCGACCCAGAAAATAAG  60

Query  227   AACGTTGTTACTTTCTTCAGACCTTTAACCCTAATCGTCGGCGCTAACGGAGCCGGAAAA  286
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct  61    AACGTTGTTACCTTCTTCAGACCTTTAACCCTAATCGTCGGTGCCAACGGAGCCGGAAAA  120

Query  287   ACTACGATTATAGAGTGTTTAAAGGTGTCTTGTACCGGAGAGTTGCCACCGAACGCGAGG  346
             |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||
Sbjct  121   ACTACGATTATAGAGTGTTTAAAGGTCTCTTGCACTGGAGAGTTGCCACCGAACGCAAGG  180

Query  347   TCTGGTCATAGCTTCATTCATGACCCTAAGGTTGCTGGAGAAACGGAGACAAAAGCACAA  406
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct  181   TCTGGTCATAGCTTCATTCATGACCCCAAGGTTGCCGGGGAAACGGAGACAAAAGCACAA  240

Query  407   ATAAAGCTGAGATTCAAGACAGCTGCAGGGAAGGATGTGGTATGTATAAGGTCATTTCAG  466
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  241   ATTAAGCTGAGATTCAAGACAGCTGCAGGGAAGGATGTGGTATGCATAAGGTCATTTCAG  300

Query  467   TTGACGCAAAAGGCTTCAAAGATGGAGTACAAGGCTATTGAGAGTGTGCTTCAAACCATT  526
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301   TTGACGCAAAAGGCTTCAAAGATGGAGTACAAGGCTATTGAGAGTGTGCTTCAAACCATT  360

Query  527   AATCCTCACACTGGAGAGAAAGTATGTCTCAGCTACAGATGCGCTGACATGGATAGGGAG  586
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361   AATCCTCACACTGGAGAGAAAGTATGTCTCAGCTACAGATGCGCTGACATGGATAGGGAG  420

Query  587   ATACCAGCTTTGATGGGTGTGTCAAAAGCTATTTTAGAAAACGTCATATTTGTGCATCAG  646
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  421   ATACCAGCTTTGATGGGTGTGTCAAAAGCTATTTTAGAAAACGTCATCTTTGTGCATCAG  480

Query  647   GATGAGTCTAACTGGCCACTGCAAGATCCTTCTACTTTGAAAAAGAAGTTTGATGATATT  706
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481   GATGAGTCTAACTGGCCACTGCAAGATCCTTCTACTTTGAAAAAGAAGTTTGATGATATT  540

Query  707   TTCTCAGCCACCAGATATACAAAGGCTCTGGAAGTTATTAAGAAACTTCACAAGGATCAA  766
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  541   TTTTCAGCCACCAGATATACAAAGGCTCTGGAAGTTATTAAGAAACTTCACAAGGATCAA  600

Query  767   GCTCAGGAGATAAAAACTTTCAAGTTAAAATTGGAAAATCTGCAGACCTTGAAAGACGCA  826
             |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct  601   GCTCAGGAAATAAAAACTTTTAAGTTAAAGTTGGAAAACCTGCAGACCTTGAAAGATGCA  660

Query  827   GCTTATAAGCTTCGTGAGAGCATTGCTCAAGATCAAGAAAGGACAGAATCTTCAAAAGTT  886
             |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  661   GCTTATAAGCTTCGGGAGAGCATTGCGCAAGATCAAGAAAGGACAGAATCTTCAAAAGTG  720

Query  887   CAGATGTTGGAACTGGAAACCAGTGTTCAGAAAGTTGATGCTGAAGTTCATAATAAGGAA  946
             |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  721   CAGATGTTGGAACTGGAAACCAGCATTCAGAAAGTTGATGCTGAAGTTCATAATAAGGAA  780

Query  947   ATGATGTTAAAAGATCTGAGAAAGCTCCAGGACCAAGTATCAATAAAAACTGCGGAAAGG  1006
             |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  781   ATGATGTTAAAAGATCTGAGAAAGCTACAAGACCAAGTATCAAGAAAAACTGCGGAAAGG  840

Query  1007  AGCACCTTGTTTAAGGAGCAGCAGAGACAGTATGCAGCATTACCTGAGGAAAATGAAGAT  1066
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841   AGCACCTTGTTTAAGGAGCAGCAGAGACAGTATGCAGCATTACCTGAGGAAAATGAAGAT  900

Query  1067  ACTATTGAAGAATTGAAAGAATGGAAAAGCAAGTTTGAAGAAAGACTTGCTCTTTTGGGG  1126
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct  901   ACTATTGAAGAACTGAAAGAATGGAAAAGCAAGTTTGAAGAAAGAATTGCTCTTTTGGAG  960

Query  1127  ACCAAAATTCGAAAAATGGAGAGAGAGATGGTTGACACAGAAACTACAATTTCTTCGCTT  1186
             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct  961   ACCAAAATTCGAAAAATGGAGAGAGAGATGGATGACACAGCAACTACAATTTATTCGCTT  1020

Query  1187  CACAATGCAAAAACTAACTATATGCTGGAGATCAGCAAGCTACAAACAGAAGCTGAAGCT  1246
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1021  AACAATGCAAAAACTAACTATATGCTGGAGATCAGCAAGCTACAAACAGAAGCTGAAGCT  1080

Query  1247  CATATGCTGCTGAAGAATGAAAGAGATTCTACCATCCAGAACAtttttttCCATTACAAT  1306
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||
Sbjct  1081  CATATGCTGCTGAAGAATGAAAGAGATTCTACCATTCAGAAAATTTTTTCCCATCACAAT  1140

Query  1307  TTAGGAAATGTTCCTAGTACCCCCTTCAGTACTGAGGTAGTTTTGAATCTCACAAATCGA  1366
             |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1141  TTAGGAAATGTTCCTAGTACTCCCTTCGGTACTGAGGTAGTTTTGAATCTCACAAATCGA  1200

Query  1367  ATAAAATCAAGACTGGGTGAACTTGAGATGGATTTGCTCGATAAGAAGAAATCAAATGAA  1426
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1201  ATAAAATCAAGACTGGGTGAACTTGAGATGGACTTGCTCGATAAGAAGAAATCAAATGAA  1260

Query  1427  ACTGCTCTAAGTACGGCTTGGGATTGCTATATGGATGCTAATGACCGTTGGAAAAGCATC  1486
             |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| 
Sbjct  1261  ACTGCTCTAAGTACAGCTTGGGATTGCTATATGGATGCTAATGATCGTTGGAAAAGCATT  1320

Query  1487  GAAGCTCAGAAACGAGCTAAAGATGAAATCAAGATGGGCATATCAAAACGCATAGAAGAG  1546
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1321  GAAGCTCAGAAACGAGCTAAAGACGAAATCAAGATGGGCATATCAAAACGCATAGAAGAG  1380

Query  1547  AAAGAAATTGAGCGTGATTCATTTGAATTCGAAATTTCCACTGTGGATGTTAAACAAACT  1606
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1381  AAAGAAATTGAGCGTGATTCATTTGAATTCGAAATTTCCACTGTGAATGTTAAACAAACT  1440

Query  1607  GATGAAAGAGAGAAACAAGTGCAAGTTGAGCTTGAGAGAAAGACAAAACAGAATTCTGAA  1666
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  1441  GATGAAAGAGAGAAACAAGTGCAAATTGAGCTTGAGAGAAAGACAACACAGAATTCTGAA  1500

Query  1667  AGGGGATTTGAATCCAAAATAGAACAGAAACAGCATGAAATATACAGCTTGGAGCATAAA  1726
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct  1501  TTGGGATTTGAATCCAAAATAGAACAGAAACAGCATGAAATCTACAGCATGGAGCATAAA  1560

Query  1727  ATCAAGACACTGAATCGAGAAAGAGACGTTATGGCTGGTGATGCTGAGGATAGAGTGAAA  1786
             || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1561  ATTAAGACACTGAATCGAGAAAGAGATGTTATGGCTGGTGATGCTGAGGATAGAGTGAAA  1620

Query  1787  TTGTCTTTAAAGAAGACGGAACAGGAGAATCTTAAGAAGAAACACAAAAAGAT  1839
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1621  TTGTCTTTAAAGAAGACGGAACAGGAGAATCTTAGGAAGAAACACAAAAAGAT  1673


 Score = 2193 bits (1187),  Expect = 0.0
 Identities = 1339/1408 (95%), Gaps = 28/1408 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1933  GTCAATTGAAAGGGAATATGATGACCTCAGTTTGAAATCCCGAGAAGCAGAAAAGGAGGT  1992
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  1674  GTCAATTGAAAGGGAATATGATGACCTGAGTTTGAAATCCCGACAAGCAGAAAAGGAGGT  1733

Query  1993  CAACATGTTGCAGATGAAGATACAAGAAGTAAACAATAGCCTATTCAAGCATAACAAGGA  2052
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  1734  CAACATGTTGCAGATGAAGATACAAGAAGTAAACAATAGCCTATTCAAGCACAACAAGGA  1793

Query  2053  TACAGAATCAAGAAAGAGATACATTGAGTCCAAGCTTCAGGCCTTAAAACAGGAATCAGT  2112
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1794  TACAGAATCAAGAAAGAAATACATTGAGTCCAAGCTTCAGGCCTTAAAACAGGAATCAGT  1853

Query  2113  TACCATTGATGCTTATCCCAAATTGTTGGAGTCGGCTAAGGACAAAAGAGATGACCGTAA  2172
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  1854  TACCATTGATGCTTATCCCAAATTGTTGGAGTCGGCTAAGGACGAAAGAGATGACCGTAA  1913

Query  2173  ACGCGAA-TATAACATGGCAAATGGTATGCGTC-AGATGTTTGAACCTTTTGAGAAACGA  2230
             | || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |   |
Sbjct  1914  AAGC-AAGTATAACATGGCAAATGGTATGCG-CAAGATGTTTGAACCTTTTGAGGATTTA  1971

Query  2231  GCACGTCAAGAGCATTCTTGTCCTTGCTGCGAGCGCTCTTTTACAGCTGATGAAGAGGCT  2290
             ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct  1972  GCACGTCAACATCATTATTGTCCTTGCTGTGAGCGCTCTTTTACAACTGATGAAGAGGAT  2031

Query  2291  AGCTTTATTAAGAAGCAAAGGGTAAAGGCTTCAAGCACAGGGGAGCATCTTAAAGCATTA  2350
             |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct  2032  AGCTTTGTTAAGAAGCAAAGGGTAAAGGCTTCAACCACGGGGGAGCATCTTAAAGAATTA  2091

Query  2351  GCAGTGGAGTCTTCCAATGCTGACTCTGTATTTCAACAGCTAGACAAACTACGGGCAGTT  2410
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2092  GCAGTGGAGTCTTCCAATGCTGACTCTGTATTTCAGCAGCTAGACAAACTACGGGCAGTT  2151

Query  2411  TTTGAAGAATACTCGAAACTAACTACTGAAATTATTCCTCTCGCTGAGAAAACTTTGCAA  2470
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2152  TTTGAAGAATACTCGAAACTAACTAGTGAAATTATTCCTCTCGCTGAGAAAACTTTGCAA  2211

Query  2471  GAGCATACAGAAGAGCTGGGTCAGAAGTCTGAAGCTCTTGATGATGTATTAGGAATCTCT  2530
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2212  GAGCATACAGAAGAGCTGGGTCAGAAGTCTCAAGCTCTTGATGATGTATTAGGAATCTCT  2271

Query  2531  GCACAGATAAAAGCTGACAAAGACTCGATTGAAGCACTGGTGCAGCCCCTCGAAAATGCT  2590
             || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct  2272  GCCCAGATAAAAGCTGACAAAGACTCAATTGAAGCACTGGTGCATCCCCTGGAAAATGCT  2331

Query  2591  GACAGGATCTTTCAGGAAATCGTATCCTACCAAAAGCAAATTGAAGATCTTGAATATAAG  2650
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2332  GACAGGACCTTTCAGGAAATCGTATCCTACCAAAAGCAAATTGAAGATCTTGAATATAAG  2391

Query  2651  CTTGATTTTAGGGGTCTTGGGGTTAAAACTATGGAAGAAATCCAATCAGAATTAAGTAGC  2710
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2392  CTTGATTTCAGGGGTCTTGGGGTTAAAACTATGGAAGAAATCCAATCAGAATTAAGTAGC  2451

Query  2711  CTCCAAAGCAGCAAGGATAAATTGCACGGTGAGCTGGAGAAACTTAGAGATGACCAGATT  2770
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2452  CTCCAAAGCAGCAAGGATAAATTGCACGGTGAGCTGGAGAAACTTAGAGATGACCAGATT  2511

Query  2771  TACATGGAACGTGATATATCATGCCTCCAGGCCAGATGGCATGCAGTAAGGGAGGAGAAG  2830
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  2512  TACATGGAACGTGATATATCATGCCTCCAGGCCAGATGGCATGCAGTAAGGGAAGAGAAG  2571

Query  2831  GCCAAGGCAGCCAATTTGTTACGGGACGTTACAAAGGCAGAAGAAGACCTGGAGCGTTTA  2890
             || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2572  GCTAAGGCAGCCAATTTGTTACGCGACGTTACAAAGGCAGAAGAAGACCTGGAGCGTTTA  2631

Query  2891  GCCGAGGAGAAAAGTCAACTTGACCTCGATGTGAAGTATTTGACCGAGGCCCTGGGCCCT  2950
              |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| 
Sbjct  2632  ACCGAGGAGAAAAGTCAACTTGACCTCGACGTGAAGTATTTGACCGAGGCACTGGGCCCG  2691

Query  2951  TTATCCAAGGAAAAAGAGCAATTACTGAGTGACTACAATGATATGAAGATTAGACGTAAT  3010
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2692  TTATCCAAGGAAAAAGAGCAGTTACTGAGTGACTACAATGATATGAAGATTAGACGTAAT  2751

Query  3011  CAAGAGTATGAAGAACTGGCTGAGAAAAAGAGAAACTACCAACAGGAAGTTGAGGCATTA  3070
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2752  CAAGAGTATGAAGAACTGGCTGACAAAAAGAGAAACTACCAACAGGAAGTTGAGGCATTA  2811

Query  3071  CTCAAGGCCAGTT--A---TAAA--A-TA-----A-A--TG----A---G-TATCATGAT  3106
             |||||||||||||  |   ||||  | ||     | |  ||    |   | |||||||||
Sbjct  2812  CTCAAGGCCAGTTCTAAGATAAATGAATATGCTTACAGCTGCTTCACCAGGTATCATGAT  2871

Query  3107  CTGAAGAAAGGGGAGCGCTTAGATGATATTCAAGAAAAGCAGCGGTTATCTGATTCTCAG  3166
             ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct  2872  CTGAAGAAAGGGGAGCGCTTAAATGATATTCAAGAAAAGCAGCGGTTATCCGAATCTCAG  2931

Query  3167  CTTCAGAGCTGTGAAGCTAGAAAGAATGAACTTGCAGGTGAACTGAACAGAAATAAAGAC  3226
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2932  CTTCAGAGCTGTGAAGCTAGAAAGAATGAACTTGCAGGTGAACTGAACAGAAATAAAGAC  2991

Query  3227  TTGATGCGGAATCAAGATCAACTGAGAAGAAATATAGAGGATAACTTGAACTACCGGACA  3286
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2992  TTGATGCGGAATCAAGATCAACTGAGAAGAAATATAGAGGATAACTTGAACTACCGGACA  3051

Query  3287  ACAAAAGCAAAAGTTGAGGAGCTTACAC  3314
             ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3052  ACAAAAGCAAAAGTTGAGGAGCTTACAC  3079


 Score =  612 bits (331),  Expect = 8e-174
 Identities = 336/338 (99%), Gaps = 2/338 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  3421  GCTGAACCGGTGTCGTGGAACAGTGTCTGTTTACGAGAGCAGTATTTCAAAGAACAGAGT  3480
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3108  GCTGAACCGGTGTCGTGGAACAGTGTCTGTTTACGAGAGCAGTATTTCAAAGAACAGAGT  3167

Query  3481  GGAGCTAAAA-CAGGCACAATACAAGGACATAGATAAGCGGCACTTTGATCAACTGATCC  3539
             |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3168  GGAGCTAAAAGC-GGCACAATACAAGGACATAGATAAGCGGCACTTTGATCAACTGATCC  3226

Query  3540  AGCTAAAGACAACTGAAATGGCAAATAAAGACTTGGATAGATACTACAATGCCCTTGACA  3599
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3227  AGCTAAAGACAACTGAAATGGCAAATAAAGACTTGGATAGATACTACAATGCCCTTGACA  3286

Query  3600  AAGCACTAATGCGCTTCCACACAATGAAAATGGAGGAAATAAATAAGATTATAAGGGAAC  3659
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3287  AAGCACTAATGCGCTTCCACACAATGAAAATGGAGGAAATAAATAAGATTATAAGGGAAC  3346

Query  3660  TGTGGCAGCAGACATACAGAGGTCAAGATATGGATTACATACGAATACACTCAGATTCCG  3719
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3347  TGTGGCAGCAGACATACAGAGGTCAAGATATGGATTACATACGAATACACTCAGATTCCG  3406

Query  3720  AAGGTGCAGGCACCCGCTCTTACAGCTACAAGGTTCTT  3757
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3407  AAGGTGCAGGCACCCGCTCTTACAGCTACAAGGTTCTT  3444


 Score =  472 bits (255),  Expect = 1e-131
 Identities = 263/267 (99%), Gaps = 0/267 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  3812  AAGGTTCTTGCTTCATTGATAATTAGGTTGGCTTTAGCCGAGACATTTTGCTTAAACTGT  3871
             ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  3436  AAGGTTCTTGCTTCATTGATAATTAGGCTGGCTTTAGCTGAGACATTTTGCTTAAACTGT  3495

Query  3872  GGAATATTAGCCCTTGATGAGCCAACTACAAACCTGGATGGGCCCAATTCAGAATCTCTT  3931
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3496  GGAATATTAGCCCTCGATGAGCCAACTACAAACCTGGATGGGCCCAATTCAGAATCTCTT  3555

Query  3932  GCAGGAGCTCTTCTTAGGATCATGGAAGACAGAAAGGGCCAAGAGAATTTCCAACTCATA  3991
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3556  GCAGGAGCTCTTCTTAGGATCATGGAAGACAGAAAGGGCCAAGAGAATTTCCAACTCATA  3615

Query  3992  GTCATTACCCACGATGAACGCTTTGCTCAAATGATTGGCCAAAGGCAACATGCTGAAAAA  4051
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  3616  GTCATTACCCACGATGAACGCTTTGCTCAAATGATTGGCCAACGGCAACATGCTGAAAAA  3675

Query  4052  TATTACCGGGTCGCAAAAGATGATATG  4078
             |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3676  TATTACCGGGTCGCAAAAGATGATATG  3702


> Ahg952500 jgi|Araly1|952500|scaffold_8000008.1
Length=601

 Score = 1050 bits (568),  Expect = 0.0
 Identities = 584/592 (99%), Gaps = 0/592 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  3546  AGACAACTGAAATGGCAAATAAAGACTTGGATAGATACTACAATGCCCTTGACAAAGCAC  3605
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  10    AGACAACTGAAATGGCAAATAAAGACTTGGATAGATACTACAATGCCCTTGACAAAGCAC  69

Query  3606  TAATGCGCTTCCACACAATGAAAATGGAGGAAATAAATAAGATTATAAGGGAACTGTGGC  3665
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  70    TAATGCGCTTCCACACAATGAAAATGGAGGAAATAAATAAGATTATAAGGGAACTGTGGC  129

Query  3666  AGCAGACATACAGAGGTCAAGATATGGATTACATACGAATACACTCAGATTCCGAAGGTG  3725
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  130   AGCAGACATACAGAGGTCAAGATATGGATTACATACGAATACACTCAGATTCCGAAGGTG  189

Query  3726  CAGGCACCCGCTCTTACAGCTACAAGGTTCTTATGCAGACTGGTGATACAGAACTTGAAA  3785
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  190   CAGGCACCCGCTCTTACAGCTACAAGGTTCTTATGCAGACTGGTGATACAGAACTTGAAA  249

Query  3786  TGAGAGGAAGATGCAGTGCAGGTCAAAAGGTTCTTGCTTCATTGATAATTAGGTTGGCTT  3845
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  250   TGAGAGGAAGATGCAGCGCAGGTCAAAAGGTTCTTGCTTCATTGATAATTAGGTTGGCTT  309

Query  3846  TAGCCGAGACATTTTGCTTAAACTGTGGAATATTAGCCCTTGATGAGCCAACTACAAACC  3905
             |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  310   TAGCTGAGACATTTTGCTTAAACTGTGGAATATTAGCCCTCGATGAGCCAACTACAAACC  369

Query  3906  TGGATGGGCCCAATTCAGAATCTCTTGCAGGAGCTCTTCTTAGGATCATGGAAGACAGAA  3965
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370   TGGATGGGCCCAATTCAGAATCTCTTGCAGGAGCTCTTCTTAGGATCATGGAAGACAGAA  429

Query  3966  AGGGCCAAGAGAATTTCCAACTCATAGTCATTACCCACGATGAACGCTTTGCTCAAATGA  4025
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  430   AGGGCCAAGAGAATTTCCAACTCATAGTCATTACCCACGATGAACGCTTTGCTCAAATGA  489

Query  4026  TTGGCCAAAGGCAACATGCTGAAAAATATTACCGGGTCGCAAAAGATGATATGCAACACA  4085
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  490   TTGGCCAACGGCAACATGCTGAAAAATATTACCGGGTCGCAAAAGATGATATGCAACACA  549

Query  4086  GCATAATCGAGGCCCAAGAGATCTTTGATTGATAAACCAGTGGCTTGTTCTA  4137
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||
Sbjct  550   GCATAATCGAGGCCCAAGAGATCTTTGATTGATAAATTGGTTGCTTGTTCTA  601


> Ahg339096 jgi|Araly1|339096|fgenesh1_pg.C_scaffold_2001195
Length=1329

 Score =  313 bits (169),  Expect = 9e-84
 Identities = 197/211 (93%), Gaps = 0/211 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  2514  ATGTATTAGGAATCTCTGCACAGATAAAAGCTGACAAAGACTCGATTGAAGCACTGGTGC  2573
             ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  131   ATGTATTAGAAATCTCTGCCCAGACAAAAGCTGGCAAAGACTCAATTGAAGCACTGGTGC  190

Query  2574  AGCCCCTCGAAAATGCTGACAGGATCTTTCAGGAAATCGTATCCTACCAAAAGCAAATTG  2633
             ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  191   AGCCCCTGGAAAATGCTGGCAGGATCTTTCAGGAAATCGTATCCTACCAAAAGCAAATTG  250

Query  2634  AAGATCTTGAATATAAGCTTGATTTTAGGGGTCTTGGGGTTAAAACTATGGAAGAAATCC  2693
             ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  251   AAGATCTTGAATATAAGCTCGATTTCAGGGGTCTTTGGGCTAAAACTATGGAAGAAATCC  310

Query  2694  AATCAGAATTAAGTAGCCTCCAAAGCAGCAA  2724
             |||||||| |||||| |||||| ||||||||
Sbjct  311   AATCAGAACTAAGTACCCTCCATAGCAGCAA  341



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 165322097112


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5