BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G31970.1 Length=4371 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg344958 jgi|Araly1|344958|fgenesh1_pg.C_scaffold_4001300 2769 0.0 Ahg952500 jgi|Araly1|952500|scaffold_8000008.1 1050 0.0 Ahg339096 jgi|Araly1|339096|fgenesh1_pg.C_scaffold_2001195 313 9e-84 > Ahg344958 jgi|Araly1|344958|fgenesh1_pg.C_scaffold_4001300 Length=3705 Score = 2769 bits (1499), Expect = 0.0 Identities = 1615/1673 (97%), Gaps = 0/1673 (0%) Strand=Plus/Plus Query 167 ATGAGTACGGTCGATAAAATGTTGATCAAGGGTATAAGAAGCTTCGACCCAGAAAATAAG 226 ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGAGTACGGTCGATAAAATGCTGATCAAGGGCATCAGAAGCTTCGACCCAGAAAATAAG 60 Query 227 AACGTTGTTACTTTCTTCAGACCTTTAACCCTAATCGTCGGCGCTAACGGAGCCGGAAAA 286 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 61 AACGTTGTTACCTTCTTCAGACCTTTAACCCTAATCGTCGGTGCCAACGGAGCCGGAAAA 120 Query 287 ACTACGATTATAGAGTGTTTAAAGGTGTCTTGTACCGGAGAGTTGCCACCGAACGCGAGG 346 |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 121 ACTACGATTATAGAGTGTTTAAAGGTCTCTTGCACTGGAGAGTTGCCACCGAACGCAAGG 180 Query 347 TCTGGTCATAGCTTCATTCATGACCCTAAGGTTGCTGGAGAAACGGAGACAAAAGCACAA 406 |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct 181 TCTGGTCATAGCTTCATTCATGACCCCAAGGTTGCCGGGGAAACGGAGACAAAAGCACAA 240 Query 407 ATAAAGCTGAGATTCAAGACAGCTGCAGGGAAGGATGTGGTATGTATAAGGTCATTTCAG 466 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 241 ATTAAGCTGAGATTCAAGACAGCTGCAGGGAAGGATGTGGTATGCATAAGGTCATTTCAG 300 Query 467 TTGACGCAAAAGGCTTCAAAGATGGAGTACAAGGCTATTGAGAGTGTGCTTCAAACCATT 526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 TTGACGCAAAAGGCTTCAAAGATGGAGTACAAGGCTATTGAGAGTGTGCTTCAAACCATT 360 Query 527 AATCCTCACACTGGAGAGAAAGTATGTCTCAGCTACAGATGCGCTGACATGGATAGGGAG 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 AATCCTCACACTGGAGAGAAAGTATGTCTCAGCTACAGATGCGCTGACATGGATAGGGAG 420 Query 587 ATACCAGCTTTGATGGGTGTGTCAAAAGCTATTTTAGAAAACGTCATATTTGTGCATCAG 646 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 421 ATACCAGCTTTGATGGGTGTGTCAAAAGCTATTTTAGAAAACGTCATCTTTGTGCATCAG 480 Query 647 GATGAGTCTAACTGGCCACTGCAAGATCCTTCTACTTTGAAAAAGAAGTTTGATGATATT 706 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GATGAGTCTAACTGGCCACTGCAAGATCCTTCTACTTTGAAAAAGAAGTTTGATGATATT 540 Query 707 TTCTCAGCCACCAGATATACAAAGGCTCTGGAAGTTATTAAGAAACTTCACAAGGATCAA 766 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TTTTCAGCCACCAGATATACAAAGGCTCTGGAAGTTATTAAGAAACTTCACAAGGATCAA 600 Query 767 GCTCAGGAGATAAAAACTTTCAAGTTAAAATTGGAAAATCTGCAGACCTTGAAAGACGCA 826 |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct 601 GCTCAGGAAATAAAAACTTTTAAGTTAAAGTTGGAAAACCTGCAGACCTTGAAAGATGCA 660 Query 827 GCTTATAAGCTTCGTGAGAGCATTGCTCAAGATCAAGAAAGGACAGAATCTTCAAAAGTT 886 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 GCTTATAAGCTTCGGGAGAGCATTGCGCAAGATCAAGAAAGGACAGAATCTTCAAAAGTG 720 Query 887 CAGATGTTGGAACTGGAAACCAGTGTTCAGAAAGTTGATGCTGAAGTTCATAATAAGGAA 946 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 CAGATGTTGGAACTGGAAACCAGCATTCAGAAAGTTGATGCTGAAGTTCATAATAAGGAA 780 Query 947 ATGATGTTAAAAGATCTGAGAAAGCTCCAGGACCAAGTATCAATAAAAACTGCGGAAAGG 1006 |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 781 ATGATGTTAAAAGATCTGAGAAAGCTACAAGACCAAGTATCAAGAAAAACTGCGGAAAGG 840 Query 1007 AGCACCTTGTTTAAGGAGCAGCAGAGACAGTATGCAGCATTACCTGAGGAAAATGAAGAT 1066 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 AGCACCTTGTTTAAGGAGCAGCAGAGACAGTATGCAGCATTACCTGAGGAAAATGAAGAT 900 Query 1067 ACTATTGAAGAATTGAAAGAATGGAAAAGCAAGTTTGAAGAAAGACTTGCTCTTTTGGGG 1126 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | Sbjct 901 ACTATTGAAGAACTGAAAGAATGGAAAAGCAAGTTTGAAGAAAGAATTGCTCTTTTGGAG 960 Query 1127 ACCAAAATTCGAAAAATGGAGAGAGAGATGGTTGACACAGAAACTACAATTTCTTCGCTT 1186 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct 961 ACCAAAATTCGAAAAATGGAGAGAGAGATGGATGACACAGCAACTACAATTTATTCGCTT 1020 Query 1187 CACAATGCAAAAACTAACTATATGCTGGAGATCAGCAAGCTACAAACAGAAGCTGAAGCT 1246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 AACAATGCAAAAACTAACTATATGCTGGAGATCAGCAAGCTACAAACAGAAGCTGAAGCT 1080 Query 1247 CATATGCTGCTGAAGAATGAAAGAGATTCTACCATCCAGAACAtttttttCCATTACAAT 1306 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| Sbjct 1081 CATATGCTGCTGAAGAATGAAAGAGATTCTACCATTCAGAAAATTTTTTCCCATCACAAT 1140 Query 1307 TTAGGAAATGTTCCTAGTACCCCCTTCAGTACTGAGGTAGTTTTGAATCTCACAAATCGA 1366 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 TTAGGAAATGTTCCTAGTACTCCCTTCGGTACTGAGGTAGTTTTGAATCTCACAAATCGA 1200 Query 1367 ATAAAATCAAGACTGGGTGAACTTGAGATGGATTTGCTCGATAAGAAGAAATCAAATGAA 1426 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 ATAAAATCAAGACTGGGTGAACTTGAGATGGACTTGCTCGATAAGAAGAAATCAAATGAA 1260 Query 1427 ACTGCTCTAAGTACGGCTTGGGATTGCTATATGGATGCTAATGACCGTTGGAAAAGCATC 1486 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1261 ACTGCTCTAAGTACAGCTTGGGATTGCTATATGGATGCTAATGATCGTTGGAAAAGCATT 1320 Query 1487 GAAGCTCAGAAACGAGCTAAAGATGAAATCAAGATGGGCATATCAAAACGCATAGAAGAG 1546 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 GAAGCTCAGAAACGAGCTAAAGACGAAATCAAGATGGGCATATCAAAACGCATAGAAGAG 1380 Query 1547 AAAGAAATTGAGCGTGATTCATTTGAATTCGAAATTTCCACTGTGGATGTTAAACAAACT 1606 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1381 AAAGAAATTGAGCGTGATTCATTTGAATTCGAAATTTCCACTGTGAATGTTAAACAAACT 1440 Query 1607 GATGAAAGAGAGAAACAAGTGCAAGTTGAGCTTGAGAGAAAGACAAAACAGAATTCTGAA 1666 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1441 GATGAAAGAGAGAAACAAGTGCAAATTGAGCTTGAGAGAAAGACAACACAGAATTCTGAA 1500 Query 1667 AGGGGATTTGAATCCAAAATAGAACAGAAACAGCATGAAATATACAGCTTGGAGCATAAA 1726 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| Sbjct 1501 TTGGGATTTGAATCCAAAATAGAACAGAAACAGCATGAAATCTACAGCATGGAGCATAAA 1560 Query 1727 ATCAAGACACTGAATCGAGAAAGAGACGTTATGGCTGGTGATGCTGAGGATAGAGTGAAA 1786 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 ATTAAGACACTGAATCGAGAAAGAGATGTTATGGCTGGTGATGCTGAGGATAGAGTGAAA 1620 Query 1787 TTGTCTTTAAAGAAGACGGAACAGGAGAATCTTAAGAAGAAACACAAAAAGAT 1839 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1621 TTGTCTTTAAAGAAGACGGAACAGGAGAATCTTAGGAAGAAACACAAAAAGAT 1673 Score = 2193 bits (1187), Expect = 0.0 Identities = 1339/1408 (95%), Gaps = 28/1408 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1933 GTCAATTGAAAGGGAATATGATGACCTCAGTTTGAAATCCCGAGAAGCAGAAAAGGAGGT 1992 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1674 GTCAATTGAAAGGGAATATGATGACCTGAGTTTGAAATCCCGACAAGCAGAAAAGGAGGT 1733 Query 1993 CAACATGTTGCAGATGAAGATACAAGAAGTAAACAATAGCCTATTCAAGCATAACAAGGA 2052 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1734 CAACATGTTGCAGATGAAGATACAAGAAGTAAACAATAGCCTATTCAAGCACAACAAGGA 1793 Query 2053 TACAGAATCAAGAAAGAGATACATTGAGTCCAAGCTTCAGGCCTTAAAACAGGAATCAGT 2112 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1794 TACAGAATCAAGAAAGAAATACATTGAGTCCAAGCTTCAGGCCTTAAAACAGGAATCAGT 1853 Query 2113 TACCATTGATGCTTATCCCAAATTGTTGGAGTCGGCTAAGGACAAAAGAGATGACCGTAA 2172 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1854 TACCATTGATGCTTATCCCAAATTGTTGGAGTCGGCTAAGGACGAAAGAGATGACCGTAA 1913 Query 2173 ACGCGAA-TATAACATGGCAAATGGTATGCGTC-AGATGTTTGAACCTTTTGAGAAACGA 2230 | || || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | | Sbjct 1914 AAGC-AAGTATAACATGGCAAATGGTATGCG-CAAGATGTTTGAACCTTTTGAGGATTTA 1971 Query 2231 GCACGTCAAGAGCATTCTTGTCCTTGCTGCGAGCGCTCTTTTACAGCTGATGAAGAGGCT 2290 ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | Sbjct 1972 GCACGTCAACATCATTATTGTCCTTGCTGTGAGCGCTCTTTTACAACTGATGAAGAGGAT 2031 Query 2291 AGCTTTATTAAGAAGCAAAGGGTAAAGGCTTCAAGCACAGGGGAGCATCTTAAAGCATTA 2350 |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| Sbjct 2032 AGCTTTGTTAAGAAGCAAAGGGTAAAGGCTTCAACCACGGGGGAGCATCTTAAAGAATTA 2091 Query 2351 GCAGTGGAGTCTTCCAATGCTGACTCTGTATTTCAACAGCTAGACAAACTACGGGCAGTT 2410 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2092 GCAGTGGAGTCTTCCAATGCTGACTCTGTATTTCAGCAGCTAGACAAACTACGGGCAGTT 2151 Query 2411 TTTGAAGAATACTCGAAACTAACTACTGAAATTATTCCTCTCGCTGAGAAAACTTTGCAA 2470 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2152 TTTGAAGAATACTCGAAACTAACTAGTGAAATTATTCCTCTCGCTGAGAAAACTTTGCAA 2211 Query 2471 GAGCATACAGAAGAGCTGGGTCAGAAGTCTGAAGCTCTTGATGATGTATTAGGAATCTCT 2530 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2212 GAGCATACAGAAGAGCTGGGTCAGAAGTCTCAAGCTCTTGATGATGTATTAGGAATCTCT 2271 Query 2531 GCACAGATAAAAGCTGACAAAGACTCGATTGAAGCACTGGTGCAGCCCCTCGAAAATGCT 2590 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 2272 GCCCAGATAAAAGCTGACAAAGACTCAATTGAAGCACTGGTGCATCCCCTGGAAAATGCT 2331 Query 2591 GACAGGATCTTTCAGGAAATCGTATCCTACCAAAAGCAAATTGAAGATCTTGAATATAAG 2650 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2332 GACAGGACCTTTCAGGAAATCGTATCCTACCAAAAGCAAATTGAAGATCTTGAATATAAG 2391 Query 2651 CTTGATTTTAGGGGTCTTGGGGTTAAAACTATGGAAGAAATCCAATCAGAATTAAGTAGC 2710 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2392 CTTGATTTCAGGGGTCTTGGGGTTAAAACTATGGAAGAAATCCAATCAGAATTAAGTAGC 2451 Query 2711 CTCCAAAGCAGCAAGGATAAATTGCACGGTGAGCTGGAGAAACTTAGAGATGACCAGATT 2770 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2452 CTCCAAAGCAGCAAGGATAAATTGCACGGTGAGCTGGAGAAACTTAGAGATGACCAGATT 2511 Query 2771 TACATGGAACGTGATATATCATGCCTCCAGGCCAGATGGCATGCAGTAAGGGAGGAGAAG 2830 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2512 TACATGGAACGTGATATATCATGCCTCCAGGCCAGATGGCATGCAGTAAGGGAAGAGAAG 2571 Query 2831 GCCAAGGCAGCCAATTTGTTACGGGACGTTACAAAGGCAGAAGAAGACCTGGAGCGTTTA 2890 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2572 GCTAAGGCAGCCAATTTGTTACGCGACGTTACAAAGGCAGAAGAAGACCTGGAGCGTTTA 2631 Query 2891 GCCGAGGAGAAAAGTCAACTTGACCTCGATGTGAAGTATTTGACCGAGGCCCTGGGCCCT 2950 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2632 ACCGAGGAGAAAAGTCAACTTGACCTCGACGTGAAGTATTTGACCGAGGCACTGGGCCCG 2691 Query 2951 TTATCCAAGGAAAAAGAGCAATTACTGAGTGACTACAATGATATGAAGATTAGACGTAAT 3010 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2692 TTATCCAAGGAAAAAGAGCAGTTACTGAGTGACTACAATGATATGAAGATTAGACGTAAT 2751 Query 3011 CAAGAGTATGAAGAACTGGCTGAGAAAAAGAGAAACTACCAACAGGAAGTTGAGGCATTA 3070 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2752 CAAGAGTATGAAGAACTGGCTGACAAAAAGAGAAACTACCAACAGGAAGTTGAGGCATTA 2811 Query 3071 CTCAAGGCCAGTT--A---TAAA--A-TA-----A-A--TG----A---G-TATCATGAT 3106 ||||||||||||| | |||| | || | | || | | ||||||||| Sbjct 2812 CTCAAGGCCAGTTCTAAGATAAATGAATATGCTTACAGCTGCTTCACCAGGTATCATGAT 2871 Query 3107 CTGAAGAAAGGGGAGCGCTTAGATGATATTCAAGAAAAGCAGCGGTTATCTGATTCTCAG 3166 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct 2872 CTGAAGAAAGGGGAGCGCTTAAATGATATTCAAGAAAAGCAGCGGTTATCCGAATCTCAG 2931 Query 3167 CTTCAGAGCTGTGAAGCTAGAAAGAATGAACTTGCAGGTGAACTGAACAGAAATAAAGAC 3226 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2932 CTTCAGAGCTGTGAAGCTAGAAAGAATGAACTTGCAGGTGAACTGAACAGAAATAAAGAC 2991 Query 3227 TTGATGCGGAATCAAGATCAACTGAGAAGAAATATAGAGGATAACTTGAACTACCGGACA 3286 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2992 TTGATGCGGAATCAAGATCAACTGAGAAGAAATATAGAGGATAACTTGAACTACCGGACA 3051 Query 3287 ACAAAAGCAAAAGTTGAGGAGCTTACAC 3314 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3052 ACAAAAGCAAAAGTTGAGGAGCTTACAC 3079 Score = 612 bits (331), Expect = 8e-174 Identities = 336/338 (99%), Gaps = 2/338 (1%) Strand=Plus/Plus Query 3421 GCTGAACCGGTGTCGTGGAACAGTGTCTGTTTACGAGAGCAGTATTTCAAAGAACAGAGT 3480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3108 GCTGAACCGGTGTCGTGGAACAGTGTCTGTTTACGAGAGCAGTATTTCAAAGAACAGAGT 3167 Query 3481 GGAGCTAAAA-CAGGCACAATACAAGGACATAGATAAGCGGCACTTTGATCAACTGATCC 3539 |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3168 GGAGCTAAAAGC-GGCACAATACAAGGACATAGATAAGCGGCACTTTGATCAACTGATCC 3226 Query 3540 AGCTAAAGACAACTGAAATGGCAAATAAAGACTTGGATAGATACTACAATGCCCTTGACA 3599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3227 AGCTAAAGACAACTGAAATGGCAAATAAAGACTTGGATAGATACTACAATGCCCTTGACA 3286 Query 3600 AAGCACTAATGCGCTTCCACACAATGAAAATGGAGGAAATAAATAAGATTATAAGGGAAC 3659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3287 AAGCACTAATGCGCTTCCACACAATGAAAATGGAGGAAATAAATAAGATTATAAGGGAAC 3346 Query 3660 TGTGGCAGCAGACATACAGAGGTCAAGATATGGATTACATACGAATACACTCAGATTCCG 3719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3347 TGTGGCAGCAGACATACAGAGGTCAAGATATGGATTACATACGAATACACTCAGATTCCG 3406 Query 3720 AAGGTGCAGGCACCCGCTCTTACAGCTACAAGGTTCTT 3757 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3407 AAGGTGCAGGCACCCGCTCTTACAGCTACAAGGTTCTT 3444 Score = 472 bits (255), Expect = 1e-131 Identities = 263/267 (99%), Gaps = 0/267 (0%) Strand=Plus/Plus Query 3812 AAGGTTCTTGCTTCATTGATAATTAGGTTGGCTTTAGCCGAGACATTTTGCTTAAACTGT 3871 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3436 AAGGTTCTTGCTTCATTGATAATTAGGCTGGCTTTAGCTGAGACATTTTGCTTAAACTGT 3495 Query 3872 GGAATATTAGCCCTTGATGAGCCAACTACAAACCTGGATGGGCCCAATTCAGAATCTCTT 3931 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3496 GGAATATTAGCCCTCGATGAGCCAACTACAAACCTGGATGGGCCCAATTCAGAATCTCTT 3555 Query 3932 GCAGGAGCTCTTCTTAGGATCATGGAAGACAGAAAGGGCCAAGAGAATTTCCAACTCATA 3991 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3556 GCAGGAGCTCTTCTTAGGATCATGGAAGACAGAAAGGGCCAAGAGAATTTCCAACTCATA 3615 Query 3992 GTCATTACCCACGATGAACGCTTTGCTCAAATGATTGGCCAAAGGCAACATGCTGAAAAA 4051 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3616 GTCATTACCCACGATGAACGCTTTGCTCAAATGATTGGCCAACGGCAACATGCTGAAAAA 3675 Query 4052 TATTACCGGGTCGCAAAAGATGATATG 4078 ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3676 TATTACCGGGTCGCAAAAGATGATATG 3702 > Ahg952500 jgi|Araly1|952500|scaffold_8000008.1 Length=601 Score = 1050 bits (568), Expect = 0.0 Identities = 584/592 (99%), Gaps = 0/592 (0%) Strand=Plus/Plus Query 3546 AGACAACTGAAATGGCAAATAAAGACTTGGATAGATACTACAATGCCCTTGACAAAGCAC 3605 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 AGACAACTGAAATGGCAAATAAAGACTTGGATAGATACTACAATGCCCTTGACAAAGCAC 69 Query 3606 TAATGCGCTTCCACACAATGAAAATGGAGGAAATAAATAAGATTATAAGGGAACTGTGGC 3665 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 70 TAATGCGCTTCCACACAATGAAAATGGAGGAAATAAATAAGATTATAAGGGAACTGTGGC 129 Query 3666 AGCAGACATACAGAGGTCAAGATATGGATTACATACGAATACACTCAGATTCCGAAGGTG 3725 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 130 AGCAGACATACAGAGGTCAAGATATGGATTACATACGAATACACTCAGATTCCGAAGGTG 189 Query 3726 CAGGCACCCGCTCTTACAGCTACAAGGTTCTTATGCAGACTGGTGATACAGAACTTGAAA 3785 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 190 CAGGCACCCGCTCTTACAGCTACAAGGTTCTTATGCAGACTGGTGATACAGAACTTGAAA 249 Query 3786 TGAGAGGAAGATGCAGTGCAGGTCAAAAGGTTCTTGCTTCATTGATAATTAGGTTGGCTT 3845 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 250 TGAGAGGAAGATGCAGCGCAGGTCAAAAGGTTCTTGCTTCATTGATAATTAGGTTGGCTT 309 Query 3846 TAGCCGAGACATTTTGCTTAAACTGTGGAATATTAGCCCTTGATGAGCCAACTACAAACC 3905 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 310 TAGCTGAGACATTTTGCTTAAACTGTGGAATATTAGCCCTCGATGAGCCAACTACAAACC 369 Query 3906 TGGATGGGCCCAATTCAGAATCTCTTGCAGGAGCTCTTCTTAGGATCATGGAAGACAGAA 3965 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 370 TGGATGGGCCCAATTCAGAATCTCTTGCAGGAGCTCTTCTTAGGATCATGGAAGACAGAA 429 Query 3966 AGGGCCAAGAGAATTTCCAACTCATAGTCATTACCCACGATGAACGCTTTGCTCAAATGA 4025 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 430 AGGGCCAAGAGAATTTCCAACTCATAGTCATTACCCACGATGAACGCTTTGCTCAAATGA 489 Query 4026 TTGGCCAAAGGCAACATGCTGAAAAATATTACCGGGTCGCAAAAGATGATATGCAACACA 4085 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 490 TTGGCCAACGGCAACATGCTGAAAAATATTACCGGGTCGCAAAAGATGATATGCAACACA 549 Query 4086 GCATAATCGAGGCCCAAGAGATCTTTGATTGATAAACCAGTGGCTTGTTCTA 4137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| Sbjct 550 GCATAATCGAGGCCCAAGAGATCTTTGATTGATAAATTGGTTGCTTGTTCTA 601 > Ahg339096 jgi|Araly1|339096|fgenesh1_pg.C_scaffold_2001195 Length=1329 Score = 313 bits (169), Expect = 9e-84 Identities = 197/211 (93%), Gaps = 0/211 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2514 ATGTATTAGGAATCTCTGCACAGATAAAAGCTGACAAAGACTCGATTGAAGCACTGGTGC 2573 ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 131 ATGTATTAGAAATCTCTGCCCAGACAAAAGCTGGCAAAGACTCAATTGAAGCACTGGTGC 190 Query 2574 AGCCCCTCGAAAATGCTGACAGGATCTTTCAGGAAATCGTATCCTACCAAAAGCAAATTG 2633 ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 191 AGCCCCTGGAAAATGCTGGCAGGATCTTTCAGGAAATCGTATCCTACCAAAAGCAAATTG 250 Query 2634 AAGATCTTGAATATAAGCTTGATTTTAGGGGTCTTGGGGTTAAAACTATGGAAGAAATCC 2693 ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| Sbjct 251 AAGATCTTGAATATAAGCTCGATTTCAGGGGTCTTTGGGCTAAAACTATGGAAGAAATCC 310 Query 2694 AATCAGAATTAAGTAGCCTCCAAAGCAGCAA 2724 |||||||| |||||| |||||| |||||||| Sbjct 311 AATCAGAACTAAGTACCCTCCATAGCAGCAA 341 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 165322097112 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5