BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G32400.1 Length=3261 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg482168 jgi|Araly1|482168|fgenesh2_kg.4__1228__AT2G32400.1 4894 0.0 Ahg947434 jgi|Araly1|947434|scaffold_703663.1 1493 0.0 > Ahg482168 jgi|Araly1|482168|fgenesh2_kg.4__1228__AT2G32400.1 Length=3201 Score = 4894 bits (2650), Expect = 0.0 Identities = 3029/3212 (94%), Gaps = 25/3212 (1%) Strand=Plus/Plus Query 62 GATGAATTTCTGGGCATGATTTGATCTCTCTAG-TTTTGTTTCTCTTCCTTTA-GTA--- 116 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | | Sbjct 1 GATGAATTTCTGGGCATGATTTGATCTCTCAAGTTTTTGTTTTTCTTCCTTTAGGAAGGT 60 Query 117 ATCTCCTGTCAAATCATGGTTTTTTAAAAAAGATAGTTCTTGACTTCTCTTGTTAAAAAT 176 |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| Sbjct 61 ATCTCCAGTCAAATCATGGTTTTTT------TTTAGTTCTCGACTTCTCTTGTTAATAAT 114 Query 177 TCGTTGCGTTGTCGTAAAATTTCCCTTTTTTAACTTATGCCTACAAAGTGTTTGCGTATA 236 ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct 115 TCGTTGCTTTGTCGTAAAATTTCCCTTTTTAAACTTATGCCTGCAAAGTGTTTGTGTATA 174 Query 237 TTCCGCAGAGAGAACCAGAAGGTAGCTCAAAGAGGTCAAAGTTGGAAACTTTACCTTGCT 296 |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 175 TTCCGCAGAGAGAACCTGAAGGTTGCTCAAAGAGGTCAAAGTTGGAAATTTTACCTTGCT 234 Query 297 TAGTTCTCTAATCTTCTCATCCTCAATGCTGAATGAAGAGTTGCTAGATTTAAATGAGAT 356 ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| Sbjct 235 TAGTTCTCTTTTCGTATCATCCTCAATGCTGAATGAAGAGACGCTAGATTTAAAAGAGAT 294 Query 357 GGTTCTAGTTCCAACACAAACTA-TCTGAAGTGGTCCTTACTTTGATTGCATTATCTCCA 415 ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 295 GGTTCTAGTTCCAACACAAACTATTTTGAACTGGTCCTTACTTTGATTGCATTGTCTCCA 354 Query 416 TGGGACTGGGCATTGACCCATCTGTCGCTATTACGGCACTGATTGTGGTCATTCTGGTGG 475 |||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 355 TGGGGCTGGGCGTTGACCCATTTGTGGCTATTACGGCACTGATTCTGGTCATTCTGGTGG 414 Query 476 TTCCAATGGATTGCCAAAGACCTCAACTGGTGAACATCGGTGCTGTTTTTGCTTTTGATT 535 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 415 TTCCAATGGATTGCCAAAGGCCTCAAGTGGTGAACATCGGTGCTGTTTTCGCTTTTGATT 474 Query 536 CGGTTATCGGAAGAGCTGCAAAAGTAGCTCTAGAGGCAGCTGTTTCCGATGTGAACAATG 595 ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct 475 CGGTTGTCGGAAGAGCTGCAAAAGTAGCTCTCGAGGCAGCTGTCTCCGATGTCAACGCTG 534 Query 596 ATAAAAGCTTTCTCAAAGAAACGGAGCTACGGCTAT-TAATGGAGGATTCTGCCTGCAAT 654 | || | ||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| Sbjct 535 ACCCAACCGTTCTCAAAGGAACGAAGCTACGGCT-TCTCATGGAGGATTCTGCCTGCAAT 593 Query 655 GTCTTTCGTGGGTCCTTTGGAGCTTTTGAATTGCTTGAGAAAGAAGTGGTGGCTATGATC 714 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 594 GTCTTCCGTGGGTCCTTTGGAGCTTTTGAATTGCTTGAGAAAGAAGTGGTGGCTATGATC 653 Query 715 GGTCCAATTTCATCCTCTGTTGCTCATACAATTTCCGATATTGCAAAAGGGCTCCACTTT 774 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 654 GGTCCAATTTCATCCTCTGTTGCTCATACAATATCCGATATTGCAAAAGGGCTCCACTTT 713 Query 775 CCTCTTGTCTCATTTGCAGCAACTGATCCAACTCTCTCTGCCCTCCAATTTCCCTTCTTT 834 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 714 CCTCTTGTCTCATTTGCAGCAACTGATCCAACTCTCTCTGCCCTCCAATTTCCCTTCTTT 773 Query 835 CTTCGGACTACACCTAATGATGCCCACCAAATGTCTGCCCTTGTGGATCTTATCAATTTT 894 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 774 CTTCGGACTACACCTAATGATGCCCACCAAATGTCTGCCCTTGTGGATCTTATCAATTTT 833 Query 895 TATGGATGGAAAGAAGTGATCTCAGTTTACTCGGATGATGAGCTCGGAAGAAATGGAGTT 954 ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || Sbjct 834 TATGGTTGGAAAGAGGTGATATCAGTTTACTCTGATGATGAGCTCGGAAGAAATGGAATT 893 Query 955 TCTGCTCTAGATGATGAACTGTACAAGAAAAGATCCAGAATTTCCTATAAAGTGCCGCTC 1014 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 894 TCTGCTCTAGATGATGAACTGTACAAGAAAAGATCCAGAATTTCCTATAAAGTGCCGCTC 953 Query 1015 TCAGTTCATTCTGATGAAAAATTCCTTACTAATGCTTTGAACAAATCCAAGTCCATCGGT 1074 ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 954 TCAGTGCATTCTGATGAAAAAGTCCTTACTGATGCTTTGAACAAATCCAAGTCCATCGGT 1013 Query 1075 CCTCGAGTTTATATTCTTCATTTTGGTCCGGACCCATTGCTCAGAATTTTTGATATAGCG 1134 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1014 CCTCGGGTTTATATTCTTCATTTTGGTCCAGACCCATTGCTCAGAATTTTTGATATAGCG 1073 Query 1135 CAAAAGCTGCAGATGATGACCCATGAATACGTATGGCTCGCCACAGACTGGCTCTCTGTT 1194 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1074 CAAAAGCTGCAGATGATGACCCATGAATACGTGTGGCTCGCCACAGACTGGCTCTCAGTT 1133 Query 1195 ACCTTAGATTCTT-T--GAGTGACAAAGGTACTCTAAAACGCCTTGAAGGAGTAGTGGGG 1251 || |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1134 ACTTTAGATTCTTCTTTGAGTGACAAAGGTACTTTAAAACGTCTTGAAGGAGTAGTGGGG 1193 Query 1252 CTTCGTCAACATATCCCAGAATCCGTAAAGATGGAACATTTCACGCATAAACTGCAGAGC 1311 ||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| | || |||||||||||| Sbjct 1194 CTTCGTCAACACATCCCAGAATCCGAAAAGGTGCAACATTTCGCACAGAAACTGCAGAGC 1253 Query 1312 AACAGATCAATGAATGCCTACGCATTACATGCCTATGATACAGTGTGGATGATTGCGCAT 1371 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1254 AACAGATCAATGAATGCCTACGCATTCCATGCCTATGATACAGTGTGGATGATTGCATAT 1313 Query 1372 GGCATCGAGGAA-TTGCTGAATGAAGGAATCAACATAACGTTTTCTTACTCCGAAAAGTT 1430 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1314 GGCATCGAG-AAGTTGCTGAATGAAGGAATCAACATAACGTTTTCTTACTCCGAAAAGTT 1372 Query 1431 ACTTCATGCACGGGGAACCAAACTGCACTTGGAGAAAATCAAATTTTTCAACAGTGGGGA 1490 |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1373 ACTTCATGCACGAGGAACTAAACTGCACCTGGAGAAAATCAAATTTTTCAACAGCGGGGA 1432 Query 1491 GTTACTACTTGAGAAACTTCTGAAAGTAAACTTTACTGGTATAGCCGGTCAAGTTCAGTT 1550 | |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1433 GCTACTACTTGAGAAACTTCTGAAGGTGAACTTCACTGGTATAGCCGGTCAAGTTCAGTT 1492 Query 1551 TGGTTCTGGCCGAAACGTTATCGGCTGTGACTACGAAATTATCAATGTAAACAAAACCGA 1610 |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1493 TGGTTCTGGCCGAAACGTCATTGGCTGTGACTACGAAATTATCAATGTAGACAAAACCGG 1552 Query 1611 TGTTCATACTGTCGGTTTCTGGTCGAAAAATGGAGGCTTTTCGGTTGTAGCCCCAAAAAC 1670 |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1553 TGTTCATACTGTGGGTTTCTGGTCGGAAAATGGAGGCTTTTCGGTTGGAGCCCCAAAAAC 1612 Query 1671 CCGTCATTCACAGAAGAAGACTAGCTTTGTTTCTGATGAAAAACTTGGAGATATAACCTG 1730 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1613 CCGACATTCACAGAAGAAGACTAGCTTTGTTTCTGATGAAAAACTTGGAGACATAACCTG 1672 Query 1731 GCCTGGTGGTGGCCGTGAAAAGCCACGTGGTTGGGTCATTGCAGATTCTGCAGATCCATT 1790 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1673 GCCTGGTGGTGGCCGTGAAAAGCCACGTGGTTGGGTCATTGCAGATTCTGCAGATCCATT 1732 Query 1791 GAAGATTGTTGTCCCGAGAAGAGTGAGTTTTGTCGAGTTTGTGACTGAAGAAAAGAACAG 1850 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1733 GAAGATTGTTGTCCCAAGAAGAGTGAGTTTTGTTGAGTTTGTGACTGAAGAAAAGAACAG 1792 Query 1851 TAGCCATCGGATCCAAGGATTTTGCATCGATGTCTTCATTGAAGCATTAAAGTTCGTCCC 1910 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1793 TAGCCATCGGATCCAAGGATTTTGCATCGACGTCTTCATTGAAGCATTGAAGTTCGTCCC 1852 Query 1911 TTACAGTGTTCCTTACATATTTGAGCCTTTCGGGAATGGTCATTCAAGTCCTAATTACAA 1970 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1853 TTACAGTGTTCCTTACATATTTGAGCCATTCGGGAATGGTCATTCAAGTCCTAATTACAA 1912 Query 1971 CCACCTTATTCAAATGGTCACGGATGGTGTATATGATGCTGCTGTTGGGGATATTGCAAT 2030 ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1913 CCAGCTTATTCAAATGGTCACAGATGGCGTATATGATGCAGCTGTTGGGGATATTGCAAT 1972 Query 2031 AGTCCCAAGCCGGTCCAAGTTAGTGGATTTCTCGCAGCCATATGCTTCCACAGGCCTTGT 2090 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1973 AGTCCCAAGCCGGTCCAAATTAGTGGATTTCTCGCAACCATATGCTTCCACAGGCCTTGT 2032 Query 2091 AGTGGTGATTCCTGCTAATGATGACAATGCGACTTGGATCTTTCTGAGACCCTTCACCAG 2150 ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2033 GGTGGTGATTCCAGCCAATGATGACAATGCAACTTGGATCTTTCTGAGACCCTTCACCAT 2092 Query 2151 CCGGTTATGGTGTGTTGTTCTAGTTTCATTCCTGGTTATTGCCGTAGTCATCTGGATCCT 2210 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2093 CCGGTTATGGTGTGTTGTTCTAGTTTCATTCCTGGTTATTGCCGTAGTCATCTGGATCCT 2152 Query 2211 CGAACATCGCATCAATGAAGATTTCAGAGGGCCACCCCGAAGACAACTCAGCACAATGCT 2270 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | Sbjct 2153 CGAACATCGCATCAATGAAGATTTCAGAGGGCCACCCCGAAGACAATTGACCACAATGAT 2212 Query 2271 CTTGTTCAGCTTCTCAACTCTTTTCAAGAGAAACCAGGAAGATACAATAAGTAATCTAGC 2330 ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 2213 CTTATTCAGCTTTTCAACTCTTTTCAAGAGAAACCAGGAAGATACGATAAGCAATCTAGC 2272 Query 2331 AAGACTAGTGATGATTGTATGGCTCTTCCTATTGATGGTTCTAACCGCGAGCTACACAGC 2390 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2273 AAGACTAGTGATGATTGTATGGCTCTTCCTATTGATGGTTCTAACTGCGAGCTACACAGC 2332 Query 2391 GAACCTCACCTCAATCCTCACAGTTCAACAGCTTCCCTCTGCTATTACCGGTATTGATAG 2450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || Sbjct 2333 GAACCTCACCTCAATCCTCACAGTTCAACAGCTTCCTTCTGCCATTACCGGCATCGACAG 2392 Query 2451 CTTGCGGGCAAGTGAGGTACCTATCGGGTACCAGGCTGGGACGTTCACTTTAGAGTATTT 2510 ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 2393 CTTGCGGGCAAGTGAAGTGCCTATCGGGTACCAGGCTGGGACATTCACATTAGAGTATTT 2452 Query 2511 AACCTACAGTCTTGGCATGGCTCGGTCTAGACTGGTCCCACTTGACTCGACCGAGGAGTA 2570 |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2453 AACCTACAGTCTTGGCATGGCTCGCTCTAGGCTAGTCCCACTTGACTCGACCGAGGAGTA 2512 Query 2571 TGAAAAGGCTCTAAAGCTGGGGCCAACCAATTGGGGAGGTGTTGCTGCCATTGTCGACGA 2630 |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 2513 TGAAAAGGCTCTAAAGCTAGGACCAACCAACTGGGGAGGTGTGGCTGCTATTGTCGACGA 2572 Query 2631 ACTCCCTTACATCGAACTGTTTCTAGCAGAACGAACAGGCTTCAAGATTGTTGGAGAACC 2690 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 2573 ACTCCCTTACATCGAACTGTTTCTAGCAGAACGAACAGGCTTCAAGATTGTCGGAGAGCC 2632 Query 2691 CTTTATGCACCGTGGTTGGGGATTTGCGTTTAAGAGAGATTCTCCATTGGCTATAGACAT 2750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2633 CTTTATGCACCGTGGTTGGGGATTTGCGTTTAAGAGAGATTCTCCACTGGCTATAGACAT 2692 Query 2751 GTCAACAGCTATCTTGAAACTCTCTGAGACGAGGAAATTGCAAGAAATTCGAAAGAAATG 2810 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2693 GTCAACAGCTATCTTGAAACTCTCTGAGACCAGGAAATTGCAAGAGATTCGAAAGAAATG 2752 Query 2811 GTTATGCAAGACGAATTGCGCAGGGAAATCAAATTGGAACCCAGAGCCAAACCAGCTTCA 2870 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2753 GTTATGCAAGAAGAATTGCGCAGAGAAATCAAATTGGAACCCAGAGCCAAACCAGCTTCA 2812 Query 2871 TCTCAAAAGCTTCAAAGGGCTGTACCTTGTCTGCATTGCAATCACAGTCTCTGCGTTTTT 2930 |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2813 TCTCAAGAGCTTCAAAGGGTTGTACCTTGTCTGCATTGCAATCACAGTCTCTGCGTTTAT 2872 Query 2931 GGTGTTTGTTCTCAGGATGATACGCCAGTTCGTGCGGTACAGACGGATGGAGAGAACATC 2990 |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2873 AGTGTTTGTTCTCAGGATGATACGCCAATTTGTGCGGTACAGACGGATGGAGAGAACATG 2932 Query 2991 CTCGATGCCACGCGCTTCTTGGTCAG-CTTCTCCTAC-ATTGCGG-TTGAGAGAATTAGT 3047 |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| | || |||| || |||||||| || Sbjct 2933 CTCGTTGCCACGCGCTTCTTGGTC-GTCTTCTCCTTCGAT-GCGGCTT-AGAGAATTGGT 2989 Query 3048 GTTTGATTTTGTGGAGTTTGTGGATGAGAAAGAAGAAGCTATTAAGAGAATGTTCAGAAG 3107 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2990 GTTTGATTTCGTGGAGTTTGTGGATGAGAAAGAAGAAGCTATCAAGAGAATGTTCAGAAG 3049 Query 3108 AAGCGATGACTCTAATAACAACCCATCTCATGTAGGGGAAGTCCAAGCTGATACTGAGGT 3167 || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3050 GAGTGATGACTCTAATAACAACCCATCTCATGTTGGGGAAGTCCAAGCTGATACAGAGGT 3109 Query 3168 ACCACGAAATTGATGAGTAGATTCCACTCTATAGGAAGAAAATTGTTATGTATAAGAACT 3227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | Sbjct 3110 ACCACGAAATTGATGAGTAGATTCCACTCTATAGGAAGAAAATTGTTATGTATATGAATT 3169 Query 3228 AGATATAGCTAACATGTAAGTCAATATTCGAA 3259 |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3170 AGATATAGCTAACATGTAAGTCAATATTCGAA 3201 > Ahg947434 jgi|Araly1|947434|scaffold_703663.1 Length=1441 Score = 1493 bits (808), Expect = 0.0 Identities = 920/975 (94%), Gaps = 3/975 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1992 GGATG-GTGTATATGATGCTGCTGTTGGGGATATTGCAATAGTCCCAAGCCGGTCCAAGT 2050 ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 418 GGATGATTGCATATGATGCAGCTGTTGGGGATATTGCAATAGTCCCAAGCCGGTCCAAAT 477 Query 2051 TAGTGGATTTCTCGCAGCCATATGCTTCCACAGGCCTTGTAGTGGTGATTCCTGCTAATG 2110 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | Sbjct 478 TAGTGGATTTCTCGCAGCCATATGCTTCCACAGGCCTTGTGGTGGTGATTCCAGCTAACG 537 Query 2111 ATGACAATGCGACTTGGATCTTTCTGAGACCCTTCACCAGCCGGTTATGGTGTGTTGTTC 2170 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 538 ATGACAATGCAACTTGGATCTTTCTGAGACCCTTCACCATCCGGTTATGGTGTGTTGTTC 597 Query 2171 TAGTTTCATTCCTGGTTATTGCCGTAGTCATCTGGATCCTCGAACATCGCATCAATGAAG 2230 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 598 TAGTTTCATTCTTGGTTATTGCCGTAGTCATCTGGATCCTCGAACATCGCATCAATGAAG 657 Query 2231 ATTTCAGAGGGCCACCCCGAAGACAACTCAGCACAATGCTCTTGTTCAGCTTCTCAACTC 2290 |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct 658 ATTTCAGAGGGCCACCCCGAAGACAATTGACCACAATGATCTTATTCAGCTTCTCAACTC 717 Query 2291 TTTTCAAGAGAAACCAGGAAGATACAATAAGTAATCTAGCAAGACTAGTGATGATTGTAT 2350 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 718 TTTTCAAGAGAAACCAGGAAGATACGATAAGCAATCTAGCAAGACTAGTGATGATTGTAT 777 Query 2351 GGCTCTTCCTATTGATGGTTCTAACCGCGAGCTACACAGCGAACCTCACCTCAATCCTCA 2410 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 778 GGCTCTTCCTATTGATGGTTCTAACTGCGAGCTACACAGCGAACCTCACCTCAATCCTCA 837 Query 2411 CAGTTCAACAGCTTCCCTCTGCTATTACCGGTATTGATAGCTTGCGGGCAAGTGAGGTAC 2470 |||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| | | Sbjct 838 CAGTTCAACAGCTTCCTTCTGCCATTACCGGCATCGACAGCTTGCGGGCAAGTGAATTGC 897 Query 2471 CTATCGGGTACCAGGCTGGGACGTTCACTTTAGAGTATTTAACCTACAGTCTTGGCATGG 2530 |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 CTATCGGGTACCAGGCTGGGACATTCACATTAGAGTATTTAACCTACAGTCTTGGCATGG 957 Query 2531 CTCGGTCTAGACTGGTCCCACTTGACTCGACCG-AGGAGTATGAAAAGGCTCTAAAGCTG 2589 |||| ||||| || ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| Sbjct 958 CTCGCTCTAGGCTAGTCCCACTTGACTCGACGGTAG-AGTATGAAAAGGCTCTAAAGCTA 1016 Query 2590 GGGCCAACCAATTGGGGAGGTGTTGCTGCCATTGTCGACGAACTCCCTTACATCGAACTG 2649 || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1017 GGACCAACCAACTGGGGAGGTGTGGCTGCTATTGTCGACGAACTCCCTTACATCGAACTG 1076 Query 2650 TTTCTAGCAGAACGAACAGGCTTCAAGATTGTTGGAGAACCCTTTATGCACCGTGGTTGG 2709 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1077 TTTCTAGCAGAACGAACAGGCTTCAAGATTGTCGGAGAGCCCTTTATGCACCGTGGTTGG 1136 Query 2710 GGATTTGCGTTTAAGAGAGATTCTCCATTGGCTATAGACATGTCAACAGCTATCTTGAAA 2769 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1137 GGATTTGCGTTTAAGAGAGATTCTCCACTGGCTATAGACATGTCAACAGCTATCTTGAAA 1196 Query 2770 CTCTCTGAGACGAGGAAATTGCAAGAAATTCGAAAGAAATGGTTATGCAAGACGAATTGC 2829 ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1197 CTCTCTGAGGCCAGGAAATTGCAAGAGATTCGAAAGAAATGGTTATGCAAGAAGAATTGC 1256 Query 2830 GCAGGGAAATCAAATTGGAACCCAGAGCCAAACCAGCTTCATCTCAAAAGCTTCAAAGGG 2889 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1257 GCAGAGAAATCAAATTGGAACCCAGAGCCAAACCAGCTTCATCTCAAGAGCTTCAAAGGG 1316 Query 2890 CTGTACCTTGTCTGCATTGCAATCACAGTCTCTGCGTTTTTGGTGTTTGTTCTCAGGATG 2949 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct 1317 TTGTACCTAGTCTGCATTGCAATCACAGTCTCTGCGTTTATAGTGTTTGTTCTCAGGATG 1376 Query 2950 ATACGCCAGTTCGTG 2964 |||||||| || ||| Sbjct 1377 ATACGCCAATTTGTG 1391 Score = 363 bits (196), Expect = 6e-99 Identities = 238/258 (92%), Gaps = 4/258 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1114 CTCAG-AATTTTTGATATAGCGCAAAAGCTGCAGATGATGACCCATGAATACGTATGGCT 1172 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 170 CTCAGTAATTTTTGATATAGCGCAAAAGCTGCAGATGATGACCCATGAATACGTGTGGCT 229 Query 1173 CGCCACAGACTGGCTCTCTGTTACCTTAGATTCTT-TG-A-GTGACAAAGGTACTCTAAA 1229 |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | | ||||||||||| || |||| Sbjct 230 CGCCACAGACTGGCTCTCAGTTACTTTAGATTCTTCTTTAAGTGACAAAGGTGCTTTAAA 289 Query 1230 ACGCCTTGAAGGAGTAGTGGGGCTTCGTCAACATATCCCAGAATCCGTAAAGATGGAACA 1289 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||| Sbjct 290 ACGTCTTGAAGGAGTAGTGGGGCTTCGTCAACACATCCCAGAATCCGCAAAGGTGCAACA 349 Query 1290 TTTCACGCATAAACTGCAGAGCAACAGATCAATGAATGCCTACGCATTACATGCCTATGA 1349 |||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 350 TTTCGCACAGAAACTGCAGAGCAAGAGATCAATGAATGCCTACGCATTCCATGCCTATGA 409 Query 1350 TACAGTGTGGATGATTGC 1367 |||||||||||||||||| Sbjct 410 TACAGTGTGGATGATTGC 427 Score = 296 bits (160), Expect = 6e-79 Identities = 170/175 (97%), Gaps = 0/175 (0%) Strand=Plus/Plus Query 845 CACCTAATGATGCCCACCAAATGTCTGCCCTTGTGGATCTTATCAATTTTTATGGATGGA 904 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| Sbjct 1 CACCTAATGATGCCCACCAAATGTCTGCCCTTGTGGATCTTATCGATTTTTATGGTTGGA 60 Query 905 AAGAAGTGATCTCAGTTTACTCGGATGATGAGCTCGGAAGAAATGGAGTTTCTGCTCTAG 964 |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AAGAGGTGATATCAGTTTACTCAGATGATGAGCTCGGAAGAAATGGAGTTTCTGCTCTAG 120 Query 965 ATGATGAACTGTACAAGAAAAGATCCAGAATTTCCTATAAAGTGCCGCTCTCAGT 1019 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ATGATGAACTGTACAAGAAAAGATCCAGAATTTCCTATAAAGTGCCGCTCTCAGT 175 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 123078191082 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5