BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G35110.1 Length=4643 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg934119 jgi|Araly1|934119|scaffold_402107.1 7160 0.0 > Ahg934119 jgi|Araly1|934119|scaffold_402107.1 Length=4324 Score = 7160 bits (3877), Expect = 0.0 Identities = 4166/4305 (97%), Gaps = 21/4305 (0%) Strand=Plus/Plus Query 105 GAATTAATGGCGAATTCTCGTCAATATTATCCATCTCAAGATGAATCAATGTCCCCGACT 164 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 18 GAATTAATGGCGAAATCCCGTCAATATTATCCATCTCAAGATGAATCAATGTCCCCGACT 77 Query 165 TCTGTGAGATCAAGGGAATGGGAAGGTCCTTCCAGATGGACTGAGTACTTGGGACCTGAA 224 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 78 TCTGTGAGATCGAGGGAATGGGAAGGTCCTTCCAGATGGACTGAGTACTTGGGACCTGAA 137 Query 225 ATGGCTGCATCAGTGTCTTCTACTAGGAGCTCTAAGCAAATTGATGG--A----CA-TG- 276 |||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||| | || | Sbjct 138 ATGGCTGCATCA--GT-TTCTTCTAGGAGCTCAAAGCAAATTGATGGAAATCTTCAGAGT 194 Query 277 T-TGGTGGTTCCACAAAGGCTTTGAACATACAATGGGTAGTTCAAATGATTGAGGTTGCT 335 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 195 TCTGGTGGTTCCACAAAGGCTTTGAACATACAATGGGTAGTTCAAATGATTGAGGTTGCA 254 Query 336 GACGGTCTCATGGCTAAAATGTATAGACTGAATCAAATCTTGGAGTATCCTGATCCTGTT 395 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 255 GAAGGTCTCATGGCTAAAATGTATAGACTGAATCAAATCTTGGAGTACCCTGATCCTGTT 314 Query 396 GGCCATGTATTCTCTGAAGCATTTTGGAAAGCGGGTGTCTTCCCTAACCATCCACGGATA 455 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 315 GGCCATGTTTTCTCTGAAGCATTTTGGAAAGCGGGTGTCTTCCCTAACCATCCACGGATA 374 Query 456 TGCACTTTGCTCTCTAAAAAGTTCCCTGAGCATTTCAGCAAATTGCAACTTGAACGTATT 515 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 375 TGCACTTTGCTCTCTAAAAAGTTCCCTGAGCATTTCAGCAAATTGCAACTTGAACGTATT 434 Query 516 GATAAGTTTTCACTGGATAGCTTGCATGATGGTGCTGAACTTCACTTACAGAGCTTAGAG 575 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 435 GACAAGTTTTCACTGGATAGCTTGCACGATGGTGCTGAACTTCACTTACAGAGCTTAGAG 494 Query 576 CCATGGATACAGCTGCTGCTCGACTTGATGGCATTTCGAGAACAGGCACTGCGGCTTATA 635 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 495 CCATGGATACAGCTGCTGCTCGACTTGATGGCATTTCGAGAACAGGCACTGCGGCTTATA 554 Query 636 TTGGACCTAAGCAGCACTGTAATTACCTTGCTGCCTCATCAGAACTCACTTATTCTGCAT 695 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 555 TTGGACCTAAGCAGCACTGTAATTACCTTGCTGCCTCATCAGAACTCACTTATTCTGCAT 614 Query 696 GCATTCATGGATCTCTTTTGTGCATTTGTCCGAGTCAATCTCTTCGCAGAGAAGATTCCT 755 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 615 GCATTCATGGATCTCTTTTGTGCATTTGTCCGAGTCAATCTTTTCGCAGAGAAGATTCCT 674 Query 756 AGGAAAATGTTGTTGCAAGTCTACAACCTTCTGCATGCGCTATCAAGAAATGATCGAGAC 815 |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 675 AGGAAAATGTTGCTGCAAGTGTACAACCTTCTGCATGCGCTATCAAGAAATGATCGAGAC 734 Query 816 TGTGACTTTTATCACCGCTTGGTGCAATTCATAGACTCTTATGATCCCCCATTGAAAGGC 875 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 735 TGTGACTTTTATCACCGCTTGGTGCAATTCATAGACTCTTATGATCCCCCATTAAAAGGC 794 Query 876 TTACAAGAAGATTTGAATTTTGTCAGCCCAAGGATTGGAGAGGTCCTGGAGGCTGTAGGA 935 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 795 TTGCAAGAAGATTTGAATTTTGTCAGCCCAAGGATTGGAGAGGTCCTGGAGGCTGTAGGA 854 Query 936 CCCAGTATTTTTCTATCTGCAGATACGAGGAAGTTGAGAAATGAGGGATTTTTAAGCCCA 995 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 855 CCCAGTATTTTTCTATCTGCAGATACGAGGAAGTTGAGAAATGAGGGATTTTTAAGCCCA 914 Query 996 TATCATCCTAGATTCCCAGATATACTTACAAATTCTGCTCATCCCATGAGAGCGCAAGAT 1055 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 915 TATCATCCTAGATTCCCAGATATACTTACAAATTCTGCTCATCCCATGAGAGCGCAAGAT 974 Query 1056 CTTGCAAATGTTACTTCGTACCGAGAGTGGGTGCTTCTTGGATATCTCGTTTGCCCCGAC 1115 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 975 CTTGCGAATGTTACTTCGTACCGAGAATGGGTGCTTCTTGGATATCTCGTTTGCCCGGAC 1034 Query 1116 GAGCTTCTTCGTGTTACTAGCATTGATATCGCCCTGGTCGTGCTAAAGGAAAACTTAGTC 1175 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1035 GAGCTTCTTCGTGTTACTAGCATTGATATCGCCCTGGTTGTGCTAAAGGAAAACTTAGTC 1094 Query 1176 GTGACGTTATTCCGGGATGAGGTGAGTTTATATCAAATGGTCTGCGAAAAAGAGTTTGGT 1235 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| || Sbjct 1095 GTGACGTTATTCCGGGATGAGGTGAGTTCATATCAAATTGTCAACGACAAAGAGTTTTGT 1154 Query 1236 ATTGGAATTAGTTTTGCATCAGCTGACTCTATTAATC-TAACTATGCAGTACATTCTGTT 1294 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||| Sbjct 1155 ATTGGAATTTGTTTTGCATCAGCTGACTCTATTAA-CTTGGCCATGCAGTACATTCTGTT 1213 Query 1295 GCACGAAGACTACCAGTTGTATGTTTTACCCCGAGTGTTAGAATCAAAGAAGATGGCTAA 1354 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1214 GCACGAAGACTACCAGTTGTATGTTTTACCCCGTGTGTTAGAATCAAAGAAGATGGCAAA 1273 Query 1355 GTCTGGACGGACTAAACAAAAGGAAGCTGATCTAGAATATAGTGTAGCAAAACAAGTTGA 1414 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1274 GTCTGGTCGGACTAAACAAAAGGAAGCTGATCTAGAATATAGTGTAGCAAAACAAGTTGA 1333 Query 1415 GAAAATGATCAGTGAGGTGCATGAGCAAGCATTGCAATTATGTGATACCATACACCGAGA 1474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1334 GAAAATGATCAGTGAGGTGCATGAGCAAGCATTGCAATTATGTGATACCATACACCGAGA 1393 Query 1475 AAGGAGAATATTGCTGAAGCAGGAAATAGGGCGGATGGTTTTATTTTTCACTGATCAACC 1534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1394 AAGGAGAATATTGCTGAAGCAGGAAATAGGGCGGATGGTTTTATTTTTCACTGATCAACC 1453 Query 1535 AAGTTTGCTGGCTCCAAACATTCAGATGGTATTCTCTGCGTTGGCTTTGGCCCAATCTGA 1594 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 1454 AAGTTTGCTGGCTCCAAACATTCAGATGGTATTCTCTGCATTGGCTTTGGCCCAGTCTGA 1513 Query 1595 GGTTCTCTGGTATTTTCAACATGCTGGTATTGCATCCTCAAGATCCAAAGCTGCTCGAGT 1654 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1514 GGTTCTCTGGTATTTTCAACATGCTGGTATTGCATCCTCAAGATCTAAAGCTGCTCGAGT 1573 Query 1655 GATACCAGTAGACATAGATCCAAATGATCCTACCATTGGCTTCCTGCTCGATGGAATGGA 1714 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1574 GATACCAGTTGACATAGATCCAAATGATCCTACCATTGGCTTCCTGCTCGATGGAATGGA 1633 Query 1715 CCGTCTCTGCTGTTTAGTGCGCAAGTACATCTCAGCTGCTCGAGGTTATGCACTATCATA 1774 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1634 CCGTCTCTGCTGTTTAGTGCGCAAGTACATCTCAGCTGCTCGAGGTTATGCACTATCATA 1693 Query 1775 CCTTTCTTCATCTGCTGGAAGGATTCGTTACTTGATGGGTACTCCTGGAATTGTGGCTCT 1834 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1694 CCTTTCTTCATCTGCTGGAAGGATTCGTTACTTGATGGGTACTCCTGGAATTGTGGCTCT 1753 Query 1835 GGACCTTGATCCTACCTTGAAAGGCCTTTTTCAGCGTATTGTGCAACATCTCGAAAGTAT 1894 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| Sbjct 1754 GGACCTTGATCCTACCTTGAAAGGCCTATTTCAGCGTATTGTTCAACATCTCGAAAATAT 1813 Query 1895 ACCCAAGGCGCAGGGAGAAAATGTTTCTGCAATCACATGTGACCTATCTGATTTCCGGAA 1954 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1814 ACCCAAAGCGCAGGGAGAAAATGTTTCTGCAATCACATGTGACCTATCTGATTTCCGGAA 1873 Query 1955 AGATTGGTTGTCCATTTTGATGATTGTCACTTCTTCTCGATCATCGATAAACATCAGGCA 2014 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1874 AGATTGGTTGTCCATTTTAATGATTGTCACTTCTTCTCGATCATCGATAAACATCAGGCA 1933 Query 2015 TTTGGAAAAAGCCACTGTCTCTACTGGGAAGGAGGGCTTGCTATCGGAAGGAAATGCTGC 2074 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1934 TCTGGAAAAAGCCACTGTCTCTACTGGGAAGGAGGGCTTGCTATCGGAAGGAAATGCTGC 1993 Query 2075 ATATAACTGGTCCAGATGTGTTGATGAGTTAGAGTCTCAATTGTCAAAGCATGGAAGTCT 2134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1994 ATATAACTGGTCCAGATGTGTTGATGAGTTAGAGTCTCAATTATCAAAGCATGGAAGTCT 2053 Query 2135 GAAGAAATTATATTTCTACCATCAACACCTCACAACTGTTTTCAGAAATACAATGTTTGG 2194 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2054 GAAGAAATTATATTTCTATCATCAACACCTCACAACTGTTTTCAGAAATACAATGTTTGG 2113 Query 2195 ACCAGAAGGACGTCCTCAGCATTGTTGTGCATGGCTCAGTGTGGCTAGTAGTTTCCCGGA 2254 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2114 ACCAGAAGGACGTCCTCAACATTGTTGTGCATGGCTCAGTGTGGCTAGTAGTTTCCCGGA 2173 Query 2255 ATGTGCTTCACTAATAATTCCTGAGGAGGTTACCAAATTTGGGCGAGATGCTGTGCTTTA 2314 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 2174 ATGTGCTTCACTTATAATTCCTGAGGAGGTTACCAAATTCGGGCGAGATGCAGTGCTTTA 2233 Query 2315 CGTCGAGTCTCTTATTGAATCAATAATGGGGGGACTGGAGGGCCTAATTAATATTCTTGA 2374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2234 CGTCGAGTCTCTTATTGAATCAATAATGGGGGGACTGGAGGGCCTAATAAATATTCTTGA 2293 Query 2375 TTCAGAAGGCGGGTTTGGCGCTCTAGAATCTCAGCTTCTTCCAGAACAAGCTGCAGCGTA 2434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2294 TTCAGAAGGCGGGTTTGGCGCTCTAGAATCTCAGCTTCTTCCAGAACAAGCTGCAGCGTA 2353 Query 2435 TCTGAATAATGCATCAAGAATTTCTGC-TCCTTCAGTGAAATCCCCCAGGGTTGTAGGCG 2493 ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2354 TCTGAATAATGCATCAAGAATTTCTGCCTC-TTCAGTGAAATCCCCCAGGGTTGTAGGCG 2412 Query 2494 GGTTTACTTTGCCTGGCCATGAGAGCTATCCTGAGAATAATAAGTCTATAAAGATGTTGG 2553 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2413 GGTTTACTTTGCCCGGCCATGAGAGCTATCCTGAGAATAATAAGTCTATTAAGATGTTGG 2472 Query 2554 AAGCTGCAATTCAAAGGTTGACTAATTTGTGTTCAATTCTGAACGACATGGAGCCTATTT 2613 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2473 AAGCTGCAATCCAAAGGTTGACTAATTTGTGTTCAATTCTGAACGACATGGAGCCTATCT 2532 Query 2614 GTGTTATAAACCACGTATTTGTTCTAAGAGAGTACATGAGAGAATGCATCCTTGGGAACT 2673 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2533 GTGTTATAAACCACGTATTTGTGCTAAGAGAGTACATGAGAGAATGCATCCTTGGGAATT 2592 Query 2674 TCAAGAGAAGATTTCTTACTGCTCTACAAACCGATAACGATCTCCAGCGGCCTTCTGTTT 2733 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | Sbjct 2593 TCAAGAGAAGATTTCTTACTGCACTACAAACAGATAATGATCTTCAGCGGCCTTCTGTCT 2652 Query 2734 TGGAATCTCTTATCAGGCGGCATATGGGCATAGTTCACTTGGCAGAGCAGCACGTTAGCA 2793 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2653 TGGAATCTCTTATCAGGCGGCATATGAGCATAGTTCACTTGGCAGAGCAGCACGTTAGCA 2712 Query 2794 TGGACCTAACCCAAGGCATCAGAGAAATTTTACTCACAGAAGCCTTTTCAGGGCCTGTGT 2853 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2713 TGGACCTAACCCAAGGCATCAGAGAAATTTTACTCACAGAAGCCTTTTCAGGGCCTGTGT 2772 Query 2854 CATCTTTGCATACATTCGAAAAACCTGCTGAACAACAGCAAACCACTGGATCTGCAGTTG 2913 | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2773 CGTCTTTGCATACATTCGAAAAGCCTGGTGAACAACAGCAAAACACTGGATCTGCAGTTG 2832 Query 2914 AAGTTGTATGCAACTGGTACATGGACAATATCATCAAGGATGTGTCTGGCGCAGGAATCC 2973 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2833 AAGTTGTGTGCAACTGGTACATGGACAATATCATCAAGGATGTGTCTGGCGCAGGAATCC 2892 Query 2974 TCTTCGCTCCGAGGCACAAATACTTCAAAAGCACTAGACCAGTTGGAGGGTATTTTGCAG 3033 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2893 TCTTCGCTCCAAGGCACAAATACTTCAAAAGCACTAGACCAGTTGGAGGGTATTTTGCAG 2952 Query 3034 AGTCAGTCACCGACCTCAAGGAATTACAGGCGTTTGTTCGTATCTTCGGCGGCTATGGAG 3093 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2953 AGTCAGTCACCGACCTCAAGGAATTACAGGGGTTTGTTCGTATCTTCGGCGGCTATGGAG 3012 Query 3094 TTGACCGGCTGGATAGGATGATGAAAGTACATACAGCTGCCCTGGTAAACTGCATAGAAA 3153 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3013 TAGACCGGCTGGATAGGATGATGAAAGTACATACAGCTGCCCTGGTAAACTGCATAGAAA 3072 Query 3154 CTTCTCTGAGATCAAACCGGGAATTGATTGAAGCAGCTGCTGCAAGTATGCATTCTGGTG 3213 | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3073 CATCTCTGAGATCAAACCGGGAATTGATTGAGGCAGCTGCTGCAAGTATGCATTCTGGTG 3132 Query 3214 ACAGAGTGGAGAGAGACGCATCTGTTAGGCAGATAGTTGATTTGGATACCGTAATAGGAT 3273 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3133 ACAGAGTAGAGAGAGACGCATCTGTTAGGCAGATAGTGGATTTGGATACCGTAATAGGAT 3192 Query 3274 TTTGTATTGAAGCTGGTCAAGCGTTGGCTTTTGATGACCTCCTCGCTGAAGCCTCTGGTG 3333 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct 3193 TTTGTATTGAAGCTGGTCAAGCGTTGGCTTTTGATGAGCTCCTCGCCGAAGCCTCTGGTG 3252 Query 3334 CTGTTCTTGAAGACAATGCATCCTTGATACACTCGATGATCTCTGGCATCGTTGAGCACA 3393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3253 CTGTTCTTGAAGACAATGCATCCTTGATACACTCGATGATCTCTGGCATCGTTGAGCATA 3312 Query 3394 TACCTGAAGAAATACCTGAAAAGAAAGAAATCAGAAGGATCAAAGGCGTGGCAAATGGTG 3453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3313 TACCTGAAGAAATACCTGAAAAGAAAGAAATCAGAAGGATCAAAGGCGTGGCAAATGGCG 3372 Query 3454 TTGGCGTAGCAGGTGATCACGACTCTGAATGGGTTAGATTAATCCTAGAAGAGGTAGGAG 3513 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3373 TTGGCGTAGCAGGAGATCACGACTCTGAATGGGTTAGATTAATCCTCGAAGAGGTAGGAG 3432 Query 3514 GTGCAAATGACAACTCATGGAGTTTGTTACCTTACTTTTTTGCCTCTTTCATGACCTCAA 3573 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3433 GTGCAAATGACAACTCATGGAGTTTGTTACCTTACTTTTTTGCCTCTTTCATGACCTCAA 3492 Query 3574 ACGCCTGGAACACTACTGGCTTCAACATCGAGACTGGCGGATTCAGCAACAATATTCATT 3633 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| Sbjct 3493 ACGCCTGGAACACTACTGGCTTCAACATCGAGACTGGCGGATTCAGCAATAACATCCATT 3552 Query 3634 GCTTGGCTCGGTGTATTAGTGCTGTCATCGCTGGAAGTGAGTACGTAAGGTTACAACGTG 3693 ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| Sbjct 3553 GCTTGGCTCGGTGTATTAGCGCTGTCATTGCAGGAAGTGAGTACGTTAGGTTACAGCGTG 3612 Query 3694 AATACCAGCAGCAGCATCAGTCCCTCTCGAATGGTCATCACTCTAGTGAAAATCTCGACT 3753 ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3613 AATACCAGCAGCAGCATCAATCCCTCTCCAATGGTCATCACTCTAGTGAAAATCTAGACT 3672 Query 3754 CAGAGTTTCCACCCCGTGTAACTGCTGAAGCAAGCATTAAATCCT-CAATGTTACTCTTT 3812 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| Sbjct 3673 CAGAGTTTCAACCCCGTGTAACTGCTGAAGCAAGCATTAAATC-TGCAATGTTACTCTTT 3731 Query 3813 GTAAAATTCGCTGCATCGATCGTGCTAGATTCATGGAGCGAAGCCAACAGATCGCATCTC 3872 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 3732 GTAAAATTCGCTGCATCGATCGTGCTAGATTCATGGAGTGAAGCCAACAGATCTCATCTT 3791 Query 3873 GTGGCTAAGCTTATCTTCCTGGACCAACTCTGTGAGATCTCACCATACCTCCCTAGAAGC 3932 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3792 GTGGCTAAGCTTATCTTCCTGGACCAACTCTGTGAGATCTCACCATACCTCCCAAGAAGC 3851 Query 3933 TCCCTCGAATCACATGTCCCGTACACCATCCTCAGGTCAATCTACACCCAATACTACTCC 3992 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3852 TCCCTTGAATCACATGTCCCGTACACCATCCTCAGGTCAATCTACACCCAATACTACTCC 3911 Query 3993 AACACACCTTCCACACCGCTCTCAACAGCATCCCCGTACCACTCCCCATCCGTATCGCTC 4052 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct 3912 AACACACCGTCCACACCGCTCTCAACAGCATCCCCGTACCACTCTCCATCCGTATCACTC 3971 Query 4053 ATCCACGCTTCTCCCTCCATGAAAAACTCCACCACTCCCCAGCGTGGTAGTGGTAGCGGC 4112 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3972 ATCCACGCTTCTCCATCCATGAAAAACTCCACCACTCCCCAGCGTGGTAGTGGTAGCGGC 4031 Query 4113 AGTAGCTCTACAGCTGCCCCTGATTCAGGCTACTTCAAAGGCTCATCATCTTCACTATAC 4172 |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4032 AGTAGCTCCGCAGCTGCCCCAGATTCAGGGTACTTCAAAGGCTCATCATCTTCACTCTAC 4091 Query 4173 GGTCAGGAACACTACACCGAATCCGAAACTGGAAACTCAAGAAACAATGAGaacaacaac 4232 ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4092 AGTCAGGAACACTACAACGAACCCGAAACTGGAATCTCAAGAAACAATGAGAACAACAAC 4151 Query 4233 aacaacaaacaaAGGGGAAGTTCTCGTCGTTCCGGACCATTGGATTACAGCTCGAGCCAT 4292 ||||| | |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4152 AACAA-A--CAAAGGGGGAGCTCCCGTCGTTCTGGACCATTGGATTACAGCTCGAGCCAT 4208 Query 4293 AAAGGAGGGTCAGGATCAAACAGCACAGGTCCTAGTCCTCTTCCTAGGTTTGCTGTCTCA 4352 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct 4209 AAAGGAGGGTCAGGATCAAACAGCACAGGTCCTAGTCCACTTCCCAGGTTTGCTGTCTCA 4268 Query 4353 AGATCTGGTCCCATCTCATATAAACAGCATAACTAAGTAACAACA 4397 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 4269 AGATCTGGTCCCATCTCATATAAGCAGCATAACTAAGTAACAACA 4313 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 175673756968 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5