BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G35690.1 Length=2377 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg934192 jgi|Araly1|934192|scaffold_402180.1 3278 0.0 Ahg493199 jgi|Araly1|493199|fgenesh2_kg.7__2632__AT4G16760.1 1869 0.0 Ahg918666 jgi|Araly1|918666|Al_scaffold_0575_1 1712 0.0 > Ahg934192 jgi|Araly1|934192|scaffold_402180.1 Length=2036 Score = 3278 bits (1775), Expect = 0.0 Identities = 1953/2040 (96%), Gaps = 8/2040 (0%) Strand=Plus/Plus Query 188 TCTGAGACAATAGAGAGAACAATGGAGAGAGTTGATCACCTTGCCGATGAGAGGAACAAA 247 ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1 TCTGAAACAATAGAGGGAATAATGGAGAGAGTTGATCACCTTGCTGATGAGAGGAACAAA 60 Query 248 GCAGAGTTCAACGTCGACGATATGAAGATCGTCTGGGCCGGTTCCCGCCACGCTTTCGAT 307 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 GCTGAGTTCAACGTCGACGATATGAAGATCGTCTGGGCCGGTTCCCGCCACGCTTTCGAC 120 Query 308 GTTTCAAATCGTATGTCTCGCCTCGTCGCTAATGATCCGGTCTTTGAGAAAAGCAAAAGA 367 ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 121 GTTTCAAATCGCATTTCTCGCCTCGTCGCCAATGATCCGATCTTTGAGAAAAGCAAAAGA 180 Query 368 GCTGTGATGAGTAGGAAAGAGTTGTTCAAGAACACGTTGAGGAAAAGTGTTCACGCTTGG 427 || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 181 GCAGTAATGAGAAGGAAAGAGTTATTCAAGAACACGTTGAGAAAAAGTGTTCACGCTTGG 240 Query 428 AAGTTGATTAACGAGCTTCGTCTCTCAGATGAGGAAGGACTCAAATTGAGATCTTTCATG 487 ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct 241 AAGATGATTAACGAGCTTCGTCTCTCTGATGAGGAAGGAATCAAATTAAGATCTTTCATG 300 Query 488 GATCAACCAGGCTTCTTGGATCTGCATTGGGGAATGTTTGTGCCTGCAATTAAAGGACAA 547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 301 GATCAACCAGGCTTCTTGGATCTGCATTGGGGAATGTTTGTGCCTGCACTTAAAGGACAA 360 Query 548 GGCACAG-AGCAACAACAACAAAAGTGGTTGTCTTTAGCTACTAAGATGCAGATAATTGG 606 ||||||| || |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| Sbjct 361 GGCACAGAAG-AACAGCAACACAAGTGGTTGTCTCTAGCTAATAAGATGCAGATAATTGG 419 Query 607 ATGTTATGCTCAAACTGAGCTTGGTCATGGCTCTAATGTTCAAGGCCTTGAGACAACCGC 666 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 420 ATGTTATGCTCAAACTGAGCTTGGTCATGGCTCTAATGTTCAAGGACTTGAGACAACCGC 479 Query 667 TACTTTTGATCCAAAGACAGATCAGTTTATCATTCACAGTCCAACTCAGACATCATCCAA 726 ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 480 CACTTTCGATCCAAAGACAGACCAGTTTATCATTCACAGTCCAACTCAGACATCATCTAA 539 Query 727 ATGGTGGCCTGGTGGGTTAGGAAAAGTTTCTACTCATGCTGTTATTTATGCTCGTCTAAT 786 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 540 ATGGTGGCCTGGTGGACTAGGAAAAGTTTCTACTCATGCTGTTGTTTATGCTCGTCTAAT 599 Query 787 AACCAATGGCAAAGACCATGGTGTACATGGATTCATCGTGCAGCTGCGTAGTTTGGATGA 846 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 AACCAATGGCAAAGACCATGGTGTCCATGGATTCATCGTGCAGCTGCGTAGTTTGGATGA 659 Query 847 TCATTCTCCTCTTCCGGGTATAACCGTTGGTGATATCGGAATGAAGTTTGGAAACGGGGC 906 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 TCATTCTCCGCTTCCAGGTATAACCGTTGGTGATATCGGAATGAAGTTTGGAAACGGGGC 719 Query 907 ATATAACTCAATGGACAATGGTTTTCTTATGTTTGATCATTTTCGCATTCCTAGAGATCA 966 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 720 ATATAACTCAATGGACAATGGTTTTCTTATGTTTGATCATTTTCGTATTCCTAGAGATCA 779 Query 967 AATGCTCATGAGACTGTCAAAAGTTACAAGAGAAGGAAAATATGTAGCATCAGATGTTCC 1026 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 AATGCTCATGAGACTGTCAAAAGTTACAAGAGAAGGAAAATATGTAGCATCAGATGTTCC 839 Query 1027 AAGGCAATTGGTGTATGGTACTATGGTGTATGTGAGACAGTCTATTGTGTCAAATGCTTC 1086 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 AAGGCAATTGGTGTATGGTACTATGGTGTATGTGAGACAGTCTATTGTGTCAAATGCTTC 899 Query 1087 CACCGCGCTGGCTCGGGCAGTTTGCATTGCTACTAGGTACAGTGCTGTTCGAAGGCAGTT 1146 |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 CACCGCGCTGGCTCGGGCGGTCTGCATTGCTACAAGGTACAGTGCTGTTCGAAGGCAGTT 959 Query 1147 TGGCTCACATGATGGTGGCATTGAGACACAGGTGATTAATTATAAAACTCAGCAGAACAG 1206 ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct 960 TGGCTCACAGGATGGTGGAATTGAGACACAGGTGATTGATTATAAAACACAGCAGAACAG 1019 Query 1207 GTTGTTTCCTCTGCTGGCATCTGCATATGCATTTCGGTTTGTAGGGGAATGGCTGAAGTG 1266 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || Sbjct 1020 ATTGTTTCCTCTGCTAGCATCTGCATATGCATTTCGATTTGTAGGGGAGTGGCTGAAATG 1079 Query 1267 GCTCTACACTGATGTAACAAAAAGACTAGAGGCCAGTGATTTCGCAACATTGCCTGAAGC 1326 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1080 GCTCTACACTGATGTAACAAAAAGACTAGACACCAGTGATTTCGCAACATTGCCTGAAGC 1139 Query 1327 TCATGCATGCACTGCTGGATTGAAGTCTATGACTACCTCAGCCACCTCTGATGGGATTGA 1386 |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1140 TCATGCTTGCACTGCAGGATTGAAGTCTATGACTACCTCAGCCACCTCTGATGGTATTGA 1199 Query 1387 AGAATGTCGTAAGTTATGTGGTGGACATGGATACTTGTGGTGTAGTGGGCTTCCTGAATT 1446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct 1200 AGAATGTCGTAAGTTATGTGGTGGACATGGATACTTGTGGTGTAGTGGCCTTCCTGAGTT 1259 Query 1447 GTTTGCTGTATATGTTCCTGCTTGCACATACGAGGGAGACAATGTTGTGTTGCAGTTACA 1506 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1260 GTTTGCTGTATATGTTCCTGCTTGCACATATGAGGGAGACAATGTTGTGTTGCAATTACA 1319 Query 1507 GGTTGCTAGATTTCTGATGAAGACAGTTTCACAGTTGGGTTCTGGAAAGGCTCCTTCTGG 1566 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1320 GGTTGCTAGATTTCTGATGAAGACAGTTTCACAATTGGGTTCTGGAAAGGCTCCTTCTGG 1379 Query 1567 GACAACTGCTTATATGGGCAGAGCAAAACACCTTTTGCAATGCAGTTCCGGAGTTCGAAA 1626 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| Sbjct 1380 GACAACTGCTTATATGGGCAGAGCAAAACACCTTTTGCAATGCCGTTCCGGTGTTCGAAA 1439 Query 1627 TGCT-AGGGACTGGTTAAACCCTGGTATGGTGTTGGAAGCTTTTGAAGCAAGAGCTTTGA 1685 |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1440 TGCTGAGG-ATTGGTTAAACCCTGGTATGGTGTTGGAAGCTTTTGAAGCAAGGGCTTTGA 1498 Query 1686 GAATGGCTGTTACTTGTGCTAACAATCTAAGCAAGTTTGAGAATCAAGAACAAGGATTCT 1745 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1499 GAATGGCTGTTACTTGTGCTAACAATCTAAGCAAGTTTGAGAATCAAGAACAAGGATTCT 1558 Query 1746 CAGAACTCTTGGCTGATCTTGTTGAGGCTGCTACTGCTCATTGCCAGTTAATTGTTGTTT 1805 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1559 CAGAACTCTTGGCTGATCTTGTTGAGGCTGCTACTGCTCATTGCCAGTTAATTGTTGTTT 1618 Query 1806 CTAAGTTTATAGCCAAAGTAGAGGGAGATATTGAAGGAAAAGGAGTGAAGAAACAGCTCA 1865 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1619 CTAAGTTTATAGCCAAAGTAGAGGGAAATATTGAAGGAAAAGGAGTGAAGAAACAGCTCA 1678 Query 1866 AGAATCTATGCTACATCTACGCACTCTATCTCCTTCACAAACACCTTGGTGATTTCCTCA 1925 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1679 AGAATCTATGCTACATCTATGCACTCTATCTCCTTCACAAACACCTTGGTGATTTCCTCA 1738 Query 1926 GTACAAACTCTGTTACTCCTGAACAAGCCTCACTTGCGAACCAGC-AGCTTCGATCACTC 1984 ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| || ||||||| |||||| Sbjct 1739 GTACAAACTCTGTCACTCCTGAACAAGGCTCCCTCGCGAACC-GCCAGCTTCGGTCACTC 1797 Query 1985 TACTCTCAGGTTCGACCAAACGCAGTGGCCCTAGTGGACGCCTTCGACTACACGGACCAG 2044 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| Sbjct 1798 TACTCTCAGGTTCGACCAAACGCAGTGGCCCTAGTGGATGCCTTTGACTACACTGACCAC 1857 Query 2045 TATCTTGGCTCTGT-CTTAGGCCGCTATGACGGAAACGTTTATCCAAAGCTTTTCGAGGA 2103 |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1858 TATCTTGGCTCTGTGCTG-GGCCGCTATGATGGAAACGTTTATCCAAAGCTTTTCGAGGA 1916 Query 2104 AGCGTTGAAGGATCCACTCAATGACTCGGTGGTTCCTGACGGCTACCGTGAGTACATCCG 2163 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || Sbjct 1917 AGCGTTGAAGGATCCACTCAATGACTCGGTGGTTCCTGACGGCTACCATGAATACATTCG 1976 Query 2164 ACCGTTGATTAAGCAACGCTTCCGCTCTGCCAAACTCTAACTCTTTCTTTGTGCGGCTAA 2223 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1977 ACCGTTGATTAAGCAACGCTTCCGCTCTGCCAAACTCTAACTCTTTCTTTGTTCGGCTAA 2036 > Ahg493199 jgi|Araly1|493199|fgenesh2_kg.7__2632__AT4G16760.1 Length=2415 Score = 1869 bits (1012), Expect = 0.0 Identities = 1680/2001 (84%), Gaps = 51/2001 (3%) Strand=Plus/Plus Query 204 GAA-CAATGG-AGAGAGTTGATCACCTTGCCGATGAGAGGAACAAAGCAGAGTTCAACGT 261 ||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||| Sbjct 164 GAATCAATGGAAG-GAGTTGATCACCTTGCTGATGAGAGGAACAAGGCGGAGTTCGACGT 222 Query 262 CGACGATATGAAGATCGTCTGGGCCGGTTCCCGCCACGCTTTCGATGTTTCAAATCGTA- 320 ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| | Sbjct 223 CGAGGAGATGAAGATCGTCTGGGCTGGTTCCCGCCACGCTTTTGAGGTTTCCGATCGAAT 282 Query 321 TGTCTCGCCTCGTCGCTAATGATCCGGTCTTTGAGAAAAGCAAAAGAGCT-GTGATGAGT 379 || | || |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| | | ||||| Sbjct 283 TG-CCCGTCTCGTCGCCAGCGATCCGGTATTTGAGAAAAGCAATAGAGCTCG-GTTGAGT 340 Query 380 AGGAAAGAGTTGTTCAAGAACACGTTGAGGAAAA-GTGTTCACG-CTTGGAAGTTGATTA 437 ||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||| ||| ||| | ||| ||| ||||| Sbjct 341 AGGAAGGAGCTGTTTAAGAGTACGTTGA-GAAAATGTGCTCATGCCTT-TAAGAGGATTA 398 Query 438 ACGAGCTTCGTCTCTCAGATGAGGAAGGACTCAA-ATTGA-G-ATCTTTCATGGATCAAC 494 ||||||||||||| | || || |||| | || ||||| | | |||| || ||||| | Sbjct 399 TCGAGCTTCGTCTCACTGAGGAAGAAGCA-GGAAGATTGAGGCA-CTTT-ATCGATCAGC 455 Query 495 CAGGCTTCT-TGGATCTGCATTGGGGAATGTTTGTGCCTGCAATTAAAGGACAAGGCACA 553 | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| Sbjct 456 C-TGCCTATGTGGATCTGCATTGGGGAATGTTTGTGCCTGCTATTAAGGGGCAGGGCACA 514 Query 554 GAGCAACAACAACAA-AAGTGGTTGTCTTTAGCTACTAAGATGCAGATAATTGGATGTTA 612 ||| | || | | || ||||||||||| | || | |||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 515 GAGGAGCAGC-AGAAGAAGTGGTTGTCGCTGGCGAATAAGATGCAGATTATTGGGTGTTA 573 Query 613 TGCTCAAACTGAGCTTGGTCATGGCTCTAATGTTCAAGGCCTTGAGACAACCGCTACTTT 672 ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || Sbjct 574 TGCACAGACTGAGCTTGGTCATGGCTCAAATGTTCAAGGACTTGAGACAACTGCCACATT 633 Query 673 TGATCCAAAGACAGATCAGTTTATCATTCACAGTCCAACTCAGACAT-CATCCAAATGGT 731 |||||| ||||| ||| ||||| | ||||| | |||||||||||| | |||||||||||| Sbjct 634 TGATCCCAAGACTGATGAGTTTGTAATTCATACTCCAACTCAGAC-TGCATCCAAATGGT 692 Query 732 GGCCTGGTGGGTTAGGAAAAGTTTCTACTCATGCTGTTATTTATGCTCGTCTAATAACCA 791 |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| | Sbjct 693 GGCCTGGTGGTTTGGGAAAAGTTTCTACCCATGCTGTTGTTTACGCTCGTCTCATAACTA 752 Query 792 ATGGCAAAGACCATGGTGTACATGGATTCATCGTGCAGCTGCGTAGTTTGGATGATCATT 851 | || |||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||| Sbjct 753 ACGGAAAAGACTATGGTATCCATGGATTCATCGTGCAACTGCGCAGCTTAGAAGACCATT 812 Query 852 CTCCTCTTCCGGGTATAACCGTTGGTGATATCGGAATGAAGTTTGGAAACGGGGCATATA 911 ||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||| | ||||| || ||||||| Sbjct 813 CTCCTCTTCCGAATATAACTGTTGGTGATATCGGGACGAAGATGGGAAATGGAGCATATA 872 Query 912 ACTCAATGGACAATGGTTTTCTTATGTTTGATCATTTTCGCATTCCTAGAGATCAAATGC 971 | ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 873 ATTCAATGGACAACGGGTTTCTTATGTTTGATCATGTTCGCATTCCTAGAGATCAAATGC 932 Query 972 TCATGAGACTGTCAAAAGTTACAAGAGAAGGAAAATATGTAGCATCAGATGTTCCAAGGC 1031 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| || Sbjct 933 TCATGAGGCTGTCAAAAGTTACAAGGGAAGGAAAATATGTTCCATCGGATGTTCCAAAGC 992 Query 1032 AATTGGTGTATGGTACTATGGTGTATGTGAGAC-AGTCTATTGTGTCAAATGCTTCCACC 1090 | |||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || ||||||||| Sbjct 993 AGCTGGTATATGGTACTATGGTGTATGTGAGACAAG-CAATTGTGGCAGATGCTTCCATT 1051 Query 1091 GCGCTGGCTCGGGCAGTTTGCATTGCTACTAGGTACAGTGCTGTTCGAAGGCAGTTTGGC 1150 || || |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||| Sbjct 1052 GCACTATCTCGAGCAGTTTGCATAGCTACAAGGTACAGCGCAGTGCGGAGGCAGTTTGGC 1111 Query 1151 TCACATGATGGTGGCATTGAGACACAGGTGATTAATTATAAAACTCAGCAGAACAGGTTG 1210 ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1112 GCACATAATGGTGGCATTGAGACACAGGTGATTGATTATAAAACTCAGCAGAACAGGCTA 1171 Query 1211 TTTCCTCTGCTGGCATCTGCATATGCATTTCGGTTTGTAGGGGAATGGCTGAAGTGGCTC 1270 ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| Sbjct 1172 TTTCCTCTGCTAGCATCTGCATATGCATTTCGATTTGTTGGAGAGTGGCTAAAATGGCTG 1231 Query 1271 TACACTGATGTAACAAAAAGACTAGAGGCCAGTGATTTCGCAACATTGCCTGAAGCTCAT 1330 ||||| |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct 1232 TACACGGATGTAACTGAAAGACTGGCGGCTAGTGATTTCGCAACTTTGCCTGAGGCTCAT 1291 Query 1331 GCATGCACTGCTGGATTGAAGTCTATGACTACCTCAGCCACCT-CTGATGGGATTGAAGA 1389 ||||||||||| || ||||||||| | || ||| |||||| || | |||| |||||||| Sbjct 1292 GCATGCACTGCAGGGTTGAAGTCTCTCACCACCACAGCCA-CTGCGGATGCCATTGAAGA 1350 Query 1390 ATGTCGTAAGTTATGTGGTGGACATGGATACTTGTGGTGTAGTGGGCTTCCTGAATTGTT 1449 |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||| Sbjct 1351 ATGTCGTAAGTTATGTGGTGGACACGGCTACTTGTGGTGCAGTGGGCTCCCCGAGCTGTT 1410 Query 1450 TGCTGTATATGTTCCTGCTTGCACATACGAGGGAGACAATGTTGTGTTGCAGTTACAGGT 1509 |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct 1411 TGCTGTATATGTTCCTGCCTGCACATACGAAGGAGACAATGTTGTGCTGCAATTACAGGT 1470 Query 1510 TGCTAGATTTCTGATGAAGACAGTTTCACAGTTGGGTTCTGGAAAGGCTCCT-TCTGGGA 1568 |||| |||| || ||||||||||| | ||| |||| |||||||||| |||| | ||| | Sbjct 1471 TGCTCGATTCCTCATGAAGACAGTCGCCCAGCTGGGATCTGGAAAGGTTCCTGT-TGGCA 1529 Query 1569 CAACTGCTTATATGGGCAGAGCAAAACACCTTTTGCAATG-CAGTTCCGGAGTTCGAAAT 1627 ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| | |||| || |||| ||| Sbjct 1530 CAACTGCTTATATGGGCCGGGCCGCACATCTTTTGCAATGTC-GTTCTGGTGTTCAAAAG 1588 Query 1628 GCT-AGGGACTGGTTAAACCCTGGTATGGTGTTGGAAGCTTTTGAAGCAAGAGCTTTGAG 1686 ||| ||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| Sbjct 1589 GCTGAGG-ATTGGTTAAACCCTGATGCGGTACTGGAAGCTTTCGAAGCTAGGGCTCTGAG 1647 Query 1687 AATGGCTGTTACTTGTGCTAACAATCTAAGCAAGTTTGAGAATCAAGAACAAGGATTCTC 1746 |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | Sbjct 1648 AATGGCTGTTACTTGTGCCAAAAATCTCAGCAAGTTTGAGAATCAGGAACAAGGATTC-C 1706 Query 1747 A-GAACTCTTGGCTGATCTTG-TTGAGGCTGCTACTGCTCATTGCCAGTTAATTGTTGTT 1804 | || |||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| Sbjct 1707 AAGAGCTCTTGGCTGAT-TTGGTTGAGGCCGCTATTGCTCATTGCCAATTGATTGTTGTT 1765 Query 1805 TCTAAGTTTATAGCCAAAGTAGAG--GGAGATATTGAAGGAAAAGGAGTGAAGAAACAGC 1862 || ||||| ||||| ||| ||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||| Sbjct 1766 TCCAAGTTCATAGCGAAACTAGAGCAGGACATAG-GA-GGCAAAGGAGTGAAGAAACAGC 1823 Query 1863 TCAAGAATCTATGCTACATCTACGCACTCTATCTCCTTCACAAACACCTTGGTGATTTCC 1922 | || ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||| Sbjct 1824 TGAATAATCTGTGTTACATTTACGCGCTTTATCTCCTTCACAAACATCTCGGTGATTTCC 1883 Query 1923 TCAGTACAAACTCTGTTACTCCTGAACAAGCCTCACTTGCGAACCAGCAGCTTCGATCAC 1982 || || ||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||| | ||||| || || | Sbjct 1884 TCTCCACTAACTCCATCACTCCCAAACAAGCCTCTCTTGCTAACGACCAGCTCCGTTC-C 1942 Query 1983 TC-TACTCTCAGGTTCGACCAAACGCAGTGGCCCTAGTGGACGCCTTCGACTACACGGAC 2041 | ||||||||||| || || || || || || || |||||||||||| | ||||| ||| Sbjct 1943 TTATACTCTCAGGTCCGTCCTAATGCGGTTGCACTTGTGGACGCCTTCAATTACACAGAC 2002 Query 2042 CAGTATCTTGG-CTCTGT-CTTAGGCCGCTATGACGGAAACGTTTATCCAAAGCT-TTTC 2098 || || |||| ||| || || ||||| |||||||| || || || |||||||| ||| Sbjct 2003 CATTA-CTTGAACTCGGTGCTG-GGCCGTTATGACGGTAATGTGTACCCAAAGCTCTTT- 2059 Query 2099 GAGGAAGCGTTGAAGGATCCACTCAATGACTCGGTGGTTCCTGACGGCTACCGTGAGTAC 2158 |||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| || |||| ||| ||| Sbjct 2060 GAGGAAGCGTGGAAGGATCCATTGAACGACTCGGTGGTTCCTGATGGGTACCATGAATAC 2119 Query 2159 ATCCGACC-GTTGATTAAGCA 2178 | ||||| || | ||||||| Sbjct 2120 CTTCGACCTGT-GCTTAAGCA 2139 > Ahg918666 jgi|Araly1|918666|Al_scaffold_0575_1 Length=1071 Score = 1712 bits (927), Expect = 0.0 Identities = 1024/1072 (96%), Gaps = 2/1072 (0%) Strand=Plus/Plus Query 209 ATGGAGAGAGTTGATCACCTTGCCGATGAGAGGAACAAAGCAGAGTTCAACGTCGACGAT 268 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGAGAGAGTTGATCACCTTGCTGATGAGAGGAACAAAGCTGAGTTCAACGTCGACGAT 60 Query 269 ATGAAGATCGTCTGGGCCGGTTCCCGCCACGCTTTCGATGTTTCAAATCGTATGTCTCGC 328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct 61 ATGAAGATCGTCTGGGCCGGTTCCCGCCACGCTTTCGACGTTTCAAATCGCATTTCTCGC 120 Query 329 CTCGTCGCTAATGATCCGGTCTTTGAGAAAAGCAAAAGAGCTGTGATGAGTAGGAAAGAG 388 |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| Sbjct 121 CTCGTCGCCAATGATCCGATCTTTGAGAAAAGCAAAAGAGCAGTAATGAGAAGGAAAGAG 180 Query 389 TTGTTCAAGAACACGTTGAGGAAAAGTGTTCACGCTTGGAAGTTGATTAACGAGCTTCGT 448 || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 181 TTATTCAAGAACACGTTGAGAAAAAGTGTTCACGCTTGGAAGATGATTAACGAGCTTCGT 240 Query 449 CTCTCAGATGAGGAAGGACTCAAATTGAGATCTTTCATGGATCAACCAGGCTTCTTGGAT 508 ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CTCTCTGATGAGGAAGGAATCAAATTAAGATCTTTCATGGATCAACCAGGCTTCTTGGAT 300 Query 509 CTGCATTGGGGAATGTTTGTGCCTGCAATTAAAGGACAAGGCACAG-AGCAACAACAACA 567 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| Sbjct 301 CTGCATTGGGGAATGTTTGTGCCTGCACTTAAAGGACAAGGCACAGAAG-AACAGCAACA 359 Query 568 AAAGTGGTTGTCTTTAGCTACTAAGATGCAGATAATTGGATGTTATGCTCAAACTGAGCT 627 |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 CAAGTGGTTGTCTCTAGCTAATAAGATGCAGATAATTGGATGTTATGCTCAAACTGAGCT 419 Query 628 TGGTCATGGCTCTAATGTTCAAGGCCTTGAGACAACCGCTACTTTTGATCCAAAGACAGA 687 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 420 TGGTCATGGCTCTAATGTTCAAGGACTTGAGACAACCGCCACTTTCGATCCAAAGACAGA 479 Query 688 TCAGTTTATCATTCACAGTCCAACTCAGACATCATCCAAATGGTGGCCTGGTGGGTTAGG 747 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct 480 CCAGTTTATCATTCACAGTCCAACTCAGACATCATCTAAATGGTGGCCTGGTGGACTAGG 539 Query 748 AAAAGTTTCTACTCATGCTGTTATTTATGCTCGTCTAATAACCAATGGCAAAGACCATGG 807 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 AAAAGTTTCTACTCATGCTGTTGTTTATGCTCGTCTAATAACCAATGGCAAAGACCATGG 599 Query 808 TGTACATGGATTCATCGTGCAGCTGCGTAGTTTGGATGATCATTCTCCTCTTCCGGGTAT 867 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 600 TGTCCATGGATTCATCGTGCAGCTGCGTAGTTTGGATGATCATTCTCCGCTTCCAGGTAT 659 Query 868 AACCGTTGGTGATATCGGAATGAAGTTTGGAAACGGGGCATATAACTCAATGGACAATGG 927 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 AACCGTTGGTGATATCGGAATGAAGTTTGGAAACGGGGCATATAACTCAATGGACAATGG 719 Query 928 TTTTCTTATGTTTGATCATTTTCGCATTCCTAGAGATCAAATGCTCATGAGACTGTCAAA 987 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 TTTTCTTATGTTTGATCATTTTCGTATTCCTAGAGATCAAATGCTCATGAGACTGTCAAA 779 Query 988 AGTTACAAGAGAAGGAAAATATGTAGCATCAGATGTTCCAAGGCAATTGGTGTATGGTAC 1047 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 AGTTACAAGAGAAGGAAAATATGTAGCATCAGATGTTCCAAGGCAATTGGTGTATGGTAC 839 Query 1048 TATGGTGTATGTGAGACAGTCTATTGTGTCAAATGCTTCCACCGCGCTGGCTCGGGCAGT 1107 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 840 TATGGTGTATGTGAGACAGTCTATTGTGTCAAATGCTTCCACCGCGCTGGCTCGGGCGGT 899 Query 1108 TTGCATTGCTACTAGGTACAGTGCTGTTCGAAGGCAGTTTGGCTCACATGATGGTGGCAT 1167 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct 900 CTGCATTGCTACAAGGTACAGTGCTGTTCGAAGGCAGTTTGGCTCACAGGATGGTGGAAT 959 Query 1168 TGAGACACAGGTGATTAATTATAAAACTCAGCAGAACAGGTTGTTTCCTCTGCTGGCATC 1227 |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 960 TGAGACACAGGTGATTGATTATAAAACACAGCAGAACAGATTGTTTCCTCTGCTAGCATC 1019 Query 1228 TGCATATGCATTTCGGTTTGTAGGGGAATGGCTGAAGTGGCTCTACACTGAT 1279 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| Sbjct 1020 TGCATATGCATTTCGATTTGTAGGGGAGTGGCTGAAATGGCTCTACACCGAT 1071 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 89550165995 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5