BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G39800.1 Length=2886 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg483012 jgi|Araly1|483012|fgenesh2_kg.4__2072__AT2G39800.1 4510 0.0 Ahg485989 jgi|Araly1|485989|fgenesh2_kg.5__1981__AT3G55610.1 2383 0.0 Ahg952470 jgi|Araly1|952470|scaffold_77200001.1 1242 0.0 > Ahg483012 jgi|Araly1|483012|fgenesh2_kg.4__2072__AT2G39800.1 Length=2802 Score = 4510 bits (2442), Expect = 0.0 Identities = 2701/2823 (96%), Gaps = 29/2823 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 CTTCCACGGCGTTTCCTCAGCCGCCGATTTTATTTATTTCCCAAAATACCCATCACCTAT 60 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1 CTTCCACGGCGCTTCCTCAGCCGCCGATTTTATTTATTTCCCAAAATACCCATCACCCCT 60 Query 61 AGCGCCACAATCCTCTACATCACACCCTAATCTCATTACCATACACCACCCAACGAACAC 120 ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 61 AGCGCCACAATCCCCTACAACACACCCTACTCTCCTTACCATACACCACCCAACGACCAC 120 Query 121 GCGCCACTTCATTTGTTAGTATCTAAAATACCAAACCTACCCTTAGTTCC-ACACGTGGC 179 |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| Sbjct 121 GCGCCACTTCATCTGTCAGTGTCTAAAATACCAAATCTACCCTTA-TTCCAACACGTGGC 179 Query 180 GTTTCCTGGTTTGATAACAGAGCCTGAGTCTCTGGTGTCGCTGGTGTTTATAAACCCCTT 239 | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct 180 GCTTCATGGTTTGGTAACAGAGCCTGAGTCTCTGGTGTTGTTGGTGTTTATAAACCCCTT 239 Query 240 CATATCTTCCTTGGTGATCTCCACCTTTCCCTCACCTGATATTTATTTTCTTACCTTAAA 299 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | Sbjct 240 CATATCTTCCTTGGTGATCTCCACCTTTCCCTCACCTGATATTTA-TTT-TTA-C----- 291 Query 300 TACGACGGTGCTTCACTGAGTCCGACTCAGTTAACTCGTTCCTCTCTC--TGT-GTGTGG 356 ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| Sbjct 292 -ACG-C--TGCTTCACTGATTCCGACTCAGTTAACTCGTTCCTCTCTCTGTGTGGTGTGG 347 Query 357 TTTTGGTAGACGACGACGACGATAATGGAGGAGCTAGATCGTTCACGTGCTTTTGCCAGA 416 ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 348 TTTTGGT--A-GACGACGACGATAATGGAGGAGTTAGATCGTTCACGTGCTTTTGCTAGA 404 Query 417 GACGTCAAACGTATCGTCGTTAAGGTTGGGACAGCAGTTGTTACTGGAAAAGGTGGAAGA 476 ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 405 GACGTTAAACGTATCGTCGTTAAGGTTGGGACCGCAGTTGTAACTGGAAAAGGTGGAAGA 464 Query 477 TTGGCTCTTGGTCGTTTAGGAGCACTGTGTGAACAGCTTGCGGAATTAAACTCGGATGGA 536 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 465 TTGGCTCTTGGTCGATTAGGAGCACTGTGTGAACAGCTTGCGGAATTAAACTCGGATGGA 524 Query 537 TTTGAGGTGATATTGGTGTCATCTGGTGCGGTTGGTCTTGGCAGGCAAAGGCTTCGTTAT 596 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| Sbjct 525 TTTGAGGTGATATTGGTGTCATCTGGTGCGGTTGGTCTTGGCCGGCAAAGGCTTCGATAT 584 Query 597 CGACAATTAGTCAATAGCAGCTTTGCGGATCTTCAGAAGCCTCAGACTGAACTTGATGGG 656 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 585 CGACAATTAGTCAATAGCAGCTTTGCGGATCTTCAGAAGCCTCAGACTGAACTTGATGGG 644 Query 657 AAGGCTTGTGCTGGTGTTGGACAAAGCAGTCTTATGGCTTACTATGAGACTATGTTTGAC 716 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct 645 AAGGCTTGTGCTGGTGTTGGACAAAGCAGTCTTATGGCTTATTATGAGACTATGTTCGAC 704 Query 717 CAGCTTGATGTGACGGCAGCTCAACTTCTGGTGAATGACAGTAGTTTTAGAGACAAGGAT 776 ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 705 CAGCTGGATGTGACCGCGGCTCAACTTCTGGTGAATGACAGTAGCTTTAGAGACAAGGAT 764 Query 777 TTCAGGAAGCAACTTAATGAAACTGTCAAGTCTATGCTTGATTTGAGGGTTATTCCAATT 836 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 765 TTCAGGAAGCAACTTAATGAAACTGTCAAGTCCATGCTTGATTTGAGGGTTATTCCAATT 824 Query 837 TTCAATGAGAATGATGCTATTAGCACCCGAAGAGCCCCATATCAGGATTCTTCTGGTATT 896 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 825 TTCAATGAGAATGATGCTATTAGCACCCGAAGAGCCCCTTATCAGGATTCTTCTGGTATT 884 Query 897 TTCTGGGATAACGATAGCTTAGCTGCTCTACTGGCGTTGGAACTGAAAGCTGATCTTCTG 956 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 885 TTCTGGGATAACGATAGCTTAGCTGCTCTACTGGCGCTCGAACTGAAAGCTGATCTTCTG 944 Query 957 ATTCTTCTGAGCGATGTTGAAGGTCTTTACACAGGCCCTCCAAGTGATCCTAACTCAAAG 1016 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 945 ATTCTCCTGAGTGATGTTGAAGGTCTTTACACAGGCCCTCCAAGTGATCCTAACTCAAAG 1004 Query 1017 TTGATCCACACTTTTGTTAAAGAAAAACATCAAGATGAGATTACATTCGGCGACAAATCA 1076 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1005 TTGATCCACACTTTTGTTAAAGAAAAACATCAAGACGAGATTACATTCGGCGACAAATCA 1064 Query 1077 AGATTAGGGAGAGGGGGTATGACTGCAAAAGTCAAAGCTGCAGTCAATGCAGCTTATGCT 1136 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1065 AGATTAGGGAGAGGGGGTATGACTGCAAAAGTCAAAGCTGCAGTGAATGCAGCTTATGCT 1124 Query 1137 GGGATTCCTGTCATCATAACCAGTGGGTATTCAGCTGAGAACATAGATAAAGTCCTCAGA 1196 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| Sbjct 1125 GGGATTCCTGTCATCATAACCAGTGGCTATTCAGCTGAGAACATTGACAAAGTCCTCAGA 1184 Query 1197 GGACTACGTGTTGGAACCTTGTTTCATCAAGATGCTCGTTTATGGGCTCCGATCACAGAT 1256 ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1185 GGACTGCGTGTTGGAACCTTATTCCATCAAGATGCTCGTTTATGGGCTCCGATCACAGAT 1244 Query 1257 TCTAATGCTCGTGACATGGCAGTTGCTGCGAGGGAAAGTTCCAGAAAGCTTCAGGCCTTA 1316 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1245 TCTAATGCTCGTGACATGGCAGTTGCTGCGAGGGAAAGTTCCAGAAAGCTTCAGGCCTTA 1304 Query 1317 TCTTCGGAAGACAGGaaaaaaaTTCTGCTTGATATTGCCGATGCCCTTGAAGCAAATGTT 1376 ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1305 TCTTCAGAAGATAGGAAAAAAATTCTGCTTGATATTGCCGATGCCCTTGAAGCAAATGAA 1364 Query 1377 ACTACAATCAAAGCTGAGAATGAGTTAGATGTAGCTTCTGCACAAGAGGCTGGGTTGGAA 1436 || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1365 ACAAGAATCAAAGCTGAGAATGAGTTAGATGTAGCTGCTGCACAAGAGGCTGGGTTGGAA 1424 Query 1437 GAGTCAATGGTGGCTCGCTTAGTTATGACACCTGGAAAGATCTCGAGCCTTGCAGCTTCA 1496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1425 GAGTCAATGGTGGCTCGCTTAGTTATGACACCTGGAAAGATCTCGAGCCTTGCAGCTTCA 1484 Query 1497 GTTCGTAAGCTAGCTGATATGGAAGATCCAATCGGCCGTGTTTTAAAGAAAACAGAGGTG 1556 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1485 GTTCGTAAGCTAGCTGAAATGGAAGATCCAATCGGCCGTGTTTTAAAGAAAACAGAGGTG 1544 Query 1557 GCAGATGGTCTTGTCTTAGAGAAGACCTCATCACCATTAGGCGTACTTCTGATTGTTTTT 1616 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1545 GCAGATGGTCTTGTCTTAGAGAAGACCTCATCTCCATTAGGCGTACTCCTGATTGTTTTT 1604 Query 1617 GAATCCCGACCTGATGCACTTGTACAGATAGCTTCACTTGCCATCCGTAGTGGAAATGGT 1676 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1605 GAATCCCGACCTGATGCACTTGTACAGATAGCTTCACTTGCCATCCGTAGTGGAAATGGT 1664 Query 1677 CTTCTGCTGAAGGGTGGAAAGGAGGCCCGGCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTGATC 1736 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1665 CTTCTGTTGAAGGGTGGAAAAGAGGCCCGGCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTAATT 1724 Query 1737 ACTGATGCAATTCCAGAGACTGTTGGGGGTAAACTCATTGGACTTGTGACTTCAAGAGAA 1796 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1725 ACTGATGCAATTCCAGAGACTGTTGGGGGTAAACTCATTGGACTTGTGACTTCAAGAGAA 1784 Query 1797 GAGATTCCTGATTTGCTTAAGCTTGAT-GACGTTATCGATCTTGTGATCCCAAGAGGAAG 1855 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || Sbjct 1785 GAGATTCCTGATTTGCTTAAGC-TGATGGACGTTATTGATCTGGTGATCCCAAGAGGCAG 1843 Query 1856 CAACAAGCTTGTTACTCAGATAAAAAATACTACAAAAATCCCTGTGCTAGG-TCATGCTG 1914 ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || || |||||||| Sbjct 1844 CAACAAGCTTGTTACTCAGATTGAAAATACTACGGAAATGCGTGTACT-GGTTCATGCTG 1902 Query 1915 ATGGAATCTGTCATGTATATGTCGACAAGGCTTGTGATACGGATATGGCAAAGCGCATAG 1974 |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1903 ATGGAATCTGTCATGTGTATGTCGACAAGTCTTGTGATACGGATATGGCAAAGCGCATAG 1962 Query 1975 TTTCTGATGCAAAGTTGGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACCCTTCTTGTGC 2034 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 1963 TTTCTGATGCAAAGTTGGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACTCTCCTTGTGC 2022 Query 2035 ATAAGGATCTAGAGCAGAATGCTGTGCTTAATGAGCTTATTTTTGCTCTGCAGAGCAATG 2094 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2023 ATAAGGATCTAGAGCAGAATGCTGTGCTCAATGAGCTTATTTTTGCTCTTCAGAGCAATG 2082 Query 2095 GAGTCACTTTGTATGGTGGACCAAGGGCAAGT-AAGATACTGAACATACCAGAAGCACGG 2153 |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2083 GAGTCACTTTGTATGGTGGACCAAGGGCAAGTGCA-ATACTGAACATACCAGAAGCACGG 2141 Query 2154 TCATTCAACCATGAGTACTGTGCCAAGGCTTGCACTGTTGAAGTTGTAGAAGACGTTTAT 2213 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2142 TCATTTAACCATGAGTACTGTGCCAAGGCTTGCACTGTTGAAGTTGTAGAAGACGTTTAT 2201 Query 2214 GGTGCTATAGATCACATTCACCGACATGGGAGTGCACACACAGACTGCATTGTGACAGAG 2273 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2202 GGTGCTATAGATCACATTCACCGACATGGGAGTGCACACACAGACTGCATTGTGACAGAG 2261 Query 2274 GATCACGAAGTTGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTGGATAGCGCTGCTGTGTTCCACAAC 2333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 2262 GATCACGAAGTTGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTGGACAGCGCTGCTGTTTTCCACAAC 2321 Query 2334 GCCAGCACAAGATTCTCAGATGGTTTCCGATTTGGACTTGGTGCAGAGGTGGGGGTAAGC 2393 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct 2322 GCAAGCACAAGATTCTCAGATGGTTTCCGATTTGGACTTGGTGCTGAGGTGGGAGTAAGC 2381 Query 2394 ACGGGCAGGATCCATGCTCGTGGTCCAGTCGGGGTCGAAGGATTACTTACAACGAGATGG 2453 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2382 ACGGGCAGGATCCATGCTCGTGGTCCAGTCGGGGTTGAAGGATTACTTACAACGAGATGG 2441 Query 2454 ATAATGAGAGGAAAAGGACAAGTTGTCGACGGAGACAATGGAATTGTTTACACCCATCAG 2513 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2442 ATAATGAGAGGAAAAGGTCAAGTTGTCGACGGAGACAATGGAATTGTTTACACCCATCAG 2501 Query 2514 GACATTCCCATCCAAGCTTAAA-CAAGACTTCCGAGTGTGTGTTTGTGTATTTGGTTGAG 2572 |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| Sbjct 2502 GACATTCCCATCCAAGCTTAAAACCAGACTTC-GAGTGTGTCTTTTTGTGTTTGGTTGAG 2560 Query 2573 ACTTGAGGAGAGACACAGAGGAGGATGGGCTTTTTTGTTTCCTCTCTGCTTAGTACTCAT 2632 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2561 ACTTGAGGAGAGACACAGAGGAGGATGGGCTTTTT-GTTTCCTCTCTGCTTAGTACTCAT 2619 Query 2633 ATCCTATCATTATTATTATTACTACTACTTATTATTGAAACCCTCGCTTATGTAGTGGTT 2692 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2620 ATCCTATCATTATTATTATTACTACTACTTATTATTGAAACCCTCGCTTATGTAGTGGTT 2679 Query 2693 TTGATTTAGGGTTAGGATTGCACCAAAAATAAGATCCACTTTACCACTTAGTCTTGCTCA 2752 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2680 TTGATTTAGGGTTAGGATTGCACCAAAAATAAGATCCACTTTACCACTTGGTCTTGCTCA 2739 Query 2753 TAAGTACGATGAAGAACATTTAATTAGCTTCTCTTCTTGTCATTGTAAGCTACCTACACA 2812 |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2740 TAAGTAAGATGAAGAACATTTTATTAGCTTCTCTTCTTGTCATTGTAAGCTACCTACACC 2799 Query 2813 TTT 2815 ||| Sbjct 2800 TTT 2802 > Ahg485989 jgi|Araly1|485989|fgenesh2_kg.5__1981__AT3G55610.1 Length=2543 Score = 2383 bits (1290), Expect = 0.0 Identities = 1872/2152 (87%), Gaps = 44/2152 (2%) Strand=Plus/Plus Query 386 GGAGCTAGATCGTTCACGTGCTTTTGCCAGAGACGTCAAACGTATCGTCGTTAAGGTTGG 445 |||| | ||||||||||| || || |||| |||||| || ||||||||||| |||||||| Sbjct 113 GGAGATCGATCGTTCACGCGCGTTCGCCAAAGACGTTAAGCGTATCGTCGTCAAGGTTGG 172 Query 446 GACAGCAGTTGTTACTGGAAAAGGTGGAAGATTGGCTCTTGGTCGTTTAGGAGCACTGTG 505 ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || Sbjct 173 GACTGCAGTTGTTACTGGGAAAGGTGGAAGATTGGCTCTTGGACGTTTAGGAGCAATCTG 232 Query 506 TGAACAGCTTGCGGAATTAAACTCGGATGGATTTGAGGTGATATTGGTGTCATCTGGTGC 565 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct 233 TGAACAGCTTGCGGAATTAAACTCGGATGGATTTGAGGTCATTTTGGTGTCATCTGGTGC 292 Query 566 GGTTGGTCTTGG-CAGGCAAAGGCTTCGTTATCGACAATTAGTCAATAGCAGCTTTGCGG 624 |||||||| || | | || |||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||| | Sbjct 293 CGTTGGTCTCGGTC-GACAGAGGCTTCGATATAGACAACTAGTCAACAGCAGTTTTGCAG 351 Query 625 ATCTTCAGAAGCCTCAGACT-GAACTTGATGGGAAGGCTTGTGCTGGTGTTGGACAAAGC 683 | || |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 352 ACCTACAGAAGCCACAGA-TGGAACTTGATGGGAAGGCTTGTGCTGGTGTTGGACAAAGT 410 Query 684 AGTCTTATGGCTTACTATGAGACTATGTTTGACCAGCTT-GATGTGACGGCAGCTCAACT 742 || || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| | Sbjct 411 AGCCTCATGGCTTACTATGAGACTATGTTTGACCAG-TTGGATGTGACGGTTGCTCAAAT 469 Query 743 TCTGGTGAATGACAGTAGTTTTAGAGACAAGGATTTCAGGAAGCAACTTAATGAAACTGT 802 || |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || Sbjct 470 GCTTGTGACTGATAGCAGTTTTAGAGATAAGGATTTCAGGAAGCAACTTAGTGAAACAGT 529 Query 803 C-AAGTCTATGCTTGA-TTTGAGGGTTATTCCAATTTTCAATGAGAATGATGCTATTAGC 860 | ||| | |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct 530 CAAAG-CGATGC-TGAGGATGAGGGTTATTCCTGTTTTCAATGAAAATGATGCTATAAGC 587 Query 861 ACCCGAAGAGCCCCATATCAGGATTCTTCTGGTAT-TTTCTGGGATAACGATAGCTTAGC 919 || || |||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||||| Sbjct 588 ACTCGCAGAGCCCCCTATAAGGATTCTACTGGTATATTT-TGGGATAATGACAGCTTAGC 646 Query 920 TGCTCTACTGGCGTTGGAACTGAAAGCTGATCTTCTGATTCTTCTGAGCGATGTTGAAGG 979 |||||| ||| || | || ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| || Sbjct 647 TGCTCTTCTGTCGCTAGAGCTGAAAGCTGATCTTTTGATTCTTCTAAGTGATGTTGAGGG 706 Query 980 TCTTTACACAGGCCCTCCAAGTGATCCTAACTCAAAGTTGATCCACACTTTTGTTAAAGA 1039 ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||||| Sbjct 707 TCTTTACACTGGCCCTCCAAGTGATTCTACCTCAAAGTTAATCCACACATTCATTAAAGA 766 Query 1040 AAAACATCAAGATGAGATTACATTCGGCGACAAA-T-CAAGATTAGGGA-GAGGGGGTAT 1096 |||||| || || |||||||| || ||||| ||| | ||| |||| ||| |||||||||| Sbjct 767 AAAACACCAGGACGAGATTACTTTTGGCGA-AAAGTCCAA-ATTA-GGACGAGGGGGTAT 823 Query 1097 GACTGCAAAAGTCAAAGCTGCAGTCAATGCAGCTTATGCTGG-GATTCCTGTCATCATAA 1155 |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| Sbjct 824 GACTGCAAAAGTTAAAGCTGCTGTTAATGCAGCTTATGGTGGCG-TTCCTGTTATCATAA 882 Query 1156 CCAGTGGGTATTCAGCTGAGAACAT-AGATAAAGTCCTCAGAGGACTACGTGTTGGAACC 1214 ||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||||||| |||||||| ||| Sbjct 883 CCAGTGGGTATGCAGCTGAGAATATAAG-TAAAGTCCTTAGAGGACTGCGTGTTGGTACC 941 Query 1215 TTGTTTCATCAAGATGCTCGTTTATGGGCTCCGATCACAGATTCTAATGCTCGTGACATG 1274 |||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||| ||| | ||||||||||| Sbjct 942 CTGTTCCATCAAGATGCTCATTTGTGGGCGCCGGTCGTAGATACTACTTCTCGTGACATG 1001 Query 1275 GCAGTTGCTGCGAGGGAAAGTTCCAGAAAGCTTCAGGCCTTATCTTCGGAAGACAGGaaa 1334 ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct 1002 GCAGTTGCTGCAAGGGAAAGCTCGAGAAAGCTTCAGGCCTTATCTTCAGAAGATAGGAAA 1061 Query 1335 aaaaTTCTGCTTGATATTGCCGATGCCCTTGAAGCAAATGTTACTACAATCAAAGCTGAG 1394 ||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| Sbjct 1062 CAAATTCTACTCGACATTGCCAATGCCCTTGAAGCAAATGAGAAAACAATTAAAGCTGAG 1121 Query 1395 AATGAGTTAGATGTAGCTTCTGCACAAGAGGCTGGGT-TGGAAGAGTCAATGGTGGCTCG 1453 ||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| | | |||||||| |||| ||||| Sbjct 1122 AATGATTTAGATGTCGCTGCAGCACAAGAAGCTGGATAT-GAAGAGTCTTTGGTAGCTCG 1180 Query 1454 CTTAGTTATGACA-CCTGGAAAGATCTCGAGCCTTGCAGCTTCAGTTCGTAAGCTAGCTG 1512 ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||| Sbjct 1181 CTTAGTTATGA-AGCCTGGGAAGATCTCAAGCCTTGCGGCTTCCGTACGCCAGCTAGCTG 1239 Query 1513 ATATGGAAGATCCAATCGGCCGTGTTTTAAAGAAAACAGAGGTGGCAGATGGTCTTG-TC 1571 | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || || | Sbjct 1240 AAATGGAAGATCCAATAGGCCGTGTATTAAAGAAAACCCAGGTTGCAGATGATC-TGATT 1298 Query 1572 TTAGAGAAGACCTCATCACCATTAGGCGTACTTCTGATTGTTTTTGAATCCCGACCTGAT 1631 ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1299 TTAGAGAAGACCTCATCACCAATAGGTGTTCTTCTGATTGTTTTTGAATCCCGGCCTGAT 1358 Query 1632 GCACTTGTACAGATAGCTTCACTTGCCATCCGTAGTGGAAATGGTCTTCTGCTGAAGGGT 1691 |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1359 GCACTTGTTCAAATAGCTTCGCTTGCAATCCGGAGTGGAAATGGTCTTCTCCTGAAGGGT 1418 Query 1692 GGAAAGGAGGCCCGGCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTGATCACTGATGCAATTCCA 1751 ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1419 GGAAAGGAGGCTCGTCGATCAAATGCTATCTTACACAAGGTGATCACTGATGCAATTCC- 1477 Query 1752 GA-GACTGTTGGGGGTAAACTCATTGGACTTGTGACTTCAAGAGAAGAGATTCCTGATTT 1810 || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 1478 GAAGACTGTTGGAGGTAAACTCATAGGACTTGTGACTTCGAGAGAGGAGATTCCTGATTT 1537 Query 1811 GCTTAAGCTTGATGACGTTATCGATCTTGTGATCCCAAGAGGAAGCAACAAGCTTGTTAC 1870 ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct 1538 GCTCAAGCTTGATGACGTTATTGATCTTGTAATCCCAAGAGGCAGCAACAAGCTTGTTTC 1597 Query 1871 TCAGATAAAAAA-TACTACAAAAATCCCTGTGCTAGGTCATGCTGATGGAATCTGTCATG 1929 |||||||||||| | | || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1598 TCAGATAAAAAACT-CGACGAAAATCCCAGTGCTAGGCCATGCTGATGGAATCTGTCATG 1656 Query 1930 TATATGTCGACAAGGCTTGTGATAC-GGATATGGCAAAGCGCATAGTTTCTGATGCAAAG 1988 ||||||| || ||| ||||| | || ||| |||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct 1657 TATATGTTGATAAGTCTTGTAA-ACTGGACATGGCAAAGCGCATCGTTTCCGACGCAAAG 1715 Query 1989 TTGGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACCCTTCTTGTGCATAAGGATCTAGAG 2048 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| Sbjct 1716 TTAGACTATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACCCTTCTTGTACATAAAGATTTGGAG 1775 Query 2049 CAGAATGCTGTGCTTAATGAGCTTATTTTTGCTCTGCAGAGCAATGGAGTCACTTTGTAT 2108 ||||||| | | || ||||| ||||||| || |||||| | ||| || |||||||||||| Sbjct 1776 CAGAATGGTTTTCTCAATGATCTTATTTATGTTCTGCAAACCAAAGGCGTCACTTTGTAT 1835 Query 2109 GGTGGACCAAGGGCAAGT--AAGATACTGAACATACCAGAAGCACGGTCATT-CAACCAT 2165 ||||| ||||| |||||| || | |||||| || || ||| || ||||| || ||| Sbjct 1836 GGTGGGCCAAGAGCAAGTGCAA-A-ACTGAATATTCCGGAAACAAAATCATTTCA-CCAC 1892 Query 2166 GAGTACTGTGCCAAGGCTTGCACTGTTGAAGTTGTAGAAGACGTTTATGGTGCTATAGAT 2225 |||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1893 GAGTACAGTTCCAAGGCCTGCACCGTTGAAATTGTAGAAGACGTATATGGTGCTATAGAT 1952 Query 2226 CACATTCACCGACATGGGAGTGCACACACAGACTGCATTGTGACAGAGGATCAC-GAAGT 2284 || ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||| | ||||| Sbjct 1953 CATATTCACCAACATGGAAGTGCACACACTGATTGCATAGTGACAGAAGAT-AGTGAAGT 2011 Query 2285 TGCAGAGCTATTCCTTCGCCAAGTGGATAGCGCTGCTGTGTTCCACAACGCCAGCACAAG 2344 |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| Sbjct 2012 GGCAGAGATATTCCTCCGCCAAGTGGACAGTGCTGCTGTTTTCCACAATGCAAGCACAAG 2071 Query 2345 ATTCTCAGATGGTTTCCGATTTGGACTTGGTGCAGAGGTGGGGGTAAGCACGGGCAGGAT 2404 |||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| Sbjct 2072 ATTCTCTGATGGTTTTCGGTTCGGACTTGGTGCTGAGGTGGGAATAAGCACAAGCAGGAT 2131 Query 2405 CCATGCTCGTGGTCCAGTCGGGGTCGAAGGATTACTT-ACAACGAGATGGATAATGAGAG 2463 ||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 2132 TCATGCCCGTGGTCCAGTCGGAGTTGAAGGATTA-TTGACAACGAGATGGATAATGAGAG 2190 Query 2464 GAAAAGGACAAGTTGTCGACGGAGACAATGGAATTGTTTACACCCATCAGGA 2515 |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||| Sbjct 2191 GAAAAGGACAAGTTGTGGATGGAGACAATGGAATCGTTTACACCCATAAGGA 2242 > Ahg952470 jgi|Araly1|952470|scaffold_77200001.1 Length=1010 Score = 1242 bits (672), Expect = 0.0 Identities = 718/740 (97%), Gaps = 4/740 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1816 AGCTTGATGACGTTATCGATCTTGTGATCCCAAGAGGAAGCAACAAGCTTGTTACTCAGA 1875 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 272 AGCTTGATGATGTTATCGATCTTGTGATCCCAAGAGGCAGCAACAAGCTTGTTACTCAGA 331 Query 1876 TAAAAAATACTACAAAAATCCCTGTGCTAGGTCATGCTGATGGAATCTGTCATGTATATG 1935 ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 332 TAAAAAATACTACAAAAATTCCTGTGCTTGGTCATGCTGATGGAATCTGTCATGTATATG 391 Query 1936 TCGACAAGGCTTGTGATACGGATATGGCAAAGCGCATAGTTTCTGATGCAAAGTTGGACT 1995 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 392 TCGACAAGGCTTGTGATACGGATATGGCAAAGCGCATAGTTTCTGATGCAAAGTTGGACT 451 Query 1996 ATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACCCTTCTTGTGCATAAGGATCTAGAGCAGAATG 2055 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 452 ATCCAGCAGCCTGTAATGCGATGGAAACCCTTCTTGTGCATAAGGATCTAGAGCAGAATG 511 Query 2056 CTGTGCTTAATGAGCTTATTTTTGCTCTGCAGAGCAATGGAGTCACTTTGTATGGTGGAC 2115 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 512 CTGTGCTCAATGAGCTTATTTTTGCTCTGCAGAGCAATGGAGTCACTTTGTATGGTGGAC 571 Query 2116 CAAGGGCAAGTA-AGATACTGAACATACCAGAAGCACGGTCATTCAACCATGAGTACTGT 2174 ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 572 CAAGGGCAAGTGCA-ATACTGAACATACCAGAAGCACGGTCATTCAACCATGAGTACTGT 630 Query 2175 GCCAAGGCTTGCACTGTTGAAGTTGTAGAAGACGTTTATGGTGCTATAGATCACATTCAC 2234 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 631 GCCAAGGCTTGCACTGTTGAAGTTGTTGAAGACGTTTATGGTGCTATAGATCACATTCAC 690 Query 2235 CGACATGGGAGTGCACACACAGACTGCATTGTGACAGAGGATCACGAAGTTGCAGAGCTA 2294 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 691 CGACATGGAAGTGCACACACAGACTGCATTGTGACAGAGGATCACGAAGTTGCAGAGCTA 750 Query 2295 TTCCTTCGCCAAGTGGATAGCGCTGCTGTGTTCCACAACGCCAGCACAAGATTCTCAGAT 2354 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| Sbjct 751 TTCCTTCGCCAAGTGGACAGCGCTGCTGTTTTCCACAACGCAAGCACACGATTCTCAGAT 810 Query 2355 GGTTTCCGATTTGGACTTGGTGCAGAGGTGGGGGTAAGCACGGGCAGGATCCATGCTCGT 2414 ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| Sbjct 811 GGTTTCCGATTTGGACTTGGTGCTGAGGTGGGAGTAAGCACGGGCCGTATCCATGCTCGT 870 Query 2415 GGTCCAGTCGGGGTCGAAGGATTACTTACAACGAGATGGATAATGAGAGGAAAAGGACAA 2474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 871 GGTCCAGTCGGGGTCGAAGGATTACTTACAACGAGATGGATAATGAGAGGAAAAGGACAA 930 Query 2475 GTTGTCGACGGAGACAATGGAATTGTTTACACCCATCAGGACATTCCCATCCAAGCTTAA 2534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 931 GTTGTCGACGGAGACAATGGAATTGTTTACACCCATCAGGACATTCCCATCCAAGCTTAA 990 Query 2535 A-CAAGACTTCCGAGTGTGT 2553 | ||| || || |||||||| Sbjct 991 AACAAAACGTC-GAGTGTGT 1009 Score = 244 bits (132), Expect = 2e-63 Identities = 146/153 (95%), Gaps = 0/153 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1665 AGTGGAAATGGTCTTCTGCTGAAGGGTGGAAAGGAGGCCCGGCGATCAAATGCTATCTTA 1724 ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 34 AGTGGTAATGGTCTTCTGTTGAAGGGTGGAAAAGAGGCCCGGCGATCAAATGCTATCTTA 93 Query 1725 CACAAGGTGATCACTGATGCAATTCCAGAGACTGTTGGGGGTAAACTCATTGGACTTGTG 1784 ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 94 CACAAGGTGATTACTGATGCAATTCCAGAGACGGTCGGGGGTAAACTCATTGGACTTGTG 153 Query 1785 ACTTCAAGAGAAGAGATTCCTGATTTGCTTAAG 1817 ||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 154 ACTTCAAGAGAAGAGATTCCTGATTTGCTCAAG 186 Score = 65.8 bits (35), Expect = 2e-09 Identities = 35/35 (100%), Gaps = 0/35 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1609 TTGTTTTTGAATCCCGACCTGATGCACTTGTACAG 1643 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 TTGTTTTTGAATCCCGACCTGATGCACTTGTACAG 35 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 108938100700 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5