BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G45350.1 Length=1842 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg483672 jgi|Araly1|483672|fgenesh2_kg.4__2732__AT2G45350.1 2848 0.0 Ahg935489 jgi|Araly1|935489|scaffold_403477.1 1799 0.0 Ahg935487 jgi|Araly1|935487|scaffold_403475.1 1799 0.0 > Ahg483672 jgi|Araly1|483672|fgenesh2_kg.4__2732__AT2G45350.1 Length=1821 Score = 2848 bits (1542), Expect = 0.0 Identities = 1732/1825 (95%), Gaps = 8/1825 (0%) Strand=Plus/Plus Query 22 ATGGAGTGTTCGATTTCATCCACCATTCATGTCCTTGGAAGCTGCAAAACTTCAGATGAC 81 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1 ATGGAGTGTTCGATTTCATCCACCATTCAAGTCCTTGGAAGCTGCAAAACTTCATATGAC 60 Query 82 GTGAACCAAATCCACG-GGCGATTGATTAAGACGGGAATCATCAAAAACTCAAATCTCAC 140 |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| Sbjct 61 GTGAACAAAATCCACGCGG-GATTGATTAAGACGGGAATTATCAAAAATTCTAATCTCAC 119 Query 141 TACGAGGATTGTTCTGGCTTTTGCCTCTTCTCGACGTCCGTATCTCGCCGATTTCGCGCG 200 ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| Sbjct 120 TACAAGGATTGTTCTCGCTTTTGCCGCTTCTCGACGACCGTATCTCGCTGAATTCGCGCG 179 Query 201 TTGTGTCTTCCACGAGTATCACGTATGTTCGTTTTCATTTGGAGAGGTGGAGGATCCATT 260 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| Sbjct 180 TTGTGTCTTCCACGAGTATCACGTATGTTCATTTTCACCCGGAGAGATGGAGGATCCATT 239 Query 261 TTTATGGAACGCCGTGATCAAGTCTCACTCTCATGGAAAGGATCCGAGACAAGCTCTGCT 320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 240 TTTATGGAACGCCGTGATCAAGTCTCACTCTCATGGAAAGGATCCGAGACAAGCTCTGCT 299 Query 321 CTTGCTCTGTTTGATGCTCGAGAATGGGGTTTCCGTGGACAAATTCTCACTGTCACTTGT 380 |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 300 CTTGTTCTGTTTGATGCTCGAGAATGGTGTTTCCGTGGACAAATTCTCACTGTCCCTTGT 359 Query 381 TCTTAAAGCGTGTTCGAGGTTAGGTTTTGTAAAAGGAGGAATGCAGATTCATGGGTTTTT 440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 TCTTAAAGCGTGTTCGAGGTTAGGTTTTGTAAAAGGAGGAATGCAGATTCATGGGTTTTT 419 Query 441 GaaaaaaaCTGGACTTTGGTCGGATTTGTTTCTACAGAATTGTTTGATTGGCTTGTATCT 500 || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 420 GAGAAAGACTGGACTTTGGTCGGATTTGTTTCTACAGAATTGTTTGATTGGGTTGTATCT 479 Query 501 GAAATGTGGTTGTTTAGGTTTAT-CACGCCAGATGTTTGATAGAATGCCGAAGAGAGACT 559 ||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 480 GAAATGTGGTTGTTTAGGTTT-TGCCCGCCAGATATTTGATAGAATGCCGCAGAGAGACT 538 Query 560 CTGTTTCTTATAATTCCATGATTGATGGGTATGTCAAATGTGGATTGATTGTATCCGCGC 619 |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| Sbjct 539 CTGTTTCTTACAATTCCATGATTGACGGGTATGTCAAATGCGGATTGATTGAATCCGCGC 598 Query 620 GTGAATTGTTCGATTTGATGCCTATG-GAGATGAAGAATTTGATATCTTGGAACTCTATG 678 |||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 599 GTGAATTGTTCGATTTGATGTC-AAGAGAGATGAAGAATTTGATATCTTGGAACTCTATG 657 Query 679 ATAAGTGGTTATGCTCAGACATCAGATGGAGTTGACATAGCGTCTAAACTGTTTGCTGAT 738 |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| Sbjct 658 ATAAGTGGATATGCTCAGACATCAGATGGAGTTAACATAGCTTCAAAACTGTTTGCTGAA 717 Query 739 ATGCCTGAGAAGGACTTGATTTCGTGGAACTCAATGATAGATGGATATGTAAAACACGGA 798 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 718 ATGCCTGAGAAGGACTTGATTTCATGGAACTCAATGATCGATGGATATGTAAAACACGGA 777 Query 799 AGAATCGAAGATGCTAAGGGTTTATTCGATGTGATGCCGAGAAGAGATGTAGTTACTTGG 858 |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 778 AGAATCGAGGATGCTAAGGGTTTATTTGATGTGATGCCGAGAAGAGATGTGGTTACTTGT 837 Query 859 GCTACCATGATTGATGGGTATGCAAAGTTAGGTTTTGTTCATCACGCTAAGACTCTGTTT 918 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 838 GCTACCATGATTGATGGGTATGCAAAGTTAGGTTTTGTTCATCAGGCTAAGACTCTGTTT 897 Query 919 GACCAAATGCCTCATAGAGATGTTGTGGCATATAATTCTATGATGGCTGGTTATGTTCAA 978 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 GACCAAATGCCTCTTAGAGATGTTGTGGCATATAATTCTATGATGGCTGGTTATGTTCAA 957 Query 979 AACAAGTATCACATGGAAGCTCTTGAAATATTTAGTGACATGGAAAAGGAGAGTCACTTG 1038 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 958 AACAAGTGTCACATGGAAGCTCTTGAAATATTTAACGACATGGAAAAGGAGAGTCACTTG 1017 Query 1039 TTACCCGATGATACGACTTTGGTAAT-AGTTCTGCCTGCAATTGCTCAGCTTGGCCGATT 1097 | ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1018 TCACCCGATGAAACGACTTTGGTAATCA-TTCTTTCTGCAATTGCTCAGCTTGGCCGATT 1076 Query 1098 ATCCAAAGCCATAGATATGCATTTGTACATCGTGGAGAAACAATTCTATCTAGGTGGAAA 1157 ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1077 ATCGAAAGCCACCGATATGCATTTGTATATTGTGGAGAAACAATTCTATCTAGGTGGAAA 1136 Query 1158 ACTCGGTGTTGCTCTCATTGATATGTATTCGAAATGCGGAAGCATACAACACGCCATGTT 1217 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1137 ACTCGGCGTTGCTCTCATTGATATGTATTCGAAATGCGGAAGCATACAACACGCCATGTT 1196 Query 1218 GGTTTTCGAGGGAATCGAAAACAAAAGCATTGATCACTGGAATGCTATGATTGGTGGGCT 1277 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1197 GGTTTTCGAGGGAATCGAAAACAAAAGCATTGATCACTGGAATGCTATGATTGGTGGGCT 1256 Query 1278 CGCTATTCATGGTCTAGGGGAATCTGCATTCGATATGCTCTTGCAGATTGAGAGACTCTC 1337 ||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1257 AGCTGTTCATGGTCTTGGAGAATCCGCATTCAATATGCTCTTGCAGATCGAGAGACTCTC 1316 Query 1338 TTTAAAACCAGACGATATCACCTTTGTTGGCGTTTTAAATGCTTGCAGCCACTCTGGGTT 1397 ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || Sbjct 1317 CATAATACCAGATGATATCACCTTTGTTGGAGTTTTAAATGCTTGTAGCCACTCTGGATT 1376 Query 1398 AGTAAAGGAAGGCCTTCTCTGCTTTGAGCTCATGAGGAGAAAACACAAGATAGAACCAAG 1457 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1377 AGTGAAGGAAGGCCTTCTCTGCTTTGAGCTCATGAGGAGAAAACACAAGATAGAACCAAG 1436 Query 1458 ATTGCAACACTATGGTTGTATGGTAGACATACTATCGAGATCCGGAAGTATAGAGCTAGC 1517 |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1437 GTTGCAACACTATGGGTGTATGGTCGACATACTATCGAGATCCGGTAGTATAGAGCTAGC 1496 Query 1518 CAAAAACTTAATAGAGGAAATGCCTGTTGAGCCAAATGATGTCATATGGAGAACGTTTCT 1577 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1497 CAAAAACTTAATAGAGGAAATGCCAATTGAGCCAAATGATGTCATATGGAGAACATTTCT 1556 Query 1578 CACCGCTTGTAGTCACCACAAGGAGTTTGAAACGGGAGAGCTTGTCGCAAAACACCTTAT 1637 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1557 CACCGCTTGTAGTCACCACAAGGAGTTTGAAACGGGAGAGCTTGTCGCGAAACACCTTAT 1616 Query 1638 TTTGCAGGCTGGATATAACCCGAGCTCATATGTGCTACTCTCTAACATGTATGCTAGTTT 1697 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1617 TTTGCAGGCTGGCTATAACCCGAGCTCATATGTGCTTCTCTCTAACATGTATGCTAGTTT 1676 Query 1698 TGGAATGTGGAAGGATGTTCGTAGAGTTAGAACGATGATGAAGGAAAGAAAGATAGAGAA 1757 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1677 TGGAATGTGGAAGGATGTTCGTAGAGTTAGAACGATGATGAAGGAAAGAAAGATAGAGAA 1736 Query 1758 AATTCCTGGTTGTAGTTGGATTGAGCTCGATGGAAGAGTCCATGAGTTCTTTGTAGATAG 1817 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1737 AATTCCTGGATGTAGTTGGATTGAGCTCGATGGAAGAGTCCATGAGTTCTTTGTAGATAG 1796 Query 1818 CATTGAAGTTTCCAGTACATTGTAG 1842 |||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1797 CATTGAAGTTTCCAATACATTGTAG 1821 > Ahg935489 jgi|Araly1|935489|scaffold_403477.1 Length=1282 Score = 1799 bits (974), Expect = 0.0 Identities = 1088/1144 (95%), Gaps = 4/1144 (0%) Strand=Plus/Plus Query 702 AGATGGAGTTG-A-CATAGCGTCTAAACTGTTTGCTGATATGCCTGAGAAGGACTTGATT 759 ||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 119 AGATGCAATTGCAGCATAGCGTCAAAACTGTTTGCTGAAATGCCTGAGAAGGACTTGATT 178 Query 760 TCGTGGAACTCAATGATAGATGGATATGTAAAACACGGAAGAATCGAAGATGCTAAGGGT 819 || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 179 TCATGGAACTCAATGATCGATGGATATGTAAAACACGGAAGAATCGAGGATGCTAAGGGT 238 Query 820 TTATTCGATGTGATGCCGAGAAGAGATGTAGTTACTTGGGCTACCATGATTGATGGGTAT 879 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 239 TTATTTGATGTGATGCCGAGAAGAGATGTGGTTACTTGTGCTACCATGATTGATGGGTAT 298 Query 880 GCAAAGTTAGGTTTTGTTCATCACGCTAAGACTCTGTTTGACCAAATGCCTCATAGAGAT 939 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 299 GCAAAGTTAGGTTTTGTTCATCAGGCTAAGACTCTGTTTGACCAAATGCCTCTTAGAGAT 358 Query 940 GTTGTGGCATATAATTCTATGATGGCTGGTTATGTTCAAAACAAGTATCACATGGAAGCT 999 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 359 GTTGTGGCATATAATTCTATGATGGCTGGTTATGTTCAAAACAAGTGTCACATGGAAGCT 418 Query 1000 CTTGAAATATTTAGTGACATGGAAAAGGAGAGTCACTTGTTACCCGATGATACGACTTTG 1059 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct 419 CTTGAAATATTTAACGACATGGAAAAGGAGAGTCACTTGTCACCCGATGAAACGACTTTG 478 Query 1060 GTAAT-AGTTCTGCCTGCAATTGCTCAGCTTGGCCGATTATCCAAAGCCATAGATATGCA 1118 ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| Sbjct 479 GTAATCA-TTCTTTCTGCAATTGCTCAGCTTGGCCGATTATCGAAAGCCACCGATATGCA 537 Query 1119 TTTGTACATCGTGGAGAAACAATTCTATCTAGGTGGAAAACTCGGTGTTGCTCTCATTGA 1178 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 538 TTTGTATATTGTGGAGAAACAATTCTATCTAGGTGGAAAACTCGGCGTTGCTCTCATTGA 597 Query 1179 TATGTATTCGAAATGCGGAAGCATACAACACGCCATGTTGGTTTTCGAGGGAATCGAAAA 1238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 598 TATGTATTCGAAATGCGGAAGCATACAACACGCCATGTTGGTTTTCGAGGGAATCGAAAA 657 Query 1239 CAAAAGCATTGATCACTGGAATGCTATGATTGGTGGGCTCGCTATTCATGGTCTAGGGGA 1298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || Sbjct 658 CAAAAGCATTGATCACTGGAATGCTATGATTGGTGGGCTAGCTGTTCATGGTCTTGGAGA 717 Query 1299 ATCTGCATTCGATATGCTCTTGCAGATTGAGAGACTCTCTTTAAAACCAGACGATATCAC 1358 ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| Sbjct 718 ATCCGCATTCAATATGCTCTTGCAGATCGAGAGACTCTCCATAATACCAGATGATATCAC 777 Query 1359 CTTTGTTGGCGTTTTAAATGCTTGCAGCCACTCTGGGTTAGTAAAGGAAGGCCTTCTCTG 1418 ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct 778 CTTTGTTGGAGTTTTAAATGCTTGTAGCCACTCTGGATTAGTGAAGGAAGGCCTTCTCTG 837 Query 1419 CTTTGAGCTCATGAGGAGAAAACACAAGATAGAACCAAGATTGCAACACTATGGTTGTAT 1478 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 838 CTTTGAGCTCATGAGGAGAAAACACAAGATAGAACCAAGGTTGCAACACTATGGGTGTAT 897 Query 1479 GGTAGACATACTATCGAGATCCGGAAGTATAGAGCTAGCCAAAAACTTAATAGAGGAAAT 1538 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 898 GGTCGACATACTATCGAGATCCGGTAGTATAGAGCTAGCCAAAAACTTAATAGAGGAAAT 957 Query 1539 GCCTGTTGAGCCAAATGATGTCATATGGAGAACGTTTCTCACCGCTTGTAGTCACCACAA 1598 ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 958 GCCAATTGAGCCAAATGATGTCATATGGAGAACATTTCTCACCGCTTGTAGTCACCACAA 1017 Query 1599 GGAGTTTGAAACGGGAGAGCTTGTCGCAAAACACCTTATTTTGCAGGCTGGATATAACCC 1658 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1018 GGAGTTTGAAACGGGAGAGCTTGTCGCGAAACACCTTATTTTGCAGGCTGGCTATAACCC 1077 Query 1659 GAGCTCATATGTGCTACTCTCTAACATGTATGCTAGTTTTGGAATGTGGAAGGATGTTCG 1718 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1078 GAGCTCATATGTGCTTCTCTCTAACATGTATGCTAGTTTTGGAATGTGGAAGGATGTTCG 1137 Query 1719 TAGAGTTAGAACGATGATGAAGGAAAGAAAGATAGAGAAAATTCCTGGTTGTAGTTGGAT 1778 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1138 TAGAGTTAGAACGATGATGAAGGAAAGAAAGATAGAGAAAATTCCTGGATGTAGTTGGAT 1197 Query 1779 TGAGCTCGATGGAAGAGTCCATGAGTTCTTTGTAGATAGCATTGAAGTTTCCAGTACATT 1838 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1198 TGAGCTCGATGGAAGAGTCCATGAGTTCTTTGTAGATAGCATTGAAGTTTCCAATACATT 1257 Query 1839 GTAG 1842 |||| Sbjct 1258 GTAG 1261 > Ahg935487 jgi|Araly1|935487|scaffold_403475.1 Length=1270 Score = 1799 bits (974), Expect = 0.0 Identities = 1088/1144 (95%), Gaps = 4/1144 (0%) Strand=Plus/Plus Query 702 AGATGGAGTTG-A-CATAGCGTCTAAACTGTTTGCTGATATGCCTGAGAAGGACTTGATT 759 ||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 107 AGATGCAATTGCAGCATAGCGTCAAAACTGTTTGCTGAAATGCCTGAGAAGGACTTGATT 166 Query 760 TCGTGGAACTCAATGATAGATGGATATGTAAAACACGGAAGAATCGAAGATGCTAAGGGT 819 || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 167 TCATGGAACTCAATGATCGATGGATATGTAAAACACGGAAGAATCGAGGATGCTAAGGGT 226 Query 820 TTATTCGATGTGATGCCGAGAAGAGATGTAGTTACTTGGGCTACCATGATTGATGGGTAT 879 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 227 TTATTTGATGTGATGCCGAGAAGAGATGTGGTTACTTGTGCTACCATGATTGATGGGTAT 286 Query 880 GCAAAGTTAGGTTTTGTTCATCACGCTAAGACTCTGTTTGACCAAATGCCTCATAGAGAT 939 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 287 GCAAAGTTAGGTTTTGTTCATCAGGCTAAGACTCTGTTTGACCAAATGCCTCTTAGAGAT 346 Query 940 GTTGTGGCATATAATTCTATGATGGCTGGTTATGTTCAAAACAAGTATCACATGGAAGCT 999 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 347 GTTGTGGCATATAATTCTATGATGGCTGGTTATGTTCAAAACAAGTGTCACATGGAAGCT 406 Query 1000 CTTGAAATATTTAGTGACATGGAAAAGGAGAGTCACTTGTTACCCGATGATACGACTTTG 1059 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct 407 CTTGAAATATTTAACGACATGGAAAAGGAGAGTCACTTGTCACCCGATGAAACGACTTTG 466 Query 1060 GTAAT-AGTTCTGCCTGCAATTGCTCAGCTTGGCCGATTATCCAAAGCCATAGATATGCA 1118 ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| Sbjct 467 GTAATCA-TTCTTTCTGCAATTGCTCAGCTTGGCCGATTATCGAAAGCCACCGATATGCA 525 Query 1119 TTTGTACATCGTGGAGAAACAATTCTATCTAGGTGGAAAACTCGGTGTTGCTCTCATTGA 1178 |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 526 TTTGTATATTGTGGAGAAACAATTCTATCTAGGTGGAAAACTCGGCGTTGCTCTCATTGA 585 Query 1179 TATGTATTCGAAATGCGGAAGCATACAACACGCCATGTTGGTTTTCGAGGGAATCGAAAA 1238 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 586 TATGTATTCGAAATGCGGAAGCATACAACACGCCATGTTGGTTTTCGAGGGAATCGAAAA 645 Query 1239 CAAAAGCATTGATCACTGGAATGCTATGATTGGTGGGCTCGCTATTCATGGTCTAGGGGA 1298 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || Sbjct 646 CAAAAGCATTGATCACTGGAATGCTATGATTGGTGGGCTAGCTGTTCATGGTCTTGGAGA 705 Query 1299 ATCTGCATTCGATATGCTCTTGCAGATTGAGAGACTCTCTTTAAAACCAGACGATATCAC 1358 ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| Sbjct 706 ATCCGCATTCAATATGCTCTTGCAGATCGAGAGACTCTCCATAATACCAGATGATATCAC 765 Query 1359 CTTTGTTGGCGTTTTAAATGCTTGCAGCCACTCTGGGTTAGTAAAGGAAGGCCTTCTCTG 1418 ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| Sbjct 766 CTTTGTTGGAGTTTTAAATGCTTGTAGCCACTCTGGATTAGTGAAGGAAGGCCTTCTCTG 825 Query 1419 CTTTGAGCTCATGAGGAGAAAACACAAGATAGAACCAAGATTGCAACACTATGGTTGTAT 1478 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 826 CTTTGAGCTCATGAGGAGAAAACACAAGATAGAACCAAGGTTGCAACACTATGGGTGTAT 885 Query 1479 GGTAGACATACTATCGAGATCCGGAAGTATAGAGCTAGCCAAAAACTTAATAGAGGAAAT 1538 ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 886 GGTCGACATACTATCGAGATCCGGTAGTATAGAGCTAGCCAAAAACTTAATAGAGGAAAT 945 Query 1539 GCCTGTTGAGCCAAATGATGTCATATGGAGAACGTTTCTCACCGCTTGTAGTCACCACAA 1598 ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 946 GCCAATTGAGCCAAATGATGTCATATGGAGAACATTTCTCACCGCTTGTAGTCACCACAA 1005 Query 1599 GGAGTTTGAAACGGGAGAGCTTGTCGCAAAACACCTTATTTTGCAGGCTGGATATAACCC 1658 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1006 GGAGTTTGAAACGGGAGAGCTTGTCGCGAAACACCTTATTTTGCAGGCTGGCTATAACCC 1065 Query 1659 GAGCTCATATGTGCTACTCTCTAACATGTATGCTAGTTTTGGAATGTGGAAGGATGTTCG 1718 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1066 GAGCTCATATGTGCTTCTCTCTAACATGTATGCTAGTTTTGGAATGTGGAAGGATGTTCG 1125 Query 1719 TAGAGTTAGAACGATGATGAAGGAAAGAAAGATAGAGAAAATTCCTGGTTGTAGTTGGAT 1778 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1126 TAGAGTTAGAACGATGATGAAGGAAAGAAAGATAGAGAAAATTCCTGGATGTAGTTGGAT 1185 Query 1779 TGAGCTCGATGGAAGAGTCCATGAGTTCTTTGTAGATAGCATTGAAGTTTCCAGTACATT 1838 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1186 TGAGCTCGATGGAAGAGTCCATGAGTTCTTTGTAGATAGCATTGAAGTTTCCAATACATT 1245 Query 1839 GTAG 1842 |||| Sbjct 1246 GTAG 1249 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 69171884920 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5