BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT2G46020.2

Length=6747
                                                                      Score        E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)     Value

  Ahg483746 jgi|Araly1|483746|fgenesh2_kg.4__2806__AT2G46020.1        1.092e+04  0.0  


> Ahg483746 jgi|Araly1|483746|fgenesh2_kg.4__2806__AT2G46020.1
Length=6561

 Score = 1.092e+04 bits (5911),  Expect = 0.0
 Identities = 6369/6589 (97%), Gaps = 35/6589 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGCAATCTGGAGGCAGTGGCGGAGGGCCCGCTCGGAATCCGGCCATGGGTCCGGCTGGT  60
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  1     ATGCAATCTGGAGGCAGTGGCGGAGGGCCCGCTCGGAATCCGCCCATGGGTCCGGCTGGT  60

Query  61    CGGACTGCTTCCACGTCATCCGCTGCTTCTCCTTCTTCTTCCTCTTCATCTGTgcagcag  120
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |  | |
Sbjct  61    CGGACTGCGTCCACGTCATCCGCTGCTTCTCCTTCTTCTTCCTCTTC--C--T-C--C-G  112

Query  121   cagcaacagcaacagcaacagcagcaacagcaacagcagctggcgtctaggcagcagcag  180
               |   |||| | | | | | |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  113   -TG---CAGC-A-A-C-A-A-CAGCAACAG---CAGCAGCTGGCGTCTAGGCAGCAACAG  159

Query  181   cagcagcacagAAACTCAGATACAAACGAAAATATGTTTGCATATCAACCTGGTGGGGTT  240
             |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||
Sbjct  160   CAGCAGCAGAGAAACTCAGATGCAAACGAAAACATGTTTGCATATCATGCTGGTGGGGTT  219

Query  241   CAGGGAATGATGGGCGGTGGCAACTTTGCTTCGTCTCCGGGCTCTATGCAAATGCCTCAG  300
             |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
Sbjct  220   CAGGGAATGATGGGAGGTGGCAACTTTGCTTCGTCTTCTGGCTCTATGCAAATGCCTCAG  279

Query  301   CAGTCTA-GAAAtttttttGAGTCTCCTCAGcaacaacaacaacaacaacaacaGGGTTC  359
             ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||
Sbjct  280   CAGTCTAGGAAA-TTCTTTGAGTCTCCTCAACAACAACAACAACAGCAGCAACAGGGCTC  338

Query  360   TTCTACCCAAGAGGGCCAGCAAAATTTTAATCCAATGCAGCAAGCGTATATTCAGTTTGC  419
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  339   TTCTACCCAAGAGGGCCAGCAAAGTTTTAATCCAATGCAGCAAGCGTATATTCAGTTTGC  398

Query  420   TATGCAGGCTCAGCATCAAAAAGCACAGCAGCAAGCTAGGATGGGAATGGTGGGTTCATC  479
             ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||
Sbjct  399   TATACAGGCTCAGCAACAAAAAGCACAGCAGCAAGCTAGAATGGGAATGATAGGTTCATC  458

Query  480   AAGTGTGGGAAAGGATCAAGATGCACGAATGGGAATGTTGAATATGCAAGACTTGAATCC  539
             |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct  459   AAGTGTCGGAAAAGATCAAGATGCACGGATGGGAATGTTGAATATACAAGATTTGAATCC  518

Query  540   GTCTAGTCAGCCCCAGGCCTCATCATCGAAGCCATCGGGCGATCAGTTTGCTCGCGGTGA  599
             |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct  519   GTCTAGTCAGGCCCAGGCCTCATCGTCTAAGCCATCGGGAGATCAGTTTGGTCGCGGTGA  578

Query  600   AAGGCAGACT-GAATCAAGTTCTCAGCAAAGGAACGAAACAAAATCTCATCCTCAGCAGC  658
             |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  579   AAGGCAGA-TGGAATCAGGTTCTCAGCAAAGGAACGAAACAAATTCTCATCCTCAGCAGC  637

Query  659   AGGTGGGTACCGGACAACTAATGCCTGGAAATATGATAAGGCCAATGCAAGCACCACAGG  718
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| 
Sbjct  638   AGGTGGGTACCGGACAACTAATACCTGGAAATATGATAAGGCCAATGCAGGCACCACAGC  697

Query  719   CTCAGCAGCTTGTCAATAACATGGGAAACAACCAACTCGCATTTGCACAACAGTGGCAGG  778
             |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  698   CTCAACAGCTTATCAATAATATGGGAAATAACCAACTCGCATTTGCACAACAGTGGCAGG  757

Query  779   CAATGCAGGCATGGGCGCGTGAGCGTAATATCGATCTCTCACATCCTGCCAACGCCAGCC  838
             ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  758   CAATGCAGGCATGGGCGCGTGAGAGGAATATCGATCTCTCACATCCTGCCAACGCCAGCC  817

Query  839   AAATGGCACACATCCTTCAGGCAAGAATGGCTGCTCAACAGAAAGCTGGTGAAGGCAATG  898
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||
Sbjct  818   AAATGGCACACATCCTTCAGGCAAGAATGGCTGCCCAACAGAAAGTTAGTGAAGGCAATG  877

Query  899   TGGCCTCACAGTCACCATCTATTCCAATCTCTAGCCAGCCGGCTTCATCTTCGGTTGTTC  958
             |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  878   TGGCTTCACAGGCACCTTCTATTCCAATCTCTAGCCAGCCGGCTTCATCTTCGGTTGTTC  937

Query  959   CAGGTGAGAATTCACCACATGCCAACTCTGCTAGTGATATCTCTGGGCAGTCAGGATCAG  1018
             |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  938   CAGGTGAGAATTCACCGCGTACCAACTCTGCTAGTGATATCTCTGGGCAGTCAGGATCAG  997

Query  1019  CGAAGGCCAGACATGCATTATCTACTGGCTCATTTGCCTCGACTTCCAGTCCCAGAATGG  1078
             | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  998   CAAAGGCCAGGCATGCAATATCTACTGGCTCATTTGCTTCGACTTCCAGTCCCAGAATGG  1057

Query  1079  TCAATCCTGCTATGAATCCCTTCTCCGGCCAAGGGAGAGAGAATCCAATGTATCCTCGAC  1138
             ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  1058  TCAATCCTGCTATGAATCCCTTCTCCGTCCAAGGGAGAGATAATCCAATGTATCCTCGAC  1117

Query  1139  ATTTAGTTCAGCCTACAAATGGGATGCCCTCAGGAAATCCCCTGCAGACTTCTGCAAATG  1198
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  1118  ATTTAGTTCAGCCTACAAATGGGATGCCCTCAGGAAATTCCCTGCAGACTTCTGCAAATG  1177

Query  1199  AGACTCCTGTTTTGGATCAGAATGCATCTACaaaaaaaaGTTTAGGTCCTGCTGAACATT  1258
             |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1178  AGACTCTTGTTTTGGATCAGAATGTGTCTACAAAAAAAAGTTTAGGTCCTGCTGAACATT  1237

Query  1259  TGCAAATGCAGCAGCCTAGGCAACTGAATACACCGACTCCAAATTTAGTAGCGCCATCTG  1318
             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct  1238  TGCAAATGCAGCAGCCTAGGCAACTGAATGCACCGACTTCAAATTTACTAGCGCCATCTG  1297

Query  1319  ATACTGGTCCACTCAGTAACTCGTCCCTTCAGAGTGGACAGGGGACCCAACAAGCACAGC  1378
             ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1298  ATACTGGTCCACTCAGTAATTCTTCCTTTCAGAGTGGACAGGGGACCCAACAAGCACAGC  1357

Query  1379  AGCGATCAGGATTTACCAAACAGCAACTCCATGTTCTCAAAGCCCAGATACTGGCATTTA  1438
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1358  AGCGAGCAGGATTTACCAAACAGCAACTCCATGTTCTCAAAGCCCAGATACTGGCATTTA  1417

Query  1439  GGCGTTTGAAGAAAGGGGAAGGTTCTTTGCCTCCGGAGCTTCTTCAAGCTATTTCTCCAC  1498
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1418  GGCGTTTGAAGAAAGGGGAAGGTTCTTTGCCTCCAGAGCTTCTTCAAGCTATTGCTCCAC  1477

Query  1499  CACCGCTTGAACTACAGACGCAGAGGCAAATATCTCCTGCCATAG-GGA-AAGTTCAGGA  1556
             |||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||   | | ||| ||||||||||
Sbjct  1478  CACCGCTTCAACTGCAGACACAGAGGCAAATAACTCCTG--TTGGAGGACAAGTTCAGGA  1535

Query  1557  TAGATCTTCAG-ACAAAACTGGAGAAGACCAAGCAAGGTCGCTAGAGTGTGGCAAGGAGT  1615
             |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  1536  TAGAGCTTCAGAAC-AAACTGGAGAAGACCAAGCAAGGTCGCTAGAGTGTGGCAAAGAGT  1594

Query  1616  CTCAGGCTGCTGCTTCTTCAAATGGACCAATTTTTTCTAAAGAGGAAGATAATGTTGGAG  1675
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1595  CTCAGGCTGCTGCTTCTTCAAATGGACCGATTTTTTCTAAAGAGGAAGATAATGTTGGAG  1654

Query  1676  ATACAGAAGTAGCTTTGACGACAGGCCACAGCCAATTATTTCAAAACCTGGGAAAAGAAG  1735
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1655  ATACAGAAGTAGCTTTGACAACAGGCCACAGCCAATTATTTCAAAACCTGGGAAAAGAAG  1714

Query  1736  CTACTTCTACTGACGTGGCTACGAAAGAGGAGCAACAGACTGATGTATTCCCTGTTAAGT  1795
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  1715  CTACTTCTACTGACGTGGCTACGAAAGAGGAGCAACAAACTGATGTATTCCCTGTTAAGT  1774

Query  1796  CAGACCAAGGAGCAGATTCTAGTACTCAAAAGAATCCTAGAAGTGATTCTACAGCTGATA  1855
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1775  CAGACCAAGGAGCAGATTCTAGTACTCAAAAGAATCCTAGAAGTGATTCTACAGCTGATA  1834

Query  1856  AGGGAAAGGCTGTTGCATCTGATGGAAGCCAATCTAAGGTTCCTCCACAAGCAAACTCTC  1915
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1835  AGGGAAAGGCTGTTGTATCTGATGGAAGCCAATCTAAGGTTCCTCCACAAGCAAACTCTC  1894

Query  1916  CCCAGCCGCCCAAGGATACAGCCTCTGCCAGGAAATATTATGGACCGTTGTTTGATTTTC  1975
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1895  CCCAGCAGCCCAAGGATACAGCCTCTGCCAGGAAATATTATGGACCGTTGTTTGATTTTC  1954

Query  1976  CCTTTTTCACTCGAAAACTTGACTCTTATGGGTCTGCAACAGCCAATGCCAATAACAATC  2035
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1955  CCTTTTTCACTCGAAAACTTGATTCTTATGGGTCTGCAACAGCCAATGCCAATAACAATC  2014

Query  2036  TCACATTAGCATATGATATTAAAGATCTGATTTGTGAAGAAGGTGCAGAGTTCCTTAGTA  2095
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  2015  TCACATTAGCATATGATATTAAAGATCTGATTTGTGATGAAGGTGCAGAGTTCCTTAGTA  2074

Query  2096  AGAAAAGAACAGACAGTTTGAAGAAGATAAATGGTCTGCTAGCAAAAAATTTAGAAAGGA  2155
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2075  AGAAAAGAACAGACAGTTTGAAGAAGATAAATGGTCTGCTAGCAAAAAATTTAGAAAGGA  2134

Query  2156  AAAGGATTAGGCCTGATCTTGTTTTACGGCTTCAAATTGAAGAGAAAAAGCTTAGGCTAT  2215
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2135  AAAGGATTAGGCCTGATCTTGTTTTACGGCTTCAAATTGAAGAGAAAAAGCTTAGGCTAT  2194

Query  2216  CTG-ATCTTCAGTCTCGTGTTAGAGAGGAAGTAGATCGACAACAACAGGAGATAATGTCC  2274
             | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2195  C-GAATCTTCAGTCTCGTGTTAGAGAGGAAGTGGATCGACAACAACAGGAGATAATGTCC  2253

Query  2275  ATGCCGGATAGGCCGTACCGCAAATTTGTGAGGTTATGCGAACGGCAACGCCTAGAAATG  2334
             ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  2254  ATGCCCGATAGGCCATACCGCAAATTTGTGAGGTTGTGCGAACGGCAACGCCTTGAAATG  2313

Query  2335  AATAGACAAGTACTGGCCAATCAGAAAGCTGTCAGAGAGAAGCAGCTGAAAACCATTTTT  2394
             |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2314  AATAGACAAGTACTGGCCAACCAGAAAGCTGTTAGAGAGAAGCAGCTGAAAACCATTTTT  2373

Query  2395  CAGTGGCGTAAGAAACTCCTTGAGGCTCATTGGGCTATACGTGATGCACGCACTGCTCGT  2454
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2374  CAGTGGCGTAAGAAACTCCTTGAGGCTCACTGGGCTATACGTGATGCACGCACTGCTCGT  2433

Query  2455  AACAGGGGAGTGGCCAAATACCATGAAAAGATGTTGAGAGAGTTTTCAAAGAGAAAAGAT  2514
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  2434  AACAGGGGAGTGGCCAAATACCATGAAAAGATGTTGAGAGAGTTTTCGAAGAGAAAAGAT  2493

Query  2515  GATGGCCGCAACAAAAGGATGGAGGCCTTGAAGAATAATGATGTAGAAAGATACAGGGAG  2574
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  2494  GATGGCCGGAACAAAAGGATGGAGGCCTTGAAGAATAATGATGTAGAAAGGTACAGGGAG  2553

Query  2575  ATGTTGCTGGAACAGCAAACTAATATGCCTGGTGATGCTGCTGAAAGATATGCTGTTCTC  2634
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2554  ATGTTGCTGGAACAGCAAACAAATATGCCTGGTGATGCTGCTGAAAGATATGCTGTTCTC  2613

Query  2635  TCTTCATTTTTGACCCAAACCGAAGATTATCTTCATAAACTTGGAGGTAAGATTACTGCC  2694
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2614  TCTTCATTTTTGACCCAAACCGAAGATTATCTTCATAAACTTGGAGGTAAGATTACTGCC  2673

Query  2695  ACAAAAAATCAACAGGAAGTGGAGGAGGCAGCAAATGCTGCAGCAGTAGCAGCGAGATTG  2754
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  2674  ACAAAAAATCAACAGGAAGTGGAGGAGGCAGCGAATGCTGCAGCAGTAGCAGCCAGATTG  2733

Query  2755  CAGGGGTTGTCAGAAGAAGAGGTCAGGGCAGCAGCTACTTGTGCTCGAGAAGAAGTTGTG  2814
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2734  CAGGGCTTGTCAGAAGAAGAGGTCAGGGCAGCAGCTACTTGTGCTCGAGAAGAAGTTGTG  2793

Query  2815  ATCAGAAATAGATTTACGGAAATGAATGCGCCAAAAGAAAATTCATCTGTCAACAAGTAC  2874
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  2794  ATCAGAAATAGATTTACGGAAATGAATGCGCCAAAAGAAAATTCATCTGTCAACAAGTAT  2853

Query  2875  TATACTCTGGCTCATGCTGTAAATGAAGTGGTTGTAAGACAACCTTCAATGCTTCAGGCT  2934
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2854  TATACTCTGGCTCATGCTGTAAATGAAGTGGTTATAAGACAACCTTCAATGCTTCAGGCT  2913

Query  2935  GGAACTTTGCGTGATTACCAGCTGGTTGGATTACAATGGATGCTATCGTTGTATAATAAC  2994
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  2914  GGAACTTTGCGTGATTACCAGCTGGTTGGATTACAATGGATGCTATCGCTGTATAATAAC  2973

Query  2995  AAATTAAACGGGATCTTGGCTGATGAGATGGGTCTTGGAAAAACTGTTCAGGTAATGGCA  3054
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  2974  AAATTAAATGGGATCTTGGCTGATGAGATGGGTCTTGGAAAAACTGTGCAGGTAATGGCA  3033

Query  3055  CTGATTGCTTACCTTATGGAGTTTAAAGGGAATTATGGACCGCATCTCATCATCGTTCCC  3114
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3034  CTGATTGCTTACCTTATGGAGTTTAAGGGGAATTATGGACCGCATCTCATCATCGTTCCC  3093

Query  3115  AATGCTGTTCTGGTGAATTGGAAGAGTGAACTCCATACTTGGCTGCCATCTGTTTCATGC  3174
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3094  AATGCTGTTCTGGTGAATTGGAAGAGTGAACTCCATACTTGGCTGCCATCTGTTTCATGC  3153

Query  3175  ATATATTATGTTGGTACAAAGGATCAACGTTCAAAATTGTTCTCTCAGGAGGTTTGCGCC  3234
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3154  ATATATTATGTTGGTACAAAGGATCAACGTTCAAAATTGTTCTCTCAGGAGGTTTGCGCC  3213

Query  3235  ATGAAGTTCAATGTCCTCGTTACGACTTATGAGTTCATTATGTATGATCGATCAAAACTC  3294
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3214  ATGAAGTTCAATGTCCTCGTTACGACTTATGAGTTCATTATGTATGATCGATCAAAACTC  3273

Query  3295  TCAAAAGTTGACTGGAAATATATTATAATTGATGAAGCACAACGGATGAAGGACAGAGAA  3354
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3274  TCAAAAGTTGACTGGAAATATATTATAATTGATGAAGCACAACGGATGAAGGACAGAGAA  3333

Query  3355  TCTGTTTTGGCCCGAGATCTTGACCGGTATCGCTGCCAGAGGAGATTACTTCTCACTGGA  3414
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3334  TCTGTTTTGGCCCGAGATCTTGACCGGTATCGCTGCCAGAGGAGATTACTTCTCACTGGA  3393

Query  3415  ACACCTTTGCAGAACGATCTGAAAGAGCTTTGGTCACTATTGAACCTTCTCCTTCCTGAT  3474
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3394  ACACCTTTGCAGAACGATCTGAAAGAGCTTTGGTCACTATTGAACCTTCTCCTTCCTGAT  3453

Query  3475  GTCTTTGACAATCGAAAAGCATTTCATGATTGGTTTGCGCAACCCTTTCAAAAAGAAGGT  3534
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3454  GTCTTTGACAATCGAAAAGCATTTCATGATTGGTTTGCGCAACCCTTTCAAAAAGAAGGT  3513

Query  3535  CCTGCGCATAATATAGAAGATGACTGGCTGGAGACTGaaaaaaaGGTCATAGTCATTCAC  3594
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  3514  CCTGCGCATAATATAGAGGATGACTGGCTGGAGACTGAAAAAAAGGTTATAGTCATTCAC  3573

Query  3595  AGACTTCATCAAATTTTAGAGCCATTCATGCTCAGACGCCGTGTTGAGGATGTGGAAGGG  3654
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3574  AGACTTCATCAAATTTTAGAGCCATTCATGCTCAGACGCCGTGTTGAGGATGTGGAAGGG  3633

Query  3655  TCACTTCCTGCTAAGGTTTCTGTAGTCTTACGATGTAGAATGTCTGCTATTCAGAGTGCC  3714
             |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3634  TCACTTCCTGCTAAGGTTTCTGTAGTTTTAAGGTGTAGAATGTCTGCTATTCAGAGTGCC  3693

Query  3715  GTTTATGATTGGATTAAAGCGACTGGAACTCTTAGAGTTGATCCAGACGATGAAAAACTT  3774
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3694  GTTTATGATTGGATTAAAGCGACTGGAACTCTTAGAGTTGATCCAGACGATGAAAAACTT  3753

Query  3775  AGGGCTCAAAAGAATCCGATATACCAAGCCAAGATATATAGAACTTTAAATAATAGGTGC  3834
             ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3754  AGGGCCCAGAAGAATCCAATATACCAAGCCAAGATATATAGAACTTTAAATAATAGGTGC  3813

Query  3835  ATGGAGTTGAGGAAAGCCTGCAATCATCCTTTGCTCAATTATCCATATTTCAATGACTTT  3894
             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct  3814  ATGGAGTTGAGGAAAGCCTGCAATCATCCTTTACTCAACTATCCATATTTCAACGACTTT  3873

Query  3895  TCCAAAGATTTCCTCGTAAGGTCATGTGGAAAATTGTGGATTCTGGACAGGATCCTTATA  3954
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  3874  TCCAAAGATTTCCTCGTAAGGTCATGTGGAAAATTGTGGATTCTGGATAGGATCCTTATA  3933

Query  3955  AAGCTACAGAGGACAGGCCATCGTGTATTGCTCTTCAGTACAATGACTAAACTTCTTGAT  4014
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3934  AAGCTACAGAGGACAGGCCATCGTGTATTGCTCTTCAGTACAATGACTAAACTTCTTGAT  3993

Query  4015  ATCTTGGAAGAGTATCTACAATGGAGAAGGCTTGTATACAGAAGAATTGATGGGACTACC  4074
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  3994  ATCTTGGAAGAGTATCTACAATGGAGAAGGCTTGTATACAGAAGAATAGATGGGACTACC  4053

Query  4075  AGCCTAGAAGATCGGGAATCAGCTATTGTGGACTTCAATGATCCTGATACGGATTGCTTT  4134
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4054  AGCCTAGAAGATCGGGAATCAGCTATTGTGGACTTCAATGATCCTGATACGGATTGCTTT  4113

Query  4135  ATCTTCTTGCTTAGTATACGTGCAGCTGGACGGGGTCTCAACCTTCAGACTGCTGACACA  4194
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4114  ATCTTCTTGCTTAGTATACGTGCAGCTGGACGGGGTCTCAACCTTCAGACTGCTGACACA  4173

Query  4195  GTTGTTATATATGATCCTGATCCAAATCCCAAGAATGAGGAACAAGCAGTTGCCAGAGCC  4254
             ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4174  GTTGTGATATATGATCCGGATCCAAATCCCAAGAATGAGGAACAAGCAGTTGCCAGAGCC  4233

Query  4255  CATCGTATAGGGCAGACAAGGGAAGTAAAAGTGATTTATATGGAGGCAGTTGTTGAAAAA  4314
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4234  CATCGTATAGGGCAGACAAGGGAAGTAAAAGTGATTTATATGGAGGCAGTTGTTGAAAAA  4293

Query  4315  CTCTCCAGCCATCAAAAGGAGGACGAGCTTAGAAGTGGTGGTTCAGTAGACCTAGAGGAT  4374
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  4294  ATCTCCAGCCATCAAAAGGAGGACGAGCTTAGAAGTGGTGGTTCAATAGACCTAGAGGAT  4353

Query  4375  GACATGGCTGGGAAGGACCGATATATAGGATCTATAGAGGGTCTCATAAGGAATAATATT  4434
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4354  GACATGGCTGGGAAGGACCGATATATAGGATCTATAGAGGGTCTCATAAGGAATAATATT  4413

Query  4435  CAACAGTATAAGATTGACATGGCTGATGAGGTCATTAATGCTGGTCGTTTTGACCAAAGG  4494
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  4414  CAACAGTATAAGATTGACATGGCTGATGAGGTCATTAATGCTGGGCGTTTTGACCAAAGG  4473

Query  4495  ACAACTCATGAAGAGCGACGAATGACATTGGAGACTTTATTGCATGACGAAGAGAGATAT  4554
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  4474  ACAACTCATGAAGAGCGACGAATGACATTGGAGACTCTATTGCATGACGAAGAGAGATAT  4533

Query  4555  CAAGAAACTGTCCATGATGTACCTTCTCTGCATGAGGTGAACAGAATGATTGCCAGAAGC  4614
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  4534  CAAGAAACTGTCCATGATGTACCTTCTCTGCATGAGGTGAACAGGATGATTGCCAGAAGC  4593

Query  4615  GAGGAGGAAGTTGAGTTATTTGATCAGATGGATGAAGAATTTGACTGGACGGAGGAGATG  4674
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4594  GAAGAGGAAGTTGAGTTATTTGATCAGATGGATGAAGAATTTGACTGGACGGAGGAGATG  4653

Query  4675  ACTAATCATGAGCAGGTGCCTAAGTGGCTTCGAGCTAGTACCAGAGAGGTGAATGCTACT  4734
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4654  ACTAATCATGAGCAGGTGCCTAAGTGGCTTCGAGCTAGTACCAGAGAGGTGAATGCTACT  4713

Query  4735  GTTGCTGATTTGTCTAAGAAACCGTCAAAGAACATGTTGTCTAGCAGTAACCTGATTGTA  4794
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| 
Sbjct  4714  GTTGCTGATTTGTCTAAGAAACCTTCAAAGAACATGTTGTCTAGCAGTAATCTGATTGTG  4773

Query  4795  CAACCTGGTGGACCTGGAGGTGAGAGAAAAAGGGGCCGGCCCAAGAGCAAAAAGATTAAC  4854
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4774  CAACCTGGTGGACCGGGAGGTGAGAGAAAAAGGGGGCGGCCCAAGAGCAAAAAGATTAAC  4833

Query  4855  TACAAGGAAATTGAAGATGACATTGCAGGTTACTCTGAGGAAAGCTCTGAGGAAAGGAAC  4914
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4834  TACAAGGAAATTGAAGATGACATTGCAGGTTACTCTGAGGAAAGCTCTGAGGAAAGGAAC  4893

Query  4915  ATTGATTCTGGGAATGAAGAAGAGGGAGATATTCGACAATTTGATGATGATGAACTTACT  4974
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  4894  ATTGATTCTGGGAATGAAGAAGAGGGAGATATTCGACAATTTGATGATGATGAACTTAC-  4952

Query  4975  GG-CGCTCTTGGAGATCATCAAACCAACAAGGGAGAATTTGATGGAGAGAACCCCGTCTG  5033
             || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct  4953  GGTCGCTCTTGGAGATCACCAAACCAACAAGGGAGAATCTGATGGAGAGAACCCTGTCTG  5012

Query  5034  TGGTTATGATTATCCTCCGGGTTCTGGTAGTTATaaaaaaaaTCCTCCTCGTGATGATGC  5093
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  5013  TGGTTATGATTATCCTCCGGGTTCTGGTAGTTATAAAAAAATTCCTCCTCGTGATGATGC  5072

Query  5094  TGGTTCGTCAGGATCTTCTCCAGAGAGCCATAGATCGAAAGAAATGGCATCTCCTGTTTC  5153
              ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  5073  CGGTTCTTCAGGATCTTCTCCAGAGAGCCATAGATCGAAAGAGATGGCATCTCCTGTTTC  5132

Query  5154  TTCACAAAAGTTTGGCTCTTTGTCTGCATTGGACACTAGGCCAGGTTCTGTCTCTAAAAG  5213
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  5133  TTCACAAAAGTTTGGCTCTTTGTCTGCATTGGACACTAGGCCAGGTTCTGTCTCAAAAAG  5192

Query  5214  ACTGCTGGATGACCTAGAAGAGGGGGAAATAGCAGCATCAGGGGATTCTCACATAGATCT  5273
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  5193  ACTGCTGGATGACCTAGAAGAGGGGGAAATAGCAGCATCAGGGGATTCTCACGTAGATCT  5252

Query  5274  CCAACGATCAGGAAGTTGGGCCCATGACCGTGATGAAGGGGATGAAGAACAGGTTCTGCA  5333
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  5253  CCAACGATCAGGAAGTTGGGCCCATGACCGTGATGAAGGGGATGAAGAACAGGTTTTGCA  5312

Query  5334  ACCTACGATAAAACGGAAACGGAGTATTCGTCTAAGACCCCGTCAGACGGCAGAAAGAGT  5393
             ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||
Sbjct  5313  ACCTACGATAAAACGAAAACGGAGTATTCGTCTACGACCCCGTCAAACGGTAGACAGAGT  5372

Query  5394  TGACGGTAGTGAGATGCCTGCAGCTCAGCCATTGCAAGTGGATCGTAGCTACCGATCAAA  5453
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  5373  TGACGGTAGTGAGATGCCTGCAGCTCAGCCATTACAAGTTGATCGTAGCTACCGATCAAA  5432

Query  5454  GTTAAGGACAGTTGTTGACTCGCATAGTTCAAGACAAGATCAGAGTGATTCGTCCTCGAG  5513
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  5433  GTTAAGGACAGTTGTTGACTCGCATGGTTCAAGACAAGATCAGAGTGATTCGTCCTCTAG  5492

Query  5514  ACTAAGGAGTGTACCTGCAAAGAAGGTAGCTAGTACTTCCAAACTCCATGTCTCATCACC  5573
             ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  5493  ACTTAGGAGTTTACCTGCAAAGAAGGTAGCTAGTACTTCCAAACTCCATGTATCATCACC  5552

Query  5574  AAAATCTGGTAGATTGAATGCTACACAGCTTACCGTGGAGGATAACGCTGAAGCTTCCAG  5633
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5553  AAAATCTGGTAGATTGAATGCCACACAGCTTACCGTGGAGGATAACGCTGAAGCTTCCAG  5612

Query  5634  AGAAACATGGGATGGAACTAGTCCTATTAGCTCTTCAAATGCTGGTGCAAGAATGTCCCA  5693
             |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  5613  AGAAACATGGGATGGAACTAGTCCTATTGGCTCTTCAAATACTGGTGCAAGAATGTCCCA  5672

Query  5694  CATCATACAGAAACGGTGCAAAATCGTGATTAGCAAGCTCCAGAGGAGAATCGACAAGGA  5753
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  5673  CATCATACAGAAACGGTGCAAAAACGTGATTAGCAAGCTCCAAAGGAGAATCGACAAGGA  5732

Query  5754  AGGTCAGCAGATTGTACCTATGCTGACAAATTTGTGGAAGAGAATTCAGAATGGTTATGC  5813
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5733  AGGTCAGCAGATTGTACCTATGCTGACAAATTTGTGGAAGAGAATTCAGAATGGTTATGC  5792

Query  5814  AGCTGGAGGTGTAAATAACCTTTTGGAACTACGAGAGATAGACCACCGGGTAGAAAGACT  5873
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct  5793  AGCTGGAGGTGTAAATAACCTTTTGGAACTACGAGAGATAGACCAGCGAGTAGAAAGACT  5852

Query  5874  AGAGTATGCAGGAGTTATGGAACTCGCATCTGACGTGCAGTTAATGCTAAGGGGAGCAAT  5933
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5853  AGAGTACGCAGGAGTTATGGAACTCGCATCTGACGTGCAGTTAATGCTAAGGGGAGCAAT  5912

Query  5934  GCAATTCTATGGGTTTTCACATGAGGTGAGATCTGAAGCAAAGAAGGTTCACAATCTGTT  5993
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  5913  GCAATTCTATGGATTTTCACATGAGGTGAGATCTGAAGCAAGGAAGGTTCACAATCTGTT  5972

Query  5994  CTTTGATCTATTAAAGATGTCTTTCCCAGACACAGATTTCCGGGAAGCAAGGAATGCTCT  6053
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5973  CTTTGATCTATTAAAGATGTCTTTCCCAGACACAGATTTCCGGGAAGCAAGGAATGCTCT  6032

Query  6054  TTCCTTTTCTGGCTCAGCCCCAACTTTGGTGTCTACACCAACCCCAAGAGGAGCAGGAAT  6113
             ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct  6033  TTCCTTTTCTGGCCCAATCCCAAATTTGGTGTCTACACCATCCCCAAGAGGAGCAGGCAT  6092

Query  6114  TAGCCAAGGCAAGAGGCAAAAGTTAGTAAACGAGCCGGAAACCGAGCCAAGCTCTCCTCA  6173
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  6093  TAGCCAAGGCAAGAGGCAAAAGTTGGTAAACGAGGCGGAACCCGAGCCAAGCTCTCCTCA  6152

Query  6174  GAGATCTCAACAACGTGAGAACTCAAGGATCAGAGTACAGATACCGCAGAAAGAAACAAA  6233
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  6153  GAGATCTCAACAACGTGAGAACTCAAGGATCAGAGTACAGATACCGCAGAAAGAAACAAA  6212

Query  6234  GCTTGGGGGGACAACAAGCCACACTGATGAATCCCCAATATTAGCTCATCCAGGGGAATT  6293
              |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  6213  TCTTGGGGGCACAACAAGCCACACTGATGAATCCCCAATTTTAGCTCATCCAGGGGAATT  6272

Query  6294  AGTAATCTGCAAGAAAAAGAGGAAAGACCGAGAGAAGTCTGGTCCGAAAACCCGAACTGG  6353
             ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  6273  AGTTATCTGCAAGAAGAAGAGGAAAGACCGAGAGAAGTCTGCTCCGAAAACCCGAACTGG  6332

Query  6354  TGGCTCCAGCAGCCCAGTTTCACCACCTCCAGCAATGATTGGTCGTGGTCTTAGAAGTCC  6413
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  6333  TGGCTCCAGCAGCCCAGTTTCACCACCTCCAGCTATGATTGGTCGTGGTCTTAGAAGTCC  6392

Query  6414  TGTGTCTGGTGGAGTTCCAAGGGAAACAAGGCTAGCACAACAGCAGCGGTGGCCAAACCA  6473
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct  6393  TGTGTCTGGTGGAGTTCCAAGGGAAACAAGGCTAGCACAGCAGCAGCGCTGGCCAAACCA  6452

Query  6474  ACCCACTCATCCAAACAACAGCGGTGCGGCCGGTGATTCTGTGGGATGGGCAAATCCGGT  6533
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  6453  ACCCACTCATCCAAACAACAGCGGTGCGGCCGGTGATTCCGTGGGATGGGCAAATCCGGT  6512

Query  6534  GAAGAGGTTAAGGACAGATTCTGGTAAAAGACGGCCTAGCCATTTATAG  6582
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  6513  GAAGAGGTTAAGGACAGATTCTGGTAAAAGACGGCCTAGCCATTTATAG  6561



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 255746890560


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5