BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G46020.2 Length=6747 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg483746 jgi|Araly1|483746|fgenesh2_kg.4__2806__AT2G46020.1 1.092e+04 0.0 > Ahg483746 jgi|Araly1|483746|fgenesh2_kg.4__2806__AT2G46020.1 Length=6561 Score = 1.092e+04 bits (5911), Expect = 0.0 Identities = 6369/6589 (97%), Gaps = 35/6589 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGCAATCTGGAGGCAGTGGCGGAGGGCCCGCTCGGAATCCGGCCATGGGTCCGGCTGGT 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGCAATCTGGAGGCAGTGGCGGAGGGCCCGCTCGGAATCCGCCCATGGGTCCGGCTGGT 60 Query 61 CGGACTGCTTCCACGTCATCCGCTGCTTCTCCTTCTTCTTCCTCTTCATCTGTgcagcag 120 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | | Sbjct 61 CGGACTGCGTCCACGTCATCCGCTGCTTCTCCTTCTTCTTCCTCTTC--C--T-C--C-G 112 Query 121 cagcaacagcaacagcaacagcagcaacagcaacagcagctggcgtctaggcagcagcag 180 | |||| | | | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 113 -TG---CAGC-A-A-C-A-A-CAGCAACAG---CAGCAGCTGGCGTCTAGGCAGCAACAG 159 Query 181 cagcagcacagAAACTCAGATACAAACGAAAATATGTTTGCATATCAACCTGGTGGGGTT 240 |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 160 CAGCAGCAGAGAAACTCAGATGCAAACGAAAACATGTTTGCATATCATGCTGGTGGGGTT 219 Query 241 CAGGGAATGATGGGCGGTGGCAACTTTGCTTCGTCTCCGGGCTCTATGCAAATGCCTCAG 300 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 220 CAGGGAATGATGGGAGGTGGCAACTTTGCTTCGTCTTCTGGCTCTATGCAAATGCCTCAG 279 Query 301 CAGTCTA-GAAAtttttttGAGTCTCCTCAGcaacaacaacaacaacaacaacaGGGTTC 359 ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || Sbjct 280 CAGTCTAGGAAA-TTCTTTGAGTCTCCTCAACAACAACAACAACAGCAGCAACAGGGCTC 338 Query 360 TTCTACCCAAGAGGGCCAGCAAAATTTTAATCCAATGCAGCAAGCGTATATTCAGTTTGC 419 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 339 TTCTACCCAAGAGGGCCAGCAAAGTTTTAATCCAATGCAGCAAGCGTATATTCAGTTTGC 398 Query 420 TATGCAGGCTCAGCATCAAAAAGCACAGCAGCAAGCTAGGATGGGAATGGTGGGTTCATC 479 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| Sbjct 399 TATACAGGCTCAGCAACAAAAAGCACAGCAGCAAGCTAGAATGGGAATGATAGGTTCATC 458 Query 480 AAGTGTGGGAAAGGATCAAGATGCACGAATGGGAATGTTGAATATGCAAGACTTGAATCC 539 |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 459 AAGTGTCGGAAAAGATCAAGATGCACGGATGGGAATGTTGAATATACAAGATTTGAATCC 518 Query 540 GTCTAGTCAGCCCCAGGCCTCATCATCGAAGCCATCGGGCGATCAGTTTGCTCGCGGTGA 599 |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| Sbjct 519 GTCTAGTCAGGCCCAGGCCTCATCGTCTAAGCCATCGGGAGATCAGTTTGGTCGCGGTGA 578 Query 600 AAGGCAGACT-GAATCAAGTTCTCAGCAAAGGAACGAAACAAAATCTCATCCTCAGCAGC 658 |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 579 AAGGCAGA-TGGAATCAGGTTCTCAGCAAAGGAACGAAACAAATTCTCATCCTCAGCAGC 637 Query 659 AGGTGGGTACCGGACAACTAATGCCTGGAAATATGATAAGGCCAATGCAAGCACCACAGG 718 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 638 AGGTGGGTACCGGACAACTAATACCTGGAAATATGATAAGGCCAATGCAGGCACCACAGC 697 Query 719 CTCAGCAGCTTGTCAATAACATGGGAAACAACCAACTCGCATTTGCACAACAGTGGCAGG 778 |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 698 CTCAACAGCTTATCAATAATATGGGAAATAACCAACTCGCATTTGCACAACAGTGGCAGG 757 Query 779 CAATGCAGGCATGGGCGCGTGAGCGTAATATCGATCTCTCACATCCTGCCAACGCCAGCC 838 ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 758 CAATGCAGGCATGGGCGCGTGAGAGGAATATCGATCTCTCACATCCTGCCAACGCCAGCC 817 Query 839 AAATGGCACACATCCTTCAGGCAAGAATGGCTGCTCAACAGAAAGCTGGTGAAGGCAATG 898 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| Sbjct 818 AAATGGCACACATCCTTCAGGCAAGAATGGCTGCCCAACAGAAAGTTAGTGAAGGCAATG 877 Query 899 TGGCCTCACAGTCACCATCTATTCCAATCTCTAGCCAGCCGGCTTCATCTTCGGTTGTTC 958 |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 878 TGGCTTCACAGGCACCTTCTATTCCAATCTCTAGCCAGCCGGCTTCATCTTCGGTTGTTC 937 Query 959 CAGGTGAGAATTCACCACATGCCAACTCTGCTAGTGATATCTCTGGGCAGTCAGGATCAG 1018 |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 938 CAGGTGAGAATTCACCGCGTACCAACTCTGCTAGTGATATCTCTGGGCAGTCAGGATCAG 997 Query 1019 CGAAGGCCAGACATGCATTATCTACTGGCTCATTTGCCTCGACTTCCAGTCCCAGAATGG 1078 | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 998 CAAAGGCCAGGCATGCAATATCTACTGGCTCATTTGCTTCGACTTCCAGTCCCAGAATGG 1057 Query 1079 TCAATCCTGCTATGAATCCCTTCTCCGGCCAAGGGAGAGAGAATCCAATGTATCCTCGAC 1138 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1058 TCAATCCTGCTATGAATCCCTTCTCCGTCCAAGGGAGAGATAATCCAATGTATCCTCGAC 1117 Query 1139 ATTTAGTTCAGCCTACAAATGGGATGCCCTCAGGAAATCCCCTGCAGACTTCTGCAAATG 1198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1118 ATTTAGTTCAGCCTACAAATGGGATGCCCTCAGGAAATTCCCTGCAGACTTCTGCAAATG 1177 Query 1199 AGACTCCTGTTTTGGATCAGAATGCATCTACaaaaaaaaGTTTAGGTCCTGCTGAACATT 1258 |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1178 AGACTCTTGTTTTGGATCAGAATGTGTCTACAAAAAAAAGTTTAGGTCCTGCTGAACATT 1237 Query 1259 TGCAAATGCAGCAGCCTAGGCAACTGAATACACCGACTCCAAATTTAGTAGCGCCATCTG 1318 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct 1238 TGCAAATGCAGCAGCCTAGGCAACTGAATGCACCGACTTCAAATTTACTAGCGCCATCTG 1297 Query 1319 ATACTGGTCCACTCAGTAACTCGTCCCTTCAGAGTGGACAGGGGACCCAACAAGCACAGC 1378 ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1298 ATACTGGTCCACTCAGTAATTCTTCCTTTCAGAGTGGACAGGGGACCCAACAAGCACAGC 1357 Query 1379 AGCGATCAGGATTTACCAAACAGCAACTCCATGTTCTCAAAGCCCAGATACTGGCATTTA 1438 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1358 AGCGAGCAGGATTTACCAAACAGCAACTCCATGTTCTCAAAGCCCAGATACTGGCATTTA 1417 Query 1439 GGCGTTTGAAGAAAGGGGAAGGTTCTTTGCCTCCGGAGCTTCTTCAAGCTATTTCTCCAC 1498 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1418 GGCGTTTGAAGAAAGGGGAAGGTTCTTTGCCTCCAGAGCTTCTTCAAGCTATTGCTCCAC 1477 Query 1499 CACCGCTTGAACTACAGACGCAGAGGCAAATATCTCCTGCCATAG-GGA-AAGTTCAGGA 1556 |||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||| Sbjct 1478 CACCGCTTCAACTGCAGACACAGAGGCAAATAACTCCTG--TTGGAGGACAAGTTCAGGA 1535 Query 1557 TAGATCTTCAG-ACAAAACTGGAGAAGACCAAGCAAGGTCGCTAGAGTGTGGCAAGGAGT 1615 |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1536 TAGAGCTTCAGAAC-AAACTGGAGAAGACCAAGCAAGGTCGCTAGAGTGTGGCAAAGAGT 1594 Query 1616 CTCAGGCTGCTGCTTCTTCAAATGGACCAATTTTTTCTAAAGAGGAAGATAATGTTGGAG 1675 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1595 CTCAGGCTGCTGCTTCTTCAAATGGACCGATTTTTTCTAAAGAGGAAGATAATGTTGGAG 1654 Query 1676 ATACAGAAGTAGCTTTGACGACAGGCCACAGCCAATTATTTCAAAACCTGGGAAAAGAAG 1735 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1655 ATACAGAAGTAGCTTTGACAACAGGCCACAGCCAATTATTTCAAAACCTGGGAAAAGAAG 1714 Query 1736 CTACTTCTACTGACGTGGCTACGAAAGAGGAGCAACAGACTGATGTATTCCCTGTTAAGT 1795 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1715 CTACTTCTACTGACGTGGCTACGAAAGAGGAGCAACAAACTGATGTATTCCCTGTTAAGT 1774 Query 1796 CAGACCAAGGAGCAGATTCTAGTACTCAAAAGAATCCTAGAAGTGATTCTACAGCTGATA 1855 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1775 CAGACCAAGGAGCAGATTCTAGTACTCAAAAGAATCCTAGAAGTGATTCTACAGCTGATA 1834 Query 1856 AGGGAAAGGCTGTTGCATCTGATGGAAGCCAATCTAAGGTTCCTCCACAAGCAAACTCTC 1915 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1835 AGGGAAAGGCTGTTGTATCTGATGGAAGCCAATCTAAGGTTCCTCCACAAGCAAACTCTC 1894 Query 1916 CCCAGCCGCCCAAGGATACAGCCTCTGCCAGGAAATATTATGGACCGTTGTTTGATTTTC 1975 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1895 CCCAGCAGCCCAAGGATACAGCCTCTGCCAGGAAATATTATGGACCGTTGTTTGATTTTC 1954 Query 1976 CCTTTTTCACTCGAAAACTTGACTCTTATGGGTCTGCAACAGCCAATGCCAATAACAATC 2035 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1955 CCTTTTTCACTCGAAAACTTGATTCTTATGGGTCTGCAACAGCCAATGCCAATAACAATC 2014 Query 2036 TCACATTAGCATATGATATTAAAGATCTGATTTGTGAAGAAGGTGCAGAGTTCCTTAGTA 2095 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2015 TCACATTAGCATATGATATTAAAGATCTGATTTGTGATGAAGGTGCAGAGTTCCTTAGTA 2074 Query 2096 AGAAAAGAACAGACAGTTTGAAGAAGATAAATGGTCTGCTAGCAAAAAATTTAGAAAGGA 2155 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2075 AGAAAAGAACAGACAGTTTGAAGAAGATAAATGGTCTGCTAGCAAAAAATTTAGAAAGGA 2134 Query 2156 AAAGGATTAGGCCTGATCTTGTTTTACGGCTTCAAATTGAAGAGAAAAAGCTTAGGCTAT 2215 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2135 AAAGGATTAGGCCTGATCTTGTTTTACGGCTTCAAATTGAAGAGAAAAAGCTTAGGCTAT 2194 Query 2216 CTG-ATCTTCAGTCTCGTGTTAGAGAGGAAGTAGATCGACAACAACAGGAGATAATGTCC 2274 | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2195 C-GAATCTTCAGTCTCGTGTTAGAGAGGAAGTGGATCGACAACAACAGGAGATAATGTCC 2253 Query 2275 ATGCCGGATAGGCCGTACCGCAAATTTGTGAGGTTATGCGAACGGCAACGCCTAGAAATG 2334 ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2254 ATGCCCGATAGGCCATACCGCAAATTTGTGAGGTTGTGCGAACGGCAACGCCTTGAAATG 2313 Query 2335 AATAGACAAGTACTGGCCAATCAGAAAGCTGTCAGAGAGAAGCAGCTGAAAACCATTTTT 2394 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2314 AATAGACAAGTACTGGCCAACCAGAAAGCTGTTAGAGAGAAGCAGCTGAAAACCATTTTT 2373 Query 2395 CAGTGGCGTAAGAAACTCCTTGAGGCTCATTGGGCTATACGTGATGCACGCACTGCTCGT 2454 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2374 CAGTGGCGTAAGAAACTCCTTGAGGCTCACTGGGCTATACGTGATGCACGCACTGCTCGT 2433 Query 2455 AACAGGGGAGTGGCCAAATACCATGAAAAGATGTTGAGAGAGTTTTCAAAGAGAAAAGAT 2514 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2434 AACAGGGGAGTGGCCAAATACCATGAAAAGATGTTGAGAGAGTTTTCGAAGAGAAAAGAT 2493 Query 2515 GATGGCCGCAACAAAAGGATGGAGGCCTTGAAGAATAATGATGTAGAAAGATACAGGGAG 2574 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2494 GATGGCCGGAACAAAAGGATGGAGGCCTTGAAGAATAATGATGTAGAAAGGTACAGGGAG 2553 Query 2575 ATGTTGCTGGAACAGCAAACTAATATGCCTGGTGATGCTGCTGAAAGATATGCTGTTCTC 2634 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2554 ATGTTGCTGGAACAGCAAACAAATATGCCTGGTGATGCTGCTGAAAGATATGCTGTTCTC 2613 Query 2635 TCTTCATTTTTGACCCAAACCGAAGATTATCTTCATAAACTTGGAGGTAAGATTACTGCC 2694 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2614 TCTTCATTTTTGACCCAAACCGAAGATTATCTTCATAAACTTGGAGGTAAGATTACTGCC 2673 Query 2695 ACAAAAAATCAACAGGAAGTGGAGGAGGCAGCAAATGCTGCAGCAGTAGCAGCGAGATTG 2754 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2674 ACAAAAAATCAACAGGAAGTGGAGGAGGCAGCGAATGCTGCAGCAGTAGCAGCCAGATTG 2733 Query 2755 CAGGGGTTGTCAGAAGAAGAGGTCAGGGCAGCAGCTACTTGTGCTCGAGAAGAAGTTGTG 2814 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2734 CAGGGCTTGTCAGAAGAAGAGGTCAGGGCAGCAGCTACTTGTGCTCGAGAAGAAGTTGTG 2793 Query 2815 ATCAGAAATAGATTTACGGAAATGAATGCGCCAAAAGAAAATTCATCTGTCAACAAGTAC 2874 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2794 ATCAGAAATAGATTTACGGAAATGAATGCGCCAAAAGAAAATTCATCTGTCAACAAGTAT 2853 Query 2875 TATACTCTGGCTCATGCTGTAAATGAAGTGGTTGTAAGACAACCTTCAATGCTTCAGGCT 2934 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2854 TATACTCTGGCTCATGCTGTAAATGAAGTGGTTATAAGACAACCTTCAATGCTTCAGGCT 2913 Query 2935 GGAACTTTGCGTGATTACCAGCTGGTTGGATTACAATGGATGCTATCGTTGTATAATAAC 2994 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2914 GGAACTTTGCGTGATTACCAGCTGGTTGGATTACAATGGATGCTATCGCTGTATAATAAC 2973 Query 2995 AAATTAAACGGGATCTTGGCTGATGAGATGGGTCTTGGAAAAACTGTTCAGGTAATGGCA 3054 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2974 AAATTAAATGGGATCTTGGCTGATGAGATGGGTCTTGGAAAAACTGTGCAGGTAATGGCA 3033 Query 3055 CTGATTGCTTACCTTATGGAGTTTAAAGGGAATTATGGACCGCATCTCATCATCGTTCCC 3114 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3034 CTGATTGCTTACCTTATGGAGTTTAAGGGGAATTATGGACCGCATCTCATCATCGTTCCC 3093 Query 3115 AATGCTGTTCTGGTGAATTGGAAGAGTGAACTCCATACTTGGCTGCCATCTGTTTCATGC 3174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3094 AATGCTGTTCTGGTGAATTGGAAGAGTGAACTCCATACTTGGCTGCCATCTGTTTCATGC 3153 Query 3175 ATATATTATGTTGGTACAAAGGATCAACGTTCAAAATTGTTCTCTCAGGAGGTTTGCGCC 3234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3154 ATATATTATGTTGGTACAAAGGATCAACGTTCAAAATTGTTCTCTCAGGAGGTTTGCGCC 3213 Query 3235 ATGAAGTTCAATGTCCTCGTTACGACTTATGAGTTCATTATGTATGATCGATCAAAACTC 3294 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3214 ATGAAGTTCAATGTCCTCGTTACGACTTATGAGTTCATTATGTATGATCGATCAAAACTC 3273 Query 3295 TCAAAAGTTGACTGGAAATATATTATAATTGATGAAGCACAACGGATGAAGGACAGAGAA 3354 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3274 TCAAAAGTTGACTGGAAATATATTATAATTGATGAAGCACAACGGATGAAGGACAGAGAA 3333 Query 3355 TCTGTTTTGGCCCGAGATCTTGACCGGTATCGCTGCCAGAGGAGATTACTTCTCACTGGA 3414 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3334 TCTGTTTTGGCCCGAGATCTTGACCGGTATCGCTGCCAGAGGAGATTACTTCTCACTGGA 3393 Query 3415 ACACCTTTGCAGAACGATCTGAAAGAGCTTTGGTCACTATTGAACCTTCTCCTTCCTGAT 3474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3394 ACACCTTTGCAGAACGATCTGAAAGAGCTTTGGTCACTATTGAACCTTCTCCTTCCTGAT 3453 Query 3475 GTCTTTGACAATCGAAAAGCATTTCATGATTGGTTTGCGCAACCCTTTCAAAAAGAAGGT 3534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3454 GTCTTTGACAATCGAAAAGCATTTCATGATTGGTTTGCGCAACCCTTTCAAAAAGAAGGT 3513 Query 3535 CCTGCGCATAATATAGAAGATGACTGGCTGGAGACTGaaaaaaaGGTCATAGTCATTCAC 3594 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3514 CCTGCGCATAATATAGAGGATGACTGGCTGGAGACTGAAAAAAAGGTTATAGTCATTCAC 3573 Query 3595 AGACTTCATCAAATTTTAGAGCCATTCATGCTCAGACGCCGTGTTGAGGATGTGGAAGGG 3654 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3574 AGACTTCATCAAATTTTAGAGCCATTCATGCTCAGACGCCGTGTTGAGGATGTGGAAGGG 3633 Query 3655 TCACTTCCTGCTAAGGTTTCTGTAGTCTTACGATGTAGAATGTCTGCTATTCAGAGTGCC 3714 |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3634 TCACTTCCTGCTAAGGTTTCTGTAGTTTTAAGGTGTAGAATGTCTGCTATTCAGAGTGCC 3693 Query 3715 GTTTATGATTGGATTAAAGCGACTGGAACTCTTAGAGTTGATCCAGACGATGAAAAACTT 3774 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3694 GTTTATGATTGGATTAAAGCGACTGGAACTCTTAGAGTTGATCCAGACGATGAAAAACTT 3753 Query 3775 AGGGCTCAAAAGAATCCGATATACCAAGCCAAGATATATAGAACTTTAAATAATAGGTGC 3834 ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3754 AGGGCCCAGAAGAATCCAATATACCAAGCCAAGATATATAGAACTTTAAATAATAGGTGC 3813 Query 3835 ATGGAGTTGAGGAAAGCCTGCAATCATCCTTTGCTCAATTATCCATATTTCAATGACTTT 3894 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| Sbjct 3814 ATGGAGTTGAGGAAAGCCTGCAATCATCCTTTACTCAACTATCCATATTTCAACGACTTT 3873 Query 3895 TCCAAAGATTTCCTCGTAAGGTCATGTGGAAAATTGTGGATTCTGGACAGGATCCTTATA 3954 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3874 TCCAAAGATTTCCTCGTAAGGTCATGTGGAAAATTGTGGATTCTGGATAGGATCCTTATA 3933 Query 3955 AAGCTACAGAGGACAGGCCATCGTGTATTGCTCTTCAGTACAATGACTAAACTTCTTGAT 4014 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3934 AAGCTACAGAGGACAGGCCATCGTGTATTGCTCTTCAGTACAATGACTAAACTTCTTGAT 3993 Query 4015 ATCTTGGAAGAGTATCTACAATGGAGAAGGCTTGTATACAGAAGAATTGATGGGACTACC 4074 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3994 ATCTTGGAAGAGTATCTACAATGGAGAAGGCTTGTATACAGAAGAATAGATGGGACTACC 4053 Query 4075 AGCCTAGAAGATCGGGAATCAGCTATTGTGGACTTCAATGATCCTGATACGGATTGCTTT 4134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4054 AGCCTAGAAGATCGGGAATCAGCTATTGTGGACTTCAATGATCCTGATACGGATTGCTTT 4113 Query 4135 ATCTTCTTGCTTAGTATACGTGCAGCTGGACGGGGTCTCAACCTTCAGACTGCTGACACA 4194 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4114 ATCTTCTTGCTTAGTATACGTGCAGCTGGACGGGGTCTCAACCTTCAGACTGCTGACACA 4173 Query 4195 GTTGTTATATATGATCCTGATCCAAATCCCAAGAATGAGGAACAAGCAGTTGCCAGAGCC 4254 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4174 GTTGTGATATATGATCCGGATCCAAATCCCAAGAATGAGGAACAAGCAGTTGCCAGAGCC 4233 Query 4255 CATCGTATAGGGCAGACAAGGGAAGTAAAAGTGATTTATATGGAGGCAGTTGTTGAAAAA 4314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4234 CATCGTATAGGGCAGACAAGGGAAGTAAAAGTGATTTATATGGAGGCAGTTGTTGAAAAA 4293 Query 4315 CTCTCCAGCCATCAAAAGGAGGACGAGCTTAGAAGTGGTGGTTCAGTAGACCTAGAGGAT 4374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 4294 ATCTCCAGCCATCAAAAGGAGGACGAGCTTAGAAGTGGTGGTTCAATAGACCTAGAGGAT 4353 Query 4375 GACATGGCTGGGAAGGACCGATATATAGGATCTATAGAGGGTCTCATAAGGAATAATATT 4434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4354 GACATGGCTGGGAAGGACCGATATATAGGATCTATAGAGGGTCTCATAAGGAATAATATT 4413 Query 4435 CAACAGTATAAGATTGACATGGCTGATGAGGTCATTAATGCTGGTCGTTTTGACCAAAGG 4494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 4414 CAACAGTATAAGATTGACATGGCTGATGAGGTCATTAATGCTGGGCGTTTTGACCAAAGG 4473 Query 4495 ACAACTCATGAAGAGCGACGAATGACATTGGAGACTTTATTGCATGACGAAGAGAGATAT 4554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4474 ACAACTCATGAAGAGCGACGAATGACATTGGAGACTCTATTGCATGACGAAGAGAGATAT 4533 Query 4555 CAAGAAACTGTCCATGATGTACCTTCTCTGCATGAGGTGAACAGAATGATTGCCAGAAGC 4614 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 4534 CAAGAAACTGTCCATGATGTACCTTCTCTGCATGAGGTGAACAGGATGATTGCCAGAAGC 4593 Query 4615 GAGGAGGAAGTTGAGTTATTTGATCAGATGGATGAAGAATTTGACTGGACGGAGGAGATG 4674 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4594 GAAGAGGAAGTTGAGTTATTTGATCAGATGGATGAAGAATTTGACTGGACGGAGGAGATG 4653 Query 4675 ACTAATCATGAGCAGGTGCCTAAGTGGCTTCGAGCTAGTACCAGAGAGGTGAATGCTACT 4734 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4654 ACTAATCATGAGCAGGTGCCTAAGTGGCTTCGAGCTAGTACCAGAGAGGTGAATGCTACT 4713 Query 4735 GTTGCTGATTTGTCTAAGAAACCGTCAAAGAACATGTTGTCTAGCAGTAACCTGATTGTA 4794 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 4714 GTTGCTGATTTGTCTAAGAAACCTTCAAAGAACATGTTGTCTAGCAGTAATCTGATTGTG 4773 Query 4795 CAACCTGGTGGACCTGGAGGTGAGAGAAAAAGGGGCCGGCCCAAGAGCAAAAAGATTAAC 4854 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 4774 CAACCTGGTGGACCGGGAGGTGAGAGAAAAAGGGGGCGGCCCAAGAGCAAAAAGATTAAC 4833 Query 4855 TACAAGGAAATTGAAGATGACATTGCAGGTTACTCTGAGGAAAGCTCTGAGGAAAGGAAC 4914 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4834 TACAAGGAAATTGAAGATGACATTGCAGGTTACTCTGAGGAAAGCTCTGAGGAAAGGAAC 4893 Query 4915 ATTGATTCTGGGAATGAAGAAGAGGGAGATATTCGACAATTTGATGATGATGAACTTACT 4974 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4894 ATTGATTCTGGGAATGAAGAAGAGGGAGATATTCGACAATTTGATGATGATGAACTTAC- 4952 Query 4975 GG-CGCTCTTGGAGATCATCAAACCAACAAGGGAGAATTTGATGGAGAGAACCCCGTCTG 5033 || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| Sbjct 4953 GGTCGCTCTTGGAGATCACCAAACCAACAAGGGAGAATCTGATGGAGAGAACCCTGTCTG 5012 Query 5034 TGGTTATGATTATCCTCCGGGTTCTGGTAGTTATaaaaaaaaTCCTCCTCGTGATGATGC 5093 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 5013 TGGTTATGATTATCCTCCGGGTTCTGGTAGTTATAAAAAAATTCCTCCTCGTGATGATGC 5072 Query 5094 TGGTTCGTCAGGATCTTCTCCAGAGAGCCATAGATCGAAAGAAATGGCATCTCCTGTTTC 5153 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 5073 CGGTTCTTCAGGATCTTCTCCAGAGAGCCATAGATCGAAAGAGATGGCATCTCCTGTTTC 5132 Query 5154 TTCACAAAAGTTTGGCTCTTTGTCTGCATTGGACACTAGGCCAGGTTCTGTCTCTAAAAG 5213 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 5133 TTCACAAAAGTTTGGCTCTTTGTCTGCATTGGACACTAGGCCAGGTTCTGTCTCAAAAAG 5192 Query 5214 ACTGCTGGATGACCTAGAAGAGGGGGAAATAGCAGCATCAGGGGATTCTCACATAGATCT 5273 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 5193 ACTGCTGGATGACCTAGAAGAGGGGGAAATAGCAGCATCAGGGGATTCTCACGTAGATCT 5252 Query 5274 CCAACGATCAGGAAGTTGGGCCCATGACCGTGATGAAGGGGATGAAGAACAGGTTCTGCA 5333 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 5253 CCAACGATCAGGAAGTTGGGCCCATGACCGTGATGAAGGGGATGAAGAACAGGTTTTGCA 5312 Query 5334 ACCTACGATAAAACGGAAACGGAGTATTCGTCTAAGACCCCGTCAGACGGCAGAAAGAGT 5393 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| Sbjct 5313 ACCTACGATAAAACGAAAACGGAGTATTCGTCTACGACCCCGTCAAACGGTAGACAGAGT 5372 Query 5394 TGACGGTAGTGAGATGCCTGCAGCTCAGCCATTGCAAGTGGATCGTAGCTACCGATCAAA 5453 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 5373 TGACGGTAGTGAGATGCCTGCAGCTCAGCCATTACAAGTTGATCGTAGCTACCGATCAAA 5432 Query 5454 GTTAAGGACAGTTGTTGACTCGCATAGTTCAAGACAAGATCAGAGTGATTCGTCCTCGAG 5513 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 5433 GTTAAGGACAGTTGTTGACTCGCATGGTTCAAGACAAGATCAGAGTGATTCGTCCTCTAG 5492 Query 5514 ACTAAGGAGTGTACCTGCAAAGAAGGTAGCTAGTACTTCCAAACTCCATGTCTCATCACC 5573 ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 5493 ACTTAGGAGTTTACCTGCAAAGAAGGTAGCTAGTACTTCCAAACTCCATGTATCATCACC 5552 Query 5574 AAAATCTGGTAGATTGAATGCTACACAGCTTACCGTGGAGGATAACGCTGAAGCTTCCAG 5633 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5553 AAAATCTGGTAGATTGAATGCCACACAGCTTACCGTGGAGGATAACGCTGAAGCTTCCAG 5612 Query 5634 AGAAACATGGGATGGAACTAGTCCTATTAGCTCTTCAAATGCTGGTGCAAGAATGTCCCA 5693 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 5613 AGAAACATGGGATGGAACTAGTCCTATTGGCTCTTCAAATACTGGTGCAAGAATGTCCCA 5672 Query 5694 CATCATACAGAAACGGTGCAAAATCGTGATTAGCAAGCTCCAGAGGAGAATCGACAAGGA 5753 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 5673 CATCATACAGAAACGGTGCAAAAACGTGATTAGCAAGCTCCAAAGGAGAATCGACAAGGA 5732 Query 5754 AGGTCAGCAGATTGTACCTATGCTGACAAATTTGTGGAAGAGAATTCAGAATGGTTATGC 5813 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5733 AGGTCAGCAGATTGTACCTATGCTGACAAATTTGTGGAAGAGAATTCAGAATGGTTATGC 5792 Query 5814 AGCTGGAGGTGTAAATAACCTTTTGGAACTACGAGAGATAGACCACCGGGTAGAAAGACT 5873 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 5793 AGCTGGAGGTGTAAATAACCTTTTGGAACTACGAGAGATAGACCAGCGAGTAGAAAGACT 5852 Query 5874 AGAGTATGCAGGAGTTATGGAACTCGCATCTGACGTGCAGTTAATGCTAAGGGGAGCAAT 5933 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5853 AGAGTACGCAGGAGTTATGGAACTCGCATCTGACGTGCAGTTAATGCTAAGGGGAGCAAT 5912 Query 5934 GCAATTCTATGGGTTTTCACATGAGGTGAGATCTGAAGCAAAGAAGGTTCACAATCTGTT 5993 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 5913 GCAATTCTATGGATTTTCACATGAGGTGAGATCTGAAGCAAGGAAGGTTCACAATCTGTT 5972 Query 5994 CTTTGATCTATTAAAGATGTCTTTCCCAGACACAGATTTCCGGGAAGCAAGGAATGCTCT 6053 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5973 CTTTGATCTATTAAAGATGTCTTTCCCAGACACAGATTTCCGGGAAGCAAGGAATGCTCT 6032 Query 6054 TTCCTTTTCTGGCTCAGCCCCAACTTTGGTGTCTACACCAACCCCAAGAGGAGCAGGAAT 6113 ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || Sbjct 6033 TTCCTTTTCTGGCCCAATCCCAAATTTGGTGTCTACACCATCCCCAAGAGGAGCAGGCAT 6092 Query 6114 TAGCCAAGGCAAGAGGCAAAAGTTAGTAAACGAGCCGGAAACCGAGCCAAGCTCTCCTCA 6173 |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 6093 TAGCCAAGGCAAGAGGCAAAAGTTGGTAAACGAGGCGGAACCCGAGCCAAGCTCTCCTCA 6152 Query 6174 GAGATCTCAACAACGTGAGAACTCAAGGATCAGAGTACAGATACCGCAGAAAGAAACAAA 6233 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6153 GAGATCTCAACAACGTGAGAACTCAAGGATCAGAGTACAGATACCGCAGAAAGAAACAAA 6212 Query 6234 GCTTGGGGGGACAACAAGCCACACTGATGAATCCCCAATATTAGCTCATCCAGGGGAATT 6293 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 6213 TCTTGGGGGCACAACAAGCCACACTGATGAATCCCCAATTTTAGCTCATCCAGGGGAATT 6272 Query 6294 AGTAATCTGCAAGAAAAAGAGGAAAGACCGAGAGAAGTCTGGTCCGAAAACCCGAACTGG 6353 ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 6273 AGTTATCTGCAAGAAGAAGAGGAAAGACCGAGAGAAGTCTGCTCCGAAAACCCGAACTGG 6332 Query 6354 TGGCTCCAGCAGCCCAGTTTCACCACCTCCAGCAATGATTGGTCGTGGTCTTAGAAGTCC 6413 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6333 TGGCTCCAGCAGCCCAGTTTCACCACCTCCAGCTATGATTGGTCGTGGTCTTAGAAGTCC 6392 Query 6414 TGTGTCTGGTGGAGTTCCAAGGGAAACAAGGCTAGCACAACAGCAGCGGTGGCCAAACCA 6473 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 6393 TGTGTCTGGTGGAGTTCCAAGGGAAACAAGGCTAGCACAGCAGCAGCGCTGGCCAAACCA 6452 Query 6474 ACCCACTCATCCAAACAACAGCGGTGCGGCCGGTGATTCTGTGGGATGGGCAAATCCGGT 6533 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 6453 ACCCACTCATCCAAACAACAGCGGTGCGGCCGGTGATTCCGTGGGATGGGCAAATCCGGT 6512 Query 6534 GAAGAGGTTAAGGACAGATTCTGGTAAAAGACGGCCTAGCCATTTATAG 6582 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6513 GAAGAGGTTAAGGACAGATTCTGGTAAAAGACGGCCTAGCCATTTATAG 6561 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 255746890560 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5