BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT2G46340.1
Length=3799
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg483787 jgi|Araly1|483787|fgenesh2_kg.4__2847__AT2G46340.1 5400 0.0
> Ahg483787 jgi|Araly1|483787|fgenesh2_kg.4__2847__AT2G46340.1
Length=3665
Score = 5400 bits (2924), Expect = 0.0
Identities = 3462/3712 (93%), Gaps = 75/3712 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 75 AAAGAGATATT-ATATGTAATTATCAATAGTATATGACAAATTTATAGCCTCACctttct 133
||||||| ||| |||| | || ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6 AAAGAGAGATTCATAT-T-ATCATC-A-A-TATATGACAAATTTATAGCCTCACCTTTCT 60
Query 134 tcttcttcttcttct-tcttctgtgtgtttttgaatttgctttcttc-aagaggtttc-t 190
|||||||||| || | || || | || || || | ||||||| || | |
Sbjct 61 TCTTCTTCTT-TT-TGAATT-TG-CT-TTCTTCAA-GAGGTTTCTTCTTCTTGGAACCGT 114
Query 191 tctCCA--CACCGCTTCGGTGTATGATCTGATTGTGAT-CTCTCTCGATATCTGGGATCT 247
| | | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| | || | |
Sbjct 115 T-TGGATTCACCGCTTCGGTTTATGATCTGATTGTGATGAGAT-TCGAT-T-TGTTTTTT 170
Query 248 -T-CGGGGTATGGAGGCTGTAGATTATTATTATTATTACGTGTGGTGCTGATGCAATGAG 305
| |||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||| | || ||| ||| |
Sbjct 171 GTATAAGGTATGGAGGCTGTAG---ATTGTTATCATTCCATGT-G-GC-AATG-AAT--G 221
Query 306 TGTTGATGCCTGTTATGGAAAGAGTAGCTGAAGAAACTGTGGCGACT---AACAACATAC 362
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 222 TG--GATGCCTGCTATGGAAAGAGTAGCTGAAGAAACTGTGGCGAGTAACAACAACATAC 279
Query 363 AATTGAAAGCACGAGTGGATGATGTTCCTTGTAATAAGCTTGATGCTCGTCATAACGATA 422
||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||
Sbjct 280 AATTGAAAGGACGAGTGGATGATGTTCCTTG---TACGCTTGATGCTCTTCATAGTAATA 336
Query 423 TGGTGATTCAATCAGAAACT-GCAAACAGTGATTGTCCTGGAAGCTCAGCTCACAGGAAT 481
|||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 337 TGGTGATTGAATCAGAAACTAG-AAACAGTGACTGTCCTGGAAGCTCAGCTCACAGGAAT 395
Query 482 GTTGATTTGACTAAGCCGCCGCCTCCTGAGGAAGCCGCAGGAGCTAAGCTTTCTGTTGAA 541
|||| ||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||
Sbjct 396 CTTGAGATGACTAAGCCGCCGCCTCCGGAGGAATCTGCTGGAGCTAAGCTTTCTGTTGAA 455
Query 542 GAGTTGACATTGGGGAACTACAGGATTGTTCAAGGGAGTAATAATACTAATGTGGATAGT 601
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||
Sbjct 456 GAGTTGACATTGGGGAACTATAGGATTGTTCAAGGGACTACTACTACTAATATGGATAGT 515
Query 602 CCTAGGGCTGGCAAGTTTGAGCATCTTTATCGT-TTGGCTAGAGGGTCTGCTTTTAGGGC 660
|||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || | |||||
Sbjct 516 TCTAGGGCTGGGAAGTTTGAGCATCTTTATCGTCTT-GCTAGAGGGTCTTCTCTAAGGGC 574
Query 661 AGGAGATGGGGATCTTGATTCTCAACCTCGTGATATGGATCAAATGTTGTCCAGAATCAG 720
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 575 AGGAGATGGGGATCTTGATTCTCAACCTCGTGACATGGATCAAATGTTGTCAAGAATTAG 634
Query 721 ACAACAGCTTGCTGGAGCTCCTTCTGAGAGGCAAAACTTGAAACCTTTTATGTCTAGGAG 780
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 635 ACAACAGCTTGCTGGAGCTCCTTCCGAAAGGCAAAACCTGAAACCTTTTATGACTAGGAG 694
Query 781 GAGCGATCAGAATCTTGAAGCTTTTTCTGAACGTCTAAGAGCAGCTGGTGAGAATAGTAT 840
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 695 GAGCGATCAGAATCTTGAATCTTTTTCTGAACGTCTAAGAGCAGCTGGTGAGAACAGTAT 754
Query 841 TATGAATGCTCCTGCATTGATC---AGTGAAGGTGTCCAAATGAAAACGCCGGTGAGTTC 897
|||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | |
Sbjct 755 TATGAAAGCTCCTGCATTGATCAGTAGTGAAGGTGTCCAATTGAACACGCC--T--G--- 807
Query 898 TTCGAATTTTTCTCAGTTGTTACTTAAAAGAGCTATGAAAGGGAAAGGGGTAGTAGGAAA 957
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 808 -TC-AATTTTTCTCAGTTGTTACTTAAAAGAGCTATGAAGGGGAAAGGGGTAGTAGGAAA 865
Query 958 GAACCAGGAAACTCCTCCTGAATTTGTCTCTGATCAAGATTTAGGAAGCAAGGaaaaaaa 1017
||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 866 GAACCAGGAGTCTCCTCCTGAATTTGTCTCTGACCAAGATTTAGGAAGCAAGGAAAAAAA 925
Query 1018 GTTGGATATTAGCAAGTCGCCTACTCCTCACGATGTGTTACCTCTAAAATCAAGTCCCAA 1077
|||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 926 GTTGGATAGTAGCAAGTCGCCTACTCCTCACCATGTGTTACCCCTAAAATCAAGTCCCAA 985
Query 1078 AGGAAATGGTATGGTATCACATGGTGATGGGAATCATAGTAAATCTTC-TATTGGAATCA 1136
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||
Sbjct 986 AGGAAATGGGATGGTATCACATGGTGATGGGAATCATACTAAATCTTCTTA-TGGAATCA 1044
Query 1137 GTTTGAGGGAGTTTCTTAGATCAAGTTATGCTAAAAGAGAAAAAAGACATGGCCTTTGTC 1196
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1045 GTTTGAGGGAGTTTCTTAGATCAAGTTATGTTAAACGAGAGAAAAGACATGGCCTTTGTC 1104
Query 1197 TATTTAGGCAGCTGGTGGAACTGGTTGACTCAGCCCATTCAAAAAGATTATTCTTGCTAG 1256
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1105 TATTTAGGCAGCTGGTGGAGCTGGTTGACTCAGCCCATTCAAAAGGATTATTCTTGCTAG 1164
Query 1257 ACTTGAGACCATCCCTTTTCACTTTAGTTCCATCAAAGAAACTTAGATATATTGGTAATT 1316
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1165 ACTTGAGACCATCCCTTTTCACTTTAGTTCCATCGAAGAAACTTAGATATATTGGTACTT 1224
Query 1317 TTGGAAAGAACGATCTAGAATCAGATGTTGACGAAGATTTGAATAGGAGGAGGCCTGTTG 1376
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1225 TTGGAAAGAACGATCTAGACTCAGATGTTGACGAAGATTTGAATAGGAGGAGGCCTGTTG 1284
Query 1377 TTGAGGAATCATCTAGTGGAGGTAGGGATTCGAAGAAAAGAAAAATGGACTTGCATTTGA 1436
|| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1285 TTCAGGAATCATCTATTGGAGGTAGGGATTCAAAGAAAAGAAAAATGGACTTGCATGTGC 1344
Query 1437 ATTCTCCAGGGAATCAACTTCAGGCCACTTCAACCGGGCGACCTTTCAAAAGGAAAAGCC 1496
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1345 ATTCTCCAGGGAGTCAACTTCAGGCCACTTCAACCAGGAGACCTTTCAAAAGGAAAAGCC 1404
Query 1497 CTGTGATTGATTTAAACATGGTTGATGCACGTAATCCAGACAGTTGCGAGCTTCAACAGC 1556
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405 CTGTGATTGATTTAAATGTGGTTGATGCACGTAATCCAGACAGTTGCGAGCTTCAACAGC 1464
Query 1557 AAGACTACATAAAAAATTTAAGCGTGTCTTCAGTGTCGAGAAAACAGTCTATGTCCACAT 1616
||||||| || ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465 AAGACTATATCAAAAATTTAAGTGTGTCTTCAATGACGAGAAAACAGTCTATGTCCACAT 1524
Query 1617 GGCTAGAAGAGCAATGGTATACTTGTCCAGAGGAGATAAATGGAGAAGATATTGGAGAAA 1676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |
Sbjct 1525 GGCTAGAAGAGCAATGGTATACTTGTCCAGAGGAGATTAATGGAGAAGATATCGGAGATA 1584
Query 1677 AATCAAATATTTATGCCCTTGGTGTTCTTCTGTTTGAGTTGCTATGCCATTGCGAGTCAG 1736
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1585 AATCAAATATATATGCCCTTGGTGTTCTTCTGTTTGAGTTGCTATGCCATTGCGAGTCCG 1644
Query 1737 GCGAGATGCATGCTGCAATGATGGCAGATTTACGCCATCGGATTCTCCCACCAACATTTC 1796
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1645 GTGAAATGCATGCTGCAATGATGGCAGATTTACGCCATCGGATTCTCCCACCAACATTTC 1704
Query 1797 TCTCGAAATACCCGAAGGAAGCTGGATTTTGTCTTTGGCTTCTACATCCTGAACCCTCCT 1856
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1705 TCTCAAAATACCCGAAGGAAGCTGGATTTTGTCTTTGGCTTCTACATCCTGAACCCTCGT 1764
Query 1857 CCCGACCATCAGCTAGAGATATACTAAAGTCAGAGTTGATATGCGAGGATGATTCAGTTA 1916
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765 CCCGACCAACAGCTAGAGATATACTGAAGTCAGAGTTGATATGCGAGGATGATTCAGTTA 1824
Query 1917 AATCGACTGCTGCTGCTGAGGAGATATCTGAGCTGTTACTTCATTTTTTGTCTTCAT-TA 1975
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 1825 AATCGACTGCTGCTGCTGAGGAGATATCTGAGCTCTTACTTCATTTTTTGTCTTC-TCTA 1883
Query 1976 GAAGTGCAGAAGAAGAAAAAAGCATCTAAACTTTTGCAAGATATCCAGACCTTAGAGGAT 2035
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1884 GAAGTGCAGAAGCAGAAAAAAGCATCTAAGCTTTTGCAAGACATCCAGACCTTAGAGGAT 1943
Query 2036 GATATTAAGGAGGCCGAGCGAAGATATTCTTCAAATGTATCTCTGGTGAGATCTCATGGA 2095
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1944 GATATCAAGGAGGCCGAGCGAAGATATTCTTCAAATGTATCTCTGGTGAGATCTCATGGA 2003
Query 2096 GCTATTGAAAAAAGGGTGCAATCATCTCCCCTAGACGAGCACTGTACAACTTCCAGTGCC 2155
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |
Sbjct 2004 GCTATTGAAAGAAGGGTGCAATCATCTCCCCTAGACGAGCACTGTACAACTTCTGGCGTC 2063
Query 2156 TTGTTTGTACCAACTGCTAATACAGACAGGCTGATGAGTAATATCCGTCAACTTGAAGAT 2215
||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2064 TTGCTTGTACCAAGTGCTAATACAGACAGGCTGATGAGTAATATCCGTCAACTTGAAGAT 2123
Query 2216 GCATATTTTTTCATGCGATCACAAATCAACTTATCGAGTTCTGCTGCTACTGCCCGTTCT 2275
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 2124 GCATATTTCTTCATGCGATCACAAATCAACTTGTCGAGTTCTGCTGCTAGTACCCGTTCT 2183
Query 2276 GACAAAA---CACTAAAGGACAGGGACAGATGCTCTGAAAACCAAAATGAAAATCAGGAT 2332
|| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2184 GAAAAAATTGTACTAAAGGACAGGGACAGATGCTCTGAAAACCAAAATGAAAATCAGTTT 2243
Query 2333 ATGAGTACCAAAGGAAAATCTTCAGATCAACTCGAAGTGTTTTTCGAGGGGTTGTGCAAA 2392
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2244 ATGAGTACCAAAGGAAAATCTTCAGATCAACTGGAAGTGTTTTTCGAGGGGTTGTGCAAA 2303
Query 2393 TTTGCTCGGTATAGCAAGTTCGAAACCTGTGGGACAATAAGAAGTGGGGACCTTTTAAAC 2452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2304 TTTGCTCGGTATAGCAAGTTCGAAACCTGTGGGACAATAAGAAGTGGGGACCTTTTAAAC 2363
Query 2453 TCTGCAAGTGTGGTCTGCTCGTTGAGTTTTGACCCTGATGAAGAACACATAGCAGCAGCT 2512
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2364 TCTGCAAGTGTGGTCTGCTCATTGAGTTTTGACCCTGATGAGGAACACATAGCAGCAGCT 2423
Query 2513 GGGATATCAAAGAAGATCAAGATTTTTGACTTCAATGCATTTATGAATGAATCTGTCGGT 2572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2424 GGGATATCAAAGAAGATCAAGATTTTTGACTTCAATGCATTTATGAATGAATCTGTCGGT 2483
Query 2573 GTTCATTATCCACTAGTAGAGATGGTCAACAAATCTAAATTAAGCTGTGTTTGCTGGAAT 2632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2484 GTTCATTATCCACTAGTAGAGATGGTCAACAAATCTAAATTAAGCTGTGTTTGCTGGAAT 2543
Query 2633 AGCTACATCAAAAACTACTTGGCCTCGACTGACTACGATGGTGTAGTTCAGATATGGGAT 2692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2544 AGCTACATCAAAAACTACTTGGCCTCGACTGACTACGATGGTGTAGTTCAGATTTGGGAT 2603
Query 2693 GCCGGCACTGGACAAGGATTTTCGCAGTACACAGAACACCAGAAGAGAGCCTGGTCAGTT 2752
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 2604 GCCGGGACTGGACAAGGATTTTCGCAGTACACCGAACACCAAAAGAGAGCATGGTCAGTT 2663
Query 2753 GATTTTTCTCCATCTGACCCGACAAAATTTGTTAGTGGAAGTGATGACTGCTCGGTGAAG 2812
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2664 GATTTTTCTCCATCTGACCCGACAAAATTTGTCAGTGGAAGTGATGACTGCACGGTGAAA 2723
Query 2813 CTTTGGAGCATCAATGAGAAACGTTCATTAGGCACAATCTGGAGTCCAGCAAATGTGTGT 2872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2724 CTTTGGAGCATCAATGAGAAACGTTCATTAGGCACAATCTGGAGTCCAGCAAATGTGTGT 2783
Query 2873 TGCGTGCAATTCTCTTCTTATTCCAATCACTTATTGGCATTTGGGTCAGCTGATTACAAG 2932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2784 TGCGTGCAATTCTCTTCTTATTCCAATCACTTATTGGCATTTGGGTCAGCTGATTACAAG 2843
Query 2933 GTCTATTGCTATGACCTTCGGTATGTCAAAACACCTTGGTGCACATTGGCTGGTCATGAG 2992
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2844 GTCTATTGCTATGATCTTCGGTATGTCAAAACACCTTGGTGCACATTGGCTGGTCATGAG 2903
Query 2993 AAAGCGGTGAGTTATGTTAAATTTATGGATTCAGAAACCATTGTTTCTGCTTCCACTGAT 3052
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2904 AAAGCAGTGAGTTATGTTAAATTTATGGATTCAGAAACCATTGTTTCTGCTTCCACTGAT 2963
Query 3053 AACTCTCTCAAGCTTTGGAATCTTAACAAGACAAATTCCTCTGGTTTATCTCCTGGTGCT 3112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2964 AACTCTCTCAAGCTTTGGAATCTTAACAAGACAAATTCCTCTGGTTTATCTCCTGGTGCT 3023
Query 3113 TGTTCATTGACATATAAAGGACATACAAATCAGAAGAATTTCGTTGGATTGTCGGTTTTG 3172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 3024 TGTTCATTGACATATAAAGGACATACAAATCAGAAGAATTTTGTCGGATTGTCGGTTTTG 3083
Query 3173 GACGGATACATAGCTTGTGGTTCAGAGACCAATGAGGTATATAGTTACTATAAATCTTTA 3232
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3084 GACGGGTACATAGCTTGTGGTTCAGAGACCAATGAGGTATATAGTTACTATAAATCCTTA 3143
Query 3233 CCGATGCCAATGACTTCATACAAGTTTGGATCCGTCGATCCCATTTCTGGAAACGAATAC 3292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3144 CCGATGCCAATGACTTCATACAAGTTTGGATCCGTCGATCCCATTTCTGGAAACGAATAC 3203
Query 3293 TTTGATGACAATGGACAGTTTGTGTCGAGCGTCTGTTGGAGGAAAAAATCGAATATGCTT 3352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3204 TTTGATGACAATGGACAGTTTGTGTCGAGCGTCTGTTGGAGGAAAAAATCGAATATGCTT 3263
Query 3353 GTAGCTGCAAACTCTACTGGAAACATGAAGCTACTAAAACTTGTTTGACAACTTGGCCTT 3412
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3264 GTAGCTGCAAACTCTACTGGAAACATGAAGCTGCTAAAACTTGTTTGACAACTTGGCGTC 3323
Query 3413 TTCGCTACTACTGCGGGCATTGGACTTTTTGAGTCTGAAACTAGGACAAAGCAGGTCTGA 3472
||| ||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||
Sbjct 3324 TTCACTACTAC-G-GG-CATTGGACTCTTTGAGTCTGAAACTAGGACAAACCAGTT-TGA 3379
Query 3473 CTTTGAAGCAAACGTTTTTGTCCTGGAAACTATGATCCCATATGACCAGAAGAGaaaaaa 3532
|||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 3380 CTTTGAAG-AAACGTTTTTGTCCTGGAAATTA-GATCCTATATGACCAGAACAGAAAAAA 3437
Query 3533 aG-TTCGAAATCTTGGAGAAGTTGAAGAAGCAAAACTGTCTGTGATAATATATTATTTGA 3591
| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||
Sbjct 3438 AAATT-GAAATCTTAGAGAAGTTGAAGAAGCAAAACTGTCTGTGGTAATAT-T-ATTTGA 3494
Query 3592 TTCTTCTTCCTGTAATTCTATATATATGAGATATAATTTGAGATAAACTTCTCAGATTCT 3651
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3495 TTCTTCTTCCTGTAATCCTATACATATGAGATATAATTTGAGATAA-CTTCTCAGATTCT 3553
Query 3652 TCAGAAATGATTCATATTTGGTCGGCATAACGTGTAATGATGAGAGGTATATAACTTGTA 3711
|||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3554 TCAGAAGTGATTCAGATTTGGTCGGCATAATGTGTAATGATGAGAGGTATATAACTTGTA 3613
Query 3712 CAAGTGTGTTATATCGTTAGCTCGGTTATGTAATTGTTGTTGGAGATTCTCT 3763
||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3614 CAAGTGTGTTATATCATTAGCTCAATTATGTAATTGTTGTTGGAGATTCTCT 3665
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 143553165356
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5