BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT2G47940.1 Length=2278 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg497185 jgi|Araly1|497185|fgenesh2_kg.39__5__AT2G47940.1 3247 0.0 Ahg483986 jgi|Araly1|483986|fgenesh2_kg.4__3046__AT2G47940.2 3234 0.0 > Ahg497185 jgi|Araly1|497185|fgenesh2_kg.39__5__AT2G47940.1 Length=2182 Score = 3247 bits (1758), Expect = 0.0 Identities = 2071/2213 (94%), Gaps = 57/2213 (3%) Strand=Plus/Plus Query 51 tctctctcGCCGGCCGATATGGCCGCCTCCGTAGCAAACTGCTGCTTCTCCGTCCTCAAT 110 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1 TCTCTCTCGCCGGCCGATATGGCCGTCTCCGTAGCAAACTGCAGCTTCTCCGTCCTCAAT 60 Query 111 GCCTCCGTTAAAATTCAATCTTCGTCCATCTCCTCACCGTGGTGTTTCGT-GTCCGCATC 169 |||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct 61 GCCTCCGTTAAACTTCAATCTTCATGCGTCTCCTCACCGTGGTGTTTCGTAG-CCGCATC 119 Query 170 GTCGTTGACTCCCCG-AGCTTCCTCCAATATTAAGAGGAAATCGTCGAGGTCTGATTCAC 228 || || | || || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 120 -TC--AGA-----AGAAG--TCGTTGAATCTTAAGAGGAAATCGTCGAGGTCTGATTCAT 169 Query 229 CATCTCCTATATTAAACCCAGAGAAGAATTACCCAGGTAGAGTTCGAGATGAAAGTTCCA 288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| Sbjct 170 CATCTCCTATATTAAACCCAGAGAAGAATTACCCAGGTAGAGTTCGAGATGATAGTCCCA 229 Query 289 ATCCTCCTCAAAAAATGGCTTTCAAGGCTTTTGGGTCACCCAAAAAGGAGAAAAAAGAGT 348 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 230 ATCCTCCTCAAAAAATGGCTTTCAAGGCCTTTGGGTCACCAAAAAAGGAGAAAAAAGAGC 289 Query 349 CTCTTTCTGATTTTAGTCGAGACCAACAGACTGATCCTGCCAAGATTCACGATGCATCCT 408 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct 290 CTCTCTCTGATTTTAGTCGAGACCAACAGACTGATCCTGGCAAGATTCACGATGCATCTT 349 Query 409 TTCTCAACGCTG-TTGTC--AA-G----G-TTTATTGC-AC-TC-A-TACTGCT-CCTGA 454 |||||||||||| || || || | | ||| || | | || | |||| || | || Sbjct 350 TTCTCAACGCTGTTTTTCGTAATGAATTGCTTTCTT-CTTCTTCAATTACT-CTGCTTGC 407 Query 455 TTACTCCCTCCCATG-GC-AGAAGCAAAGGCAATTTA-CTAGTACTGGAA-G---TGCTT 507 || || ||| | || | | |||||||| |||| | |||| ||||||| | ||||| Sbjct 408 TT-CTTCCTTCTTTGAACTACAAGCAAAGACAATGGAGCTAGCACTGGAAGGCATTGCTT 466 Query 508 TTATGATTGGAGATGGCAAGCTCTTGACCAATGCCCATTGTGTCGAACACGATACACAGG 567 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 467 TTATGATTGGAGATGGCAAGCTCTTGACTAATGCCCATTGTGTCGAACATGATACACAGG 526 Query 568 TTAAAGTTAAGAGAAGGGGAGATGATCGAAAGTATGTGGCTAAGGTTTTAGTTAGGGGTG 627 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 527 TTAAAGTTAAGAGAAGGGGAGATGATCGAAAGTATGTGGCTAAGGTTTTAGTAAGGGGTG 586 Query 628 TGGACTGTGACATTGCTTTGCTTTCCGTAGAAAGCGAGGATTTCTGGAAAGGAGCTGAAC 687 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 587 TGGACTGTGACATAGCTTTGCTTTCCGTAGAAAGCGAGGATTTCTGGAAAGGAGCTGAAC 646 Query 688 CACTACGGCTGGGCCATTTACCCCGCCTTCAGGATTCAGTTACTGTCGTGGGATATCCTC 747 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 647 CACTGCGGCTGGGCCATTTACCCCGCCTTCAGGATTCAGTAACTGTCGTGGGATATCCTC 706 Query 748 TTGGAGGAGATACAATCTCTGTTACAAAAGGGGTTGTATCACGTATAGAGGTAACATCTT 807 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 707 TTGGAGGAGATACAATCTCTGTTACAAAAGGGGTTGTATCACGTATAGAGGTAACATCAT 766 Query 808 ACGCTCATGGATCATCCGACTTGCTTGGAATTCAAATCGACGCTGCTATAAATCCAGGGA 867 | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 767 ATGCTCATGGATCATCTGACTTGCTTGGAATTCAAATCGACGCTGCAATAAATCCAGGGA 826 Query 868 ATAGTGGTGGCCCTGCATTCAACGACCAGGGGGAATGTATTGGAGTAGCATTCCAGGTTT 927 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 827 ATAGTGGTGGCCCTGCATTCAACGACCAGGGGGAATGTATTGGAGTAGCATTCCAGGTTT 886 Query 928 ACAGATCCGAAGAAACTGAAAATATTGGATATGTGATTCCAACAACCGTTGTTTCTCACT 987 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 887 ACAGATCCGAAGAAACTGAAAATATTGGATATGTAATTCCAACAACCGTTGTTTCTCACT 946 Query 988 TTTTGACTGATTATGAGAGGAACGGAAAGTACACTGGTTACCCTTGCCTTGGAGTATTGC 1047 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 947 TTTTGACTGATTATGAGAGGAACGGAAAGTACACTGGTTACCCTTGCCTTGGAGTGTTGC 1006 Query 1048 TGCAGAAATTAGAAAATCCAGCTCTGCGGGAGTGCCTCAAAGTTCCTACAAATGAGGGGG 1107 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1007 TGCAGAAATTAGAAAATCCAGCTCTGCGGGAGTGCCTCAAAGTTCCTACAAATGAGGGGG 1066 Query 1108 TTCTGGTGCGAAGAGTTGAACCTACATCTGATGCAAGTAAAGTCCTGAAAGAGGGAGATG 1167 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1067 TACTGGTGCGAAGAGTTGAACCTACATCTGATGCAAGTAAAGTCCTGAAAGAGGGAGATG 1126 Query 1168 TGATTGTAAGTTTTGATGATCTACATGTGGGATGTGAAGGAACTGTACCCTTCCGATCTA 1227 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1127 TGATTGTAAGTTTTGATGATCTACATGTGGGATGTGAAGGAACTGTACCCTTCCGATCCA 1186 Query 1228 GTGAACGCATTGCATTCCGTTATCTCATCAGTCAAAAATTTGCAGGTGATATCGCTGAGA 1287 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1187 GTGAACGCATTGCATTCCGTTATCTCATCAGTCAAAAATTTGCAGGTGATATCGCTGAGC 1246 Query 1288 TTGGTATCATTAGAGCAGGAGAACATAAGAAAGTTCAAGTAGTTCTAAGGCCACGAGTGC 1347 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1247 TTGGTATCATTAGAGCAGGAGAACATAAGAAAGTTCAAGTAGTTCTAAGACCACGAGTGC 1306 Query 1348 ACCTGGTACCGTACCATATTGATGGAGGTCAGCCATCATACATTATAGTTGCTGGTTTGG 1407 ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1307 ACCTGGTACCGTATCATATTGATGGAGGTCAACCATCATACATTATTGTTGCTGGTTTGG 1366 Query 1408 TGTTTACTCCGCTCTCAGAACCCCTGATAGAGGAGGAGTGTGAGGATACCATAGGCTTGA 1467 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1367 TGTTTACTCCGCTCTCAGAACCCCTGATAGAGGAGGAGTGTGAGGATACCATAGGCTTGA 1426 Query 1468 AATTGTTAACAAAGGCACGCTACTCTGTGGCAAGGTTCAGAGGAGAACAAATCGTCATCC 1527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1427 AATTGTTAACAAAGGCACGCTACTCTGTGGCAAGGTTCAGAGGAGAACAAATCGTCATCC 1486 Query 1528 TATCACAGGTATTGGCAAATGAAGTAAACATCGGCTATGAGGACATGAATAACCAGCAGG 1587 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1487 TATCACAGGTCTTGGCAAATGAAGTAAACATCGGCTATGAGGACATGAATAACCAACAGG 1546 Query 1588 TCCTGAAGTTCAATGGAATTCCAATAAGAAACATCCATCACTTGGCACATCTCATTGATA 1647 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1547 TCCTGAAGTTCAATGGAATTCCTATAAGAAACATCCATCACTTGGCACATCTCATTGACA 1606 Query 1648 TGTGCAAAGATAAGTATCTAGTTTTTGAGTTCGAAGACAACTATGTTGCTGTGTTGGAGA 1707 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1607 TGTGCAAAGATAAGTATCTCGTTTTTGAGTTTGAAGACAACTATGTTGCTGTGTTGGAGA 1666 Query 1708 GGGAAGCTTCAAATTCTGCTTCCTTGTGCATCCTCAAAGATTATGGAATTCCCTCGGAAA 1767 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1667 GAGAAGCTTCAAATTCTGCTTCCTTGTGCATCCTCAAAGATTATGGAATTCCCTCGGAAA 1726 Query 1768 GATCCGCTGATCTGCTCGAGCCATATGTTGATCCAATAGATGACACCCAAGCGCTTGACC 1827 |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1727 GATCTGCTGATCTGCTCGAGCCATATGTAGATCCAATAGATGACACCCAAGCGCTTGACC 1786 Query 1828 AAGGTATTGGAGACAGCCCTGTGTCAAATCTGGAAATCGGCTTTGATGGACTGGTGTGGG 1887 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1787 AAGGTATTGGAGACAGCCCTGTGTCAAATCTGGAAATCGGCTTTGATGGACTGGTGTGGG 1846 Query 1888 CATAAAATATTCGAAAA-GGCGTCCGCAGATGGAAACCACTGAAAGCTCATACAGCTTCC 1946 |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1847 CATAAA-TGTTCAAAAAAGGCGTCCGCAGATGGAAGCCACAGAAAGCTCATACAGCTTCC 1905 Query 1947 CCGAACATATGGGAAAGCTTTCAGCTTCATCCTCATTCATAAGGTCTTGTGCTGCTCAAA 2006 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct 1906 CCGAATTTATGGGAAAGCTTTCAGCTTTATCCTCATTCAGAAGGTCTTGAGCTGCTC--- 1962 Query 2007 CTCAAAGTTTAGTGAATTCTTTCTTCTTTATTCAAACCTCTATGGATTGAGTTTAATAGA 2066 | || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1963 C--AA-GTTTAGTGAATTCTTTCTTC---A---AAACCTCTAGGGATTGAGTTTAATAGA 2013 Query 2067 AAGTTGGCCATGAGAATGCTCGGCCATTGTGTTCAGATGAATGTATACTGCTAAAAGCAT 2126 ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2014 AAGTTTGCCATGAGAATGCTTGACCATTGTGTGCAGATGAATGTA--CTGCTAAAAGCAT 2071 Query 2127 TGCCAGAATCTCGACAAAA-GTCAACAAATTATTCAGTGTCTGATT-TTCTATGAGAAAA 2184 ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||| Sbjct 2072 TGCCAGAATCTTGACAAAAAGTCAACAAATTATGCAATGTCTGATTATT-TATGAGAAA- 2129 Query 2185 TGAAATGCAGCAATGTCTTCTGTGACTGTAatatatatatatatatatatata 2237 |||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2130 TGAAATCCAGCAATGTCTTCTGTAACAGAAATATATATATATATATATATATA 2182 > Ahg483986 jgi|Araly1|483986|fgenesh2_kg.4__3046__AT2G47940.2 Length=2156 Score = 3234 bits (1751), Expect = 0.0 Identities = 2036/2164 (94%), Gaps = 57/2164 (3%) Strand=Plus/Plus Query 51 tctctctcGCCGGCCGATATGGCCGCCTCCGTAGCAAACTGCTGCTTCTCCGTCCTCAAT 110 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 19 TCTCTCTCGCCGGCCGATATGGCCGTCTCCGTAGCAAACTGCAGCTTCTCCGTCCTCAAT 78 Query 111 GCCTCCGTTAAAATTCAATCTTCGTCCATCTCCTCACCGTGGTGTTTCGT-GTCCGCATC 169 |||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct 79 GCCTCCGTTAAACTTCAATCTTCATGCGTCTCCTCACCGTGGTGTTTCGTAG-CCGCATC 137 Query 170 GTCGTTGACTCCCCG-AGCTTCCTCCAATATTAAGAGGAAATCGTCGAGGTCTGATTCAC 228 || || | || || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 138 -TC--AGA-----AGAAG--TCGTTGAATCTTAAGAGGAAATCGTCGAGGTCTGATTCAT 187 Query 229 CATCTCCTATATTAAACCC--AG----AGAAGAATTACCCAGGTAGAGTTCGAGATGAAA 282 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 188 CATCTCCTATATTAAACCCAGAGACCCAGAAGAATTACCCAGGTAGAGTTCGAGATGATA 247 Query 283 GTTCCAATCCTCCTCAAAAAATGGCTTTCAAGGCTTTTGGGTCACCCAAAAAGGAGAAAA 342 || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 248 GTCCCAATCCTCCTCAAAAAATGGCTTTCAAGGCCTTTGGGTCACCAAAAAAGGAGAAAA 307 Query 343 AAGAGTCTCTTTCTGATTTTAGTCGAGACCAACAGACTGATCCTGCCAAGATTCACGATG 402 ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | Sbjct 308 AAGAGCCTCTCTCTGATTTTAGTCGAGACCAACAGACTGATCCTGGCAAGATTCACGACG 367 Query 403 CATCCTTTCTCAACGCTGTTGTCAAGGTTTATTGCACTCATACTGCTCCTGATTACTCCC 462 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 368 CATCTTTTCTCAACGCTGTTGTCAAGGTTTATTGCACTCATACTGCGCCTGATTACTCCC 427 Query 463 TCCCATGGCAGAAGCAAAGGCAATTTACTAGTACTGG-A---A-G--------------- 502 ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | | | Sbjct 428 TCCCATGGCAGAAGCAAAGACAATTTACTAGCACTGGAAGGCATGTTTTTTTTATTCACA 487 Query 503 -TGCTTTTATGATTGGAGATGGCAAGCTCTTGACCAATGCCCATTGTGTCGAACACGATA 561 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct 488 TTGCTTTTATGATTGGAGATGGCAAGCTCTTGACTAATGCCCATTGTGTCGAACATGATA 547 Query 562 CACAGGTTAAAGTTAAGAGAAGGGGAGATGATCGAAAGTATGTGGCTAAGGTTTTAGTTA 621 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 548 CACAGGTTAAAGTTAAGAGAAGGGGAGATGATCGAAAGTATGTGGCTAAGGTTTTAGTAA 607 Query 622 GGGGTGTGGACTGTGACATTGCTTTGCTTTCCGTAGAAAGCGAGGATTTCTGGAAAGGAG 681 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 608 GGGGTGTGGACTGTGACATAGCTTTGCTTTCCGTAGAAAGCGAGGATTTCTGGAAAGGAG 667 Query 682 CTGAACCACTACGGCTGGGCCATTTACCCCGCCTTCAGGATTCAGTTACTGTCGTGGGAT 741 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 668 CTGAACCACTGCGGCTGGGCCATTTACCCCGCCTTCAGGATTCAGTAACTGTCGTGGGAT 727 Query 742 ATCCTCTTGGAGGAGATACAATCTCTGTTACAAAAGGGGTTGTATCACGTATAGAGGTAA 801 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 728 ATCCTCTTGGAGGAGATACAATCTCTGTTACAAAAGGGGTTGTATCACGTATAGAGGTAA 787 Query 802 CATCTTACGCTCATGGATCATCCGACTTGCTTGGAATTCAAATCGACGCTGCTATAAATC 861 |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 788 CATCATATGCTCATGGATCATCTGACTTGCTTGGAATTCAAATCGACGCTGCAATAAATC 847 Query 862 CAGGGAATAGTGGTGGCCCTGCATTCAACGACCAGGGGGAATGTATTGGAGTAGCATTCC 921 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 848 CAGGGAATAGTGGTGGCCCTGCATTCAACGACCAGGGGGAATGTATTGGAGTAGCATTCC 907 Query 922 AGGTTTACAGATCCGAAGAAACTGAAAATATTGGATATGTGATTCCAACAACCGTTGTTT 981 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 908 AGGTTTACAGATCCGAAGAAACTGAAAATATTGGATATGTAATTCCAACAACCGTTGTTT 967 Query 982 CTCACTTTTTGACTGATTATGAGAGGAACGGAAAGTACACTGGTTACCCTTGCCTTGGAG 1041 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 968 CTCACTTTTTGACTGATTATGAGAGGAACGGAAAGTACACTGGTTACCCTTGCCTTGGAG 1027 Query 1042 TATTGCTGCAGAAATTAGAAAATCCAGCTCTGCGGGAGTGCCTCAAAGTTCCTACAAATG 1101 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1028 TGTTGCTGCAGAAATTAGAAAATCCAGCTCTGCGGGAGTGCCTCAAAGTTCCTACAAATG 1087 Query 1102 AGGGGGTTCTGGTGCGAAGAGTTGAACCTACATCTGATGCAAGTAAAGTCCTGAAAGAGG 1161 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1088 AGGGGGTACTGGTGCGAAGAGTTGAACCTACATCTGATGCAAGTAAAGTCCTGAAAGAGG 1147 Query 1162 GAGATGTGATTGTAAGTTTTGATGATCTACATGTGGGATGTGAAGGAACTGTACCCTTCC 1221 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1148 GAGATGTGATTGTAAGTTTTGATGATCTACATGTGGGATGTGAAGGAACTGTACCCTTCC 1207 Query 1222 GATCTAGTGAACGCATTGCATTCCGTTATCTCATCAGTCAAAAATTTGCAGGTGATATCG 1281 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1208 GATCCAGTGAACGCATTGCATTCCGTTATCTCATCAGTCAAAAATTTGCAGGTGATATCG 1267 Query 1282 CTGAGATTGGTATCATTAGAGCAGGAGAACATAAGAAAGTTCAAGTAGTTCTAAGGCCAC 1341 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1268 CTGAGCTTGGTATCATTAGAGCAGGAGAACATAAGAAAGTTCAAGTAGTTCTAAGACCAC 1327 Query 1342 GAGTGCACCTGGTACCGTACCATATTGATGGAGGTCAGCCATCATACATTATAGTTGCTG 1401 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct 1328 GAGTGCACCTGGTACCGTATCATATTGATGGAGGTCAACCATCATACATTATTGTTGCTG 1387 Query 1402 GTTTGGTGTTTACTCCGCTCTCAGAACCCCTGATAGAGGAGGAGTGTGAGGATACCATAG 1461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1388 GTTTGGTGTTTACTCCGCTCTCAGAACCCCTGATAGAGGAGGAGTGTGAGGATACCATAG 1447 Query 1462 GCTTGAAATTGTTAACAAAGGCACGCTACTCTGTGGCAAGGTTCAGAGGAGAACAAATCG 1521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1448 GCTTGAAATTGTTAACAAAGGCACGCTACTCTGTGGCAAGGTTCAGAGGAGAACAAATCG 1507 Query 1522 TCATCCTATCACAGGTATTGGCAAATGAAGTAAACATCGGCTATGAGGACATGAATAACC 1581 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1508 TCATCCTATCACAGGTCTTGGCAAATGAAGTAAACATCGGCTATGAGGACATGAATAACC 1567 Query 1582 AGCAGGTCCTGAAGTTCAATGGAATTCCAATAAGAAACATCCATCACTTGGCACATCTCA 1641 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1568 AACAGGTCCTGAAGTTCAATGGAATTCCTATAAGAAACATCCATCACTTGGCACATCTCA 1627 Query 1642 TTGATATGTGCAAAGATAAGTATCTAGTTTTTGAGTTCGAAGACAACTATGTTGCTGTGT 1701 |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1628 TTGACATGTGCAAAGATAAGTATCTCGTTTTTGAGTTTGAAGACAACTATGTTGCTGTGT 1687 Query 1702 TGGAGAGGGAAGCTTCAAATTCTGCTTCCTTGTGCATCCTCAAAGATTATGGAATTCCCT 1761 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1688 TGGAGAGAGAAGCTTCAAATTCTGCTTCCTTGTGCATCCTCAAAGATTATGGAATTCCCT 1747 Query 1762 CGGAAAGATCCGCTGATCTGCTCGAGCCATATGTTGATCCAATAGATGACACCCAAGCGC 1821 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1748 CGGAAAGATCTGCTGATCTGCTCGAGCCATATGTAGATCCAATAGATGACACCCAAGCGC 1807 Query 1822 TTGACCAAGGTATTGGAGACAGCCCTGTGTCAAATCTGGAAATCGGCTTTGATGGACTGG 1881 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1808 TTGACCAAGGTATTGGAGACAGCCCTGTGTCAAATCTGGAAATCGGCTTTGATGGACTGG 1867 Query 1882 TGTGGGCATAAAATATTCGAAAA-GGCGTCCGCAGATGGAAACCACTGAAAGCTCATACA 1940 |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct 1868 TGTGGGCATAAA-TGTTCAAAAAAGGCGTCCGCAGATGGAAGCCACAGAAAGCTCATACA 1926 Query 1941 GCTTCCCCGAACATATGGGAAAGCTTTCAGCTTCATCCTCATTCATAAGGTCTTGTGCTG 2000 ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct 1927 GCTTCCCCGAATTTATGGGAAAGCTTTCAGCTTTATCCTCATTCAGAAGGTCTTGAGCTG 1986 Query 2001 CTCAAACTCAAAGTTTAGTGAATTCTTTCTTCTTTATTCAAACCTCTATGGATTGAGTTT 2060 ||| | || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| Sbjct 1987 CTC---C--AA-GTTTAGTGAATTCTTTCTTC---A---AAACCTCTAGGGATTGAGTTT 2034 Query 2061 AATAGAAAGTTGGCCATGAGAATGCTCGGCCATTGTGTTCAGATGAATGTATACTGCTAA 2120 ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||| Sbjct 2035 AATAGAAAGTTTGCCATGAGAATGCTTGACCATTGTGTGCAGATGAATGTA--CTGCTAA 2092 Query 2121 AAGCATTGCCAGAATCTCGACAAAA-GTCAACAAATTATTCAGTGTCTGATTTTCTATGA 2179 ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| Sbjct 2093 AAGCATTGCCAGAATCTTGACAAAAAGTCAACAAATTATGCAATGTCTGATTTTTTATGA 2152 Query 2180 GAAA 2183 |||| Sbjct 2153 GAAA 2156 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 85779231740 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5