BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G03720.1 Length=2664 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg340533 jgi|Araly1|340533|fgenesh1_pg.C_scaffold_3000296 2689 0.0 Ahg952171 jgi|Araly1|952171|scaffold_43500001.1 931 0.0 Ahg927928 jgi|Araly1|927928|scaffold_300385.1 595 5e-169 Ahg918707 jgi|Araly1|918707|Al_scaffold_0492_2 363 5e-99 Ahg927883 jgi|Araly1|927883|scaffold_300340.1 255 9e-67 Ahg927846 jgi|Araly1|927846|scaffold_300303.1 228 2e-58 > Ahg340533 jgi|Araly1|340533|fgenesh1_pg.C_scaffold_3000296 Length=1914 Score = 2689 bits (1456), Expect = 0.0 Identities = 1540/1581 (97%), Gaps = 4/1581 (0%) Strand=Plus/Plus Query 604 ATGAACAGTCTTGTGAGAAGAAAACAAGTTGATTCTGTTCATCTTATCAAAAACGATGGA 663 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1 ATGAACAGTCTTGTCAGAAGGAAACAAGTTGATTCTGTTCATCTGATCAAAAACGATGGA 60 Query 664 CCTCATCAGCTTGCCAAGAAACTATCCGCCGTTGATCTTGTTGCTATTGGAGTTGGGACA 723 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 61 CCTCATCAGCTTGCCAAGAAACTATCCGCCGTTGATCTTGTCGCTATTGGAGTTGGGACA 120 Query 724 ACAATTGGAGCAGGAGTGTATATTCTTGTGGGAACGGTAGCTAGAGAGCACACAGGACCT 783 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 ACAATTGGAGCAGGAGTGTATATTCTTGTGGGAACAGTAGCTAGAGAGCACACAGGACCT 180 Query 784 GCTCTTGCTGTATCATTCTTCATTGCTGGAGTAGCTGCTGCTCTCTCTGCCTGTTGTTAT 843 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 181 GCTCTTGCTGTATCATTCTTCATTGCTGGTGTAGCTGCTGCTCTCTCGGCCTGTTGTTAT 240 Query 844 GCTGAGCTTGCTTCTCGTTGTCCATCTGCTGGGAGTGCTTATCATTATGCGTACATTTGT 903 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| Sbjct 241 GCTGAGCTTGCTTCTCGTTGTCCATCTGCTGGGAGTGCTTATCATTATGCATACATATGT 300 Query 904 CTTGGAGAAGGGATTGCTTGGTTGGTTGGTTGGGCACTGGTGTTGGATTATACAATTGGT 963 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CTTGGAGAAGGGATTGCTTGGTTGGTTGGTTGGGCGCTGGTGTTGGATTATACAATTGGT 360 Query 964 GGATCAGCCATTGCCCGTGGCATAACTCCAAATCTGGCATCtttttttGGTGGTTTGGAC 1023 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 361 GGATCAGCCATTGCCCGTGGCATAACTCCAAATCTGGCATCATTTTTTGGTGGTTTGGAC 420 Query 1024 AATCTTCCTGTGTTCTTAGCTCGACAAACTATACCCGGGGTTGGTATTGTGGTTGATCCA 1083 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 AAACTTCCTGTGTTCTTAGCTCGACAAACTATACCCGGGGTTGGTATTGTGGTTGATCCA 480 Query 1084 TGTGCTGCACTTTTGATTATGATTGTCACGATACTACTATGTTTTGGGATAAAGGAGAGT 1143 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TGTGCAGCACTTTTGATTATGATTGTCACGATACTACTATGTTTTGGGATAAAGGAGAGT 540 Query 1144 TCAACAGTACAAGCAATTGTAACATCAGTGAATGTTTGCACCTTGGTTTTCATCATAGTA 1203 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 TCATTAGTACAAGCAATTGTAACATCAGTGAATGTTTGCACCTTGGTTTTCATCATAGTA 600 Query 1204 GTTGGTGGATATTTAGCTTGCAAGACTGGATGGGTTGGATATGATCTCCCCAGTGGGTAC 1263 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct 601 GTTGGTGGATATTTAGCTTGCAAGACCGGATGGGTTGGATATGATCTTCCGAGTGGGTAT 660 Query 1264 TTTCCTTTTGGACTAAATGGGATACTTGCCGGATCTGCTGTAGTATTCTTCTCATACATT 1323 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 661 TTTCCTTTTGGACTAAATGGGATACTTGCCGGATCTGCTATAGTATTCTTCTCATACATT 720 Query 1324 GGATTTGATACTGTAACTAGTACGGCTGAGGAGGTGAAAAATCCTCAAAGGGATCTTCCA 1383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 GGATTTGATACTGTAACTAGTACGGCTGAGGAGGTGAAAAATCCTCAAAGGGATCTTCCA 780 Query 1384 TTGGGAATCGGGATTGCATTACTGATATGCTGCATTTTGTATATGCTTTTATCAGTAGTT 1443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TTGGGAATCGGGATTGCATTACTGATATGCTGCATTTTATATATGCTTTTATCAGTAGTT 840 Query 1444 ATTGTTGGATTGGTCCCATACTATTCATTGAATCCTGATACTCCTATCTCCTCTGCATTT 1503 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 ATTGTTGGATTAGTCCCATACTATTCATTGAATCCTGATACTCCTATCTCCTCTGCATTT 900 Query 1504 GGAGACAGTGGGATGCAATGGGCAGCGTACATCTTAACCACTGGGGCAATAACTGCTCTA 1563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 GGAGACAGTGGGATGCAATGGGCAGCGTACATCTTAACCACTGGGGCAATAACTGCTCTA 960 Query 1564 TGTGCGAGTTTGTTGGGTTCCCTTCTGGCTCAGCCACGAATATTCATGGCAATGGCTAGG 1623 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 961 TGCGCGAGTTTGTTGGGTTCCCTTCTGGCTCAGCCACGAATTTTCATGGCAATGGCTAGG 1020 Query 1624 GATGGATTGTTGCCAGCTTTCTTTTCAGAAATTAGCCCACGAACTCAAGTACCAGTGAAA 1683 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 GATGGATTGTTGCCGGCTTTCTTTTCAGAAATTAGCCCACGAACTCAAGTACCAGTGAAA 1080 Query 1684 AGCACAATAGCTATTGGTGTTCTTGCCGCTGCACTCGCATTTTTCATGGATGTTGCACAG 1743 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 AGCACAATAGCTATTGGTGTGCTTGCCGCTGCACTCGCATTTTTCATGGATGTTGCACAG 1140 Query 1744 TTGTCCGAGATGGTTAGTGTAGGCACTCTAATGGCATTCACTGCCGTTGCAGTC-TGTGT 1802 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| Sbjct 1141 TTGTCCGAAATGGTTAGTGTAGGCACTCTAATGGCATTCACTGCCGTTGCAG-CATGTGT 1199 Query 1803 GCTAGTTCTTAGATATGTACCACCAGATGGAGTTCCCCTATCATCTTCCTCCCAAACTTT 1862 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1200 GCTAGTTCTTAGATATGTACCACCAGATGGAGTTCCCCTATCATCTTCCTCTCAAACTTT 1259 Query 1863 GAGTGATACCGATGAAAGTAGAGCTGAAACTGAAAATTTTCTTGTGGATGCTATAGAATC 1922 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1260 GAGTGATACCGATGAAAGTGGAGCTGAAACTGAAAATTTTCTTGTGGATGCTATAGAATC 1319 Query 1923 TTCTGATTCCCCTCTACTTGGAAATGAAACTGCTCGAGATGAAAAGTATTTTGGAAAGAG 1982 ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1320 TTCTGATTCCCCTCTACTTGGCAATGAAACTGCACGAGATGAAAAGTATTTTGGAAAGAG 1379 Query 1983 GAGAAAAATTGC-TGCCTGGAGTATAGCTCTTGTGTGCATAGGTGTCCTAGGTCTTGCTT 2041 ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1380 AAGAAAAATTGCGT-CCTGGAGTATAGCTCTTGTGTGCATAGGTGTGCTAGGTCTTGCTT 1438 Query 2042 CAGCAGCTTCAGCTGAGCGTCTTCCAAGTTTTCCTCGTTTCACTATATGTGGTGTCAGTG 2101 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1439 CAGCAGCTTCGGCTGAGCGTCTTCCAAGTTTTCCTCGGTTCACTATATGTGGTGTCAGTG 1498 Query 2102 CAGTCATCTTGCTTGGCAGTTTGATTACTCTTGGCTACATTGACGAGGATGAAGAAAGGC 2161 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1499 CCGTCATCTTGCTTGGCAGTTTGATTACTCTTGGCTACATCGACGAGGATGAAGAAAGGC 1558 Query 2162 ACAACTTTGGACACAAAGGAG 2182 ||||||||||||||||||||| Sbjct 1559 ACAACTTTGGACACAAAGGAG 1579 Score = 396 bits (214), Expect = 5e-109 Identities = 236/247 (96%), Gaps = 0/247 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2182 GGGTTTCTCTGCCCATTCGTCCCATACCTTCCAGTTCTTTGCATTTTGATCAACACCTAC 2241 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1664 GGGTTTCTCTGCCCATTCGTCCCATACCTTCCAGTTCTTTGCATATTGATCAACACCTAC 1723 Query 2242 TTGATCATCAACATTGGAGCTGGGACATGGATCAGGGTCTTGATATGGCTACTTATTGGA 2301 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1724 TTGATCATCAACATTGGAGCTGGGACATGGATCAGGGTCTTGGTATGGCTACTTATTGGA 1783 Query 2302 AGCATGATCTATATCTTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTGAACAATGCGGTTTACGTT 2361 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1784 AGCATGATCTATCTCTTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTGAACAATGCGGTTTGCGTT 1843 Query 2362 CCCACAATGACTTGTACGAGAAAAACAACAGATCATCTTGCTTAAGATTGGTGGATCAAT 2421 || | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1844 CCAAGGACGACTTGTACCAGAAAAACAACAGATCATCTTGCTTAAGATTGGTGGTTCAAT 1903 Query 2422 GCTGCAG 2428 || |||| Sbjct 1904 GCAGCAG 1910 > Ahg952171 jgi|Araly1|952171|scaffold_43500001.1 Length=1105 Score = 931 bits (504), Expect = 0.0 Identities = 562/590 (95%), Gaps = 4/590 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1865 GTGATACCGATGAAAGTAGAGCTGAAACTGAAAATTTTCTTGTGGATGCTATAGAATCTT 1924 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 519 GTGATACCGATGAAAGTGGAGCTGAAACTGAAAATTTTCTTGTGGATGCTATAGAATCTT 578 Query 1925 CTGATTCCCCTCTACTTGGAAATGAAACTGCTCGAGATGAAAAGTATTTTGGAAAGAGGA 1984 ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 579 CTGATTCCCCTCTACTTGGCAATGAAACTGCACGAGATGAAAAGTATTTTGGAAAGAGAA 638 Query 1985 GAAAAATTGCTG-CCTGGAGTATAGCTCTTGTGTGCATAGGTGTCCTAGGTCTTGCTTCA 2043 |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 639 GAAAAATTGC-GTCATGGAGTATAGCTCTTGTGTGCATAGGTGTGCTAGGTCTTGCTTCA 697 Query 2044 GCAGCTTCAGCTGAGCGTCTTCCAAGTTTTCCTCGTTTCACTATATGTGGTGTCAGTGCA 2103 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 698 GCAGCTTCGGCTGAGCGTCTTCCAAGTTTTCCTCGGTTCACTATATGTGGTGTCAGTGCC 757 Query 2104 GTCATCTTGCTTGGCAGTTTGATTACTCTTGGCTACATTGACGAGGATGAAGAAAGGCAC 2163 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 758 GTCATCTTGCTTGGCAGTTTGATTACTCTTGGCTACATCGACGAGGATGAAGAAAGGCAC 817 Query 2164 AACTTTGGACACAAAGGAGGGTTTCTCTGCCCATTCGTCCCATACCTTCCAGTTCTTTGC 2223 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 818 AACTTTGGACACAAAGGAGGGTTTCTCTGCCCATTCGTCCCATACCTTCCAGTTCTTTGC 877 Query 2224 ATTTTGATCAACACCTACTTGATCATCAACATTGGAGCTGGGACATGGATCAGGGTCTTG 2283 || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 878 ATATTGATCAACACCTACTTGATCATCAACATTGG--CTGGGACATGGATCAGGGTCTTG 935 Query 2284 ATATGGCTACTTATTGGAAGCATGATCTATATCTTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTG 2343 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 936 GTATGGCTACTTATTGGAAGCATGATCTATCTCTTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTG 995 Query 2344 AACAATGCGGTTTACGTTCCCACAATGACTTGTACGAGAAAAACAACAGATCATCTTGCT 2403 ||||||||||||| |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 996 AACAATGCGGTTTGCGTTCCAAGGACGACTTGTACCAGAAAAACAACAGATCATCTTGCT 1055 Query 2404 TAAGATTGGTGGATCAATGCTGCAGTTAAAGGGACTCGAGCTCAAGCTTT 2453 |||||||||||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| Sbjct 1056 TAAGATTGGTGGTTCAATGCAGCAGCTGAAGGGAGTCGAGCTCAAGCTTT 1105 > Ahg927928 jgi|Araly1|927928|scaffold_300385.1 Length=506 Score = 595 bits (322), Expect = 5e-169 Identities = 366/387 (95%), Gaps = 4/387 (1%) Strand=Plus/Plus Query 2068 AGTTTTCCTCGTTTCACTAT-ATGTGGTGTCAGTGCAGTCATCTTGCTTGGCAGTTTGAT 2126 ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 123 AGTTTTCCTCGGTTCACTGTGA-GTGGTGTCAGTGCAGTCATCTTGCTTGGCAGTTTGAT 181 Query 2127 TACTCTTGGCTACATTGACGAGGATGAAGAAAGGCACAACTTTGGACACAAAGGAGGGTT 2186 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 182 TACTCTTGGCTACATCGACGAGGATGAAGAAAGGCACAACTTTGAACACAAAGGAGGGTT 241 Query 2187 TCTCTGCCCATTCGTCCCATACCTTCCAGTTCTTTGCATTTTGATCAACACCTACTTGAT 2246 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 242 TCTCTGCCCATTCGTCCCATACCTTCCAGTTCTTTGCATATTGATCAACACCTACTTGAT 301 Query 2247 CATCAACATTGGAGCTGGGACATGGATCAGGGTCTTGATATGGCTACTTATTGGAAGCAT 2306 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 302 CATCAACATTGG--CTGGGACATGGATCAGGGTCTTGGTATGGCTACTTATTGGAAGCAT 359 Query 2307 GATCTATATCTTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTGAACAATGCGGTTTACGTTCCCAC 2366 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 360 GATCTATCTCTTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTGAACAATGCGGTTTACGTTCCAAG 419 Query 2367 AATGACTTGTACGAGAAAAACAACAGATCATCTTGCTTAAGATTGGTGGATCAATGCTGC 2426 | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || Sbjct 420 GACGACTTGTACCAGAAAAACAACAGATCATCTTGCTTAAGATTGGTGGTTCAATGCAGC 479 Query 2427 AGTTAAAGGGACTCGAGCTCAAGCTTT 2453 || | |||||| ||||||||||||||| Sbjct 480 AGCTGAAGGGAGTCGAGCTCAAGCTTT 506 > Ahg918707 jgi|Araly1|918707|Al_scaffold_0492_2 Length=402 Score = 363 bits (196), Expect = 5e-99 Identities = 231/246 (94%), Gaps = 9/246 (4%) Strand=Plus/Plus Query 2183 GGTTTCTCTGCCCATTCGTCCCATACCTTCCAGTTCTTTGCATTTTGATCAACACCTACT 2242 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 162 GGTTTCTCTGCCCATTCGTCCCATACCTTCCAGTTCTTTGCATATTGATCAACACCTACT 221 Query 2243 TGATCATCAACATTGGAGCTGGGACATGGATCAGGGTCTTGATATGGCTACTTATTGGAA 2302 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 222 TGATCATCAACATTGGAGCTGGGACATGGATCAGGGTCTTGGTATGGCTACTTATTGGAA 281 Query 2303 GCATGATCTATATCTTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTGAACAATGCGGTTTACGTTC 2362 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 282 GCATGATCTATCTCTTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTGAACAATGCGGTTTAC---- 337 Query 2363 CCACAATGACTTGTACGAGAAAAACAACAGATCATCTTGCTTAAGATTGGTGGATCAATG 2422 || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 338 --AC---GACTTGTACCAGAAAAACAACAGATCATCTTGCTTAAGATTGGTGGTTCAATG 392 Query 2423 CTGCAG 2428 | |||| Sbjct 393 CAGCAG 398 > Ahg927883 jgi|Araly1|927883|scaffold_300340.1 Length=1078 Score = 255 bits (138), Expect = 9e-67 Identities = 217/254 (85%), Gaps = 10/254 (4%) Strand=Plus/Plus Query 95 ACAAGAAA-G-GA-GATGACAAGAATAACTGGAAAGTGATTCAACCTTT-AATGAATCAA 150 |||| ||| | || |||||||| |||| |||||||||| || ||||||| || ||| ||| Sbjct 511 ACAAAAAAGGAGATGATGACAACAATAGCTGGAAAGTGCTTGAACCTTTGAA-GAAACAA 569 Query 151 CGATGCGTGGATATGGTGTGTAAAGAAAGCAAGCTTTACGTGCTTACTGATACTC-ACGT 209 | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || Sbjct 570 CAATACGTAGATATGGTGTGTAAAGAAAGCAAGCTTTACGTGCTTAGTGATACTCGA-GT 628 Query 210 CACTGTTCTTGATTTCTCCCACGCTGATGCTTCTCCAATACAATGTGCAAGTTTCAAATC 269 |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 629 CACTGTTCTTGATTTCTCCCGTGATGATTCTCCTCCAATAAAATGTGCAAGTTTCAAATC 688 Query 270 TCCGAATTATGGTAATGATTCGTTTTGCGGCAAGAATCTTGCTGTGACTTTGTCAGGACA 329 || | ||||| | | |||||| | || ||||||||||| |||||||||||| | ||| Sbjct 689 TCTGGATTATCCT--T-ATTCGTCTCACGACAAGAATCTTGTTGTGACTTTGTCTGTACA 745 Query 330 AGTTTTGATCGTTA 343 |||||||||||||| Sbjct 746 AGTTTTGATCGTTA 759 > Ahg927846 jgi|Araly1|927846|scaffold_300303.1 Length=247 Score = 228 bits (123), Expect = 2e-58 Identities = 154/167 (92%), Gaps = 9/167 (5%) Strand=Plus/Plus Query 2257 GGAGCTGGGACATGGATCAGGGTCTTGATATGGCTACTTATTGGAAGCATGATCTATATC 2316 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 87 GGAGCTGGGACATGGATCAGGGTCTTGGTATGGCTACTTATTGGAAGCATGATCTATCTC 146 Query 2317 TTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTGAACAATGCGGTTTACGTTCCCACAATGACTTGT 2376 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 147 TTCTATGGCCGATCTCACAGCTTACTGAACAATGCGGTTTAC------AC---GACTTGT 197 Query 2377 ACGAGAAAAACAACAGATCATCTTGCTTAAGATTGGTGGATCAATGC 2423 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 198 ACCAGAAAAACAACAGATCATCTTGCTTAAGATTGGTGGTTCAATGC 244 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 100482066310 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5