BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G03780.1 Length=2617 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg477628 jgi|Araly1|477628|fgenesh2_kg.3__329__AT3G03780.2 4362 0.0 Ahg488656 jgi|Araly1|488656|fgenesh2_kg.6__1790__AT5G17920.1 2815 0.0 Ahg913528 jgi|Araly1|913528|Al_scaffold_0001_3782 403 3e-111 > Ahg477628 jgi|Araly1|477628|fgenesh2_kg.3__329__AT3G03780.2 Length=2596 Score = 4362 bits (2362), Expect = 0.0 Identities = 2502/2569 (97%), Gaps = 12/2569 (0%) Strand=Plus/Plus Query 55 GTa-aaaaaacaaaaaacaaacaaaaaTGGCTTCCCACATTGTTGGATATCCACGTATGG 113 ||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 34 GTACAAAAAA-AAAAAAGAATCAAAAATGGCTTCCCACATTGTTGGATATCCACGTATGG 92 Query 114 GACCTAAGAGAGAGCTCAAGTTTGCATTGGAGTCTTTCTGGGATGGCAAGAGCAGTGCCG 173 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 93 GACCTAAGAGAGAGCTCAAGTTTGCATTGGAGTCTTTCTGGGATGGCAAGAGCAGTGCCG 152 Query 174 ATGATTTGCAGAAGGTGTCTGCTGATCTCAGGTCTGATATCTGGAAACAGATGTCTGCTG 233 | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 153 AGGATTTGCAGAAGGTGTCTGCTGATCTAAGGTCTGATATCTGGAAACAGATGTCTGCTG 212 Query 234 CTGGGATTAAGTATATCCCAAGCAACACCTTTTCTCATTATGACCAGGTGCTTGACACCA 293 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 213 CTGGGATTAAGTATATCCCAAGCAACACCTTTTCTCATTATGACCAGGTGCTTGACACCA 272 Query 294 CCGCCATGCTTGGTGCTGTTCCATCTAGATATGGATTTACCAGTGGTGAGATCGGTCTCG 353 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 273 CCGCCATGCTTGGTGCTGTTCCACCTAGATATGGATTTACTAGTGGTGAGATCGGTCTCG 332 Query 354 ATGTTTACTTCTCCATGGCTAGAGGAAATGCCTCTGTTCCAGCTATGGAGATGACCAAGT 413 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 333 ATGTTTACTTCTCCATGGCTAGAGGAAATGCCTCTGTTCCAGCTATGGAGATGACCAAGT 392 Query 414 GGTTTGACACCAACTACCATTACATCGTCCCAGAGTTGGGCCCTGAAGTGAAATTTTCTT 473 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 393 GGTTTGACACCAACTACCATTACATCGTCCCAGAGTTGGGCCCTGAAGTGAAATTCTCTT 452 Query 474 ACGCATCTCACAAGGCTGTCAATGAGTACAAGGAGGCCAAGGCTCTTGGTGTTGAGACCG 533 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct 453 ACGCATCTCACAAGGCTGTGAATGAGTACAAGGAGGCTAAGGCTCTTGGTGTTGAGACGG 512 Query 534 TCCCTGTACTTGTTGGCCCTGTCTCTTACTTGCTTCTTTCCAAGCTTGCTAAGGGTGTTG 593 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 513 TCCCTGTACTTGTTGGCCCTGTCTCTTACTTGCTTCTTTCCAAGCTTGCTAAGGGTGTTG 572 Query 594 ACAAGTCATTTGATCTTCTCTCCCTTCTCCCCAAAATCCTCCCAGTTTACAAGGAAGTCA 653 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct 573 ACAAGTCATTTGATCTTCTCTCCCTTCTCCCCAAAATTCTCCCAGTCTACAAGGAAGTCA 632 Query 654 TTGCAGAGCTTAAGGCAGCTGGTGCCTCCTGGATTCAGCTTGATGAGCCTCTCTTTGTCA 713 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 633 TTGCAGAACTTAAGGCAGCTGGTGCCTCTTGGATTCAGCTTGATGAGCCTCTCTTTGTCA 692 Query 714 TGGATCTCGAGGGTCACAAACTCCAGGCTTTTAGCGGTGCCTATGCTGAGCTTGAATCAA 773 ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 693 TGGATCTTGAGGGTCAAAAACTCCAGGCTTTTAGCGGTGCCTATGCTGAGCTTGAATCAA 752 Query 774 CTCTCTCTGGTCTGAATGTTCTTGTGGAGACCTACTTCGCTGATATCCCTGCTGAAGCAT 833 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 753 CTCTCTCTGGTCTGAATGTTCTTGTGGAGACCTACTTTGCTGATATCCCTGCTGAAGCAT 812 Query 834 ACAAGACCCTTACTTCCTTGAAGGGTGTGACTGCCTTCGGATTTGATTTGGTTCGTGGCA 893 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct 813 ACAAGACTCTTACTTCCTTGAAGGGTGTGACTGCCTTTGGATTTGATTTGGTTCGTGGTA 872 Query 894 CCAAGACCATTGACTTGATCAAGTCAGGTTTCCCACAGGGCAAGTACCTCTTTGCTGGTG 953 ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 873 CCAAGACCATTGACTTGATCAAGGCTGGTTTCCCCCAGGGCAAGTACCTCTTTGCTGGTG 932 Query 954 TTGTTGACGGAAGGAACATCTGGGCCAATGACCTCGCTGCCTCTCTCATCACCTTGCAGT 1013 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 933 TTGTTGACGGAAGGAACATCTGGGCCAATGACCTCGCTGCCTCTCTCATCACCTTGCAGT 992 Query 1014 CACTTGAGGGTGTTGTTGGTAAAGACAAGCTTGTGGTCTCAACCTCTTGCTCTCTTCTCC 1073 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 993 CACTTGAGGGTGTTGTTGGTAAAGACAAGCTTGTGGTCTCAACCTCTTGCTCTCTTCTCC 1052 Query 1074 ACACTGCCGTTGACCTTATTAACGAGACTAAGCTTGATGCTGAAATCAAGTCGTGGCTAG 1133 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1053 ACACTGCCGTTGACCTTGTTAACGAGACTAAGCTTGATGCTGAAATCAAGTCGTGGCTAG 1112 Query 1134 CTTTTGCTGCCCAGAAGGTTGTTGAAGTTGACGCATTGGCCAAGGCTTTGGCCGGTCAGA 1193 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1113 CTTTTGCCGCCCAGAAGGTTGTTGAAGTTGACGCATTGGCCAAGGCTTTAGCCGGTCAGA 1172 Query 1194 CAAATGAGAGTTTCTTCACTGCCAACGCTGACGCATTGTCTTCGAGGAGGTCTTCCCCAA 1253 | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1173 CGAATGAGAGTTTCTTCACTGCCAACGCTGATGCTTTGTCTTCGAGGAGGTCTTCCCCAA 1232 Query 1254 GAGTCACCAATGAGTCTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGCTTTGAAGGGATCTGACCACCGCC 1313 ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1233 GAGTCACTAATGAGGCTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGCTTTGAAGGGGTCTGACCACCGCC 1292 Query 1314 GTACAACTGAAGTTAGCGCAAGGCTAGATGCTCAGCAGAAGAAGCTTAACCTTCCAATCC 1373 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1293 GTACAACCGAAGTTAGCGCAAGGCTAGATGCTCAGCAGAAGAAGCTTAACCTTCCAATCC 1352 Query 1374 TCCCAACCACAACCATTGGATCCTTCCCACAGACCGTGGAACTCAGGAGAGTTCGCCGTG 1433 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1353 TCCCAACCACCACCATTGGATCCTTCCCACAGACCGTGGAACTCAGGAGAGTTCGCCGTG 1412 Query 1434 AATACAAGGCCAAGAAAATCTCTGAAGAGGATTACGTCAAGGCCATCAAGGAAGAGATCA 1493 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1413 AATACAAGGCGAAGAAAATCTCTGAAGAGGATTACGTCAAGGCCATCAAGGAAGAGATCA 1472 Query 1494 AGAAAGTTGTTGACATCCAAGAGGACCTTGACATTGATGTTCTTGTTCACGGAGAGCCTG 1553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1473 AGAAAGTTGTTGACATCCAAGAGGACCTTGACATTGATGTTCTTGTTCACGGAGAGCCTG 1532 Query 1554 AGAGAAACGACATGGTTGAGTACTTTGGAGAGCAATTGTCAGGTTTCGCATTCACAGCAA 1613 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1533 AGAGAAACGATATGGTTGAGTACTTTGGAGAGCAATTGTCAGGTTTCGCATTCACAGCAA 1592 Query 1614 ACGGATGGGTGCAATCCTATGGATCTCGCTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTATGGTGACG 1673 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1593 ATGGGTGGGTGCAATCCTATGGATCTCGCTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTACGGTGACG 1652 Query 1674 TGAGCCGCCCCAAGCCAATGACAGTCTTCTGGTCCTCAACAGCTCAGAGCATGACCAAAC 1733 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1653 TGAGCCGCCCCAAGCCAATGACAGTCTTCTGGTCCTCAACAGCTCAGAGCATGACCAAAC 1712 Query 1734 GTCCAATGAAGGGTATGCTTACAGGTCCAGTCACAATTCTCAACTGGTCTTTTGTCAGAA 1793 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| Sbjct 1713 GTCCAATGAAGGGAATGCTTACAGGTCCAGTCACAATTCTTAACTGGTCTTTTGTTAGAA 1772 Query 1794 ACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAAGATGAAGTGG 1853 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1773 ACGACCAGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAAGACGAAGTGG 1832 Query 1854 AAGACCTCGAGAAAGGCGGTATTGGAGTCATTCAGATCGATGAAGCCGCACTTAGAGAAG 1913 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1833 AAGACCTCGAGAAAGGCGGTATTGGAGTCATTCAGATCGATGAAGCCGCACTCAGAGAAG 1892 Query 1914 GATTGCCTCTTAGGAAAGCCGAACACTCTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACTCTTTCA 1973 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1893 GATTGCCTCTTAGGAAAGCCGAACACTCTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACTCTTTCA 1952 Query 1974 GAATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACAGCACTCAGATTCACACTCACATGTGTTACTCAA 2033 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1953 GAATCACCAACTGTGGCGTCCAAGACAGCACTCAGATTCACACTCACATGTGTTACTCAA 2012 Query 2034 ACTTCAACGACATCATCCACTCAATCATTGACATGGACGCTGATGTCATCACCATTGAGA 2093 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2013 ACTTCAATGACATCATCCACTCAATCATCGACATGGACGCTGATGTCATCACCATTGAGA 2072 Query 2094 ACTCTCGTTCAGACGAGAAGCTTCTCTCAGTGTTCCGTGAAGGAGTGAAGTACGGTGCAG 2153 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2073 ACTCTCGTTCAGACGAGAAGCTTCTATCAGTGTTCCGTGAAGGAGTGAAGTACGGTGCAG 2132 Query 2154 GAATCGGTCCTGGTGTTTACGACATTCACTCTCCGAGAATACCATCCACAGATGAAATTG 2213 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2133 GAATCGGTCCTGGTGTTTACGACATTCACTCTCCAAGAATACCATCCACAGAAGAAATTG 2192 Query 2214 CAGACAGGATCAACAAGATGCTTGCGGTTCTTGAGCAGAACATCTTGTGGGTTAACCCTG 2273 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2193 CAGACAGGATCAACAAGATGCTTGCGGTTCTTGAGCAGAACATCTTGTGGGTTAACCCTG 2252 Query 2274 ACTGTGGTCTGAAGACAAGGAAGTACACTGAGGTTAAACCAGCACTTAAAGCCATGGTTG 2333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2253 ACTGTGGTCTGAAGACAAGGAAGTACACTGAGGTTAAACCAGCACTTAAAGCCATGGTTG 2312 Query 2334 ACGCGGCTAAGCTTATCCGCTCCCAGCTCGGTAGTGCCAAGTGAAGAGCTTGAAGATATT 2393 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2313 ACGCGGCTAAGCTTATCCGCTCCCAGCTCGCTAGTGCCAAGTGAAGAACTTGAAGATATC 2372 Query 2394 ATTTCTATATTCCGGGATTTTTCTACGTGGTTTGTGTTTGTTCAGTTTCAATAACTTTTC 2453 |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2373 ATTTCTAT-TTCCGGGATTTTTATACGTGGTTTGTGTTTGTTCAGTTTCAATAACTTTTC 2431 Query 2454 TTCCAAGAAAAATATTTT-AGCCAAAGTTAGGTTTTGAGGGAATGGAGTCACACTCTCTC 2512 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2432 TTCCAAGAAAAATATTTTTAGCCAAAGTTAGGTTTTGAGGGAATGGAGTCACACTCTCTC 2491 Query 2513 GCTTTCGTTGAAGAGAGTTTACGGCTTT-ATACT-ATATGT-TTCTCTTGTTGCAATGTT 2569 ||||||||||||||||||||| |||||| || || |||| | |||| ||||||||||||| Sbjct 2492 GCTTTCGTTGAAGAGAGTTTATGGCTTTCAT-CTTATAT-TCTTCTTTTGTTGCAATGTT 2549 Query 2570 ATATGTATCTTTGTTTTCTCT-AATGAAATATATGCTTCTTTGATCTCT 2617 ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2550 ATATGTATCTTTGTTTTCTCTTAATGAAATAT--GCTTCTTTGATCTCT 2596 > Ahg488656 jgi|Araly1|488656|fgenesh2_kg.6__1790__AT5G17920.1 Length=2762 Score = 2815 bits (1524), Expect = 0.0 Identities = 2065/2325 (89%), Gaps = 42/2325 (2%) Strand=Plus/Plus Query 77 aaaaTGGCTTCCCACATTGTTGGATATCCACGTATGGGACCTAAGAGAGAGCTCAAGTTT 136 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 169 AAAATGGCTTCACACATTGTTGGATATCCACGTATGGGCCCTAAGAGAGAGCTCAAGTTT 228 Query 137 GCATTGGAGTCTTTCTGGGATGGCAAGAGCAGTGCCGATGAT-TTGCAGAAGGTGTCTGC 195 || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||| || |||||||||||||| Sbjct 229 GCTTTGGAATCTTTCTGGGATGGTAAGAGCACTGCTGAGGATCTT-CAGAAGGTGTCTGC 287 Query 196 TGATCTCAGGTCTGAT--ATCTGGAAACAGATGTCTGCTGCTGGGATTAAGTAT-ATCCC 252 |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| Sbjct 288 TGATCTCAGGTC--ATCCATCTGGAAACAGATGTCTGCGGCTGGGACTAAGT-TCATCCC 344 Query 253 AAGCAACACCTTTTCTCATTATGACCAGGTGCTTGACACCACCGCCATGCTTGGTGCTGT 312 ||||||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 345 AAGCAACACCTTTGCTCACTACGACCAGGTTCTCGACACCACCGCTATGCTCGGTGCTGT 404 Query 313 TCCATCTAGATATGGATTTAC-C-AGTGGTGAGATCGGTCTCGATGTTTACTTCTCCATG 370 |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct 405 TCCACCTAGATATGG--TTACACTGGTGGTGAGATCGGGCTTGATGTTTACTTCTCCATG 462 Query 371 GCTAGAGGAAATGCCTCTGTTCCAGCTATGGAGATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAC 430 || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 463 GCCAGAGGAAATGCCTCTGTGCCTGCTATGGAAATGACCAAGTGGTTTGACACCAACTAC 522 Query 431 CATTACATCGTCCCAGAGTTGGGCCCTGAAGTGAAATTTTCTTACGCATCTCACAAGGCT 490 |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| Sbjct 523 CATTACATCGTCCCTGAGTTGGGCCCTGAGGTCAACTTCTCTTACGCATCCCACAAGGCG 582 Query 491 GTCAATGAGTACAAGGAGGCCAAGGCTCTTGGTGTTGAGACCGTCCCTGTACTTGTTGGC 550 || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 583 GTGAATGAGTACAAGGAGGCCAAAGCTCTTGGTGTTGACACCGTCCCTGTACTTGTTGGC 642 Query 551 CCTGTCTCTTACTTGCTTCTTTCCAA-GCTTGCTAAGGGTGTTGACAAGTCATTTGATCT 609 || |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 643 CCAGTCTCTTACTTGCTGCTTTCCAAGGC-TGCCAAGGGTGTTGACAAGTCATTTGATCT 701 Query 610 TCTCTCCCTTCTCCCCAAAATCCTCCCAG-TTTACAAGGAAGTCATTGCAGAGCTTAAGG 668 ||| || |||||||| ||||| ||||| | | ||||||||||| ||| | |||||||||| Sbjct 702 TCTTTCTCTTCTCCCTAAAATTCTCCC-GATCTACAAGGAAGTGATTACCGAGCTTAAGG 760 Query 669 CAGCTGGTGCCTCCTGGATTCAGCTTGATGAGCCTCTCTTTGTCATGGATCTCGAGGGTC 728 ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||| Sbjct 761 CAGCTGGTGCCACCTGGATTCAGCTTGACGAGCCTGTCCTTGTTATGGATCTTGAGGGTC 820 Query 729 ACAAACTCCAGGCTTTTAGC-GGTGCCTATGCTGAGCTTGAATCAACTCTCTCTGGTCTG 787 ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || Sbjct 821 ACAAACTCCAGGCCTTTA-CTGGTGCCTATGCTGAACTTGAATCAACTCTTTCTGGTTTG 879 Query 788 AATGTTCTTGTGGAGACCTACTTCGCTGATATCCCTGCTGAAGCATACAAGACCCTTACT 847 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| Sbjct 880 AATGTTCTTGTCGAGACCTACTTCGCTGATATCCCTGCTGAGGCATACAAGACCCTAACT 939 Query 848 TCCTTGAAGGGTGTGACTGCCTTCGGATTTGATTTGGTTCGTGGCACCAAGACCATTGAC 907 || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 940 TCATTGAAGGGTGTGACTGCCTTTGGTTTTGATTTGGTTCGTGGCACCAAGACCCTTGA- 998 Query 908 TTGA-TCAAGTCAGGTTTCCCACAGGGCAAGTACCTCTTTGCTGGTGTTGTTGACGGAAG 966 || | ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 999 TTTAGTCAAGGCAGGTTTCCCTGAGGGAAAGTACCTCTTTGCTGGTGTTGTTGATGGAAG 1058 Query 967 GAACATCTGGGCCAATGACCTCGCTGCCTCTCTCATCACCTTGCAGTCACTTGAGGGTGT 1026 ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || | Sbjct 1059 GAACATCTGGGCCAATGACTTTGCTGCGTCTCTCAGCACCTTGCAGGCACTTGAAGGCAT 1118 Query 1027 TGTTGGTAAAGACAAGCTTGTGGTCTCAACCTCTTGCTCTCTTCTCCACACTGCCGTTGA 1086 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| Sbjct 1119 TGTTGGTAAAGACAAGCTTGTGGTCTCAACCTCCTGCTCTCTTCTCCACACCGCTGTTGA 1178 Query 1087 CCTTATTAACGAGACTAAGCTTGATGCTGAAATCAAGTCGTGGCTAGCTTTTGCTGCCCA 1146 ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || ||||||||||| Sbjct 1179 TCTTATCAATGAGACTAAGCTTGATGATGAAATCAAGTCATGGTTGGCGTTTGCTGCCCA 1238 Query 1147 GAAGGTTGTTGAAGTTG-ACGCATTGGCCAAGGCTTTGGCCGGTCAGACA-AATGAGAG- 1203 |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| | Sbjct 1239 GAAGGTTGTTGAAG-TGAACGCATTGGCTAAGGCTTTGGCTGGTCAGA-AGGATGAG-GC 1295 Query 1204 T-TTCTTCACTGCCAACGCTGAC-GCATTGTCTTCGAGGAGGTCTTCCCCAAGAGTCACC 1261 | || ||| ||||||| |||| | || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1296 TCTT-TTCTCTGCCAATGCTG-CGGCTTTGGCTTCAAGGAGGTCTTCCCCAAGAGTCACC 1353 Query 1262 AATGAGTCTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGCTTTGAAGGGATCTGACCACCGCCGTACAACT 1321 || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| Sbjct 1354 AACGAGGGTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGCTTTGAAGGGATCTGACCACCGTCGTGCAACT 1413 Query 1322 GAA-GTTAGCGCAAGGCTAGATGCTCAGCAGAAGAAGCTTAACCTTCCAATCCTCCCAAC 1380 || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| Sbjct 1414 -AATGTTAGTGCTAGGCTAGATGCTCAGCAGAAGAAGCTCAACCTCCCAATCCTGCCAAC 1472 Query 1381 CACAACCATTGGATCCTTCCCACAGACCGTGGAACTCAGGAGAGTTCGCCGTGAATACAA 1440 ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 1473 CACAACCATCGGATCCTTCCCACAGACCGTAGAGCTCAGGAGAGTTCGTCGTGAGTACAA 1532 Query 1441 GGCCAAGAAA-ATCTCTGAAGAGGATTACGTCAAGGCCATCAAGGAAGAGATCAAGAAAG 1499 ||| || ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1533 GGCGAA-AAAGGTCTCTGAGGAGGACTACGTTAAGGCCATCAAGGAAGAGATCAAGAAAG 1591 Query 1500 TTGTTGACATCCAAGAGGACCTTGACATTGATGTTCTTGTTCACGGAGAGCCTGAGAGAA 1559 |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct 1592 TTGTTGACCTCCAAGAGGAACTTGACATCGATGTTCTTGTCCACGGAGAGCCAGAGAGAA 1651 Query 1560 ACGACATGGTTGAGTACTTTGGAGAGCAATTGTCAGGTTTCGCATTCACAGCAAACGGAT 1619 | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||| Sbjct 1652 ATGACATGGTTGAGTACTTCGGGGAGCAGTTGTCTGGTTTTGCCTTCACTGCAAACGGAT 1711 Query 1620 GGGTGCAATCCTATGGATCTCGCTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTATGGTGACGTGAGCC 1679 |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| Sbjct 1712 GGGTCCAATCTTATGGATCTCGTTGTGTGAAGCCACCAGTTATCTACGGTGATGTGAGCC 1771 Query 1680 GCCCCAAGCCAATGACAGTCTTCTGGTCCTCAACAGCTCAGAGCATGACCAAACGTCCAA 1739 | |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| Sbjct 1772 GTCCCAAGGCAATGACCGTCTTCTGGTCCGCAATGGCTCAGAGCATGACCTCTCGCCCAA 1831 Query 1740 TGAAGGGTATGCTTACAGGTCCAGTCACAATTCTCAACTGGTCTTTTGTCAGAAACGACC 1799 |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct 1832 TGAAGGGTATGCTTACCGGTCCCGTCACCATTCTCAACTGGTCCTTCGTCAGAAACGACC 1891 Query 1800 AGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAAGATGAAGTGGAAGACC 1859 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || | Sbjct 1892 AGCCCAGGCACGAAACCTGTTACCAGATCGCTTTGGCCATCAAGGACGAAGTCGAGGATC 1951 Query 1860 TCGAGAAAGGCGGTATTGGAGTCATTCAGATCGATGAAGCCGCACTTAGAGAAGGATTGC 1919 | |||||||| || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | Sbjct 1952 TTGAGAAAGGTGGAATCGGTGTCATTCAGATTGATGAGGCTGCACTTAGAGAAGGACTAC 2011 Query 1920 CTCTTAGGAAAGCCGAACACT-CTTTCTACTTGGACTGGGCTGTTCACTCTTTCAGAATC 1978 | || |||||| |||| || | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| Sbjct 2012 CACTCAGGAAATCCGAGCA-TGCTTTCTACTTGGACTGGGCCGTTCACTCCTTCAGAATC 2070 Query 1979 ACCAACTGTGGCGTCCAAGACAGCACTCAGATTCACACTCACATGTGTTACTCAAACTTC 2038 ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| Sbjct 2071 ACCAACTGTGGAGTCCAAGACAGCACCCAGATCCACACTCACATGTGCTACTCCCACTTC 2130 Query 2039 AACGACATCATCCACTCAATCATTGACATGGACGCTGATGTCATCACCATTGAGAACTCT 2098 || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2131 AATGACATCATACACTCCATCATCGACATGGATGCTGATGTCATCACCATTGAGAACTC- 2189 Query 2099 C-GTTCAGACGAGAAGCTTCTCTCAGTGTTCCGTGAAGGAGTGAAGTACGGTGCAGGAAT 2157 | | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2190 CAGGTCTGACGAGAAGCTTCTCTCCGTGTTCCGTGAAGGAGTGAAGTACGGTGCTGGAAT 2249 Query 2158 CGGTCCTGGTGTTTACGACATTCACTCTCCGAGAATACCATCCACAGATGAAATTGCAGA 2217 ||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| | || ||||| ||||| Sbjct 2250 TGGTCCAGGAGTCTACGACATCCACTCTCCAAGAATACCATCTTCTGAGGAAATCGCAGA 2309 Query 2218 CAGGATCAACAAGATGCTTGCGGTTCTTGAGCAGAACATC-TTGTGGGTTAACCCTGACT 2276 ||| |||||||||||||||| || || |||||||||||| || ||||| |||||||||| Sbjct 2310 GAGGGTCAACAAGATGCTTGCTGTCCTAGAGCAGAACATCCTT-TGGGTCAACCCTGACT 2368 Query 2277 GTGGTCTGAAGACAAGGAAGTACACTGAGGTTAAACCAGCACTTAA-AGCCATGGTTGAC 2335 ||||||| ||||| | |||||||| |||||||| || || || || | | |||||||| Sbjct 2369 GTGGTCTCAAGACCCGTAAGTACACCGAGGTTAAGCCTGCGCTCAAGAAC-ATGGTTGAT 2427 Query 2336 GCGGCTAAGCTTATCCGCTCCCAGCTCGGTAGTGCCAAGTGAAGA 2380 ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2428 GCGGCCAAGCTCATCCGTTCCCAGCTCGCCAGTGCCAAGTGAAGA 2472 > Ahg913528 jgi|Araly1|913528|Al_scaffold_0001_3782 Length=366 Score = 403 bits (218), Expect = 3e-111 Identities = 322/371 (87%), Gaps = 11/371 (3%) Strand=Plus/Plus Query 941 CTCTTTGCTGGTGTTGTTGACGGAAGGAACATCTGGGCCAATGACCTCGCTGCCTCTCTC 1000 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| || || Sbjct 1 CTCTTTGCTGGTGTTGTTGATGGAAGGAACATCTGGGCCAACGACTTTGCTGCGTCCCTA 60 Query 1001 ATCACCTTGCAGTCACTTGAGGGTGTTGTTGGTAAAGACAAGCTTGTGGTCTCAACCTCT 1060 | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AGCACCTTGCAGGCACTTGAGGACATTGTTGGTAAAGACAAGCTTGTGGTCTCAACCTCC 120 Query 1061 TGCTCTCTTCTCCACACTGCCGTTGACCTTATTAACGAGACTAAGCTTGATGCTGAAATC 1120 ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||| Sbjct 121 TGCTCTCTTCTCCACACCGCTGTTGATCTTATCAATGAGACTAAGCTTGATGATGAAATC 180 Query 1121 AAGTCGTGGCTAGCTTTTGCTGCCCAGAAGGTTGTTGAAGTTGAC-GCATTGGCCAAGGC 1179 ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| Sbjct 181 AAGTCATGGTTGGCGTTTGCTGCCCAGAAGGTTGTTGAAGT-GAATGCGTTGGCCAAGGC 239 Query 1180 TTTGGCCGGTCAGACAA-ATGAGAG-T-TTCTTCACTGCCAACGCTGACG-CATTGTCTT 1235 |||||| ||||||| | ||||| | | || ||| ||||||| |||| || | ||| ||| Sbjct 240 TTTGGCTGGTCAGA-AGGATGAG-GCTCTT-TTCTCTGCCAATGCTG-CGACTTTGGCTT 295 Query 1236 CGAGGAGGTCTTCCCC-AAGAGTCACCAATGAGTCTGTCCAGAAGGCTGCTGCTGCTTTG 1294 | ||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||| Sbjct 296 CAAGGAGGTTTTCCCCCAAGAGTCACCAACGAGGGTGTTCAGAAGGCCGCTGCTGCTTTG 355 Query 1295 AAGGGATCTGA 1305 ||||||||||| Sbjct 356 AAGGGATCTGA 366 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 98691824795 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5