BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G11670.1 Length=2687 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg928882 jgi|Araly1|928882|scaffold_301339.1 3984 0.0 Ahg918607 jgi|Araly1|918607|Al_scaffold_0222_2 3112 0.0 > Ahg928882 jgi|Araly1|928882|scaffold_301339.1 Length=2470 Score = 3984 bits (2157), Expect = 0.0 Identities = 2363/2466 (96%), Gaps = 0/2466 (0%) Strand=Plus/Plus Query 44 GAAACGATAAACCCTAAGTCATGGTAAAGGAAACTCTAATTCCTCCGTCATCTACGTCAA 103 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1 GAAACGATAAACCCTAAATCATGGTAAAGGAAACTCTAATTCCTCCGTCTTCTACGTCAA 60 Query 104 TGACGACCGGAACATCTTCTTCTTCGTCTCTTTCAATGACGTTATCCTCAACAAACGCGT 163 || ||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct 61 TGGCGACCGGTACGGCGACGTCTTCGTCTCTTTCAATGACGTTGTCATCAACAAACGCGT 120 Query 164 TATCGTTTTTGTCGAAAGGATGGAGAGAGGTATGGGATTCAGCAGATGCGGATTTGCAGC 223 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TATCGTTTTTGTCGAAAGGTTGGAGAGAGGTATGGGATTCAGCAGATGCGGATTTGCAGT 180 Query 224 TGATGCGAGACAGAGCTAACTCTGTTAAGAATCTAGCATCAACGTTCGATAGAGAGATCG 283 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| Sbjct 181 TGATGCGAGACAGAGCTAACTCCGTTAAGAATCTAGCATCGACGTTCGACAGAGAGATCG 240 Query 284 AGAATTTCCTCAATAACTCGGCGAGGTCTGCGTTTCCCGTTGGTTCACCATCGGCGTCGT 343 |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | Sbjct 241 AGAATTTCCTCAATAATTCGGCCAGGTCTGCGTTTCCCGTCGGGTCACCATCGGCGTCTT 300 Query 344 CTTTCTCAAATGAAATTGGTATCATGAAGAAGCTTCAGCCGAAGATTTCGGAGTTTCGTA 403 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CTTTCTCAAGTGAAATTGGTATCATGAAGAAGCTTCAGCCGAAGATTTCGGAGTTTCGTA 360 Query 404 GGGTTTATTCGGCGCCGGAGATTAGTCGCAAGGTTATGGAGAGATGGGGACCTGCGAGAG 463 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 361 GGGTTTATTCGGCGCCGGAGATTAGTCGTAAGGTTATGGAGAGATGGGGACCAGCGAGAG 420 Query 464 CGAAGCTTGGAATGGATCTATCGGCGATTAAGAAGGCGATTGTGTCTGAGATGGAATTGG 523 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CGAAGCTGGGAATGGATCTATCGGCGATTAAGAAGGCGATTGTGTCTGAGATGGAATTGG 480 Query 524 ATGAGCGTCAGGGAGTTTTGGAGATGAGTAGATTGAGGAGACGGCGTAATAGTGATAGGG 583 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 481 ATGAGCGTCAGGGAGTTTTAGAGATGGGTAGATTGAGGAGACGGCGTAATAGTGACAGGG 540 Query 584 TTAGGTTTACGGAGTTTTTCGCGGAGGCTGAGAGAGATGGAGAAGCTTATTTCGGTGATT 643 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct 541 TTAGGTTTACGGAGTTTTTCGCGGAGGCTGAGAGAGATGGAGAAGGTAATTTCGGTGATT 600 Query 644 GGGAACCGATTAGGTCTTTGAAGAGTAGATTTAAAGAGTTTGAGAAACGAAGCTCGTTAG 703 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 601 GGGAACCGATTAGGTCTTTGAAGACTAGATTTAAAGAGTTTGAGAAACGAAACTCGTTAG 660 Query 704 AAATATTGAGTGGATTCAAGAACAGTGAATTTGTTGAGAAGCTCAAAACCAGCTTTAAAT 763 ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 AAATATTGAGTGGATTCAAGAACAGCGAATTTGTGGAGAAGCTCAAAACCAGCTTTAAAT 720 Query 764 CAATTTACAAAGAAACTGATGAGGCTAAGGATGTCCCTCCGTTGGATGTACCTGAACTGT 823 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct 721 CAATTTACAAAGAAACTGATGAGGCTAAGGATGTCCCTCCATTGGATGTACCTGAACTTT 780 Query 824 TGGCATGTTTGGTTAGACAATCTGAACCTTTTCTTGATCAGATTGGTGTTAGAAAGGATA 883 |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 TGGCCTGTTTGGTTAGACAGTCTGAACCTTTTCTTGATCAGATTGGTGTTAGAAAGGATA 840 Query 884 CATGTGACCGAATAGTAGAAAGCCTTTGCAAATGCAAGAGCCAACAACTTTGGCGTCTGC 943 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 841 TGTGCGACCGAATAGTAGAAAGCCTTTGCAAATGCAAGAGCCAACACCTTTGGCGTCTGC 900 Query 944 CATCTGCACAAGCATCCGATTTAATTGAAAATGATAACCATGGAGTTGATTTGGATATGA 1003 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 901 CATCTGCACAAGCATCCGATTTAATTGAAAATGATAATCATGGAGTTGATTTGGATATGA 960 Query 1004 GGATAGCCAGTGTTCTTCAAAGCACAGGACACCATTATGATGGTGGGTTTTGGACTGATT 1063 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 961 GGATAGCCAGTGTTCTTCAAAGCACAGGACACCATTATGATGGTGGCTTTTGGACTGATT 1020 Query 1064 TTGTGAAGCCTGAGACACCGGAAAACAAAAGGCATGTGGCAATTGTTACAACAGCTAGTC 1123 ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 TTGTGAAGCCTGAGACATCAGAAAATAAAAGGCATGTGGCAATTGTTACAACAGCTAGTC 1080 Query 1124 TTCCTTGGATGACCGGAACAGCTGTAAATCCGCTATTCAGAGCGGCGTATTTGGCAAAAG 1183 | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 TCCCTTGGATGACCGGAACAGCTGTAAATCCACTATTCAGAGCGGCGTATTTGGCAAAAT 1140 Query 1184 CTGCAAAACAGAGTGTTACTCTCGTGGTTCCTTGGCTCTGCGAATCTGATCAAGAACTAG 1243 ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 CTGCAAAACAGAGTGTTACACTTGTAGTTCCTTGGCTCTGCGAATCTGATCAAGAACTAG 1200 Query 1244 TGTATCCAAACAATCTCACCTTCAGCTCACCTGAAGAACAAGAGAGTTATATACGTAAAT 1303 | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1201 TTTATCCAAACAATCTCACCTTTAGTTCACCTGAAGAACAAGAGAGCTATATACGTAAAT 1260 Query 1304 GGTTGGAGGAAAGGATTGGTTTCAAGGCTGATTTTAAAATCTCCTTTTACCCAGGAAAGT 1363 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1261 GGTTGGAGGAAAGGATTGGTTTCAAGGCTGATTTTAAAATCTCTTTTTACCCAGGAAAGT 1320 Query 1364 TTTCAAAAGAAAGGCGCAGCATATTTCCTGCTGGTGACACTTCTCAATTTATATCGTCAA 1423 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 TTTCAAAAGAAAGGCGTAGCATATTTCCTGCTGGTGACACTTCTCAATTTATATCGTCAA 1380 Query 1424 AAGATGCTGACATTGCTATACTTGAAGAACCTGAACATCTCAACTGGTATTATCACGGCA 1483 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1381 AAGATGCTGACATTGCTATACTTGAAGAACCTGAGCATCTCAACTGGTACCATCACGGCA 1440 Query 1484 AGCGTTGGACTGATAAATTCAACCATGTTGTTGGAATTGTCCACACAAACTACTTAGAGT 1543 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1441 AGCGTTGGACCGATAAATTCAACCATGTTGTTGGAATTGTCCACACAAACTACTTAGAGT 1500 Query 1544 ACATCAAGAGGGAGAAGAATGGAGCTCTTCAAGCATTTTTTGTGAACCATGTAAACAATT 1603 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1501 ACATCAAGAGGGAGAAGAATGGTGCTCTTCAAGCATTTTTTGTGAATCATGTAAACAATT 1560 Query 1604 GGGTCACACGAGCGTATTGTGACAAGGTTCTTCGCCTCTCTGCGGCAACACAAGATTTAC 1663 ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1561 GGGTCACACGAGCATATTGTGACAAGGTTCTTCGTCTCTCTGGGGCAACACAAGATTTAC 1620 Query 1664 CAAAGTCTGTTGTATGCAATGTCCATGGTGTCAATCCCAAGTTCCTTATGATTGGGGAGA 1723 |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1621 CAAAATCTGTTGTATGCAATGTCCACGGTGTCAATCCCAAGTTCCTTATGATTGGGGGGA 1680 Query 1724 AAATTGCTGAAGAGAGATCCCGTGGTGAACAAGCTTTCTCAAAAGGTGCATACTTCTTAG 1783 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1681 AAATTGCTGAAGAGAGATCCCGTGGTGAACAAGCTTTCTCCAAAGGTGCATACTTCTTAG 1740 Query 1784 GAAAAATGGTGTGGGCTAAAGGATACAGAGAACTAATAGATCTGATGGCTAAACACAAAA 1843 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1741 GAAAAATGGTGTGGGCTAAAGGATACAGAGAACTAATAGATCTGATGGCTAAGCACAAAA 1800 Query 1844 GCGAACTTGGGAGCTTCAATCTAGATGTATATGGGAACGGTGAAGATGCAGTCGAGGTCC 1903 ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1801 GCGAACTCGGGAGCTTCAATCTAGATGTCTATGGGAACGGTGAAGATGCAGTCGAAGTCC 1860 Query 1904 AACGTGCAGCAAAGAAACATGACTTGAATCTCAATTTCCTCAAAGGAAGGGACCACGCTG 1963 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1861 AACGTGCAGCAAAGAAACATGACTTAAATCTCAATTTCCTCAAAGGAAGGGACCACGCCG 1920 Query 1964 ACGATGCTCTTCACAAGTACAAAGTGTTCATAAACCCCAGCATCAGCGATGTTCTATGCA 2023 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1921 ACGATTCTCTTCACAAGTACAAAGTGTTCATAAACCCCAGCATCAGCGATGTTCTATGCA 1980 Query 2024 CAGCAACCGCAGAAGCACTAGCCATGGGGAAGTTTGTGGTGTGTGCAGATCACCCTTCAA 2083 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1981 CAGCAACCGCAGAAGCACTAGCCATGGGGAAGTTTGTGGTGTGTGCAGATCATCCTTCAA 2040 Query 2084 ACGAATTCTTTAGATCATTCCCGAACTGCTTAACTTACAAAACATCCGAAGACTTTGTGT 2143 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2041 ACGAATTCTTCAGATCATTCCCGAACTGCTTAACTTACAAAACATCCGAAGACTTTGTGT 2100 Query 2144 CCAAAGTGCAAGAAGCAATGACGAAAGAGCCACTACCTCTCACTCCTGAACAAATGTACA 2203 |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||| Sbjct 2101 CCAAAGTGAAAGAAGCAATGACGAAGGAGCCATTACCTCTCACTCCAGAGCAAATGTACA 2160 Query 2204 ATCTCTCTTGGGAAGCAGCAACACAGAGGTTCATGGAGTATTCAGATCTCGATAAGATCT 2263 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2161 ATCTCTCTTGGGAAGCAGCAACACAGAGGTTCATGGAGTATTCAGATCTCGATAAGATCT 2220 Query 2264 TAAACAATGGAGAGGGAGGAAGGAAGATGCGAAAATCAAGATCGGTTCCGAGCTTTAACG 2323 |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2221 TAAATGATGGAGATGGAGGAAGGAGGATGCGAAAATCAAGATCAGTTCCGAGCTTTAACG 2280 Query 2324 AGGTGGTCGATGGAGGATTGGCATTCTCACACTATGTTCTAACAGGGAACGATTTCTTGA 2383 || ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2281 AGATGGTCGATGGAGGGTTAGCATTCACACACTATGTTCTAACAGGGAACGATTTCTTGA 2340 Query 2384 GACTATGCACTGGAGCAACACCAAGAACAAAAGACTATGATAATCAACATTGCAAGGATC 2443 |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2341 GACTATGCACAGGAGCAACACCAAGAACAAAAGATTATGATAAGCAACATTGCAAGGATC 2400 Query 2444 TGAATCTCGTACCACCTCACGTTCACAAGCCAATCTTCGGCTGGTAGATATTTCCCCATA 2503 ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | Sbjct 2401 TGAATCTTGTTCCGCCTCACGTTCACAAGCCAATCTTTGGCTGGTAGATATTTCCCCAGA 2460 Query 2504 GGCCAC 2509 |||||| Sbjct 2461 GGCCAC 2466 > Ahg918607 jgi|Araly1|918607|Al_scaffold_0222_2 Length=1920 Score = 3112 bits (1685), Expect = 0.0 Identities = 1841/1919 (96%), Gaps = 0/1919 (0%) Strand=Plus/Plus Query 64 ATGGTAAAGGAAACTCTAATTCCTCCGTCATCTACGTCAATGACGACCGGAACATCTTCT 123 |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | | Sbjct 1 ATGGTAAAAGAAACTCTAATTCCTCCGTCTTCTACGTCAATGGCGACCGGTACGGCGACG 60 Query 124 TCTTCGTCTCTTTCAATGACGTTATCCTCAACAAACGCGTTATCGTTTTTGTCGAAAGGA 183 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 TCTTCGTCTCTTTCAATGACGTTGTCATCAACAAACGCGTTATCGTTTTTGTCGAAAGGT 120 Query 184 TGGAGAGAGGTATGGGATTCAGCAGATGCGGATTTGCAGCTGATGCGAGACAGAGCTAAC 243 ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 121 TGGAGAGAGGTATGGGATTCAGCGGATACGGATTTGCAGTTGATGCGAGACAGAGCTAAC 180 Query 244 TCTGTTAAGAATCTAGCATCAACGTTCGATAGAGAGATCGAGAATTTCCTCAATAACTCG 303 || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 181 TCCGTTAAGAATCTAGCATCGACGTTCGACAGAGAGATCGAGAATTTCCTCAATAATTCG 240 Query 304 GCGAGGTCTGCGTTTCCCGTTGGTTCACCATCGGCGTCGTCTTTCTCAAATGAAATTGGT 363 || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| Sbjct 241 GCCAGGTCTGCGTTTCCCGTCGGGTCACCATCGGCGTCTTCTTTCTCAAGTGAAATTGGT 300 Query 364 ATCATGAAGAAGCTTCAGCCGAAGATTTCGGAGTTTCGTAGGGTTTATTCGGCGCCGGAG 423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATCATGAAGAAGCTTCAGCCGAAGATTTCGGAGTTTCGTAGGGTTTATTCGGCGCCGGAG 360 Query 424 ATTAGTCGCAAGGTTATGGAGAGATGGGGACCTGCGAGAGCGAAGCTTGGAATGGATCTA 483 |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 361 ATTAGTCGTAAGGTTATGGAGAGATGGGGACCAGCGAGAGCGAAGCTGGGAATGGATCTA 420 Query 484 TCGGCGATTAAGAAGGCGATTGTGTCTGAGATGGAATTGGATGAGCGTCAGGGAGTTTTG 543 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 TCGGCGATTAAGAAGGCGATTGTGTCTGAGATGGAATTGGATGAGCGTCAGGGAGTTTTA 480 Query 544 GAGATGAGTAGATTGAGGAGACGGCGTAATAGTGATAGGGTTAGGTTTACGGAGTTTTTC 603 |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 GAGATGGGTAGATTGAGGAGACGGCGTAATAGTGACAGGGTTAGGTTTACGGAGTTTTTC 540 Query 604 GCGGAGGCTGAGAGAGATGGAGAAGCTTATTTCGGTGATTGGGAACCGATTAGGTCTTTG 663 ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 GCGGAGGCTGAGAGAGATGGAGAAGGTAATTTCGGTGATTGGGAACCGATTAGGTCTTTG 600 Query 664 AAGAGTAGATTTAAAGAGTTTGAGAAACGAAGCTCGTTAGAAATATTGAGTGGATTCAAG 723 |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 AAGACTAGATTTAAAGAGTTTGAGAAACGAAACTCGTTAGAAATATTGAGTGGATTCAAG 660 Query 724 AACAGTGAATTTGTTGAGAAGCTCAAAACCAGCTTTAAATCAATTTACAAAGAAACTGAT 783 ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 661 AACAGCGAATTTGTGGAGAAGCTCAAAACCAGCTTTAAATCAAGTTACAAAGAAACTGAT 720 Query 784 GAGGCTAAGGATGTCCCTCCGTTGGATGTACCTGAACTGTTGGCATGTTTGGTTAGACAA 843 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| Sbjct 721 GAGGCTAAGGATGTCCCTCCATTGGATGTACCTGAACTTTTGGCCTGTTTGGTTAGACAG 780 Query 844 TCTGAACCTTTTCTTGATCAGATTGGTGTTAGAAAGGATACATGTGACCGAATAGTAGAA 903 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| Sbjct 781 TCTGAACCTTTTCTTGATCAGATTGGTGTTAGAAAGGATATGTGCGACCGAATAGTAGAA 840 Query 904 AGCCTTTGCAAATGCAAGAGCCAACAACTTTGGCGTCTGCCATCTGCACAAGCATCCGAT 963 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 AGCCTTTGCAAATGCAAGAGCCAACACCTTTGGCGTCTGCCATCTGCACAAGCATCCGAT 900 Query 964 TTAATTGAAAATGATAACCATGGAGTTGATTTGGATATGAGGATAGCCAGTGTTCTTCAA 1023 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 TTAATTGAAAATGATAATCATGGAGTTGATTTGGATATGAGGATAGCCAGTGTTCTTCAA 960 Query 1024 AGCACAGGACACCATTATGATGGTGGGTTTTGGACTGATTTTGTGAAGCCTGAGACACCG 1083 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 961 AGCACAGGACACCATTATGATGGTGGCTTTTGGACTGATTTTGTGAAGCCTGAGACATCA 1020 Query 1084 GAAAACAAAAGGCATGTGGCAATTGTTACAACAGCTAGTCTTCCTTGGATGACCGGAACA 1143 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1021 GAAAATAAAAGGCATGTGGCAATTGTTACAACAGCTAGTCTCCCTTGGATGACCGGAACA 1080 Query 1144 GCTGTAAATCCGCTATTCAGAGCGGCGTATTTGGCAAAAGCTGCAAAACAGAGTGTTACT 1203 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1081 GCTGTAAATCCACTATTCAGAGCGGCGTATTTGGCAAAATCTGCAAAACAGAGTGTTACA 1140 Query 1204 CTCGTGGTTCCTTGGCTCTGCGAATCTGATCAAGAACTAGTGTATCCAAACAATCTCACC 1263 || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1141 CTTGTAGTTCCTTGGCTCTGCGAATCTGATCAAGAACTAGTTTATCCAAACAATCTCACC 1200 Query 1264 TTCAGCTCACCTGAAGAACAAGAGAGTTATATACGTAAATGGTTGGAGGAAAGGATTGGT 1323 || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 TTTAGTTCACCTGAAGAACAAGAGAGCTATATACGTAAATGGTTGGAGGAAAGGATTGGT 1260 Query 1324 TTCAAGGCTGATTTTAAAATCTCCTTTTACCCAGGAAAGTTTTCAAAAGAAAGGCGCAGC 1383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1261 TTCAAGGCTGATTTTAAAATCTCCTTTTACCCAGGAAAGTTTTCAAAAGAAAGGCGTAGC 1320 Query 1384 ATATTTCCTGCTGGTGACACTTCTCAATTTATATCGTCAAAAGATGCTGACATTGCTATA 1443 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 ATATTTCCTGCTGGTGACACTTCTCAATTTATATCGTCAAAAGATGCTGACATTGCTATA 1380 Query 1444 CTTGAAGAACCTGAACATCTCAACTGGTATTATCACGGCAAGCGTTGGACTGATAAATTC 1503 |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1381 CTTGAAGAACCTGAGCATCTCAACTGGTACCATCACGGCAAGCGTTGGACCGATAAATTC 1440 Query 1504 AACCATGTTGTTGGAATTGTCCACACAAACTACTTAGAGTACATCAAGAGGGAGAAGAAT 1563 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1441 AACCATGTTGTTGGAATTGTCCACACAAACTACTTAGAGTACATCAAGAGGGAGAAGAAT 1500 Query 1564 GGAGCTCTTCAAGCATTTTTTGTGAACCATGTAAACAATTGGGTCACACGAGCGTATTGT 1623 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1501 GGAGCTCTTCAAGCATTTTTTGTGAATCATGTAAACAATTGGGTCACACGAGCATATTGT 1560 Query 1624 GACAAGGTTCTTCGCCTCTCTGCGGCAACACAAGATTTACCAAAGTCTGTTGTATGCAAT 1683 |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1561 GACAAGGTTCTTCGTCTCTCTGGGGCAACACAAGATTTACCAAAATCTGTTGTATGCAAT 1620 Query 1684 GTCCATGGTGTCAATCCCAAGTTCCTTATGATTGGGGAGAAAATTGCTGAAGAGAGATCC 1743 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1621 GTCCACGGTGTCAATCCCAAGTTCCTTATGATTGGGGGGAAAATTGCTGAAGAGAGATCC 1680 Query 1744 CGTGGTGAACAAGCTTTCTCAAAAGGTGCATACTTCTTAGGAAAAATGGTGTGGGCTAAA 1803 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1681 CGTGGTGAACAAGCTTTCTCCAAAGGTGCATACTTCTTAGGAAAAATGGTGTGGGCTAAA 1740 Query 1804 GGATACAGAGAACTAATAGATCTGATGGCTAAACACAAAAGCGAACTTGGGAGCTTCAAT 1863 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1741 GGATACAGAGAACTAATAGATCTGATGGCTAAGCACAAAAGCGAACTTGGGAGCTTCAAT 1800 Query 1864 CTAGATGTATATGGGAACGGTGAAGATGCAGTCGAGGTCCAACGTGCAGCAAAGAAACAT 1923 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1801 CTAGATGTCTATGGGAACGGTGAAGATGCAGTCGAAGTCCAACGTGCAGCAAAGAAACAT 1860 Query 1924 GACTTGAATCTCAATTTCCTCAAAGGAAGGGACCACGCTGACGATGCTCTTCACAAGTA 1982 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1861 GACTTAAATCTCAATTTCCTCAAAGGAAGGGACCACGCCGACGATGCTCTTCACAAGTA 1919 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 101358141945 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5