BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G12810.1
Length=6848
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg478644 jgi|Araly1|478644|fgenesh2_kg.3__1345__AT3G12810.1 1.081e+04 0.0
> Ahg478644 jgi|Araly1|478644|fgenesh2_kg.3__1345__AT3G12810.1
Length=6691
Score = 1.081e+04 bits (5851), Expect = 0.0
Identities = 6439/6718 (96%), Gaps = 59/6718 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 148 TTGGAATTTTCTACATCTGTTTGCGCCGCGAGCTCGGGTTTCTTTCTCTCTGAAGCAGAG 207
|||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | | |||||||| ||
Sbjct 7 TTGGAATTTTCTACATCTATTTGCGCCGCTAGCTCGGGTTTC--T-T-TCTGAAGC--AG 60
Query 208 GCTCTTCTAGATTaaaaaaaaaaaaaaTCTCAAAACCAAAGCTTCTTCCtttttttACCA 267
|||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 61 GCTCTTCTGGATT----AAAAAAAAAATCTCAAAACCAAAGCTTCTTCC-TTTTTTACAA 115
Query 268 A----TTCGTATCTCCCA-TTTTTAGTTTTCTTCGATCTCAAATCACACCATCTTAGTAA 322
| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 116 ATTCGTTCGTATCTCCCATTTTTTATTTTTC-TCGATCTCCTATCACATCATCTTAGTAA 174
Query 323 GAATGAAGTGAAGAGATTTGAGAAGaaaaaaaaCACTAATCTTGTTCCCGTTCGATTCTT 382
||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 GAATGAAGTGAAGAGATTT---CAG---AAAAA-TCTAATCTTGTTCCCGTTCGATTC-- 225
Query 383 GAGGAAAACAAATTTCAGCTAGATTTAAGATTTGGAATCGAATATTACTGTAATGTTTTG 442
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 226 GAGGAAAACAAATTTCAGCTAGATTTGAGATTTGGAATCGAAAATTACTGTAATGTTTTG 285
Query 443 GGTGACGGGAACCTAGTGATGAAATCGTTGCTTGGGtttttttGCGCTGAAGTGGAAACC 502
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 286 GGTGAC-GGAACCTAGTGATGAAATCTTTGCTTGGGTTTTTTTGCGCTGAAGTGGAAACC 344
Query 503 CTAATTTCTTGGGCTTTGTGCAGTCACACAGTTTGCACTCTGCAGTCACTAACCATCTTC 562
||||||||| |||||||||| | || || | |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 345 CTAATTTCTCGGGCTTTGTGTACTCGCAAACTTTGCACTCTGCAGTCACTAGTCATCTTC 404
Query 563 -T---TCTTGGAAGATTTTGCTTAAAGGCGTTAGT-AATGGCGTCTAAAGGTGGTAAATC 617
| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 405 TTCGCTCTTTGAAGATTTTGCTTAGAGGCGTTAGTAAATGGCGTCTAAAGGTGGGAAATC 464
Query 618 TAAACCTGATATAGTAATGGCGTCC-AAGAGTGGGAAATCTAAACCTGATAATGAATCCA 676
||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 465 TAAACCTGATATAGTAATGGCGTCCAAAG-GTGGCAAATCTAAACCTGATAATGACTCCA 523
Query 677 GAGCTAAGCGTCAGAAGACGCTCGAAGCTCCTAAAGAACCACGTCGTCCTAAAACTCACT 736
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 524 GAGCTAAACGTCACAAGACGCTCGAAGCTCCTAAAGAACCACGTCGCCCGAAAACTCACT 583
Query 737 GGGACCATGTATTGGAGGAGATGGCTTGGCTGTCAAAGGACTTTGAGTCTGAGAGGAAAT 796
|||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 584 GGGACCATGTTTTGGAGGAGATGGCTTGGCTCTCAAAGGACTTTGAGTCTGAGAGGAAGT 643
Query 797 GGAAGCTGGCGCAGGCGAAGAAGGTTGCTTTGAGAGCCAGCAAAGGAATGCTAGATCAGG 856
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 644 GGAAGCTGGCGCAGGCGAAGAAGGTTGCTTTGAGGGCCAGCAAAGGAATGCTAGATCAGG 703
Query 857 CATCTAGGGAAGAAAGGAAGCTAAAGGAAGAAGAACAGCGACTTCGGAAAGTAGCCCTCA 916
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||
Sbjct 704 CATCTAGGGAAGAAAGGAAGCTAAAGGAAGAAGAACAGCGGCTACGGAAAGTAGCTCTCA 763
Query 917 ATATCTCGAAAGACATGAAAAAGTTTTGGATGAAAGTTGAGAAGCTGGTGCTTTACAAGC 976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 764 ATATCTCGAAAGACATGAAAAAGTTTTGGATGAAAGTAGAGAAGCTGGTGCTTTACAAGC 823
Query 977 ATCAGTTGGTACGCAATGAGAAGAAGAAGAAGGCTATGGACAAGCAACTTGAATTTCTGT 1036
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 824 ATCAGCTGGTACGCAATGAGAAGAAGAAGAAGGCTATGGACAAGCAACTTGAATTTCTGT 883
Query 1037 TAGGCCAAACTGAGAGGTACTCAACCATGTTGGCAGAAAATTTAGTGGAGCCTTATAAAC 1096
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 884 TAGGCCAAACTGAGAGGTACTCAACCATGTTGGCCGAAAATTTAGTGGAGCCTTATAAAC 943
Query 1097 AGGGCCAAAATACTCCTTCAAAACCTCTACTAACTATCGAATCAAAAAGTGATGAGGAGA 1156
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 944 AGGGCCAAAATACTCCTTCAAAACCTCTACTAGCTATCGAATCAAAAAGTGACGAGGAGA 1003
Query 1157 GGGCAGAACAGATACCTCCAGAGATAAATTCTTCTGCAGGTCTTGAATCAGGAAGTCCTG 1216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004 GGGCAGAACAGATACCTCCAGAGATAAATTCTTCTGCAGGTCTTGAATCAGGAAGTCCTG 1063
Query 1217 AACTCGATGAGGATTATGATCTAAAATCTGAGGATGAGACCGAAGATGATGAAGATACTA 1276
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064 AACTCGATGAGGACTATGATCTAAAATCCGAGGATGAGACCGAAGATGATGAAGATACTA 1123
Query 1277 TTGAGGAGGATGAAAAACACTTCACCAAACGTGAAAGACAGGAAGAGTTGGAAGCTTTGC 1336
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124 TTGAGGAGGATGAAAAACACTTCACCAAACGGGAAAGACAGGAAGAGTTGGAAGCTTTGC 1183
Query 1337 AAAATGAAGTGGATCTACCAGTTGAGGAGCTGCTCAGACGTTATACCT-CTGGAAGAGTT 1395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1184 AAAATGAAGTGGATCTACCAGTTGAGGAGCTGCTCAGACGTTATA-CTGCTGGAAGAGTT 1242
Query 1396 AGCCGAGAAACCAGCCCAGTAAAAGATGAAAATGAGGACAATCTGACCTCAGTTAGCCGA 1455
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1243 AGCCGAGAAACCAGCCCAGTAAAAGATGAAAATGTGGACAATCTGGCCTCAGTTAGCCGA 1302
Query 1456 GTAACCAGCCCAGTAAAAGATGAAAATCAGGACAATCTGGCCTCAGTAGGTCAAGATCAT 1515
| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303 GAAACCAGCCCAGTAAAAGATGAAAATGAGGACAATCTGGCCTCAGTAGGTCAAGATCAT 1362
Query 1516 GGAGAGGACAAGAACAATCTTGCAGCTTCTGAAGAAACTGAAGGGAACCCAAGTGTTCGT 1575
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1363 GGAGAGGACAAGAACAATCTTACAGCTTCTGAAGAAACTGAAGGGAACCCAAGTGTTCGT 1422
Query 1576 CGTTCTAATGATAGCTATGGTCATTTGGCAATATCCGAGACCCATTCACATGACCTTGAG 1635
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1423 CGTTCTAATGATAGCTATGGCCATTTGGCAATATCTGAGACCCATTCTCATGACCTCGAA 1482
Query 1636 CCAGGCATGACGACTGCATCTGTGAAGTCCAGAAAGGAAGATCATACCTATGATTTTAAC 1695
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1483 CCAGGCATGACGACTGCATCTGTGAAGTCCAGAAAGGAAGATCATACCTATGATTTCAAT 1542
Query 1696 GATGAACAGGAAGATGTTGACTTTGTTCTTGCCAATGGTGAGGAAAAGGATGATGAGGCG 1755
||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 1543 GATGAACTGGAAGATGTTGACTTTGTTGTTGCCACTGGTGAGGAGAAGGATGATGAGACA 1602
Query 1756 ACATTGGCTGTCGAAGAGGAACTGGCGAAAGCAGATAATGAAGATCATGTCGAAGAGATT 1815
||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 1603 ACATTGGCTATCGAAGAGGAATTGGCGAAAGCTGATAATGAAGACCATGTGGAAGAGATT 1662
Query 1816 GCCCTGCTGCAAAAAGAGAGTGAAATGCCTATTGAAGTACTACTTGCAAGGTATAAGGAG 1875
|| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1663 GCTCTGCTGCAAAAAGAGAATGAAATGCCTATTGAAGTACTACTTGCAAGGTATAAGGAG 1722
Query 1876 GATTTCGGTGG-CAAGGATATATCTGAGGATGAATCTGAATCTTCATTTGCTGTATCTGA 1934
|||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||
Sbjct 1723 GATTTCGG-GGACAAGGATATATCTGAGGATGACTCTGAATATTCATGTGCTCAATCTGA 1781
Query 1935 AGACTCTATAGTAGACTCTGACGAAAATAGGCAGCAAGCTGATTTAGATGATGACAACGT 1994
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||
Sbjct 1782 AGACTCTATAGTAGACTCTGACGAAAATAGGCAGCAAGCTGATTCAGATAATGAAAACGT 1841
Query 1995 TGATTTAACAGAATGTAAGCTAGATCCAGAGCCTTGCTCAGAAAATGTTGAAGGCACATT 2054
||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 TGATTCAACAGAATGTAAGCCAGATCCAGAGCCTTGCTCAGAAAATGTTGAAGGCACATT 1901
Query 2055 CCATGAAGTAGCAGAAGATAATGATAAAGATAGTAGTGATAAAATTGCTGATGCAGCAGC 2114
||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1902 CCATGAAATAACAGAAGATAATGGTAAAGATAGTAGTGATAAAATTGCTGATGCAGCAGC 1961
Query 2115 AGCAGCAAGATCTGCCCAGCCAACTGGATTTACATACTCCACAACAAAAGTTCGAACGAA 2174
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1962 AGCAGCAAGATCTGCGCAGCCAACTGGATTTACATACTCCACAACAAAAGTTCGAACGAA 2021
Query 2175 ACTGCCGTTTCTACTTAAGCATTCTCTGCGTGAGTACCAACACATTGGTTTGGACTGGCT 2234
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2022 ACTGCCGTTTCTACTCAAGCATTCTCTGCGTGAGTACCAACACATTGGTTTGGACTGGCT 2081
Query 2235 TGTCACGATGTATGAGAAAAAGTTGAACGGTATTCTGGCTGATGAAATGGGTCTTGGAAA 2294
|||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2082 TGTCACGATGTATGAGAAAAGGCTGAACGGTATTCTGGCTGATGAAATGGGTCTTGGAAA 2141
Query 2295 GACAATTATGACCATTGCTCTTCTAGCTCACCTTGCATGTGATAAGGGAATATGGGGTCC 2354
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2142 GACAATTATGACCATTGCTCTTCTAGCACACCTCGCATGTGATAAGGGGATATGGGGTCC 2201
Query 2355 CCATCTGATTGTGGTTCCTACAAGTGTGATGCTTAATTGGGAGACTGAGTTTCTTAAATG 2414
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2202 CCATCTGATTGTGGTTCCAACAAGTGTGATGCTTAATTGGGAGACTGAGTTTCTTAAATG 2261
Query 2415 GTGTCCTGCATTTAAAATTCTCACCTACTTTGGTAGTGCAAAGGAGCGGAAACTCAAGAG 2474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2262 GTGTCCTGCATTTAAAATTCTCACCTACTTTGGTAGTGCAAAGGAGCGGAAACTCAAGAG 2321
Query 2475 ACAAGGATGGATGAAGCTTAACTCATTTCATGTATGCATAACAACCTATAGGCTAGTTAT 2534
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2322 ACAAGGATGGATGAAGCTTAACTCATTTCATGTATGCATAACGACCTATAGGCTAGTTAT 2381
Query 2535 TCAGGACAGTAAAATGTTCAAGCGCAAGAAGTGGAAATACTTGATTCTTGACGAAGCCCA 2594
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2382 TCAAGACAGTAAAATGTTCAAGCGCAAGAAGTGGAAATATTTGATTCTTGACGAAGCCCA 2441
Query 2595 TTTAATTAAGAATTGGAAGTCTCAGAGATGGCAGACACTATTGAACTTCAATTCTAAACG 2654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442 TTTAATTAAGAATTGGAAGTCTCAGAGATGGCAGACACTATTGAACTTCAATTCTAAACG 2501
Query 2655 CAGAATTTTGTTGACTGGTACACCCCTGCAGAATGATCTTATGGAACTGTGGTCACTTAT 2714
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2502 CAGAATTTTGTTGACTGGTACACCACTGCAGAATGATCTTATGGAATTGTGGTCACTTAT 2561
Query 2715 GCACTTTCTGATGCCACATGTCTTTCAGTCTCACCAGGAATTCAAAGACTGGTTCTGTAA 2774
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2562 GCATTTTCTGATGCCACATGTTTTTCAGTCTCACCAGGAATTCAAAGATTGGTTCTGTAA 2621
Query 2775 CCCAATAGCAGGGATGGTCGAGGGACAAGAAAAAATCAACAAAGAAGTTATTGATCGCTT 2834
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2622 CCCGATAGCAGGGATGGTTGAGGGACAAGAAAAAATCAACAAAGAAGTTATTGATCGCTT 2681
Query 2835 ACATAATGTCCTCCGTCCTTTCCTTCTACGGCGCCTAAAAAGGGATGTGGAGAAGCAACT 2894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2682 ACATAATGTCCTCCGTCCTTTCCTTCTACGGCGCCTAAAAAGGGATGTGGAGAAGCAACT 2741
Query 2895 TCCTTCGAAACATGAGCATGTTATTTTCTGTAGACTGTCTAAGAGGCAGCGCAACTTGTA 2954
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2742 TCCTTCGAAACATGAGCATGTTATTTTCTGTAGACTGTCTAAGAGGCAACGCAACTTGTA 2801
Query 2955 TGAGGACTTCATAGCAAGCACAGAAACACAGGCTACGCTTACCAGTGGAAGCTTTTTTGG 3014
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2802 TGAGGACTTCATAGCGAGCACAGAAACACAGGCTACGCTTAACAGTGGAAGCTTTTTTGG 2861
Query 3015 GATGATAAGTATCATAATGCAGTTGCGGAAAGTTTGTAATCATCCTGATCTCTTTGAGGG 3074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2862 GATGATAAGTATCATAATGCAGTTGCGGAAAGTTTGTAATCATCCTGATCTCTTTGAGGG 2921
Query 3075 TCGTCCTATTGTAAGTTCTTTTGATATGGCTGGCATTGATGTGCAGTTGAGTTCAACAAT 3134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2922 TCGTCCTATTGTAAGTTCTTTTGATATGGCTGGCATTGATGTGCAGTTGAGTTCAACGAT 2981
Query 3135 CTGTTCGCTACTATTGGAAAGTCCGTTTTCCAAGGTTGATCTTGAGGCTTTGGGATTCTT 3194
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2982 CTGTTCGCTGCTTTTGGAAAGTCCGTTTTCCAAGGTTGATCTTGAGGCTTTGGGATTCTT 3041
Query 3195 ATTCACCCATCTTGATTTTTCTATGACTTCTTGGGAAGGAGATGAGATCAAAGCTATTTC 3254
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3042 ATTCACCCATCTTGATTTTTCGATGACTTCTTGGGAAGGAGATGAGATAAAAGCTATTTC 3101
Query 3255 AACACCCTCAGAATTAATCAAACAGCGTGTGAACTTGAAGGATGATCTAGAAGCAATCCC 3314
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 3102 AACACCCTCAGAATTAATCAAACAGCGTGTGAACTTGAAGGATGATATGGAAGCAATCCC 3161
Query 3315 TTTGAGTCCAAAAAACCGCAAAAATCTGCAAGGGACAAATATTTTTGAAGAAATTCGTAA 3374
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3162 TTTGAGTTTGAAAAACCGCAAAAATCTGCAAGGGACAAATATTTTTGAAGAAATTCGTAA 3221
Query 3375 GGCTGTCTTTGAGGAAA-GGATACAAGAATCTAAGGATCGGGCAGCAGCCATTGCATGGT 3433
|||||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3222 GGCTGTTTTTGAGGAAAGGGTTA-AAGAAACTAAGGATCGGGCAGCAGCCATTGCCTGGT 3280
Query 3434 GGAATTCTTTGAGATGCCAGAGAAAGCCGACTTACTCTACATCACTAAGAACTCTTTTAA 3493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 3281 GGAATTCTTTGAGATGCCAGAGAAAGCCGACTTACTCTACATCTCTAAGAACTCTTTTGA 3340
Query 3494 CCATTAAGGGTCCTCTTGATG---------ATCTTAAAGCTAACTGTTCATCTTACATGT 3544
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3341 CCATTAAGGGTCCTCTTGATGATATACACCATCTTAAAGCTAACTGTTCATCTTACATGT 3400
Query 3545 ATTCATCAATCCTCGCTGACATAGTCCTTTCACCAATCGAGCGTTTTCAG-AAGATGATT 3603
|||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 3401 ATTCCTCAATCCTCGCTGACATAGTTCTTTCACCGATCGAGCGTTTTCAGCAA-ATGATT 3459
Query 3604 GAGCTAGTTGAAGCTTTCACATTTGCGATTCCAGCTGCACGAGTGCCTTCACCTACTTGC 3663
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3460 GAGCTAGTTGAAGCTTTCACATTTGCGATTCCAGCTGCACGAGTGCCTTCACCTGCTTGC 3519
Query 3664 TGGTGCAGTAAAAGTGACTCTCCTGTTTTTCTTAGTCCATCGTACAAGGAAAAAGTTACA 3723
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 3520 TGGTGCAGCAAAAGTGACTCTCCTGTTTTTCTTAGTCCATCATACAAGGAGAAAGTTACA 3579
Query 3724 GATTTATTGTCACCTCTTTTATCTCCAATTAGACCTGCAATCGTTAGGAGACAAGTATAT 3783
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3580 GATTTATTGTCACCTCTTTTATCTCCGATTAGACCTGCAATCGTTAGGAGACAAGTATAT 3639
Query 3784 TTTCCAGATAGGCGACTGATACAGTTTGATTGTGGTAAGCTGCAGGAGCTTGCTATGTTA 3843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3640 TTTCCAGATAGGCGACTGATACAGTTTGATTGTGGTAAGCTGCAGGAGCTTGCTATGTTA 3699
Query 3844 TTGAGGAAATTAAAATTTGGGGGTCACAGAGCGTTGATATTCACGCAAATGACCAAGATG 3903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3700 TTGAGGAAATTAAAATTTGGGGGTCACAGAGCGTTGATATTCACGCAAATGACCAAGATG 3759
Query 3904 CTTGACGTCTTGGAGGCTTTCATTAATTTATATGGTTATACCTACATGCGTCTTGATGGC 3963
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3760 CTTGACGTCTTGGAGGCTTTCATTAATTTATATGGTTATACCTACATGCGTCTTGACGGC 3819
Query 3964 TCTACACCTCCAGAAGAGAGGCAGACGTTAATGCAGCGGTTTAATACAAATCCCAAGATC 4023
||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3820 TCTACTCCACCAGAAGAGAGGCAGACATTAATGCAGCGGTTTAATACAAATCCCAAGATC 3879
Query 4024 TTTCTTTTCATTTTGTCAACCCGAAGTGGGGGCGTTGGCATCAACCTTGTGGGTGCGGAC 4083
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3880 TTTCTTTTCATTTTGTCAACCCGTAGTGGGGGCGTTGGCATCAACCTTGTGGGTGCGGAC 3939
Query 4084 ACAGTTATATTCTATGACAGTGACTGGAATCCTGCTATGGATCAACAAGCTCAAGATCGC 4143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3940 ACAGTTATATTCTATGACAGTGACTGGAATCCTGCTATGGATCAACAAGCTCAAGATCGC 3999
Query 4144 TGCCACAGGATAGGTCAGACACGTGAAGTGCATATATACCGGTTGATAAGTGAGAGCACC 4203
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4000 TGCCACAGGATAGGTCAGACACGTGAAGTGCATATTTACCGGTTGATAAGTGAGAGCACC 4059
Query 4204 ATTGAGGAGAATATCTTAAAGAAAGCAAACCAGAAGCGTGTGCTTGATAACCTAGTAATT 4263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4060 ATTGAGGAGAATATCTTAAAGAAAGCAAACCAGAAGCGTGTGCTTGATAACCTAGTAATT 4119
Query 4264 CAAAACGGTGAGTATAACACCGAATTTTTCAAGAAGCTCGATCCCATGGAATTGTTCTCT 4323
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4120 CAAAACGGAGAGTATAACACCGAATTTTTCAAGAAGCTCGATCCAATGGAATTGTTCTCT 4179
Query 4324 GGGCATAAGGCTCTGACTACAAAGGATGAAAAGGAAACAAGCAAGCATTGTGGGGCGGAT 4383
|| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 4180 GGACATAAGACTCTGACTACAAAGGATGAAAAGGAAACAAGCAAAAATTGCGGGGCGGAG 4239
Query 4384 ATACCTCTATCAAATGCAGATGTTGAGGCTGCTCTAAAACAGGCCGAAGATGAGGCAGAT 4443
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4240 ATACCTCTGTCAAATGCAGATGTTGAGGCTGCTTTAAAACAGGCAGAAGATGAGGCAGAT 4299
Query 4444 TATATGGCTCTCAAAAGAGTAGAACAAGAAGAAGCTGTGGACAATCAAGAGTTCACAGAA 4503
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4300 TATATGGCTCTTAAAAGAGTAGAACAAGAAGAAGCTGTGGACAATCAAGAGTTTACAGAA 4359
Query 4504 GAACCTGTAGAGAGACCAGAAGACGATGAGCTAGTAAATGAAGATGACATAAAGGCTGAT 4563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4360 GAACCTGTAGAGAGACCAGAAGACGATGAGCTAGTAAATGAAGATGACATAAAGGCTGAT 4419
Query 4564 GAGCCTGCTGATCAAGGTTTAGTTGCAGCAGGGCCGGCCAAAGAAGAAATGTCATTGTTA 4623
|||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4420 GAGCCTGCTGATCATGGTTTAGTTGCAGCCGGGTTGGCCAAAGAAGAAATTTCATTGTTA 4479
Query 4624 CATAGTGATATCAGGGATGAGAGAGCTGTTATCACTACTTCAAGCCAAGAAGATGACACT 4683
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4480 CATAGTGATATCAGGGATGAGAGAGCTGTAATCACTACTTCAAGCCAAGAAGATGACGCT 4539
Query 4684 GATGTATTAGATGATGTCAAGCAAATGGCTGCAGCAGCGGCTGATGCTGGACAAGCTATC 4743
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4540 GATGTGTTAGATGATGTCAAGCAAATGGCTGCAGCAGCCGCTGATGCTGGACAAGCTATC 4599
Query 4744 TCATCTTTTGAGAATCAGCTACGTCCTATTGATAGATATGCGATTAGATTTTTAGAGCTT 4803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4600 TCATCTTTTGAGAATCAGCTACGTCCTATTGATAGATATGCGATTAGATTTTTAGAGCTT 4659
Query 4804 TGGGACCCCATCATTGTTGAGGCTGCAATGGAAAATGAAGCAGGATTTGAAGAGAAAGAA 4863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4660 TGGGACCCCATCATTGTTGAGGCTGCAATGGAAAATGAAGCGGGATTTGAAGAGAAAGAA 4719
Query 4864 TGGGAACTTGACCACATTGAGAAGTACAAGGAGGAAATGGAAGCTGAGATTGATGATGGG 4923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4720 TGGGAACTTGACCACATTGAGAAGTACAAGGAGGAAATGGAAGCTGAGATTGATGATGGG 4779
Query 4924 GAAGAGCCTCTTGTTTACGAGAAATGGGATGCTGATTTTGCAACTGAGGCATACAGGCAG 4983
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4780 GAAGAGCCTCTTGTTTACGAGAAATGGGATGCTGATTTTGCAACCGAGGCATACAGGCAG 4839
Query 4984 CAAGTGGAAGTCTTAGCTCAGCACCAGTTAATGGAAGATTTGGAAAATGAAGCTAGAGAG 5043
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4840 CAAGTGGAAGTCTTAGCTCAGCACCAGTTGATGGAAGATTTGGAAAATGAAGCTAGAGAG 4899
Query 5044 AGGGAAGCGGCAGAGGTGGCTGAAATGGTTTTGACACAGAACGAAAGTGCTCATGTACTG 5103
|||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4900 AGGGAAGCTGCAGAGGTGGCTGATATGGATTTGACACAGAACGAAAGTGCTCATGTACCG 4959
Query 5104 AAGCCTAAGAAGAAGAAAAAGGCGAAGAAAGCCAAATATAAATCCCTGAAGAAAGGATCA 5163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4960 AAGCCTAAGAAGAAGAAAAAGGCGAAGAAAGCCAAATATAAATCCCTGAAGAAAGGATCA 5019
Query 5164 CTGGCTGCCGAATCAAAACATGTGAAGTCAGTTGTGAAAATTGAAGATTCTACTGATGAT 5223
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5020 CTGGCTGCCGAAGCAAAACATGTGAAGTCAGTTGTGAAAATTGAAGATTCGACTGATGAT 5079
Query 5224 GATAATGAAGAATTCGGCTATGTGAGTAGCAGTGACTCGGATATGGTTACACCGCTTTCG 5283
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5080 GATAATGAAGAATTCGGCTATGTGAGTAGCAGTGACTCAGATATGGTTACACCGCTTTCG 5139
Query 5284 CGGATGCATATGAAGGGCAAGAAAAGAGATTTAATTGTTGACACTGATgaagagaagacc 5343
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 5140 CGGATGCATATGAAAGGCAAGAAAAGAGATTTAATTGTTGACACTGAAGAAGAGAAAACC 5199
Query 5344 tcaaagaagaaagcaaagaagcacaagaagTCTCTCCCGAATTCAGATATCAAATATAAG 5403
|| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5200 TCGCAGAAGAAAGCAAAGAAGCACAAGAAGTCTATTCCGAATTCAGATATCAAATATAAG 5259
Query 5404 CAAACAAGTGCACTACTTGATGAACTGGAACCATCAAAGCCGTCTGACAGTATGGTTGTT 5463
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5260 CAAACAAGTGCTCTACTTGAGGAACTGGAACCATCAAAGCAGTCTGACAGTATGGTTGTT 5319
Query 5464 GATAATGAGTTGAAATTGACGAACAGGGGTAAAACTGTAGGGAAAAAATTCATCACTTCC 5523
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5320 GATAATGAATTGAAACTGACGAACAGGGGTAAAACTATAGGGAAAAAATTCATCACTTCC 5379
Query 5524 ATGCCAATAAAGCGTGTTCTTATGATCAAGCCAGAGAAATTGAAGAAAGGAAATCTGTGG 5583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5380 ATGCCAATAAAGCGTGTTCTTATGATCAAGCCAGAGAAATTGAAGAAAGGAAATCTGTGG 5439
Query 5584 TCTAGAGATTGTGTTCCCTCGCCTGATTCTTGGTTGCCGCAGGAAGATGCTATATTGTGT 5643
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 5440 TCTAGAGATTGTGTTCCCTCGCCTGATTCTTGGTTGCCTCAGGAAGACGCTATATTGTGT 5499
Query 5644 GCCATGGTTCATGAATATGGGCCTAACTGGAATTTTGTTAGCGGAACTCTTTATGGAATG 5703
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5500 GCCATGGTTCATGAATATGGGCCTAATTGGAATTTGGTTAGCGGAACTCTTTATGGAATG 5559
Query 5704 ACAGCTGGTGGGGCTTACAGAGGACGGTATCGGCATCCTGCATATTGTTGTGAGAGATAT 5763
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5560 ACAGCTGGTGGGGCTTACAGAGGACGGTATCGACATCCTGCATATTGTTGTGAGAGATAT 5619
Query 5764 AGAGAGCTTATTCAACGACATATTTTGTCTGCTTCCGACAGTGCAGTGAACGAGAAGAAC 5823
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5620 AGAGAGCTTATCCAACGACATATTTTGTCTGCTTCCGACAGTGCAGTGAACGAGAAGAAC 5679
Query 5824 CTCAACACAGGTTCTGGGAAGGCTCTCCTTAAAGTCACTGAGGAAAATATTCGGACACTC 5883
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5680 GTCAACACAGGTTCTGGGAAGGCTCTCCTTAAAGTCACTGAGGAAAATATTCGGACACTC 5739
Query 5884 CTAAATGTTGCAGCTGAGCAGCCAGATACGGAGATGCTCCTACAAAAACATTTTTCTTGC 5943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5740 CTAAATGTTGCAGCTGAGCAGCCAGATACGGAGATGCTCCTACAAAAACATTTTTCTTGC 5799
Query 5944 TTGCTGTCATCAATTTGGAGGACGTCTACCCGCACTGGGAATGATCAAATGCTCTCCTTA 6003
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5800 TTGCTGTCATCAATTTGGAGGACGTCGACCCGAACTGGGAATGATCAAATGCTCTCCTTA 5859
Query 6004 AACAGTCCTATTTTCAACAGACAGTTTATGGGTTCCGTGAATCACACCCAAGATTTAGCT 6063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 5860 AACAGTCCTATTTTCAACAGACAGTTTATGGGTTCCGTGAATCGCACCCAAGATTTAGCT 5919
Query 6064 AGAAAGCCTTGGCAGGGGATGAAGGTCACCAGCTTAAGTAGAAAGTTGTTAGAATCCGCT 6123
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5920 AGAAAGCCTTGGCAGGGGATGAAGGTCACCAGCTTAAGTAGAAAGTTGTTAGAATCTGCT 5979
Query 6124 CTCCAGGATTCTGGCCCGAGTCAGCCAGACAATACTATTTCCCGTTCTAGGTTGCAGGAG 6183
||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 5980 CTCCAGGATTCCGGCACGAGTCAACCAGACGATACTGTTTCCCGTTCTAGGTTGCAGGAG 6039
Query 6184 ACTCAACCTATCAATAAATTGGGATTAGAGTTAACCTTGGAATTCCCACGTGGCAATGAT 6243
| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 6040 AATCAACCTATCAATAAAGTGGGATTAGACTTAACCTTGGAATTCCCACGCGGCAAAGAT 6099
Query 6244 GATTCCCTGA-ATCAGTTTCCACCGATGATTAGTCTGTCCATTGATGGGTCAGATTCATT 6302
|||||||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 6100 GATTCCCTGACA-CAGTTTCCACCCATGATAAATCTGTCCATTGATGAGTCAGATTCATT 6158
Query 6303 AAATTATGTGAACGAGCCCCCAGGGGAAGATGTTCTAAAAGGTTCTAGGGTTGCTGCAGA 6362
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6159 AAATTATGTGAATGAGCCCCCAGGGGAAGATGTTCTAAAAGGTTCTAGGGTTGCTGCAGA 6218
Query 6363 GAACCGTTACAGGAATGCTGCAAATGCTTGTATTGAAGATTCATTTGGATGGGCTTCAAA 6422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6219 GAACCGTTACAGGAATGCTGCAAATGCTTGTATTGAAGATTCATTTGGATGGGCTTCAAA 6278
Query 6423 CACGTTCCCAGCCAATGATCTGAAGTCAAGAACAGGCACGAAAGCACAGTCCCTGGGGAA 6482
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 6279 CACGTTCCCAGCCAATGATCTGAAGTCAAAAACAGGCACGAAAACACAGTCCCTGGGGAA 6338
Query 6483 ACACAAGCTATCCGCCTCAGACTCAGCCAAGTCTACAAAAAGCAAACACCGCAAACTCTT 6542
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6339 ACACAAGCTATCCGGCTCAGACTCAGCCAAGTCTACAAAAAGCAAACACCGCAAACTCTT 6398
Query 6543 AGCAGAGCAATTGGAAGGGGCATGGGTTAGGCCAAATGATCCGAATCTCAAGTTTGATTT 6602
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6399 AGCAGAGCAATTGGAAGTGGCATGGGTTAGGCCAAATGACCCGAATCTCAAGTTTGATTT 6458
Query 6603 CACACCTGGTGATagggaggaggaggaggagcaggaggTGGATGAGAAAGCGAATTCAGC 6662
|||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 6459 CACACCTGCTGATAGGGAGGACGAGGAG---CAGGAGGTGGAGGAGAAAGCGGTTTCAGA 6515
Query 6663 AGAGATAGAGATGATAAGCTGTTCACAATGGTATGATCCATTCTTTACCTCAGGCCTTGA 6722
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6516 AGAGATAGAGATGATAAGTTGTTCACAATGGTATGATCCATTCTTTACCTCAGGCCTTGA 6575
Query 6723 TGATTGCTCATTAGCTTCGGATATCTCAGAAATAGAGTAGTAAAAAAGCCTTTT-GTAAA 6781
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 6576 TGATTGCTCATTAGCTTCGGATATCTCAGAAATAGAGTAGTAAAA--GCCTTTTTGTAAA 6633
Query 6782 AGTAAAAACCTGCTTGCAGAAGAAAATGCTGATGATTGTGGATGATCATTTTCTTAAC 6839
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 6634 AGTAAAAACCTGCTTGCAGAAGAAAATGCTGATTATTATGGATGACCATTTTCTTAAC 6691
Score = 100 bits (54), Expect = 1e-19
Identities = 56/57 (98%), Gaps = 0/57 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1392 AGTTAGCCGAGAAACCAGCCCAGTAAAAGATGAAAATGAGGACAATCTGACCTCAGT 1448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1293 AGTTAGCCGAGAAACCAGCCCAGTAAAAGATGAAAATGAGGACAATCTGGCCTCAGT 1349
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 259590705433
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5