BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G14270.1 Length=5987 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg478844 jgi|Araly1|478844|fgenesh2_kg.3__1545__AT3G14270.1 9407 0.0 Ahg491361 jgi|Araly1|491361|fgenesh2_kg.7__794__AT4G33240.2 52.8 3e-05 > Ahg478844 jgi|Araly1|478844|fgenesh2_kg.3__1545__AT3G14270.1 Length=5702 Score = 9407 bits (5094), Expect = 0.0 Identities = 5529/5735 (96%), Gaps = 45/5735 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 AAAATTCGAGTATTGAAGAACGACGACGACGATCTTCTGGGTGACTCAAAGTGAGAGGTT 60 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| Sbjct 1 AAAATTCGAGTATTGAAG-ACGACGACGACGATCTTCTGGGTGAATCAGAGTGAGAGGTT 59 Query 61 AAGCTCAAGGTCTCTGGATTGCT-TTTGAATTTGCATGCTGTTGGA--GGATGATAGACC 117 ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||| Sbjct 60 AAGCTCAAGGTCTCTGGATTGCTCTTT-AATTTGCCTGCTATTGGAGGGGATGATAGACC 118 Query 118 ATCGGTATGTGCTTGAGTTTTCTCGAGGAAGGATGAACCGATACGAGCCGTCTTATTGAT 177 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 119 ATCGGTATGTGCTTGAGTTTTCTCCAGGAAGGATGAATCGATACGAGCCATCTTATTGA- 177 Query 178 TAATTATATATATGTAG-TGGAGTGCCTGAAGGAGatatatatatatataGTAGCAGTTG 236 | |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| Sbjct 178 T--TTAT-TATATGTAGCT-GAGTGCCTGAAGGAG----ATATA-GTA-GGTAGCAGTTG 227 Query 237 GATATTAGGGTTTTCATTTGTTAGGTG-TGAGTTTCTTTTGTTGTTGTTAATTTGGATTC 295 ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||| Sbjct 228 GATATTAGGGTTTCCATTTGTTAGGTGTTGAG---C---T-TTGTTGTTCATTTGGATTC 280 Query 296 TAGACTTCCATGACCATCGTAGCATGATGGTTGGGAAGGTTTTAGATGGGTACAAGAGAT 355 ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 281 TAGACTTCCATGACCATCGGAGCATGATGGTTTGGAAGATTTTAGATGGGTACAAGAGAT 340 Query 356 AGTAATAATAGGACATTCTCTGAGATTGTGGGTCTGATTAAATCCTGGCTCCCCTGGCGA 415 || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 341 AG---TAATAGGACATTCTCTGAGATAGTGGGTCTGATTAAATCCTGGCTTCCCTGGCGA 397 Query 416 TCCGAGCCAGCTACTGTGTCCAGGGATTTTTGGATGCCTGATCAGAGCTGTCGTGTATGT 475 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 398 TCCGAGCCAGCTACTGTGTCCAGGGATTTTTGGATGCCTGATCAGAGCTGTCGTGTATGT 457 Query 476 TACGAGTGTGATTGTCAGTTTACCCTCATCAATCGTAGGCACCATTGTCGTCATTGTGGG 535 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 458 TACGAGTGTGATTGTCAGTTTACCCTCATCAATCGTAGGCACCATTGTCGTCTTTGTGGC 517 Query 536 AGAGTTTTCTGTGGCAAGTGTACTGCCAACTCTA-TTCCTTTTGCTCCCAGCGACTTGAG 594 ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| Sbjct 518 AGAGTTTTCTGCGGCAAGTGTACAGCCAACTC-AGTACCTTTTGCTCCCAGCGACTTGAG 576 Query 595 AACTCCTCGTGAAGACTGGGAGAGGATACGTGTTTGCAATTATTGTTTCAGGCAGTGGGA 654 ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 577 AACTCCTCGTGAAGAGTGGGAGAGGATCCGTGTTTGCAATTATTGTTTCAGGCAGTGGGA 636 Query 655 GCAAGGTGATGGTGGCCCACACGTCTCAAATATCACGGAACTTAGTACTTCACCTTCAGA 714 ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 637 GCAAGGTGATGGTGGACCACATGTTTCAAATATCACGGAACTTAGTACTTCACCTTCAGA 696 Query 715 GACAAGTCTTCTTAGCTCTAAGACCAGTACAACAGCCAATAGTAGTAGCTTCGCTCTTGG 774 |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 697 GACAAGTCTTCTTAGCTCAAAGACCAGTACAACTGCCAATAGTAGTAGCTTCGCTCTTGG 756 Query 775 CTCCATGCCGGGACTGATTGGT-CTTAATCAAAGGGTTCATCATGGTTCTGATGTCAGCT 833 ||| ||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 757 CTCGATGCCAGGACTGATTGGTCCTT-GTCATAGGGTTCATCATGGTTCTGATGTCAGCT 815 Query 834 TGCACGGAGTATCTTCAATGGAGACAAGCGTAACCAAGCAAGGCAAAGAAACTTCAAGGA 893 |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| Sbjct 816 TGCACGGAGTATCTTCAATGGAAACAAGCACAACCAGGCAAGGCAAAGAAACTTCGAGGA 875 Query 894 GGAGCAGCTTCATTGCCACAGACGTGGAAGATCCATCTCGCTTTGCTTTAAATAGCATCA 953 ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | || | Sbjct 876 GGACCAGCTTCATTGCCACAGATGTGGAAGATCCATCTCGCTTTGCTTT--A-A--AT-A 929 Query 954 GGAGTGATGATGAGTACGACGAGTATGGTGCATACCAGACTGATATTGAGACGAGTCATT 1013 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 930 GGAGTGATGATGAGTACGACGAGTATGGTGTATACCAGACTGATATTGAGACGAGTCATT 989 Query 1014 CTCCTCGAGCTAATGAATATTATGGTCCAATGGAATACAATGGAATGGGCATTGATGATG 1073 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 990 CTCCTCGAGCTAATGAATATTATGGTCCCATGGAATACAATGGAATGAGCATTGATGATG 1049 Query 1074 TCCCCTGTAAGCATCTTG-GTGGAGAAACCGCGGACCAGAAAAGTTTAAGCGGCTCTCCA 1132 |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1050 GCCCCTGTAAGCATC-TGAGTGGAGAAACCGCTGACCAGAAAAGTTTGAGCGGCTCTCCA 1108 Query 1133 CTCATTCATCAGTGCCTTGAATCTCTGATTCGGGAAGGATCAGAGCAGTTCCAGAAGAAA 1192 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1109 CTCATTCATCAGTGTCTTGAATCTCTGATTCGGGAAGGATCAGAGCAATTCCAGAAGAAA 1168 Query 1193 AGTGAGCATGATGGTCGTGACGAATGTGAAGCTTCTTCTCCAGCAGATATTTCAGATGAT 1252 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1169 GGTGAGCATGATGGTCGTGACGAATGTGAAGCTTCTTCTCCAGCAGATATTTCAGATGAT 1228 Query 1253 CAAGTGGTAGAACCTGTGGATTTCGAGAACAATGGACTTTTGTGGGTTCCACCTGAGCCA 1312 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1229 CAAGTGGTAGAACCAGTGGATTTCGAGAACAATGGACTTTTGTGGGTTCCACCTGATCCA 1288 Query 1313 GAAAATGAAGAAGACGAGAGAGAAAGTGCTTTGTTTGATGAGGAAGATAACGAGGGAGAT 1372 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1289 GAAAATGAAGAAGACGAAAGAGAAAGTGCTTTGTTTGATGAGGAAGATAACGAGGGAGAT 1348 Query 1373 GCCTCAGGTGAGTGGGGATACTTACGACCTTCCACTAGCTTTGGAAGTGGAGAGTACCGT 1432 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1349 GCCTCAGGTGAGTGGGGATACTTACGACCTTCCACTAGCTTTGGAAGTGGAGAGTACCGT 1408 Query 1433 GGCGAGGATCGAACAACTGAAGAGCACAAGAAGGCTATGAAGAATGTGGTTGATGGGCAC 1492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1409 GGCGAGGATCGAACAACTGAAGAGCACAAGAAGGCTATGAAGAATGTGGTTGATGGGCAC 1468 Query 1493 TTTAGGGCTTTGCTTGCACAACTGTTGCAAGTTGAGAACATCTCTGTGAGCGATGAAGAG 1552 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1469 TTTAGGGCTTTGCTTGCACAACTGTTGCAAGTTGAGAACATCTCTGTGAGCGATGAAGAG 1528 Query 1553 GGCAAAGAGAGCTGGTTAGAGATTATCACCTCTCTTTCTTGGGAGGCTGCTAACTTATTG 1612 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1529 GGCAAAGAGAGCTGGTTAGAGATTATCACCTCTCTTTCTTGGGAGGCTGCTAACTTATTG 1588 Query 1613 AAGCCTGATATGAGCAAAAGTGGAGGAATGGATCCTGGTGGCTATGTCAAAGTAAAGTGC 1672 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1589 AAGCCTGATATGAGCAAAAGTGGAGGAATGGATCCTGGTGGCTATGTCAAAGTAAAGTGC 1648 Query 1673 CTAGCTTCTGGATTCCGACATGATAGCATGGTGGTAAAGGGAGTTGTTTGCAAGAAAAAT 1732 |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1649 CTAGCTTCTGGATTTCGACATGATAGCATGGTGGTGAAGGGAGTTGTTTGCAAGAAAAAT 1708 Query 1733 GTGGTTAATAGGAGAATGAGTACGAAGATTGAGAAAGCTCGACTATTGATTCTAGGCGGT 1792 || | | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1709 GTTGCTCATAAGAAAATGAGTACGAAGATTGAGAAAGCTCGACTTTTGATTCTAGGCGGT 1768 Query 1793 GGACTTGAGTATCAAAGGGTCTCAAACCAGTTATCAAGTTTTGATACTTTGTTGCAACAG 1852 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| Sbjct 1769 GGACTTGAGTATCAAAGGGTCTCAAATCAGTTATCAAGTTTTGATACATTGCTGCAACAG 1828 Query 1853 GAAAAGGATCATCTAAAGATGGCTGTTGCTAAGATTCACGCTGAACGTCCAAATATTCTA 1912 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1829 GAAAAGGATCATCTAAAGATGGCTGTTGCTAAGATTCATGCTGAACGTCCAAATATTCTA 1888 Query 1913 CTAGTCGAAAAATCAGTTTCTCGATTTGCGCAAGAGTATCTTCTAGCCAAAGACATATCT 1972 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1889 CTAGTCGAAAAATCAGTTTCTCGATTTGCGCAAGAATATCTTCTAGCCAAAGACATATCT 1948 Query 1973 CTTGTTCTAAACATCAAGAGGCCACTTTTAGACCGCATTGCTCGCTGCACTGGTGCTCAA 2032 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1949 GTTGTTCTAAACATCAAGAGGCCACTTCTAGACCGCATTGCTCGCTGCACTGGTGCTCAA 2008 Query 2033 ATAATTCCTTCAGTAGACCACCTCTCCTCTCAAAAGCTGGGTTACTGTGAGAATTTTCGG 2092 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2009 ATAATTCCTTCAGTAGACCACCTCTCCTCTCAAAAGCTGGGTTACTGTGAGAATTTTCGG 2068 Query 2093 GTGGATAGGTATCCTGAAGAACATGGTTCAACTGGTCAAGTTGGAAAGAAAGTGGTGAAG 2152 |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2069 GTGGATAGGTTTTTTGAGGAACATGATTCAACTGGTCAAGTTGGAAAGAAAGTGGCGAAG 2128 Query 2153 ACGTTGATGTATTTTGAGCATTGTCCAAAGCCATTAGGCTTTACTATTTTGCTGAGGGGT 2212 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct 2129 ACGTTGATGTATTTTGAGCATTGTCCAAAACCATTAGGCTTTACAATTTTGCTTAGGGGT 2188 Query 2213 GCAAATGAAGATGAGTTGAAAAAAGTGAAGCATGTGGTCCAGTATGGAGTTTTTGCAGCT 2272 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2189 GCAAATGAAGATGAGTTGAAAAAAGTGAAGCATGTGGTCCAATATGGAGTTTTTGCAGCT 2248 Query 2273 TATCATTTGGCACTCGAAACATCGTTTCTTGCTGATGAGGGAGCCTCACCAGAACTTCCT 2332 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2249 TATCATTTGGCACTCGAAACATCATTTCTTGCTGATGAGGGAGCCTCACCAGAACTTCCT 2308 Query 2333 TTGAATTCCCCGATTACGGTGGCACTTCCAGATAAATCTACGAGCATTGAACGTTCAATA 2392 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2309 TTGAATTCCCCGATTACGGTGGCACTTCCGGATAAATCTACGAGCATTGAACGTTCAATA 2368 Query 2393 TCTACTGTGCCAGGTTTCACGGTCTCAACATATGAAAAATCTCCGACAATGCTATCTTGT 2452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2369 TCTACTGTGCCAGGTTTCACGGTCTCAACATATGAAAAATCTCCGACAATGCTATCTTGT 2428 Query 2453 GCTGAACCACAACGAGCAAACAGTGTTCCAGTATCAGAGTTGCTCTCTACCACTACCAAT 2512 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2429 GCTGAACCACAACGAGCAAACAGTGTTCCAGTATCAGAGTTGCTCTCGACCACTACCAAT 2488 Query 2513 CTATCCATCCAGAAGGAT--AT-CCCTCCTATACCCTATGGTTCAGGCTGGCAGGCTAGA 2569 |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2489 CTATCCATCCAGAAGGATGCAAACCCTCTTATACCCAATGGTTCAGGCTGGCAGGCTAGA 2548 Query 2570 GAAATAAACCCGAGTTTCGTCTTTTCACGCCATAATATTTCATTGAATTTGCCTGACCGT 2629 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2549 GAAATAAACCCGAGTTTCATCTTTTCACGCCATAATGTTTCATTGAATTTGCCTGACCGT 2608 Query 2630 GTGATAGAGAGCAGAAACTCAGATTTGTCTGGAAGATCTGTACCGGTGGACACACCAGCT 2689 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2609 GTGATAGAGAGCAGAAACTCAGATTTGTCTGGAAGATCTGTACCGGTGGACACACCAGTT 2668 Query 2690 GACAAAAGCAATCCAATTGTTGTGGCAGATGAGACAACG-AACAATTCCTTACATTTATC 2748 ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| | || ||||||||||||| ||| Sbjct 2669 GACAAAACCAATCCAGTTGTTGCGGCAGATGACACATTGGAA-AATTCCTTACATTCATC 2727 Query 2749 AGGGCAAGGCTTTGTGCGAAAGAGTTCTCAAATTGGTACGAGCATTATGGTCGAAAACCA 2808 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2728 AGGGCAAGGCTTTGTGCGAAAGAGTTCTCAAAGTGGTACGAGCATTATGGTCGAAAACCA 2787 Query 2809 AGACAATGGTTCAGAGCTTACAATCGCCCAACAACAAAACAATGAGAAACCAAAGGAAAC 2868 ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2788 AGACAATGGTTCAGAGCTTACAACCGTCCAACAACAAAACAATGAGAAACCAAAGGAAAC 2847 Query 2869 ACAATCCCAAAAAGAAGAATTTCCTCCGTCACCCTCTGACCACCAGAGCATTTTGGTTTC 2928 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2848 ACAATCCCAAAAAGAAGAATTTCCTCCGTCACCCTCTGACCACCAGAGCATTTTGGTTTC 2907 Query 2929 TCTATCATCCCGATCAGTGTGGAAAGGAACTGTGTGTGAAAGGTCTCATCTCTTTCGGAT 2988 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| Sbjct 2908 TCTATCTTCCCGATCAGTGTGGAAAGGAACTGTGTGTGAGAGGTCTCACCTCTTTCGGAT 2967 Query 2989 AAAATACTATGGTAGTTTTGATAAACCCTTGGGACGGTTCTTGAGAGATCATTTGTTCGA 3048 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2968 TAAATACTATGGTAGTTTTGATAAACCCTTGGGACGGTTCTTGAGAGATCATTTGTTCGA 3027 Query 3049 TCAGAGTTACAGGTGCCGGTCATGTGAGATGCCATCAGAAGCTCATGTTCACTGTTACAC 3108 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3028 TCAGAGTTACAGGTGCCGGTCATGTGAGATGCCATCAGAAGCTCATGTTCATTGTTACAC 3087 Query 3109 TCATCGACAAGGCAGCCTTACGATATCTGTCAAGAAACTTCAAGATTATCTCTTACCTGG 3168 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct 3088 TCATCGACAAGGCAGCCTTACTATATCTGTCAAGAAGCTCCAAGATTATCTCTTACCTGG 3147 Query 3169 TGAAAAGGAGGGGAAGATCTGGATGTGGCATAGATGCCTGAGATGCCCGCGACTTAACGG 3228 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3148 TGAAAAGGAGGGGAAGATCTGGATGTGGCATAGATGCCTGAGATGCCCGCGACCTAACGG 3207 Query 3229 CTTCCCTCCAGCGACTCTACGAGTGGTTATGTCTGATGCTGCATGGGGATTATCGTTTGG 3288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3208 CTTCCCTCCAGCGACTCTACGAGTGGTTATGTCTGATGCTGCATGGGGATTATCGTTTGG 3267 Query 3289 GAAGTTTCTGGAGCTCAGTTTCTCAAATCACGCAGCTGCTAGTAGAGTAGCTTGTTGTGG 3348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3268 GAAGTTTCTGGAGCTCAGTTTCTCAAATCACGCAGCTGCTAGTAGAGTAGCTTGTTGTGG 3327 Query 3349 CCATTCTCTGCATAGAGATTGTCTTCGCTTCTATGGATTTGGGAACATGGTTGCTTGCTT 3408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3328 CCATTCTCTGCATAGAGATTGTCTTCGCTTCTATGGCTTTGGGAACATGGTTGCTTGCTT 3387 Query 3409 CCGGTACGCTACTATAGATGTTCATTCGGTCTACCTTCCACCATCAATTCTTAGTTTCAA 3468 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3388 CCGGTACGCTACTATAGATGTTCATTCGGTCTACCTTCCACCATCAATTCTTAGTTTCAA 3447 Query 3469 CTACGAGAATCAGGATTGGATACagagagagacagacgaggtgatagagagagcagagCT 3528 ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3448 CTATGAGAATCAGGACTGGATACAGAGAGAGACAGATGAGGTGATAGAGAGAGCAGAGCT 3507 Query 3529 TCTGTTTTCTGAAGTATTAAATGCTATTAGTCAAATTGCAGAGAAAGGTTTCAGGCGACG 3588 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 3508 TCTGTTTTCTGAAGTATTAAATGCTATTAGTCAAATTGCAGAGAAAGGTTTTAGGCGTCG 3567 Query 3589 AATTGGTGAACTCGAAGAAGTGCTGCAAAAAGAGAAAGCGGAATTTGAGGAGAATATGCA 3648 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| Sbjct 3568 AATTGGTGAACTCGAAGAAGTGCTGCAAAGAGAGAAATCAGAATTTGAGGAAAATATGCA 3627 Query 3649 AAAGATTTTGCACAGGGAGGTGAACGAAGGCCAACCTCTCGTGGACATTCTTGAGCTATA 3708 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3628 AAAGATGTTGCACAGGGAGGTGAACGAAGGCCAACCTCTCGTGGACATTCTTGAGCTATA 3687 Query 3709 TCGGATTCACAGACAACTTCTTTTTCAGTCATACATGTGGGATCACCGCTTAATTAATGC 3768 |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3688 TCGGATTCGCAGACAACTGCTTTTTCAGTCATACATGTGGGATCACCGCTTGATTAATGC 3747 Query 3769 ATCTACTTTACATAAGCTTGAGAATAGTGATGACACAAAGAGAGAAGAGAACGAGAAACC 3828 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3748 ATCTACTTTACATAAGCTTGAGAATAGTGATGACACAAAGAGAGAAGAGAACGAGAAACC 3807 Query 3829 TCCCTTGGCTAAGAGCCAGACGCTCCCGGAGATGAATGCTGGGACCAACTCTCTTCTTAC 3888 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3808 TCCCTTGGCTAAGAGCCAGACGCTCCCCGAGATGAATGCTGGGACCAACTCTCTTCTTAC 3867 Query 3889 TGGCTCTGAGGTTAATCTGAATCCTGATGGTGATTCTACTGGTGACACTGGCTCCTTAAA 3948 |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3868 TGGCTCAGAAGTTAATCTGAATCCTGATGGTGATTCTACTGGTGACACTGGCTCCTTAAA 3927 Query 3949 TAATGTTCAGAAAGAAGCGGATACGAATTCAGATTTGTATCAGGAAAAGGATGATGGGGG 4008 |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 3928 TAATGTTCAGAAGGAAGCGGATACAAATTCAGATTTGAATCAGGAAAAGAATGATGGGGG 3987 Query 4009 AGAAGTTTCTCCCAGCAAGACCTTACCAGATACATCTTATCCTCTGGAAAATAAAGTCGA 4068 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3988 AGAAGTTTCTCCCAGCAAGACCTTACCAGATACATCTTATCCTCTGGAAAATAAAGTCGA 4047 Query 4069 TGTTCGTAGAACACAGTCTGATGGCCAGATAGTTATGAAAAATCTATCAGCCACTCTTGA 4128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4048 TGTTCGTAGAACACAGTCTGATGGCCAGATAGTTATGAAAAATCTATCAGCCACTCTTGA 4107 Query 4129 TGCAGCATGGATAGGTGAACGTCAAACATCTGTGGAGATTCCAACCAACAATAAGGTCTC 4188 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4108 TGCAGCATGGATAGGTGAACGTCAAACATCTGTGGAGATTCCAACCAACAATAAGGTCTT 4167 Query 4189 GCTTCCTCCTTCCACCATGTCAAACTCTTCAACTTTTCCTCCAATCTCAGAGGGGCTAAT 4248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4168 GCTTCCTCCTTCCACCATGTCAAACTCTTCAACTTTTCCTCCAATCTCAGAGGGGCTAAT 4227 Query 4249 GCCTATAGATCTCCCAGAACAGCAAAATGAGTTCAAGGTGGCCTATCCTGTTTCCCCAGC 4308 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4228 GCCTATAGATCTCCCAGAACAGCAAAATGAATTCAAGGTGGCCTATCCTGTTTCCCCAGC 4287 Query 4309 ATTACCGAGTAAGAATTATGAGAATTCAGAAGACTCTGTCAGCTGGCTAAGTGTGCCATT 4368 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 4288 ATTACCAAGTAAGAATTATGAGAATTCAGAAGACTCTGTCAGCTGGTTAAGTGTGCCATT 4347 Query 4369 CCTCAACTTCTACCGTTCCATTAACAAGAATTTCCTGCTTAGCTCTCAGAAGCTTGATAC 4428 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4348 CCTCAACTTTTACCGTTCCATTAACAAGAATTTCCTGCTTAGCTCTCAGAAGCTTGATAC 4407 Query 4429 ATTTGGCGAGCATAGCCCTATCTATATTTCATCTTTTAGAGAGGCAGAGCTTCAAGGTGG 4488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4408 ATTTGGCGAGCATAGCCCTATCTATATTTCATCTTTTAGAGAGGCAGAACTTCAAGGTGG 4467 Query 4489 ACCAAGGCTACTTCTGCCCGTAGGCTTAAATGATATTGTTGTTCCGGTTTATGATGATGA 4548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 4468 ACCAAGGCTACTTCTGCCCGTAGGCTTAAATGATATTGTTGTTCCGGTATATGATGATGA 4527 Query 4549 ACCTACTAGTATGATCGCATATGCCTTAATGTCACCAGAATATCAACGCCAAACTTCTGC 4608 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 4528 ACCCACTAGTATGATCGCATATGCCTTGATGTCACCGGAATATCAACGCCAAACTTCTGT 4587 Query 4609 TGAAGGGGAATCTCTAGTTTCATATCCTTCTGAACTCAATATCCCTCGCCCAGTTGATGA 4668 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4588 TGAAGGGGAATCTCTAGTTTCATATCCTTCTGAACTCAATATCCCTCGCCCAGTTGATGA 4647 Query 4669 TACCATTTTTGACCCTAGCAGAAGCAATGGTTCAGTCGACGAGAGCATACTTTCAATATC 4728 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4648 CACCATTTTTGACCCTAGCAGAAGCAATGGTTCAGTCGACGAGAGCATACTTTCAATATC 4707 Query 4729 CTCATCTCGCAGTACCTCACTTCTGGACCCACTATCATATACAAAAGCTTTACATGCTCG 4788 |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4708 CTCATCTCGCAGTAGCTCACTTTTGGACCCACTATCATATACAAAAGCTTTACATGCTCG 4767 Query 4789 AGTCTCATATGGAGAGGACGGTACGCTTGGAAAAGTGAAGTACACTGTTACTTGTTACTA 4848 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4768 AGTCTCATATGGAGAGGACGGTACGCTTGGAAAAGTGAAGTACACTGTTACTTGTTACTA 4827 Query 4849 TGCAAAGCGGTTTGAGGCGCTACGGGGTATATGTCTCCCTTCGGAACTTGAGTATATACG 4908 |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | Sbjct 4828 TGCAAAACGATTTGAGGCGCTGCGGGGTATATGTCTCCCTTCGGAACTTGAGTTTATAAG 4887 Query 4909 GTCTCTTAGCCGGTGTAAAAAATGGGGAGCTCAAGGTGGCAAGAGCAATGTCTTCTTTGC 4968 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4888 GTCTCTTAGCCGGTGTAAAAAATGGGGAGCTCAAGGTGGCAAGAGCAATGTCTTCTTTGC 4947 Query 4969 TAAAACCCTGGACGATCGATTTATCATCAAGCAAGTCACCAAGACAGAGTTGGAATCATT 5028 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4948 TAAAACCCTGGATGATCGATTTATCATCAAGCAAGTCACCAAGACAGAGTTGGAATCATT 5007 Query 5029 CATCAAATTTGCACCTGCTTACTTTAAATACTTGTCTGAGTCTATCAGCACGAAAAGCCC 5088 |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5008 CATCAAATTTGCACCTGCTTACTTCAAATACTTATCTGAGTCTATCAGCACGAAAAGCCC 5067 Query 5089 AACCTGCCTGGCAAAAATCTTGGGAATCTATCAGGTCGCAACAAAGCAACTTAAGAGCGG 5148 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5068 AACCTGCCTGGCAAAAATATTGGGAATCTATCAGGTCGCAACAAAGCAACTTAAGAGCGG 5127 Query 5149 GAAAGAAACAAAGATGGATGTTCTGATTATGGAGAATCTTCTGTTTGGAAGAACTGTGAA 5208 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5128 GAAAGAAACAAAGATGGATGTTCTGATTATGGAGAATCTTCTGTTTGGAAGAACTGTGAA 5187 Query 5209 ACGGCTTTATGACCTTAAAGGATCTTCGCGGGCGCGCTACAATCCTGACTCTAGTGGGAG 5268 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 5188 ACGGCTATATGACCTTAAAGGATCTTCCCGGGCGCGCTACAATCCTGACTCCAGTGGGAG 5247 Query 5269 CAACAAAGTCTTGTTGGATCAAAACTTGATTGAAGCAATGCCAACTTCTCCCATTTTCGT 5328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5248 CAACAAAGTCTTGTTGGATCAAAACTTGATTGAAGCAATGCCAACTTCTCCCATTTTCGT 5307 Query 5329 CGGTAACAAAGCAAAACGATTGTTGGAAAGAGCTGTCTGGAACGATACTGCTTTTCTTGC 5388 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5308 CGGTAACAAAGCAAAACGATTGTTGGAAAGAGCCGTCTGGAACGATACTGCTTTTCTTGC 5367 Query 5389 ATTGGGTGATGTGATGGATTATTCATTGCTAGTAGGCGTGGATGAAGAAAAGAACGAGCT 5448 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5368 ATTGGGTGATGTGATGGATTATTCGTTGCTAGTAGGCGTGGATGAAGAAAAGAACGAGCT 5427 Query 5449 AGTTCTCGGGATTATCGACTTCTTGAGGCAGTACACATGGGACAAGCATCTAGAGTCTTG 5508 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5428 AGTTCTCGGGATTATCGACTTCTTGAGGCAGTACACATGGGACAAGCATCTAGAGTCTTG 5487 Query 5509 GGTGAAATTTACAGGAATCTTAGGAGGACCAAAGAATGAAGCACCAACAGTAATCTCTCC 5568 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 5488 GGTGAAATTTACAGGAATCTTAGGAGGACCAAAGAATGAAGCACCAACAGTAATATCTCC 5547 Query 5569 AAAGCAATATAAGAGAAGATTCAGAAAAGCAATGACAACTTACTTCCTCATGGTCCCTGA 5628 ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 5548 AAAGCAATACAAGAGAAGATTCAGAAAGGCGATGACAACTTACTTCCTTATGGTCCCTGA 5607 Query 5629 TCAATGGTCTCCGCCTAATGTTGTTGCAAATAACTCCAAGTCTGATCAACCTGAAGAAAC 5688 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 5608 TCAATGGTCTCCGCCTAATGTCGTTGCGAATAACTCCAGGTCTGATCAACCTGAAGAAAC 5667 Query 5689 CTCTCAAGCCGGTACACAAGCAGAGTGATACAAGA 5723 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5668 CTCTCAAGCCGGTACACAAGCAGAGTGATACAAGA 5702 > Ahg491361 jgi|Araly1|491361|fgenesh2_kg.7__794__AT4G33240.2 Length=5668 Score = 52.8 bits (28), Expect = 3e-05 Identities = 28/28 (100%), Gaps = 0/28 (0%) Strand=Plus/Plus Query 4121 ACTCTTGATGCAGCATGGATAGGTGAAC 4148 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3881 ACTCTTGATGCAGCATGGATAGGTGAAC 3908 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 226823135080 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5