BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G14570.1 Length=5931 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg929239 jgi|Araly1|929239|scaffold_301696.1 5792 0.0 > Ahg929239 jgi|Araly1|929239|scaffold_301696.1 Length=5969 Score = 5792 bits (3136), Expect = 0.0 Identities = 3313/3401 (97%), Gaps = 1/3401 (0%) Strand=Plus/Plus Query 2531 GCAGGGGGTCTGATGGCCAGAAAAATAGTATGGCCAAGTTTGTCTTGGTCTGGAACCAAG 2590 ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2549 GCA-GGGGTCAGACGGCCAGAAAAATAGTATGGCCAAGTTTGTCTTGGTCTGGAACCAAG 2607 Query 2591 TCATTAACAGTTTCAGAACAGAAGATCTGATAAGTAACAAGGAATTAGATTTGATGACGA 2650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2608 TCATTAACAGTTTCAGAACAGAAGATCTGATAAGTAACAAGGAATTAGATTTGATGACGA 2667 Query 2651 TGCCGCTGTCATCGGAGGTATTATCAGGAATCATCCGTTGGCCCATTTTCCTCCTTGCAA 2710 ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2668 TGCCGATGTCATCGGAGGTATTATCAGGGATCATCCGTTGGCCCATTTTCCTCCTTGCAA 2727 Query 2711 ATAAGTTTTCAACAGCTCTGAGCATTGCAAAAGATTTTGTCGGGAAGGATGAGGTTCTCT 2770 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct 2728 ATAAGTTTTCAACAGCTCTGAGCATTGCAAAAGATTTTGTCGAGAAGGATGAGGTTCTTT 2787 Query 2771 ATCGAAGGATTCGGAAAGACGAGTACATGTACTACGCAGTAAAAGAGTGCTATGAATCTT 2830 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2788 ATCGAAGGATTCGGAAAGACGAGTACATGTACTACGCAGTAAAAGAATGCTATGAATCTT 2847 Query 2831 TGAAGTACATTCTTCAGATTCTTGTTGTTGGTGATCTTGAGAAAAAGATTATATCTGGTA 2890 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2848 TGAAGTACATTCTTCAGATTCTTGTTGTTGGTGATCTTGAGAAAAAGATTATATCTGGTA 2907 Query 2891 TAATAAACGAGATAGAGGAAAGCATCAGACAGTCAAGTTTGCTTGAAGAATTTAAGATGG 2950 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2908 TAATAAACGAAATAGAGGAAAGCATCAGACAGTCAAGTTTGCTTGAAGAATTTAAGATGA 2967 Query 2951 CTGAGCTCCCAGCGTTGCATGACAAATGTATTGAGCTGGTTCAACTCCTGGTTGAGGGAA 3010 ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2968 CTGAGCTCCCAGCATTGCATGAAAAATGTATTGAGCTGGTTCAACTCCTGGTTGAGGGAA 3027 Query 3011 GTGCCGAGCAACTCCAGGTTGAGAAAAGCGAAGAACTGCATGGTAAACTTGTAAAGGCTC 3070 ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3028 GTGACGAGCAACTCCAGGAAGAGAAAAGCGAAGAACTGCATGGTAAACTTGTAAAGGCTC 3087 Query 3071 TTCAGGATATCTTTGAGCTAGTAACAAATGATATGATGGTACATGGTGACAGAATTCTGG 3130 ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3088 TTCAGGACATATTTGAGCTAGTAACAAATGATATGATGGTACATGGTGACAGAGTTCTGG 3147 Query 3131 ATTTGCTCCAGTCTCGGGAGGGGTCAGGAGAAGACACAGGTATTTTTATGAGGGTTATAG 3190 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3148 ATTTGCTCCAGTCTCGGGAGGGGTCAGGAGAAGACACAGGTATTTTTATGAGGGTTATAG 3207 Query 3191 AACCACAGTTGTTTGAATCCTACGGAGAATGGAGATGCATTCATTTTCCGCTGCCAGATA 3250 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3208 AACCACAGTTGTTTGAATCTTATGGAGAATGGAGATGCATTCATTTTCCGCTGCCAGATA 3267 Query 3251 GTGCTTCATTGAGTGAACAGATCCAGCGTTTTCTGTTATTGTTAACTGTCAAAGATAGTG 3310 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3268 GTGCTTCATTGAGTGAACAGATCCAGCGTTTTCTGTTATTGTTAACTGTCAAAGATAGTG 3327 Query 3311 CAATGGACATACCAGAGAACTTAGATGCTCGGCGGCGCCTATCTTTCTTTGCTACTTCGC 3370 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3328 CTATGGACATACCAGAGAACTTAGACGCTCGGCGGCGCCTATCTTTCTTTGCTACTTCGC 3387 Query 3371 TTTTCATGGATATGCCCGATGCTCCGAAAGTACGCAATATGATGTCATTCAGTGTTTTGA 3430 |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3388 TTTTCATGGATATGCCTGACGCTCCGAAAGTACGCCATATGATGTCATTCAGTGTTTTGA 3447 Query 3431 CACCGCATTATCAGGAGGATATTAACTATTCAACGAACGAACTACATTCCACCAAGTCTA 3490 | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| Sbjct 3448 CTCCGCATTATCAGGAGGATATTAACTTTTCAACGAAGGAACTACATTCCACCACGTCTA 3507 Query 3491 GTGTGTCAATCATCTTTTATATGCAGAAGATTTTTCCAGATGAGTGGAAAAACTTTCTTG 3550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3508 GTGTGTCAATCATCTTTTATATGCAGAAGATTTTTCCAGATGAGTGGAAAAACTTTCTTG 3567 Query 3551 AGCGAATGGGATGTGATAATTTAGACGCCTTAAAGAAAGAGGGTAAAGAAGAAGAGCTTC 3610 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3568 AGCGAATGGGATGTGATAATTTGGACGCCTTAAAGAAAGAGGGTAAAGAAGAAGAGCTTC 3627 Query 3611 GAAACTGGGCATCATTTCGTGGACAAACATTGAGTAGAACAGTTCGTGGTATGATGTATT 3670 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3628 GAAACTGGGCATCATTTCGTGGACAAACATTGAGTAGAACAGTTCGTGGAATGATGTATT 3687 Query 3671 GCCGAGAAGCTCTGAAATTGCAAGCCTTCCTTGACATGGCAGATGACGAGGATATTCTTG 3730 |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3688 GCCGTGAAGCTTTGAAATTGCAAGCCTTCCTTGACATGGCAGATGACGAGGATATTCTTG 3747 Query 3731 AAGGATACAAGGACGTGGAACGAAGTAACAGACCTTTAGCCGCACAACTTGATGCATTGG 3790 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3748 AAGGATACAAGGACGTGGAACGAAGTAACCGACCTTTAGCCGCACAACTTGATGCATTAG 3807 Query 3791 CAGATATGAAATTCACGTATGTTGTTTCTTGCCAAATGTTTGGAGCCCAAAAATCATCTG 3850 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3808 CAGATATGAAATTCACGTATGTTGTGTCTTGCCAAATGTTTGGAGCCCAAAAATCAGCTG 3867 Query 3851 GGGATCCTCACGCGCAGGATATACTTGACCTGATGATAAAGTATCCATCTCTCCGTGTTG 3910 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3868 GGGATCCCCACGCGCAGGATATACTTGACCTGATGATAAAGTACCCATCTCTCCGTGTTG 3927 Query 3911 CATACGTTGAGGAGAGGGAAGAAATCGTGTTGGATGTTCCAAAGAAGGTTTACTACTCTA 3970 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | Sbjct 3928 CATACGTTGAGGAGAGGGAAGAAATCGTGTTGGATGTTCCAAAGAAAGTTTACTACTCAA 3987 Query 3971 TATTGGTAAAAGCTGTTAACGGTTTCGATCAGGAAATTTACCGTGTCAAACTTCCTGGAC 4030 | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3988 TTTTGGTAAAAGCTGTCAACGGTTTCGATCAGGAAATTTACCGTGTCAAACTTCCTGGAC 4047 Query 4031 CACCTAACATTGGAGAGGGAAAGCCTGAGAATCAAAATCACGCCATAGTTTTCACTCGAG 4090 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4048 CACCTAACATTGGAGAGGGGAAGCCTGAGAATCAAAATCACGCCATAGTTTTCACTCGAG 4107 Query 4091 GTGAAGCACTTCAGACGATCGACATGAACCAAGATCACTACCTGGAAGAGGCTTTCAAAA 4150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4108 GTGAAGCACTTCAGACGATCGACATGAACCAAGATCACTACCTGGAAGAGGCTTTCAAAA 4167 Query 4151 TGAGAAATCTCCTTCAAGAATTTCTTCGAAACCGTGGAAGAAGACCTCCAACAATTCTTG 4210 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 4168 TGAGAAATCTCCTTCAAGAATTTCTTCGAAACCGTGGAAGAAGACCTCCAACAGTTCTTG 4227 Query 4211 GTTTAAGGGAACACATATTCACCGGAAGTGTTTCTTCTCTAGCATGGTTCATGTCATATC 4270 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4228 GGTTAAGGGAACACATATTCACCGGAAGTGTTTCTTCTCTAGCATGGTTCATGTCATATC 4287 Query 4271 AAGAAACCAGTTTTGTCACAATCGGTCAAAGGCTTCTTGCTAATCCTCTCAGAGTCCGGT 4330 |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct 4288 AAGAAACCAGTTTTGTAACGATCGGTCAAAGGCTGCTTGATAATCCTCTCAGAGTCCGGT 4347 Query 4331 TTCACTATGGGCATCCAGATGTCTTCGACAGAATATTTCACATAACAAGGGGTGGCATCA 4390 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4348 TTCACTATGGGCATCCAGATGTCTTCGACAGAATATTTCACATAACAAGGGGTGGCATCA 4407 Query 4391 GTAAATCATCGAGAACTATTAACTTAAGCGAGGACGTTTTCGCAGGTTATAATACTACCT 4450 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| Sbjct 4408 GTAAATCATCGAGAACTATTAACTTAAGCGAGGACGTTTTCGCGGGTTATAATACCACCC 4467 Query 4451 TACGACGTGGATGCATAACCTACAATGAGTACCTCCAAGTTGGAAAAGGTCGTGATGTTG 4510 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4468 TACGACGTGGATGCATAACCTACAATGAGTACCTCCAAGTTGGAAAAGGTCGTGATGTTG 4527 Query 4511 GCCTCAATCAAATCTCAAAGTTTGAGGCCAAGGTGGCTAACGGAAACAGTGAACAGACTA 4570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4528 GCCTCAATCAAATCTCAAAGTTTGAGGCCAAGGTGGCTAACGGAAACAGTGAACAGACTA 4587 Query 4571 TTAGCCGTGACATATACCGTTTAGGACAACGTTTTGATTTCTTCAGAATGTTGTCTTGTT 4630 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4588 TTAGCCGTGACATATACCGTTTAGGACAACGTTTTGATTTCTTCAGAATGTTGTCTTGTT 4647 Query 4631 ATTTCACAACCATTGGATTCTACTTCAGTAGCTTGATTTCCGTGATCGGGATTTATATTT 4690 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 4648 ATTTCACAACCATTGGATTCTACGTCAGTAGCTTGATTTCCGTGATCGGGATATATATTT 4707 Query 4691 ATCTCTATGGTCAACTCTACCTCGTACTCAGTGGGTTGCAGAAGACGCTTATTCTTGAGG 4750 |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4708 ATCTATATGGTCAACTCTACCTCGTGCTCAGTGGGTTGCAGAAGACGCTTATTCTTGAGG 4767 Query 4751 CCAAGGTGAAAAACATAAAATCATTGGAAACAGCCCTTGCCTCTCAATCATTTATCCAGC 4810 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4768 CCAAGGTGAAAAACATAAAATCATTGGAAACAGCCCTTGCCTCTCAATCATTTATCCAGC 4827 Query 4811 TAGGTCTCTTGACCGGTCTACCAATGGTGATGGAGATTGGGTTGGAGAAAGGATTTCTTA 4870 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 4828 TAGGTCTCTTGACTGGTCTACCAATGGTGATGGAGATTGGATTGGAGAAAGGATTTCTTA 4887 Query 4871 TAGCCTTTCAAGATTTCATACTCATGCAGCTACAGCTTGCTGCATTCTTCTTCACTTTCT 4930 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4888 TAGCCTTTCAAGATTTCATACTCATGCAGCTACAGCTTGCTGCATTCTTCTTCACTTTCT 4947 Query 4931 CTCTAGGAACTAAAACGCATTACTTTGGCAGAACAATTCTCCATGGAGGTGCCAAATACA 4990 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 4948 CTCTAGGAACTAAAACGCATTACTTCGGCAGAACAATTCTCCATGGAGGCGCCAAATACA 5007 Query 4991 GACCCACAGGGCGTAAAGTAGTGGTGTTCCATGCCAACTTCAGTGAAAATTACAGATTAT 5050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5008 GACCCACAGGGCGTAAAGTAGTGGTGTTCCATGCCAACTTCAGTGAAAATTACAGATTAT 5067 Query 5051 ATTCTCGAAGCCATTTCATCAAAGGTTTTGAGCTCATGATTCTTCTGGTCGTCTACGAGT 5110 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5068 ATTCTCGAAGCCATTTCATCAAAGGTTTTGAGCTCATGATTCTTCTGGTCGTCTACGAGT 5127 Query 5111 TGTTCAAGCATACATCTCAAAGCAACATGGCTTACTCATTCATCACTTTCTCAGTGTGGT 5170 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 5128 TGTTCAAGCATACATCTCAAAGCAACATGGCTTACTCATTTATCACTTTCTCAGTGTGGT 5187 Query 5171 TCATGTCTTTTACTTGGTTATGCGCCCCGTTTCTCTTCAACCCTTCAGGCTTTACCTGGG 5230 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 5188 TCATGTCTTTTACATGGTTATGCGCCCCGTTTCTCTTTAACCCTTCAGGCTTTACCTGGG 5247 Query 5231 AAATAATAGTCGGTGACTGGAGAGACTGGAACAGGTGGATCAAAGAGCAAGGTGGAATAG 5290 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 5248 AAATAATAGTCGGTGACTGGAGAGACTGGAACAGGTGGATCAAAGAGCAAGGTGGGATAG 5307 Query 5291 GGATTCAGCAAGACAAGAGCTGGCAATCTTGGTGGAACGACGAGCAAGCCCATCTACGTG 5350 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 5308 GGATTCAGCAAGACAAGAGTTGGCAATCTTGGTGGAATGACGAGCAAGCCCATCTACGTG 5367 Query 5351 GCTCTGGTGTTGGAGCTCGCTGTTTGGAGATAATTTTGTCCCTCAGGTTCTTTGTGTATC 5410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5368 GCTCTGGTGTTGGAGCTCGCTGTTTGGAGATAATTTTGTCCCTCAGGTTCTTTGTGTATC 5427 Query 5411 AGTATGGTTTGGTATATCACCTTGACATTACCCAAAGCAACACAAATATCATAGTCTACG 5470 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 5428 AGTATGGGTTGGTATATCACCTTGACATTACCCAAAGCAACACAAATATCATAGTCTATG 5487 Query 5471 CGCTTTCTTGGGTCGTGATTCTCGCCACATTCTTCACAGTCAAGGCAGTAGACCTAGGAA 5530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 5488 CGCTTTCTTGGGTCGTGATTCTCGCCACATTCTTCACAGTCAAGGCCGTAGACCTAGGAA 5547 Query 5531 GACAACTCTTCAGCACAAGAAAGCATCTCGTGTTTCGGTTCTTCAAAGTCTTCGTCTTCG 5590 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5548 GACAACTCTTCAGCACAAGAAAGCATCTCGTATTTCGGTTCTTCAAAGTCTTCGTCTTCG 5607 Query 5591 TGAGCATACTTACAATCATAATCACTCTAGCAAACATCTGTCACCTCTCTGTCAAGGACC 5650 ||||||| || ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5608 TGAGCATTCTAACAGTCATTATCACTCTATCAAACATCTGTCACCTCTCTGTCAAGGACC 5667 Query 5651 TTCTAGTCTCTTGCTTAGCTTTCTTGCCCACTGGTTGGGGTCTGATTCTGATTGCACAAG 5710 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5668 TTCTAGTCTCTTGCTTAGCTTTCTTGCCCACCGGTTGGGGTCTGATTCTGATTGCACAAG 5727 Query 5711 CGGTTAGGCCAAAGATAGAAGGAACGAGCTTATGGGAGTTCACACAGGTTCTTGCTCGAG 5770 |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 5728 CGGTTAGGCCAAAGATAGAAGGGACGAGCTTGTGGGAGTTCACACAGGTTCTTGCCCGAG 5787 Query 5771 CTTATGATTATGGAATGGGCGTTGTTCTGTTTGCACCAATGGCTATCTTAGCATGGCTTC 5830 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 5788 CTTATGATTATGGAATGGGAGTTGTTCTGTTTGCACCAATGGCTATCTTAGCTTGGCTTC 5847 Query 5831 CTATTATTTCTGCGTTTCAGACTCGTTTTCTATTCAACGAAGCTTTTAACAGAAGACTTC 5890 |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct 5848 CTATCATTTCTGCGTTTCAGACACGCTTTCTCTTCAATGAAGCTTTTAACAGAAGGCTTC 5907 Query 5891 AAATTCAACCTATTCTTGCAGGGAAGAAGAAGAATCGATGA 5931 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5908 AAATTCAACCTATTCTTGCAGGGAAGAAGAAGAATCGATGA 5948 Score = 3642 bits (1972), Expect = 0.0 Identities = 2111/2180 (97%), Gaps = 2/2180 (0%) Strand=Plus/Plus Query 355 GATGAAGAGTTCACTGTGAGAAGAAGAAAGGAGAAGAGTGATGTTCGGGAACTCAAACGT 414 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 327 GATGAAGAGTTTACTGTGAGAAGAAGAAAGGAGAAGAGTGATGTTCGGGAGCTCAAACGT 386 Query 415 GTTTATCATGCTTACAAGGAATATATTATCAGACATGGTGCAGCTTTCAATTTGGATAAC 474 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| Sbjct 387 GTTTATCATGCTTACAAGGAATACATTATCAGACATGGTGCATCATTCAATTTGGATAAT 446 Query 475 AGTCAGCGAGAGAAGTTGATTAACGCACGCAGAATTGCTTCTGTTTTGTATGAAGTTCTC 534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 447 AGTCAGCGAGAGAAGTTGATTAACGCACGCAGAATTGCTTCTGTTTTGTATGAAGTTCTC 506 Query 535 AAGACAGTCACAAGTGGCGCTGGCCCGCAGGCCATTGCGGATAGAGAAAGTATTCGAGCA 594 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 507 AAGACAGTCACAAGTGGCGCTGGCCCCCAGGCCATTGCGGATAGAGAAAGTATTCGGGCA 566 Query 595 AAATCTGAATTTTATGTGCCGTATAACATTCTTCCTCTCGATAAAGGAGGGGTACACCAA 654 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 567 AAATCTGAATTTTATGTGCCGTATAACATTCTTCCTCTTGATAAAGGAGGGGTACACCAA 626 Query 655 GCAATTATGCATCTGCCTGAGATTAAAGCTGCTGTTGCAATTGTACGTAACACTCGCGGG 714 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 627 GCAATTATGCATCTGCCTGAGATTAAAGCTGCTGTTGCAATTGTACGTAACACTCGCGGG 686 Query 715 TTGCCTCCTCCAGAGGAATTTCAGAGACACCAGCCTTTTCTGGATTTATTTGAATTTCTG 774 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 687 TTGCCTCCTCCAGAGGAGTTTCAGAGACACCAGCCTTTTCTGGATTTATTTGAATTTCTG 746 Query 775 CAGTATGCCTTTGGGTTCCAGAATGGAAATGTTGCCAATCAGAGAGAGCATCTGATTCTA 834 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct 747 CAGTATGCCTTTGGGTTCCAGAATGGAAATGTTGCCAATCAGAGAGAGCATATGATCCTA 806 Query 835 CTACTCAGTAACACCATTATACGGCAACCACAGAAGCAGTCTTCAGCTCCAAAGTCTGGT 894 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 807 CTACTCAGTAACACCATTATACGGCAACCTCAGAAGCAGTCTTCAGCACCAAAGTCTGGT 866 Query 895 GATGAGGCAGTAGATGCATTGATGAAGAAGTTTTTTAAGAACTACACGAACTGGTGCAAA 954 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 867 GATGAGGCAGTAGATGCATTAATGAAGAAGTTTTTTAAGAACTACACAAACTGGTGCAAA 926 Query 955 TTTCTTGGGAGAAAAAATAACATTAGGTTGCCCTATGTGAAACAGGAAGCCCTACAATAT 1014 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 927 TTTCTTGGAAGAAAAAATAACATCAGGTTGCCCTATGTGAAACAGGAAGCCCTACAATAT 986 Query 1015 AAAACATTGTATATAGGACTCTACCTTCTCATATGGGGAGAGGCGTCGAACTTGAGGTTC 1074 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 987 AAAACACTGTATATAGGACTCTACCTTCTCATATGGGGAGAGGCGTCGAACTTGAGGTTC 1046 Query 1075 ATGCCAGAGTGCCTGTGTTATATTTTCCACCACATGGCATATGAATTGCATGGAGTTTTA 1134 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1047 ATGCCAGAGTGTCTGTGTTATATTTTCCACCACATGGCATATGAATTGCATGGAGTCTTA 1106 Query 1135 ACCGGTGCAGTTAGTATGATAACTGGGGAGAAGGTTGCTCCAGCATATGGTGGAGGACAC 1194 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| Sbjct 1107 ACCAGTGCAGTTAGTATGATAACTGGGGAGAAGGTCGCGCCAGCATATGGTGGAGGACAC 1166 Query 1195 GAATCTTTCCTTGCGGATGTAGTTACTCCCATATACATGG-TTGTCCAAAAGGAAGCTGA 1253 ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||| Sbjct 1167 GAATCTTTCCTTGCGAATGTAGTTACCCCCATATATA-GGATTGTCGAAAAGGAAGCTGA 1225 Query 1254 GAAGAATAAGAATGGAACTGCTGATCATTCTATGTGGAGAAACTACGATGATCTGAACGA 1313 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || Sbjct 1226 GAAGAACAAGAATGGAACTGCTGATCATTCTATGTGGAGAAATTACGATGATCTGAATGA 1285 Query 1314 GTTCTTCTGGTCTCTTGAATGCTTCGAAATAGGTTGGCCAATGCGTCCCGAGCACGATTT 1373 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1286 GTTCTTCTGGTCTCTTGAATGCTTCGAAATAGGTTGGCCAATGCGTCCGGAGCACGATTT 1345 Query 1374 TTTCTGTGTAGAATCATCAGAAACCAGTAAACCAGGGAGATGGCGAGGAATGCTTAGATT 1433 |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1346 CTTCTGTGTAGAATCATTAGACACCAGTAAACCAGGGAGATGGCGAGGAATGCTTAGATT 1405 Query 1434 TCGCAAGCAGACAAAGAAAACGGATGAAGAAATAGAGGATGACGAAGAACTTGGGGTTCT 1493 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1406 TCGCAAGCAGACAAAGAAAACGGATGAAGAAATGGAGGATGACGAAGAACTTGGGGTTCT 1465 Query 1494 CAGTGAGGAACAACCTAAACCAACCTCAAGATGGCTGGGGAAGACAAATTTTGTAGAGAC 1553 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1466 CAGTGAGGAACAAACTAAACCAACCTCAAGATGGCTGGGGAAGACAAATTTTGTAGAGAC 1525 Query 1554 TCGTTCCTTTTGGCAGATATTCCGGAGCTTTGACAGAATGTGGAGTTTCTTTGTTTTGTC 1613 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1526 TCGTTCCTTTTGGCAGATATTCCGGAGCTTTGACAGAATGTGGAGTTTCTTTGTTTTGTC 1585 Query 1614 CCTACAGGCATTGATAATTATGGCTTGTCATGATGTGGGATCTCCACTCCAAGTGTTTAA 1673 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct 1586 TCTACAGGCATTGATAATTATGGCTTGTCATGATGTGGGATCTCCACTTCAAATGTTTAA 1645 Query 1674 TGCTAATATATTCGAAGACGTCATGAGCATTTTCATTACCTCAGCAATTCTAAAGCTTAT 1733 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1646 TGCCAATATATTTGAAGACGTCATGAGCATTTTCATTACCTCTGCAATTCTAAAGCTTAT 1705 Query 1734 AAAAGGTATTCTTGACATAATCTTCAAGTGGAAAGCAAGAAACACAATGCCGATCAATGA 1793 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1706 AAAAGGTATTCTTGACATAATCTTCAAGTGGAAAGCCAGAAACACAATGCCGATCAATGA 1765 Query 1794 AAAGAAGAAGCGGTTGGTGAAGTTGGGCTTTGCTGCGATGTGGACTATTATTCTACCAGT 1853 ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1766 AAAGAAGAAGCAGATGGTGAAGTTGGGGTTTGCTGCGATGTGGACTATTATTCTACCAGT 1825 Query 1854 GCTGTATTCTCATTCAAGAAGGAAATACATTTGTTATTTCACAAATTACAAAACCTGGCT 1913 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1826 GCTGTATTCTCATTCAAGAAGGAAATACATGTGTTATTTCACAGATTACAAAACCTGGCT 1885 Query 1914 TGGTGAATGGTGTTTTTCTCCATACATGGTGGCAGTCACGATATACCTGACAGGAAGTGC 1973 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1886 TGGTGAATGGTGTTTTTCTCCATACACGGTGGCAGTCACGATATACATGACAGGAAGTGC 1945 Query 1974 AATTGAGTTGGTCTTGTTTTTCGTTCCTGCCATCAGCAAATACATTGAGACCTCCAATCA 2033 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1946 GATTGAGTTGGTCTTGTTTTTCGTTCCTGCCATCAGCAAATACATTGAGACCTCCAATCA 2005 Query 2034 TGGCATCTTTAAAACTTTGTCTTGGTGGGGACAGCCTAGGTTATATGTTGGGCGAGGAAT 2093 | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2006 TCGCATCTTCAAAACTTTGTCTTGGTGGGGACAGCCTAGGTTATATGTTGGGCGAGGAAT 2065 Query 2094 GCAAGAAACTCAGGTGTCACAATTCAAATACACTTTCTTCTGGATTCTGGTTCTCCTGAC 2153 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2066 GCAAGAAACTCAGGTGTCACAATTCAAATACACCTTCTTCTGGATTCTGGTTCTCCTGAC 2125 Query 2154 CAAGTTTGCTTTCAGCTATGCATTTGAGATAAAGCCTCTAATAGAACCTACACGACTGAT 2213 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2126 TAAGTTTTTTTTCAGCTATGCATTTGAGATAAAGCCTCTAATAGAACCTACACGACTGAT 2185 Query 2214 AATGAAAGTTGGTGTGCGGAATTATGAATGGCATGAAATTTTCCCAGAAGTGAAGAGTAA 2273 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2186 AATGAAAGTTGGCGTGCGGAATTATGAATGGCATGAAATTTTCCCAGAAGTGAAGAGTAA 2245 Query 2274 TGCTGCTGCAATTGTTGCAGTATGGGCGCCAATAATGGTGGTCTATTTCATGGATACACA 2333 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2246 TGCTGCTGCAATTGTCGCAGTATGGGCGCCAATAATGGTGGTCTATTTCATGGATACACA 2305 Query 2334 AATATGGTATTCAGTTTACTGTACGATCTTTGGTGGACTGTATGGTGTTCTGCACCACCT 2393 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| Sbjct 2306 AATATGGTATTCAGTTTACTGTACGATCTTTGGTGGGCTGTATGGAGTTCTGCATCACCT 2365 Query 2394 TGGTGAGATTCGAACTTTAGGCATGTTGAGAGGCCGGTTTCATACTTTACCTTCAGCTTT 2453 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2366 TGGTGAGATTCGAACTTTAGGCATGTTGAGAGGCCGGTTTCATACTTTACCTTCTGCTTT 2425 Query 2454 CAATGCATCCCTTATTCCACACTCAACAAAAGATGAGAAAAGGAGAAAACAAAGAGGTTT 2513 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2426 CAATGCATCCCTTATTCCACACTCAGTAAAAGATGAGAAAAGGAGAAAACAAAGAGGCTT 2485 Query 2514 TTTCCCCTTCAATTTAGGCA 2533 |||||||||||||||||||| Sbjct 2486 TTTCCCCTTCAATTTAGGCA 2505 Score = 429 bits (232), Expect = 1e-118 Identities = 287/313 (92%), Gaps = 6/313 (2%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTCTCACGAAATCGTCCCCGTTGATCCCATTGATGTTCCTAGCACGAGTTACTCACGG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct 21 ATGTCTCACGAAATCGTCCCCGTTGATCCCATTGATGTCCCGAGCACGAGTTACTCACGG 80 Query 61 CCAATTCTGGGTCCTCGTGAAGATTCGCCGGAACGTGCTACCGAGTTCACGAGATCCCTA 120 || | ||||| |||||| || |||||||| || || | | |||||||||||||||| Sbjct 81 CCGAGTCTGGCTCCTCGGGATGATTCGCC--AA-TTGGT--C-AGTTCACGAGATCCCTT 134 Query 121 ACTTTTCGGGAACATGTGTCGTCGGAGCCTTTTGATAGCGAGAGGCTTCCAGCGACATTA 180 ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 135 ACTTTTCGGGAACATGTTTCGTCGGAGCCATTTGATAGCGAGAGGCTTCCGGCGACATTA 194 Query 181 GCTTCCGAGATTCAGAGGTTTCTTCGTATTGCTAACTTGGTTGAGTCTGAGGAACCTCGA 240 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 195 GCTTCTGAGATTCAGAGGTTTCTTCGTATAGCTAACTTGGTTGAGTCTGAGGAACCTCGA 254 Query 241 ATTGCTTATCTATGCCGATTTCATGCTTTCGAGATAGCCCACCACATGGATAGAAACTCT 300 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||| Sbjct 255 ATTGCTTATCTATGCCGTTTTCATGCTTTCGAGATAGCTCATCATATGGACAGAAACTCT 314 Query 301 ACCGGAAGAGGTG 313 ||||||||||||| Sbjct 315 ACCGGAAGAGGTG 327 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 224691910992 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5