BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G17750.1 Length=3936 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg479256 jgi|Araly1|479256|fgenesh2_kg.3__1957__AT3G17750.1 6154 0.0 > Ahg479256 jgi|Araly1|479256|fgenesh2_kg.3__1957__AT3G17750.1 Length=3894 Score = 6154 bits (3332), Expect = 0.0 Identities = 3734/3924 (95%), Gaps = 44/3924 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 GCATTATTATTTGCGCATTGGTGGCGTTGATAATGGGATGTCCAAGGAGGAGGGAAGCGC 60 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GCATAATTATTTGCGCATTGGTGGCGTTGATAATGGGATGTCCAAGGAGGAGGGAAGCGC 60 Query 61 CGGGATTGCAGCATAAGCAAATTTATTAAGACGAAGAAGAAGAAGCTCCATTAGATTTTG 120 ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 61 CGGGATTGCAG---AAG-----------A-A-GAAGAAGAAGAAGCTCCATTTGATTTTG 104 Query 121 CAGAACAAATCAAAAGAACTTCAACAAGGAATATTGC---AAGAAATTGATTGAAGCTGC 177 ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| Sbjct 105 CAGAACAAAGC-AAAG-ACTTCAACAAGGAATAATGCAAGAAGAAATTGATTGAAGCTGC 162 Query 178 TCGAATTAGATCTGTTTTGTGAAAATTTGTTTCTAGAGATTTGGGGAAATGGAGGATTCG 237 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct 163 TCGAATTAGATCTGTTTTGTGAAACTTTGTTTCTAGGGATTTGGGGAAATGGAGGACTCG 222 Query 238 AGCTCTATCGATTCGATTTTGGAATTTTTGCGGAAGAATCATTTTATGAGAGCTGAAGCT 297 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 223 AGCTCTATCGACTCGATTTTGGAGTTTTTGCGGAAGAATCGTTTTATGAGAGCTGAAGCT 282 Query 298 GCGTTGATTAGTGAGCTTTCTAAGAAACCAAGTTCAAATGGGTCTCTTCAAAAGCTTAAC 357 ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 283 GCGCTGATTAGTGAGCTTTCTAATAACCCAAGTTCAAATGGGTGTCTTCAAAAGCTTAAC 342 Query 358 TTTGAGGATAATTGTGTGAGCAAGTTGTTGGATAAGAAGAAGC-AAGGCGGGAGTAGCCA 416 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||| Sbjct 343 TTTGAGGATAATGGTGTGAGCAAGTTGTTGGATAAGACGAAGCAAAGG-GGCAGTAGCCA 401 Query 417 AGCATT-GGGTCTTCACAACGATAGTCACATTTCTGATGAATTGGTTGTGAAAGAGATAC 475 |||||| || | |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 402 AGCATTAGGCT-TTCAAAAGGACAGTCACATTTCTGATGAATTGGTTGTGAAAGAGATTC 460 Query 476 AATGTGGAGCTGCCAATAACTTACACGAGAGTAATCTTATGAATGATGTTTCTGTTCAGA 535 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 461 AATGTGGAGCTGCCAATAACTTACGCGAGAGTAATCTTATGAACGATGTTTCTGTTCAGA 520 Query 536 CACAAAGTGGTAATGCAGATTTTTGGGAGGAGAGATTCACGTTTGCTGAAGGATTTGAGG 595 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct 521 CACAAAGTGGTAATGCAGATTTTTGGGAGGAGAGATTCATGTTTTCTGAAGGATTTGAGG 580 Query 596 ATACCGAGCTCGATTTACCTCCCTGGAACCATACCTCTACTGATATTGTAGCTGACTCTG 655 |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 581 ATACCGGGCTTGATTTACCTCCCTGGAACCATAATTCTACCGATATTGTAGCTGACTCTG 640 Query 656 AGGAATACAGTATCAATCCAAGTAAAAGAGGCTTTGTGAATCCACGGAGTTCAAAGCAAT 715 | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 641 AAGTATACAGTATCAATCCAAGTAAAAGAGGCTTTGTGAATCCACGGAGCTCAAAGCAAT 700 Query 716 CAAGTCATGAAAAGGTTCCTGAACCTGGTAAAAGCAATAAAGTGGTTGTGGAAGACGTCT 775 | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct 701 CGAGTCATGAAAAGGTTCCTGAAACTGGTAAAAGCAATGAAGTGGTTGTGGAAGACATCT 760 Query 776 TCTCTTCTTTTGAGAAGATACGGACTGGAAGCTCTAGCCAGGTATCTCAGTATGACCA-T 834 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct 761 TCTCTTCTTGTGAGAAGATACGGACTGGAAGCTCTAGCCAGGTATCTCAGTATGA-CAGT 819 Query 835 GGCAAAGCATGTCAATCTCTGGAAGTTGATAATAAGGTTGGGAACTCTGCAATACAAGAA 894 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 820 GGCAAAGCATGTCAATCTCTGGAAGTTGATAACAAGGTTGGGAACTCTGCAATACAAGAA 879 Query 895 GGATTCGTCACCACGTCATGGTCAAGAAGCGAAGAGAACATTGGTGCTTCACCAGACCAT 954 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 880 GGATTTGTCACCACGTCTTGGTCAAGAAGCGAAGAGAACATTGGTGCTTCACCAGACCAT 939 Query 955 TGGAAGGATTGTTCTGTTACAACTGTTTTTCCGTTGTCCAAAGGAAGCACGTCAACAAAA 1014 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || Sbjct 940 TGGAAGGATTGTTCTGTTACAACTGTTTTTCCATTGTCCAAGGGAAGCACGTCAACAGAA 999 Query 1015 GATAATGGTGTAGCCATTTTAGATAAATGGCAAGGAAAGAAACTGGTTGGCGCGAGTGAT 1074 |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| Sbjct 1000 GATAATAGTGTAGCCATTTTAGACAAAAGGCAAGGAAAGAAAAAGGTTGGCACCAGTGAT 1059 Query 1075 TCCAGGATTCTTATCAAGGAGCAGGAAGATGATGTGGCAACAGCGCTATACCTTGGGAAG 1134 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1060 TCCAGGATTCTTATTAAGGAGCAGGAAGATGATGTGGCAACAGCGCTATACCTTGGAAAG 1119 Query 1135 TCACAGTCTGGTTATGAACATAAGATTCCAAGCAGCTTAGCATTTTCGCTGGCTCATGAT 1194 ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1120 TCACAGTCTGGTTATGAACATAATAATCTAAGCAGCTTAGCATTTTCGCTGCCTCATGAT 1179 Query 1195 GCTCCGAGGGAAGATTTACCTAGACTGCCACATGTAAAAATCAAGTCAGAGGATAAACTA 1254 | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1180 GGTCCGAGGGAAGACTTACCTAGACTGCCACATGTAAAAATCAAGTCAGAGGATAAACCG 1239 Query 1255 ATGAACTTTACTTGGGAAGAAAAACACGAGCGAGACATATTGGACGAGAAGCTGATTAAT 1314 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1240 ATGAACTTTACTTGGGAAGAAAAACATGAGCGAGACATATTGGACGAGAAGCTGATTAAT 1299 Query 1315 ACTGATAATGCTTTCC-TATTAGGCTCTTATCTAGATGTTCCTATTGGACAAGAAATAAA 1373 ||||| ||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1300 ACTGAGAATTCTTTCCTTA-TCGGCTCTTATCTAGATGTTCCTATTGGACAAGAAATCAA 1358 Query 1374 TTCATCAGGTGGCAAAATGGCTGGTGGAGGAAACTGGTTGTCTGTAAGTCACGGAATAGC 1433 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1359 TTCATCAGGTGGCAAAATGGCTGGTGGAGGAAACTGGTTGTCTGTAAGTCACGGAATAGC 1418 Query 1434 AGACGATGCATCTGACTTGATTTTTGGCTTTGGCGATGGCTTAGGTGCTCTCAATGAACA 1493 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1419 AGACAATGCATCTGACTTGATTTTTGGCTTTGGCGATGGATTAGGTGCTCTCAATGAACA 1478 Query 1494 TTCAAATGAGTATTGGGACTCTGATGAATATGACGACGATGATGATGTTGGTTACATTAG 1553 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1479 TTCAAATGAGTATTGGGACTCTGATGAATATGACGACGATGATGATGTTGGTTACATTAG 1538 Query 1554 GCAACCAATTGAGGATGAGGCATGGTTTTTGGGTCACGAAGTCGACTATCCTAGTGATAA 1613 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| Sbjct 1539 GCAACCAATTGAGGATGAGGCATGGTTTTTGGGTCACGAAGTTGACTATCCTAGCGATAA 1598 Query 1614 TGAGAAAGGCACAGAGCACGGAAGTGTTCCTGATACGCAGGATAAAAGTCAAACCAAGAA 1673 ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1599 TGAAAAAGGCACAGAGCGCGGAAGTGTTCCTGATACGCAGGATAAAAGTCAAACCAAGAA 1658 Query 1674 TGATGATGATCATTCATTTGCCGAGGAGGATTCTTATTTCTCCGGTGAGCAATATGTACT 1733 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1659 TGATGATGATCATTCATTTGCCGAGGAGGATTCTTATTTCTCCGGTGAGCAATATGTGCT 1718 Query 1734 CGCTAAAGGCATTGAGCCAGTTACTGCTTCCAATGATCCGATGGGTCTCTCAATGACTGA 1793 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1719 CGCTAAAGGCATTGAGCCAGTTACTGCTTCCAATGATCCGATGGGTCTCTCAATGACTGA 1778 Query 1794 AACATACAGCACGACCAAGCAAGCTGATTTGGTTGCTCGATATGACGGGCAATTGATGGA 1853 ||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1779 AACATACAGCAGGACCAAGGAACCTGATTTGCTTGCTCGATATGACGGGCAATTGATGGA 1838 Query 1854 TGCAGAGGAGCTAAGTTTGATGGACACTGAACCTGTGTGGAAGGGATTTGTCAGCCATGA 1913 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1839 TGCAGAGGAGCTAAGTTTGATGCACACTGAACCTGTGTGGAAGGGATTTGTCAGCCATGA 1898 Query 1914 AAATGATGTAATTTTGTTGAAGAAAGGGAAAGTCGAGGACAACTCTGGTAGAA-TCTGTC 1972 ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || || | |||| Sbjct 1899 AAATGATCTAATTTTGTTGAACAAAGGGAAAGTCGAGGATAACTGTAATA-AACTATGTC 1957 Query 1973 GGAAGGATATCCGCGCAGAAGATGATCGAAATGCTGCAGTTAGGTCAATTGGTGTAGGAA 2032 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1958 CGAAGGATATCCGCGCAGAAGATGATCGAAATGCTGCAGTTAGGTCAATTGGTGTAGGAA 2017 Query 2033 TGAGCGATGATGTTGATGACAATGGGAGTATAATACCTGAATACTTTCCTGGAGAAGGTA 2092 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2018 TGAGCGATGATGTTGATGACAATGGGAGTATAATACCTGAATACTTTCCTGGAGAAGGTA 2077 Query 2093 GTGAATGGGATCTGGAGCTCCTTCCTTATCGCGGAGTTGGAGTTGCTGGTGTTAAGCCTC 2152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| Sbjct 2078 GTGAATGGGATCTGGAGCTCCTTCCTTATCGCGGAGTTGGCGTTGCTGGTGTCAAGCCTC 2137 Query 2153 CACCTGGTAAAGGTGCGAGTATGCTGCTTAAAAACTTTGCA-GATGGTGGATTCTCATTT 2211 |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| Sbjct 2138 CACCTGGTAAAGGTGCAACTATGCAGCTTAAAAACTTTGCAAG-TGGTGGTTTCTCCTTT 2196 Query 2212 CCCTCTCCAGTAGCTGATAGACAGAAGTCCCAGGATGATTCTGCAAACCCTGAATGGTCA 2271 |||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2197 CCCTCTCCAGTACCTGATAGACAGATGTCCCATGAAGATTCTGCAAACCCTGAATGGTCA 2256 Query 2272 AACCATTGCGATGCTGTTGTGAGAAATGAAAGTGATGAACCAAAGGGGCTAATCCAGTCC 2331 ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| Sbjct 2257 AACCATTGCAATGCTGTTGTGAGAAATGAAACTGATGAATCAAAGGGCCTAATCGAGTCC 2316 Query 2332 GATAGCATGATTGTCTCTTCGACAAAAAGATGCAGTGGCTCTTCTTCTGAAAGAAATTTA 2391 ||||| ||| |||| |||| ||||||| || |||| |||||||| |||||||||||| || Sbjct 2317 GATAGTATGGTTGTTTCTTTGACAAAACGACGCAGCGGCTCTTCCTCTGAAAGAAATATA 2376 Query 2392 AGAGACATGGATGATGAAAAGGTTGCGAGTTCAAGAAATTCTTCCCCATCCGCACTCTCC 2451 | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2377 ACAGACATGGATGATGAAAAGGTTGCAAGTTCAAGAAACTCTTCCCCATCCGCACTCTCC 2436 Query 2452 CATAGTTCTGATACTGGGAGAGAGCACAAAGAAGAAGATGAGGAAGAAACTAGTCATGGG 2511 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2437 CATAGTTCTGATACTGGGAGAGAGCACAAGGAAGAAGATGAGGAAGAAACTGGTCATGGG 2496 Query 2512 CCTGAAGAAGATCCTGGGACCTCGTTCGAGGATGAGGATGCCATCGTGGTCCAAGAGCAA 2571 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2497 CCGGAAGAAGATCCTGGGACCTCGTTCGAGGATGAGGATGCAATCGTGGTCCAAGAGCAA 2556 Query 2572 GTAAGACAGATTCAAGCCCAAGAGCAGGATTTTGAGACCTTCAACCTGAAGATTGTTCAC 2631 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2557 GTAAGACAGATTCAAGCCCAAGAGCAGGATTTTGAGACCTTCAACCTGAAGATTGTTCAC 2616 Query 2632 AGGAAAAATAGGACTGGTTTTGAGGAGGATAAGAACTTCCATGTGGTTTTGAATTCTGTC 2691 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2617 AGGAAAAACAGGACTGGTTTTGAGGAGGATAAGAACTTCCATGTGGTTTTGAATTCTGTC 2676 Query 2692 ATTGCTGGTCGTTACCATGTCACTGAGCATCTTGGATCAGCAGCTTTTAGCAAAGCAATA 2751 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2677 ATTGCTGGTCGTTACCATGTCACTGAGCATCTTGGATCAGCAGCTTTTAGCAAAGCAATA 2736 Query 2752 CAAGCACATGACCTCCACACCGGCATTGATGTTTGTGTAAAGATCATAAAGAACAACAAA 2811 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2737 CAAGCACATGACCTCCACACCGGCATTGATGTCTGTGTAAAGATCATAAAGAACAACAAA 2796 Query 2812 GACTTTTTTGATCAAAGCCTTGATGAGATCAAACTTCTCAAGTATGTCAACCAGCATGAT 2871 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2797 GACTTTTTTGACCAAAGCCTTGATGAAATCAAACTTCTCAAGTATGTCAACCAGCATGAT 2856 Query 2872 CCTGCTGACAAATATCATCTCCTTCGACTGTATGACTACTTCTACTTCCGGGAGCACCTG 2931 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2857 CCTGCTGACAAATACCATCTCCTTCGACTGTATGACTACTTCTACTTCCGGGAGCACCTG 2916 Query 2932 TTAATAGTATGTGAACTTCTCAAGGCAAACTTGTATGAGTTCCAAAAGTTTAATAGGGAA 2991 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2917 TTAATAGTATGTGAACTTCTCAAGGCAAACTTGTATGAGTTCCAAAAGTTTAATAGGGAA 2976 Query 2992 TCAGGGGGAGAGGTTTATTTCACTATGCCAAGATTGCAGTCAATTACTATCCAGTGCTTG 3051 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2977 TCAGGTGGAGAGGTTTATTTCACTATGCCAAGATTGCAGTCAATTACTATCCAGTGCTTG 3036 Query 3052 GAAGCATTGAACTTTCTGCATGGTCTCGGCCTTATACACTGCGACTTAAAACCTGAAAAC 3111 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3037 GAAGCATTGAACTTTCTTCATGGTCTGGGCCTTATACACTGCGACTTAAAACCTGAAAAC 3096 Query 3112 ATACTAATCAAAAGCTACAGCAGATGCGAAATCAAAGTTATTGATCTGGGAAGTAGCTGT 3171 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3097 ATACTAATCAAAAGCTACAGCAGATGCGAAATCAAAGTTATTGATCTGGGAAGTAGCTGT 3156 Query 3172 TTTGAGACAGATCATCTTTGCTCCTATGTCCAGTCTAGATCCTACCGTGCTCCAGAAGTC 3231 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3157 TTTGAGACAGATCATCTTTGCTCCTATGTTCAGTCTAGATCCTACCGTGCTCCAGAAGTC 3216 Query 3232 ATTCTTGGGCTTCCATATGATAAAAAGATAGATATCTGGTCACTTGGCTGCATTTTGGCA 3291 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3217 ATTCTTGGGCTTCCATATGATAAGAAGATAGATATCTGGTCACTTGGCTGCATTTTGGCT 3276 Query 3292 GAACTATGTACCGGCAATGTTCTTTTCCAAAATGATTCTCCGGCTACTTTACTTGCAAGG 3351 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| Sbjct 3277 GAACTGTGTACCGGCAATGTTCTTTTCCAAAATGATTCTCCGGCAACTTTGCTTGCAAGG 3336 Query 3352 GTCATCGGTATAATCGGATCAATTGACCAAGAAATGCTTGCCAAAGGACGTGATACATGC 3411 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3337 GTCATCGGTATAATCGGATCCATTGACCAAGAAATGCTTGCCAAAGGACGTGATACATGC 3396 Query 3412 AAGTACTTCACCAAAAATCATTTACTATATGAGAGGAACCAGGAGAGTAACAATTTGGAG 3471 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3397 AAGTACTTCACCAAAAATCATTTACTATATGAGAGGAACCAGGAGAGTAACAATTTGGAG 3456 Query 3472 TACCTAATACCGAAAAAGTCATCGCT-AAGGCGTAGACTACCAATGGGTGACCAAGGCTT 3530 |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3457 TACCTAATACCGAAAAAGTCATCGCTTAAG-CGTAGACTGCCAATGGGTGACCAAGGCTT 3515 Query 3531 CATAGACTTTGTGGCATACTTGCTCCAAGTTGATCCAAAGAAACGCCCGTCTGCATTTGA 3590 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| Sbjct 3516 CATAGACTTTGTGGCATACTTGCTCCAAGTTGATCCAAAGAAACGCCCTTCTGCATCTGA 3575 Query 3591 AGCTCTTAAGCATCCTTGGTTGACTTATCCCTACGAACCCATATCTGCC-TGATTCTGT- 3648 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || Sbjct 3576 AGCTCTTAAGCATCCTTGGTTGACTTATCCCTACGAACCCATATCT-CCGTGATTCGGTC 3634 Query 3649 AGGTGCAACAAAAGCAGAATGGATGAGAGCTAGTCAAGGAAGAAGATGATGGTTTGTTTT 3708 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3635 AGA-GCAACAAAAGCAGAATGGATGAGAGCTAGTCAAGGAAGAAGATGATGGTTTGCTTT 3693 Query 3709 TCAGACATTGTTTTTTGTTGAAAAGTCTGCTGAGAGTGAAATCTTTCAGACCTTGTTGTA 3768 || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3694 TCCCACATT-TTTTTTGTTGAAAAGTCTGCTAAGAGGGAAATCTTTCAGACCTTGTTGTA 3752 Query 3769 TATTAATTTGATGTGTGACTATTGCTCATTTGGTCTCAGCATTTTGTTTCACTGGTAGCT 3828 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3753 TATTAATTTGATGTGTGACTATTGCTCATTTGGTCTCAGCATTTTGTTTCACTGGTAGCT 3812 Query 3829 TGTGAAATATAGTCCCTTCTTCGATTTTGCTTTT-GCCACATGCTTTGGGTATTTGATTA 3887 ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||| Sbjct 3813 TGTGAAATATAGTCCCTTCTTCGATTTTGATTTTTGCCAAATGCTTTGGGT-TT-GATTA 3870 Query 3888 TAT-GATTGTAGCCGGTGATATTT 3910 ||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3871 TATTGATTGTAGCCGGTGATATTT 3894 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 148767052857 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5