BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G19170.1
Length=3559
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg479430 jgi|Araly1|479430|fgenesh2_kg.3__2131__AT3G19170.1 5803 0.0
Ahg923384 jgi|Araly1|923384|scaffold_104665.1 3520 0.0
> Ahg479430 jgi|Araly1|479430|fgenesh2_kg.3__2131__AT3G19170.1
Length=3523
Score = 5803 bits (3142), Expect = 0.0
Identities = 3376/3488 (97%), Gaps = 20/3488 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 tattttacttttttCCTCTACAAGCAAAAAC---ACACA-ACT-ACACAAGGATAAAACC 64
|||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||
Sbjct 1 TATTTTACTTTTTTCCTCGACAAGTAAAAACAAAACACACAATGACACAAGGATAAAACC 60
Query 65 TC--TTGCCGTTGGGTTTA-TTTAGCTTCTTTGCAATATCCTTAATTTCGTCTCCGTCAG 121
|| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 61 TCTTTTGCCGTTGGGTTTATTTTA-CTTCTTTGCAATATCCTT-ATTTCGTCTCCGTCAG 118
Query 122 TAGCAGTCTCCGCCGGGAATAttttttttCCGGTAGCTATGCTCCGAACCGTCTCTTGTT 181
||||||||| ||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||
Sbjct 119 TAGCAGTCTTCGCCGGGAA-A-TATATTTCCGGTAGCGATGCTCCGGACCGTATCTTGTT 176
Query 182 TAGCTTCGCGCAGCTCGTCCTCTCTATTCTTTCGCTTCTTTCGTCAGTTCCCTCGCTCTT 241
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 177 TAGCTTCGCGCAGCTCGGCCTCTCTATTCTTTCGCTTCTTTCGTCAGTTCCCTCGCTCTT 236
Query 242 ACATGTCTCTCACATCGTCGACGGCAGCTCTCCGTGTCCCCAGTCGCAATCTTCGCCGAA 301
|||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 237 ACATGTCTCTAACATCGTCGACGGCCGCTCTCCATGTCCCCAGTCGCAATCTTCGCCGGA 296
Query 302 TTTCCTCTCCCTCAGTCGCCGGTAGACGTCT-TTTGCTCCGACGAGGTTTGAGGATTCCC 360
|||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTTCCTCTCCTTCAGTTGCCGGAAGACGTCTCTTT-CTCCGCCGAGGTTTGAGGATTCCC 355
Query 361 TCCGCCGCAGTTCGCAGTGTCAATGGGCAGTTCTCTCGCCTCTCTGTTCGCGCCGTCGCC 420
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 356 TCCGCCGCAGTTCGTAGTGTCAATGGGCAGTTCTCTCGCCTCTCTGTTCGCGCCGTCGCC 415
Query 421 ACACAACCCGCTCCACTTTATCCTGATGTAGGTCAAGATGAGGCTGAGAAGCTTGGATTT 480
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 416 ACACAACCCGCACCACTTTATCCCGATGTAGGTCAAGATGAGGCTGAGAAGCTTGGATTT 475
Query 481 GAAAAAGTGTCGGAAGAATTCATCTCAGAGTGTAAATCAAAGGCGATACTCTTCAAACAC 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 476 GAAAAAGTGTCGGAAGAATTCATCTCAGAGTGTAAATCAAAGGCGATTCTCTTCAAACAC 535
Query 541 AAGAAAACTGGTTGCGAGGTGATGTCTGTGTCAAATGAGGATGAGAACAAGGTCTTCGGT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 AAGAAAACTGGTTGCGAGGTGATGTCTGTGTCAAACGAGGATGAGAACAAGGTCTTCGGC 595
Query 601 GTTGTTTTCAGAACTCCTCCGAAGGATTCCACTGGCATTCCGCACATACTGGAACATAGC 660
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 596 GTTGTTTTCAGGACTCCTCCGAAGGATTCCACTGGCATTCCGCACATACTGGAACATAGC 655
Query 661 GTTCTATGTGGGTCAAGAAAGTACCCGGTAAAAGAGCCATTTGTTGAACTACTCAAGGGA 720
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 656 GTTCTATGTGGGTCAAGAAAGTACCCGCTAAAAGAGCCATTTGTTGAACTACTCAAGGGA 715
Query 721 AGTTTGCATACTTTTCTAAATGCATTCACATATCCTGATAGGACCTGCTACCCAGTTGCT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 716 AGTTTGCATACTTTTCTAAATGCATTCACATATCCGGATAGGACCTGCTACCCAGTTGCT 775
Query 781 TCCACCAATACAAAGGATTTTTACAATCTTGTCGATGTATATTTGGATGCTGTCTTCTTC 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 776 TCCACCAATACAAAGGATTTTTACAATCTTGTCGATGTATATTTGGATGCTGTCTTCTTC 835
Query 841 CCCAAGTGTGTGGATGACGCT-CACACCTTTCAGCAAGAGGGCTGGCACTATGAACTTAA 899
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 836 CCCAAGTGTGTGGATGACG-TGCACACCTTTCAGCAAGAGGGCTGGCACTATGAGCTTAA 894
Query 900 TGATCCCTCGGAAGACATATCTTACAAAGGTGTTGTTTTTAATGAGATGAAAGGGGTCTA 959
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 895 TGATCCCTCTGAAGACATATCTTACAAAGGTGTTGTTTTTAATGAGATGAAAGGTGTCTA 954
Query 960 TTCACAGCCTGATAATATTTTAGGGCGAATTGCTCAACAGGCCTTA-T--CCCCAGAAAA 1016
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 955 TTCACAGCCTGATAATATTTTAGGGCGAATTGCTCAACAGGCCTTATTAATCCCAGAAAA 1014
Query 1017 TACATATGGTGTTGACAGTGGAGGTGATCCAAAAGATATTCCTAATCTGACATTTGAGGA 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1015 TACATATGGTGTTGACAGTGGAGGTGATCCAAAAGATATCCCTAAGCTGACATTTGAGGA 1074
Query 1077 ATTCAAGGAGTTCCACCGTCAATATTATCACCCAAGCAACGCCAGGATCTGGTTCTATGG 1136
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 ATTCAAGGAGTTCCACCGTCAGTATTATCACCCAAGCAATGCCAGGATCTGGTTCTATGG 1134
Query 1137 AGATGATGATCCCGTTCACCGCCTCCGTGTCTTGAGTGAATACTTGGATATGTTTGAAGC 1196
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1135 AGATGATGATCCCGTTCACCGCCTTCGTGTCTTAAGTGAATACTTGGACATGTTTGAAGC 1194
Query 1197 AAGTCCATCTCCCAATAGTTCAAAGATTAAATTTCAAAAGCTATTCTCTGAGCCTGTCAG 1256
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1195 AAGTCCATCTCCCGATAGTTCAAAGATTAAACCTCAAAAGTTATTCTCTGAGCCTGTCAG 1254
Query 1257 ACTGGTTGAGAAATATCCTGCTGGTCGAGATGGTGACCTTAAAAAGAAGCATATGTTGTG 1316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1255 ACTGGTTGAGAAATATCCTGCTGGTCGAGATGGTGACCTTAAAAAGAAGCACATGTTGTG 1314
Query 1317 CGTTAACTGGCTATTGTCTGAGAAGCCCTTGGACTTGCAAACTCAACTTGCACTTGGCTT 1376
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315 TGTTAACTGGCTATTGTCTGAGAAGCCCTTGGACTTGCAAACTCAACTTGCACTTGGCTT 1374
Query 1377 CTTGGATCATCTTATGCTGGGGACTCCTGCTTCACCACTAAGAAAGATCTTATTGGAAAG 1436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1375 CTTGGATCATCTTATGCTGGGGACTCCTGCTTCACCACTAAGAAAAATCTTATTGGAAAG 1434
Query 1437 CGGTTTAGGAGAAGCTCTTGTCAGTAGTGGGTTGTCAGACGAACTCTTGCAGCCCCAGTT 1496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435 CGGTTTAGGAGAAGCTCTTGTCAGTAGTGGGTTGTCAGACGAACTCTTGCAGCCCCAGTT 1494
Query 1497 CGGTATTGGTTTGAAAGGTGTGTCCGAAGAGAATGTTCAAAAGGTTGAAGAGTTGATCAT 1556
| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 CAGTATTGGTTTGAAAGGTGTGTCCGAAGATAATGTTCAAAAGGTTGAAGAGTTGATCAT 1554
Query 1557 GGATACTCTGAAAAAGTTGGCAGAAGAAGGGTTTGACAATGATGCTGTGGAGGCATCCAT 1616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GGATACTCTGAAAAAGTTGGCAGAAGAAGGGTTTGACAATGATGCTGTGGAGGCATCCAT 1614
Query 1617 GAATACAATTGAGTTTTCTTTGAGGGAAAACAACACAGGATCTTTCCCTCGTGGTTTATC 1676
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615 GAATACAATTGAGTTTTCTCTGAGGGAAAACAACACAGGATCTTTCCCTCGTGGTTTATC 1674
Query 1677 ACTTATGCTCCAATCTATTTCAAAATGGATATACGATATGGATCCTTTTGAGCCATTAAA 1736
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 ACTTATGCTCCAATCTATTGCAAAATGGATATACGATATGGATCCTTTTGAGCCATTAAA 1734
Query 1737 GTATACGGAACCATTGAAGGCCCTGAAAACCAGAATAGCTGAGGAGGGATCCAAGGCTGT 1796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 1735 GTATACGGAACCATTGAAGGCCCTGAAAACCAGAATAGCGGAGGAGGGATCCAAGGCCGT 1794
Query 1797 CTTTTCCCCACTGATAGAGAAGCTTATCTTGAACAACTCGCATCGTGTTACCATAGAGAT 1856
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1795 CTTTTCCCCACTGATAGAGAAGTTTATCTTGAACAACTCGCATCGTGTTACCATAGAGAT 1854
Query 1857 GCAGCCTGATCCTGAAAAAGCTACTCAAGAGGAAGTGGAAGAGAAAAATATCCTGGAAAA 1916
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855 GCAGCCTGATCCCGAAAAAGCTACTCAAGAGGAAGTGGAAGAGAAAAATATCCTGGAAAA 1914
Query 1917 AGTTAAAGCAGCTATGACAGAAGAAGATCTTGCAGAGCTAGCACGTGCTACAGAGGAGCT 1976
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 AGTCAAAGCAGCTATGACAGAAGAAGATCTTGCAGAGCTAGCACGTGCTACAGAGGAGCT 1974
Query 1977 GAAATTGAAACAAGAAACTCCTGACCCTCCTGAAGCATTGAGATGTGTCCCAAGTTTGAA 2036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1975 AAAATTGAAACAAGAAACTCCTGACCCTCCTGAAGCATTGAGATGTGTCCCAAGTTTGAA 2034
Query 2037 CTTGGGTGACATTCCAAAAGAACCTACTTATGTTCCCACCGAGGTTGGAGATATTAATGG 2096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2035 CTTGGGTGACATTCCAAAAGAACCTACTTATGTTCCCACCGAGGTTGGAGATATTAATGG 2094
Query 2097 TGTGAAGGTTTTGCGGCATGACCTTTTCACCAATGATATTATCTATACTGAAGTAGTCTT 2156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 2095 TGTGAAGGTTTTGCGGCATGACCTTTTCACCAATGATATAATCTACGCTGAAGTAGTCTT 2154
Query 2157 TGATATTGGTTCGCTGAAACATGAGCTTCTTCCACTAGTACCACTTTTCTGTCAATCATT 2216
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155 TGATATTGGTTCCCTGAAACATGAGCTTCTTCCACTAGTACCACTTTTCTGTCAATCATT 2214
Query 2217 ACTGGAGATGGGCACAAAAGATTTGACTTTTGTTCAACTTAATCAGTTGATTGGAAGGAA 2276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 ACTGGAGATGGGCACAAAAGATTTGACTTTTGTTCAACTTAATCAGTTGATTGGAAGGAA 2274
Query 2277 AACGGGAGGGATATCAGTTTATCCCCTTACATCATCAGTGAGGGGTAAGGATGAACCATG 2336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2275 AACGGGAGGGATATCAGTTTATCCCCTTACATCATCAGTGAGGGGTAAGGATGAACCATG 2334
Query 2337 CAGCAAAATTATCGTACGCGGAAAATCCATGGCTGGGCGTGCTGACGACCTTTTTAACCT 2396
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2335 CAGCAAAATTATCATACGCGGAAAATCCATGGCTGGGCGTGCTGACGACCTTTTTAACCT 2394
Query 2397 GATGAACTGCTTGTTGCAAGAGGTTCAATTTACAGATCAGCAGAGGTTTAAACAGTTTGT 2456
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2395 GATGAATTGCTTGTTGCAAGAGGTTCAATTTACAGATCAGCAGAGGTTTAAACAGTTTGT 2454
Query 2457 CTCTCAAAGCAGAGCACGGATGGAGAACCGATTGAGGGGAAGTGGTCATGGAATTGCTGC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2455 CTCTCAAAGCAGAGCACGGATGGAGAACCGATTGAGGGGAAGTGGTCATGGAATTGCTGC 2514
Query 2517 GGCGAGGATGGATGCAATGTTGAACATTGCTGGATGGATGTCTGAACAGATGGGTGGTCT 2576
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2515 GGCGAGAATGGATGCAATGTTGAACATTGCTGGATGGATGTCTGAACAGATGGGTGGTCT 2574
Query 2577 CAGCTATCTTGAATTTTTACATACTCTTGAAAAGAAAGTGGATGAAGACTGGGAAGGAAT 2636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2575 CAGCTATCTTGAATTTTTACATACTCTTGAAAAGAAAGTGGATGAAGACTGGGAAGGAAT 2634
Query 2637 TTCATCCTCGCTTGAGGAGATCAGAAGATCTCTCCTTGCTAGAAACGGTTGCATAGTTAA 2696
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||
Sbjct 2635 TTCATCCTCACTTGAGGAGATCAGAAGATCTCTCCTTGCCAGGAATGGTTGCATAGTTAA 2694
Query 2697 TATGACTGCTGATGGGAAGTCTCTCACAAATGTCGAAAAATCTGTTGCAAAATTTCTAGA 2756
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2695 CATGACTGCTGATGGGAAGTCTCTCACCAACGTCGAAAAATCTGTTGCGAAATTTCTAGA 2754
Query 2757 TTTACTCCCTGAGAACCCGTCTGGTGGGCTTGTCACTTGGGATGGTCGACTTCCTCTGAG 2816
|||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2755 TTTACTCCCTGAGAACCCCTCCGGTGGGCTGGTCACTTGGGATGGTCGACTTCCTCTCAG 2814
Query 2817 AAATGAAGCCATTGTAATACCAACCCAGGTAAACTATGTTGGAAAAGCGGGTAACATATA 2876
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2815 AAATGAAGCAATTGTGATACCAACCCAGGTAAACTATGTTGGAAAAGCGGGTAACATATA 2874
Query 2877 CAGCACCGGGTATGAGCTTGATGGCAGTGCGTATGTTATATCAAAGCATATTAGCAATAC 2936
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2875 CAGCACCGGGTATGAGCTTGATGGCAGTGCATATGTTATATCAAAGCATATAAGCAATAC 2934
Query 2937 ATGGTTATGGGATCGTGTTCGTGTAAGTGGTGGTGCATATGGAGGTTTCTGTGATTTCGA 2996
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2935 ATGGTTATGGGATCGTGTTCGTGTAAGCGGTGGTGCATATGGAGGTTTCTGTGATTTCGA 2994
Query 2997 TTCGCATTCAGGAGTATTTTCTTACTTATCGTACCGGGATCCAAACTTGTTGAAGACACT 3056
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2995 TTCGCATTCAGGAGTATTTTCTTACTTATCTTACCGGGATCCAAACTTGTTGAAGACACT 3054
Query 3057 TGATATATATGATGGAACTGGAGATTTCTTACGTGGCCTTGATGTGGATCAAGAAACACT 3116
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3055 TGACATATATGATGGAACTGGAGATTTCTTACGTGGCCTTGATGTGGATCAAGAAACACT 3114
Query 3117 CACTAAAGCTATTATTGGCACCATCGGTGATGTTGATTCATACCAATTACCTGATGCCAA 3176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3115 CACTAAAGCTATTATTGGCACCATCGGTGATGTTGATTCATACCAATTACCTGATGCCAA 3174
Query 3177 AGGTTATAGCAGTTTGTTGAGGCATTTACTCGGAGTAACTGACGAAGAACGACAAAGAAA 3236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3175 AGGTTATAGCAGTTTGTTGAGGCATTTACTCGGAGTAACTGACGAAGAACGACAAAGAAA 3234
Query 3237 GCGTGAAGAGATACTAACAACAAGTTTGAAGGACTTCAAGGATTTCGCACAAGCAATAGA 3296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3235 GCGTGAAGAGATACTAACAACAAGTTTGAAGGACTTCAAGGATTTCGCAGAAGCAATAGA 3294
Query 3297 TGTGGTTAGAGATAAAGGTGTTGCGGTGGCTGTGGCATCCGCGGAAGACATTGATGCAGC 3356
|| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3295 TGCGGTTAGAGATAATGGTGTTGCGGTGGCTGTGGCATCCGCAGAAGACATTGATGCAGC 3354
Query 3357 GAACAATGAACGCTCCAACTTTTTCGAGGTGAAGAAAGCTCTCTAAACAGATTGGACAAC 3416
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3355 AAACAATGAACGCTCCAACTTTTTCGAGGTGAAGAAAGCTCTCTAAAGGGATTGGACAAC 3414
Query 3417 TTTCAGTAATACTATTTACGATTGAGAATCTCATTAGATTTCTCTTGGTTTCTTTTCTAC 3476
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3415 TTTCAC-AATAATATTTACGATTGAGAATCTCATTAGATTTCTCTTGGTTTCTTTTCTAC 3473
Query 3477 CGGAGTCA 3484
||||||
Sbjct 3474 TAGAGTCA 3481
> Ahg923384 jgi|Araly1|923384|scaffold_104665.1
Length=3272
Score = 3520 bits (1906), Expect = 0.0
Identities = 2674/3045 (88%), Gaps = 51/3045 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 380 TCAATGGGCAGTTCTCTCGCCTCTCTGTTCGCGCCGTCGCCACACAACCCGCTCCACTTT 439
||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||| ||| ||
Sbjct 232 TCAATGGACAGTTCTCTCGCTTATCCATTCGCGCCGTCGCTACACAATCCG---CACCTT 288
Query 440 ATCCTGA-TGTAGGTCAAGATGAGGCTGAGAAGCTTGGATTTGAAAAAGTGTCGGAAGAA 498
| | | | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||
Sbjct 289 CTTC-AATTCCCGGTCAAGATGAAGCTGAGAAGCTTGGATTTGAGAAAGTCTCTGAAGAG 347
Query 499 TTCATCTCAGAGTGTAAATCAAAGGC-GATACTCTTCAAACACAAGAAAACTGGTTGCGA 557
|| ||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 348 TTTATCTCAGAGTGTAAATCTAAGGCTG-TTCTCTTCAGACACAAGAAAACCGGTTGCGA 406
Query 558 GGTGATGTCTGTGTCAAATGAGGATGAGAACAAGGTCTTCGGTGTTGTTTTCAGAACTCC 617
|||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||| |||||
Sbjct 407 GGTGATGTCTGTTTCAAACGATGATGAGAACAAGGTGTTTGGCATTGTTTTCAGGACTCC 466
Query 618 TCCGAAGGATTCCACTGGCATTCCGCACATACTGGAACATAGCGT-TCTATGTGGGTCAA 676
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 467 TCCGAAAGATTCCACTGGCATTCCTCACATACTGGAACATAGCGTAT-TATGTGGGTCAA 525
Query 677 GAAAGTACCCGGTAAAAGAGCCATTTGTTGAACTACTCAAGGGAAGTTTGCATACTTTTC 736
||||||||||| | || || |||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| |
Sbjct 526 GAAAGTACCCGCTGAAGGAACCATTTGTCGAATTATTAAAGGGAAGTTTGCATACTTTCC 585
Query 737 TAAATGCATTCACATATCCTGATAGGACCTGCTACCCAGTTGCTTCCACCAATACAAAGG 796
| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 586 TTAATGCATTCACATATCCTGATAGGACTTGCTACCCAGTTGCTTCCACAAATACAAAGG 645
Query 797 ATTTTTACAATCTTGTCGATGTATATTTGGATGCTGTCTTCTTCCCCAAGTGTGTGGATG 856
|||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 646 ATTTCTACAACCTTGTCGATGTATACTTGGATGCTGTGTTCTTCCCCAAGTGTGTGGATG 705
Query 857 ACGCTCACACCTTTCAGCAAGAGGGCTGGCACTATGAACTTAATGATCCCTCGGAAGACA 916
||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||
Sbjct 706 ACGTTCACACTTTTCAGCAGGAGGGTTGGCACTATGAGCTTAACGATCCTTCAGAAGACA 765
Query 917 TATCTTACAAAGGTGTTGTTTTTAATGAGATGAAAGGGGTCTATTCACAGCCTGATAATA 976
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 766 TATCTTACAAAGGCGTTGTTTTTAATGAGATGAAAGGTGTCTATTCACAACCTGATAATA 825
Query 977 TTTTAGGGCGAATTGCTCAACAGGCCTTATCCCCAGAAAATACATATGGTGTTGACAGTG 1036
| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 826 TACTAGGGCGGATTACTCAACAGGCCTTATGCCCGGAAAATACATACGGTGTTGACAGTG 885
Query 1037 GAGGTGATCCAAAAGATATTCCTAATCTGACATTTGAGGAATTCAAGGAGTTCCACCGTC 1096
||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 886 GAGGTGATCCAAAAGATATCCCTAATCTTACGTTTGAGGAATTTAAGGAGTTCCACCGTC 945
Query 1097 AATATTATCACCCAAGCAACGCCAGGATCTGGTTCTATGGAGATGATGATCCCGTTCACC 1156
||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 946 AATATTATCACCCAAACAATGCCAGGATATGGTTCTATGGAGATGATGATCCAGTTCACC 1005
Query 1157 GCCTCCGTGTCTTGAGTGAATACTTGGATATGTTTGAAGCAAGTCCATCTCCCAATAGTT 1216
||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||
Sbjct 1006 GCCTCTGCGTCTTGAGTGAATACTTGAACATGTTTGATGCAAGTCCAGCTCGTGATAGTT 1065
Query 1217 CAAAGATTAAATTTCAAAAGCTATTCTCTGAGCCT-GTCAGACTGGTTGAGAAATATCCT 1275
||||| || || |||||||||||||||| |||| | |||| | ||||| |||||||||
Sbjct 1066 CAAAGGTTGAACCACAAAAGCTATTCTCTGGGCCTCG-CAGAATTGTTGAAAAATATCCT 1124
Query 1276 GCTGGTCG-AGATGGTGACCTTAAAAAGAAGCATATGTTGTGCGTTAACTGGCTATTGTC 1334
|||||| | |||||| |||||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||| | ||
Sbjct 1125 GCTGGT-GAAGATGGCGACCTTAAGAAGAAACGTATGGTGTGCCTTAACTGGCTGCTCTC 1183
Query 1335 TGAGAAGCC-CTTGGACTTGCAAACTCAACTTGCACTTGGCTTCTTGGATCATCTTATGC 1393
||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 1184 TGACAAGCCAC-TGGACTTGCAAACTCAACTCGCGCTTGGGTTTTTGGATCATCTTATGC 1242
Query 1394 TGGGGACTCCTGCTTCACCACTAAGAAAGATCTTATTGGAAAGCGGTTTAGGAGAAGCTC 1453
| |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1243 TTGGGACTCCTGCTTCCCCATTGAGAAAAATCTTATTGGAAAGCGGATTAGGAGAAGCTC 1302
Query 1454 TTGTCAGTAGTGGGTTGTCAGACGAAC-TCTTGCAGCCCCAGTTCGGTATTGGTTTGAAA 1512
|||| | ||||||| || ||| |||| || | |||||||| ||| |||| |||||||||
Sbjct 1303 TTGTTAATAGTGGGATGGAAGATGAACTTC-TCCAGCCCCAATTCAGTATAGGTTTGAAA 1361
Query 1513 GGTGTGTCCGAAGAGAATGTTCAAAAGGTTGAAGAGTTGATCATGGATACTCTGAAAAAG 1572
||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||
Sbjct 1362 GGTGTTTCCGATGATAATGTCCAAAAGGTTGAAGACTTGGTCATGAATACTCTGAGAAAC 1421
Query 1573 TTGGCAGAAGAAGGGTTTGACAATGATGCTGTGGAGGCATCCATGAATACAATTGAGTTT 1632
|||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 1422 TTGGCAGATGAGGGGTTTGACACTGATGCTGTTGAGGCATCTATGAATACCATTGAGTTT 1481
Query 1633 TCTTTGAGGGAAAACAACACAGGATCTTTCCCTCGTGGTTTATCACTTATGCTCCAATCT 1692
||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1482 TCTCTGAGAGAAAACAATACAGGGTCTTTCCCTCGTGGTTTATCACTTATGCTTCAATCA 1541
Query 1693 ATTTCAAAATGGATATACGATATGGATCCTTTTGAGCCATTAAAGTAT-ACGGAACCATT 1751
||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||
Sbjct 1542 ATTGCGAAATGGATATACGACATGGATCCTTTTGAGCCATTAAAGTATGA-GGAATCATT 1600
Query 1752 GAAGGCCCTGAAAACCAGAATAGCTGAGGAGGGATCCAAGGCTGTCTTTTCCCCACTGAT 1811
|||| |||||||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1601 GAAGTCCCTGAAAGCTAGAATAGCTGAGAAAGGATCTAAGGCTGTCTTTTCCCCTCTGAT 1660
Query 1812 AGAGAAGCTTATCTTGAACAACTCGCATCGTGTTACCATAGAGATGCAGCCTGATCCTGA 1871
|||| || |||| ||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||
Sbjct 1661 AGAGGAGTTTATTTTGAACAACCCTCATTGTGTTACTATCGAGATGCAGCCTGATCCAGA 1720
Query 1872 AAAAGCTACTCAAGAGGAAGTGGAAGAGAAAAATATCCTGGAAAAAGTTAAAGC-AGCTA 1930
|||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| || ||
Sbjct 1721 GAAAGCTTCTCAAGAGGAAGCGGAGGAGAAAATTATTCTAGAAAAAGTTAAAGCAAG-TA 1779
Query 1931 TGACAGAAGAAGATCTTGCAGAGCTAGCACGTGCTACAGAGGAGCTGAAATTGAAACAAG 1990
|||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 1780 TGACAGAAGAGGATCTTGCAGAACTAGCGCGTGCCACAGAGGAGTTGAAATTGAAGCAAG 1839
Query 1991 AAACTCCTGACCCTCCTGAAGCATTGAGATGTGTCCCAAGTTTGAACTTGGGTGACATTC 2050
| ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 1840 AGACTCCTGACCCTCCTGAAGCACTGAAATGCGTTCCAAGTTTAAACTTGAGTGACATTC 1899
Query 2051 CAAAAGAACCTACT-TATGTTCCCACCGAGGTTGGAGATATTAATGGTGTGAAGGTTTTG 2109
|||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1900 CAAAAGAACCTA-TATATGTTCCCACTGAGGTTGGAGATATTAATGGCGTGAAGGTTTTG 1958
Query 2110 CGGCATGACCT-TTTCACCAATGATATTA-TCTATACTGAAGTAGTCTTTGATATTGGTT 2167
|||||||| || ||| || ||||||| || |||| |||||||||||||||||||| || |
Sbjct 1959 CGGCATGATCTCTTT-ACAAATGATA-TACTCTACACTGAAGTAGTCTTTGATATGGGCT 2016
Query 2168 CGCTGAAACATGAGCTTCTTCCACTAG-TACCACTTTTCTGTCAATCATTACTGGAGATG 2226
| || |||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2017 CACTAAAACATGAGCTTCTTCAACT-GATACCTCTCTTCTGTCAATCATTACTAGAGATG 2075
Query 2227 GGCACAAAAGATTTGACTTTTGTTCAACTTAATCAGTTGATTGGAAGGAAA-ACGGGAGG 2285
||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| || |||||
Sbjct 2076 GGCACGCAAGATTTGACTTTTGTACAACTTAATCAGTTAATTGGAA-GAAAGACCGGAGG 2134
Query 2286 GATATCAGTTTATCCCCTTACATCATCAGTG-AGGGGTAAGGATGAACCATGCAGCAAAA 2344
|||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| |||||| ||||| |||||||
Sbjct 2135 GATATCAGTTTATCCCCTTACATCCTCTGTGTA-TGGTAGGGATGATCCATGTAGCAAAA 2193
Query 2345 TTATCGTACGCGGAAAATCCATGGCTGGGCGTGCTGACGACCTTTTTAACCTGATGAACT 2404
|||| || || ||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 2194 TTATTGTGCGTGGAAAATCCATGGTTGGACGCGCTGAAGACCTTTTCAACCTGATGAACT 2253
Query 2405 GCT-TGTTGCAAGAGGTTCAATTTACAGATCAGCAGA-GGTTTAAACAGTTTGTCTCTCA 2462
| | || |||||||||||| |||||||||| | || | |||||||||| || ||||||||
Sbjct 2254 G-TGTGCTGCAAGAGGTTCGATTTACAGATAAACA-ACGGTTTAAACAATTCGTCTCTCA 2311
Query 2463 AAGCAGAGCACGGATGGAGAACCGATTGAGGGGAAGTGGTCATGGAATTGCTGCGGCGAG 2522
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 2312 GAGTAGAGCACGAATGGAGAACCGATTGAGGGGAAGTGGTCAAGGAATTGCTGCTGCGAG 2371
Query 2523 GATGGATGCAATGTTGAACATTGCTGGATGGATGTCTGAACAGATGGGTGGTCTCAGCTA 2582
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2372 GATGGATGCAATGTTGAACGTTGCTGGATGGATGTCTGAACAGATGGGTGGTCTCAGTTA 2431
Query 2583 TCTTGAATTTTTACATACTCTTGAAAAGAAAGTGGATGAAGACTGGGAAGGAATTTCATC 2642
||||||||| |||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2432 CCTTGAATTTCTACACACCCTTGAACAGAAGGTGGATCAAGACTGGGAAGGAATTTCATC 2491
Query 2643 CTCGCTTGAGGAGATCAGAAGATCTCTCCTTGCTAGAAACGGTTGCATAGTTAATATGAC 2702
||| |||||||| |||||||||||| ||||| | || || ||||||||||||||||||||
Sbjct 2492 CTCACTTGAGGAAATCAGAAGATCTTTCCTTTCCAGGAATGGTTGCATAGTTAATATGAC 2551
Query 2703 TGCTGATGGGAAGTCTCTCACAAATGTC-GAAAAATCTGTTGCAAAATTTCTAGATTTAC 2761
||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 2552 TGCTGATGGGAAGTCCCTCACAAA-CACGGAAAAATATGTTGGAAAATTTCTTGATTTAC 2610
Query 2762 TCCCTGAGAACCCGTCTGGTGGGCTTGTCACTTGGGATGGTCGACTTCCTCTGAGAAATG 2821
||||||| || || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 2611 TCCCTGAAAATCCATCTGGTGGACTCGTCACTTGGGATGCACGACTTCCTTTGAGAAATG 2670
Query 2822 AAGCCATTGTAATACCAACCCAGGTAAACTATGTTGGAAAAGCGGGTAACATATACAGCA 2881
|||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 2671 AAGCAATTGTGATACCAACCCAGGTGAACTATGTTGGAAAAGCGGGAAATATATACAGCA 2730
Query 2882 CCGGGTATGAGCTTGATGGCAGTGCGTATGTTATATCAAAGCATATTAGCAATACATGGT 2941
|| || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 2731 GTGGCTACGAGCTTGATGGAAGTTCATATGTTATATCAAAGCATATTAGTAACACATGGT 2790
Query 2942 TATGGGATCGTGTTCGTGTAAGTGGTGGTGCATATGGAGGTTTCTGTGATTTCGATTCGC 3001
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2791 TATGGGATCGTGTCCGTGTAAGTGGTGGTGCATATGGAGGTTTCTGTGATTTTGATTCAC 2850
Query 3002 ATTCAGGAGTATTTTC-TTACTTATCGTACCGGGATCCAAACTTGTTGAAGACACTTGAT 3060
|||| ||||||||||| || |||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| || ||
Sbjct 2851 ATTCGGGAGTATTTTCGTT-CTTATCTTACCGTGATCCCAACCTATTAAAGACTCTGGAC 2909
Query 3061 ATATATGATGGAACTGGAGATTTCTTACGTGGCCTTGATGTGGATCAAGAAACACTCACT 3120
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| || || |||
Sbjct 2910 ATATATGATGGAACTGGGGATTTCTTACGTGGCCTCGATGTCGATGAAGACACCCTTACT 2969
Query 3121 AAAGCTATTATTGGCACCATCGGTGATGTTGATTCATACCAATTACCTGATGCCAAAGGT 3180
||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 2970 AAAGCAATTATTGGGACAATTGGCGATGTTGATTCATACCAACTCCCTGATGCCAAAGGT 3029
Query 3181 TATAGCAGTTTGTTGAGGCATTTACTCGGA-GTAACTGACGAAGA-ACGACAAAGAA-AG 3237
|||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| | | |||| || |
Sbjct 3030 TATAGCAGTTTGTTGAGGCATTTACTTA-ATGTAACCGATGAAGAGAGG-CAAATAAGA- 3086
Query 3238 CGTGAAGAGATACTAACAACAAGTTTGAAGGACTTCAAGGATTTCGCACAAGCAATAGA- 3296
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||
Sbjct 3087 CGTGAAGAGATACTATCAACAAGTTTGAAGGACTTCAAGGAATTCGCAGAGGCAATAGAC 3146
Query 3297 TGTGGTTAGAGATAAAGGTGTTGCGGTGGCTGTGGCATC-CGCGGAAGACATTGATGCAG 3355
| | ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | | |||||||||||||||
Sbjct 3147 TCAG-TTAGAGATAAAGGCGTTGCAGTGGCAGTGGCATCACAAG-AAGACATTGATGCAG 3204
Query 3356 CGAACAATGAACGCTCCAACTTTTTCGAGGTGAAGAAAGCTCTCT 3400
| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3205 CAAACAAAGAACGCTCAAACTTTTTCGAGGTGAAGAAAGGTCTCT 3249
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 134419347836
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5