BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G21180.1 Length=3771 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg479638 jgi|Araly1|479638|fgenesh2_kg.3__2339__AT3G21180.1 6093 0.0 > Ahg479638 jgi|Araly1|479638|fgenesh2_kg.3__2339__AT3G21180.1 Length=3734 Score = 6093 bits (3299), Expect = 0.0 Identities = 3621/3770 (96%), Gaps = 47/3770 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 AGTTTCTCttttttttCTCTGTGATTGACAGAGAGGTAAGAGaaaaaaaaGAGAGAAAGT 60 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 AGTTTCTCTTTTTTTTCTCTGTAATTGACAGAGAGGTAAGAGAAAAAAAAGAGAGAAAGT 60 Query 61 G-TTTCGGTTTTTGTTGCCTTCTCTCGAGTTAGGCCTTCTCTCTTCCGTCACACCATCA- 118 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 61 GTTTTCGGTTTTTGTTGCCTTCTCTTGAGTTAGGCCTTCTCTCTTCCGTCCCACCATCAT 120 Query 119 -ttttttttCTCCATAACGACCAAATCATAAAACCGGTCGTTCCTAttttttctttctct 177 |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| Sbjct 121 TTTTTTTTTTTCCATAACGACCAAATCATAAAACAGGTCGTTCCTA-TTTTTC-TT-TCT 177 Query 178 gcgttttttgtttCGAATTCTTCAATAGAATTTTAAAAGAAAGAAGAAAGCTGGGTGAGA 237 | || || | | |||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct 178 -C------TG---CG------T---T----TTTTGAAAG-AAGAAGAAAGCTGGGTGAGA 213 Query 238 CGAAGGAAGGAAGAATGAGCACTTCGTCGAGCAACGGATTGCTTCTGACGTCAATGTCAG 297 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 214 CGAAGGAAGGAAGAATGAGCACTTCGTCGAGCAATGGATTGCTCCTGACGTCAATGTCAG 273 Query 298 GACGTCATGACGACATGGAAGCTGGTTCTGCTAAAACTGAAGAACATTCTGATCATGAAG 357 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 274 GTCGTCATGACGACATGGAAGCTGGTTCTGCTAAAACTGAAGAACATTCTGATCATGAAG 333 Query 358 AGCTTCAACATGATCCTGATGATCCTTTTGATATTGATAACACCAAGAACGCTTCTGTTG 417 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 334 AGCTTCAACATGATCCTGATGATCCTTTTGACATTGATAACACCAAGAATGCTTCTGTTG 393 Query 418 AATCTCTTCGTCGTTGGAGACAAGCCGCTCTTGTGTTGAACGCATCGCGTCGGTTTCGAT 477 ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 394 AATCTCTTCGTCGTTGGAGGCAAGCGGCTCTTGTGTTGAACGCATCTCGTCGGTTTCGAT 453 Query 478 ACACTTTGGATCTTAATAAAGAAGAACATTATGATAATCGAAGGAGGATGATCAGAGCTC 537 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 454 ACACTTTGGATCTTAATAAAGAAGAACATTATGATAATCGAAGGAGGATGATCAGAGCTC 513 Query 538 ATGCTCAAGTCATTAGGGCAGCATTGCTTTTTAAACTGGCTGGTGAACAACAAATTGCGT 597 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 514 ATGCTCAAGTCATTAGGGCAGCATTGCTTTTTAAATTGGCTGGTGAACAACAACTTGCGT 573 Query 598 TTGG---ATCATCAACACCAGCAGCTTCTACTGGTAACTTTGACATTGATCTTGAAAAGC 654 |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 574 TTGGATCATCATCAACACCAGCAGCTTCAACTGGTAACTTTGACATTGATCTTGAAAAGC 633 Query 655 TTGTGTCTATGACAAGGAACCAGAACATGTCCAATTTGCAGCAATATGGAGGGGTCAAAG 714 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 634 TTGTGTCAATGACAAGGAACCAGAAGATGTCCAATTTGCAGCAATATGGAGGGGTCAAAG 693 Query 715 GTGTTGCAGAGAAGTTGAAGTCAAATATGGAACAAGGAATCAATGAGGATGAGAAAGAGG 774 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 694 GTGTTGCAGAGAAGCTGAAGTCAAATATGGAACAAGGAATCAATGAGGATGAGAAAGAGG 753 Query 775 TGATAGATAGGAAGAATGCTTTTGGATCTAACACTTACCCAAAAAAGAAGGGGAAAAACT 834 |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct 754 TGATAGATGGGAAGAATGCTTTTGTATCTAACACATACCCAAAGAAGAAGGGGAAAAACG 813 Query 835 TTTTTATGTTCCTCTGGGAAGCTTGGCAAGATTTAACTCTCATCATCTTGATCATAGCGG 894 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 814 TCTTTATGTTCCTCTGGGAAGCTTGGCAAGATTTAACTCTCATCATCTTGATCATAGCGG 873 Query 895 CTGTAACATC-ATTGGCATTGGGAATAAAGACAGAGGGTTTGAAAGAAGGTTGGCTTGAT 953 |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 874 CTGTAACATCGA-TGGCATTGGGAATAAAAACAGAGGGTTTGAAAGAAGGTTGGCTTGAT 932 Query 954 GGTGGAAGCATTGCCTTTGCGGTTTTGCTTGTCATTGTTGTTACAGCTGTTAGTGACTAT 1013 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 933 GGTGGAAGCATTGCCTTTGCGGTTTTGCTTGTCATTATTGTTACAGCTGTTAGTGACTAT 992 Query 1014 CGCCAATCTCTCCAGTTTCAAAACCTCAACGATGAAAAAAGAAATATACAACTAGAGGTC 1073 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 993 CGCCAATCTCTCCAGTTTCAAAACCTCAACGATGAAAAAAGAAATATACAACTGGAGGTC 1052 Query 1074 ATGAGAGGAGGGAGAACAGTGAAGATATCAATCTATGACGTTGTTGTCGGAGATGTTATA 1133 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1053 ATGAGAGGAGGGAGAACAGTGAAGATTTCAATCTATGACGTTGTTGTCGGAGATGTTATA 1112 Query 1134 CCTCTTAGGATAGGTGACCAGGTCCCTGCGGATGGAGTGCTAATTAGTGGTCATTCTCTT 1193 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1113 CCTCTTAGGATAGGTGACCAGGTCCCTGCGGATGGAGTGCTAATTAGTGGTCATTCTCTT 1172 Query 1194 GCTATTGATGAATCTAGCATGACCGGTGAAAGCAAGATTGTTCACAAGGATCAAAAATCC 1253 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1173 GCTATTGATGAATCTAGCATGACCGGTGAAAGCAAGATTGTTCACAAGGATCAAAAATCA 1232 Query 1254 CCTTTTCTAATGTCTGGCTGTAAAGTAGCTGACGGAGTCGGTAACATGCTGGTTACTGGT 1313 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1233 CCTTTTCTAATGTCTGGTTGTAAAGTAGCTGATGGAGTCGGTAACATGCTGGTTACTGGT 1292 Query 1314 GTTGGAATCAACACTGAGTGGGGATTGTTGATGGCAAGTATCTCAGAAGATACTGGTGAA 1373 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1293 GTTGGAATTAACACTGAGTGGGGATTGTTGATGGCAAGTATCTCAGAGGATACTGGTGAA 1352 Query 1374 GAAACTCCATTGCAGGTGAGGTTAAATGGTCTTGCAACCTTCATAGGGATAGTGGGGCTC 1433 |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 1353 GAAACTCCCGTGCAGGTTCGGTTAAATGGTCTTGCAACCTTCATCGGTATAGTGGGGCTT 1412 Query 1434 TCAGTGGCTCTTGTTGTCCTGGTGGCTCTTCTTGTGAGATATTTTACCGGAACTACTCAA 1493 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1413 TCAGTGGCTCTTGTTGTCCTGGTGGCTCTTCTTGTGAGATATTTTACCGGAACTACTCAA 1472 Query 1494 GATACTAATGGAGCGACCCAGTTTATCAAAGGGACGACTAGTATCAGTGACATTGTAGAT 1553 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1473 GATACTAATGGAGCGACTCAGTTTATCAAAGGGACGACTAGTATCAGTGACATTGTAGAT 1532 Query 1554 GATTGTGTAAAGATATTTACAATCGCCGTGACAATTGTGGTTGTAGCAGTGCCTGAGGGA 1613 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| Sbjct 1533 GATTGTGTAAAGATATTTACAATCGCCGTGACAATTGTTGTTGTGGCTGTGCCTGAGGGA 1592 Query 1614 CTTCCCCTAGCAGTTACCCTCACTTTGGCTTACTCAATGCGAAAGATGATGGCAGACAAA 1673 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1593 CTTCCCTTAGCAGTTACCCTCACTTTGGCTTACTCAATGAGAAAGATGATGGCAGACAAA 1652 Query 1674 GCTTTGGTTAGAAGGCTTTCAGCTTGTGAAACCATGGGATCAGCAACAACAATCTGCAGT 1733 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1653 GCTTTGGTTAGAAGGCTTTCAGCTTGTGAAACCATGGGCTCAGCAACAACAATCTGCAGT 1712 Query 1734 GACAAAACTGGAACTTTAACTTTGAATCAGATGACTGTGGTTGAAACTTATGCTGGAGGA 1793 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1713 GACAAAACTGGAACTTTAACTTTGAATCAGATGACTGTGGTTGAAACTTATGCTGGAGGA 1772 Query 1794 TCAAAGATGGATGTAGCAGACAACCCTTCCGGTCTCCACCCTAAACTTGTTGCCTTAATA 1853 ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1773 TCAAAGATGGATGTAGCGGACAACCCTTCTGGTCTCCACCCTAAACTTGTTGCCTTAATA 1832 Query 1854 AGTGAGGGTGTTGCACAAAACACAACAGGAAACATTTTTCATCCCAAGGATGGTGGAGAG 1913 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1833 AGTGAGGGTGTGGCACAAAACACAACAGGAAACGTTTTTCATCCCAAGGAAGGTGGAGAG 1892 Query 1914 GTGGAGATTTCTGGATCTCCCACAGAGAAGGCTATTCT-GTCTTGGGCTTATAAGTTGGG 1972 |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||| Sbjct 1893 GTGGAGATTTCTGGATCTCCAACAGAGAAGGCTAT-CTTGTCCTGGGCGTATATGTTGGG 1951 Query 1973 GATGAAGTTTGATACCATCAGGTCGGAGTCTGCTATCATCCATGCCTTCCCTTTCAATTC 2032 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1952 GATGAAGTTTGATACCATCAGGTCGGAGTCTGCTATCATCCATGCTTTCCCTTTCAATTC 2011 Query 2033 AGAGAAAAAGCGTGGTGGTGTTGCTGTGCTTCGAGGTGATTCTGAAGTTTTCATTCACTG 2092 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2012 AGAGAAAAAGCGTGGTGGTGTTGCTTTGCTTCGAGGTGATTCTGAAGTTTCCATTCACTG 2071 Query 2093 GAAGGGAGCAGCAGAGATAGTTTTGGCTTGCTGTACACAATACATGGACTCAAATGGTAC 2152 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2072 GAAGGGAGCAGCAGAGATAGTTTTGGCTTGCTGTACACAATACATGGACTCAAATGGTAC 2131 Query 2153 TCTGCAGTCCATTGAGAGCCAAAAGGAATTTTTCAGAGTTGCTATCGATAGCATGGCGAA 2212 ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2132 TCTGCAGTCCATTGATAGCCAGAAGGAATTTTTCAGAGTTGCTATCGATAGCATGGCGAA 2191 Query 2213 AAATAGCTTGCGATGTGTTGCTATTGCATGCAGAACACAAGAGCTGAACCAAGTTCCCAA 2272 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2192 AAATAGCTTGCGATGTGTTGCTATTGCATGCAGAACACAAGAACTGAACCAAGTTCCCAA 2251 Query 2273 GGAACAAGAGGACTTGGATAAATGGGCTTTACCTGAAGATGAACTCATTTTGCTTGCTAT 2332 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2252 GGAACAAGAGGACTTGGATAAATGGGCTTTACCTGAAGATGAACTGATTTTGCTTGCTAT 2311 Query 2333 CGTTGGCATAAAGGATCCTTGTCGTCCCGGTGTCAGAGAAGCAGTGAGAATCTGTACCAG 2392 |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 2312 CGTTGGGATAAAGGATCCTTGTCGTCCTGGTGTCAGAGAAGCAGTGAGAATCTGCACTAG 2371 Query 2393 TGCTGGTGTTAAGGTACGAATGGTGACTGGTGACAATCTTCAAACAGCAAAAGCAATTGC 2452 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2372 TGCTGGTGTTAAGGTACGAATGGTGACTGGTGACAATCTTCAAACAGCAAAAGCAATTGC 2431 Query 2453 TTTGGAGTGTGGTATACTTTCTTCAGATACAGAAGCTGTTGAGCCTACTATCATCGAAGG 2512 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2432 TTTGGAGTGTGGTATACTTTGTTCAGATACAGAAGCTGTTGAGCCTACTATCATCGAAGG 2491 Query 2513 AAAAGTGTTCCGTGAGCTATCTGAGAAAGAGAGAGAACAAGTAGCCAAGAAAATAACGGT 2572 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2492 AAAAGTGTTCCGTGAGCTATCTGAAAAAGAGAGAGAACAAGTAGCCAAGAAAATAACGGT 2551 Query 2573 GATGGGTAGGTCATCTCCTAACGACAAGCTCTTACTTGTTCAAGCACTACGGAAAAATGG 2632 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2552 GATGGGTAGGTCATCTCCTAATGACAAGCTTTTACTTGTTCAAGCACTACGGAAAAATGG 2611 Query 2633 AGATGTTGTTGCAGTCACTGGTGATGGTACTAATGATGCTCCTGCCCTCCATGAGGCAGA 2692 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 2612 AGATGTTGTTGCTGTCACTGGTGATGGTACTAATGATGCTCCTGCACTTCATGAGGCAGA 2671 Query 2693 TATAGGTCTCTCTATGGGTATATCAGGAACTGAAGTTGCAAAAGAGAGTTCTGACATCAT 2752 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 2672 CATAGGTCTCTCTATGGGTATATCAGGAACTGAAGTTGCGAAAGAGAGTTCCGACATCAT 2731 Query 2753 TATTTTGGATGACAATTTTGCTTCAGTAGTAAAGGTTGTTCGTTGGGGCCGTTCTGTGTA 2812 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2732 TATTTTGGATGACAATTTTGCTTCAGTAGTAAAGGTTGTTCGCTGGGGCCGTTCTGTGTA 2791 Query 2813 TGCTAACATTCAGAAATTCATACAATTCCAGCTTACTGTGAATGTTGCCGCACTTATAAT 2872 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2792 TGCAAATATTCAGAAATTCATACAATTCCAGCTTACTGTGAATGTTGCAGCACTTATAAT 2851 Query 2873 CAATGTTGTAGCAGCAATGTCTTCTGGTGACGTCCCTCTAAAGGCTGTACAGCTGCTTTG 2932 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2852 CAATGTTGTAGCAGCAATGTCTTCTGGTGACGTTCCTCTAAAGGCTGTCCAGCTGCTTTG 2911 Query 2933 GGTCAACCTTATCATGGATACTCTTGGAGCACTTGCACTAGCTACAGAGCCACCAACCGA 2992 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2912 GGTCAACCTTATCATGGATACTCTTGGAGCACTTGCACTCGCTACAGAGCCACCAACCGA 2971 Query 2993 TCATCTTATGCATAGAACCCCTGTTGGAAGAAGGGAACCTCTTATAACAAACATCATGTG 3052 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2972 TCATCTTATGCATAGAACCCCTGTTGGAAGAAGGGAACCTCTTATAACAAACATCATGTG 3031 Query 3053 GAGGAACTTGCTTGTTCAGTCATTCTATCAAGTGGCTGTTCTCCTAGTTCTCAACTTTGC 3112 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3032 GAGGAACTTGCTTGTTCAGTCATTCTATCAAGTGGCTGTTCTCCTGGTTCTCAACTTTGC 3091 Query 3113 AGGCTTAAGCATTCTTGGCTTGAACCATGAAAACCATGCACATGCTGTGGAAGTGAAGAA 3172 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3092 AGGATTAAGCATTCTTGGCTTGAACCATGAAAACCATGCACATGCTGTGGAAGTGAAGAA 3151 Query 3173 CACTATGATATTCAATGCCTTTGTCATGTGTCAAATATTCAACGAGTTCAACGCAAGAAA 3232 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || Sbjct 3152 CACTATGATATTCAATGCCTTTGTCATGTGTCAAATATTCAACGAGTTCAATGCAAGGAA 3211 Query 3233 ACCTGATGAAATGAATGTATTCCGGGGAGTAAATAAGAACCCTCTCTTCGTAGCAATTGT 3292 |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3212 ACCTGATGAAATGAATGTTTTCCGGGGAGTATCTAAGAACCCTCTCTTCGTAGCAATTGT 3271 Query 3293 TGGAGTCACTTTTATACTTCAGAT-CATCATCGTTACTTTCCTCGGAAAGTTTGCTCACA 3351 |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3272 TGGAGTCACTTTTATACTTCAGATAC-TCATCGTTACTTTCCTCGGAAAGTTTGCCCACA 3330 Query 3352 CCGTTAGACTGGGATGGCAGTTATGGCTTGCTTCTATAATCATTGGATTGGTCAGCTGGC 3411 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3331 CCGTTAGACTGGGATGGCAGCTATGGCTTGCTTCTATTCTCATTGGATTGGTCAGCTGGC 3390 Query 3412 CACTAGCAATTGTTGGGAAACTGATCCCTGTACCCAAGACACCGATGAGCGTCTACTTCA 3471 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 3391 CACTAGCAATTGTTGGGAAACTGATTCCTGTACCCAAGACTCCGATGAGCGTCTACTTCA 3450 Query 3472 AGAAACCGTTCCGTAAATACAAAGCTTCAAGAAATGCATAAAACATACA--ACTAGGTTC 3529 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct 3451 AGAAACCGTTCCGTAAATACAAAGCTTCAAGAAATGCATAAAACATA-AGTACTAGGTTC 3509 Query 3530 TCAGCCTTCCTCATACAGAAGCAATAACAGATATAACCTGTGACAATGGCCTAAACCTCT 3589 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3510 TCA-CCTTCCTCATACAGAAGCAATAACAGATATAACCTGTGACAATGGCCTAAACCTCT 3568 Query 3590 AACCTTTCTTTCTATCTTTTTTAAAAATGGTAAAAGTATTTTCAAATGTATACTGCAATG 3649 ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 3569 AACCTTTCTTTCTTTCTTTTTTAAA--TGGTAAAAGTATTTTCAAATGTATACTGCATTG 3626 Query 3650 AGATCCAATTCTTTTGTCCCTTTTCATATTTCTTCTTTTTGTATGATGTAAAAGTGCAAC 3709 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3627 A--TCCAATTCTTTTGTCCCTTTTCATATTTCTTCTTTTTGTATGATGTAAAAGTGCAAC 3684 Query 3710 TGTGAATTGAATTGGATTTGTGGTTGTACTAACGAGAGTTTGGCTCAGTC 3759 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3685 TGTGAATTGAATTGGATTTGTGGTTGTACTAACGAGGGTTTGGCTCAGTC 3734 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 142487553312 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5