BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G24880.1 Length=6089 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg480005 jgi|Araly1|480005|fgenesh2_kg.3__2706__AT3G24880.1 5616 0.0 > Ahg480005 jgi|Araly1|480005|fgenesh2_kg.3__2706__AT3G24880.1 Length=6139 Score = 5616 bits (3041), Expect = 0.0 Identities = 3369/3526 (96%), Gaps = 27/3526 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGCATGGAAGCGTTTCAGGATATCTTCTAGTAAATGCTGAGGTTGATTCCATGGGAGGA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGCATGGAAGCGTTTCAGGATATCTTCTAGTAAATGCTGAGGTTGATTCCATGGGAGGA 60 Query 61 GTTATCGATAGTGGAGGTGGTATTGGTGTTAAAACATCTCCGCGCCGAACAGCTATTGAG 120 ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 61 GTTATTGATAGTGGAGGTGGTATTGGTGTCAAAACTTCTCCGCGCCGAACAGCAATTGAG 120 Query 121 AAGGCTCAAGCGGAGCTAAGGCAAGAGTATGATGTTCGTGAGGAAAGGAGGAGAGAATTG 180 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || Sbjct 121 AAGGCTCAAGCGGAGCTAAGGCAAGAGTATGATGTCCGTGAGGAAAGGAGGAGAGAACTG 180 Query 181 GAGTTTCTAGAGAAAGGCGGTAATCCCTTGGATTTCAAGTTTGGTATTGCAACTTCACAT 240 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 181 GAGTTTCTGGAAAAAGGCGGTAATCCCTTGGATTTCAAGTTCGGTATTGCAACTTCACAT 240 Query 241 AGCGTCCAATCTACATCACTCACAGATCAGCAAGCAGAGCATTTTGTAAACAGTGAAGTC 300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 241 AGCGTCCAATCTACATCACTCACAGATCAGCAAGCAGAGCATTTTATAAACAGTGAAGTC 300 Query 301 AAAGATAGTTTTGCCCTGACTGCCTCACCACATGGTGACTCGGTGGAGAGTAGCGGTAGA 360 || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| Sbjct 301 AAGGATAGTTTTGCCCTGACTGCCTCACCACATGGAGACTCTGTGGAGAGTAGCGGTAGA 360 Query 361 CCTGGAGTTCCTACAATTTCTGAACCCAATACAGCAGATAATCTTTTACTGTTTGATTCT 420 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CCTGGAGTTCCTACAATTTCTGAACCTAATACAGCAGATAATCTTTTACTGTTTGATTCT 420 Query 421 GAAAACAAGTCAGTTGAAGGGGAAAGAAATTTGAGACATCCTAATAGGCAAAACAGAACT 480 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 GAAAACAAGTCAGTTGAAGGAGAAAGAAATTTGAGATATCCTAATAGGCAAAACAGAACT 480 Query 481 TCTGAGTCAGAACGATCTTCCAAAGCACACACCAACCAGAATACCAAAGAAACAGAAGAT 540 ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TCTGACTCAGAACGATCTTCCAAAGCAAACACCAACCAGAATACCAAAGAAACAGAAGAT 540 Query 541 TCTGCCATCTTTCGCCCGTATGCTCGGAGGAACAGATCGAAGATAAGTCGGGATCCAGCA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct 541 TCTGCCATCTTTCGCCCGTATGCTCGGAGGAACAGATCAAAGATAAATCGGGATCCAGCG 600 Query 601 CGGTCAAGCTCTACGGATTTAGTTCAGAATCGTGGTGGTCTTGCAACGTCTATATCTATT 660 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 601 CGGTCAAGCTCTACAGATTTAGTTCAGAATCGTGGTGGTCTTGCAACATCTATATCCATT 660 Query 661 CGCAGAGGATCAGTGGAAGGAAAGGGTTGCATTCCCGAAGCAGCCAATCAAAAGGATATG 720 |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | Sbjct 661 CGCAGAGGATCAGTAGAAGGAGAGGGTTGCATTCCTGAAGCAGCCAATCAAAAGGATAGG 720 Query 721 CATACAACTTCTGTATCTTGTCCAGTATTTGCAAATTCAAATGGTAATATCGTTCCGAAA 780 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| Sbjct 721 CATACAACTTCTGTATCTTGTCCAATATTTGCAAATACAAATGGTAATAACGTTCCAAAA 780 Query 781 AATAGAGTTTCCAGCAATTCGCTGAATACTAAGGTGGATGGTGAACCTGTTGTACGAGAG 840 ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 AATAGAGTTCCCAGCAATTCTCTGAATACTAAGGTGGATGGTGAACCTGTTGTACGAGAG 840 Query 841 AGTACTGCTGGATCCAAGACTAGTCTATTGAAAGATGAAGCCGACATTTCGTATAGTAAA 900 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| Sbjct 841 AGTACTGCTGGATCCAAGACTAGTCTATTTAAAGATGAAGCCGACATTACATATAGAAAA 900 Query 901 AGCTCTGCATATTTGCCAGTTGGAGAGTCTGGCCTTGCTGGGGAGAAGGCACAACTAGTT 960 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 901 AGGTCTGCATATTTGCCAGTTGGAGAGTCTGGCCTTGCTGGGGAGAAGGCACAGCTAGTT 960 Query 961 TC-----G-ACTG-G--TGGTTCTCCCAAAGCTGCAACAATAGCT-GGCCAGAAAAATAG 1010 || | || | | |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| Sbjct 961 TCGAGTGGTACAGAGATTGGTTCTCCCAAAGCTGCAACAATAGCTAGG-CAGGAAAATAA 1019 Query 1011 TTCTACCCAACTGAATGGCCTAAGAGATTCCACGGTAGAGGAAGAAAGCTTAACAAATAG 1070 |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1020 TTCTACCCAACTGAATGGCCTAAGAGATTCCATGGGAGAGGAAGAAAGCTTAACAAATAG 1079 Query 1071 AGGAGCTACAGGGACTAATGGGTTAGAGTCAGAGTCTTCTCATGCGAACAACGTAGAAGT 1130 ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1080 AGGAGCTGCAGGGACTAAAGGGATAGAGTCAGAGTCTTCTCATGCTAACAACGTAGAAGT 1139 Query 1131 AAATGTAGATAATGAAAGAGATCTTTATAAAGTGGACAAACTTGACTCTGATGAAATCTC 1190 | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1140 AGATGTAGATAATGAAAGAGATCTTTATAAAGTGGAGAAACTTGACTCTGATGAAATCTC 1199 Query 1191 TATGCAGAAGACTTTGAGAGTAGAGGGGTTACTAGATCAAACAGTTGGTGAAATGAC-CA 1249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | Sbjct 1200 TATGCAGAAGACTTTGAGAGTAGAGGGGTTACTAGATCAAACAGTTGGTGAAATAACGC- 1258 Query 1250 AAACTAAGATTGAAGATGAGACAGGTCAATCTACCACCATTATCAGTGAGTGCATTCCTG 1309 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| Sbjct 1259 AAACTAAGATTGAAGATGAGACAGGTCAATCTACCACCATTATTACTGAGTGCATTCCTG 1318 Query 1310 AATGTGAAATGCAGATGAAATCGGTTAAAATTGAAAATCAAAGTCACAGAAGTACAGCTG 1369 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1319 AGCGTGAAATGCAGATGAAATCGGTTAAAATTGAAAATCAAAGTCACAGAAGTACAGCTG 1378 Query 1370 AGATGCAAACTAAGGAGAAAAGTTCCGAGACTGAGAAAAGGCTTCAAGATGGGTTGGTTG 1429 ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1379 AGATGCAAAATGAGGAGAAAGGTTTTGAGACTGAGAAAAGGCTTCAAGATGGGTTGGTTG 1438 Query 1430 TACTCGAAAATGACAGTAAAGTTGGTAGTATTTTATCTGAAAATCCTAGCAGCACGTTGT 1489 ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1439 TACCCGAAAATGACAGGAAAGTTGGTAGTATTTTACCTGAAAATCCTAGCAGCTCGTTGT 1498 Query 1490 GCTCTGGAATTCCTCAGGCATCTGTAGACACAAGTTCTTGCACAGTTGGCAATAGTTTAT 1549 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1499 GCTCGGGAATTCCTCAGGCATCTGTAGACACAAGTTCTTGCACAGTTGGCAATAATTTAT 1558 Query 1550 TGTCAGGAACTGACATTGAAGCATTAAAACATCAGCCGAGCTCAGATGCAGTTATGTTAG 1609 ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1559 TGTCAGGAACTGATATTGAATCACTAAAACATCAGCCGAGCTCAGATGCAGTTGTGTTAG 1618 Query 1610 ATACTGTCAAGGAGGACGCTATTCTTGAGGAGGCCCGGATTATACAGGCAAAGaaaaaaa 1669 ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1619 ATACTATCAAGGAGGACTCTATCCTTGAAGAGGCACGGATTATACAGGCAAAGAGAAAAA 1678 Query 1670 GAATTGCCGAATTATCTTGTGGTACTGCACCAGTGGAGGTCCGTGAGAAATCTCAATGGG 1729 |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1679 GAATTGCCGAGTTATCTTTTGGTACTGCACCATTGGAGGTCCGTGAGAAATCTCAATGGG 1738 Query 1730 ATTTTGTCCTCGAAGAAATGGCATGGCTGGCAAATGATTTTGCGCAGGAGCGCCTTTGGA 1789 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1739 ATTTTGTCCTCGAAGAAATGGCATGGCTGGCAAATGATTTTGCGCAGGAGCGCCTTTGGA 1798 Query 1790 AAATGACTGCTGCCGCACAAATTTGCCATCGAGTTGCTTTGACTTGTCAGTTGAGATTTG 1849 | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1799 AGATGACTGCTGCAGCACAAATTTGCCATCGAGTTGCTTTGACTTGTCAGTTGAGATTTG 1858 Query 1850 AGGAACGAAATCAGCACAGAAAGCTGaaaaaaaTAGCTTCAGTCCTATCTAATGCTATCT 1909 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1859 AGGAACGAAATCAGCACAAAAAGCTGAAAAAAATAGCTTCAGTCCTATCTAATGCTATCT 1918 Query 1910 TACAATTCTGGAGTTCTGTGGAGGCCGAGGTTCCTGGGGAGCTGGAGGAGACGAGCTTGG 1969 || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1919 TAGAATTCTGGAGTTCTGT----G--GAGGTTCCTGGGGAGCTGGAGGAGACGAGCTTGG 1972 Query 1970 GAATTGTTAAGGAGACTTGCCAAGAATCTAATTGTTTGAATGGCAGAAG-ATGTTTAGCT 2028 | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| Sbjct 1973 GTATTGTTAAGGAGACTTGCCAAGAATCTAATTGTGTGAATGGCAG-AGTATGTTTGGCT 2031 Query 2029 GCGGGTGTCAAGGAATATGCAAGTAGATTTTTGAAGTACAACAACTCTTCCATCTCCTAT 2088 | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2032 GGGGGTGTCAAGGAGTATGCAAGTAGATTTTTGAAGTACAACAACTCTTCCATCTCCTAT 2091 Query 2089 CATTCAGCTGCACCGTCAACACCTGACAATATGTGCGACCCAGAAATATTGGATATATCT 2148 ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2092 CATTCAGCTGCACTGTCAACACCGGACAATATGTGCAACCCAGAAATATTGGATATATCT 2151 Query 2149 ATGGTTGATCAGCTTACAGAAGCAAGCCTCTTTTATTCAGTTCCATCTGGTGCAATGGAG 2208 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2152 ATGGTTGATCAGCTTACAGAAGCAAGCCTCTTTTATTCAGTTCCATCTGGTGCAATGGAG 2211 Query 2209 GTGTACCTTAAGTCCATTGAGTCGCATCTTACACGTTGTGAGAAGTCTGGAAGTAGCATG 2268 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2212 GTGTACCATAAGTCCATTGAGTCGCATCTTACACGCTGTGAGAAGTCTGGAAGTAGCATG 2271 Query 2269 CAGGAGGAGGTTGATACATCAGCCTATGATACTGCTGGAGATATAGGATATAATGTTACT 2328 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||| Sbjct 2272 CAGGAGGAGGTTGATACATCAGCCTATGATACTGCT-G-G----AGGATATAATGGTACT 2325 Query 2329 GCGTTCGATGAGGATGAAGGAGAAACAAGTACCTATTATCTTCCGGGAGCTTTCGAGTCT 2388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2326 GCGTTCGATGAGGATGAAGGAGAAACAAGTACCTATTATCTTCCAGGAGCTTTCGAGTCT 2385 Query 2389 AGCAGATCATTTAATATAAGCCACaaaaaaaGGAAGAATCTGATGAAGTCTCATTCTGCC 2448 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2386 AGCAGATCATTTAATATAAGCCACAAAAAAAGGAAGAATCTGATGAAGTCTCATTCTGCC 2445 Query 2449 CGGTCATATGATCTTGGGGACGATTTACCATACGTCAACAACACAGGTGGCTCTAACTCA 2508 |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2446 CGGTCATATGATCTTGGGGATGATTTACCATATGTCAACTACACAGGTGGCTCTAACTCA 2505 Query 2509 TCAAGTTTGATGGCAAAAAGGCCTGACAGTAATATTAATGCCGGCTCAGTTCCAACAAGG 2568 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 2506 TCAAGTTTGATGGCAAAAAGGCCTGCCAGTAATATTAATGCCGGCTCAGTTCCGACGAGG 2565 Query 2569 CGAGTGCGCACTGCTTCCAGGCAGAGGGTTGTGAGTCCTTTTGGGTGTGCTACTACTGGG 2628 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2566 CGAGTGCGCACTGCTTCCAGGCAGAGGATTGTGAGTCCTTTTGGGTGTGCTACTGCTGGG 2625 Query 2629 AATTTACCAGTGCCCTCGAAGACAGATGCGTCTAGTGGGGATACTAGTTCTTTCCAGGAT 2688 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2626 AATTTACCAGTGCCCTCGAAGACAGATGCGTCTAGTGGGGATACTAGTTCTTTCCAGGAT 2685 Query 2689 GAGTATAGTAGTTTGCATGGTGGATCGGCAGTCCAAAAAGGCACAGAGGTTGAGTCAAGT 2748 ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2686 GAGCAAAGTAGTTTGCATGGTGGATCGGCAGTCCAAAAAGGCACAGAGGTTGAGTCAAGT 2745 Query 2749 GTTAACTTTGAAAAGCTGTTACCTTATGACATGGCTGAAACCTCAGGAAGACCTAAAAAG 2808 | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2746 GGTAATTTTGAAAAGATGTTACCTTATGACATGGCTGAAACCTCAGGAAAACCTAAAAAG 2805 Query 2809 AAAAAGAAGACTCATCAGGGCTCCGCATATGACCAAACTTGGCATCTCGATCCGTCAGTC 2868 || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2806 AAGAAGAAGACTCATCAGGGATCCGCATATGACCAAACCTGGCATCTCGATCCGTCAGTC 2865 Query 2869 CATGTTGAACAGAAGGACCACTGGAAGAAGCGACCAGAGAATAATTTCGATATGAATGGT 2928 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2866 CATGTTGAACAGAAGGACCACTGGAAGAAGCGACCAGAGAATCATTTCGATATGAATGGC 2925 Query 2929 CTGTATGGTCCTCATAGTGCAAAGAAGCAAAAGACCACCAAGCAATTGGTAGAGAATAAT 2988 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2926 CTGTATGGTCCTCATAGTGCAAAGAAGCAAAAGACCACCAAGCAATTGGTAGACAATAAT 2985 Query 2989 TTTGATATGGCTATTCCTCACACTGGATCGATTCCTTCTCCGGCTGCTTCCCAGATGAGC 3048 |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2986 TTTGATATTGCTATTCCTCACGCTGGATCGATTCCTTCTCCGGCAGCTTCCCAGATGAGC 3045 Query 3049 AATATGTCCAACCCCAACAAATCTATCAAATTTATTGGAGGTCGTGATAGGGGCAGAAAA 3108 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3046 AATATGTCCAACCCCAACAAATCTATCAAATTTATTGGAGGTCGTGATAGGGCCAGAAAA 3105 Query 3109 ATAAAAGGCCTGAAGATTTCTCCTGGTCAGCATGGTTCTGGAAATCCATGGTCACTATTT 3168 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3106 ATAAAAGGCCTGAAGATTTCTCCTGGTCAGCATGGTTCTGGAAATCCGTGGTCACTATTT 3165 Query 3169 GAGGATCAGGCGCTTGTTGTCCTGGTGCATGATATGGGCCCTAACTGGGAGCTCATTAGT 3228 ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3166 GAGGATCAGGCGCTTGTTGTCCTAGTGCATGACATGGGCCCTAACTGGGAGCTCATTAGT 3225 Query 3229 GATGCAATGAACAGCACTCTTAAAATTAAGTGTATATATCGCAATCCGACTGAGTGCAAG 3288 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3226 GATGCTATGAACAGCACCCTTAAAATTAAGTGTATATATCGCAATCCGACTGAGTGCAAG 3285 Query 3289 GACCGGCATAAGATTCTGATGGATAAAACTGCTGGTGATGGGGCTGATAGTGCAGAAGAT 3348 || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3286 GAGCGGCATAAGATTCTGATGGATAAGACTGCTGGTGATGGGGCTGATAGTGCTGAAGAT 3345 Query 3349 TCAGGGAATTCTCAGTCTTATCCATCCACTTTGCCTGGCATCCCAAAGGGAAGTGCGAGA 3408 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3346 TCAGGGAATTCCCAGTCTTATCCATCCACTTTGCCTGGCATCCCAAAGGGAAGTGCGAGA 3405 Query 3409 CAGTTGTTTCAACGACTGCAAGGGCCAATGGAGGAAGATACCCTGAAGTCTCATTTTGAG 3468 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3406 CAGTTGTTTCAACGACTGCAAGGGCCAATGGAGGAAGATACCCTGAAGTCTCATTTTGAG 3465 Query 3469 AAGATTTGTTTGATTGGGAAGAAATTACATTATAGAAAGACACAGA 3514 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3466 AAGATTTGTTTGATTGGGAAGAAGTTACATTATAGAAAGACACAGA 3511 Score = 3747 bits (2029), Expect = 0.0 Identities = 2398/2565 (93%), Gaps = 70/2565 (3%) Strand=Plus/Plus Query 3512 AGAGTGTTATCGGGGTTTCTGTGGTTTCTTTTGTTCACGGAATTCAGTTTTCAAGTTGCA 3571 ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3554 AGAGTGTTATCAGAGTTTCTGTGGTTTCTTTTGTTCACGGAATTCAGTTTTCAAGTTGCA 3613 Query 3572 CTGGAGCTGGCATATCTCAATCA-CTCGACATACCAGGTCTGCATGTTTCTAAGTATAGC 3630 ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3614 CTGGAGCTGGCATATCTCAATCACCT-GACATACCAGGTTTGCATGTTTCTAAGTATAGC 3672 Query 3631 TGCAAATCTTGGCTAGGATTTCCTGAAAATGATGGTCGGGATTCCAAGCAAATAGTACCA 3690 ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3673 TGCAAATCTTGGCTAACATTTGCTGAAAATGATGGTCGGGATCCCAAGCAAATAGTACCA 3732 Query 3691 GTTCACAATTCACAAGTCATGGCTCTCTCTCAAGTATTCCCGAATAATCTGAATGGAGGT 3750 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3733 GTTCACAATTCACAAGTTATGGCTCTTTCTCAAGTATTCCCGAATAATCTGAATGGAGGT 3792 Query 3751 GTTCTTACGCCCCTTGATGTCTGTGACGCATCAACTTCAGGTCAAGATGTATTTTCACTT 3810 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3793 GTTCTTACGCCCCTTGATGTCTGTGATGCATCAACTTCAGGTCAAGATGTATTTTCACTT 3852 Query 3811 GAAAATCCAGGTCTTCCAATGTTGAATCAGGGAACGCCAGTGCTCCCTACTTCTGGAGCA 3870 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3853 GAAAATCCAGGTCTTCCAATTTTGAATCAGGGAACGCCAGTGCTCCATACTTCTGGAGCA 3912 Query 3871 CATCCATCCACTCCTGGATCATCTGGTGTTGTTCTGAGCAACAATTTGCCAACCACATCT 3930 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3913 CATCCATCCACTCCTGGATCGTCTGGTGTGGTTCTGAGTAACAATTTGCCAACCACATCT 3972 Query 3931 GGCCTACAGAGTGCTTCTGTCAGGGATGGTAGATTCAATGTTCCTAGAGGGTCTTTGCCA 3990 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3973 GGCCTACAGAGTGCTTCTGTCAGGGATGGTAGATTCAATGTTCCTAGAGGGTCTTTGCCA 4032 Query 3991 CTTGATGAACAACACCGACTACAACAATTTAATCAAACGTTATCTGGTAGAAACCTGCAG 4050 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||| Sbjct 4033 CTTGATGAACAACACCGACTACAACAATTTAATCAGATGTTATCCGGTAGAAACCTACAG 4092 Query 4051 CAGCCCTCCTTATCAACTCCTGCAGCTGTCTCAGGATCTGATCGTGGACATCGCATGGTT 4110 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4093 CAGCCCTCCTTATCAACTCCTGGAGCTGTCTCAGGATCTGATCGTGGACATCGCATGGTT 4152 Query 4111 CCTGGTGGAAATGCTATGGGTGTAAGTGGAATGAACAGGAACACACCCATGTCAAGGCCT 4170 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4153 CCTGGTGGAAATGCTATGGGTGTAACTGGAATGAACAGGAACACACCCATGTCAAGGCCT 4212 Query 4171 GGTTTTCAAGGGATGGCCTCATCAGCAATGCCAAATACTGGTAGTATGCTTTCCTCTGGC 4230 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4213 GGTTTCCAAGGGATGGCCTCATCAGCAATGCCAAATACTGGTAGTATGCTTTCTTCTGGT 4272 Query 4231 ATGGTAGAAATTCCAAACACTGGAAATATTCATTCCGGAGGAGGAGCTTCTCAAGGAAAC 4290 ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4273 ATGGTAGGAATTCCAAACACTGGAAATGTTCATTCCGGAGGAGGAGCTTCTCAAGGAAAC 4332 Query 4291 TCCATGATCAGGCCTCGTGAAGCTGTGCAGCATATGATGCGGATGCAGGCTGCTCAAGGG 4350 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 4333 TCCATGCTCAGGCCTCGTGAAGCTGTGCAGCATATGATGCGGATGCAAGCTGCTCAAGGG 4392 Query 4351 AACAGTCCGGGGATCCCAGCTTTCAGTAATTTGAGTTCTGGATTTACCAACCAGACAACT 4410 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4393 AACAGTCCGGGGATCCCAGCTTTCAGTAATTTGAGTTCTGGATTTACCAACCAGACAACT 4452 Query 4411 CCTGTTCAGGCGTACCCAGGCCATCTTTCCCAGCAGCATCAGATGTCACCGCAGTCACAT 4470 ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4453 CCTGTTCAGGCATACCCAGGCCAACTTTCCCAGCAGCATCAGATGTCACCGCAGTCACAT 4512 Query 4471 GTGCTTGGCAACTCGCATCATCCTCATCTCCAGAGCCCAAGTCAAGCCACTGGGGCACAG 4530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4513 GTGCTTGGCAACTCGCATCATCCTCATCTCCAGAGCCCAAGTCAAGCCACTGGGGCACAG 4572 Query 4531 CAAGAAGCATTTGCTATCCGTCAAAGACAAATTCACCAGAGGTATTTGCAGCAACAGCAA 4590 || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4573 CAGGAAGCATTTGCTATCCGTCAAAGGCAAATACACCAGAGGTATTTGCAGCAACAGCA- 4631 Query 4591 CAGCAACAGCAGTTTCCAGCATCTGGTTCTATGATGCCACATGTACAACAACCTCAGGGC 4650 ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4632 --GCA---GCAGTTTCCAGCATCTGGTACTATGATGCCACATGTACAACAACCTCAGGGC 4686 Query 4651 TCTTCTGTTTCTTCTTCTCCACAAAACAGTCCTCAGACTCAACCACCTGTTTCGCCCCAG 4710 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4687 TCGTCTGTTTCTTCTTCTCCACAAAACAGTCCTCAGACTCAACCACCTGTTTCGCCCCAG 4746 Query 4711 CCATTATCCATGCCCCCGGTGTCGCCCTCTCCTAATATTAATGCTATGGCACAACAGAAA 4770 |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4747 CCATTATCGATGCCCCCAGTGTCGCCCTCTCCTAATATTAATGCTATGGCACAACAGAAC 4806 Query 4771 CCTCAAAAATCTCAGTTGGCGCTTCATGGTTTGGGTAGGAGTCCTCAGTCTGGTACTTCT 4830 ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4807 CCTAAAAAATCTCAGTTGCCGCTTCATGGTCTGGGTAGGAGTCCTCAGTCTGGTACTTCT 4866 Query 4831 GGAGTGAACAATCAAGCTGGAAAACAAAGGCAGCGACAACTTCAGCAG---T--C----- 4880 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | Sbjct 4867 GGAGTGAACAATCAAGCTGGAAAACAACGGCAGCGACAACTTCAGCAGCAGTTGCAGCAG 4926 Query 4881 T--GCAAGACAGCATCCACACCAGCGGCAGCCAACACAAGGTCAACAGCTGAATAAACAA 4938 | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || Sbjct 4927 TCTGCAAGACAACATCCACACCAGCGGCAGCCAACACAAGGTCAACAGCAGAATAAA-AA 4985 Query 4939 CTGAAGGGGATGGGTAGAGGCAACATGATCCATCAGAACATCACTGTTGATCAGTCACAC 4998 | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 4986 --G--GGG-ATGGGTAGAGGCAGCATGATCCATCAGAACATCACTGTCGATCAGTCACAC 5040 Query 4999 CTGAATGGCCTTACCATG-CCCCAAGGAAACCAGGCTACTGAAAAAGGAGAGAT-AGCGG 5056 |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| Sbjct 5041 CTGAATGGTCTTACCATGGCCCCA-GGAAATCAGGCTACCGAAAAAGGAGAG-TCAGCGG 5098 Query 5057 TTCCAGTTAGGCCTGATCAGCAGTCTAGTGTGGGGACTACCACGAGCACGA-ATCTGCAG 5115 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| Sbjct 5099 TTCCAGTTAGGCCTGATCAGCAGTCTAGTGCAGGGACTAGCACGAGCAC-ACATCTGCAG 5157 Query 5116 TCTAAACCATTTGTTTCTCCCTTGTCTTCAAATCATTCACAGCAACTGCCAAAATCATTC 5175 ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 5158 TCTAAACCATTTGTTCCTCCCTTATCTTCAAATCATTCACAGCAACTGCCAAACTCATTC 5217 Query 5176 CCTGGTGCTTTGCCTCCATCCCCTCAACAACAGATGCAATTACATTCAGACAATAGCATC 5235 |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5218 CCTGGTGCTTCGTCTCCGTCCC---AACAACAGATGCAATTACATTCAGACAATAGCATC 5274 Query 5236 CAAGGCCAGAGCTCACCTGCGACCCCATGTAATATTTTATCCACCTCTAGCCCGTCAATT 5295 |||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 5275 CAAGGCCAGACCTCACCTGCGGCCCCATGTAACATCTTATCCACCTCTAGCCCGTCAATT 5334 Query 5296 GCACCAGCGGTTGCACCTTCTAACCATCAGCATTTGTTGATACACCAAAAGCAGCGCAAT 5355 |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5335 ACACCTGCAGTTGCACCTTCCAACCATCAGCATTTGTTGATACACCAAAAGCAGCGCAAT 5394 Query 5356 CAAGTGCAATCAACAGCTCAGCGAGTTGTTCAACATAATCATCTAGGGAACTCTGAGTTA 5415 |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 5395 CAAGTGCAATCAGCAGCTCAGCGAGTTGTTCATCATAATCATCTAGGAAACTCTGAGTTA 5454 Query 5416 TCAAAGAAGTCCCAAGCTGAACGCATGCCACGTGTTCCACAGTCTGTAACCAATACTACC 5475 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| Sbjct 5455 TCAAAGAAGTCCCAAGCTGAACGTATGCCACGTGTTCCGCTGTCTGTCACCAATACAACC 5514 Query 5476 CAAACTGTTAGTATGGGTACGACCAAGGGTATGCCTCAAGCGAGTAATGATTTGAAAAAC 5535 ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5515 CAAACTGCTAGTATGGGTACGACCAAGGGTATGCATCAAGCGAGTAATGATTTGAAAAAC 5574 Query 5536 ATAAAAGCAGTTGGTTCTACTGCGGTGCCTGCTTTGGAACCTCCATCTTGTGTTGCTTCT 5595 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 5575 ATAAAAGCAGTTGGTTCTACTGCGGCGCCTGCTTTGGAACCTCCATCTTGTGTTGCCTCT 5634 Query 5596 GTGCAAATCACTGCTTCGAAAGTAGTAAACAGTTCCAATACAGATTCAGCAGGAAATGAT 5655 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct 5635 GTGCAAAGCACTGCTTCTAAAGTAGTAAACAGTTCCAATACAGATTCAGCTGGGAATGAT 5694 Query 5656 CCAGTATCAACACCGAACCAAGGACTAGCTCA--A--A---A---G----C------A-- 5693 |||||| ||||||||||||||||||||||||| | | | | | | Sbjct 5695 CCAGTAACAACACCGAACCAAGGACTAGCTCAGGAGCATCTATCTGGTGACTTGCCTAGT 5754 Query 5694 C--GGGATCAAGGGCGTTACACAGAGACAACAACAGTCTCTACCTTCAGAAGAAAAGAGA 5751 | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5755 CACGGGATCAAGGGCGTGACACAGAGACAACAACAGTCTCTACCTTCAGAAGAAAAGAGA 5814 Query 5752 CCGAAA-TTGCCAGAGAAGCCGACTGTACAAAATCAGAAACACCTTGCTTCTGAG--G-A 5807 || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | Sbjct 5815 CC-AAAGTTGCCAGAGAAGCTGACTGTACAAAATCAAAAACACCTTGCTTCTGAGCAGCA 5873 Query 5808 ---GCAGCCTCATTTAGAAGAAGCACAAGAATTATCATCTTCCAAGCCTCCTGATACAAA 5864 ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5874 ACAGCAGCCTCAATTAGAAGAAGCACTGGAAGTATCATCTTCCAAGCCTCCTGATACAAA 5933 Query 5865 AGTGGAATGAGAGGCATGACAGATGAACCTAGAACCTTGAGTAGCTGTAGATCCTGCAAA 5924 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 5934 AGTGGAATGAGAGGCATGACAGATGAACCTAGAACCTTGAGTAGTTGTAGATCCTGCAAA 5993 Query 5925 GCTTAACGCTGGCCCTTACCGACAACAACCCTGTACAGGAACCCAAACTGGTTTGTGTCC 5984 |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| Sbjct 5994 GCTTAATGCTGGCCCTTACCAACAACAACCCTGTACAGGAACCCAAACTGGTTTATCTCC 6053 Query 5985 TCCACCTTCAGAGTCGGGTC-TC--TTTTTGGCATTAACATCTTG 6026 ||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct 6054 TCCGCCTTCAGATTCGGGTCCTCACTTTTTGGCATTAACATCTTG 6098 Score = 56.5 bits (30), Expect = 2e-06 Identities = 30/30 (100%), Gaps = 0/30 (0%) Strand=Plus/Plus Query 6059 GTATAACATAACAAACTCTACAGATTGTGG 6088 |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6110 GTATAACATAACAAACTCTACAGATTGTGG 6139 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 230705007526 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5