BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G28860.1 Length=4228 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg484657 jgi|Araly1|484657|fgenesh2_kg.5__649__AT3G28860.1 6577 0.0 > Ahg484657 jgi|Araly1|484657|fgenesh2_kg.5__649__AT3G28860.1 Length=4151 Score = 6577 bits (3561), Expect = 0.0 Identities = 3982/4183 (95%), Gaps = 38/4183 (1%) Strand=Plus/Plus Query 22 tctcACCACTTCAAAACAAGACACTCGTAAAAGAGTTCTTGAACTTCACAAAACAATTGT 81 ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || Sbjct 1 TCTCATCACTTCAAAACAAGACACTCGTAGAAGAGTTCTTGAACTTCAC--AA-AA---- 53 Query 82 CAGATTTTCAAGAAAAACTTTATAAAACAAAAAACATTTCATTCTTtctctctctctctc 141 || |||||||||||||||||| | |||| ||||| | || | ||| | |||||||||| Sbjct 54 CA-ATTTTCAAGAAAAACTTT-TTAAAC-AAAAA-A---CA-T-TTTAT-TCTCTCTCTC 103 Query 142 tcACTGCTCAATGATCTCGTTTTCTCACTAAACCAACTCGTTTCTTCTTACTTTCTTTAA 201 | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 104 T--CTGCTCAATGATCTCGTTTTCTCACTGAGCCAACTCGTTTCTTCTTTCTTTCTTTAA 161 Query 202 CTCGGATCTACAAAAAACCATGTCGGAAACTAACACAACCGATGCCAAGACTGTTCCAGC 261 ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || Sbjct 162 CTCGGATCT--AAAAAACCATGTCGGAACCTAACACGACCGATGCCAAGACTGTTCCGGC 219 Query 262 AGAAGCAGAGAAGAAGAAAGAACAGAGTTTACCATTCTTTAAACTCTTTTCTTTCGCTGA 321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 220 AGAAGCAGAGAAGAAGAAAGAACAGAGTTTACCATTCTTTAAACTCTTCTCTTTCGCTGA 279 Query 322 TAAATTTGATTATCTCTTAATGTTCGTTGGTTCTCTTGGTGCCATTGTTCATGGCTCTTC 381 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 280 TAAATTTGATTATCTCTTAATGTTCGTTGGTTCTCTTGGTGCCATTGTTCATGGCTCTTC 339 Query 382 CATGCCTGTCTTCTTTTTACTCTTTGGTCAAATGGTTAATGGATTTGGTAAAAACCAAAT 441 |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 340 CATGCCTGTCTTTTTTTTACTGTTTGGTCAAATGGTTAATGGATTTGGTAAAAACCAAAT 399 Query 442 GGATTTACATCAAATGGTTCATGAAGTCTCTAGATATTCTCTATATTTCGTCTACTTGGG 501 |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 400 GGATTTACATCAAATGGTTCATGAAGTCTCAAAATATTCTCTGTATTTCGTCTACTTGGG 459 Query 502 TTTGGTCGTTTGCTTCTCTTCTTACGCAGAGATAGCATGTTGGATGTATTCTGGAGAAAG 561 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 460 TTTGGTCGTTTGCTTCTCTTCATACGCAGAGATAGCATGTTGGATGTATTCTGGAGAAAG 519 Query 562 ACAAGTAGCAGCATTAAGGAAGAAATATCTTGAAGCAGTATTAAAACAAGACGTTGGGTT 621 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 520 ACAAGTAGCAGCATTAAGGAAGAAATATCTTGAAGCAGTATTAAAACAAGACGTTGGGTT 579 Query 622 CTTTGATACTGATGCTAGAACTGGTGACATTGTCTTTAGTGTTTCTACTGATACTCTTCT 681 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 580 CTTTGATACTGATGCAAGAACTGGTGACATTGTCTTTAGTGTTTCTACTGATACTCTTCT 639 Query 682 TGTTCAAGATGCCATTAGTGAAAAGGTTGGAAACTTTATACATTACCTCTCAACATTTTT 741 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 640 TGTTCAAGATGCCATTAGTGAAAAGGTTGGAAACTTTATACATTACCTATCAACATTTTT 699 Query 742 GGCGGGATTAGTAGTTGGATTTGTATCAGCATGGAAATTAGCTTTGTTAAGTGTTGCTGT 801 ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 700 GGCGGGACTAGTCGTTGGATTTGTATCAGCATGGAAATTAGCTTTGTTAAGTGTTGCGGT 759 Query 802 GATTCCCGGAATCGCTTTCGCCGGAGGTTTATACGCTTATACACTCACCGGAATTACTTC 861 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 760 GATTCCCGGAATCGCTTTCGCCGGAGGTTTATACGCTTATACACTCACCGGAATTACTTC 819 Query 862 AAAGAGCCGTGAATCTTATGCTAACGCCGGTGTTATCGCCGAGCAGGCAATTGCTCAAGT 921 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 820 AAAGAGCCGTGAATCTTATGCTAACGCCGGCGTTATCGCCGAGCAGGCAATTGCTCAAGT 879 Query 922 TCGAACTGTTTATTCTTATGTTGGAGAGAGTAAGGCACTTAATGCGTATTCGGATGCGAT 981 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| Sbjct 880 TCGAACTGTTTACTCTTATGTTGGAGAGAGTAAGGCACTTAGTTCGTATTCGGATGCGAT 939 Query 982 TCAGTATACGCTTAAGCTCGGTTATAAAGCGGGGATGGCTAAAGGGTTGGGTTTAGGATG 1041 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 940 TCAGTATACGCTTAAGCTCGGTTATAAAGCTGGGATGGCTAAAGGATTGGGTTTAGGATG 999 Query 1042 TACTTATGGAATAGCTTGTATGTCATGGGCTTTGGTGTTTTGGTATGCTGGAGTTTTTAT 1101 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct 1000 TACTTATGGAATAGCTTGTATGTCATGGGCTTTGGTGTTTTGGTATGCCGGGGTTTTTAT 1059 Query 1102 TCGGAATGGACAAACCGATGGAGGAAAGGCGTTTACTGCTATATTCTCTGCTATTGTTGG 1161 ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 1060 TCGGAATGGGCAGACCGATGGAGGAAAGGCGTTTACGGCTATATTCTCTGCCATTGTTGG 1119 Query 1162 TGGAATGAGTTTGGGGCAATCTTTCTCGAATCTTGGGGCGTTTAGTAAAGGTAAAGCGGC 1221 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1120 TGGAATGAGTTTGGGACAATCTTTCTCCAATCTTGGGGCTTTTAGTAAAGGTAAAGCGGC 1179 Query 1222 TGGTTATAAGTTGATGGAGATAATTAACCAGAGACCGACGATAATTCAAGACCCGTTGGA 1281 |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1180 TGGTTACAAGCTGATGGAGATAATTAACCAGAGACCGACGATAATTCAAGACCCGTTAGA 1239 Query 1282 TGGAAAATGTTTGGATCAAGTTCATGGGAACATTGAGTTTAAAGATGTGACTTTTAGCTA 1341 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1240 CGGAAAATGCTTGGATCAAGTTCATGGGAACATTGAGTTTAAAGATGTGACTTTTAGCTA 1299 Query 1342 TCCTTCACGGCCTGATGTTATGATCTTCAGGAACTTTAATATTTTCTTCCCTTCTGGGAA 1401 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1300 TCCTTCACGGCCTGATGTTATGATATTCAGAAACTTTAATATTTTCTTTCCTTCTGGGAA 1359 Query 1402 AACTGTGGCGGTTGTTGGTGGGAGTGGCTCTGGAAAGAGTACTGTTGTTTCCCTCATTGA 1461 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1360 AACTGTGGCGGTTGTTGGTGGGAGTGGCTCTGGAAAGAGTACTGTTGTTTCCCTCATTGA 1419 Query 1462 GAGATTCTATGATCCAAACAGCGGGCAAATTCTGTTGGATGGTGTTGAGATAAAGACGCT 1521 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct 1420 GAGATTCTACGATCCAAACAGCGGGCAAATTCTGTTGGATGGTGTTGAAATAAAGACTCT 1479 Query 1522 TCAGTTGAAGTTTTTGCGTGAACAAATCGGGCTTGTGAATCAAGAACCTGCGCTCTTTGC 1581 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| Sbjct 1480 TCAGTTGAAGTTTTTGCGCGAACAAATCGGGCTTGTGAATCAAGAACCAGCTCTGTTTGC 1539 Query 1582 CACTACTATACTAGAGAACATACTCTATGGAAAGCCTGATGCAACAATGGTTGAAGTTGA 1641 ||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1540 CACCACCATACTTGAGAACATACTCTACGGAAAGCCTGATGCAACAATGGTTGAAGTTGA 1599 Query 1642 AGCTGCTGCTTCCGCTGCGAATGCGCATAGTTTCATTACATTACTTCCTAAAGGCTACGA 1701 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || Sbjct 1600 AGCTGCTGCTTCCGCTGCGAATGCGCATAGTTTCATTACATTGCTTCCTAAAGGTTATGA 1659 Query 1702 CACACAGGTTGGAGAACGTGGTGTTCAACTCTCAGGTGGACAGAAGCAGAGAATTGCAAT 1761 ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1660 CACACAGGTTGGAGAACGTGGAGTTCAACTATCAGGTGGACAGAAACAGAGAATTGCAAT 1719 Query 1762 TGCTAGGGCGATGTTGAAAGACCCAAAGATTCTGTTACTAGATGAAGCTACAAGCGCTCT 1821 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1720 TGCTAGGGCAATGTTGAAAGACCCAAAGATTCTGTTACTAGATGAAGCTACAAGTGCTCT 1779 Query 1822 TGATGCTAGCTCTGAGAGCATTGTTCAGGAAGCTTTAGACAGAGTCATGGTGGGGAGGAC 1881 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct 1780 TGATGCTAGCTCTGAGAGCATTGTTCAGGAAGCTTTAGACAGAGTCATGGTAGGCAGGAC 1839 Query 1882 CACTGTTGTTGTTGCTCATCGTCTCTGCACCATCAGAAATGTTGATTCCATTGCCGTGAT 1941 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1840 CACTGTGGTTGTTGCTCATCGTCTCTGCACCATCAGAAATGTTGATTCCATTGCCGTGAT 1899 Query 1942 ACAGCAAGGCCAAGTTGTTGAAACCGGAACACATGAAGAACTCATTGCCAAATCCGGTGC 2001 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1900 ACAACAAGGCCAAGTTGTTGAAACCGGAACACATGAAGAACTCATTGCCAAATCCGGTGC 1959 Query 2002 TTACGCATCCCTCATCAGGTTTCAGGAAATGGTTGGTACTCGAGATTTCTCAAACCCGTC 2061 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1960 TTACGCATCCCTCATCAGGTTTCAAGAAATGGTTGGTACTCGAGATTTCTCAAATCCGTC 2019 Query 2062 AACTCGTCGCACTCGTTCAACCCGTTTGAGCCATTCACTGTCAACGAAATCACTCAGTTT 2121 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 2020 AACTCGTCGCACTCGTTCAACCCGTTTGAGCCATTCTCTGTCAACAAAATCACTCAGTTT 2079 Query 2122 AAGATCAGGAAGTTTGAGGAATCTGAGCTATTCTTACAGCACTGGAGCTGATGGTCGGAT 2181 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2080 AAGATCAGGAAGTTTGAGGAATCTGAGCTATTCGTACAGCACTGGAGCTGATGGTCGGAT 2139 Query 2182 AGAGATGATTTCAAATGCAGAGACTGACCGAAAGACTCGTGCCCCTGAAAATTACTTCTA 2241 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2140 AGAGATGATTTCAAATGCAGAGACGGACCGAAAGACTCGCGCCCCTGAAAATTACTTCTA 2199 Query 2242 CAGGCTTCTCAAGCTTAATTCACCGGAATGGCCTTACTCAATCATGGGAG-CAGTAGGCT 2300 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || | |||| Sbjct 2200 CAGGCTTCTCAAGCTTAATTCACCTGAATGGCCTTACTCCATCATGGGAGCCA-TTGGCT 2258 Query 2301 CAATTCTTTCTGGTTTCATTGGTCCTACATTTGCTATTGTGATGAGCAACATGATCGAAG 2360 | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| Sbjct 2259 CGATTCTTTCTGGTTTCATCGGACCTACATTTGCTATTGTGATGAGTAATATGATCGAAG 2318 Query 2361 TCTTCTACTACACAGACTATGATTCAATGGAAAGGAAAACAAAAGAGTATGTCTTCATCT 2420 ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| || || || ||||||| Sbjct 2319 TCTTCTACTACACAGACTACAATTCAATGGAGAGAAAAACAAAGGAATACGTTTTCATCT 2378 Query 2421 ACATTGGTGCTGGTCTCTATGCTGTGGGTGCTTATTTGATCCAACATTACTTCTTTAGCA 2480 |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2379 ACATCGGTGCTGGTCTCTACGCTGTGGGTGCTTATTTGATCCAACATTACTTCTTTAGCA 2438 Query 2481 TCATGGGAGAAAACCTCACAACAAGAGTAAGAAGAATGATGCTCTCAGCTATCTTGAGAA 2540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2439 TCATGGGAGAAAACCTCACAACAAGAGTAAGAAGAATGATGCTCTCAGCTATCTTGAGAA 2498 Query 2541 ACGAAGTTGGTTGGTTCGATGAGGATGAACACAACTCAAGCCTGATCGCTGCACGTTTAG 2600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2499 ACGAAGTTGGTTGGTTCGATGAGGATGAACACAACTCAAGCCTGATCGCTGCACGGTTAG 2558 Query 2601 CTACTGATGCAGCAGATGTTAAATCCGCTATAGCCGAGAGAATCTCAGTAATTCTACAAA 2660 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2559 CTACTGATGCAGCCGATGTTAAATCCGCTATAGCCGAGAGAATCTCAGTAATTCTACAAA 2618 Query 2661 ACATGACTTCACTTCTCACATCCTTCATAGTCGCCTTCATAGTAGAATGGAGAGTCTCAC 2720 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2619 ACATGACTTCACTTCTCACATCCTTCATAGTTGCCTTCATAGTAGAATGGAGAGTCTCAC 2678 Query 2721 TTCTCATCTTAGGCACATTCCCACTTCTAGTCCTCGCTAACTTTGCTCAGCAACTATCTC 2780 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2679 TTCTCATCTTAGGCACATTCCCACTTCTAGTCCTCGCCAACTTTGCTCAGCAACTATCTT 2738 Query 2781 TGAAGGGTTTTGCTGGAGACACAGCTAAGGCTCATGCAAAGACTTCAATGATTGCTGGTG 2840 ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2739 TGAAGGGTTTTGCTGGAGATACAGCCAAGGCGCATGCAAAGACTTCAATGATTGCTGGTG 2798 Query 2841 AAGGAGTCAGTAACATTAGAACCGTAGCAGCTTTCAATGCACAGAGCAAGATTCTCTCTT 2900 ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2799 AAGGAGTTAGCAACATTAGAACTGTAGCAGCGTTCAATGCACAGAGCAAAATTCTCTCTT 2858 Query 2901 TGTTCTGTCATGAGCTTCGTGTACCTCAGAAAAGAAGCTTATACCGAAGTCAAACCTCGG 2960 |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct 2859 TGTTCTGTCACGAGCTTCGTGTTCCTCAGAAAAGAAGTTTATACCGGAGTCAAACCTCGG 2918 Query 2961 GTTTCCTATTTGGCCTCTCGCAGCTTGCTCTCTATGGTTCTGAGGCTTTAATTCTCTGGT 3020 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2919 GTTTCCTATTTGGCCTCTCGCAGCTTGCTCTATATGGTTCTGAGGCTTTGATTCTCTGGT 2978 Query 3021 ATGGTGCCCACCTTGTGAGTAAAGGCGTGTCAACCTTTTCCAAAGTGATCAAAGTGTTTG 3080 |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2979 ATGGCGCCCACCTTGTGAGCAAAGGCGTGTCAACCTTTTCCAAAGTGATCAAAGTGTTTG 3038 Query 3081 TGGTTTTGGTCATTACTGCAAACTCTGTTGCTGAAACTGTCAGTCTTGCTCCTGAAATTA 3140 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3039 TGGTTTTGGTCATTACTGCAAACTCTGTTGCTGAAACTGTCAGCCTTGCTCCTGAAATTA 3098 Query 3141 TTCGGGGAGGTGAAGCTGTTGGTTCGGTTTTCTCGGTCTTGGACAGGCAGAC-CAGGATT 3199 | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||| Sbjct 3099 TCCGGGGAGGTGAAGCGGTTGGTTCGGTTTTCTCGGTATTGGATAGGCAAACTC-GGATT 3157 Query 3200 GACCCGGATGATGCTGATGCTGATCCCGTGGAGACGATCCGTGGAGACATTGAGTTTAGG 3259 ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3158 GACCCGGATGATGCTGATGCTGATCCCGTTGAAACAATCCGTGGAGACATAGAGTTTAGG 3217 Query 3260 CATGTTGATTTCGCTTACCCTTCAAGACCCGACGTCATGGTTTTCAGGGACTTTAACCTC 3319 ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3218 CATGTGGATTTCGCTTACCCTTCAAGACCAGATGTCATGGTTTTCAGGGACTTTAACCTC 3277 Query 3320 AGAATTCGAGCTGGACATAGCCAAGCTCTTGTGGGCGCGAGTGGGTCAGGGAAGAGTTCT 3379 ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3278 AGAATCCGAGCTGGACATAGCCAAGCTCTAGTGGGCGCAAGTGGGTCAGGGAAGAGTTCT 3337 Query 3380 GTAATTGCGATGATCGAGCGGTTTTACGACCCTCTTGCTGGAAAAGTCATGATTGATGGC 3439 ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3338 GTAATCGCGATGATTGAGCGGTTTTATGACCCGCTTGCTGGAAAAGTCATGATTGATGGC 3397 Query 3440 AAAGACATCCGCCGGCTAAACCTGAAATCTCTAAGGCTCAAAATCGGTCTTGTTCAACAA 3499 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3398 AAAGATATCCGCCGGCTAAACCTGAAATCTCTAAGGCTCAAAATCGGTCTTGTTCAACAA 3457 Query 3500 GAACCAGCTCTCTTCGCAGCAACGATCTTCGACAACATCGCCTATGGTAAAGATGGTGCA 3559 ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 3458 GAACCAGCTCTTTTCGCAGCAACCATCTTCGACAACATCGCATATGGGAAAGATGGTGCA 3517 Query 3560 ACTGAATCCGAGGTAATTGATGCAGCTCGAGCCGCAAATGCTCACGGTTTCATCAGTGGT 3619 |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3518 ACTGAATCCGAGGTAATTGAGGCAGCGCGGGCCGCAAATGCTCATGGTTTCATCAGTGGT 3577 Query 3620 TTACCTGAAGGTTACAAAACTCCAGTAGGCGAAAGAGGAGTGCAGTTATCAGGTGGACAG 3679 || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3578 TTGCCTGAAGGTTACAAAACTCCAGTGGGCGAAAGAGGAGTGCAGTTATCAGGTGGACAG 3637 Query 3680 AAACAGAGGATCGCGATAGCAAGAGCTGTGCTCAAGAACCCTACAGTGTTGCTTCTAGAC 3739 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3638 AAACAGAGGATCGCGATAGCAAGAGCTGTGCTCAAGAACCCTACAGTGTTGCTTCTAGAC 3697 Query 3740 GAAGCAACTAGCGCACTAGATGCAGAATCAGAATGCGTGCTGCAAGAGGCGTTAGAGAGG 3799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 3698 GAAGCAACTAGCGCACTAGATGCAGAATCAGAATGCGTGCTGCAAGAGGCATTAGAGAGG 3757 Query 3800 CTCATGAGAGGTCGGACCACCGTGGTAGTTGCTCACCGCTTGTCCACCATAAGAGGTGTT 3859 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3758 CTCATGAGAGGTCGGACAACCGTGGTAGTTGCTCACCGCTTGTCCACCATAAGAGGTGTT 3817 Query 3860 GATTGCATTGGTGTGATTCAAGACGGGCGGATTGTGGAGCAAGGCAGCCATTCAGAGCTC 3919 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3818 GATTGCATTGGTGTGATTCAAGACGGGCGGATTGTGGAGCAAGGCAGCCATTCCGAGCTC 3877 Query 3920 GTTAGCCGACCAGAGGGAGCTTATTCAAGGCTGTTACAGCTTCAAACACATAGGATTTGA 3979 || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3878 GTAAGCCGACCAGAGGGAGCGTATTCAAGGCTTTTACAGCTTCAAACGCATAGGATTTGA 3937 Query 3980 AGCTTGATCATGGATTaaaaacaaaaaa---TCGGTTTGTGTAAttttttttATATTAAA 4036 ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||| Sbjct 3938 AGCTTGATCATGGTTTAAAAACAAAAAAAAATCGGTTTCTGTAATTTTTTTTAAATCAAA 3997 Query 4037 ACTTTAATTTGGAAGATTTCTATGGACTATAACGATAATATGAATAGGTGTAGATAATGA 4096 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3998 ACTTTAATTTGGAAGATTTCGATGGACTATAACGATAATATGGATAGGTGTAGATAATGA 4057 Query 4097 AGCTTTTGGAGTGTTTATGAAGGTTCTTTAATTAAGGGTTAt-ttttttCGCATTTTGCT 4155 |||||||| | | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| Sbjct 4058 AGCTTTTGC--T-T--ATGAAGGTTCTTTAAG---GGGTTTTCTTTTTTCGCATTT-GCT 4108 Query 4156 TATGTGCCCGTTTTGGAACATAAGACTGAACTATGTTTTCGTT 4198 ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct 4109 TATGTGCCCGTTTTGGAACATGAGACTAAACTATGTTTTCGTT 4151 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 159879864173 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5