BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G50590.1 Length=5231 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg485406 jgi|Araly1|485406|fgenesh2_kg.5__1398__AT3G50590.1 4676 0.0 > Ahg485406 jgi|Araly1|485406|fgenesh2_kg.5__1398__AT3G50590.1 Length=5011 Score = 4676 bits (2532), Expect = 0.0 Identities = 2785/2905 (96%), Gaps = 25/2905 (1%) Strand=Plus/Plus Query 2229 AAATTGACTCGTCATGTTCAATGGCAAGAAACACCCCGGGGATATGTCGCAGGGATATTA 2288 |||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2131 AAATAG-CTCTTCAGGTTCAATGGCAAGAAACACCCCGGGGATATGTCGCAGGGATATTA 2189 Query 2289 ACAACCCAAAGGGTGCTGATGGTATCTCTTCTATGGGTTGGGCCTGCCTTACTCTTTTCT 2348 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2190 ACAACCCAAAGGGTGCTGATGGTATCTCTTCTATGGGTTGGGCCTGCCTTACTCTTTTCT 2249 Query 2349 ACAACAACTGCTGTATGTTTACTTGGCTGGGATGGGAAAGTGAGGACTATTCTTTCCATA 2408 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 2250 ACAACAACTGCTGTATGTTTGCTTGGCTGGGATGGGAAAGTGAGGACCATTCTTTCTATA 2309 Query 2409 AGTACACCATACGCAGCCCTAGTTGGTGCCTTGAATGACCGCCTATTGCTTGCTCATCCC 2468 |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| Sbjct 2310 AGTACACCATACGCAGCCTTAGTTGGTGCGTTGAATGACCGCCTATTACTCGCTAATCCC 2369 Query 2469 ACTGATATAAGTCCGAAGCAGAAAAAGGGGATCGAAATCAAGAGCTGCCTTGTTGGGCTA 2528 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2370 ACTGATATAAGTCCGAAGCAGAAAAAGGGGATTGAAATCAAGAGCTGTCTTGTTGGGCTA 2429 Query 2529 CTTGAACCGCTTTTAATTGGATTTTCTACAATGCAACAAACATTTGAACAGAAAGTAGAC 2588 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2430 CTAGAACCGCTTTTAATTGGATTTTCTACAATGCAACAAACATTTGAACAGAAAGTGGAC 2489 Query 2589 CTTTCTGAAATATTGTATCAAATAACAACAAGGTTTGATAGCTTGCGAATTACTCCAAGA 2648 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2490 CTTTCTGAAATATTGTATCAAATAACAACAAGGTTTGATAGCTTGCGAATTACTCCAAGA 2549 Query 2649 TCTCTTGATATTCTTGCTAGAAGCGCTCCAGTATGTGGAGATCTTGCTGTATCACTAGCT 2708 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2550 TCTCTTGATATTCTTGCTAGAAGCGCTCCAGTATGTGGAGATCTTGCTGTATCACTAGCT 2609 Query 2709 CAAGCAGGCCCTCAATTCAACCAGGTATTACGTTGTGCATATGCGATAAAGGCTCTTCGG 2768 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2610 CAAGCAGGCCCTCAATTCAACCAGGTATTACGTTGTGCATATGCAATAAAGGCTCTTCGG 2669 Query 2769 TTCTCCACGGCATTGTCAGTTTTAAAGGACGAGTTCTTGCGTTCTAGAGACTATCCAAAA 2828 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2670 TTCTCCACGGCATTGTCGGTTTTAAAGGACGAGTTCTTGCGTTCTAGAGACTATCCAAAA 2729 Query 2829 TGTCCTCCAACTTCTCTTTTGTTCCAGAGGTTCCGGCAGCTTGGATATGCCTGTATCAAA 2888 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2730 TGTCCTCCAACTTCTCTTTTGTTCCAGAGGTTCCGTCAGCTTGGATATGCCTGTATCAAA 2789 Query 2889 TATGGTCAATTCGATAGCGCAAAGGAAACTTTTGAAGTAATAGGCGACTATGAGAGCATG 2948 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2790 TATGGTCAATTTGATAGCGCAAAGGAAACTTTTGAAGTAATAGCCGACTATGAGAGCATG 2849 Query 2949 CTAGATCTTTTTATATGCCACCTCAACCCTAGTGCTATGCGTCGTCTTGCCCAGAAATTG 3008 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2850 CTAGATCTTTTCATATGCCACCTCAACCCTAGTGCTATGCGTCGTCTTGCCCAGAAATTG 2909 Query 3009 GAAGAAGAAAGTGGAGATCCCGAGTTGAGACGATATTGTGAAAGGATTTTACGAGTACGG 3068 ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2910 GAAGAAGAAAGCGGAGATCCTGAGTTGAGACGATATTGTGAAAGGATTTTAAGAGTACGG 2969 Query 3069 TCTACAGGATGGACCCAGGGAATTTTTGCTAATTTTGCAGCTGAGAGTATGGTTCCAAAA 3128 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2970 TCTACAGGATGGACCCAGGGAATTTTTGCTAATTTTGCAGCTGAGAGTATGGTTCCAAAA 3029 Query 3129 GGACCAGAATGGGGTGGTGGCAACTGGGAAATCAAGACTCCAACCGACATGAAGAGCATA 3188 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3030 GGACCAGAATGGGGTGGTGGCAACTGGGAAATCAAGACTCCAACCGACATGAAAAGCATA 3089 Query 3189 CCTAAGTGGGAGCTTGCTGGGGAAGTAATGCCATACATGAAGAATGAAGATGGAACCATC 3248 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3090 CCTAAGTGGGAGCTTGCTGGGGAAGTAATGCCATACATGAAGAATGAAGATGGAACAATC 3149 Query 3249 CCCTCAATAGTAGCTGATCATATTGGTGTTTACTTGGGCTGTGTCAAAGGCAGAGTTAAT 3308 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3150 CCCTCAATAGTAGCTGATCATATTGGTGTTTACTTGGGCTGTGTTAAAGGCAGAGTTAAT 3209 Query 3309 GTGGTGGAAATTAAAGAAGACAGCTTAGTTTCTAAACCTGGAGGGCTTAGTTTGTTGGGT 3368 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct 3210 GTGGTGGAGATTAAAGAAGACAGCTTAGTTTCTAAACCAGGAGTGCTTAGTTTGTTGGGT 3269 Query 3369 AAACCTGTATCGGATAAACCTCTGGCACTTCCTGCTGGTGAATCAAGTTCGATGATGGGT 3428 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| Sbjct 3270 AAACCTGTATCGGATAAACCTTTGGCACTTCCTGCTGGCGAATCCAGTTCGTTGATGGGT 3329 Query 3429 CTGGAATCCCTTGGAAAACAAAACGTAGCTGATGAACAGGCAAAGGCTGCTGAGGAATTC 3488 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3330 CTGGAATCCCTTGGAAAACAAAACGTAGCTGATGAACAGGCAAAGGCTGCTGAGGAATTC 3389 Query 3489 AAGAAAACAATGTATGGTGCTACTGGTGATGGCAGCAGCAGTGACGAGGAAGGTGTAACA 3548 ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3390 AAGAAAACAATGTATGGTGCTGCTGGTGATGGCAGTAGCAGTGACGAGGAAGGTGTGACA 3449 Query 3549 AAACCTAAGAAGCTGCAGATTAGAATACGAGAAAAGCCAACATCTACCACCGTGGACGTC 3608 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3450 AAACCTAAGAAACTGCAGATTAGAATACGAGAAAAGCCAACATCTACCACCGTGGACGTC 3509 Query 3609 AATAAGCTTAAAGAAGCTGCTAAAACGTTTAAACTCGGAGATGGTCTAGGCTTAACAATG 3668 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3510 AATAAGCTTAAAGAAGCTGCTAAAACGTTTAAACTCGGAGATGGGCTAGGCTTAACAATG 3569 Query 3669 AGTAGAACAAAATCAATTAATGCTGGATCTCAGGATTTGGGTCAGATGTTAAGCCAGCCT 3728 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3570 AGTAGAACAAAATCAATTAATGCTGGATCCCAGGATTTGGGTCAGATGTTAAACCAGCCT 3629 Query 3729 TCTTCCTCAACAGTTGCAACTACAACTGCTCCAAGTTCTGCATCTGCTCCTGTTGATCCT 3788 ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3630 TCTTCCTCAACAGCTGCAACTACAACTGCTCCCGGTTCTGCATCTGCTCCTGTTGATCCT 3689 Query 3789 TTTGCAATGAGCTCATGGACACAGCAACCTCAACCAGTTTCTCAACCAGCTCCACCTGGT 3848 ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3690 TTTGCGATGGGCTCATGGACACAACAACCTCAACCAGTTTCTCAACCAGCTCCACCTGGT 3749 Query 3849 GTAGCCGCGCCGATACCGGAAGACTTTTTCCAAAACACAATCCCATCTGTTGAGGTTGCC 3908 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3750 GTAGCTGCGCCGATACCGGAAGACTTTTTCCAAAACACTATCCCATCTGTTGAGGTTGCC 3809 Query 3909 AAGACATTGCCTCCTCCTGGCACTTATCTTTCGAAAATGGACCAAGCTGCTCGAGCTGCA 3968 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | Sbjct 3810 AAGACATTGCCTCCTCCTGGCACTTATCTTTCGAAAATGGACCAAGCTGC---A-----A 3861 Query 3969 ATAGCTGCACAGGGTGGTCCAAATCAAGCAAATAATACTCCTCTGCCTGATATTGGTCTT 4028 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct 3862 -TAGCTGCACAGGGTGTTCCAAATCAAGCAAATAATACTACTCTTCCTGATATTGGTCTT 3920 Query 4029 CCCGATGGTGGTGTTCCTCAACAGTATCCTCAACAAACAAGTCAACAACCTGGTGCGCCA 4088 ||||||||||| |||||||||||| | | || |||||||||||||||| ||| Sbjct 3921 CCCGATGGTGGCGTTCCTCAACAG-A-C---AA-------GTCAACAACCTGGTGCTCCA 3968 Query 4089 TTTCAGACTGTTGGACTTCCTGACGGCGGTGTTCGTCAACAGTATCCTGGTCAGAACCAG 4148 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | Sbjct 3969 TTTCAGACTGTTGGACTTCCTGACGGCGGTGTTCCTCAACAGTATCCTGGTCAGACCCTG 4028 Query 4149 GTGCCATCTCAGGTTCCCGTTTCTACACAGCCTCTTGATCTTAGCGTTCTTGGAGTTCCA 4208 | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4029 GGGCCATCCCAGGTTCCCGTTTCTACACAGCCTCTTGATCTTAGCGTTCTTGGAGTTCCA 4088 Query 4209 AATACCGGCGATTCTGGTAAGCCTCCTGGACAACCTCAATCGCCTCCTGCATCAGTTCGT 4268 ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4089 AATACTGGTGATTCTGGAAAGCCTCCCGGACAACCTCAATCGCCTCCTGCATCAGTTCGT 4148 Query 4269 CCTGGACAGGTTCCACGTGGAGCTGCAGCTCCGGTTTGTTTCAAGACTGGACTTGCCCAT 4328 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4149 CCTGGACAGGTTCCACGTGGAGCTGCAGCTCCTGTTTGTTTCAAGACTGGACTTGCACAT 4208 Query 4329 CTTGAACAAAACCAGCTTCCAGATGCACTGTCTTGCTTTGACGAAGCATTCTTGGCTCTG 4388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 4209 CTTGAACAAAACCAGCTTCCAGATGCACTGTCTTGCTTCGACGAAGCATTCTTGGCTCTG 4268 Query 4389 GCTAAGGATCAATCGCGTGGTGCAGATATCAAAGCTCAAGCCACAATCTGTGCTCAGTAC 4448 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4269 GCTAAGGATCAATCACGTGGAGCAGATATCAAAGCTCAAGCCACAATCTGTGCTCAGTAC 4328 Query 4449 AAGATAGCTGTAACTCTCCTTCGGGAAATCTTGAGGCTACAAAGAGTCCAAGGTGCAAGT 4508 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4329 AAGATAGCTGTAACTCTCCTTCGGGAAATCTTGAGGCTACAAAGAGTCCAAGGTGCAAGT 4388 Query 4509 GCATTAAGCGCAAAGGACGAAATGGCAAGACTTTCAAGGCATCTAGCTTCACTGCCACTA 4568 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4389 GCATTAAGCGCAAAAGACGAAATGGCAAGACTTTCAAGGCATCTAGCTTCACTGCCACTA 4448 Query 4569 CTAGCCAAGCACCGTATAAACTGCATACGTACTGCAATCAAAAGAAACATGGAAGTTCAA 4628 ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 4449 CTAGCAAAGCACCGCATAAACTGCATACGCACTGCAATCAAAAGAAATATGGAAGTTCAA 4508 Query 4629 AACTATGGCTACTCAAAGCAGATGCTGGAACTTCTTTTATCAAAGGCACCAGCGAGTAAG 4688 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | Sbjct 4509 AACTATGGCTACTCAAAGCAGATGCTGGAACTTCTTTTATCAAAGGCACCAGCGAGCAGG 4568 Query 4689 CAAGAGGAATTAAGAGGACTAGTCGATCTCTGTGTCCAGAGAGGCACATCGAACAAATCC 4748 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4569 CAAGAGGAATTAAGAGGACTAGTCGATCTCTGTGTCCAGAGAGGCACATCGAACAAATCC 4628 Query 4749 ATTGACCCGCTTGAAGATCCTTCTCAGTTATGCTCAGCTACGCTCAGCAGATTATCGACT 4808 || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4629 ATCGACCCACTTGAAGATCCTTCTCAGTTATGCTCAGCTACGCTCAGCAGATTATCGACT 4688 Query 4809 ATTGGATACGATGTTTGTGATCTCTGTGGTGCTAAGTTTGCTGCTCTTTCGTCGCCCGGT 4868 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 4689 ATTGGATACGATGTTTGTGATCTCTGTGGCGCAAAGTTTGCTGCTCTTTCATCGCCCGGT 4748 Query 4869 TGTATCATATGCGGTATGGGAAGCATCAAACGCTCTGATGCACTCGCTGGACCTGCACCT 4928 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 4749 TGTATCATATGCGGTATGGGAAGCATCAAACGGTCTGATGCACTCGCTGGACCCGCACCT 4808 Query 4929 GTATCCACACCGTTTGGCTAAAGGTTATAGACACTATCACCGTTGGTGTTAATCAACATC 4988 |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | | || |||||||||||||||||| Sbjct 4809 GTATCCACACCGTTCGGCTAAACGTTATAGACATTGTTACGGTTGGTGTTAATCAACATT 4868 Query 4989 TAAGCAAATTTCAAACTGGTTACATGTACGAACTCATTCGATCGATTTTGTGGG-TTTGA 5047 |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4869 TAAGCAAATTTCAAACTGGTTACATGCAAGAAC--ATTCGATCGATTTTGTGGGGTTTGA 4926 Query 5048 TTTTGATTTATTCGTCTGTATATGATTTGATTATTTGTATCTGTTTATTTTCCGTACGTA 5107 ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4927 TTTTGGTTTATTCGTCTGTATATGATTTGATCATTTGTATCTGTTTATTTTCCGTACGTA 4986 Query 5108 GCTAATACAATTTGTTGAGATATTT 5132 ||||||||| |||||||||| |||| Sbjct 4987 GCTAATACAGTTTGTTGAGAGATTT 5011 Score = 1810 bits (980), Expect = 0.0 Identities = 1059/1098 (96%), Gaps = 2/1098 (0%) Strand=Plus/Plus Query 16 AAAACCTTCGTGTACCTTCGTATTCTCTGCATTGGATTTGAAGCAAATTGATGAACTAGT 75 |||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1 AAAACCTTCGTGTATCTTCATATCCTCAGCATCGGATTTGAAGCAAATTGATGAACTCGT 60 Query 76 AATCTCACACGGATCTAAGAGCAGAAGTTATGGAGTGGGCAACGGTGCAGCATCTGGATC 135 ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AATCTCACAGGGATCTAAGAGCAGGAGTTATGGAGTGGGCAACGGTGCAGCATCTGGATC 120 Query 136 TGCGTCATGTAGGTCGCGGTGTGAGCAAGCCACTACAACCTCATACGGCGGCGTTTCATC 195 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 121 TGCGTCATGTAGGTCGCGGTGTGAGCAAGCCGCTGCAACCACATACGGCGGCGTTTCATC 180 Query 196 CTTCTCAAGCCGTTATCGCTGTTGCCGTTGGCTCTCACATCATGGAATTTGATGCATTAA 255 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CTTCTCAAGCCGTTATCGCTGTTGCCGTTGGCTCTCACATCATGGAATTTGATGCATTAA 240 Query 256 CGGGATGTAAGATCGCGTCTATTGATATTGGATCTCCAGCTGTTAGAATGTTGTATAGTC 315 |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 CGGGGTGTAAGATCGCGTCGATTGACATTGGATCTCCAGCTGTTAGAATGTTGTATAGTC 300 Query 316 CTACTAGCAGCAATGCTGTTGTTGCCATTCTTGAGGATTGTACAATTAGGTCTTGTGATT 375 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 CTACTAGCAGCAATGCTGTTGTTGCAATTCTTGAGGATTGTACAATTAGGTCTTGTGATT 360 Query 376 TTGAAACGGAGCAGACTTGTGTATTGCACTCACCGGAGAAGAGGAGTGAGCACATTTCCT 435 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 TTGAAACGGAGCAGACTTGTGTATTGCACTCACCGGAGAAGAGGAGTGAGCACATTTCCT 420 Query 436 CAGATACTGAAGTTCATCTTGCTGTGACGCCACTTCAACCTGTTGTGTTCTTT-GGATTC 494 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| Sbjct 421 CAGATACTGAAGTTCATCTTGCTGTGACGCCACTCCAACCTGTTGTGTT-TTTCGGATTC 479 Query 495 CCAAAACGAATGAGTGTCACAGTTGTTGGAACTGTTGAAGGTGGAAGAGCTCCAACCAAA 554 |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 480 CCAAAAAGAATGAGTGTGACAGTTGTTGGAACTGTTGAAGGTGGAAGAGCTCCGACAAAA 539 Query 555 ATTAAGACAGATTTGAAGAAACCAATTGTGAACATTGCTTGCCATCCTCGACTACCTGTC 614 ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct 540 ATTAAGACAGACCTGAAGAAACCGATTGTGAACATTGCTTGCCATCCCCGACTCCCTGTC 599 Query 615 CTGTATGTAGCATATGCAGAGGGGTTGATACGAGCTTATAACATTCATACTTATGCTGTT 674 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 CTGTATGTAGCATATGCAGAGGGGTTGATAAGAGCTTATAACATTCATACTTATGCTGTT 659 Query 675 CATTATACACTACAGCTTGATAATACTATTAAACTTATCGGCGCAAGTTCGTTTGCTTTT 734 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 CATTATACACTACAGCTTGATAATACTATTAAACTTATCGGCGCAAGTTCGTTTGCTTTT 719 Query 735 CACCCAACACTAGAATGGATTTTTGTTGGAGATAGGAGGGGTACACTTTTAGCGTGGGAT 794 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 CACCCAACACTAGAATGGATTTTTGTTGGAGATAGGAGGGGTACACTTTTAGCGTGGGAT 779 Query 795 GTTTCAACTGAAAGACCTAATATGATTGGAATAACGCAAGTGGGTTCGCAACCCATCACT 854 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 GTTTCAACTGAAAGACCTAATATGATTGGAATAACGCAAGTGGGTTCGCAACCCATCACT 839 Query 855 TCAATTTCTTGGCTTCCTATGTTGCGTGTACTTGTCACTGTGTCCAAGGATGGATCTCTT 914 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 840 TCAATTTCTTGGCTTTCTATGTTGCGTGTACTTGTCACTGTGTCCAAGGATGGATCTCTT 899 Query 915 CAAGTGTGGAAGACACGAGTAATAATTAATCCCAATAGGCCTTCGACACAAACAAACTTC 974 ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 CAAGTGTGGAAGACACGGGTAATAATCAATCCCAACAGGCCTTCGACACAAACAAACTTT 959 Query 975 TTTGAGCCTGCTGCTATGGAATCAATAGACATTCCTAAAATTCTCTCCCAACAGGGTGGC 1034 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct 960 TTTGAGCCTGCTGCTATGGAATCAATAGACGTTCCTAGAATTCTCTCTCAACAGGGTGGG 1019 Query 1035 GAAGCTGTTTACCCTTTACCACGAATCAAAACTTTAGAAGTTCACCCAAAGCTGAACTTA 1094 |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1020 GAAGCTGTTTACCCCTTACCGCGAATCAAAACTTTAGAAGTTCACCCAAAGCTGAACTTA 1079 Query 1095 GCAGCTTTGATTTTTGCA 1112 |||||||||||||||||| Sbjct 1080 GCAGCTTTGATTTTTGCA 1097 Score = 1507 bits (816), Expect = 0.0 Identities = 979/1049 (93%), Gaps = 45/1049 (4%) Strand=Plus/Plus Query 1113 AACATGGTGGGTAATGAGAACACTCAAAATCGAGCAGCTCAGACTAGAGAAGGAAGGAAG 1172 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1133 AACATGGCGGGTAATGAGAACACTCAAAATCGAGCAGCTCAGACTAGGGAAGGAAGGAAG 1192 Query 1173 CAGCTCTTTGCAGTTTTGCAAAGTGCTAGGGGATCTTCAGCTTCTGTTCTAAAGGAAAAG 1232 ||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||| |||||||| Sbjct 1193 CAGCTCTTTGCAGTTCTGCAAAGTGCTAGGGG------A---TC--TTC---AGGAAAAG 1238 Query 1233 CTTTCGTCTATGGGTTCCTCTGGAATTTTAGCCGAGCATCAACTTCAAGCTCTGCTACAG 1292 ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1239 CTTTCATCGATGGGTTCCTCTGGAATTTTAGCCGAGCATCAACTCCAAGCTCTGCTACAG 1298 Query 1293 GAG------CACAAGGGCCAGAGTCAGCTAACAATTTCAGATATCGCACGGAAGGCGTTC 1346 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1299 GAGCATCATCACAAGGGCCAGAGTCAGCTAACAATTTCAGATATTGCACGGAAGGCGTTC 1358 Query 1347 TTGTATAGTCATTTTATGGAGGGTCATGCCAAAACTGCTCCAATATCAAGGTTACCCCTT 1406 ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1359 CTGTATAG--------T----GGCCATGCCAAAACTGCTCCAATATCAAGGTTACCCCTT 1406 Query 1407 ATTACGGTCGTGGATACAAAGGATCAACTTAAAGACATTCCTGTTTGCCAGCCATTTCAT 1466 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| Sbjct 1407 ATTACCGTCGTGGATACAAAGGATCAACTTAAAGACATTCC----T-----CCATTTCAT 1457 Query 1467 TTGGAGCTGAATTTCTTCAATAAGCCAAATAGAGTTCTTCATTATCCTGTGAGGTCCTTT 1526 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1458 TTGGAGCTGAATTTCTTCAATAAGCCAAATAGAGTTCTTCATTATCCTGTGAGGGCCTTT 1517 Query 1527 TATATCGAGGGCCTTAACCTCATGGCTCACAATCTCTGTTCTGGAACAGACAACATCTAC 1586 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1518 TATATCGAGGGCCTTAACCTCATGGCACACAATCTCTGTTCTGGAACGGACAACATCTAC 1577 Query 1587 AAGAAGCTGTACACATCGATCCCCGGAAATGTTGAATATCATTCGAAACACATTGTTTAC 1646 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1578 AAGAAGCTGTACACATCGATTCCCGGAAATGTAGAATATCATTCGAAACACATTGTTTAC 1637 Query 1647 AGTCGTAAAAGGCACCTCTTTCTGGTTGTCTTTGAGTTCAGTGGTGCTACAAATGAAGTT 1706 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 1638 AGTCGTAAAAGGCACCTCTTTCTGGTTGTCTTTGAGTTTAGTGGTGCTACGAATGAAGTT 1697 Query 1707 GTGCTTTACTGGGAAAATACAGGTTCCCAGCTGCCTAATAGCAAAGGAAGCACTGCTAAA 1766 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1698 GTGCTTTACTGGGAAAATACAGGTTCTCAGCTGCCTAATAGCAAAGGAAGCACTGCTAAA 1757 Query 1767 GGTTGTGATGCTGCCTTTATCGGCCCAAATGACGATCAATTTGCAATTCTTGACGAGGAT 1826 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1758 GGTTGTGATGCTGCCTTTATTGGCCCAAATGACGATCAATTTGCAATTCTTGACGAGGAT 1817 Query 1827 AAGACAGGACTGTCTATGTATATCCTCCCAAAACT-TACCACAATGGAAGAGAATGAGAA 1885 ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1818 AAGACAGGACTTTCTATGTATATCCTCCCAAAA-TATACCACAATGGAAGAGAATGAGAA 1876 Query 1886 GAATTTGTTATCTGAAGAAAACCAAAAGAAAGAGGCGGAT-CCTTCTGGAATTCAGGGTC 1944 |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || || ||||||||||||| Sbjct 1877 GAATTTATTATCTGAAGAGAACCAAAACAAAGAGGCAGATGCC-TCGGGAATTCAGGGTC 1935 Query 1945 CACAACAATTCATGTTTGAGACAGAAGTCGATCGTGTTTTTTCCACACCGATAGAGTCCA 2004 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1936 CACAACAATTCATGTTTGAGACAGAAGTCGATCGTGTTTTTTCCACACCGATAGAGTCCA 1995 Query 2005 CTCTGATGTTTGCTTGTAATGGAACCCAAATTGGGCTGGCAAAGTTGTTTCAAGGCTACC 2064 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1996 CTCTGATGTTTGCTTGTAATGGAACCCAAATTGGGCTGGCAAAGTTGTTTCAAGGCTACC 2055 Query 2065 GTCTCTCAGCTTCAGATGGTCATTATATTTCAACACAAGGTGAGGGACGAAAGTCAATCA 2124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2056 GTCTCTCAGCTTCAGATGGTCATTATATTTCAACACAAGGTGAGGGACGAAAGTCAATCA 2115 Query 2125 AGTTGAAGAAACATGAAATAGCTCTTCAG 2153 ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2116 AGTTGAAGAAACATGAAATAGCTCTTCAG 2144 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 198051609892 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5