BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G54670.3
Length=4308
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg323999 jgi|Araly1|323999|fgenesh1_pm.C_scaffold_5001543 3022 0.0
> Ahg323999 jgi|Araly1|323999|fgenesh1_pm.C_scaffold_5001543
Length=3774
Score = 3022 bits (1636), Expect = 0.0
Identities = 1771/1833 (97%), Gaps = 21/1833 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 336 ATGCCTGCGATACAATCCCCATCGGGGAAGATCTTGCAGCTTGAGATGGAGAATTTCAAA 395
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCTGCGATACAAACCCCATCGGGGAAGATCTTGCAGCTTGAGATGGAGAATTTCAAA 60
Query 396 TCTTACAAGGGTCATCAATTGGTTGGTCCTTTCAAGGATTTCACTGCTATTATTGGTCCC 455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TCTTACAAGGGTCATCAATTGGTTGGTCCTTTCAAGGATTTCACTGCTATTATTGGTCCC 120
Query 456 AACGGTTCTGGCAAATCTAACCTAATGGACGCTATTAGCTTCGTCCTCGGCGTTCGTACC 515
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||
Sbjct 121 AACGGTGCTGGCAAATCTAACCTAATGGACGCTATTAGCTTTGTGCTCGGTGTTCGTACC 180
Query 516 GGTCAACTTCGTGGTTCTCAGCTTAAGGATCTTATCTACGCTTTTGATGATCGTGACAAG 575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GGTCAACTTCGTGGTTCTCAGCTTAAGGATCTTATCTACGCTTTTGATGATCGTGACAAG 240
Query 576 GAACAGAGAGGTCGTAAAGCTTTTGTTCGACTCGTTTATCAGATGGACGATGGAGTAGAG 635
|||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 GAACAGAGAGGTCGGAGAGCGTTTGTTCGACTCGTTTATCAGATGGACGATGGAGTAGAG 300
Query 636 CTTCGTTTCACTCGTTCTATTACTAGCGCTGGTGGGAGTGAGTACCGTATTGATAATAGG 695
|||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 301 CTTCATTTCACACGTACTATTACTAGCGCTGGTGGGAGTGAGTACCGTATCGATAATAGG 360
Query 696 GTTGTGAATTTGGATGAGTACAATGGGAAGCTACGATCTCTTGGGATACTTGTTAAGGCT 755
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 361 GTTGTGAATTTGGATGAGTACAATGGGAAGCTACGATCTCTAGGGATACTTGTTAAGGCT 420
Query 756 CGTAATTTCTTGGTCTTTCAGGGTGATGTTGAATCTATTGCTTCGAAGAATCCAAAAGAA 815
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 CGTAATTTCTTGGTGTTTCAGGGTGATGTTGAATCTATTGCTTCGAAGAATCCAAAAGAA 480
Query 816 CTTACTGGACTCCTCGAGGAGATTTCTGGTTCCGAGGAGCTTAAGAAAGAGTATGAAGGA 875
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 481 CTTACTGGACTCCTCGAAGAGATTTCTGGGTCCGAGGAGCTTAAGAAAGAGTATGAAGAA 540
Query 876 CTAGAAGAAAAGAAGGCCAGCGCTGAAGAAAAAGCAGCTCTTATATACCagaagaagaaa 935
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CTAGAAGAAAAGAAGGCCAGTGCTGAAGAAAAAGCAGCTCTTATATACCAGAAGAAGAAA 600
Query 936 acaattggaaatgagaagaagctgaagaaagcacaaaaggaagaagctgagaagcatcta 995
|| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 ACCATTGGGAATGAGAAGAAGCTGAAGAAAGCACAGAAGGAAGAAGCTGAGAAGCATCTA 660
Query 996 aggctgcaggaagaaCTGAAAGCTCTGAAGAGAGAACGCTTCCTATGGCAATTATATAAC 1055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 661 AGGCTGCAGGAAGAACTGAAAGCTCTGAAGAGAGAACGCTTCCTATGGCAATTGTATAAC 720
Query 1056 ATTGAAAATGATATCGAGAAGGCGAATGAGGATGTTGATTCTGAAAAGAGCAATCGTAAA 1115
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 721 ATTGAAAATGATATCGAGAAGGCGACTGAGGATGTTGATGCTGAAAAGAGCAATCGTAAA 780
Query 1116 GATGTCATGAGAGAGCTGGAAAAGTTTGAACGTGAGGCAGGTAAGAGAAAGGTAGAGCAA 1175
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 781 GATGTCATGAGAGAGCTGGAAAAGTTTGAACGTGAGGCAGGTAAGAGAAAGGTAGAACAA 840
Query 1176 GCAAAGTATCTGAAAGAAATTGCTCAACGTGAGAAGAAGATTGCTGAGAAAAGCTCGAAG 1235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GCAAAGTATCTGAAAGAAATTGCTCAACGTGAGAAGAAGATTGCTGAGAAAAGCTCGAAG 900
Query 1236 CTTGG-AAAA-----A-T-T--C------A-----GCAACCTGAGCTTCTGAGATTTAAG 1274
||||| |||| | | | | | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 CTTGGAAAAATTGTGAGTATACCTTGGAAATCTGTGCAACCTGAGCTTCTGAGATTTAAG 960
Query 1275 GAGGAGATAGCTCGCATAAAAGCAAAAATTGAGACCAATAGAAAGGACGTGGATAAGAGG 1334
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 961 GAGGAGATAGCTCGCATAAAAGCAAAAATTGAGAGCAACAGAAAGGACGTGGATAAGAGG 1020
Query 1335 aaaaaagaaaaaGGGAAGCATTCCAAAGAAATTGAACAGATGCAGAAAAGCATTAAGGAG 1394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 1021 AAAAAAGAAAAAGGGAAGCATTCCAAAGAAATTGAACAGATGCAGGATAGCATTAAGGAG 1080
Query 1395 CTGAATAAGAAAATGGAATTATTTAATAAGAAGAGACAAGATAGCAGCGGAAAACTCCCA 1454
|||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 CTGAATAAGAAAATGGAATTATATAATGAGAAGAGACAAGATAGCAGCGGAAAACTCCCA 1140
Query 1455 ATGCTTGACAGTCAACTGCAAGATTATTTTCGACTAAAAGAAGAAGCTGGAATGAAAACC 1514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 ATGCTTGACAGTCAACTGCAAGATTATTTTCGACTAAAAGAAGAAGCTGGAATGAAAACC 1200
Query 1515 ATTAAGCTAAGAGATGAGCACGAGGTTCTAGAGAGGCAACGGCGTACCGATCTTGAAGCA 1574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1201 ATTAAGCTAAGAGATGAGCACGAGGTTCTAGAGAGGCAACGGCGTACTGATCTCGAAGCA 1260
Query 1575 TTGAGAAATCTGGAAGAAAATTACCAGCAACTAATAAATAGGAAGAATGATCTTGATGAA 1634
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 TTGAGAAATCTGGAAGAAAATTACCAGCAACTAATAAACAGGAAGAATGATCTTGATGAA 1320
Query 1635 CAAATTAAGCGATTTAAAGACAGGCAAGGAGAGATTGAAACATCTTCGTCGAAATATAAG 1694
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1321 CAAATTAAGCGATTTAAAGACAGGCAAGAAGAGATTGAAACATCTTCTTCGAAATATAAG 1380
Query 1695 AATGAAACAACTAGTCTGAAAACGGAGTTACGTGCACTGCAAGAGAAGCACGTAAATGCC 1754
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1381 AATGAAACAACTAGTCTGAAAAAGGAGTTACGTGCACTGCAAGAGAAGCATGTAAATGCC 1440
Query 1755 AGGGAGGCCTCTGCGAAGTTGAAGACTAGAATCGCGGAATTAGAAGACCAGTTAAGTGAT 1814
||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441 AGGAATGCCTCTGAGAAGTTGAAGACTAGAATCGCGGAATTAGAAGACCAGTTAAGTGAT 1500
Query 1815 TTAACGGCTGAAAGGTATGAAAATGAGAGAGATAGTAGGCTAACACAGGCTGTTGAGTCT 1874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 TTAACGGCTGAAAGGTATGAAAATGAGAGAGATAGTAGGCTAACACAGGCTGTTGAGTCT 1560
Query 1875 CTCAAGCGTCTATTTCAAGGAGTTCATGGTCGGATGACTGATCTTTGTCGGCCAAATCGG 1934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561 CTCAAGCGTCTATTTCAAGGAGTTCATGGTCGGATGACTGATCTTTGTCGGCCAAATCGG 1620
Query 1935 AAGAAGTATAACCTTGCTGTCACTGTTGCCATGGGAAGATTTATGGATGCAGTAGTTGTA 1994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 AAGAAGTATAACCTTGCTGTCACTGTTGCCATGGGAAGATTTATGGATGCAGTAGTTGTA 1680
Query 1995 GAAGATGAAAACACGGGAAAGGATTGCATCAAGTACTTGAAAGAGCAAAGGCTTCCTCCT 2054
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 GAAGATGAAAACACGGGAAAGGATTGCATCAAGTACTTGAAAGAGCAAAGGCTTCCTCCT 1740
Query 2055 ATGACATTTATTCCTCTTCAGTCAGTACGTGTCAAGCAAGTGTTTGAAAGATTGAGAAAT 2114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 ATGACATTTATTCCTCTTCAGTCAGTACGTGTCAAGCAAGTGTTTGAAAGATTGAGAAAT 1800
Query 2115 TTGGGTGGCACAGCAAAGCTGGTGTTCGATGTT 2147
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1801 TTGGGTGGCACAGCAAAGCTGGTGTTCGATGTT 1833
Score = 1781 bits (964), Expect = 0.0
Identities = 1000/1018 (98%), Gaps = 0/1018 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3038 AGAGTGCAAACAAAAGTCGGAGGAGTATGAGAAGGAAATCCTGGATTGGAAAAAGCAGGC 3097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2757 AGAGTGCAAACAAAAGTCGGAGGAGTATGAGAAGGAAATCCTGGATTGGAAAAAGCAGGC 2816
Query 3098 TTCTCAAGCGACAACAAGCATAACCAAGCTCAATCGTCAAATACATTCGAAGGAAACACA 3157
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2817 TTCTCAAGCGACAACTAGCATAACCAAGCTCAATCGTCAAATACATTCGAAGGAAACACA 2876
Query 3158 AATTGAGCAGCTGATCTCACAGAAACAGGAAATAACTGAGAAGTGTGAGCTCGAACATAT 3217
|||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2877 AATTGAGCAGCTGATCTCGCAGAAGCAGGAAATAACTGAGAAGTGTGAGCTCGAACATAT 2936
Query 3218 TACCCTTCCTGTCTTATCAGATGCTATGGAGGAAGATGATTCAGATGGGCCACAGTTTGA 3277
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2937 TACCCTTCCTGTTTTATCAGATGCTATGGAGGAAGATGACTCAGATGGGCCACAGTTTGA 2996
Query 3278 CTTTAGTGAGCTGGGTAGAGCTTATCTCCAAGAACGGAGACCATCTGCTCGTGAAAAAGT 3337
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2997 CTTTAGTGAGCTAGATAGAGCTTATCTCCAAGAACGGAGACCATCTGCTCGTGAAAAAGT 3056
Query 3338 GGAGGCAGAATTTAGGCAGAAAATAGAATCTAAAACATCCGAGATTGAAAGAACGGCTCC 3397
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3057 GGAGGCGGAATTTAGGCAGAAAATAGAATCTAAAACATCCGAGATTGAAAGAACGGCTCC 3116
Query 3398 AAATTTGAGAGCGCTTGACCAGTATGAGGCTATACAAGAGAAAGAAAAACAAGTTAGCCA 3457
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3117 AAATTTGAGAGCGCTTGACCAGTATGAGGCTATACAAGAGAAGGAAAAACAAGTTAGCCA 3176
Query 3458 GGAGTTTGAAGCGGCCAGGAAAGAGGAGAAGCAAGTAGCGGATGCCTTTAATACTGTTAA 3517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3177 GGAGTTTGAAGCGGCCAGGAAAGAGGAGAAGCAAGTAGCGGATGCCTTTAATACTGTTAA 3236
Query 3518 GCAGAAGAGGTATGAGCTATTTATGGAAGCTTTCAACCACATTGCTAGCAACATTGACAA 3577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3237 GCAGAAGAGGTATGAGCTATTTATGGAAGCTTTCAACCACATTGCTAGCAACATTGACAA 3296
Query 3578 GATCTATAAGCAACTAACCAAGAGTAATACGCACCCACTGGGTGGGACTGCTTATCTAAA 3637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3297 GATCTATAAGCAACTAACCAAGAGTAATACGCACCCACTGGGTGGGACTGCCTATCTAAA 3356
Query 3638 CCTAGAAAATGAGGATGATCCGTTTCTACATGGTATAAAGTATACTACAATGCCCCCAAC 3697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3357 CCTAGAAAATGAGGATGATCCGTTTCTACATGGTATAAAGTATACTACAATGCCCCCAAC 3416
Query 3698 AAAGCGATTTCGTGACATGGAACAGCTCTCTGGAGGAGAGAAAACAGTTGCGGCCTTGGC 3757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3417 AAAGCGATTTCGTGACATGGAACAGCTCTCTGGAGGAGAGAAAACAGTTGCGGCCTTGGC 3476
Query 3758 GTTGCTCTTCTCCATACATAGCTATAGGCCTTCACCCTTTTTCATACTTGATGAAGTGGA 3817
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3477 GTTGCTCTTCTCCATCCATAGCTATAGGCCTTCACCCTTTTTCATACTTGATGAAGTGGA 3536
Query 3818 TGCTGCGCTTGATAATCTAAACGTGGCAAAAGTTGCTAAATTCATTCGTAGCAAGTCATG 3877
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3537 TGCTGCGCTTGATAATTTAAACGTGGCAAAAGTTGCTAAATTCATACGTAGCAAGTCATG 3596
Query 3878 CCAAGCCGCACGTGACAATCAGGATGCAGAGGATGGGAATGGCTTCCAAAGCATTGTAAT 3937
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3597 CCAAGCGGCACGTGACAATCAGGATGCAGAGGATGGGAATGGCTTCCAAAGCATTGTAAT 3656
Query 3938 ATCTCTCAAGGACAGCTTCTATGACAAGGCGGAGGCTCTGGTTGGAGTTTACAGAGACAC 3997
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3657 ATCTCTCAAGGACAGCTTCTATGACAAGGCAGAAGCTCTGGTTGGAGTTTACAGAGACAC 3716
Query 3998 CGAGAGGAGTTGCTCAAGTACAATGTCATTTGACCTTAGGAACTACCAAGAATCGTGA 4055
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3717 TGAGAGGAGTTGCTCAAGTACAATGTCATTTGACCTTCGGAACTACCAAGAATCGTGA 3774
Score = 1410 bits (763), Expect = 0.0
Identities = 837/872 (96%), Gaps = 8/872 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2175 GTTTCTAAAATATATATTTTTGTCCTTAACTACTCCACGTTCGATCCTGAATTGGAGAAG 2234
||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1831 GTTTCTAAAGTATATGTTTTGGTCCTTAACTACTCCACGTTCGATCCTGAATTGGAGAAG 1890
Query 2235 GCGGTTCTCTATGCTGTTGGAAATACTCTTGTCTGCGACGAACTTGAAGAAGCCAAGGTT 2294
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1891 GCGGTCCTCTTTGCTGTTGGAAATACTCTTGTCTGCGACGAACTTGAAGAAGCCAAGGTT 1950
Query 2295 CTTAGCTGGAGCGGAGAGAGATTTAAAGTTGTGACTGTTGATGGTATATTACTCACAAAG 2354
|||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951 CTTAGCTGGACCGGAGAGAGACATAAAGTTGTGACTGTTGATGGTATATTACTCACAAAG 2010
Query 2355 GCGGGAACAATGACTGGTGGTACAAGTGGTGGAATGGAAGCAAAGTCTAATAAATGGGAT 2414
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2011 GCGGGAACAATGACTGGTGGTACCAGTGGTGGAATGGAAGCAAAGTCTAATAAATGGGAT 2070
Query 2415 GATAAGAAAATTGAAGGTTTGAAGAAAAATAAAGAAG-ATTTCGAACAACAACTAGAAAA 2473
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| | || | |||||
Sbjct 2071 GATAAGAAAATTGAAGGTTTGAAGAAAAAGAAAGAAGAACAT-GAACTAGAATTGGAAAA 2129
Query 2474 TATTGGATCTATTCGAGAAATGCAAATGAAAGAGTCTGAAATATCGGGTAAAATAAGTGG 2533
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2130 TATTGGATCTATTCGAGAAATGCAAATGAAGGAGTCTGAAATATCGGGTAAAATAAGTGG 2189
Query 2534 ACTTGaaaaaaaGATTCAGTATGCTGAAATTGAGAAGAAAAGTATCAAAGACAAACTTCC 2593
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2190 ACTTGAAAAAAAGATTCAGTATGCTGAAATTGAGAAGAAAAGCATCAAAGACAAACTTCC 2249
Query 2594 ACAGCTTGAGCAAGAGGAGCGGAATATCATTGAAGAAATTGATCGCATAAAACCTGAACT 2653
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2250 ACAGCTTGAGCAAGAGAAGCGGAATATCATTGAAGAAATTGATCGCATAAAGCCTGAACT 2309
Query 2654 CTCTAAGGCAA--G----AACTGAGGTCGATAAGAGAAAGACAGAAATGAATAAGTTGGA 2707
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2310 CTCTAAGGCAATTGCAAAAACTGAGGTCGATAAGAGAAAGACAGAAATGAATAAGTTGGA 2369
Query 2708 GAAAAGAATGAATGAGATCGTGGACCGTATCTATAAGGATTTTAGCCAGTCTGTTGGGGT 2767
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2370 GAAAAGAATGAATGAGATTGTGGACCGTATCTATAAGGATTTTAGCCAGTCTGTTGGGGT 2429
Query 2768 TCCAAACATACGTGTATATGAAGAAACTCAGCTCAAGACTGCTGAAAAGGAGGCTGAAGA 2827
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2430 TCCAAACATACGTGTATATGAAGAAACTCAGCTGAAGACTGCTGAAAAGGAGGCTGAAGA 2489
Query 2828 AAGGCTGGAACTGAGTAACCAGCTTGCTAAGTTAAAATACCAGCTGGAATATGAGCAAAA 2887
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2490 AAGGCTGGAACTGAGTAATCAGCTTGCTAAGTTAAAATACCAGCTGGAATATGAGCAAAA 2549
Query 2888 CCGTGATGTGGGGTCACGGATTCGAAAGATAGAGTCTTCTATCAGTTCTCTGGAAACTGA 2947
||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2550 CCGAGATGTGGGGTCACGGATTCGAAAGCTAGAGTCTTCTATCAGTTCTCTGGAAACTGA 2609
Query 2948 TTTGGAAGGTATACAGAAGACAATGTCTGAACGTAAGGAGACAGCGGTAAAAATAACTAA 3007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2610 TTTGGAAGGTATACAGAAGACAATGTCTGAACGTAAGGAGACAGCAGTAAAAATTACTAA 2669
Query 3008 TGAAATCAACAATTGGAAGAAGGAAATGGAAG 3039
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2670 TGAAATCAACAATTGGAAGAAGGAAATGGAAG 2701
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 162924470013
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5