BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT3G55410.1 Length=3494 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg485968 jgi|Araly1|485968|fgenesh2_kg.5__1960__AT3G55410.1 5722 0.0 Ahg940181 jgi|Araly1|940181|scaffold_600725.1 243 9e-63 > Ahg485968 jgi|Araly1|485968|fgenesh2_kg.5__1960__AT3G55410.1 Length=3404 Score = 5722 bits (3098), Expect = 0.0 Identities = 3308/3410 (97%), Gaps = 12/3410 (0%) Strand=Plus/Plus Query 55 AGTGTAGAACGACGATTGTTGAATGCGTTATTGTAATTGTTAAGAATTGAAGTTAAAGTG 114 |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1 AGTGGAGAAAGACGATTGTTGAATGCGTTATTGTAATTGTTAAGTATTGAAGTTAAAGCA 60 Query 115 TTGTTTTTGAATCTGGTGAAATGGTGTGGTTTCGTGCTGGTTCCAGTGTTACAAAGCTAG 174 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| Sbjct 61 TTGTTTTTGAATCTGGTGAAATGGTGTGGTTTCGAGCTGGTTCGAGTGTTACAAAGCTAG 120 Query 175 CTGTTAGAAGGATTTTGAATCAGGGTGCTTCGTATGCGACGAGGACACGGTCTATTCCGT 234 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 121 CTGTTAGAAGGATTTTGAATCAGGGTGGTTCGTATGCGACGAGGACACGGTCTCTTCCGT 180 Query 235 CTCAAACTCGTTCCTTTCACTCGACTATATGCAGACCAAAGGCTCAGAGTGCTCCAGTTC 294 |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 181 CTCAAACTCGTTCCTTTCACTCGACTATTTACAGACCAAAGGCTCAGAGTGCTCCTGTTC 240 Query 295 CTAGAGCTGTTCCTCTTTCTAAGCTAACTGATAGTTTCTTAGATGGGACGAGCAGTGTCT 354 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 241 CTAGAGCTGTACCTCTTTCTAAGCTAACTGATAGTTTCTTAGATGGGACGAGCAGTGTTT 300 Query 355 ACCTTGAGGAGTTACAAAGGGCTTGGGAAGCTGATCCTAACAGTGTAGATGAGTCTTGGG 414 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 ATCTTGAGGAGTTACAAAGGGCTTGGGAAGCTGATCCTAACAGTGTAGATGAGTCTTGGG 360 Query 415 ATAATTTCTTTAGGAACTTTGTTGGTCAGGCTGCCACGTCTCCTGGCATCTCTGGGCAGA 474 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 361 ATAATTTCTTTAGGAACTTTGTCGGTCAGGCTGCCACGTCTCCTGGCATTTCTGGGCAGA 420 Query 475 CAATTCAGGAGAGTATGAGGCTGTTGTTACTTGTTAGGGCTTATCAGGTGAATGGTCACA 534 |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 CAATTCAGGAGAGTATGAGGCTGTTGCTACTTGTCAGGGCTTATCAGGTGAATGGTCACA 480 Query 535 TGAAAGCGAAGTTGGATCCGTTAGGTTTGGAACAGCGAGAGATCCCTGAGGATCTTGACT 594 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 481 TGAAAGCAAAGTTGGATCCGTTAGGTTTGGAACAGCGAGAGATCCCTGAGGATCTTGACT 540 Query 595 TGGCTCTTTATGGATTCACTGAGGCTGACCTTGACAGAGAGTTCTTCTTGGGGGTGTGGC 654 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 541 TGGCTCTTTATGGATTCACTGAGGCTGATCTTGACAGAGAGTTCTTCTTGGGAGTGTGGC 600 Query 655 AGATGTCAGGATTCATGTCTGAGAACCGACCAGTGCAGACCCTTCGTTCCATATTGACAA 714 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 AGATGTCAGGATTCATGTCTGAGAACCGACCAGTGCAGACCCTTCGTTCCATATTGACAA 660 Query 715 GGCTCGAACAGGCATACTGTGGGAATATCGGATTTGAGTATATGCACATTGCAGATCGAG 774 |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 661 GGCTTGAACAGGCATACTGTGGGAATATTGGGTTTGAGTATATGCACATTGCAGATCGGG 720 Query 775 ATAAATGTAACTGGTTGAGAGAAAAGATTGAGACACCAACTCCTTGGCGGTACAACAGGG 834 |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 721 ATAAATGTAATTGGTTGAGAGAAAAGATTGAAACACCAACTCCTTGGCAGTACAACAGGG 780 Query 835 AGCGCCGTGAGGTGATTCTCGATCGGCTTGCATGGAGTACTCAGTTCGAGAATTTCTTAG 894 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 781 AGCGCCGTGAGGTGATTCTCGATCGGCTTGCATGGAGTACTCAGTTTGAGAATTTCTTAG 840 Query 895 CTACCAAGTGGACAACAGCCAAAAGATTTGGACTTGAGGGAGGAGAATCATTAATTCCTG 954 ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 CTACCAAGTGGACAACAGCTAAGAGATTTGGACTTGAGGGAGGAGAATCATTAATTCCTG 900 Query 955 GAATGAAGGAGATGTTTGACAGAGCAGCAGATCTTGGAGTAGAGAGTATTGTTATTGGAA 1014 | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 GTATGAAGGAGATGTTTGACAGGGCCGCAGACCTTGGAGTAGAGAGTATTGTTATTGGAA 960 Query 1015 TGTCTCACAGAGGAAGATTGAATGTTCTGGGTAATGTTGTTCGGAAGCCACTCCGTCAGA 1074 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 961 TGTCTCACAGAGGAAGATTGAATGTTCTGGGTAATGTTGTTCGGAAGCCACTCCGTCAGA 1020 Query 1075 TATTTAGTGAGTTCAGTGGTGGTATTAGGCCTGTAGATGAAGTTGGCTACACTGGAACTG 1134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1021 TATTTAGTGAGTTCAGTGGTGGTATTAGGCCTGTAGATGAAGTTGGCTACACTGGAACTG 1080 Query 1135 GTGATGTCAAATATCACTTGGGAACCTCTTATGATCGACCTACAAGAGGTGGGAAGAAAA 1194 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1081 GTGATGTCAAATATCACTTGGGAACCTCTTATGATCGACCTACAAGAGGTGGGAAGAAAA 1140 Query 1195 TCCATCTCTCTTTGGTTGCTAATCCAAGTCACTTGGAAGCTGCAGATTCTGTTGTTGTTG 1254 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 TCCATCTCTCTTTGGTTGCTAATCCAAGTCACTTGGAAGCTGCAGATTCTGTTGTTGTTG 1200 Query 1255 GCAAAACCAGAGCAAAACAGTACTACTCCAATGATTTAGACAGGACCAAAAATTTAGGTA 1314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1201 GCAAAACCAGAGCAAAACAGTACTACTCCAATGATTTAGACAGGACCAAAAATTTAGGTA 1260 Query 1315 TTTTGATTCACGGAGATGGTAGTTTTGCTGGACAAGGGGTAGTCTATGAAACTCTCCATC 1374 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| Sbjct 1261 TTTTGATTCATGGAGATGGTAGTTTTGCTGGACAAGGGGTAGTTTACGAAACTCTGCATC 1320 Query 1375 TTAGTGCTCTTCCAAACTACACCACCGGAGGAACCATACATATTGTGGTGAACAACCAAG 1434 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 TTAGTGCTCTTCCAAACTACACCACCGGGGGAACCATACATATTGTGGTGAACAACCAAG 1380 Query 1435 TGGCTTTCACGACAGATCCAAGGGCGGGGAGATCTTCCCAGTATTGTACTGATGTTGCAA 1494 ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | Sbjct 1381 TGGCTTTTACTACAGACCCAAGGGCTGGGAGATCTTCCCAGTATTGTACGGATGTTGCTA 1440 Query 1495 AGGCTTTGAGTGCTCCCATCTTTCATGTTAATGGGGATGATGTTGAGGCTGTTGTTCATG 1554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1441 AGGCTTTGAGTGCTCCCATCTTTCATGTTAATGGGGATGATGTTGAGGCTGTTGTTCATG 1500 Query 1555 CCTGCGAGCTTGCTGCTGAGTGGCGTCAGACTTTTCATTCTGATGTTGTCGTTGATTTGG 1614 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 CCTGCGAGCTTGCTGCTGAGTGGCGTCAGACTTTTCATTCTGATGTTGTCGTTGATTTGG 1560 Query 1615 TTTGCTACCGTAGGTTCGGGCATAATGAGATAGATGAACCATCTTTCACTCAGCCAAAAA 1674 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1561 TTTGCTACCGTAGGTTCGGGCATAATGAGATAGATGAACCATCCTTCACTCAGCCAAAAA 1620 Query 1675 TGTACAAGGTTATCAAAAATCATCCTTCAACCCTTCAGATCTACCACAAAAAGCTCTTGG 1734 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1621 TGTACAAGGTTATCAAAAATCATCCTTCAACCCTTCAGATCTACCACAAAAAGCTCTTGG 1680 Query 1735 AATGCGGTGAAGTATCACAACAGGATATTGACCGGATACAGGAAAAGGTTAACACCATCC 1794 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1681 AATGCGGTGAAGTATCACAACAGGATATCGACCGGATACAGGAAAAGGTTAACACCATCC 1740 Query 1795 TCAATGAAGAATTTGTCGCTAGTAAGGACTATCTCCCTAAGAAACGAGATTGGCTTTCAA 1854 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1741 TCAATGAAGAATTTGTCGCTAGTAAAGACTATCTCCCTAAGAAACGAGATTGGCTTTCAA 1800 Query 1855 CCAATTGGGCTGGATTTAAGTCTCCTGAGCAGATCTCACGTGTTAGAAACACTGGCGTCA 1914 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1801 CCAATTGGGCTGGATTTAAGTCTCCTGAACAGATCTCACGTGTTAGAAACACTGGCGTCA 1860 Query 1915 AACCAGAGATACTGAAGACTGTTGGCAAGGCAATTTCATCTCTTCCAGAAAACTTCAAGC 1974 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1861 AACCAGAGATACTTAAGACTGTTGGCAAGGCAATTTCATCGCTTCCAGAAAACTTCAAGC 1920 Query 1975 CACACAGGGCAGTGAAGAAAGTTTATGAACAACGTGCCCAAATGATTGAATCAGGAGAGG 2034 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1921 CACACAGGGCAGTGAAGAAAGTTTATGAACAACGTGCCCAAATGATTGAATCAGGAGAAG 1980 Query 2035 GAGTTGACTGGGCCCTTGCAGAAGCTCTTGCTTTTGCTACCTTAGTTGTGGAAGGCAATC 2094 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1981 GAGTTGACTGGGCTCTTGCAGAAGCTCTTGCTTTTGCTACCTTAGTTGTGGAAGGCAATC 2040 Query 2095 ATGTCCGATTGAGTGGTCAGGATGTCGAACGAGGAACATTTAGTCATCGTCATTCTGTCC 2154 ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2041 ATGTCCGGTTGAGTGGTCAAGATGTCGAACGAGGAACATTTAGTCATCGTCATTCTGTCC 2100 Query 2155 TTCATGACCAGGAAACTGGAGAAGAGTATTGTCCTCTAGATCATCTCATCATGAATCAGG 2214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2101 TTCATGACCAGGAAACTGGAGAAGAGTATTGTCCTCTAGATCATCTCATCATGAATCAGG 2160 Query 2215 ATCCTGAGATGTTTACTGTTAGCAACAGTTCTCTTTCAGAATTTGGTGTCCTTGGGTTCG 2274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2161 ATCCTGAGATGTTTACTGTTAGCAACAGTTCTCTTTCAGAATTTGGTGTCCTTGGGTTCG 2220 Query 2275 AATTGGGTTACTCCATGGAAAGCCCGAACTCGTTGGTACTATGGGAAGCTCAGTTTGGAG 2334 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2221 AATTGGGTTACTCCATGGAAAGCCCAAACTCGTTGGTATTATGGGAAGCTCAGTTTGGAG 2280 Query 2335 ACTTCGCCAATGGAGCTCAGGTGATATTTGATCAGTTCATCAGCAGTGGAGAAGCCAAAT 2394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2281 ACTTCGCCAATGGAGCTCAGGTGATATTTGATCAGTTCATCAGCAGTGGAGAAGCCAAAT 2340 Query 2395 GGCTGCGTCAAACCGGGCTTGTTATGCTACTTCCCCATGGTTATGATGGTCAGGGACCTG 2454 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2341 GGCTGCGTCAAACCGGGCTTGTTATGCTACTTCCCCATGGTTATGATGGTCAGGGCCCTG 2400 Query 2455 AACATTCAAGTGCGAGGTTGGAACGTTACCTTCAGATGAGTGATGATAATCCCTATGTCA 2514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2401 AACATTCAAGTGCGAGGTTGGAACGTTACCTTCAGATGAGTGATGATAATCCCTATGTCA 2460 Query 2515 TACCAGACATGGAACCAACAATGCGAAAGCAAATTCAAGAATGTAATTGGCAGATTGTCA 2574 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2461 TACCAGACATGGAACCAACGATGCGAAAGCAAATTCAAGAATGTAATTGGCAGATTGTCA 2520 Query 2575 ATGCCACAACTCCCGCCAACTATTTCCATGTTCTGCGGCGACAGATACACAGAGACTTCC 2634 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2521 ATGCCACAACTCCTGCCAACTATTTCCATGTTCTGCGGCGACAGATACACAGAGACTTCC 2580 Query 2635 GTAAGCCTCTGATTGTAATGGCACCAAAGAACTTGCTCCGTCACAAGGACTGCAAATCAA 2694 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 2581 GTAAGCCTCTGATTGTAATGGCACCAAAGAACTTGCTTCGTCACAAGGATTGCAAATCAA 2640 Query 2695 ATCTCTCAGAGTTTGATGATGTCCAAGGCCACCCAGGTTTTGACAAGCAAGGAACTAGAT 2754 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2641 ATCTCTCAGAGTTTGATGATGTCCAAGGCCACCCAGGTTTTGACAAGCAAGGAACTAGAT 2700 Query 2755 TTAAGCGATTAATCAAGGATCAGAATGATCACTCTGATCTTGAAGAAGGCATCAGAAGAT 2814 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2701 TTAAGCGATTAATCAAGGATCAGAATGATCACTCTGATCTTGAAGAAGGCATCAGAAGAT 2760 Query 2815 TGGTACTTTGCTCCGGAAAGGTCTATTATGAGCTTGATGATGAACGGAAGAAGGTTGGCG 2874 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2761 TGGTACTTTGCTCCGGAAAGGTCTATTATGAGCTTGATGATGAGCGGAAGAAGGTTGGCG 2820 Query 2875 CAACAGATGTTGCTATCTGTAGAGTTGAACAGCTTTGTCCTTTCCCATATGATCTCATTC 2934 |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2821 CAACCGATGTTGCTATCTGTAGAGTGGAACAGCTTTGTCCTTTCCCATATGATCTCATTC 2880 Query 2935 AGCGTGAGCTCAAGAGATATCCAAATGCGGAGATCGTTTGGTGCCAAGAAGAGGCGATGA 2994 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2881 AGCGTGAGCTCAAGAGATATCCAAATGCGGAGATCGTTTGGTGCCAAGAAGAGGCTATGA 2940 Query 2995 ACATGGGAGCATTCAGCTACATATCTCCACGGCTATGGACAGCAATGAGAAGCGTAAACA 3054 ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2941 ACATGGGAGCATTCAGCTACATATCGCCGCGGCTATGGACAGCAATGAGAAGCTTAAACA 3000 Query 3055 GAGGAGATATGGAAGACATTAAGTATGTTGGTCGTGGTCCTTCTGCTGCAACTGCCAC-G 3113 | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3001 GGGGAGATATGGAAGACATTAAGTACGTTGGCCGTGGTCCTTCTGCTGCAACTGCCACCG 3060 Query 3114 GGTTTCTATACTTTCCATGTCAAAGAGCAAGCCGGGCTTGTCCAGAAAGCCATCGGAAAG 3173 |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3061 GGTT-CTACACTTTCCATGTCAAAGAGCAAGCTGAGCTTGTCCAGAAAGCCATAGGAAAG 3119 Query 3174 GAACCCATCAATTAAAAACTCTTCCTTTTTAAATGACTTCTCAGACTGATAAG-AGAAAA 3232 || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||| | |||| Sbjct 3120 GAGCCCATCAATTAAAA-CTCTTCCTTTTTAAATGAATTCTCAGACCGAAAAGGAAAAAA 3178 Query 3233 AGGAGAAAACTTTGAAATAAGAACTTTGGGTGATGCAAAAGTGCTAAACAACACTGTCAA 3292 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3179 AGGAGAAAACTTTGAAATAAGAACTTTGGGTGATGCAAAAGTGCTAAACAACACTGACAA 3238 Query 3293 AATCCGCTGTTTCTTTG--ATAtttttttGGTCCCATTGATTTTGAGCCTGGCTCGTGTT 3350 ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct 3239 AATCCTCTGTTTCTTTGTTATATTTTTTTGGTCCCATTGATTTTGAGCCTGCCTAGTGTT 3298 Query 3351 GCCAG-TCAAAACATTaaaaaaaaaTCTTATATTGATATACAGTTTTGTTATTGCTCTTC 3409 || || ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3299 GC-AGGTCAAAACAT-AAAAAAAAATCTCATATTGATACACAGTTTTGTTATTGCTCTTC 3356 Query 3410 tttttttCTTCTTTGA-ATCATCTTTTGCGTTGTCATTGTCTTTTCCCTT 3458 |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3357 TTTTTT-CTTCTTTGATA-CATCTTTTGCGTTGTCATTGTCTTTTTCCTT 3404 > Ahg940181 jgi|Araly1|940181|scaffold_600725.1 Length=231 Score = 243 bits (131), Expect = 9e-63 Identities = 193/219 (88%), Gaps = 19/219 (9%) Strand=Plus/Plus Query 2854 ATGAACGGAAGAAGGTTGGCGCAACAGATGTTGCTATCTGTAGAGTTGAACAGCTTTGTC 2913 |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| Sbjct 31 ATGAGCGGAAGAAGGTTGGCGCAAGGGATGTTGCTATTTGTAGAGTGGAGCAGCTTTGTC 90 Query 2914 CTTTCCCATATGATCTCATTCAGCGTGAGCTCAAGAGATATCCAAATGCGGAGATCGTTT 2973 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | Sbjct 91 CTTTCCCATATGATCTCATTCAGCGTGAGCTCAAGAGATATCCAA-TGCC-A-A--G--- 142 Query 2974 GGTGCCAAGAAGAGGCGATGAACATGGGAGCATTCAGCTACATATCTCCACGGCTATGGA 3033 |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 143 ------AAGA-GA--CGATGAACATGGGAGCATTCAGCTACATATCTCCACGGCTATGGA 193 Query 3034 CAGCAATGAGAAGC-GTAAACAGAGGAGATATGGAAGAC 3071 |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| Sbjct 194 CAGCAATGAGAAGCTG-AAACAGAGGAGATATGGAAGAC 231 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 131945605591 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5