BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT3G59140.1
Length=4461
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg486382 jgi|Araly1|486382|fgenesh2_kg.5__2374__AT3G59140.1 4604 0.0
> Ahg486382 jgi|Araly1|486382|fgenesh2_kg.5__2374__AT3G59140.1
Length=4334
Score = 4604 bits (2493), Expect = 0.0
Identities = 2734/2854 (96%), Gaps = 2/2854 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1515 AAAGGCTTATAATGCGGTTCTGTTCTGGTCATCACCGGTGTTTGTCTCTGCTGCAACTTT 1574
||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1482 AAAGGCTTACAATGCGGTTCTGTTTTGGTCATCACCTGTGTTTGTCTCTGCTGCAACTTT 1541
Query 1575 TGCCACTTGTTATTTCCTAGACATTCCATTGAGAGCAAGTAACGTTTTCACTTTTGTGGC 1634
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1542 TGCCACTTGTTATTTCCTAGGCATTCCATTGAGAGCAAGTAATGTTTTTACTTTTGTGGC 1601
Query 1635 AACCCTGCGTCTGGTCCAAGATCCAGTAAGAATGATCCCTGATGTTATTGGAGTGACAAT 1694
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1602 AACACTACGTCTGGTCCAAGATCCAGTAAGAATGATCCCTGATGTGATTGGAGTGACAAT 1661
Query 1695 TCAGGCTAAAGTTGCCTTCAGTCGTATTGCAACATTTCTAGAAGCTCCTGAGCTTCAAGG 1754
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1662 TCAGGCTAAAGTTGCCTTCAGTCGTATTTCAACATTTCTAGAAGCTCCTGAGCTTCAAGG 1721
Query 1755 TGGGGAGAGGCGGAGAAAGCAGAGATCCGAAGGCAATCAGAACGCGATTATTATTAAATC 1814
||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1722 TGGGGAGAGGCGGAGAAAGCAGAGATCAGAAGGCGATCAGAACGCGATTGTTATTAAATC 1781
Query 1815 TGCTAGCTTTTCTTGGGAGGAGAAAGGTTCAACAAAACCAAACTTGAGAAATGTGAGTCT 1874
||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1782 TGCGAGCTTTTCTTGGGAGGAGAAGGGTTCAACAAAACCAAACTTGAGAAATGTGAGTCT 1841
Query 1875 TGAGGTTAAGTTTGGTGAGAAAGTGGCTGTTTGTGGTGAGGTTGGCTCTGGCAAGTCAAC 1934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 1842 TGAGGTTAAGTTTGGTGAGAAAGTGGCTGTTTGTGGTGAAGTTGGCTCTGGCAAATCAAC 1901
Query 1935 ACTTTTAGCTGCCATTCTCGGTGAAACTCCATGTGTCTCAGGAACAATCGATTTTTATGG 1994
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1902 ACTATTAGCTGCCATTCTCGGTGAAACTCCATGTGTCTCAGGAACAATCGATTTTTATGG 1961
Query 1995 TACCATAGCCTATGTTTCTCAAACAGCATGGATCCAAACGGGGACAATAAGAGATAACAT 2054
|||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1962 TACCATCGCCTATGTATCCCAAACAGCCTGGATCCAAACAGGGACAATAAGAGATAACAT 2021
Query 2055 CCTCTTTGGAGGTGTGATGGATGAACACCGTTACCGTGAGACAATTCAAAAATCTAGCCT 2114
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2022 ACTCTTTGGAGGTGTGATGGATGAACAACGTTACCGTGAGACAATTCAAAAGTCTAGCCT 2081
Query 2115 AGACAAAGATCTTGAGCTCTTACCTGATGGAGACCAGACTGAGATTGGTGAAAGAGGTGT 2174
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2082 AGACAAAGATCTTGAGCTCTTGCCTGATGGAGACCAGACTGAGATTGGTGAAAGAGGTGT 2141
Query 2175 AAATCTAAGTGGAGGACAGAAACAGAGGATTCAACTCGCTCGTGCGCTATACCAAGATGC 2234
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2142 AAATCTTAGTGGAGGACAGAAACAGAGGATTCAACTCGCTCGTGCGCTATACCAAGATGC 2201
Query 2235 AGACATTTATCTCCTTGATGATCCATTTAGTGCTGTTGATGCACACACTGCTTCAAGTCT 2294
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2202 AGATATTTATCTCCTTGATGATCCATTCAGTGCTGTTGATGCACACACTGCTTCAAGTTT 2261
Query 2295 GTTCCAAGAATATGTTATGGATGCTCTCGCGGGAAAAGCTGTGTTGTTGGTTACACATCA 2354
|||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2262 GTTCCAAGAATACGTTATGGGCGCTCTCGCAGGAAAAGCTGTGTTGTTGGTTACACATCA 2321
Query 2355 AGTGGATTTCTTGCCTGCTTTTGATTCTGTTTTGTTGATGTCAGATGGAGAAATCACTGA 2414
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2322 AGTGGATTTCTTGCCTGCTTTTGATTCTGTCTTGTTGATGTCAGATGGAGAAATCACTGA 2381
Query 2415 AGCTGATACATACCAAGAACTCCTAGCTAGAAGCAGAGACTTTCAAGATCTAGTGAACGC 2474
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2382 AGCCGATACATATCAAGAACTCCTAGCTAGAAGCAGAGACTTTCAAGATCTCGTGAACGC 2441
Query 2475 TCACAGAGAAACCGCTGGTTCAGAAAGAGTGGTTGCGGTAGAAAACCCCACCAAACCGGT 2534
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 2442 TCACAGAGAAACCGCTGGATCAGAAAGAGTGTTTGCGGTAGACCACCCCAGCAAACCGGT 2501
Query 2535 GAAGGAAATCAACAGAGTCATTTCATCTCAATCCAAGGTCTTGAAACCGAGTCGTTTGAT 2594
|||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2502 CAAGGAAATCAACAGAGTCCTTTCGTCCCAATCCAAGGTCTTGAAACCGAGTCGTTTGAT 2561
Query 2595 CAAACAGGAAGAGCGAGAGAAGGGAGACACGGGATTGAGACCGTACATACAGTACATGAA 2654
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2562 CAAACAGGAAGAGCGAGAGAAGGGAGACACGGGGTTGAGACCGTACATACAGTACATGAA 2621
Query 2655 TCAGAACAAAGGTTACATATTCTTCTTCATCGCGAGCTTAGCTCAGGTCACATTTGCAGT 2714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |
Sbjct 2622 TCAGAACAAAGGTTACATATTCTTCTTCATCGCGAGCCTAGCTCAGGTCATGTTTGCAAT 2681
Query 2715 TGGACAGATTCTTCAGAACTCTTGGATGGCTGCAAACGTAGATAACCCTCAAGTTAGCAC 2774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2682 TGGACAGATTCTTCAGAACTCTTGGATGGCTGCAAACGTAGATAACCCTCAAGTTAGCAC 2741
Query 2775 TTTGAAGTTGATCTTGGTCTACTTACTGATTGGATTGTGCTCAGTTCTCTGCTTGATGGT 2834
|||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2742 TTTGAAGTTGATATTGGTCTACTTGTTGATTGGGTTGTCCTCAGTTCTCTGCTTGATGGT 2801
Query 2835 TAGATCTGTCTGTGTCGTGATTATGTGCATGAAGTCATCAGCTTCATTGTTTTCTCAGCT 2894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2802 TAGATCTGTCTGTGTCGTGATTATGTGCATGAAGTCATCAGCTTCATTGTTTTCTCAGCT 2861
Query 2895 TCTTAACTCTCTTTTTAGAGCACCTATGTCATTTTATGACTCCACACCTCTTGGACGGAT 2954
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 2862 TCTTAACTCTCTTTTTAGAGCGCCTATGTCATTTTATGACTCGACACCTCTTGGAAGGAT 2921
Query 2955 TCTTAGCAGGGTCTCATCTGACTTGAGCATTGTAGACCTTGACGTTCCTTTTGGTCTGAT 3014
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2922 TCTTAGCAGGGTCTCATCTGACTTGAGCATTGTAGATCTTGACGTTCCTTTCGGTCTGAT 2981
Query 3015 CTTTGTGGTTGCGTCTTCGGTAAACACAGGTTGTAGTCTTGGAGTGTTAGCTATTGTTAC 3074
||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2982 CTTTGTGGTGGCGTCTACGGTAAACACAGGTTGCAGTCTTGGAGTGTTAGCTATTGTTAC 3041
Query 3075 TTGGCAAGTCTTGTTTGTATCTGTTCCCATGGTTTATCTAGCTTTTCGTTTACAGAAGTA 3134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3042 TTGGCAAGTCTTGTTTGTATCTGTTCCCATGGTTTATCTAGCTTTTCGTTTACAGAAGTA 3101
Query 3135 CTACTTCCAAACAGCTAAAGAGTTGATGCGGATCAATGGCACGACAAGATCTTATGTGGC 3194
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3102 CTACTTCCAAACAGCGAAAGAGTTGATGCGGATCAATGGCACAACAAGATCTTATGTGGC 3161
Query 3195 GAATCATTTAGCAGAATCAGTAGCAGGAGCAATAACAATAAGAGCATTTGATGAAGAAGA 3254
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3162 GAATCATTTAGCAGAATCAGTAGCAGGAGCAATAACAATAAGGGCATTTGATGAAGAAGA 3221
Query 3255 GAGGTTTTTCAAGAAAAGTCTCACACTCATTGATACAAACGCCAGTCCTTTCTTTCATAG 3314
||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3222 GAGGTTTTTTAAGAAAAGTCTTACACTCATTGATACAAACGCCAGTCCTTTCTTCCATAG 3281
Query 3315 CTTTGCAGCGAACGAATGGCTGATCCAGCGGCTTGAAACCGTTAGCGCCATTGTTCTCGC 3374
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 3282 CTTTGCAGCTAATGAATGGCTGATCCAGCGGCTTGAAACCGTCAGCGCCATTGTTCTTGC 3341
Query 3375 CTCCACTGCTTTCTGCATGATTTTGCTTCCC-ACAGGAACATTTAGCTCTGGGTTCATCG 3433
||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3342 CTCCACTGCTTTCTGCATGGTTTTGC-TCCCTACAGGAACATTTAGCTCTGGGTTCATCG 3400
Query 3434 GTATGGCGCTATCTTATGGTTTATCTTTGAATATGGGACTTGTTTACTCTGTTCAGAACC 3493
|||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3401 GTATGGCGCTATCTTACGGTTTATCATTAAACCTGGGACTTGTTTACTCTGTACAGAACC 3460
Query 3494 AATGTTACTTAGCTAACTGGATCATTTCGGTTGAGAGACTTAATCAGTACACACATTTAA 3553
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3461 AATGCTACTTAGCTAACTGGATCATTTCGGTTGAAAGACTTAATCAGTACACACATTTAA 3520
Query 3554 CACCTGAGGCTCCTGAAGTAATAGAAGAGACTCGACCACCGGTTAATTGGCCGGTCACAG 3613
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3521 CACCTGAGGCTCCTGAAGTAATAGAAGAGACCCGACCACCGGTTAATTGGCCGGTTACAG 3580
Query 3614 GTCGAGTCGAAATCTCGGATTTGCAGATAAGATACAGAAGAGAATCCCCACTGGTTCTAA 3673
| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3581 GCCGTGTCGAAATCTCTGATTTGCAGATAAGATACAGAAGAGAATCCCCATTGGTTCTAA 3640
Query 3674 AAGGAATCAGCTGCACATTTGAAGGAGGACACAAGATTGGAATTGTTGGCCGAACCGGTA 3733
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3641 AAGGAATCAGCTGCACATTTGAAGGAGGACACAAGATTGGAATTGTTGGCCGGACCGGTA 3700
Query 3734 GTGGGAAGACAACTCTGATCAGTGCTCTGTTCAGACTTGTTGAGCCTGTTGGAGGAAAGA 3793
|||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3701 GTGGAAAGACAACTCTGATCAGTGCTTTGTTCAGACTTGTAGAGCCTGTTGGAGGAAAGA 3760
Query 3794 TTGTCGTTGACGGTGTTGACATCTCCAAAATTGGAGTTCATGATCTGAGATCAAGGTTTG 3853
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3761 TTGTCGTTGACGGTGTTGACATCTCCAAGATTGGAGTTCATGATCTGAGATCAAGATTTG 3820
Query 3854 GGATTATACCTCAAGATCCAACTCTCTTCAATGGAACAGTGAGATTTAATCTGGATCCTT 3913
|||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3821 GGATTATACCACAGGATCCAACTCTGTTCAATGGAACAGTGAGATTTAATCTGGATCCTT 3880
Query 3914 TGTGTCAGCATTCAGATGCTGAGATTTGGGAGGTTCTTGGCAAGTGTCAACTAAAAGAAG 3973
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3881 TGTGTCAGCATTCAGATGCTGAGATTTGGGAGGTTCTTGGCAAGTGTCAACTAAAAGAAG 3940
Query 3974 TGGTTCAAGAAAAAGAGAACGGCTTAGATTCATTAGTTGTGGAGGATGGATCAAATTGGA 4033
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3941 TGGTTCAAGAAAAAGAGAACGGCTTAGACTCATTAGTTGTGGAGGATGGATCAAATTGGA 4000
Query 4034 GCATGGGACAGAGACAGTTGTTCTGTTTAGGCAGAGCAGTTTTGAGAAGAAGCAGAGTAT 4093
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4001 GCATGGGACAGAGACAGTTGTTCTGTTTAGGCAGGGCAGTTTTGAGAAGAAGCAGAGTAT 4060
Query 4094 TAGTCCTGGACGAAGCCACGGCATCGATAGATAATGCAACAGATTTGATACTTCAGAAAA 4153
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4061 TAGTCCTCGACGAAGCCACGGCATCGATAGATAATGCAACAGATTTGATACTTCAGAAAA 4120
Query 4154 CAATCAGGCGAGAATTTGCAGATTGCACTGTCATTACAGTTGCTCACCGTATCCCTACCG 4213
||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||
Sbjct 4121 CAATCAGGCGAGAATTTGCCGATTGCACCGTCATAACCGTGGCTCACCGTATCCCCACCG 4180
Query 4214 TTATGGATTGTACAATGGTTCTCTCCATCAGCGACGGACGGATTGTGGAGTATGATGAGC 4273
||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4181 TTATGGATTGTACAATGGTTCTCTCCATCAGTGAAGGACGAATTGTGGAGTATGATGAGC 4240
Query 4274 CAATGAAGTTGATGAAGGATGAGAACTCTTTGTTCGGAAAGCTTGTGAAAGAGTATTGGT 4333
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4241 CGATGAAGTTGATGAAGGATGAAAACTCTTTGTTCGGAAAGCTTGTGAAAGAGTATTGGT 4300
Query 4334 CTCATTACAACTCGGCTGACTCACGTTGATGATG 4367
|||| ||| |||| |||||||||||||| |||||
Sbjct 4301 CTCACTACCACTCAGCTGACTCACGTTGCTGATG 4334
Score = 2228 bits (1206), Expect = 0.0
Identities = 1392/1483 (94%), Gaps = 7/1483 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATAGAAAATTATTGGACTTCCTTCTGCGGGAATCACCACACATCATCAAACTGCACT 60
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||| | ||||||||||||
Sbjct 1 ATGATAGAAAATTTTTGGACTTGGTTCTGCGGGAATCA-C-CACA-CGTCAAACTGCACT 57
Query 61 GTTCGATTTCTACAGATATGTTTCGGTATCACACTCTCATTCCTAACCCTCTGTATTTGC 120
|| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 58 CTTGGATTTCTGCAGATATGTTTCGGTATCACACTCTCATTCCTAACTCTCTGTATTTGC 117
Query 121 TTGTTTCACAAGGAACCTCCCAAAAGGATTCATCAATTCTTTTGTCTGCGACTAGTGTCT 180
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 118 TTGTTTCACAAGGAATCTCCCAAAAGGATTCATCGATTCTTTTGTCTGCGAATAGTGTCT 177
Query 181 GCTCTATTCAACGGAATCATCGGATCTCTAGATTTGGTTTTAGGGATTTGGGTTTTACGA 240
||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178 GCTGTGTTCAACGGAATCATCGGATCTCTAGATTTGGTTTTAGGGATTTGGGTTTTACGA 237
Query 241 GAGAA-TCACAGTAAGCCCTTAATCCTCTGGCTGGTCATTCTGATTCAAGGGTTTACATG 299
||||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 238 GAGAACTC-CAATAAGCCCTTAATCCTCTGGCTTGTGATTCTGATTCAAGGGTTTACATG 296
Query 300 GTTATTCATTAACTTAATCATTTGCGTTAGAGGAACAAGAATCCGCAAGTCTTCGTTGAG 359
| | || ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||| || || |||||||||||
Sbjct 297 GCTCTTGATTAACTTAGTTATTTGCATTAGAGGAGCAAGAATTCGAAAATCTTCGTTGAG 356
Query 360 ATTGTTATCTATCTTCTCCTTCTTTTATGGTTTGGTCTCAAGTTGTTTATCTGTGAACAA 419
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 ATTGTTATCTATCTTCTCCTTCTTTTATGGTCTGGTCTCAAGTTGTTTATCTGTGAACAA 416
Query 420 TGCTGTGTTTGGAGATGAATTAGCAGTTAGGACAATTCTTGATGTTTTGTTACTTCCTGG 479
|||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 417 TGCTGTTTTTGGAGAAGAATTAGCTGTTAGGACGATTCTTGATGTTTTGTTACTGCCTGG 476
Query 480 GTCAGTTTTGTTACTCTTAAGTGCTTATAAAGGCTATAGATTTGATGAATCTGGTGAGAG 539
||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 GTCTGTTTTATTACTCTTAAGTGCTTATAAAGGCTATAGATTTGATGAATCTGGTGAGAG 536
Query 540 TAGTTT-ATACGAGCCTCTTAATGCTGGTGATTCAAATGGGTTTAGCGAAAAAGCCGATT 598
| |||| | | ||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||
Sbjct 537 TGGTTTGA-ATGAGCCTCTTAATGTTGGTGATTCAAGTGGGAACAACGAAAAAGCCGATT 595
Query 599 TTGATAACCGGGTTAGCCAGTTTGCTAAAGCAGGATTGTTCAGTACGTTATCATTCTGGT 658
|||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 596 CTGATAATCGGGTTAGCCAGTTTGCTGTAGCTGGGTTGTTCAGTAAGTTATCATTCTGGT 655
Query 659 GGTTGAATTCTTTGATAAAGAGAGGAAATGTGAAAGACTTGGAGGAAGAAGATATACCCG 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 656 GGTTGAATTCTTTGATAAAGAGAGGAAATGTGAAAGACTTGGAGGAAGAAGATATACCCG 715
Query 719 AGCTTCGAAAGGAAGAGCGTGCAGAGACGTGTTATTCCTTGTTTGAGGAAAATCTCATTG 778
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||
Sbjct 716 AGCTTCGCGAGGAAGAGCGTGCAGAGACGTGTTATTCCTTGTTCAAGGAGAATCTCAATG 775
Query 779 AGCAGAAGAGAAGATTAGGGAGTTCTTGTCAACCTTCGATCTTGAAAGTTACTGTTCTTT 838
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 776 AGCAGAAGAGAAGATTAGGGAGTTCTTGTCAGCCTTCGATCTTGAAAGTTACCGTTCTTT 835
Query 839 GTGTCTGGAGAGAGCTTTTGACCTCTGGTTTCTTTGCTTTTATGAAGATTGTTGCTGTTT 898
|||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 836 GTGTGTGGAGAGATCTTTTGACCTCTGGTTGCTTTGCTTTTATGAAGATTGTTGCTGTTT 895
Query 899 CAGCTGGTCCTTTGCTTCTGAATGCTTTCATTTTGGTTGCTGAAGGCAATGCAAGCTTTA 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 896 CAGCTGGTCCTTTGCTTCTGAATGCTTTCATTTTGGTTGCTGAAGGCAATGAAAGCTTTA 955
Query 959 GATATGAAGGGCTTGTGTTGGCTGTGTTGCTGTTCTTCTCAAAGATGATAGAGTCTTTGT 1018
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 GATATGAAGGATTTGTGTTGGCTGTGTTGCTGTTCTTCTCAAAGATGATAGAGTCTTTGT 1015
Query 1019 CACAGAGACAATGGTATTTCAGATGTAGAATTGTCGGTTTACGCGTGAGGTCTCTTCTAA 1078
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1016 CTCAGAGACAATGGTACTTCAGATGTAGAATTGTCGGTTTACGCGTGAGGTCTCTACTAA 1075
Query 1079 CTGCAGCTATAAACAAGAAGCAGCTGAGATTGAATAACTCTTCAAGACTGATTCATTCTG 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
Sbjct 1076 CTGCAGCTATAAACAAGAAGCAGCTGAGATTGAATAACTCTTCAAGATTGATTCATTCAG 1135
Query 1139 GCAGCGAGATTATGAACTACGCTACTGTTGATGCTTACAGAATTGGGGAGTTTCCGTATT 1198
|||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1136 GCAGCGAGATTATGAACTACGCGACTGTCGACGCCTACAGAATTGGGGAGTTTCCATATT 1195
Query 1199 GGTTTCACCAGCTTTGGACAACAAGCTTTCAGCTACTAATCGCGCTTGGGATTCTCTTTC 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1196 GGTTTCACCAGCTTTGGACAACAAGCTTTCAGCTACTAATTGCGCTTGGGATTCTCTTTC 1255
Query 1259 ATTCTGTGGGAGTTGCTACGTTTTCAGCTCTAGCTGTGATAATACTTACTGTTTTATGCA 1318
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1256 ATTCTGTGGGAGTTGCTACATTTTCAGCTCTAGCTGTGATAATACTTACTGTTCTATGCA 1315
Query 1319 ACGCTCCTATCGCAAAACTTCAGAACAAGTTTCAAAGCGAACTCATGACCTCTCAGGACG 1378
| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1316 ATGCTCCTATCGCGAAACTTCAGAACAAGTTTCAAAGCGAACTCATGACCTCTCAGGACG 1375
Query 1379 AGAGGCTGAAGGCCTGCAATGAGTCTCTTGTCAACATGAAGGTCTTGAAGCTCTATGCGT 1438
|| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1376 AGCGGCTTAAGGCCTGCAATGAGTCTCTTGTCAACATGAAGGTCTTGAAGCTCTACGCGT 1435
Query 1439 GGGAATCACATTTCAAGAAGGTTATTGAAAAGCTTAGGAACAT 1481
||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||
Sbjct 1436 GGGAATCACATTTCAAGAAGGTTATCGAGAAGCTAAGGAACAT 1478
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 168747278682
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5