BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G00060.1
Length=5025
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg943759 jgi|Araly1|943759|scaffold_604303.1 4331 0.0
Ahg943758 jgi|Araly1|943758|scaffold_604302.1 2254 0.0
> Ahg943759 jgi|Araly1|943759|scaffold_604303.1
Length=2563
Score = 4331 bits (2345), Expect = 0.0
Identities = 2496/2568 (97%), Gaps = 13/2568 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1907 ATCGTAAAGAAAAGTTGACAATGCCTAATGAACGATCCAGAACTTTGGATGAAGGGGAAT 1966
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1 ATCGTAAAGAAAAGTTGACAATGCCTAATGGACGATCCAGAACTTTGGAGGAAGGGGAAT 60
Query 1967 CCCATCGGATTCACCATCAGAGAAGAGAAGCAGGTTACGGTTTTGCCTCCAGCAGTTCAG 2026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 61 CCCATCGGATTCACCATCAGAGAAGAGAAGCAGGTTACGGTATTGCCTCCAGCAGTTCAG 120
Query 2027 AATTTGTTTCTTATGAGTGGCCTGCTGTAGCTCCTATGTACTTTTCGCATGTTAGTTCTC 2086
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 121 AATTTGTTTCTTATGAGTGGCCTGCTGTAGCTCCTATGTACTTTTCACATGTTAATTCTC 180
Query 2087 ACCTTCCAACTGCAACTGACAGACTGCACCTTGATGTTGGTCACAATTTGCATCCATACG 2146
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 181 ACCTTCCAACTGCAACTGATAGACTGCATCTTGATGTTGGTCACAATTTGCATGCATACG 240
Query 2147 TACGGCAACCTTTTGTGTCCACTGTGCAACATGCTAGAAATCCTTCAATTGAAGGTTCCC 2206
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 241 TACGCCAACCTTTTGTGTCCACTGTGCAACATGCTAGAAATCCTTCCATTGAAGGTTCCC 300
Query 2207 ACAAACAAGTTCTCTCTCGACCCATGCCCATGAGTCTAGATTGGCCTCCCATGGTTCATA 2266
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ACAAACAAGTTCTTTCTCGACCCATGCCCATGAGTCTAGATTGGCCTCCCATGGTTCATA 360
Query 2267 GCAATTGCGGCTTGACAACAGCATTCACTTGCAATTATGATTCTGGAATTTTGGTGGACA 2326
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 361 GCAATTGCGGCTTGACAACAGCATTCGCTTGCAATTATGATTCTGGAATTCTGGTGGACA 420
Query 2327 TTCCTGAACAGAAAAATAAGCACGAGCTGGGGAATGAATGCGAGAATAACTGGATGTTAG 2386
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TTCCTGAACAGAAAAATAAGCCCGAGCTGGGGAATGAATGCGAGAATAACTGGATGTTAG 480
Query 2387 AGGAAGATTTTGAGGTGCACACTGTTTCTGGAGTAGACTATAATCAATATTTCGGTGGTG 2446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AGGAAGATTTTGAGGTGCACACTGTTTCTGGAGTAGACTATAATCAATATTTCGGTGGTG 540
Query 2447 GAGTGATGTATTGGAATCCTTCCGATCATCTCGGGACTGGCTTCTCTCGCCCTCCTTCCC 2506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||
Sbjct 541 GAGTGATGTATTGGAATCCTTCCGATCATCTCGGGACTGGCTTTTCTCGTCCTCCGTCCC 600
Query 2507 TTAGTTCTGATGATAGCTCTTGGGCTTGGCATGAAGCTGAAATGAAGAGGTCTGTTGATG 2566
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 TTTGTTCTGATGATAGCTCTTGGGCTTGGCATGAAGCTGAAATGAAGAGGTCTGTTGATG 660
Query 2567 ACATGGTTGCATTTTCGTCTTCTTACAGCGCAAATGGACTAGATTCTCCAACTGCAGCCT 2626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 ACATGGTTGCATTTTCGTCTTCTTACAGCGCAAATGGACTAGATTCTCCAACTGCAGCCT 720
Query 2627 CGTTCTGTTCCCCTTTTCACCCCTTAGGCCCACCAAATCAGCCTCTCGGTTATGTTGTGC 2686
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CGTTCTGTTCCCCTTTTCACCCCTTAGGCCCGGCAAGTCAGCCTCTCGGTTATGTTGTGC 780
Query 2687 CAGGTAATGAAATATCTACCAAAATACTGCAAGCTCCGCCAACAACAATTGAAGGTGCAG 2746
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 781 CAGGTAATGAAATATCTACCAAAATACTGCAAGCTCCGCCAACAACAAGTGAAGGTGCAG 840
Query 2747 GTGAAGAGGAAGTCTCCGGAACTTTGGCTAGTTTATCAGGGGATGTTGAAGGCAATTCAG 2806
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 841 GTGAAGAGGAAGTCTCCGGAACTTTGGCTAGTTTATCAGGGGATGTTGAAGGAAATTCAG 900
Query 2807 GAGACTCACTTCCTTATCCAATTTTGCGCCCTATAATTATCCCAAATATGTCAAAATCTG 2866
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GAGACTCACTTCCTTATCCGATTTTGCGCCCTATAATTATCCCAAATATGTCAAAATCTG 960
Query 2867 AATACAAGCGTAGTTATGATACTAAAAGCCCAAACGTTCCACCTACAAGGCGCGAGCATC 2926
| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 ATTACAAGCGTAGTTATGATACGAAAAGCCCAAATGTTCCACCTACAAGGCGCGAGCATC 1020
Query 2927 CTCGTATAAAGCGGCCACCGTCACCTGTGGTACTATGTGTTCCACGTGCTCCTCGACCAC 2986
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1021 CTCGTATAAAGCGGCCACCATCACCTGTGGTACTATGTGTTCCACGTGCTCCTCGACCGC 1080
Query 2987 CACCTCCTTCTCCTGTGAGCAACTCCAGAGCACGGCGAGGTTTTCCAACTGTGAGGTCAG 3046
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1081 CACCTCCTTCTCCTGTGAGCAACTCCAGAGCACGGCGAGGTTTTCCAACTGTGAGGTCTG 1140
Query 3047 GAAGTTCAAGCCCAAGACATTGGGGTATGAGAGGCTGGTTTCATGACGGTGTAAACTGGG 3106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GAAGTTCAAGCCCAAGACATTGGGGTATGAGAGGCTGGTTTCATGACGGTGTAAACTGGG 1200
Query 3107 AAGAACCTCGTGGAGCAGA-GATTGTTTTGCCCTGGAGAAACAAAAGCCTTGCAGTCAGG 3165
|||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 AAGAACCTTGTGGAGCAGAAG-TTGTTTTGCCCTGGAGAAACAAAAGCCTTGCAGTCAGG 1259
Query 3166 CCGATCATTCAGCCGTTACCGGGGGCCCTCCTGCAAGATCACTTAATTGCAATGTCGCAA 3225
||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 CCGATCATTCAACCTTTACCGGGGGCCCTCCGGCAAGATCACTTAATTGCAATGTCGCAA 1319
Query 3226 CTAGGCCGAGACCAAGAGCATCCTGATGTGGCCTTCCCTCTGCAACCACCCGAGTTATTG 3285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 CTAGGCCGAGACCAAGAGCATCCTGATGTGGCCTTCCCTCTGCAACCACCCGAGTTATTG 1379
Query 3286 AACTGTCCAATGCAAGGGGAATCTCTCTCACTGATCCACGGTATTCTTAATGACGAGATA 3345
|||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1380 AACTGTCCAATGCAAG---AATCTTTATCACTGATCCACGGTCTTCTTAATGACGAGATA 1436
Query 3346 GATTCTTTCTGCAAGCAGGTTGCTGCAGAGAATATGGCCCGCAAACCTTATATCAATTGG 3405
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1437 GACTCTTTCTGCAAGCAGGTTGCTGCAGAGAATATGGCCCGCAAACCTTATATCAGTTGG 1496
Query 3406 GCAATCAAGCGGGTTACCCGATCTCTCCAAGTTCTGTGGCCCAGGTCTAGGACGAACATA 3465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1497 GCAATCAAGCGGGTTACCCGATCTCTCCAAGTTCTGTGGCCCAGGTCCAGGACGAACATA 1556
Query 3466 TTTGGTTCATCTGCAACTGGTTTGTCTCTCCCTTCTAGTGATGTGGATCTTGTGGTTTGT 3525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1557 TTTGGTTCATCTGCAACTGGTTTGTCTCTCCCTTCTAGTGATGTGGATCTTGTGGTTTGT 1616
Query 3526 CTTCCTCCAGTGAGAAATTTAGAACCTATCAAAGAGGCAGGAATTTTGGAGGGTCGCAAT 3585
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617 CTTCCTCCAGTGAGAAATTTGGAACCTATTAAAGAGGCAGGAATTTTGGAGGGTCGCAAT 1676
Query 3586 GGTATAAAGGAGACTTGCCTTCAGCATGCAGCCAGGTATCTCGCGAATCAAGAGTGGGTA 3645
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1677 GGTATAAAGGAGACTTGCCTTCAGCATGCAGCCAGGTATCTCGCCAATCAAGAGTGGGTA 1736
Query 3646 AAAACTGACTCCCTGAAGACAGTTGAAAACACAGCTATACCAATTATCATGCTTGTTGTG 3705
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1737 AAAACTGATTCCCTGAAGACAGTTGAAAACACAGCTATACCAATTATCATGCTTGTTGTG 1796
Query 3706 GAAGTCCCTTGTGATCT-GATATGCAGTATACAGTCACCAAAAGATGGTCCAGACTGTAT 3764
||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1797 GAAGTCCCTTGTGATCTAG-TATGCAGTATACAGTCACCAAAAGATGGCCCAGACTGTAT 1855
Query 3765 CA----C-C-GTTGACCAGGATAGCAATGGTAACACTGAAATGGTTGGATTTGAAGACTC 3818
|| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1856 CAGTATCACTGTTGACCAGGACAGCAATGGTAACACTGAAATGGTTGGATTTGAAGACTC 1915
Query 3819 TGCAGCAGCAAACTCTTTGCCAACAAACACTGGAAACTTGGCAATTGCAAAATCTGTCCG 3878
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1916 TGCAGCAGCAAACTCTTTGCCAACAAACACTGGAAACTTGGCAAATGCAAAATCTGTCCG 1975
Query 3879 TCTTGACATCAGTTTCAAAACTCCATCCCATACGGGTCTTCAAACCACGCAGCTGGTCAA 3938
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1976 TCTTGACATCAGTTTCAAAACTCCATCCCATACGGGCCTTCAAACCACGCAGCTGGTCAA 2035
Query 3939 AGATCTGACTGAGCAATTTCCAGCTGCCACACCACTTGCTCTGGTGTTAAAGCAGTTTTT 3998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2036 AGATCTGACTGAGCAATTTCCAGCTGCCACACCACTTGCTCTGGTGTTAAAGCAGTTTTT 2095
Query 3999 GGCTGATCGTACCCTGGATCAATCATACTCTGGCGGATTAAGCTCTTACTGCCTGGTCTT 4058
|||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2096 GGCTGATCGTACTCTGGATCAATCATACTCTGGTGGATTAAGCTCTTATTGCCTGGTCTT 2155
Query 4059 ACTGATTACACGTTTTCTTCAGCATGAGCATCATTTGGGGCGCTCTATCAACCAAAACCT 4118
||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2156 ACTGATTACTCGTTTTCTTCAGCATGAGCATCATCTGGGGCGCTCTATCAACCAAAACCT 2215
Query 4119 TGGGGGGCTTCTAATGGATTTTCTTTACTTTTTTGGTAATGTGTTTGATCCTCGCCAGAT 4178
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2216 TGGGGGGCTTCTAATGGATTTTCTTTACTTTTTTGGTAATGTCTTTGATCCTCGCCAGAT 2275
Query 4179 GCGTGTATCAGTGCAAGGAAGTGGTATCTATAGGAATCGGGAGAGGGGTTATAGTATTGA 4238
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2276 GCGTGTTTCAGTGCAAGGAAGTGGTATCTATAGGAATCGGGAGAGGGGTTATAGTATTGA 2335
Query 4239 TCCGATACACATTGATGATCCTCTTTTCCCAACAAATAATGTGGGTAGAAATTGCTTCCG 4298
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2336 TCCGATACACATTGATGATCCTCTTTTCCCCACAAATAATGTGGGTAGAAATTGCTTCCG 2395
Query 4299 TATACATCAATGTATTAAGGCATTTTCTGAAGCTTACTCTGTTCTGGAAAATGAGCTTAC 4358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2396 TATACATCAATGTATTAAGGCATTTTCTGAAGCTTACTCTGTTCTGGAAAATGAGCTTAC 2455
Query 4359 ATGCATTACTAGTACCAGTGATTCGTGTGGGAAGCAGCAGCTGCACAATTTGCTTCCAAA 4418
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2456 ATGCATTACTAGTTCCAGTGATTCGTGTGGGAAGCAGCAGCTACACAATTTGCTTCCAAA 2515
Query 4419 AATCATCCCAAGTATCATTTCATCTTAGGAACCAACCGAGATGTCTTT 4466
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2516 AATCATCCCAAGTATCATTTCATCTTAGGAACCAACTGAGATGTCTTT 2563
> Ahg943758 jgi|Araly1|943758|scaffold_604302.1
Length=1556
Score = 2254 bits (1220), Expect = 0.0
Identities = 1403/1491 (94%), Gaps = 13/1491 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAAAATCGCCATCTCCCTTCCAAATTCTTCTCCTCT-GCTTCATCCATGGCTCAGAA 59
|||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| || |||||||||||||||||
Sbjct 21 ATGGAAAATCGCCATCTCCCATCCAAATTCTCCTTCTCTGGC-TCATCCATGGCTCAGAA 79
Query 60 TCAACTTATCGATTCGCTAACATCTCACATATCTCTGTACCACTCCCACTCGTCTTCCTC 119
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 80 TCAACTTATCGATTCCCTCACATCTCACATATCTCTGTACCACTCCCATTCTTCTTCCTC 139
Query 120 TTCAATGGCTAATACTATCCCCAATCCTAGGTCGGCGATCCTCCGATGGTTCTCTTCTCT 179
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 140 TTCCATGGCTAATACTAGCCCCAATCCTAGGTCGGCGATCCTCCGATGGTTCTCTTCTCT 199
Query 180 CAGCGTCCACCAGCGCCTCTCTCACCTCACCGTCGTTGATCCCAAGTTCGTCCAAATCCT 239
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 200 CAGCGTCCACCAGCGCCTCTCTCACCTCACCTTCGTTGATCCCAAGTTCGTCCAAATCCT 259
Query 240 CCTTCAGATGCTTGGTTATATCCGCACTAAAGGCCCTTGCTCTTTCATCATCCTCCCAGA 299
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 260 CCTTCAGATGCTTGGTTATATCCGCACCAAAGGCCCTGGCTCTTTCATCATCCTCCCAGA 319
Query 300 CCTCCCTTCCTCCTCCGATCTCCCCAGTCTCTGCTTTAAAAAATCTCGTGGCTTAATCTC 359
|||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 320 CCTCCC-T--TCCTCCGATCTCCCCAGTCTCTGCTTTAAAAAATCTCGTGGCTTAATCTC 376
Query 360 CAGGGTTTCCGAGTCCAACGAGTCAGAGCGTTTCGTTTTCGACTCTACTCGGCTCTTTGG 419
||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 377 CAGGGTTGCCGAGTCTAACGAGCCAGAGCGTTTCGTTTTCGACTCCACTCGGCTCTTTGG 436
Query 420 TTCTGGAGAAGGGGAAAGGGCTCAAGATTGCTCTTGCTCCGTCAATTCCCTCGATTCTGT 479
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 437 TTCTAGAGAAGGGGAAAGTGCTCAAGATTGCTCTTGCTCCGTCAATTCCCTCGATTCCGT 496
Query 480 CGTCATGGCCGAGGAAT-TTCTTACAAATGTGGATCGTTTCGTGGAGACTATGGACGTC- 537
|||||||||| | | || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |
Sbjct 497 CGTCATGGCCTATG-ATCTTCTTACGAATGTGGATCGTTTTGTGGAGACTATGGATG-CT 554
Query 538 TTATCGGATGGAGCATTTCTGAGAGGAGAAGAGAGTGATTTGGGGTCCAATTGGGTAGAA 597
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 555 TTATCGAATGGAGCATTTTTGAGAGGAGAAGAGAGTGATTTGGGTTCCAATTGGGTAGAA 614
Query 598 TTAGAGTGGCTCAAAGCCAAAGGCTATTATAGCATGGAAGCCTTCGTTGCAAATAGGTTA 657
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 615 TTGGAGTGGCTTAAAGCCAAAGGCTATTATAGCATGGAAGCCTTCATTGCTAATAGGTTA 674
Query 658 GAGGTAAGCATGAGATTAGCTTGGCTGAACACAAATAGTGGCAAGAGAAGAGGAATCAAA 717
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 GAGGTAAGCTTGAGATTAGCTTGGCTGAACACCAATAGTGGCAAGAGAAGAGGAATCAAA 734
Query 718 TTGAAAGAGAAATTGAATGCTGCTGCTGCGGCTGCCAATTCGTATTGGAGGAAGAAGGCC 777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735 TTGAAAGAGAAATTGAATGCTGCTGCTGCGGCTGCCAATTCGTATTGGAGGAAGAAGGCC 794
Query 778 TGTGTTGATTGGTGGCAGAATTTGGATGCTGCAACACACAAGAAAATCTGGACTTGTTTG 837
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 795 TGTGTTGATTGGTGGCAGAATTTGGATGCCGCAACACACAAGAGAATCTGGACTTGTTTG 854
Query 838 TTTGGGAAGTCGGCTAAATCTGTGATATATGAGATTCTTAGAGAAGCAAATCAAGCACAG 897
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 855 TTGGGGAAGTCGGCTAAGTCTGTGATATATGAGATTCTCAGAGAAGCAAATCAAGCACAG 914
Query 898 CAGGGGGAAATGTGGCTCTTCAATTTTGCAAGTGCAAGGAAAGGGCGTACAGACACTTCT 957
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 915 CAGGGAGATATGTGGCTCTTCAATTTTGCAAGTGCAAGGAAAAGGCGTACAGACACTTCT 974
Query 958 GCAGTTTCATTCTGTGACATGATTTTGGAACCGAACTCTGTACCAAGGAAACCAATAACC 1017
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||
Sbjct 975 GCAGTTTCATTCTGTGACATGATTTTGGAACCAAACTCTGTATCAAGGAAACCTGTTACC 1034
Query 1018 GTAGCCAGTAATCTAAGTGGCTTATACGTTCTTCAAGAATTTGCTTCACTGCTCATCTTA 1077
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1035 CTAGCCAGTAATTTAAGTGGCTTATACGTTCTTCAAGAATTTGCTTCGCTGCTCATCTTA 1094
Query 1078 TGCCAAAATGGCTTAGTTCCAGTACATAGTGTATTTTTCAGCTCAATGGGTACTATCACA 1137
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1095 TGCCAAAATGGCTTAGTTCCAGTACAAAGCGTATTTTTCAGCTCATTGGGTACTATCACA 1154
Query 1138 ACCTTAGTGGATTGCATCTTAAGAAAACTACGAGGTTTTCTTATGGTAATCTCTATTGAT 1197
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155 ACCTTAGTGGATTGCATCTTAAGAAAACTGCGGGGTTTTCTTATGGTAATCTCTATTGAT 1214
Query 1198 TCTGTTAAAAGT-GAACTTCTTGACGACAACACTCACAAGTGTTCTCCAAGCTCATCATC 1256
|| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1215 TCCGTTAAA-GTTGAACTTCTTGATGACAACACGCACAAGTGTTCTCCAAGTTCATCATC 1273
Query 1257 AAATCAGAAGCTTGGTTCGACCAACCGTAAACAGAAAGGAAAGACCAGGAACATGAAAAA 1316
|||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1274 CAATCAGAAGCTTTGTTCGACCAGCCGTAAACACAAAGGAAAGACCAGGAACTTGAAAAA 1333
Query 1317 GCCAACTCCGGAGGCTAAATCTGATAAAAACGTTAATTTGTCCACGAAAAATGGAAAGAA 1376
||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1334 GCCTACTCCCGAGGCTACATCTGATAAAAATGTTAATTTGTCCACGAAAAGCGGAAAGAA 1393
Query 1377 AGATCAAGCTAAACTGGAATTTAACAAAAGCAGAGAAGCGATAGAATGCAAGAAAGTTCC 1436
||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394 AGATCAAGCTAAATTGGAATTTAACAAAAACAGAGAAGCGATAGAATGCAAGAAAGTTCC 1453
Query 1437 TACAGCTTCGACGATGATCAAT-GATCCTGAGGCCTCTGCAGCAACTATGG 1486
||||||||| |||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1454 TACAGCTTCAACGAAGATCAGTAG-TCCTGCGGCCTCTGCAGCAACTATGG 1503
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 190211749854
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5