BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G00450.1 Length=7108 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg895977 jgi|Araly1|895977|Al_scaffold_0006_3973 5664 0.0 > Ahg895977 jgi|Araly1|895977|Al_scaffold_0006_3973 Length=6774 Score = 5664 bits (3067), Expect = 0.0 Identities = 3338/3472 (96%), Gaps = 6/3472 (0%) Strand=Plus/Plus Query 3303 GGGTGGAAGAAACCTTGTAACTGTACCAAGGAATGTTGAAAACAACATGTGTGAAATAGG 3362 |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3306 GGGTGGGAGAAACCTTGTAACTATGCCAAGGAATGTTGAAAACAACATGTGTGAAATAGG 3365 Query 3363 CGAGGCGATTCTAGTATCATCACTGAGAAGGTATGAAAACATTCTACTTTCAGCTGATCT 3422 ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3366 GGAGGCTATTTTAGTATCATCACTGAGGAGGTATGAAAACATTCTACTTTCAGCTGATCT 3425 Query 3423 TGTTCCTGAGGCCATGACAGCTTTGATGAACCGTGCTGCATCACTTATGTCTAGTAATGG 3482 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3426 TGTTCCTGAGGCCATGACAGCTTTGATGAACCGTGTTGCATCACTTATGCCTAGTAATGG 3485 Query 3483 AAAAATTTCTGGATCAGCAGCCTTAGTTTATACTCGCTATATTTTGAAAAGATATGGAAG 3542 ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3486 AAAGATTTCTGGATCAGCAGCCTTAGTTTATGCTCGCTATATTTTGAAAAGATATGGAAG 3545 Query 3543 CCTCCCCAGTGTTGTGGAATGGCATAACAATTTCAAAGCAACATCCGAAAAGAAGCTACT 3602 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct 3546 TCTTCCCAGTGTTGTGGAATGGCATAACAATTTCAAAGCAACATGCGAAAAGAGGCTTCT 3605 Query 3603 TTCTGAACTAGATCATACGCGATCAGGAAATGGTGAGTATGGGAACCCCCTCGGGGTTCC 3662 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 3606 TTCTGAACTAGATCATACACGATCAGGAAATGGTGAGTATGGGAACCCCCTTGGGGTTCC 3665 Query 3663 AGCAGGAGTAGATAATCCAGATGACTATTTACGTaaaaaaaTCAGCATTGGCGGTGCACG 3722 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| Sbjct 3666 AGCAGGAGTAGATAATCCAGATGACTATTTACGAAAAAAAATCAGCATCGGCGGTACACG 3725 Query 3723 TCCTTCAAGAGTGGGTTTGAGTATGCGAGATGTTTTGCAACGACATGTTGAAGAGGCGAC 3782 |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3726 TCCTTCAAGAGTGGGTTTGAATATGCGAGAGGTTGTGCAACGACATGTTGAAGAGGCGAC 3785 Query 3783 TCATTATCTCAAAAAACTCATTGGGACTGGTACTATGAAAGCCTCTCTCGCTGAGAAAAA 3842 ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||| Sbjct 3786 TCATTATCTCAGAAAACTCACTGGGACTGGTACTATGAAAGCCTCACTTACCGAGAAAAA 3845 Query 3843 TGATGACGGGTATCAGGTGGCTCAACAAATTGTAGTTGGACTAATGGACTGCATTAGACA 3902 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3846 TGATGACGGGTATCAGGTGGCTCAACAAATTGTAGTTGGACTAATGGACTGCATTAGACA 3905 Query 3903 GACTGGCGGTGCAGCTCAAGAGGGTGATCCCTCTTTGGTTTCTTCTGCGGTTTCTGCGAT 3962 ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3906 GACCGGTGGTGCAGCTCAAGAGGGTGATCCCTCTTTGGTTTCTTCTGCGGTTTCTGCGAT 3965 Query 3963 TATAAACAGTGTAGGCCTTT-CAGTGGCAAGGATTACAGATTTCTCTTTGGGAAACATTT 4021 |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3966 TATAAACAGTGTAGGCCTTTCCA-TGGCAAGGATTTCAGATTTCTCTTTGGGAAACATTT 4024 Query 4022 ATCAGAATCATCCTTCTGGCGTTGATTCATCTAATATTGCACGATACATTTTACGAATCC 4081 ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4025 ATCAGAATCATCCATCTGGCGTCGATTCATCTAATATTGCACGATACATTTTACAAATCC 4084 Query 4082 ATATAACCTGTCTGTGCCTTCTTAAGGAAGCTCTTGGAGAGCGTCAAAGCCGAGTGTTTG 4141 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4085 ATATAACCTGCCTGTGCCTTCTTAAGGAAGCTCTTGGAGAGCGTCAAAGCCGAGTGTTTG 4144 Query 4142 AAATAGCACTTGCAACAGAAAGTTCCACTGCGCTTACTGGAGTTTTTGCTCCTGTGAAGG 4201 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||| Sbjct 4145 AAATAGCACTTGCAACAGAAAGTTCCACTGCTCTTGCTGGAGCTTTTGCTCCGGGGAAGG 4204 Query 4202 GATCACGAGGTCAGCATCAGCTATCTCCTGAATCCTATGATTCAAATGCAAACAATTCAA 4261 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 4205 GATCACGAGGTCAGCATCAGCTATCTCCTGAATCCTATGATTCAAATGCCAACAATTCAA 4264 Query 4262 C-AATCGATATGTCGAATGGTACTGGAAAAATGGCGCTGAGCAGAGCG-ACAAAAATTAC 4319 | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| Sbjct 4265 CAAAT-GATATGCCGAACGGTACTGGAAAAATGGCGCTGAGTAGAG-GAACAAAAATTAC 4322 Query 4320 TGCAGCTGTATCTGCACTTGTTATAGGTTCTATCACACATGGTGTTATAACCCTTGAGAG 4379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4323 TGCAGCTGTATCTGCACTTGTTATAGGTTCTATCACACATGGTGTTATAACCCTTGAGAG 4382 Query 4380 GATTGTTGGTCTACTGAGACTAAAGGATTACTTAGATTTCGTTCAGTTTGTAAGGCGTAC 4439 |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4383 GATTGTTGGTCTGCTGAGACTAAAGGAGTACTTAGATTTCGTTCAGTTTGTAAGGCGTAC 4442 Query 4440 AAAATCGAGTTCTAATGGCAGTGCTAGATCCATGGGAGCCTCTAAAGTGGAAAGCCCTAT 4499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4443 AAAATCGAGTTCTAATGGCAGTGCTAGATCCATGGGGGCCTCTAAAGTGGAAAGCCCTAT 4502 Query 4500 TGAAGTGTATGTACATTGGTTCAGACTCCTTGTTGGTAACTGTAAAACTGTTTCGGAAGG 4559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4503 TGAAGTGTATGTACATTGGTTCAGACTCCTTGTTGGTAACTGTAAAACTGTTTCGGAAGG 4562 Query 4560 GCTGGTTTTGGAGCTTGTGGGAGAATCTTCCGTGGTGGCTATATCACGCATGCAGCGTAT 4619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4563 GCTGGTTTTGGAGCTTGTGGGAGAATCTTCCGTGGTGGCTATATCACGCATGCAGCGTAT 4622 Query 4620 GCTTCCGCTGAAATTGGTCTTCCCACCAGCCTATTCAATTATTGCGTTTGTTCTGTGGAG 4679 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4623 GCTTCCGCTGAAATTGGTCTTCCCACCAGCCTATTCAATTATTGCGTTTGTTCTATGGAG 4682 Query 4680 GCCTTTTGTTTCAAATAGTAACTCTAACTCCAGCGTCCATGAAGACACTCACCGCCTTTA 4739 |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4683 GCCTTTTGTTTCGAATAGTAACTCTAACTCCGGCGTCCATGAAGACACTCACCGCCTTTA 4742 Query 4740 TCAGTCTTTGACAATGGCCTTCCATGATGTTATTAAGCATCTTCCTTTCCGAGACGTGTG 4799 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 4743 TCAGTCTTTGACAATGGCCTTCCATGATGTTATTAAGCACCTTCCTTTCCGAGACGTGTG 4802 Query 4800 CTTCAGAGACACCCAGGGACTTTATGAACTGATAGTTGCTGATTCCACAGATGCTGAATT 4859 ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 4803 CTTGAGAGACACCCAGGGACTTTATGAACTGATAGTTGCTGATTCCACAGATGCTGAGTT 4862 Query 4860 TGCGTCGGTGTTTGAATCGCATGGATTGGATATGCACTTGAAATCTGTGGCCTTTGCTCC 4919 ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4863 TGCGTCGGTATTTGAATCGTATGGTTTGGATATGCACTTGAAATCTGTGGCCTTTGCTCC 4922 Query 4920 TCTTCGAGCGCGTCTTTTCTTAAATTCCCTAATTGATTGTAAGGTGCCATCCTCTGGTTA 4979 ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4923 TCTTCGAGCACGTCTTTTCTTCAATTCCATAATTGATTGTAAGGTGCCATCCTCTGGTTA 4982 Query 4980 TTCCCATGAAGGAGTTAGTGAAGCAAAAAACCGACATCAGGGAAATGGAACAAAGCTTGT 5039 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4983 TTCCCATGAAGGAGTTAGTGAAGCAAAAAACCGACACCAGGGAAATGGAACAAAGCTTGT 5042 Query 5040 GGACAAGCTTGTATCTGTATTAGATTGCCTGCAGCCTGCAAAATTTCACTGGCAGTGGGT 5099 |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5043 GGACAAGCTTGTATCTTTATTAGATTGCCTGCAACCTGCAAAATTTCACTGGCAGTGGGT 5102 Query 5100 TGAACTCAGGCTGCTTCTAAACGAGCAAGCACTTGCTGAGAAACTCGAAAATCATGATAT 5159 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5103 TGAACTCAGGCTGCTTCTAAACGAGCAAGCACTTACTGAGAAACTCGAAAATCATGATAT 5162 Query 5160 GCCTTTGACAGATGCAATACGATCTTCCTGTCCTACCTCTGAGAAGCCTGATGCCTCTGA 5219 ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 5163 GCCTTTGACCGATGCAATACGATCTTCCTGCCCTACCTCTGAGAAGCCTGCTGCCTCTGA 5222 Query 5220 GAATGAGAAAAATTTCATTCAAATCCTCCTCACAAGGTTATTGGTTAGACCTGATGCGGT 5279 | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 5223 GTATGAGAAAAATTTCATTCAAATGCTCCTCACAAGGTTATTGGTTAGACCTGATGCAGT 5282 Query 5280 CCCTCTTTTCTCAGAAGTGGTTCATCTCTTCGGTAGATCGGTTGAGGATTCAATGTTGAA 5339 ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5283 CCCACTTTTCTCAGAAGTGGTTCATCTCTTTGGTAGATCGGTTGAGGATTCAATGTTGAA 5342 Query 5340 GCAAGCTGAATGGTTTCTAGCAGGCCAAGATGTTCTTTTTGGACGAAAAACAATCAGACA 5399 ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5343 GCAAGCTGAATGGATTCTAGGAGGTCAAGAAGTTCTTTTTGGACGAAAAACAATCAGACA 5402 Query 5400 AAAACTGATTATTGTAGGTGAAAGCAAAGGACTCCCCACGAAACCTCAGTTTTGGAAACC 5459 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5403 AAAACTGATTATTGTAGGTGAAAGCAAAGGACTTCCCACGAAACCTCAGTTTTGGAAACC 5462 Query 5460 TTGGGGTTGGTGCAACAGCTCTAGTTCCGATCATATTACAGCAAACAAGGCAGGGAAGAA 5519 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| Sbjct 5463 TTGGGGTTGGTGCAACAACTCTAGTTCCGATCATATTACAACAAACAAAGCAGGGAAGAA 5522 Query 5520 AAGGAAGTTTGAAATTACTTCTATCGAAGAAGGGGAAGTGATTGAGGAAGGTTCAGGTTC 5579 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 5523 AAGGAAGTTTGAAATTACTTCTATCGAAGAAGGGGAAGTGATTGAGGAAGGGTCAGGTTC 5582 Query 5580 AAGAAAGGTATTATTACCCCGGGTATTGGATGAGAATAGTCCCAGTGTTGGCTATGGGAT 5639 || |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5583 AAAAAAGGTATTATTACCCCGGGCAGTAGATGAGAATAGTCCCAGTGTTGGCTATGGGAT 5642 Query 5640 TACAACTGAGAGGGCTTTTGTTCAGCTAGTGCTTCCATGCATAGACCAAAGCTCTGATGA 5699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5643 TACAACTGAGAGGGCTTTTGTTCAGCTAGTGCTTCCATGCATAGACCAAAGCTCTGATGA 5702 Query 5700 GTCTCGAAGTACCTTTGTGAATGAGTTGGTAAGACAGTTTAGCAATATTGAGCAGCAATT 5759 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5703 ATCTCGAAGTACCTTTGTGAATGAGTTGGTAAGACAGTTTAGCAATATTGAGCAGCAATT 5762 Query 5760 AAGTTCAGTTACCAACCGCAGTACAACAAGCAACAAGCAAATGGGAACTGCTTCTTCTGG 5819 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 5763 AAGTTCAGTTACCAACCACAGTACAACAAACAACAAGCACATGGGAACTGCTTCTTCTGG 5822 Query 5820 GTCTGAGATTTCATCAAATAAAGGAAGTACCCGGAAGGGCCTTCGCGGTGGTAGCCCTAG 5879 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5823 GTCTGAGATTTCATCAAATAAAGGAAGTACCCGGAAGGGCCTTCGCGGTGGTAGCCCTAG 5882 Query 5880 TTTGGCAAGAAGATCCTCAGCCAATACTACTGACACTTCGCCGCCGCCTTCCCCTGCTGC 5939 ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 5883 TTTGGCAAGAAGATCCTCAACCAATATTACTGACACTGCGCCGCCGCCTTCCCCTGCTGC 5942 Query 5940 TTTGAGAGCTTCTATGTCTTTGCGGTTGCAATTTCTTCTAAGATTACTGCCTGTCATCTG 5999 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5943 TTTGAGAGCTTCTATGTCTTTGCGGTTGCAATTTCTTCTAAGATTACTGCCTGTCATCTG 6002 Query 6000 CGGGGAACCTTCATTTAAGAACACCAGACATGCACTTGCGTCTACAATAGTTCGTCTACT 6059 ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 6003 CGGGGAACCTTCATTTAGGAACACGAGACATGCACTTGCATCTACAATAGTCCGTCTACT 6062 Query 6060 TGGAAGCAGAGTAGTTTATGAAGATTATGCTGTATGTTCTCCTCGTAGTGAGCTATCAAA 6119 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| Sbjct 6063 TGGAAGCCGAGTAGTTTATGAAGATTATGCTGTCTGCTCTCCTCGTATTGAGGTATCAAA 6122 Query 6120 GGCAGAAACAGAATCAACAATAGATCCTTCTTCCATGGCAGATCTCTCTAGTGAAGTCTT 6179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6123 GGCAGAAACAGAATCAACAATAGATCCTTCTTCCATGGCAGATCTCTCTAGTGAAGTCTT 6182 Query 6180 ATTTGACCGGTTACTGTTTGTACTCCATGGGCTGTTAAGCAATCACCAGCCAAAATGGCT 6239 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6183 ATTTGACCGGTTACTGTTTGTACTCCATGGGTTGTTAAGCAATCACCAGCCAAAATGGCT 6242 Query 6240 AAAGCCAAGGCCTTCCTCTAATGAATCATCCAAAGACTTTACCTTGTTTGATCGCGATGC 6299 |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6243 AAAGCCAAGGCCTTCCTCTAGTGAACCATCCAAAGACTTTACCTTGTTTGATCGCGATGC 6302 Query 6300 AGCAGAGAGCTTACAGAATGAGCTTTCGCGGATGCAGTTACCAGACACCATTAGATGGCG 6359 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6303 AGCAGAGAGCTTACAGAATGAGCTTTCGCGGATGCAGTTACCAGACACCATTAGATGGCG 6362 Query 6360 GATCCAAGCAGCGATGCCAATCCTCCTTCCTTCTCTACGCTGTTCTCTCTCATGCCAGCC 6419 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 6363 GATCCAATCAGCGATGCCAATCCTCCTTCCTTCTCTACGCTGTTCTCTCTCGTGCCAGCC 6422 Query 6420 TCATTCTGTTCCGCCAACCGCACTCACACTTGTTCAGCCCTCTGGATCTACTGCTGCTGC 6479 |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| Sbjct 6423 TCATTCCGTTCCGCCAACTGCACTCACACTTGTTCAACCCTCTGGATCTGCCGCTGCTGC 6482 Query 6480 TGGAACCAATCAAAGAAACTCCCCTGCCATATCGAAAAGTGGAACTGCAGCAGCACAAGG 6539 |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| Sbjct 6483 TGGACCCAACCAAAGAAACTCCCCTGCCATATCGAAAACTGGAACCGCAGCAGTGCAAGG 6542 Query 6540 GAAGCTGAAGCCGACAATGTTGGCACCACATCAACAACAAGAAGCAGACAACACGGATGT 6599 ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 6543 GAAGCTGAAGCAGACAGTGTTGGCACCACCTCAACAACAAGAAGCAGATAACACGGATGT 6602 Query 6600 GGTTGACCCGTGGACGCTCCTCGAAGATGGGACAAGTTCAGGTCTATCAAGCAGCAACGC 6659 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6603 GGTTGACCCGTGGACGCTTCTCGAAGATGGGACAAGTTCAGGTCTATCAAGCAGCAACGC 6662 Query 6660 TTCAAATAGCAGCGACATGGCCAACCTTCGAGCCACCTGTTGGCTGAAAGGTGCAGTCAG 6719 |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 6663 TTCAAACAGCAGCGACATGGCCAATCTCCGAGCCACCTGTTGGCTGAAAGGTGCAGTTAG 6722 Query 6720 GGTCAGACGGACTGATCTAACTTACGTTGGTTCAGTAGACGACGACAGCTGA 6771 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6723 GGTCAGACGGACTGATCTAACTTATGTTGGTTCAGTAGACGACGACAGCTGA 6774 Score = 4732 bits (2562), Expect = 0.0 Identities = 2739/2824 (97%), Gaps = 14/2824 (0%) Strand=Plus/Plus Query 422 AGGCTGGTCAGGTTTATGGGGTGCCTCTCTCTGGTTCGCTTCTATGTAAGCCTGGATTTC 481 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 491 AGGCTGGTCAGGTTTATGGGGTGCCTCTCTCTGGTTCGCTTCTATGTAAGCCTGGATTTC 550 Query 482 CAGAACAAAGGTCATGTGGGGAGGAGACAAAGAAAAGATGGATCGAGAGTTTATCACAAC 541 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 551 CAGAACAAAGATCATGTGGGGAGGAGACAAAGAAAAAATGGATCGAGAGTTTATCACAAC 610 Query 542 AGCACAAACGATTGCGCTCTTTGGCTGATAACATTCCTGGATATAGGAGAAAAACCTTAT 601 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 611 AGCACAAACGATTGCGCTCTTTGGCTGATAACATTCCTGGATATAGGAGAAAAACCTTAT 670 Query 602 TTGAAGTCCTTATAAGGAACAATGTCCCACTATTGAGAGCTACTTGGTTTATAAAAGTGA 661 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 671 TTGAGGTCCTTATAAGGAACAATGTCCCACTATTGAGAGCTACTTGGTTTATAAAAGTGA 730 Query 662 CTTATCTCAATCAGGTACATTGTTGGGCAATAAATTGGTGCGACCTAGTCCTGCTGCTAT 721 |||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| Sbjct 731 CTTATCTCAATCAGGTACATTGTTGGGC-A-AGA---GTGCGACCTAGTCCTGCTGCTAT 785 Query 722 TTCTTCAGGAACACCTGACAAGACACAAGCTTCTCGGTGTGAGCAATGGACAAAAGATGT 781 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 786 TTCTTCAGGAACACCTGACAAGACACAAGCTTCTCGGTGTGAGCAATGGACAAAAGATGT 845 Query 782 TATTGAATATTTGCAATACCTCTTGGATGAACTTTTGTCACGGAATAGCTCATTTCCTGC 841 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 846 TATTGAATATTTGCAATACCTCTTGGATGAACTTTTGTCACGGAATAGCTCATTTACTGC 905 Query 842 TCAGCAAACTAGAGATAGGTCACCACAGATGCTTTATACAGGATCAATGCAAAAGAATAG 901 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 906 TCAGCAAACTAGAGATAGGTCACCACAGATGCTTTATACAGGATCAATGCAAAAGAATAG 965 Query 902 TCCAGCATCAACAAGCCTTTACGGCGAGGAAACATCTCTACATTTTAAATGGTGGTATAT 961 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 966 TCCAGCATCAGCAAGCCTTTACGGCGAGGAAACATCTCTACATTTTAAATGGTGGTATAT 1025 Query 962 GGTGCGTCTTCTACAGTGGCACCATGCTGAAGGGCTTCTTTTTCCTAATCTCATTGTTGA 1021 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1026 GGTGCGTCTTCTACAGTGGCACCATGCTGAAGGGCTTCTTTTTCCTAATCTCATTGTTGA 1085 Query 1022 TTGGGTTCTCAAGCTCTTACAGCTTTGTGAATTTCCATTTTGCTTTACTGCAGGAAAAGG 1081 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| Sbjct 1086 TTGGGTTCTCAAGCTCTTACAGCTTTGTGAATTTCCCTTTTGC-TTACTGCAGGAAAAGG 1144 Query 1082 AGATCTTTGAAATTTTGCAGCTGCTACTCCCCATTGTGTATGGTGTTTTAGAGAGTATTG 1141 || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1145 AGGTCTTTGAAATTTTGCAGTTGCTACTCCCCATTGTGTATGGTGTTTTAGAGAGTATTG 1204 Query 1142 TTCTCTCTCAGACATATGTACAGAGTCTTGTAGCTATTGCTGTCCGTTTCATTCAGGAAC 1201 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1205 TTCTCTCTCAGACATATGTACAGAGTCTTGTAGCTATTGCTGTCCGTTTCATTCAGGAAC 1264 Query 1202 CTGCTCCTGGTGGATCTGATCTTGTTGATAACTCTCGAAGAGCTTATACTCTATCTGCTC 1261 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1265 CTGCTCCTGGTGGATCTGATCTTGTTGATAACTCTCGAAGAGCTTATACTCTCTCTGCTC 1324 Query 1262 TAATTGAGATGGTTCGCTACTTGGTACTTGCTGCACCCGACACATTTGTTGCTTCAGATT 1321 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1325 TAATTGAGATGGTTCGCTACTTGGTACTTGCTGCACCCGACACACTTGTTGCTTCAGATT 1384 Query 1322 TCTTTCCTCTTCCTCCTTCCGTAGCAGCATGTGGACCTAATGATGTGAGCTATACGTCAA 1381 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1385 GCTTTCCTCTTCCTCCTTCCATAGCAGCATGTGGACCTAATGATGTGAGCTATACGTCAA 1444 Query 1382 AGGCTTATGAGAATCTGGAAAAGCTGAGAAGTAACTCTGCGGAGATTTCTGCCCAGTTTC 1441 ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| Sbjct 1445 AGGGTTACGAGAATCTGGAAAAGCTGAGAAGTAACTCTGCAGAGAATTCTACCCAGTTTC 1504 Query 1442 AAGGAAGAGGAGTTCTTTCCCGGTTTGAGTTCCTTTCTTTTGATTATACCATTTCAACCA 1501 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1505 AAGGAAGAGGAGTTGTTTCCCGGTTTGAGTTCCTTTCTTTTGATTATACCATTTCAACTA 1564 Query 1502 TTCAAAGAAGTGCAGATGATTTGGCAAAGATAGCTAGCGCTGGTTACCCTCAACATAACG 1561 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1565 TTCAAAGAAGTGCAGATGATTTGGCAAAGATAGCTAGCGCTGGTTACCCTCAACATAACA 1624 Query 1562 TGGCTAAAGCTGTTCAGGCCTTGGATAAAGCTTTGTCGGATGGAGATATCAGAGCTGCTT 1621 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1625 TGGCTAAAGCTGTTCAGGCCTTGGATAAAGCTTTGTCGGATGGAGATATCAGAGCTGCTT 1684 Query 1622 ACAGTTATCTCTTTGAAGACCTTTGCAATGGAGCCGTTGATGAGGCCTGGATTACTGACG 1681 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| Sbjct 1685 ACAGTTATCTCTTTGAGGACCTTTGCAATGGAGCCGTTGATGAGACCTGGATTGCTGACG 1744 Query 1682 TCAGTCCATGTTTAAGATCATCCCTTAGATGGATTGGCGCTATTAGCACATCCTTTGTTT 1741 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1745 TCAGTCCATGTTTAAGATCATCCCTTAGATGGATTGGCGCTATTAGCACATCCTTTGTTT 1804 Query 1742 GCTCCGtttttttCCTTATAGAATGGGCTACATGTGATTTTAGAGATTTCCGTGCTGGTG 1801 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1805 GCTCCGTTTTTTTCCTTATAGAATGGGCTACATGTGATTTTAGAGATTTCCGTGCCGGTG 1864 Query 1802 TGCCTAAAGATATCAAGTTCTCTGGCAGAAAAGATTGTTCTCAGGTGTATTTAGTCATTC 1861 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1865 TGCCCAAAGATATCAAGTTCTCTGGCAGAAAAGATTGTTCTCAGGTGTATTTAGTCATTC 1924 Query 1862 AGCTTCTGAAGCAAAAGATTCTGGGTGGAGAATTCACAGCTCGCAAAGGAAAGAATTGTC 1921 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1925 AGCTTCTGAAGCAAAAGATTCTGGGTGGAGAATTCGCAGCTCGCAAAGGAAAGAACAGTC 1984 Query 1922 GCAACAATTTTCTTGGTGTTTCTAAACCTAGCGGTTC-GATGGATGCATTTGAAAGCCCG 1980 |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| Sbjct 1985 GCAACAATTTGCCTGGTGTTTCTAAACCTAGCAGTTCAG-TGGATGCTTTTGAAAGCCCG 2043 Query 1981 GGCCCATTACATGATATCATAGTCTGTTGGATTGATCAGCATGAGGTACACAAGGGAGGA 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2044 GGCCCATTACATGATATCATAGTCTGTTGGATTGATCAGCATGAGGTACACAGGGGAGGA 2103 Query 2041 GCAAAGCGCTTGCAATTACTCGTTTTTGAACTTATACGTTCTGGAATCTTTAATCCCATA 2100 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2104 GCAAAGCGCTTGCAATTACTTGTTTTTGAACTTATACGTTCTGGAATCTTTAATCCCATA 2163 Query 2101 GCATATGTGAGGCAACTCATAGTTAGCGGGATGATCGATGTGATTCAACCTGCTGTTGAT 2160 ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2164 GCATACGTGAGGCAACTCATAGTTAGTGGGATGATCGATGTGATTCAACCTGCTGTTGAT 2223 Query 2161 CCTGAAAGGAGAATGAGGCACCATCGCATATTGAAACAGCTACCTGGGTGTTTTGTACAT 2220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2224 CCTGAAAGGAGAATGAGGCACCATCGCATATTGAAACAGCTACCTGGGTGTTTTGTACAT 2283 Query 2221 GAAACCTTAGAGGAAGCTCAACTCTTTGGAGGGGATAAGCTTTCCGAGGCTGTGAGAACT 2280 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2284 GAAACCCTAGAGGAAGCTCAACTCTTTGGAGGGGATAAGCTTTCCGAGGCTGTGAGGACT 2343 Query 2281 TATTCTAATGAACGGCGCCTTCTTCTTCGAGAACTGCTTGTTGAGAAAGGTAAATACTGG 2340 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2344 TATTCTAACGAACGGCGCCTTCTTCTTCGAGAACTGCTTGTTGAGAAAGGTAAATATTGG 2403 Query 2341 AATAATTTAGTTCTCTCAGATCAGAAGTCAAAGAAA-ATTTCCACTTCCCTTTCGTCTGT 2399 |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| Sbjct 2404 AATAATATAGTTCTGTCAGATCAGAAGTCAAAGAAACATT-CCACTTCCCTTCCGTCTGT 2462 Query 2400 TATTTTTCCAAGGGCGTGTAATGCCAAGAGC-AATAGTAAGGGACCTCGCAAACATACCA 2458 | ||||||||||| |||||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2463 TGTTTTTCCAAGGCCGTGTAATTCCATG-GCCAATAGTGAGGGACCTCGCAAACATACCA 2521 Query 2459 AGAGTAGTGTGGATATTAGAGAACTAAAGGAGCGCATATCAGCTCTACTGCAGTTTCCAG 2518 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2522 AGAGTCGTGTGGATATTAGAGAACTAAAGGAGCGCATATCAGCTGTACTGCAGTTTCCAG 2581 Query 2519 GTATGTCATGTGGTGTGGAAACCCCAGTGCGAGATGAATTCCAAAATAGTGTTAAGAGAT 2578 ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2582 GTATGTCATGTGGTGTGAAAAATCCAATGCAAGAGGAATTCCAAAATAGTGTTAAGAGAT 2641 Query 2579 CAAGTGGATCTGTGTATAGCAAGATGGATCAACCAGAAGCTACACCAGGGTGTGAAGACT 2638 | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2642 CTAGTGGATCTGTGTATAGCAAGATAGATCAACCAGAAGCTACACCAGGGTGTGAAGACT 2701 Query 2639 GTAGAAGAGCAAAAAGACCAAAAATGAATGATGAAAAGAGCTCTTGCTATCAAGGGAATT 2698 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2702 GTAGAAGAGCAAAAAGACCAAAAATGAACGATGAAAAGAGCTCTTGCTATCAAGGGAATT 2761 Query 2699 CACCAATTGCATCAGATGAAGAAGATAACTGGTGGATCAAGAAAGGATCGAAAACTGTGG 2758 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| Sbjct 2762 CACCAATTGCATCAGATGAAGAAGATAACTGGTGGATCAAGAAAGGATCAAAAACTCTGG 2821 Query 2759 AGTCTTCTCTGAAGGTTGATCCTCAGATAGAGATAACTAAACAAGTACCACGAGGTAGGC 2818 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2822 AGTCTTCTCTGAAGGTTGATCCTCAGATAGAGTTAACTAAACAAGTACCACGGGGTAGGC 2881 Query 2819 AGAAGATGGCGCGTAAGACACAGTCGCTGGCTCAACTACAAGCTGCTAGAATTGAAGGTA 2878 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2882 AGAAGATGGCGCGTAAGACACAGTCGCTGGCTCAACTACAAGCTGCTAGAATTGAAGGTA 2941 Query 2879 GCCAGGGCGCTTCAACGAGTCATGTTTGTGATAATAAAGTAAGCTGTCCTCATCATGGCC 2938 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2942 GCCAGGGCGCTTCAACGAGTCATGTTTGTGATAATAAAGTAAGCTGTCCTCATCATGGCC 3001 Query 2939 CTGGAGTGGAAGGAGAAAATCAGAAGGTGGTTGATGTGTTTAGAACTTCCACCCCTGTGG 2998 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3002 CTGGAGTGGAAGGAGAAAATCATAAGGTGGTTGATGTGTTTAGAACTTCCACCCCTGTGG 3061 Query 2999 ATATGGTATCTGTTGGAAACTCTTTGAAGCAGCTACAGTTTGTTGATAAGCGATCTATTG 3058 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3062 ATATTGTATCTGTTGGAAACTCTTTGAAGCAGCTACAGTTTGTTGATAAGCGGTCTATTG 3121 Query 3059 CAGTTTGGCTTACTACTGCAGTTCGGCAACTTGTTGAAGAGCCCCAAAAGAGCAGTGTGA 3118 |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3122 CAGTTTGGATTACTACTGTTGTTCGGCAACTTGTTGAAGAGCCCCAAAAGAGCAGTGTGA 3181 Query 3119 GAGTTGGGCAGTTCAATAGAGGTGCTCCAGTTGAGGAGAAGAACACAATTAGGTGGAAGC 3178 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3182 GAGTTGGGCAGTTCAATAGAGGTGCTCCAGTTGAGGAGAAGAGCACAATTAGGTGGAAGC 3241 Query 3179 TTGGGGCAGACGAGCTATACT-CCATATTATTTCTCTTGGATATCTCTCTTGACTTGGTT 3237 |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3242 TTGGGGCAGACGAGCTAT-CTTCCATATTATTTCTCTTGGATATCTCTCTTGACTTGGTT 3300 Query 3238 TCAG 3241 |||| Sbjct 3301 TCAG 3304 Score = 640 bits (346), Expect = 0.0 Identities = 407/433 (94%), Gaps = 18/433 (4%) Strand=Plus/Plus Query 10 ATGCAAAGGTATCATGCTGCCAACTGCACTAGTGCAGTCAACAATAGTGCTATAGGTGGT 69 ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1 ATGCAAAGGTATCATCCTGCCAACTGCTCTAGTGCAGTCAACAATAGTGCTGTAGGTGGT 60 Query 70 GCATCCGCGAGGGACTCAGGACGAGCTGATTCCTCTTCGATTGGAAACTATTCACTAAAC 129 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 61 GCATCCGCTAGGGACTCAGGACGAGCTGATTCCTCTTCGATTGGAAACTATTCCCTAAAC 120 Query 130 T-C---C------------AG--GAGACCACCACCGTTGACACCCTACAAGTTGAAGTGT 171 | | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TCCAGGCATGTTGATAGAAAGAAGAGACCACCACCGTTGACACCCTACAAGTTGAAGTGT 180 Query 172 GAAAAGGACGGTCTGAATTCCCGATTAGGGCCGCCTGATTTTCATCCTCCAACATCAAAT 231 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 181 GAAAAGGACGGTCTGAATTCCCGATTAGGGCCGCCTGATTTTCATCCTCCTACATCAAAT 240 Query 232 TCTCCCGAAGAGAATCTGACCAAAGAGTATGTTCAATTTGGATACAAGGAAACTGTTGAT 291 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TCTCCCGAAGAGAATCTGACCAAAGAGTACGTTCAATTTGGATACAAGGAAACTGTTGAT 300 Query 292 GGACTTAAGGAATCCGAAGAAATTATATTGTCCCAGGTCCATACTTTCTCAAAGCCTGTT 351 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 301 GGACTTAAGGAATCCGAAGAAATTATATTGTCCCAGGTCCATACTTTCTCAAAGCCTGTT 360 Query 352 GTCCATAAGTGCAAAGAGGCAGTCAGAAAGTGTCTTAGAGCTATCAATGAATCTCGTGCA 411 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 GTCCATAAGTGCAAAGAGGCAGTCAGAAAGTGTCTTAGAGCTATCAATGAATCTCGTGCA 420 Query 412 CTGAAGCGCAAGG 424 |||||||| |||| Sbjct 421 CTGAAGCGTAAGG 433 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 269485674413 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5