BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G03550.1 Length=5835 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg490214 jgi|Araly1|490214|fgenesh2_kg.6__3348__AT4G03550.1 7461 0.0 Ahg490142 jgi|Araly1|490142|fgenesh2_kg.6__3276__AT4G04970.1 209 2e-52 > Ahg490214 jgi|Araly1|490214|fgenesh2_kg.6__3348__AT4G03550.1 Length=5798 Score = 7461 bits (4040), Expect = 0.0 Identities = 4281/4396 (97%), Gaps = 22/4396 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 AGAAACTGAAACGCGGAAAGGAGGCAAAATCTTCTCGTCGTCGTTGTCGCCGTCTTCA-G 59 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| Sbjct 1 AGAAACTGAAACGCGGAAAGGAGGCAAAA-----TCGTC-TC---GTCGCCGTCTTCATC 51 Query 60 AGCTACAAACGAAAAAACTCGCTTCCGTTTCG----ATTTCTCCATTGTTATTGTTTCTT 115 ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || Sbjct 52 AGCTACAAACG--AAAACTCGCTTCCGTTTCGATTTATTTCTCCATTGTTATTG---ATT 106 Query 116 CAGTGAAGCTTTTTTCTTCGAGAAATTTCTAAGATCTACCACATGCTACTATGAGCCTCC 175 |||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 107 CAGTCAAGC-TTTTTCTCCGAGAAATTTCCAAGATCTACCACATGCTACTATGAGCCTCC 165 Query 176 GCCACCGCACCGTCCCGCCGCAAACCGGACGGCCGTTGGCGGCGGAAGCTGTCGGAATCG 235 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| Sbjct 166 GCCACCGCACCGTCCCGCCGCAAACCGGACGGCCGTTGGCGGCGGATGCTGCCGGAATCG 225 Query 236 AAGAGGAGCCGTACAATATCATTCCCGTTAACAATCTCCTCGCCGACCATCCTTCACTCC 295 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| Sbjct 226 AAGAGGAATCGTACAATATCATTCCCGTTAACAACCTCCTCGCCGACCATCCTTCTCTCC 285 Query 296 GTTTTCCCGAGGTTCGTGCCGCCGCTGCTGCTCTTAAAACCGTTGGAGACCTTCGTCGTC 355 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 286 GTTTTCCTGAGGTTCGTGCCGCCGCTGCTGCTCTTAAAACCGTCGGAGACCTTCGTCGTC 345 Query 356 CGCCGTATGTTCAATGGCGTTCTCACTACGATCTCCTCGACTGGCTCGCCTTGTTCTTCG 415 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct 346 CGCCGTATGTTCAATGGCGTTCTCACTACGATCTTCTCGACTGGCTCGCTTTGTTCTTCG 405 Query 416 GTTTCCAGAAAGATAACGTTCGTAACCAGCGTGAGCATATGGTGCTTCATCTCGCAAATG 475 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 406 GTTTCCAGAAAGATAACGTTCGTAACCAGCGTGAGCATATGGTGCTTCATCTCGCGAATG 465 Query 476 CTCAGATGCGTCTCTCTCCGCCGCCGGATAATATTGATTCTCTCGATTCCGCGGTTGTTC 535 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 466 CTCAGATGCGTCTCTCCCCGCCGCCGGATAATATTGATTCTCTCGATTCCGCTGTTGTTC 525 Query 536 GTCGGTTTCGTCGGAAACTTCTCGCTAACTACTCTAGCTGGTGTTCGTATTTGGGGAAAA 595 |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 526 GTCGGTTTCGCCGGAAACTTCTTGGTAACTACTCTAGCTGGTGTTCGTATTTGGGGAAAA 585 Query 596 AATCAAATATCTGGATCTCAGATCGGAACCCTGATTCGAGACGAGAGCTTCTCTATGTTG 655 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 586 AATCAAATATCTGGATCTCAGATCGGAGCCCTGATTCGAGACGAGAGCTTCTCTATGTGG 645 Query 656 GACTCTATCTTCTCATTTGGGGAGAGGCTGCGAATCTTCGGTTCATGCCTGAATGTATCT 715 |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct 646 GACTGTATCTTCTCATATGGGGAGAGGCTGCGAATCTTCGCTTCATGCCTGAATGTATTT 705 Query 716 GTTACATCTTCCATAACATGGCCTCTGAGCTCAACAAAATCTTAGAGGATTGCCTCGATG 775 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 706 GTTACATCTTCCATAACATGGCCTCGGAGCTCAACAAAATCTTAGAGGATTGCCTCGATG 765 Query 776 AGAACACCGGCCAACCTTACTTGCCTTCTCTCTCAGGCGAAAACGCTTTCTT-AACCGGC 834 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| Sbjct 766 AGAACACCGGCCAACCTTATTTGCCTTCTCTCTCAGGCGAAAACGCTTTCTTGAA-CGGC 824 Query 835 GTCGTTAAACCTATTTACGATACTATCCAAGCTGAGATTGATGAGAGCAAGAACGGTACA 894 || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 825 GTGGTTAAACCTATTTACGATACAATTCAAGCTGAGATTGATGAGAGCAAGAACGGTACA 884 Query 895 GTTGCGCATTGTAAGTGGAGGAACTACGACGATATCAATGAGTACTTCTGGACTGATCGG 954 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 885 GTTGCGCATTCTAAGTGGAGGAACTACGACGATATCAACGAGTACTTCTGGACGGATCGA 944 Query 955 TGTTTCAGCAAATTGAAATGGCCGCTTGATTTGGGAAGCAATTTCTTTAAGAGTAGAGGC 1014 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 945 TGTTTCAGCAAACTGAAATGGCCGCTTGATTTGGGAAGCAATTTCTTCAAGAGTAGAGGC 1004 Query 1015 AAAAGTGTAGGGAAAACTGGTTTCGTGGAGCGCAGGACGTTCTTCTACCTTTACAGGAGT 1074 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1005 AAAAGTGTAGGGAAAACTGGTTTCGTGGAGCGCAGGACGTTCTTCTACCTTTACAGGAGT 1064 Query 1075 TTTGATCGACTTTGGGTGATGCTAGCTTTGTTCCTTCAAGCCGCCATTATAGTAGCTTGG 1134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1065 TTTGATCGACTTTGGGTGATGCTAGCTTTGTTCCTTCAAGCCGCCATTATAGTAGCTTGG 1124 Query 1135 GAGGAAAAGCCAGATACCTCGTCGGTAACAAGGCAGCTGTGGAATGCTCTGAAGGCAAGA 1194 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1125 GAGGAAAAGCCAGATAATTCGTCGGTAACAAGGCAGCTGTGGAATGCTTTGAAGGCAAGA 1184 Query 1195 GATGTTCAGGTGAGACTATTGACCGTGTTCTTGACATGGAGTGGTATGCGACTCTTGCAG 1254 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1185 GATGTTCAGGTGAGACTTTTGACCGTGTTCTTGACATGGAGTGGTATGCGACTCTTGCAG 1244 Query 1255 GCTGTGCTGGACGCGGCTTCACAATATCCCCTCGTTTCCAGAGAGACCAAAAGGCATTTT 1314 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1245 GCTATGCTGGACGCGGCTTCACAATATCCCCTCATTTCCAGAGAGACCAAAAGGCACTTT 1304 Query 1315 TTCAGAATGCTGATGAAGGTTATAGCTGCCGCAGTTTGGATTGTAGCTTTCACTGTCCTC 1374 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1305 TTCAGAATGCTGATGAAGGTTATAGCTGCCGCAGTTTGGATTGTAGCTTTCACAGTCCTC 1364 Query 1375 TACACTAACATCTGGAAGCAGAAGAGGCAAGACAGGCAGTGGTCCAATGCCGCGACGACT 1434 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1365 TACACTAACATCTGGAAGCAGAAGAGGCAAGACAGGCAGTGGTCCAATACCGCGACGACT 1424 Query 1435 AAGATATACCAATTCCTTTACGCTGTGGGGGCCTTCTTGGTGCCCGAAATCCTGGCTTTG 1494 ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| Sbjct 1425 AAGATCTACCAATTCCTTTACGCTGTGGTGGCCTTCTTGGTGCCTGAAATTCTTGCTTTG 1484 Query 1495 GCTTTGTTTATTATCCCATGGATGAGAAACTTCCTGGAAGAGACCAATTGGAAAATATTC 1554 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1485 GCTTTGTTTATAATCCCATGGATGAGAAACTTCCTGGAAGAGACCAATTGGAAAATATTC 1544 Query 1555 TTTGCTCTAACTTGGTGGTTTCAAGGCAAAAGCTTTGTGGGTCGAGGTTTGAGAGAGGGT 1614 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1545 TTTGCTTTAACTTGGTGGTTTCAAGGCAAAAGCTTTGTGGGTCGAGGTTTGAGAGAGGGT 1604 Query 1615 TTAGTGGACAACATCAAGTACTCGACTTTCTGGATCTTTGTCCTAGCTACAAAGTTTACA 1674 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1605 TTAGTGGACAACATCAAGTACTCGACTTTCTGGATCTTTGTCCTAGCTACGAAGTTTACA 1664 Query 1675 TTTAGTTACTTCCTGCAGGTTAAGCCAATGATTAAACCCTCAAAGCTGCTATGGAACTTA 1734 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1665 TTTAGTTACTTCCTGCAGGTTAAGCCAATGATTAAACCCTCAAAGCTGCTATGGAACTTA 1724 Query 1735 AAGGATGTCGATTATGAGTGGCATCAGTTTTATGGAGACAGCAATAGGTTTTCTGTCGCA 1794 || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1725 AACGATGTCAAATATGAGTGGCATCAGTTTTATGGAGACAGCAATAGGTTTTCTGTCGCA 1784 Query 1795 TTGTTATGGTTGCCAGTTGTGTTGATATATCTGATGGATATCCAAATTTGGTACGCAATC 1854 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1785 TTGTTATGGTTGCCAGTTGTGTTGATATATCTGATGGATATCCAAATTTGGTACGCAATC 1844 Query 1855 TATTCTTCGATTGTTGGTGCTGTTGTTGGGCTGTTTGATCATCTGGGGGAGATCAGGGAC 1914 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1845 TATTCTTCGATTGTTGGTGCTGTTGTTGGGCTATTTGATCATCTGGGGGAGATCAGGGAC 1904 Query 1915 ATGGGACAGCTGAGGCTAAGGTTTCAATTCTTTGCTAGTGCTATTCAATTCAACCTAATG 1974 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1905 ATGGGACAGCTTAGGCTAAGGTTTCAATTCTTTGCTAGTGCTATTCAGTTCAACCTAATG 1964 Query 1975 CCTGAGGAACAACTCCTGAATGCTAGAGGCTTTGGTAACAAGTTCAAGGACGGCATTCAT 2034 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1965 CCTGAGGAACAACTCCTGAATGCTAGAGGCTTTGGTAACAAGTTCAAGGACGGCATTCAT 2024 Query 2035 AGATTGAAGCTAAGGTATGGATTTGGGAGGCCGTTTAAGAAACTTGAGTCGAATCAGGTC 2094 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2025 AGATTGAAGCTAAGGTATGGATTTGGGAGGCCGTTTAAGAAACTCGAGTCGAATCAGGTC 2084 Query 2095 GAGGCCAACAAGTTTGCGTTGATCTGGAACGAAATCATCTTAGCTTTCAGAGAAGAGGAT 2154 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2085 GAGGCCAACAAGTTTGCGTTGATCTGGAACGAAATCATCTTAGCTTTCAGAGAAGAGGAT 2144 Query 2155 ATAGTTTCTGATCGTGAAGTAGAGCTACTGGAGCTGCCAAAGAATTCCTGGGATGTGACG 2214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2145 ATAGTTTCTGATCGTGAAGTAGAGCTACTGGAGCTGCCAAAGAATTCCTGGGATGTGACG 2204 Query 2215 GTTATTCGCTGGCCGTGTTTCTTGTTGTGCAATGAGCTTTTGCTTGCACTGAGCCAGGCC 2274 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2205 GTTATTCGCTGGCCGTGTTTCTTGTTGTGCAATGAGCTTTTGCTTGCACTGAGCCAGGCC 2264 Query 2275 AGAGAGCTGATAGACGCACCTGATAAATGGCTGTGGCACAAAATATGCAAGAATGAATAC 2334 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2265 AGAGAGCTGATAGACGCACCTGATAAATGGCTGTGGCACAAAATATGCAAGAATGAATAC 2324 Query 2335 AGGCGTTGTGCTGTAGTTGAGGCATATGACAGCATCAAACATCTATTGCTCTCAATCATC 2394 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2325 AGGCGTTGTGCTGTAGTTGAGGCATATGACAGCATCAAACATCTATTGCTCTCAATCATC 2384 Query 2395 AAAGTTGACACTGAAGAACATTCGATAATTACGGTCTTCTTTCAGATAATTAATCAGTCC 2454 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 2385 AAAGTTGACACTGAAGAACATTCGATAATTACGGTCTTCTTTCAGATGATTAATCAATCC 2444 Query 2455 ATTCAGTCAGAGCAGTTCACCAAGACCTTTAGAGTGGACCTGCTGCCAAAAATTTATGAA 2514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2445 ATTCAGTCAGAGCAGTTCACCAAGACCTTTAGAGTGGACCTGCTGCCAAAAATTTACGAA 2504 Query 2515 ACACTGCAGAAATTGGTTGGGCTGGTAAATGATGAGGAAACAGATAGTGGGCGGGTGGTG 2574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2505 ACACTGCAGAAATTGGTTGGGCTGGTAAATGATGAGGAAACAGATAGTGGGCGGGTGGTG 2564 Query 2575 AATGTTCTGCAGTCTCTTTATGAGATTGCAACTCGACAGTTCTTTATAGAGAAGAAGACA 2634 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2565 AATGTTCTGCAGTCTCTTTATGAGATTGCAACTCGACAGTTCTTTATAGAGAAGAAGACA 2624 Query 2635 ACTGAACAGCTATCTAATGAAGGTTTAACTCCTCGAGACCCAGCCTCAAAGTTGCTGTTT 2694 ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2625 ACTGAACAGCTATCTAATGAAGGCTTGACTCCTCGAGACCCAGCCTCAAAGTTGCTGTTT 2684 Query 2695 CAAAATGCTATTAGGCTTCCTGATGCAAGCAATGAAGACTTCTACCGGCAGGTTAGGCGT 2754 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2685 CAAAATGCTATTAGGCTTCCTGATGCAAGCAATGAAGACTTCTACCGGCAGGTTAGGCGT 2744 Query 2755 TTACACACGATTCTCACCTCTAGGGACTCTATGCACAGCGTCCCTGTGAATCTAGAGGCG 2814 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2745 TTACACACGATTCTCACCTCTAGGGACTCTATGCACAGCGTCCCTGTGAATCTAGAGGCG 2804 Query 2815 AGACGGCGGATTGCTTTCTTCAGTAATTCGCTTTTCATGAACATGCCTCATGCCCCTCAG 2874 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2805 AGACGGCGGATTGCTTTCTTCAGTAATTCGCTTTTCATGAACATGCCTCATGCCCCTCAG 2864 Query 2875 GTTGAGAAAATGATGGCGTTCAGTGTTCTGACTCCATATTACAGTGAGGAAGTTGTATAC 2934 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2865 GTTGAGAAAATGATGGCGTTCAGTGTTCTGACTCCATATTACAATGAGGAAGTTGTATAC 2924 Query 2935 AGCAAAGAACAGCTCCGAAATGAGACTGAGGATGGGATTTCCACCCTATACTACCTGCAG 2994 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2925 AGCAAAGAACAGCTCCGAAATGAGACTGAGGATGGGATTTCCACCCTATACTACCTGCAG 2984 Query 2995 ACAATTTATGCTGATGAATGGAAAAATTTCAAGGAACGGATGCATAGGGAAGGAATCAAG 3054 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2985 ACAATTTATGCTGATGAATGGAAAAATTTCAAGGAACGGATGCATAGGGAAGGAATCAAG 3044 Query 3055 ACAGATAGTGAGTTGTGGACAACCAAGCTGAGAGACCTCAGGCTTTGGGCTTCCTACAGA 3114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3045 ACAGATAGTGAGTTGTGGACAACCAAGCTGAGAGACCTCAGGCTTTGGGCTTCCTACAGA 3104 Query 3115 GGTCAGACATTGGCACGTACAGTTCGTGGGATGATGTACTACTACCGGGCTCTTAAGATG 3174 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3105 GGTCAGACATTGGCACGTACAGTTCGTGGGATGATGTACTACTACCGGGCTCTTAAGATG 3164 Query 3175 CTCGCTTTTCTTGACTCTGCGTCTGAAATGGACATTCGGGAGGGTGCTCAGGAGCTTGGT 3234 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3165 CTCGCTTTTCTTGACTCTGCGTCTGAAATGGACATTCGGGAGGGTGCTCAGGAGCTTGGT 3224 Query 3235 TCAGTGAGGAATTTGCAGGGAGAACTGGGTGGTCAATCTGATGGGTTTGTCTCTGAAAAC 3294 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3225 TCAGTGAGGAGTTTGCAGGGAGAACTGGGTGGTCAATCTGATGGGTTTGTCTCTGAAAAC 3284 Query 3295 GACCGATCTTCCTTAAGCAGAGCAAGTAGTTCCGTGAGTACGCTGTATAAAGGCCATGAG 3354 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3285 GACCGATCTTCCTTACGCAGAGCAAGTAGTTCCGTGAGTACGCTGTATAAAGGCCATGAG 3344 Query 3355 TATGGGACTGCATTGATGAAATTCACATATGTTGTGGCGTGTCAGATCTACGGGTCTCAA 3414 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| Sbjct 3345 TACGGGACTGCATTGATGAAATTCACATATGTTGTGGCGAGCCAGATCTATGGGTCTCAA 3404 Query 3415 AAAGCAAAGAAAGAGCCTCAGGCAGAGGAAATTCTGTATCTGATGAAGCAGAACGAAGCT 3474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3405 AAAGCAAAGAAAGAGCCTCAGGCAGAGGAAATTCTGTATCTGATGAAGCAGAACGAAGCT 3464 Query 3475 CTCCGTATTGCATATGTGGATGAGGTGCCTGCGGGAAGAGGAGAGACTGATTATTACTCC 3534 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3465 CTCCGTATTGCATATGTGGATGAGGTGCCTGCGGGAAGAGGAGAGACTGATTATTACTCC 3524 Query 3535 GTTCTGGTGAAATACGATCACCAGTTGGAGAAGGAAGTGGAAATATTCCGTGTGAAGCTA 3594 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3525 GTTCTGGTGAAATACGATCACCAGTTGGAAAAGGAAGTGGAGATATTCCGTGTGAAGCTA 3584 Query 3595 CCTGGTCCAGTGAAGCTGGGCGAGGGAAAGCCAGAGAACCAGAATCATGCAATGATCTTT 3654 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3585 CCTGGTCCGGTGAAGCTGGGTGAGGGAAAGCCAGAGAACCAGAATCATGCAATGATCTTT 3644 Query 3655 ACCCGTGGTGATGCTGTTCAGACCATTGATATGAACCAAGACAGTTATTTTGAGGAAGCT 3714 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3645 ACCCGTGGTGATGCTGTTCAGACCATTGATATGAACCAAGACAGCTATTTTGAGGAAGCT 3704 Query 3715 CTCAAGATGAGAAATTTGCTCCAGGAGTACAACCATTATCATGGTATCAGAAAACCAACT 3774 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3705 CTCAAGATGAGAAATTTGCTCCAGGAGTACAAACATTATCATGGTATCAGAAAACCAACT 3764 Query 3775 ATTCTTGGTGTCAGGGAGCATATCTTCACGGGATCAGTCTCGTCACTGGCGTGGTTCATG 3834 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3765 ATTCTTGGTGTCAGGGAGCATATCTTCACGGGATCAGTCTCGTCACTGGCGTGGTTCATG 3824 Query 3835 TCTGCTCAGGAGACAAGTTTTGTCACTCTTGGTCAGCGTGTTCTTGCAAACCCACTGAAG 3894 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3825 TCTGCTCAGGAGACAAGTTTTGTCACTCTTGGTCAGCGTGTTCTTGCAAACCCGCTGAAG 3884 Query 3895 GTCAGAATGCATTATGGCCACCCTGATGTATTTGACAGATTCTGGTTCTTGAGTCGAGGC 3954 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3885 GTCAGAATGCATTATGGCCACCCTGATGTATTTGACAGATTCTGGTTCTTGAGTCGAGGC 3944 Query 3955 GGCATCAGTAAGGCTTCCAGAGTTATAAATATCAGTGAGGACATCTTTGCCGGGTTTAAC 4014 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3945 GGCATCAGCAAGGCTTCCAGAGTTATAAATATCAGTGAGGACATCTTTGCCGGGTTTAAT 4004 Query 4015 TGCACGTTAAgggggggAAACGTCACCCACCACGAGTACATTCAGGTCGGGAAGGGACGG 4074 ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4005 TGCACATTGAGGGGCGGAAACGTCACCCACCACGAGTACATTCAGGTCGGGAAGGGTCGG 4064 Query 4075 GATGTTGGATTGAATCAGATATCAATGTTTGAGGCTAAGGTAGCCAGTGGGAACGGAGAG 4134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 4065 GATGTTGGATTGAATCAGATATCAATGTTTGAGGCTAAGGTAGCTAGTGGGAACGGAGAG 4124 Query 4135 CAGGTTCTCAGCCGAGATGTGTACCGGCTCGGGCACAGGCTTGATTTCTTCAGAATGTTA 4194 |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4125 CAGGTTCTTAGCCGAGACGTGTACCGGCTCGGTCACAGGCTTGATTTCTTCAGAATGTTA 4184 Query 4195 TCATTTTTCTACACAACTGTAGGGTTTTTCTTCAACACAATGATGGTCATTCTTACTGTT 4254 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 4185 TCATTTTTCTACACAACTGTAGGGTTTTTCTTCAACACGATGATGGTCATTCTTACTGTT 4244 Query 4255 TACGCTTTCCTCTGGGGACGGGTTTATCTGGCTCTCAGCGGGGTTGAGAAGTCCGCTCTA 4314 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4245 TACGCTTTCCTCTGGGGACGGGTTTATCTGGCTCTCAGCGGGGTTGAGAAGTCCGCTCTA 4304 Query 4315 GCAGACAGTACGGACACCAACGCCGCGCTTGGGGTGATCCTGAACCAGCAGTTCATCATT 4374 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4305 GCAGACAGTACGGACAGCAACGCCGCGCTTGGGGTGATCCTGAACCAGCAGTTCATCATT 4364 Query 4375 CAGCTCGGTCTGTTCA 4390 |||||||||||||||| Sbjct 4365 CAGCTCGGTCTGTTCA 4380 Score = 2230 bits (1207), Expect = 0.0 Identities = 1361/1430 (95%), Gaps = 32/1430 (2%) Strand=Plus/Plus Query 4426 GAGGGTTTCCTTCTAGCGATATGGAATTTCATTCGAATGCAGATTCAGCTTTCAGCTGTC 4485 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4381 GAGGG-TTCCTTCTAGCGATATGGAATTTCATTCGAATGCAGATTCAGCTTTCAGCTGTC 4439 Query 4486 TTCTACACATTCTCAATGGGGACCAGAGCTCACTATTTCGGTCGAACTATTCTCCATGGT 4545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4440 TTCTACACATTCTCAATGGGGACCAGAGCTCACTATTTCGGTCGAACTATTCTCCATGGT 4499 Query 4546 GGGGCCAAGTATAGAGCCACTGGACGTGGATTTGTTGTCGAGCACAAGGGATTCACTGAG 4605 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4500 GGGGCAAAGTATAGAGCCACTGGACGTGGATTTGTTGTCGAGCACAAGGGATTCACTGAG 4559 Query 4606 AACTACCGACTGTATGCACGCAGTCACTTTGTGAAGGCCATCGAGCTTGGGCTGATCCTC 4665 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4560 AACTACCGACTGTATGCACGCAGTCACTTTGTGAAGGCCATCGAGCTTGGGCTGATCCTC 4619 Query 4666 ATAGTCTACGCTTCGCACAGTCCGATTGCCAAAGACTCGTTGATTTACATAGCCATGACT 4725 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4620 ATAGTCTACGCTTCGCACAGTCCGATTGCCAAAGACTCGTTGATTTACATAGCCATGACT 4679 Query 4726 ATCACCAGCTGGTTTCTTGTGATTTCATGGATAATGGCCCCATTTGTGTTTAACCCATCA 4785 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4680 ATCACCAGCTGGTTCCTTGTGATTTCATGGATAATGGCCCCATTTGTGTTTAACCCATCA 4739 Query 4786 GGATTCGACTGGCTTAAGACAGTCTATGACTTTGAAGACTTCATGAACTGGATCTGGTAC 4845 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 4740 GGATTCGACTGGCTTAAGACAGTCTACGACTTTGAAGACTTTATGAATTGGATCTGGTAC 4799 Query 4846 CAAGGCAGAATCTCAACGAAATCTGAACAAAGCTGGGAAAAATGGTGGTACGAGGAACAG 4905 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4800 CAAGGCAGAATCTCAACGAAATCTGAACAAAGCTGGGAAAAATGGTGGTACGAGGAACAG 4859 Query 4906 GACCACCTGAGAAACACCGGGAAGGC-AGGATTATTTGTGGAGATCATCTTGGTCCTCCG 4964 ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 4860 GACCACCTGAGAAACACCGGGC-GGTTAGGAATATTTGTGGAGATCATCTTGGACCTCCG 4918 Query 4965 GTTTTTCTTCTTCCAGTATGGGATTGTATACCAGCTTAAAATTGCAAACGGATCCACCAG 5024 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4919 GTTTTTCTTCTTTCAGTATGGGATTGTATACCAGCTCAAAATTGCAAACGGATCCACCAG 4978 Query 5025 CCTTTTTGTCTACTTGTTCTCATGGATATACATCTTTGCTATATTTGTGCTCTTCCTAGT 5084 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4979 CTTTTTTGTCTACTTGTTCTCATGGATATACATCTTTGCTATATTTGTGCTCTTCCTAGT 5038 Query 5085 CATCCAATACGCCCGTGACAAGTACTCGGCAAAAGCTCACATACGGTACAGGCTTGTCCA 5144 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5039 AATCCAATACGCCCGTGACAAGTACTCTGCAAAAGCTCACATACGGTACAGGCTTGTCCA 5098 Query 5145 ATTCCTCCTGATCGTGCTTGCTATACTGGTGATTGTTGCTTTGCTCGAGTTCACGCATTT 5204 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 5099 ATTCCTCCTGATCGTGTTTGCTATACTGGTGATTGTTGCTTTGCTTGAGTTCACGCATTT 5158 Query 5205 CAGCTTCATCGATATCTTCACAAGCCTTCTTGCATTCATCCCAACTGGCTGGGGAATTCT 5264 ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5159 CAGCTTCATCGATATCTTCACGAGTCTTCTTGCATTCATCCCAACTGGCTGGGGAATTCT 5218 Query 5265 GCTGATCGCACAGACTCAAAGGAAGT-GGCTGAAGAATTACACTATTTTCTGGAATGCTG 5323 |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||| Sbjct 5219 GCTGATCGCACAGACTCAAAGGG-GTTGGCTGAAGAAATACAGTATTTTCTGGAATGCTG 5277 Query 5324 TTGTCTCTGTTGCTCGCATGTATGACATATTGTTTGGGATACTCATAATGGTTCCAGTAG 5383 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5278 TTGTCTCTGTTGCTCGCATGTATGACATATTGTTTGGGATACTCATAATGGTTCCAGTAG 5337 Query 5384 CGTTCTTGTCATGGATGCCTGGATTCCAGTCAATGCAAACGAGGATATTATTCAATGAAG 5443 |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5338 CGTTCTTGTCGTGGATGCCTGGATTCCAATCAATGCAAACGAGGATATTATTCAATGAAG 5397 Query 5444 CTTTTAGCAGAGGACTTCGCATCATGCAGATTGTCACTGGGAAGAAATCAAAAGGCGATG 5503 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5398 CTTTTAGCAGAGGACTTCGCATCATGCAGATTGTCACTGGGAAGAAATCAAAAGGCGATG 5457 Query 5504 TCTAAGTTTAAAAAACGGTCTTAAGAAGTAAATGGTAGTTCAAATCCTATTGGTATGTGG 5563 ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || Sbjct 5458 TCTAAGTTTAAAAAATGGTCTTAAGAAGTAAATGATAGTTCAAATCCTATTGGTATGCGG 5517 Query 5564 CGAAGGAATCAGTTGGAGGTT-T-TT--GGAGAGTTTGGTTGGATGAGGAATCGGGAAGT 5619 |||||||||| |||||||||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||||| Sbjct 5518 CGAAGGAATCTGTTGGAGGTTGTATTTTGGAGAG---GGT-GGATGAGGAATCGGGAAGT 5573 Query 5620 TGGTTTGATTCGGTTA--GATGGGTTTAG-------G-GAGATATTTGATTGTCAGTGTG 5669 |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||| Sbjct 5574 TGGTTT-ATTCGGTTATAGATGGGTTTAGTCATTTAGTGAGATATTTTATCGTCAGTGTG 5632 Query 5670 TGTGGAGGGAACTCTGATTCTTGTATGGTTTTTGTTCTAAAGGTACAGCAATTTGTGTAG 5729 |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| Sbjct 5633 TGTGGAGG-AACTCTGATTCTTGTATGGTTTT-GT-CTAAAGGTAGAGCAATTTGTGTAG 5689 Query 5730 TGAGG-CTTT-GTGTATTTGTTCTCCTTCTCTCATTATAGAGCTTTAGAGCATTTTTAGT 5787 | ||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 5690 T-AGGGCTTTTGTGTATTTGTTCTCCTTCTCTCGTTGTAGAGCTTTAGAGCATTTTTAGT 5748 Query 5788 TTAT-ATTC-AGATTGTTATCTAATGTCATCTCGCAGAGCTTTTGTTCAC 5835 |||| |||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| Sbjct 5749 TTATTATTCCAGTTTGCCATCTAATGTCATTTCGCAGAGCATTTGTTCAC 5798 > Ahg490142 jgi|Araly1|490142|fgenesh2_kg.6__3276__AT4G04970.1 Length=5657 Score = 209 bits (113), Expect = 2e-52 Identities = 373/494 (76%), Gaps = 35/494 (7%) Strand=Plus/Plus Query 3351 TGAGTATGGGACTGCATTGATGAAATTCACATATGTTGTGGCGTGTCA-GATCTACGGGT 3409 ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || Sbjct 3165 TGAGTATGGGAGTGCAATGATGAAATTCACATATGTTGTGGCGTGTCAAGTT-TATGGA- 3222 Query 3410 CT-CAAAAAGCAAAGAAAG-AGCC-TCAG-GCAGAGGAAATTCTGTATC-TGATGAAGCA 3464 | || ||||||| || | | || | || || ||||| ||||||| || ||||||| | Sbjct 3223 CAGCATAAAGCAA-GAGGGGA-CCAT-AGAGCTGAGGAGATTCTGT-TCCTGATGAAAAA 3278 Query 3465 GAACGAAGCTCTCCGTATTGCATATGTGGATGAGGT-GCCTGCGGGAAGAGGAGAGACTG 3523 | || || || |||||||||||||| |||||||| | | |||||| |||| | | | Sbjct 3279 TCATGAGGCCCTTCGTATTGCATATGTTGATGAGGTCGAGTT-GGGAAG-GGAG-GTC-G 3334 Query 3524 ATTATTACTCCGTTCTGGTGAAATACGATCACCAG-TTGGAGAAG-GAAGTGGAAATAT- 3580 | || ||||| ||||| ||||||| ||||| || || | ||| || ||||| || | Sbjct 3335 AGTACTACTCGGTTCTTGTGAAATTTGATCAACAACTTC-A-AAGAGAGGTGGAGATCTA 3392 Query 3581 TCCGTGTGA-AGCTACCTGGTCCAGTGAAGCTGGGCGAGGGAAAGCCAGAGAACCAGAAT 3639 || || | | | || || || || ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || Sbjct 3393 TC-GTATCAGA-CTGCCAGGCCCCTTGAAGCTTGGCGAGGGAAAACCAGAAAACCAAAAC 3450 Query 3640 CATGCAATGATCTTTACCCGTGGTGATGCTGTT-CAGACCATTGATATGAACCAAGACAG 3698 ||||| | |||||||| || || ||||| | | ||||||||||||||||| ||||| | Sbjct 3451 CATGCTCTAATCTTTACACGAGGAGATGC-GATACAGACCATTGATATGAATCAAGATAA 3509 Query 3699 TTATTTTGAGGAAGCTCTCAAGATGAGAAATTTGCTCCAGG-AGTACAAC-CATTA-TCA 3755 |||||||||| ||||| |||||||| || ||| | | | | ||| | ||| | | Sbjct 3510 CCATTTTGAGGAGGCTCTTAAGATGAGGAACTTGTTGGAATCATT-CAAGAC-TTACT-A 3566 Query 3756 TGGTATCAGAAAACCAACTATTCTTGGTGTCAGGGAGCATA-TCTTCACGGGATCAGTCT 3814 ||| || || || || ||||||||||| ||| | ||| | | | ||||| || ||||| | Sbjct 3567 TGGCATTAGGAAGCCTACTATTCTTGGAGTCCGTGAGAA-AGTTTTCACTGGTTCAGTTT 3625 Query 3815 CGTCACTGGCGTGG 3828 | |||||||| ||| Sbjct 3626 CTTCACTGGCATGG 3639 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 221038383984 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5