BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT4G03550.1

Length=5835
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg490214 jgi|Araly1|490214|fgenesh2_kg.6__3348__AT4G03550.1        7461    0.0  
  Ahg490142 jgi|Araly1|490142|fgenesh2_kg.6__3276__AT4G04970.1         209    2e-52


> Ahg490214 jgi|Araly1|490214|fgenesh2_kg.6__3348__AT4G03550.1
Length=5798

 Score = 7461 bits (4040),  Expect = 0.0
 Identities = 4281/4396 (97%), Gaps = 22/4396 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     AGAAACTGAAACGCGGAAAGGAGGCAAAATCTTCTCGTCGTCGTTGTCGCCGTCTTCA-G  59
             |||||||||||||||||||||||||||||     ||||| ||   |||||||||||||  
Sbjct  1     AGAAACTGAAACGCGGAAAGGAGGCAAAA-----TCGTC-TC---GTCGCCGTCTTCATC  51

Query  60    AGCTACAAACGAAAAAACTCGCTTCCGTTTCG----ATTTCTCCATTGTTATTGTTTCTT  115
             |||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    ||
Sbjct  52    AGCTACAAACG--AAAACTCGCTTCCGTTTCGATTTATTTCTCCATTGTTATTG---ATT  106

Query  116   CAGTGAAGCTTTTTTCTTCGAGAAATTTCTAAGATCTACCACATGCTACTATGAGCCTCC  175
             |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  107   CAGTCAAGC-TTTTTCTCCGAGAAATTTCCAAGATCTACCACATGCTACTATGAGCCTCC  165

Query  176   GCCACCGCACCGTCCCGCCGCAAACCGGACGGCCGTTGGCGGCGGAAGCTGTCGGAATCG  235
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct  166   GCCACCGCACCGTCCCGCCGCAAACCGGACGGCCGTTGGCGGCGGATGCTGCCGGAATCG  225

Query  236   AAGAGGAGCCGTACAATATCATTCCCGTTAACAATCTCCTCGCCGACCATCCTTCACTCC  295
             |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  226   AAGAGGAATCGTACAATATCATTCCCGTTAACAACCTCCTCGCCGACCATCCTTCTCTCC  285

Query  296   GTTTTCCCGAGGTTCGTGCCGCCGCTGCTGCTCTTAAAACCGTTGGAGACCTTCGTCGTC  355
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  286   GTTTTCCTGAGGTTCGTGCCGCCGCTGCTGCTCTTAAAACCGTCGGAGACCTTCGTCGTC  345

Query  356   CGCCGTATGTTCAATGGCGTTCTCACTACGATCTCCTCGACTGGCTCGCCTTGTTCTTCG  415
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  346   CGCCGTATGTTCAATGGCGTTCTCACTACGATCTTCTCGACTGGCTCGCTTTGTTCTTCG  405

Query  416   GTTTCCAGAAAGATAACGTTCGTAACCAGCGTGAGCATATGGTGCTTCATCTCGCAAATG  475
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  406   GTTTCCAGAAAGATAACGTTCGTAACCAGCGTGAGCATATGGTGCTTCATCTCGCGAATG  465

Query  476   CTCAGATGCGTCTCTCTCCGCCGCCGGATAATATTGATTCTCTCGATTCCGCGGTTGTTC  535
             |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  466   CTCAGATGCGTCTCTCCCCGCCGCCGGATAATATTGATTCTCTCGATTCCGCTGTTGTTC  525

Query  536   GTCGGTTTCGTCGGAAACTTCTCGCTAACTACTCTAGCTGGTGTTCGTATTTGGGGAAAA  595
             |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  526   GTCGGTTTCGCCGGAAACTTCTTGGTAACTACTCTAGCTGGTGTTCGTATTTGGGGAAAA  585

Query  596   AATCAAATATCTGGATCTCAGATCGGAACCCTGATTCGAGACGAGAGCTTCTCTATGTTG  655
             ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  586   AATCAAATATCTGGATCTCAGATCGGAGCCCTGATTCGAGACGAGAGCTTCTCTATGTGG  645

Query  656   GACTCTATCTTCTCATTTGGGGAGAGGCTGCGAATCTTCGGTTCATGCCTGAATGTATCT  715
             |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct  646   GACTGTATCTTCTCATATGGGGAGAGGCTGCGAATCTTCGCTTCATGCCTGAATGTATTT  705

Query  716   GTTACATCTTCCATAACATGGCCTCTGAGCTCAACAAAATCTTAGAGGATTGCCTCGATG  775
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  706   GTTACATCTTCCATAACATGGCCTCGGAGCTCAACAAAATCTTAGAGGATTGCCTCGATG  765

Query  776   AGAACACCGGCCAACCTTACTTGCCTTCTCTCTCAGGCGAAAACGCTTTCTT-AACCGGC  834
             ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct  766   AGAACACCGGCCAACCTTATTTGCCTTCTCTCTCAGGCGAAAACGCTTTCTTGAA-CGGC  824

Query  835   GTCGTTAAACCTATTTACGATACTATCCAAGCTGAGATTGATGAGAGCAAGAACGGTACA  894
             || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  825   GTGGTTAAACCTATTTACGATACAATTCAAGCTGAGATTGATGAGAGCAAGAACGGTACA  884

Query  895   GTTGCGCATTGTAAGTGGAGGAACTACGACGATATCAATGAGTACTTCTGGACTGATCGG  954
             |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| 
Sbjct  885   GTTGCGCATTCTAAGTGGAGGAACTACGACGATATCAACGAGTACTTCTGGACGGATCGA  944

Query  955   TGTTTCAGCAAATTGAAATGGCCGCTTGATTTGGGAAGCAATTTCTTTAAGAGTAGAGGC  1014
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  945   TGTTTCAGCAAACTGAAATGGCCGCTTGATTTGGGAAGCAATTTCTTCAAGAGTAGAGGC  1004

Query  1015  AAAAGTGTAGGGAAAACTGGTTTCGTGGAGCGCAGGACGTTCTTCTACCTTTACAGGAGT  1074
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1005  AAAAGTGTAGGGAAAACTGGTTTCGTGGAGCGCAGGACGTTCTTCTACCTTTACAGGAGT  1064

Query  1075  TTTGATCGACTTTGGGTGATGCTAGCTTTGTTCCTTCAAGCCGCCATTATAGTAGCTTGG  1134
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1065  TTTGATCGACTTTGGGTGATGCTAGCTTTGTTCCTTCAAGCCGCCATTATAGTAGCTTGG  1124

Query  1135  GAGGAAAAGCCAGATACCTCGTCGGTAACAAGGCAGCTGTGGAATGCTCTGAAGGCAAGA  1194
             ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1125  GAGGAAAAGCCAGATAATTCGTCGGTAACAAGGCAGCTGTGGAATGCTTTGAAGGCAAGA  1184

Query  1195  GATGTTCAGGTGAGACTATTGACCGTGTTCTTGACATGGAGTGGTATGCGACTCTTGCAG  1254
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1185  GATGTTCAGGTGAGACTTTTGACCGTGTTCTTGACATGGAGTGGTATGCGACTCTTGCAG  1244

Query  1255  GCTGTGCTGGACGCGGCTTCACAATATCCCCTCGTTTCCAGAGAGACCAAAAGGCATTTT  1314
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  1245  GCTATGCTGGACGCGGCTTCACAATATCCCCTCATTTCCAGAGAGACCAAAAGGCACTTT  1304

Query  1315  TTCAGAATGCTGATGAAGGTTATAGCTGCCGCAGTTTGGATTGTAGCTTTCACTGTCCTC  1374
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1305  TTCAGAATGCTGATGAAGGTTATAGCTGCCGCAGTTTGGATTGTAGCTTTCACAGTCCTC  1364

Query  1375  TACACTAACATCTGGAAGCAGAAGAGGCAAGACAGGCAGTGGTCCAATGCCGCGACGACT  1434
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1365  TACACTAACATCTGGAAGCAGAAGAGGCAAGACAGGCAGTGGTCCAATACCGCGACGACT  1424

Query  1435  AAGATATACCAATTCCTTTACGCTGTGGGGGCCTTCTTGGTGCCCGAAATCCTGGCTTTG  1494
             ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||
Sbjct  1425  AAGATCTACCAATTCCTTTACGCTGTGGTGGCCTTCTTGGTGCCTGAAATTCTTGCTTTG  1484

Query  1495  GCTTTGTTTATTATCCCATGGATGAGAAACTTCCTGGAAGAGACCAATTGGAAAATATTC  1554
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1485  GCTTTGTTTATAATCCCATGGATGAGAAACTTCCTGGAAGAGACCAATTGGAAAATATTC  1544

Query  1555  TTTGCTCTAACTTGGTGGTTTCAAGGCAAAAGCTTTGTGGGTCGAGGTTTGAGAGAGGGT  1614
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1545  TTTGCTTTAACTTGGTGGTTTCAAGGCAAAAGCTTTGTGGGTCGAGGTTTGAGAGAGGGT  1604

Query  1615  TTAGTGGACAACATCAAGTACTCGACTTTCTGGATCTTTGTCCTAGCTACAAAGTTTACA  1674
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  1605  TTAGTGGACAACATCAAGTACTCGACTTTCTGGATCTTTGTCCTAGCTACGAAGTTTACA  1664

Query  1675  TTTAGTTACTTCCTGCAGGTTAAGCCAATGATTAAACCCTCAAAGCTGCTATGGAACTTA  1734
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1665  TTTAGTTACTTCCTGCAGGTTAAGCCAATGATTAAACCCTCAAAGCTGCTATGGAACTTA  1724

Query  1735  AAGGATGTCGATTATGAGTGGCATCAGTTTTATGGAGACAGCAATAGGTTTTCTGTCGCA  1794
             || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1725  AACGATGTCAAATATGAGTGGCATCAGTTTTATGGAGACAGCAATAGGTTTTCTGTCGCA  1784

Query  1795  TTGTTATGGTTGCCAGTTGTGTTGATATATCTGATGGATATCCAAATTTGGTACGCAATC  1854
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1785  TTGTTATGGTTGCCAGTTGTGTTGATATATCTGATGGATATCCAAATTTGGTACGCAATC  1844

Query  1855  TATTCTTCGATTGTTGGTGCTGTTGTTGGGCTGTTTGATCATCTGGGGGAGATCAGGGAC  1914
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1845  TATTCTTCGATTGTTGGTGCTGTTGTTGGGCTATTTGATCATCTGGGGGAGATCAGGGAC  1904

Query  1915  ATGGGACAGCTGAGGCTAAGGTTTCAATTCTTTGCTAGTGCTATTCAATTCAACCTAATG  1974
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  1905  ATGGGACAGCTTAGGCTAAGGTTTCAATTCTTTGCTAGTGCTATTCAGTTCAACCTAATG  1964

Query  1975  CCTGAGGAACAACTCCTGAATGCTAGAGGCTTTGGTAACAAGTTCAAGGACGGCATTCAT  2034
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1965  CCTGAGGAACAACTCCTGAATGCTAGAGGCTTTGGTAACAAGTTCAAGGACGGCATTCAT  2024

Query  2035  AGATTGAAGCTAAGGTATGGATTTGGGAGGCCGTTTAAGAAACTTGAGTCGAATCAGGTC  2094
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  2025  AGATTGAAGCTAAGGTATGGATTTGGGAGGCCGTTTAAGAAACTCGAGTCGAATCAGGTC  2084

Query  2095  GAGGCCAACAAGTTTGCGTTGATCTGGAACGAAATCATCTTAGCTTTCAGAGAAGAGGAT  2154
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2085  GAGGCCAACAAGTTTGCGTTGATCTGGAACGAAATCATCTTAGCTTTCAGAGAAGAGGAT  2144

Query  2155  ATAGTTTCTGATCGTGAAGTAGAGCTACTGGAGCTGCCAAAGAATTCCTGGGATGTGACG  2214
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2145  ATAGTTTCTGATCGTGAAGTAGAGCTACTGGAGCTGCCAAAGAATTCCTGGGATGTGACG  2204

Query  2215  GTTATTCGCTGGCCGTGTTTCTTGTTGTGCAATGAGCTTTTGCTTGCACTGAGCCAGGCC  2274
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2205  GTTATTCGCTGGCCGTGTTTCTTGTTGTGCAATGAGCTTTTGCTTGCACTGAGCCAGGCC  2264

Query  2275  AGAGAGCTGATAGACGCACCTGATAAATGGCTGTGGCACAAAATATGCAAGAATGAATAC  2334
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2265  AGAGAGCTGATAGACGCACCTGATAAATGGCTGTGGCACAAAATATGCAAGAATGAATAC  2324

Query  2335  AGGCGTTGTGCTGTAGTTGAGGCATATGACAGCATCAAACATCTATTGCTCTCAATCATC  2394
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2325  AGGCGTTGTGCTGTAGTTGAGGCATATGACAGCATCAAACATCTATTGCTCTCAATCATC  2384

Query  2395  AAAGTTGACACTGAAGAACATTCGATAATTACGGTCTTCTTTCAGATAATTAATCAGTCC  2454
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct  2385  AAAGTTGACACTGAAGAACATTCGATAATTACGGTCTTCTTTCAGATGATTAATCAATCC  2444

Query  2455  ATTCAGTCAGAGCAGTTCACCAAGACCTTTAGAGTGGACCTGCTGCCAAAAATTTATGAA  2514
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  2445  ATTCAGTCAGAGCAGTTCACCAAGACCTTTAGAGTGGACCTGCTGCCAAAAATTTACGAA  2504

Query  2515  ACACTGCAGAAATTGGTTGGGCTGGTAAATGATGAGGAAACAGATAGTGGGCGGGTGGTG  2574
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2505  ACACTGCAGAAATTGGTTGGGCTGGTAAATGATGAGGAAACAGATAGTGGGCGGGTGGTG  2564

Query  2575  AATGTTCTGCAGTCTCTTTATGAGATTGCAACTCGACAGTTCTTTATAGAGAAGAAGACA  2634
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2565  AATGTTCTGCAGTCTCTTTATGAGATTGCAACTCGACAGTTCTTTATAGAGAAGAAGACA  2624

Query  2635  ACTGAACAGCTATCTAATGAAGGTTTAACTCCTCGAGACCCAGCCTCAAAGTTGCTGTTT  2694
             ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2625  ACTGAACAGCTATCTAATGAAGGCTTGACTCCTCGAGACCCAGCCTCAAAGTTGCTGTTT  2684

Query  2695  CAAAATGCTATTAGGCTTCCTGATGCAAGCAATGAAGACTTCTACCGGCAGGTTAGGCGT  2754
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2685  CAAAATGCTATTAGGCTTCCTGATGCAAGCAATGAAGACTTCTACCGGCAGGTTAGGCGT  2744

Query  2755  TTACACACGATTCTCACCTCTAGGGACTCTATGCACAGCGTCCCTGTGAATCTAGAGGCG  2814
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2745  TTACACACGATTCTCACCTCTAGGGACTCTATGCACAGCGTCCCTGTGAATCTAGAGGCG  2804

Query  2815  AGACGGCGGATTGCTTTCTTCAGTAATTCGCTTTTCATGAACATGCCTCATGCCCCTCAG  2874
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2805  AGACGGCGGATTGCTTTCTTCAGTAATTCGCTTTTCATGAACATGCCTCATGCCCCTCAG  2864

Query  2875  GTTGAGAAAATGATGGCGTTCAGTGTTCTGACTCCATATTACAGTGAGGAAGTTGTATAC  2934
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  2865  GTTGAGAAAATGATGGCGTTCAGTGTTCTGACTCCATATTACAATGAGGAAGTTGTATAC  2924

Query  2935  AGCAAAGAACAGCTCCGAAATGAGACTGAGGATGGGATTTCCACCCTATACTACCTGCAG  2994
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2925  AGCAAAGAACAGCTCCGAAATGAGACTGAGGATGGGATTTCCACCCTATACTACCTGCAG  2984

Query  2995  ACAATTTATGCTGATGAATGGAAAAATTTCAAGGAACGGATGCATAGGGAAGGAATCAAG  3054
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2985  ACAATTTATGCTGATGAATGGAAAAATTTCAAGGAACGGATGCATAGGGAAGGAATCAAG  3044

Query  3055  ACAGATAGTGAGTTGTGGACAACCAAGCTGAGAGACCTCAGGCTTTGGGCTTCCTACAGA  3114
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3045  ACAGATAGTGAGTTGTGGACAACCAAGCTGAGAGACCTCAGGCTTTGGGCTTCCTACAGA  3104

Query  3115  GGTCAGACATTGGCACGTACAGTTCGTGGGATGATGTACTACTACCGGGCTCTTAAGATG  3174
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3105  GGTCAGACATTGGCACGTACAGTTCGTGGGATGATGTACTACTACCGGGCTCTTAAGATG  3164

Query  3175  CTCGCTTTTCTTGACTCTGCGTCTGAAATGGACATTCGGGAGGGTGCTCAGGAGCTTGGT  3234
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3165  CTCGCTTTTCTTGACTCTGCGTCTGAAATGGACATTCGGGAGGGTGCTCAGGAGCTTGGT  3224

Query  3235  TCAGTGAGGAATTTGCAGGGAGAACTGGGTGGTCAATCTGATGGGTTTGTCTCTGAAAAC  3294
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3225  TCAGTGAGGAGTTTGCAGGGAGAACTGGGTGGTCAATCTGATGGGTTTGTCTCTGAAAAC  3284

Query  3295  GACCGATCTTCCTTAAGCAGAGCAAGTAGTTCCGTGAGTACGCTGTATAAAGGCCATGAG  3354
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3285  GACCGATCTTCCTTACGCAGAGCAAGTAGTTCCGTGAGTACGCTGTATAAAGGCCATGAG  3344

Query  3355  TATGGGACTGCATTGATGAAATTCACATATGTTGTGGCGTGTCAGATCTACGGGTCTCAA  3414
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||
Sbjct  3345  TACGGGACTGCATTGATGAAATTCACATATGTTGTGGCGAGCCAGATCTATGGGTCTCAA  3404

Query  3415  AAAGCAAAGAAAGAGCCTCAGGCAGAGGAAATTCTGTATCTGATGAAGCAGAACGAAGCT  3474
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3405  AAAGCAAAGAAAGAGCCTCAGGCAGAGGAAATTCTGTATCTGATGAAGCAGAACGAAGCT  3464

Query  3475  CTCCGTATTGCATATGTGGATGAGGTGCCTGCGGGAAGAGGAGAGACTGATTATTACTCC  3534
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3465  CTCCGTATTGCATATGTGGATGAGGTGCCTGCGGGAAGAGGAGAGACTGATTATTACTCC  3524

Query  3535  GTTCTGGTGAAATACGATCACCAGTTGGAGAAGGAAGTGGAAATATTCCGTGTGAAGCTA  3594
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  3525  GTTCTGGTGAAATACGATCACCAGTTGGAAAAGGAAGTGGAGATATTCCGTGTGAAGCTA  3584

Query  3595  CCTGGTCCAGTGAAGCTGGGCGAGGGAAAGCCAGAGAACCAGAATCATGCAATGATCTTT  3654
             |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3585  CCTGGTCCGGTGAAGCTGGGTGAGGGAAAGCCAGAGAACCAGAATCATGCAATGATCTTT  3644

Query  3655  ACCCGTGGTGATGCTGTTCAGACCATTGATATGAACCAAGACAGTTATTTTGAGGAAGCT  3714
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  3645  ACCCGTGGTGATGCTGTTCAGACCATTGATATGAACCAAGACAGCTATTTTGAGGAAGCT  3704

Query  3715  CTCAAGATGAGAAATTTGCTCCAGGAGTACAACCATTATCATGGTATCAGAAAACCAACT  3774
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3705  CTCAAGATGAGAAATTTGCTCCAGGAGTACAAACATTATCATGGTATCAGAAAACCAACT  3764

Query  3775  ATTCTTGGTGTCAGGGAGCATATCTTCACGGGATCAGTCTCGTCACTGGCGTGGTTCATG  3834
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3765  ATTCTTGGTGTCAGGGAGCATATCTTCACGGGATCAGTCTCGTCACTGGCGTGGTTCATG  3824

Query  3835  TCTGCTCAGGAGACAAGTTTTGTCACTCTTGGTCAGCGTGTTCTTGCAAACCCACTGAAG  3894
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  3825  TCTGCTCAGGAGACAAGTTTTGTCACTCTTGGTCAGCGTGTTCTTGCAAACCCGCTGAAG  3884

Query  3895  GTCAGAATGCATTATGGCCACCCTGATGTATTTGACAGATTCTGGTTCTTGAGTCGAGGC  3954
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3885  GTCAGAATGCATTATGGCCACCCTGATGTATTTGACAGATTCTGGTTCTTGAGTCGAGGC  3944

Query  3955  GGCATCAGTAAGGCTTCCAGAGTTATAAATATCAGTGAGGACATCTTTGCCGGGTTTAAC  4014
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  3945  GGCATCAGCAAGGCTTCCAGAGTTATAAATATCAGTGAGGACATCTTTGCCGGGTTTAAT  4004

Query  4015  TGCACGTTAAgggggggAAACGTCACCCACCACGAGTACATTCAGGTCGGGAAGGGACGG  4074
             ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  4005  TGCACATTGAGGGGCGGAAACGTCACCCACCACGAGTACATTCAGGTCGGGAAGGGTCGG  4064

Query  4075  GATGTTGGATTGAATCAGATATCAATGTTTGAGGCTAAGGTAGCCAGTGGGAACGGAGAG  4134
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  4065  GATGTTGGATTGAATCAGATATCAATGTTTGAGGCTAAGGTAGCTAGTGGGAACGGAGAG  4124

Query  4135  CAGGTTCTCAGCCGAGATGTGTACCGGCTCGGGCACAGGCTTGATTTCTTCAGAATGTTA  4194
             |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4125  CAGGTTCTTAGCCGAGACGTGTACCGGCTCGGTCACAGGCTTGATTTCTTCAGAATGTTA  4184

Query  4195  TCATTTTTCTACACAACTGTAGGGTTTTTCTTCAACACAATGATGGTCATTCTTACTGTT  4254
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  4185  TCATTTTTCTACACAACTGTAGGGTTTTTCTTCAACACGATGATGGTCATTCTTACTGTT  4244

Query  4255  TACGCTTTCCTCTGGGGACGGGTTTATCTGGCTCTCAGCGGGGTTGAGAAGTCCGCTCTA  4314
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4245  TACGCTTTCCTCTGGGGACGGGTTTATCTGGCTCTCAGCGGGGTTGAGAAGTCCGCTCTA  4304

Query  4315  GCAGACAGTACGGACACCAACGCCGCGCTTGGGGTGATCCTGAACCAGCAGTTCATCATT  4374
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4305  GCAGACAGTACGGACAGCAACGCCGCGCTTGGGGTGATCCTGAACCAGCAGTTCATCATT  4364

Query  4375  CAGCTCGGTCTGTTCA  4390
             ||||||||||||||||
Sbjct  4365  CAGCTCGGTCTGTTCA  4380


 Score = 2230 bits (1207),  Expect = 0.0
 Identities = 1361/1430 (95%), Gaps = 32/1430 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  4426  GAGGGTTTCCTTCTAGCGATATGGAATTTCATTCGAATGCAGATTCAGCTTTCAGCTGTC  4485
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4381  GAGGG-TTCCTTCTAGCGATATGGAATTTCATTCGAATGCAGATTCAGCTTTCAGCTGTC  4439

Query  4486  TTCTACACATTCTCAATGGGGACCAGAGCTCACTATTTCGGTCGAACTATTCTCCATGGT  4545
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4440  TTCTACACATTCTCAATGGGGACCAGAGCTCACTATTTCGGTCGAACTATTCTCCATGGT  4499

Query  4546  GGGGCCAAGTATAGAGCCACTGGACGTGGATTTGTTGTCGAGCACAAGGGATTCACTGAG  4605
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4500  GGGGCAAAGTATAGAGCCACTGGACGTGGATTTGTTGTCGAGCACAAGGGATTCACTGAG  4559

Query  4606  AACTACCGACTGTATGCACGCAGTCACTTTGTGAAGGCCATCGAGCTTGGGCTGATCCTC  4665
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4560  AACTACCGACTGTATGCACGCAGTCACTTTGTGAAGGCCATCGAGCTTGGGCTGATCCTC  4619

Query  4666  ATAGTCTACGCTTCGCACAGTCCGATTGCCAAAGACTCGTTGATTTACATAGCCATGACT  4725
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4620  ATAGTCTACGCTTCGCACAGTCCGATTGCCAAAGACTCGTTGATTTACATAGCCATGACT  4679

Query  4726  ATCACCAGCTGGTTTCTTGTGATTTCATGGATAATGGCCCCATTTGTGTTTAACCCATCA  4785
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4680  ATCACCAGCTGGTTCCTTGTGATTTCATGGATAATGGCCCCATTTGTGTTTAACCCATCA  4739

Query  4786  GGATTCGACTGGCTTAAGACAGTCTATGACTTTGAAGACTTCATGAACTGGATCTGGTAC  4845
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct  4740  GGATTCGACTGGCTTAAGACAGTCTACGACTTTGAAGACTTTATGAATTGGATCTGGTAC  4799

Query  4846  CAAGGCAGAATCTCAACGAAATCTGAACAAAGCTGGGAAAAATGGTGGTACGAGGAACAG  4905
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4800  CAAGGCAGAATCTCAACGAAATCTGAACAAAGCTGGGAAAAATGGTGGTACGAGGAACAG  4859

Query  4906  GACCACCTGAGAAACACCGGGAAGGC-AGGATTATTTGTGGAGATCATCTTGGTCCTCCG  4964
             |||||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  4860  GACCACCTGAGAAACACCGGGC-GGTTAGGAATATTTGTGGAGATCATCTTGGACCTCCG  4918

Query  4965  GTTTTTCTTCTTCCAGTATGGGATTGTATACCAGCTTAAAATTGCAAACGGATCCACCAG  5024
             |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  4919  GTTTTTCTTCTTTCAGTATGGGATTGTATACCAGCTCAAAATTGCAAACGGATCCACCAG  4978

Query  5025  CCTTTTTGTCTACTTGTTCTCATGGATATACATCTTTGCTATATTTGTGCTCTTCCTAGT  5084
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4979  CTTTTTTGTCTACTTGTTCTCATGGATATACATCTTTGCTATATTTGTGCTCTTCCTAGT  5038

Query  5085  CATCCAATACGCCCGTGACAAGTACTCGGCAAAAGCTCACATACGGTACAGGCTTGTCCA  5144
              |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5039  AATCCAATACGCCCGTGACAAGTACTCTGCAAAAGCTCACATACGGTACAGGCTTGTCCA  5098

Query  5145  ATTCCTCCTGATCGTGCTTGCTATACTGGTGATTGTTGCTTTGCTCGAGTTCACGCATTT  5204
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  5099  ATTCCTCCTGATCGTGTTTGCTATACTGGTGATTGTTGCTTTGCTTGAGTTCACGCATTT  5158

Query  5205  CAGCTTCATCGATATCTTCACAAGCCTTCTTGCATTCATCCCAACTGGCTGGGGAATTCT  5264
             ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5159  CAGCTTCATCGATATCTTCACGAGTCTTCTTGCATTCATCCCAACTGGCTGGGGAATTCT  5218

Query  5265  GCTGATCGCACAGACTCAAAGGAAGT-GGCTGAAGAATTACACTATTTTCTGGAATGCTG  5323
             ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct  5219  GCTGATCGCACAGACTCAAAGGG-GTTGGCTGAAGAAATACAGTATTTTCTGGAATGCTG  5277

Query  5324  TTGTCTCTGTTGCTCGCATGTATGACATATTGTTTGGGATACTCATAATGGTTCCAGTAG  5383
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5278  TTGTCTCTGTTGCTCGCATGTATGACATATTGTTTGGGATACTCATAATGGTTCCAGTAG  5337

Query  5384  CGTTCTTGTCATGGATGCCTGGATTCCAGTCAATGCAAACGAGGATATTATTCAATGAAG  5443
             |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5338  CGTTCTTGTCGTGGATGCCTGGATTCCAATCAATGCAAACGAGGATATTATTCAATGAAG  5397

Query  5444  CTTTTAGCAGAGGACTTCGCATCATGCAGATTGTCACTGGGAAGAAATCAAAAGGCGATG  5503
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5398  CTTTTAGCAGAGGACTTCGCATCATGCAGATTGTCACTGGGAAGAAATCAAAAGGCGATG  5457

Query  5504  TCTAAGTTTAAAAAACGGTCTTAAGAAGTAAATGGTAGTTCAAATCCTATTGGTATGTGG  5563
             ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  5458  TCTAAGTTTAAAAAATGGTCTTAAGAAGTAAATGATAGTTCAAATCCTATTGGTATGCGG  5517

Query  5564  CGAAGGAATCAGTTGGAGGTT-T-TT--GGAGAGTTTGGTTGGATGAGGAATCGGGAAGT  5619
             |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||   ||| |||||||||||||||||||
Sbjct  5518  CGAAGGAATCTGTTGGAGGTTGTATTTTGGAGAG---GGT-GGATGAGGAATCGGGAAGT  5573

Query  5620  TGGTTTGATTCGGTTA--GATGGGTTTAG-------G-GAGATATTTGATTGTCAGTGTG  5669
             |||||| |||||||||  |||||||||||       | ||||||||| || |||||||||
Sbjct  5574  TGGTTT-ATTCGGTTATAGATGGGTTTAGTCATTTAGTGAGATATTTTATCGTCAGTGTG  5632

Query  5670  TGTGGAGGGAACTCTGATTCTTGTATGGTTTTTGTTCTAAAGGTACAGCAATTTGTGTAG  5729
             |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  5633  TGTGGAGG-AACTCTGATTCTTGTATGGTTTT-GT-CTAAAGGTAGAGCAATTTGTGTAG  5689

Query  5730  TGAGG-CTTT-GTGTATTTGTTCTCCTTCTCTCATTATAGAGCTTTAGAGCATTTTTAGT  5787
             | ||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct  5690  T-AGGGCTTTTGTGTATTTGTTCTCCTTCTCTCGTTGTAGAGCTTTAGAGCATTTTTAGT  5748

Query  5788  TTAT-ATTC-AGATTGTTATCTAATGTCATCTCGCAGAGCTTTTGTTCAC  5835
             |||| |||| || |||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct  5749  TTATTATTCCAGTTTGCCATCTAATGTCATTTCGCAGAGCATTTGTTCAC  5798


> Ahg490142 jgi|Araly1|490142|fgenesh2_kg.6__3276__AT4G04970.1
Length=5657

 Score =  209 bits (113),  Expect = 2e-52
 Identities = 373/494 (76%), Gaps = 35/494 (7%)
 Strand=Plus/Plus

Query  3351  TGAGTATGGGACTGCATTGATGAAATTCACATATGTTGTGGCGTGTCA-GATCTACGGGT  3409
             ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||  
Sbjct  3165  TGAGTATGGGAGTGCAATGATGAAATTCACATATGTTGTGGCGTGTCAAGTT-TATGGA-  3222

Query  3410  CT-CAAAAAGCAAAGAAAG-AGCC-TCAG-GCAGAGGAAATTCTGTATC-TGATGAAGCA  3464
             |  || ||||||| ||  | | || | || || ||||| ||||||| || |||||||  |
Sbjct  3223  CAGCATAAAGCAA-GAGGGGA-CCAT-AGAGCTGAGGAGATTCTGT-TCCTGATGAAAAA  3278

Query  3465  GAACGAAGCTCTCCGTATTGCATATGTGGATGAGGT-GCCTGCGGGAAGAGGAGAGACTG  3523
               | || || || |||||||||||||| |||||||| |  |  |||||| |||| | | |
Sbjct  3279  TCATGAGGCCCTTCGTATTGCATATGTTGATGAGGTCGAGTT-GGGAAG-GGAG-GTC-G  3334

Query  3524  ATTATTACTCCGTTCTGGTGAAATACGATCACCAG-TTGGAGAAG-GAAGTGGAAATAT-  3580
             | || ||||| ||||| |||||||  ||||| ||  ||  | ||| || ||||| || | 
Sbjct  3335  AGTACTACTCGGTTCTTGTGAAATTTGATCAACAACTTC-A-AAGAGAGGTGGAGATCTA  3392

Query  3581  TCCGTGTGA-AGCTACCTGGTCCAGTGAAGCTGGGCGAGGGAAAGCCAGAGAACCAGAAT  3639
             || || | | | || || || ||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || 
Sbjct  3393  TC-GTATCAGA-CTGCCAGGCCCCTTGAAGCTTGGCGAGGGAAAACCAGAAAACCAAAAC  3450

Query  3640  CATGCAATGATCTTTACCCGTGGTGATGCTGTT-CAGACCATTGATATGAACCAAGACAG  3698
             |||||  | |||||||| || || ||||| | | ||||||||||||||||| ||||| | 
Sbjct  3451  CATGCTCTAATCTTTACACGAGGAGATGC-GATACAGACCATTGATATGAATCAAGATAA  3509

Query  3699  TTATTTTGAGGAAGCTCTCAAGATGAGAAATTTGCTCCAGG-AGTACAAC-CATTA-TCA  3755
               |||||||||| ||||| |||||||| || ||| |  |   | | |||  | ||| | |
Sbjct  3510  CCATTTTGAGGAGGCTCTTAAGATGAGGAACTTGTTGGAATCATT-CAAGAC-TTACT-A  3566

Query  3756  TGGTATCAGAAAACCAACTATTCTTGGTGTCAGGGAGCATA-TCTTCACGGGATCAGTCT  3814
             ||| || || || || ||||||||||| ||| | ||| | | | ||||| || ||||| |
Sbjct  3567  TGGCATTAGGAAGCCTACTATTCTTGGAGTCCGTGAGAA-AGTTTTCACTGGTTCAGTTT  3625

Query  3815  CGTCACTGGCGTGG  3828
             | |||||||| |||
Sbjct  3626  CTTCACTGGCATGG  3639



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 221038383984


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5