BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT4G04920.1

Length=4376
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg490126 jgi|Araly1|490126|fgenesh2_kg.6__3260__AT4G04920.1        5884    0.0  


> Ahg490126 jgi|Araly1|490126|fgenesh2_kg.6__3260__AT4G04920.1
Length=3660

 Score = 5884 bits (3186),  Expect = 0.0
 Identities = 3500/3645 (96%), Gaps = 48/3645 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  52    GGTGGAGGAATCATCGAAGCTCCAGCTATAGTGGAGGA-GAAAGAGGAAGAAGGATTACA  110
             |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| || |  ||||
Sbjct  34    GGTGGAGGAAACATTGAAGCTCCAGCTACAGTGGAGGAGGAAA-AAGAACAA-G--TACA  89

Query  111   GCAGAAGCAGGAAGAGACTATTGAGTCTACCG-ATCCGATTCTCGTCGTCGTTGAGGAGA  169
             ||| ||||||||||||||   |||||||| || |||| | | | |||||||| |  | | 
Sbjct  90    GCATAAGCAGGAAGAGAC---TGAGTCTA-CGAATCC-AAT-T-GTCGTCGTCG-CG-G-  139

Query  170   AATTGTTAGAGAAATCAGTAGACGGAGAGAAAGAAGACGATAATAGTAGTAGTAGTAACA  229
              |  |   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct  140   -A--G---GAGAAATCAGCAGACGGAGAGAAAGAAGACGATAATACTAGTACTAGTAACA  193

Query  230   TGGAGATTGATCCTGTGAGTCCGGCTACAGTTTTCTGTGTTAAGCTTAAGCAGCCCAATT  289
             |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  194   TGGAGATTGATCCTGTGAGTCCGGCTACTGTTTTCTGTGTTAAGCTTAAGCAACCCAATT  253

Query  290   CCAATTTGCTTCATAAGATGAGTGTTCCTGAATTGTGCCGTAACTTCAGTGCTGTTGCGT  349
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  254   CCAATTTGCTTCATAAGATGAGTGTTCCTGATTTGTGCCGTAACTTCAGTGCTGTTGCGT  313

Query  350   GGTGTGGCAAATTGAATGCTATTGCTTGTGCTTCCGAGACCTGTGCCAGGATTCCAAGCT  409
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  314   GGTGTGGTAAATTGAATGCTATTGCTTGTGCTTCCGAGACCTGTGCCAGGATTCCAAGCT  373

Query  410   CCAAGGCAAATACACCTTTTTGGATACCAATACATATCTTGATACCTGAGCGCCCTACTG  469
             ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  374   CCAAGGCCAATACACCTTTTTGGATCCCAATACATATCTTGATACCTGAGCGCCCAACTG  433

Query  470   AGTGTGCGGTGTTTAATGTTGTGGCAGACTCTCCTCGTGATTCTGTCCAATTTATCGAAT  529
             ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  434   AGTGTGCAGTGTTTAATGTTGTGGCAGATTCTCCTCGTGATTCTGTCCAATTTATCGAAT  493

Query  530   GGTCTCCCACTTCTTGTCCTCGTGCGTTACTCATTGCTAATTTTCATGGACGTATAACTA  589
             |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  494   GGTCTCCCACTTCTTGTCCTCGCGCGTTACTCATTGCTAATTTTCATGGACGGATAACTA  553

Query  590   TCTGGACGCAGCCTACTCAGGGTTCGGCTAATTTAGTGCACGACGCTACCTCCTGGCAGT  649
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  554   TCTGGACGCAGCCTACTCAGGGTTCGGCTAATCTAGTGCACGATGCTACCTCCTGGCAGT  613

Query  650   GTGAGCATGAATGGCGTCAGGACATTGCTGTTGTTACAAAGTGGCTGACAGGGGCTTCCC  709
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
Sbjct  614   GTGAGCATGAATGGCGTCAGGACATTGCTGTTGTTACAAAGTGGCTGGCGGGGGCTTCTC  673

Query  710   CATATAGGTGGTTGTCCTCCAAGCCAAGTTCTGGTACAAATGCAAAGTCAACTTTCGAGG  769
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  674   CATATAGGTGGTTGTCCTCCAAGCCAAGTTCTGGTACGAATGCAAAGTCAACTTTCGAGG  733

Query  770   AGAAATTTCTCTCGCAGAGCTCTGAAAGCTCAGCTCGGTGGCCCAACTTTCTCTGTGTAT  829
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  734   AGAAATTTCTCTCGCAGAGCTCTGAAAGCTCAGCTCGGTGGCCCAACTTTCTCTGTGTGT  793

Query  830   GCTCTGTTTTCTCATCCGGCTCTGTTCAAATTCATTGGTCCCAGTGGCCTTCTAACCAGG  889
             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  794   GCTCTGTTTTCTCATCCGGCTCTGTTCAACTTCATTGGTCTCAGTGGCCTTCTAACCAGG  853

Query  890   GAAGCACTGCACCAAAGTGGTTTAGTACAAAGAAAGGTCTTTTAGGTGCAGGGCCAAGTG  949
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  854   GAGGCACTGCACCAAAGTGGTTTAGTACAAAGAAAGGTCTTTTAGGTGCAGGGCCCAGTG  913

Query  950   GAATTATGGCTGCTGATGCTATTATAACAGACAGTGGTGCCATGCATGTAGCAGGAGTTC  1009
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  914   GAATTATGGCTGCTGATGCTATTATAACGGACAGTGGTGCCATGCATGTTGCAGGAGTTC  973

Query  1010  CAATTGTAAACCCTTCAACAATTGTAGTATGGGAGGTGACCCCTGGCCCTGGAAATGGAC  1069
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  974   CTATTGTAAACCCTTCAACAATTGTAGTATGGGAGGTGACCCCTGGCCCTGGAAATGGAC  1033

Query  1070  TCCAGGCGACTCCAAAAATCTCTACAGGCAGTCGTGTGCCACCATCCCTTAGTTCTTCTT  1129
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1034  TCCAGGCGACTCCAAAAATCTCTACAGGCAGTCGTGTGCCACCATCCCTTAGTTCTTCTT  1093

Query  1130  CTTGGACAGGTTTTGCTCCTTTAGCTGCGTACTTGTTTAGCTGGCAAGAATACTTAATAT  1189
             |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||
Sbjct  1094  CTTGGACAGGCTTTGCTCCTTTAGCTGCTTACTTGTTCAGCTGGCAAGAGTACTTGATAT  1153

Query  1190  CCGAGATAAAGCAAGGGAAGAAGCCCTCAGATCAAGATTCCAGTGATGCTATATCGCTAA  1249
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1154  CCGAGATAAAGCAAGGGAAGAAGCCCACAGATCAAGATTCCAGTGATGCTATATCGCTAA  1213

Query  1250  GTTGCTCACCGGTTTCCAATTTTTCTGCTTATGTAAGTCCAGAGGCTGCAGCTCAGTCTG  1309
             | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1214  GCTGCTCGCCGGTTTCCAATTTTTCTGCTTATGTAAGTCCAGAGGCTGCAGCTCAGTCTG  1273

Query  1310  CAGCAACCACAACATGGGGATCTGGTGTTACCGCTGTTGCTTTTGATCCAACTCGTGGTG  1369
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1274  CAGCAACCACAACATGGGGATCTGGTGTTACTGCTGTTGCTTTTGATCCAACTCGTGGTG  1333

Query  1370  GTTCAGTGATAGCAGTTGTTATAGTTGAAGGGCAGTACATGTCTCCGTATGATCCAGATG  1429
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1334  GTTCAGTGATAGCAGTTGTTATAGTTGAAGGGCAGTACATGTCTCCGTATGATCCAGATG  1393

Query  1430  AAGGTCCTTCAATCACAGGCTGGAGAGTACAGCGCTGGGAATCAAGTGTTCAACCTGTTG  1489
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1394  AAGGTCCTTCAATCACAGGCTGGAGAGTACAGCGCTGGGAATCAAGTGTTCAACCTGTTG  1453

Query  1490  TACTGCATCAGATATTTGGAAACCCAACTTCAAATTTTGGAGGACAGGTCCCCACGCAAA  1549
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  1454  TACTGCATCAGATATTTGGAAACCCAACTTCAAATTTTGGTGGACAGGTCCCCACGCAAA  1513

Query  1550  CTGTCTGGGTATCCAGAGTGGATATGAGCATACCACCTACTAAAGATTTTAAGAATCATC  1609
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1514  CTGTCTGGGTATCCAGAGTGGATATGAGCATACCACCTACTAAAGATTTTAAGAATCATC  1573

Query  1610  AAGTAGCTGCAGCAGGACCAAGTGTGGATGCACCAAAGGAGCCTGATTCTGGTGATGAGA  1669
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1574  AAGTAGCTGCAGCAGGACCAAGTGTGGATGCACCAAAGGAGCCTGATTCTGGTGATGAGA  1633

Query  1670  AGGCTAACAAGGTTGTATTTGATCCTTTTGATTTGCCAAGTGATATTCGGACACTTGCAC  1729
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  1634  AGGCTAACAAGGTTGTTTTTGATCCTTTTGATTTGCCAAGTGATATTCGTACACTTGCAC  1693

Query  1730  GGATTGTCTATTCTGCTCATGGTGGTGAAATTGCGATTGCTTTTCTTCGTGGTGGAGTTC  1789
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1694  GGATTGTCTATTCTGCTCATGGTGGTGAAATTGCGATTGCTTTTCTTCGTGGTGGAGTTC  1753

Query  1790  ATATCTTTTCTGGTCCAACTTTTTCACCTGTTGAAAACTATCAAATAAATGTTGGATCTG  1849
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1754  ATATCTTTTCTGGTCCAACATTTTCACCTGTTGAAAACTATCAAATAAATGTTGGATCTG  1813

Query  1850  CAATTGCTGCACCCGCATTTTCACCAACAAGCTGTTGTTCGGCTTCTGTATGGCATGATG  1909
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1814  CAATTGCTGCACCCGCATTTTCTCCAACAAGCTGTTGTTCGGCTTCTGTATGGCATGATG  1873

Query  1910  CTGCTAAGGACTGCGCAATGTTGAAAATCATCCGTGTTCTTCCTCCTGCTCTTCCGCGTA  1969
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  1874  CTGCTAAGGACTGCGCAATGTTGAAAATTATCCGTGTTCTTCCTCCTGCTCTTCCACGTA  1933

Query  1970  ACCAATCAAAGGTTGATCAATCAACATGGGAGCGGGCGATCGCTGAGAGATTCTGGTGGA  2029
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  1934  ACCAATCAAAGGTTGATCAATCAACATGGGAGCGGGCGATTGCTGAGAGATTCTGGTGGA  1993

Query  2030  GTCTTTTGGTCGGAGTTGATTGGTGGGATGCAGTTGGCTGCACACAGAGTGCTGCAGAGG  2089
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1994  GTCTTTTAGTCGGAGTTGATTGGTGGGATGCAGTTGGCTGCACACAGAGTGCCGCAGAGG  2053

Query  2090  ATGGGATAGTTTCATTGAACAGCGTGATTGCTGTCATGGATGCTGATTTTCACTCCCTTC  2149
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  2054  ATGGGATAGTTTCATTGAACAGCGTGATTGCTGTCATGGACGCTGATTTTCACTCCCTTC  2113

Query  2150  CTTCAACACAGCACAGACAACAATATGGCCCTAACCTAGATAGGATCAAATGTCGGTTAC  2209
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
Sbjct  2114  CTTCAACACAGCACAGACAACAATATGGCCCTAACCTAGATAGGATCAAGTGCCGGTTGC  2173

Query  2210  TTGAAGGAACCAATGCTCAAGAGGTTCGTGCCATGGTTTTAGATATGCAAGCAAGGTTGT  2269
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  2174  TTGAAGGAACCAATGCTCAAGAGGTTCGTGCCATGGTTTTAGATATGCAAGCAAGGTTGC  2233

Query  2270  TGTTGGACATGCTTGGAAAAGGTATTGAATCAGCTCTTGTGAATCCTTCGGCGTTGGTTT  2329
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2234  TGTTGGACATGCTTGGAAAAGGAATTGAATCAGCTCTTGTGAATCCTTCGGCGTTGGTTT  2293

Query  2330  TTGAGCCATGGCGAGTAGATGGGGAGACAATAACAGGCATCAATCCGGAGGCAATGGCTG  2389
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  2294  TTGAGCCATGGCGAGTAGATGGGGAGACAATAACAGGCATCAATCCGGATGCAATGGCTG  2353

Query  2390  TTGATCCTGCTCTTGTTTCCAGTATTCAGGCTTATGTGGATGCTGTTCTTGATCTTGCTT  2449
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2354  TTGATCCTGCTCTTGTTTCCAGTATTCAGGCTTATGTGGATGCTGTTCTTGATCTTGCTT  2413

Query  2450  CTCATTTCATCACACGTTTAAGGCGTTATGCGAGTTTTTGTCGGACTCTTGCAAGCCATG  2509
             ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  2414  CTCATTTCATCACACGTTTAAGGCGCTATGCGAGTTTTTGTCGGACTCTTGCGAGCCATG  2473

Query  2510  CTGCTTCTGCTGGAACTGGCAGTAATCGCAACA-ATGTTACCAGTCCCACACAAAATGCA  2568
             ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  2474  CTGCTTCTGCTGGAACTGGCAGTAATCGCAATATA-GTTCCCAGTCCCACACAAAATGCA  2532

Query  2569  TCATCTCCTGCAACACCTCAGGTTTTTCCTGACAAGTCACTGTATCTTGCAGTAGGTCAA  2628
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  
Sbjct  2533  TCATCTCCTGCAACACCTCAGGTTTTTCCTGACAAGTCACTGTATCATGCAGCAGG-C--  2589

Query  2629  CctactactactactactactactGCTACGACAAACTCCAGCGGAAGCTCACATGTGCAA  2688
             |  |  ||  ||||||||||||||   || | || |||||| ||||||  |||    |||
Sbjct  2590  C--A--AC--CTACTACTACTACT---AC-A-AA-CTCCAGTGGAAGC--ACA----CAA  2631

Query  2689  GCTTGGATGCAGGGGGCCATAGCGAAAATTAGTAGCTCGAATGATGGA-T--CCAACTCT  2745
             |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||
Sbjct  2632  GCTTGGATGCAGGGTGCCATAGCGAAAATTAGTAGCTCGAATGATGGAGTATCCAACACT  2691

Query  2746  ACTGCAAGCCCAATCAGTGGTTCACCTACCTTCATGCCAATAAGCATCAATACAGGAACA  2805
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2692  ACTGCAAACCCAATCAGTGGTTCACCTACCTTCATGCCAATAAGCATCAATACAGGAACA  2751

Query  2806  TTTCCAGGAACACCTGCTGTTCGGCTCATTGGGGATTGTCATTTCCTTCATCGGTTATGC  2865
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  2752  TTTCCAGGAACACCTGCTGTTCGGCTCATTGGGGACTGTCATTTCCTTCATCGGTTATGT  2811

Query  2866  CAGCTGTTGCTCTTCTGTTTTCTCCAGCGGTCTTCACGATTTCCACAGCGAAATGCTGAT  2925
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  2812  CAGCTGTTACTCTTCTGTTTTCTCCAGCGGTCTTCACGATTTCCCCAGCGAAATGCTGAT  2871

Query  2926  GTTAGTTCACAAAAACTTCAAACGGGGGCTACCAGCAAATTGGAAGAAGTCAACTCTGCT  2985
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  2872  GTTAGTTCACAAAAACTTCAAACGGGGGCTACCAGCAAATTGGAAGAGGTCAACTCTGCT  2931

Query  2986  AAACCAACCCCTGCCTTGAACAGGATAGAGGACGCCCAGGGATTCCGGGGTGCCCAGTTG  3045
             ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2932  AAACCAATCCCTCCCTTGAACAGGATAGAGGAAGCCCAGGGATTCCGGGGTGCCCAGTTG  2991

Query  3046  GGTACTGGAGTGAAAGGGATTGATGAAAATTCTGCTCGTACAACAAAGATGGGTTCTGGG  3105
             ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2992  GGTGCTGGAGTGAAAGGGATTGACGAAAATTCTGCTCGTACAACAAAGATGGGTTCTGGG  3051

Query  3106  AATGCCGGTCAAGGATATACTTATGAGGAGGTGAGAGTTCTTTTCCATATACTAATGGAT  3165
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3052  AATGCCGGTCAAGGATATACTTATGAGGAGGTGAGAGTTCTTTTCCATATACTAATGGAT  3111

Query  3166  CTCTGCAAGCGAACATCTGGTCTTGCGCATCCCTTACCTGGCTCTCAGGTAGGTAGTGGA  3225
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3112  CTCTGCAAGCGAACATCTGGTCTTGCGCATCCCTTACCTGGCTCTCAGGTAGGTAGTGGA  3171

Query  3226  AACATTCAAGTTCGACTGCATTATATTGATGGAAATTACACTGTGTTACCCGAGGTGGTA  3285
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct  3172  AACATTCAAGTTCGACTGCATTATATTGATGGAAATTACACAGTGTTGCCCGAGGTGGTA  3231

Query  3286  GAAGCGGCTCTTGGACCACATATGCAGAACATGCCTCGCCCAAGAGGAGCTGATGCTGCT  3345
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3232  GAAGCAGCTCTTGGACCACATATGCAGAACATGCCTCGCCCAAGAGGAGCTGATGCTGCT  3291

Query  3346  GGTCTTCTACTTCGGGAGTTAGAGCTTCATCCGCCTTCCGAAGAATGGCATAGAAGAAAT  3405
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3292  GGTCTTCTACTTCGGGAGTTAGAGCTTCATCCGCCTTCCGAAGAATGGCATAGAAGAAAT  3351

Query  3406  TTATTTGGTGGTCCCGGGTCAGAGCCTGAGGATATGATCTTGACAGACGATGTTTCCAAG  3465
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct  3352  TTGTTTGGTGGTCCCGGGTCAGAGCCTGAGGATATGGTCCTGACAGACGATGTTTCCAAG  3411

Query  3466  CTGAGTAATTCCTTAGATCTGCCTGATACAAACTTTTCCGGAATATGTGATGGATACAAC  3525
             |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3412  CTGAGTAACTCCTTAGATCTGTCTGATACAAGCTTTTCCGGAATATGTGATGGATACAAC  3471

Query  3526  AGAGTCCATAGTCTTTGGCCAAGAAAACGCAGGATGTCTGAAAGAGATGCAGCTTTTGGT  3585
             |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3472  AGAGTCCATAGTCTTTGGCCTAGAAAGCGCAGGATGTCTGAAAGAGATGCAGCTTTTGGT  3531

Query  3586  TCAAATACTTCTGTGGGTTTGGGTGCATATCTTGGGATCATGGGTTCTCGTAGGGATGTT  3645
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3532  TCAAATACTTCTGTGGGTTTGGGTGCATATCTTGGAATCATGGGTTCTCGTAGGGATGTT  3591

Query  3646  GTGACCGCGACATGGAAAACTGGTCTTGAAGGAGTTTGGTACAAG  3690
             || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  3592  GTCACCGCGACATGGAAAACTGGTCTTGACGGAGTTTGGTACAAG  3636



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 165512384977


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5