BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G04920.1 Length=4376 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg490126 jgi|Araly1|490126|fgenesh2_kg.6__3260__AT4G04920.1 5884 0.0 > Ahg490126 jgi|Araly1|490126|fgenesh2_kg.6__3260__AT4G04920.1 Length=3660 Score = 5884 bits (3186), Expect = 0.0 Identities = 3500/3645 (96%), Gaps = 48/3645 (1%) Strand=Plus/Plus Query 52 GGTGGAGGAATCATCGAAGCTCCAGCTATAGTGGAGGA-GAAAGAGGAAGAAGGATTACA 110 |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| || | |||| Sbjct 34 GGTGGAGGAAACATTGAAGCTCCAGCTACAGTGGAGGAGGAAA-AAGAACAA-G--TACA 89 Query 111 GCAGAAGCAGGAAGAGACTATTGAGTCTACCG-ATCCGATTCTCGTCGTCGTTGAGGAGA 169 ||| |||||||||||||| |||||||| || |||| | | | |||||||| | | | Sbjct 90 GCATAAGCAGGAAGAGAC---TGAGTCTA-CGAATCC-AAT-T-GTCGTCGTCG-CG-G- 139 Query 170 AATTGTTAGAGAAATCAGTAGACGGAGAGAAAGAAGACGATAATAGTAGTAGTAGTAACA 229 | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 140 -A--G---GAGAAATCAGCAGACGGAGAGAAAGAAGACGATAATACTAGTACTAGTAACA 193 Query 230 TGGAGATTGATCCTGTGAGTCCGGCTACAGTTTTCTGTGTTAAGCTTAAGCAGCCCAATT 289 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 194 TGGAGATTGATCCTGTGAGTCCGGCTACTGTTTTCTGTGTTAAGCTTAAGCAACCCAATT 253 Query 290 CCAATTTGCTTCATAAGATGAGTGTTCCTGAATTGTGCCGTAACTTCAGTGCTGTTGCGT 349 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 254 CCAATTTGCTTCATAAGATGAGTGTTCCTGATTTGTGCCGTAACTTCAGTGCTGTTGCGT 313 Query 350 GGTGTGGCAAATTGAATGCTATTGCTTGTGCTTCCGAGACCTGTGCCAGGATTCCAAGCT 409 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 314 GGTGTGGTAAATTGAATGCTATTGCTTGTGCTTCCGAGACCTGTGCCAGGATTCCAAGCT 373 Query 410 CCAAGGCAAATACACCTTTTTGGATACCAATACATATCTTGATACCTGAGCGCCCTACTG 469 ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 374 CCAAGGCCAATACACCTTTTTGGATCCCAATACATATCTTGATACCTGAGCGCCCAACTG 433 Query 470 AGTGTGCGGTGTTTAATGTTGTGGCAGACTCTCCTCGTGATTCTGTCCAATTTATCGAAT 529 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 434 AGTGTGCAGTGTTTAATGTTGTGGCAGATTCTCCTCGTGATTCTGTCCAATTTATCGAAT 493 Query 530 GGTCTCCCACTTCTTGTCCTCGTGCGTTACTCATTGCTAATTTTCATGGACGTATAACTA 589 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 494 GGTCTCCCACTTCTTGTCCTCGCGCGTTACTCATTGCTAATTTTCATGGACGGATAACTA 553 Query 590 TCTGGACGCAGCCTACTCAGGGTTCGGCTAATTTAGTGCACGACGCTACCTCCTGGCAGT 649 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 554 TCTGGACGCAGCCTACTCAGGGTTCGGCTAATCTAGTGCACGATGCTACCTCCTGGCAGT 613 Query 650 GTGAGCATGAATGGCGTCAGGACATTGCTGTTGTTACAAAGTGGCTGACAGGGGCTTCCC 709 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | Sbjct 614 GTGAGCATGAATGGCGTCAGGACATTGCTGTTGTTACAAAGTGGCTGGCGGGGGCTTCTC 673 Query 710 CATATAGGTGGTTGTCCTCCAAGCCAAGTTCTGGTACAAATGCAAAGTCAACTTTCGAGG 769 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 674 CATATAGGTGGTTGTCCTCCAAGCCAAGTTCTGGTACGAATGCAAAGTCAACTTTCGAGG 733 Query 770 AGAAATTTCTCTCGCAGAGCTCTGAAAGCTCAGCTCGGTGGCCCAACTTTCTCTGTGTAT 829 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 734 AGAAATTTCTCTCGCAGAGCTCTGAAAGCTCAGCTCGGTGGCCCAACTTTCTCTGTGTGT 793 Query 830 GCTCTGTTTTCTCATCCGGCTCTGTTCAAATTCATTGGTCCCAGTGGCCTTCTAACCAGG 889 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 794 GCTCTGTTTTCTCATCCGGCTCTGTTCAACTTCATTGGTCTCAGTGGCCTTCTAACCAGG 853 Query 890 GAAGCACTGCACCAAAGTGGTTTAGTACAAAGAAAGGTCTTTTAGGTGCAGGGCCAAGTG 949 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 854 GAGGCACTGCACCAAAGTGGTTTAGTACAAAGAAAGGTCTTTTAGGTGCAGGGCCCAGTG 913 Query 950 GAATTATGGCTGCTGATGCTATTATAACAGACAGTGGTGCCATGCATGTAGCAGGAGTTC 1009 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 914 GAATTATGGCTGCTGATGCTATTATAACGGACAGTGGTGCCATGCATGTTGCAGGAGTTC 973 Query 1010 CAATTGTAAACCCTTCAACAATTGTAGTATGGGAGGTGACCCCTGGCCCTGGAAATGGAC 1069 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 974 CTATTGTAAACCCTTCAACAATTGTAGTATGGGAGGTGACCCCTGGCCCTGGAAATGGAC 1033 Query 1070 TCCAGGCGACTCCAAAAATCTCTACAGGCAGTCGTGTGCCACCATCCCTTAGTTCTTCTT 1129 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1034 TCCAGGCGACTCCAAAAATCTCTACAGGCAGTCGTGTGCCACCATCCCTTAGTTCTTCTT 1093 Query 1130 CTTGGACAGGTTTTGCTCCTTTAGCTGCGTACTTGTTTAGCTGGCAAGAATACTTAATAT 1189 |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| Sbjct 1094 CTTGGACAGGCTTTGCTCCTTTAGCTGCTTACTTGTTCAGCTGGCAAGAGTACTTGATAT 1153 Query 1190 CCGAGATAAAGCAAGGGAAGAAGCCCTCAGATCAAGATTCCAGTGATGCTATATCGCTAA 1249 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1154 CCGAGATAAAGCAAGGGAAGAAGCCCACAGATCAAGATTCCAGTGATGCTATATCGCTAA 1213 Query 1250 GTTGCTCACCGGTTTCCAATTTTTCTGCTTATGTAAGTCCAGAGGCTGCAGCTCAGTCTG 1309 | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1214 GCTGCTCGCCGGTTTCCAATTTTTCTGCTTATGTAAGTCCAGAGGCTGCAGCTCAGTCTG 1273 Query 1310 CAGCAACCACAACATGGGGATCTGGTGTTACCGCTGTTGCTTTTGATCCAACTCGTGGTG 1369 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1274 CAGCAACCACAACATGGGGATCTGGTGTTACTGCTGTTGCTTTTGATCCAACTCGTGGTG 1333 Query 1370 GTTCAGTGATAGCAGTTGTTATAGTTGAAGGGCAGTACATGTCTCCGTATGATCCAGATG 1429 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1334 GTTCAGTGATAGCAGTTGTTATAGTTGAAGGGCAGTACATGTCTCCGTATGATCCAGATG 1393 Query 1430 AAGGTCCTTCAATCACAGGCTGGAGAGTACAGCGCTGGGAATCAAGTGTTCAACCTGTTG 1489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1394 AAGGTCCTTCAATCACAGGCTGGAGAGTACAGCGCTGGGAATCAAGTGTTCAACCTGTTG 1453 Query 1490 TACTGCATCAGATATTTGGAAACCCAACTTCAAATTTTGGAGGACAGGTCCCCACGCAAA 1549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1454 TACTGCATCAGATATTTGGAAACCCAACTTCAAATTTTGGTGGACAGGTCCCCACGCAAA 1513 Query 1550 CTGTCTGGGTATCCAGAGTGGATATGAGCATACCACCTACTAAAGATTTTAAGAATCATC 1609 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1514 CTGTCTGGGTATCCAGAGTGGATATGAGCATACCACCTACTAAAGATTTTAAGAATCATC 1573 Query 1610 AAGTAGCTGCAGCAGGACCAAGTGTGGATGCACCAAAGGAGCCTGATTCTGGTGATGAGA 1669 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1574 AAGTAGCTGCAGCAGGACCAAGTGTGGATGCACCAAAGGAGCCTGATTCTGGTGATGAGA 1633 Query 1670 AGGCTAACAAGGTTGTATTTGATCCTTTTGATTTGCCAAGTGATATTCGGACACTTGCAC 1729 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 1634 AGGCTAACAAGGTTGTTTTTGATCCTTTTGATTTGCCAAGTGATATTCGTACACTTGCAC 1693 Query 1730 GGATTGTCTATTCTGCTCATGGTGGTGAAATTGCGATTGCTTTTCTTCGTGGTGGAGTTC 1789 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1694 GGATTGTCTATTCTGCTCATGGTGGTGAAATTGCGATTGCTTTTCTTCGTGGTGGAGTTC 1753 Query 1790 ATATCTTTTCTGGTCCAACTTTTTCACCTGTTGAAAACTATCAAATAAATGTTGGATCTG 1849 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1754 ATATCTTTTCTGGTCCAACATTTTCACCTGTTGAAAACTATCAAATAAATGTTGGATCTG 1813 Query 1850 CAATTGCTGCACCCGCATTTTCACCAACAAGCTGTTGTTCGGCTTCTGTATGGCATGATG 1909 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1814 CAATTGCTGCACCCGCATTTTCTCCAACAAGCTGTTGTTCGGCTTCTGTATGGCATGATG 1873 Query 1910 CTGCTAAGGACTGCGCAATGTTGAAAATCATCCGTGTTCTTCCTCCTGCTCTTCCGCGTA 1969 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1874 CTGCTAAGGACTGCGCAATGTTGAAAATTATCCGTGTTCTTCCTCCTGCTCTTCCACGTA 1933 Query 1970 ACCAATCAAAGGTTGATCAATCAACATGGGAGCGGGCGATCGCTGAGAGATTCTGGTGGA 2029 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1934 ACCAATCAAAGGTTGATCAATCAACATGGGAGCGGGCGATTGCTGAGAGATTCTGGTGGA 1993 Query 2030 GTCTTTTGGTCGGAGTTGATTGGTGGGATGCAGTTGGCTGCACACAGAGTGCTGCAGAGG 2089 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1994 GTCTTTTAGTCGGAGTTGATTGGTGGGATGCAGTTGGCTGCACACAGAGTGCCGCAGAGG 2053 Query 2090 ATGGGATAGTTTCATTGAACAGCGTGATTGCTGTCATGGATGCTGATTTTCACTCCCTTC 2149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2054 ATGGGATAGTTTCATTGAACAGCGTGATTGCTGTCATGGACGCTGATTTTCACTCCCTTC 2113 Query 2150 CTTCAACACAGCACAGACAACAATATGGCCCTAACCTAGATAGGATCAAATGTCGGTTAC 2209 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | Sbjct 2114 CTTCAACACAGCACAGACAACAATATGGCCCTAACCTAGATAGGATCAAGTGCCGGTTGC 2173 Query 2210 TTGAAGGAACCAATGCTCAAGAGGTTCGTGCCATGGTTTTAGATATGCAAGCAAGGTTGT 2269 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2174 TTGAAGGAACCAATGCTCAAGAGGTTCGTGCCATGGTTTTAGATATGCAAGCAAGGTTGC 2233 Query 2270 TGTTGGACATGCTTGGAAAAGGTATTGAATCAGCTCTTGTGAATCCTTCGGCGTTGGTTT 2329 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2234 TGTTGGACATGCTTGGAAAAGGAATTGAATCAGCTCTTGTGAATCCTTCGGCGTTGGTTT 2293 Query 2330 TTGAGCCATGGCGAGTAGATGGGGAGACAATAACAGGCATCAATCCGGAGGCAATGGCTG 2389 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 2294 TTGAGCCATGGCGAGTAGATGGGGAGACAATAACAGGCATCAATCCGGATGCAATGGCTG 2353 Query 2390 TTGATCCTGCTCTTGTTTCCAGTATTCAGGCTTATGTGGATGCTGTTCTTGATCTTGCTT 2449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2354 TTGATCCTGCTCTTGTTTCCAGTATTCAGGCTTATGTGGATGCTGTTCTTGATCTTGCTT 2413 Query 2450 CTCATTTCATCACACGTTTAAGGCGTTATGCGAGTTTTTGTCGGACTCTTGCAAGCCATG 2509 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2414 CTCATTTCATCACACGTTTAAGGCGCTATGCGAGTTTTTGTCGGACTCTTGCGAGCCATG 2473 Query 2510 CTGCTTCTGCTGGAACTGGCAGTAATCGCAACA-ATGTTACCAGTCCCACACAAAATGCA 2568 ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2474 CTGCTTCTGCTGGAACTGGCAGTAATCGCAATATA-GTTCCCAGTCCCACACAAAATGCA 2532 Query 2569 TCATCTCCTGCAACACCTCAGGTTTTTCCTGACAAGTCACTGTATCTTGCAGTAGGTCAA 2628 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | Sbjct 2533 TCATCTCCTGCAACACCTCAGGTTTTTCCTGACAAGTCACTGTATCATGCAGCAGG-C-- 2589 Query 2629 CctactactactactactactactGCTACGACAAACTCCAGCGGAAGCTCACATGTGCAA 2688 | | || |||||||||||||| || | || |||||| |||||| ||| ||| Sbjct 2590 C--A--AC--CTACTACTACTACT---AC-A-AA-CTCCAGTGGAAGC--ACA----CAA 2631 Query 2689 GCTTGGATGCAGGGGGCCATAGCGAAAATTAGTAGCTCGAATGATGGA-T--CCAACTCT 2745 |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || Sbjct 2632 GCTTGGATGCAGGGTGCCATAGCGAAAATTAGTAGCTCGAATGATGGAGTATCCAACACT 2691 Query 2746 ACTGCAAGCCCAATCAGTGGTTCACCTACCTTCATGCCAATAAGCATCAATACAGGAACA 2805 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2692 ACTGCAAACCCAATCAGTGGTTCACCTACCTTCATGCCAATAAGCATCAATACAGGAACA 2751 Query 2806 TTTCCAGGAACACCTGCTGTTCGGCTCATTGGGGATTGTCATTTCCTTCATCGGTTATGC 2865 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2752 TTTCCAGGAACACCTGCTGTTCGGCTCATTGGGGACTGTCATTTCCTTCATCGGTTATGT 2811 Query 2866 CAGCTGTTGCTCTTCTGTTTTCTCCAGCGGTCTTCACGATTTCCACAGCGAAATGCTGAT 2925 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2812 CAGCTGTTACTCTTCTGTTTTCTCCAGCGGTCTTCACGATTTCCCCAGCGAAATGCTGAT 2871 Query 2926 GTTAGTTCACAAAAACTTCAAACGGGGGCTACCAGCAAATTGGAAGAAGTCAACTCTGCT 2985 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2872 GTTAGTTCACAAAAACTTCAAACGGGGGCTACCAGCAAATTGGAAGAGGTCAACTCTGCT 2931 Query 2986 AAACCAACCCCTGCCTTGAACAGGATAGAGGACGCCCAGGGATTCCGGGGTGCCCAGTTG 3045 ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2932 AAACCAATCCCTCCCTTGAACAGGATAGAGGAAGCCCAGGGATTCCGGGGTGCCCAGTTG 2991 Query 3046 GGTACTGGAGTGAAAGGGATTGATGAAAATTCTGCTCGTACAACAAAGATGGGTTCTGGG 3105 ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2992 GGTGCTGGAGTGAAAGGGATTGACGAAAATTCTGCTCGTACAACAAAGATGGGTTCTGGG 3051 Query 3106 AATGCCGGTCAAGGATATACTTATGAGGAGGTGAGAGTTCTTTTCCATATACTAATGGAT 3165 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3052 AATGCCGGTCAAGGATATACTTATGAGGAGGTGAGAGTTCTTTTCCATATACTAATGGAT 3111 Query 3166 CTCTGCAAGCGAACATCTGGTCTTGCGCATCCCTTACCTGGCTCTCAGGTAGGTAGTGGA 3225 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3112 CTCTGCAAGCGAACATCTGGTCTTGCGCATCCCTTACCTGGCTCTCAGGTAGGTAGTGGA 3171 Query 3226 AACATTCAAGTTCGACTGCATTATATTGATGGAAATTACACTGTGTTACCCGAGGTGGTA 3285 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 3172 AACATTCAAGTTCGACTGCATTATATTGATGGAAATTACACAGTGTTGCCCGAGGTGGTA 3231 Query 3286 GAAGCGGCTCTTGGACCACATATGCAGAACATGCCTCGCCCAAGAGGAGCTGATGCTGCT 3345 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3232 GAAGCAGCTCTTGGACCACATATGCAGAACATGCCTCGCCCAAGAGGAGCTGATGCTGCT 3291 Query 3346 GGTCTTCTACTTCGGGAGTTAGAGCTTCATCCGCCTTCCGAAGAATGGCATAGAAGAAAT 3405 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3292 GGTCTTCTACTTCGGGAGTTAGAGCTTCATCCGCCTTCCGAAGAATGGCATAGAAGAAAT 3351 Query 3406 TTATTTGGTGGTCCCGGGTCAGAGCCTGAGGATATGATCTTGACAGACGATGTTTCCAAG 3465 || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct 3352 TTGTTTGGTGGTCCCGGGTCAGAGCCTGAGGATATGGTCCTGACAGACGATGTTTCCAAG 3411 Query 3466 CTGAGTAATTCCTTAGATCTGCCTGATACAAACTTTTCCGGAATATGTGATGGATACAAC 3525 |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3412 CTGAGTAACTCCTTAGATCTGTCTGATACAAGCTTTTCCGGAATATGTGATGGATACAAC 3471 Query 3526 AGAGTCCATAGTCTTTGGCCAAGAAAACGCAGGATGTCTGAAAGAGATGCAGCTTTTGGT 3585 |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3472 AGAGTCCATAGTCTTTGGCCTAGAAAGCGCAGGATGTCTGAAAGAGATGCAGCTTTTGGT 3531 Query 3586 TCAAATACTTCTGTGGGTTTGGGTGCATATCTTGGGATCATGGGTTCTCGTAGGGATGTT 3645 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3532 TCAAATACTTCTGTGGGTTTGGGTGCATATCTTGGAATCATGGGTTCTCGTAGGGATGTT 3591 Query 3646 GTGACCGCGACATGGAAAACTGGTCTTGAAGGAGTTTGGTACAAG 3690 || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 3592 GTCACCGCGACATGGAAAACTGGTCTTGACGGAGTTTGGTACAAG 3636 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 165512384977 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5