BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G10710.1
Length=3639
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg942891 jgi|Araly1|942891|scaffold_603435.1 5373 0.0
Ahg895208 jgi|Araly1|895208|Al_scaffold_0006_3204 2036 0.0
Ahg895136 jgi|Araly1|895136|Al_scaffold_0006_3132 1205 0.0
> Ahg942891 jgi|Araly1|942891|scaffold_603435.1
Length=3271
Score = 5373 bits (2909), Expect = 0.0
Identities = 3154/3273 (96%), Gaps = 13/3273 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 158 GTTGCTGCTGGACTCTTTAGATGGCAGACTCTCGGAATGGTAATGCCCGAGCCCCTCCTA 217
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
Sbjct 1 GTTGCTTCTGGATTCTTTAGATGGCAGACTCTCGGAATGGTAATGCGCGAGCTCCGAGTG 60
Query 218 GTGGAGTGCCTCCAAAAGCTGGGAATACTTATTCCATAGATGTTAAAAACTTTATCTCAC 277
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 61 GAGGAGTGCCTCCAAAAGCTGGGAATACTTACTCCATAGATGTTAAAAATTTTATCTCAC 120
Query 278 GTGCAAGAGCATTGTATGAACACTGGAAGAAGCACAGTGCAGACTTATGGGGATCTGCCG 337
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 121 GTGCAAGAGCTTTGTATGAGCACTGGAAGAAGCACAGTGCAGACTTATGGGGATCTGCAG 180
Query 338 ACGCTCTTGCCATTGCTACCCCTCCTGCTTCTGATGATCTGCGTTACCTGAAATCTTCAG 397
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 181 ACGCTCTTGCCATTGCTACACCTCCTGCTTCTGATGATCTGCGCTACCTGAAATCGTCAG 240
Query 398 CGTTGAATATTTGGCTTCTTGGGTATGAGTTTCCAGATACAATTATGGTTTTTAC--CAA 455
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |
Sbjct 241 CGCTGAATATTTGGCTTCTTGGGTATGAGTTTCCAGATACGATAATGGTTTTTACTTC-A 299
Query 456 GAAGCAGATCCATTTCCTGTGTAGTAGGAACAAGGCTTCTCTACTTGAAGTTGTGAAAAA 515
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 300 -AAGCAGATCCATTTCCTGTGTAGTAGGAACAAGGCATCTCTGCTTGAAGTTGTGAAGAA 358
Query 516 ACCTGCACATGATGAGTTGAAGCTTGATGTTATCATGCATGTTAAGCCTAAGGGTGATGA 575
| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 AGCTGCACATGATGAGTTGAAGGTTGATGTTATTATGCATGTTAAGCCTAAGGGTGATGA 418
Query 576 TGGAACAGGGCTGATGGATGCCATATTTCGT-GCCATCCGTGATCTATCCCGGGGTGATG 634
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 419 TGGAACAGGGCTGATGGATGCCATATTTC-TAGCCATTCGAGATCTATCCCGGGGTGATG 477
Query 635 GAAATGATTCACAAGTTGTTGGACACATTGCTCGTGAAGCCCCTGAAGGTAAGCTTCTGG 694
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478 GAAATGATTCACAAGTTGTAGGACACATTGCTCGTGAAGCCCCTGAAGGTAAGCTTCTGG 537
Query 695 AGACATGGACTGAGAGGCTAAAGAATGCAAACTTCCAGTTCGTAGATATAACTGGGGGGC 754
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 538 AGACATGGACTGAGAGGCTAAAGAATGCAAACTTCCAGTTTGTAGATATAACTGGGGGCC 597
Query 755 TGTCTGATCTATTTGCTGTTAAAGACGATACTGAGGTCATGAGTGTGAAGAAAGCTGCGT 814
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 598 TGTCTGATCTCTTTGCTGTTAAAGACGATACTGAGGTCATGAGTGTGAAGAAAGCTGCTT 657
Query 815 ATCTAGCCTACAGTGTGATGAAAAATGTTGTTGTTCCAAATCTTGAGAGTGCCATTGATG 874
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 658 ATCTAGCCTACAGTGTGATGAAAAATGTTGTTGTTCCAAACCTTGAGAGTGCCATTGATG 717
Query 875 AGGAGAAAGACGTCACCCACTCTGCCCTGATGGATCTCACTGAGAAAGCGATACTTGAGC 934
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 AGGAGAAAGACGTCACCCACTCTGCCTTGATGGATATCACTGAGAAAGCGATACTTGAGC 777
Query 935 CAACTAAGGCCAGTGTGAAACTGAAGCCAGAGAATGTTGACATATGCTACCCTCCGATAT 994
||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 CAACTAAGGCCAGTGTGAAGCTGAAGGCAGAAAATGTTGACATATGCTACCCTCCGATAT 837
Query 995 TTCAAAGCGGAGGCAAGTTTGATCTCAAACCAAGTGCTGCAAGCAATGATGAACTGCTCA 1054
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 TTCAAAGCGGAGGCAAGTTTGATCTCAAACCAAGTGCTGCAAGCAATGATGAACTGCTCA 897
Query 1055 CTTATGATCCAGCGAGTATCATAATATGTGCTGTTGGTGCTAGGTATAATAGTTATTGCT 1114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 898 CTTATGATCCAGCGAGTATCATAATATGTGCTGTTGGTGCTCGGTATAATAGTTATTGCT 957
Query 1115 CAAATGTTGCCAGGACCTACCTAATAGATGCAACTTCTCTCCAGAGCAAGGCATATGAGG 1174
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 958 CAAATGTTGCCAGGACTTACCTAATAGATGCAACTTCTCTTCAGAGCAAGGCATATGAGG 1017
Query 1175 TTCTTCTCAAGGCACATGAGGCTGCTATTGATGCTTTGAGGTCAGGAAGAAAGATAAACA 1234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 TTCTTCTCAAGGCACATGAGGCTGCTATTGATGCTTTGAGGTCAGGAAGAAAGATAAACA 1077
Query 1235 CTGTCTATCAAGCTGCCCTTTCTGTTGTTGAAAAGAATGCCCCTGAGTTCGTTGACAAGC 1294
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078 CTGTATATCAAGCTGCCCTTTCCGTTGTTGAAAAGAATGCCCCTGAGTTCGTTGACAAGC 1137
Query 1295 TAACTAAATCTGCTGGGACTGGTATCGGTCTGGAATTCCGAGAGTCAGGATTAAATATAA 1354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 TAACTAAATCTGCTGGGACTGGTATCGGTCTGGAATTCCGAGAGTCAGGATTAAATATAA 1197
Query 1355 ATGCAAAGAATGATAAAGTATTGAGACCGAAGATGGCATTTAATGTGTCTCTTGGTTTCC 1414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 ATGCAAAGAATGATAAAGTATTGAGACCGAAGATGGCATTTAATGTGTCTCTTGGTTTCC 1257
Query 1415 AGAACTTGGAATGTGAGTCAGAAAGCCGCAGCAAGAACAAGAAATTCTCACTTTTGCTAG 1474
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 AGAACTTGGAATGTGAGTCAGAAACCCGCAGCAAGAACAAGAAATTCTCACTTTTGCTAG 1317
Query 1475 CTGACACAGTTCTCGTCACAGATCAGAAACCGGAGCTTTTAACCAAGTGCTCTAAATCTG 1534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1318 CTGACACAGTTCTCGTCACAGATCAGAAACCGGAGCTTTTAACGAAGTGCTCTAAATCTG 1377
Query 1535 TTAAGGATGTGGCTTACTCCTTTAAAGAGGATGAAGAAGAAGAGAAACCGCGCAAGAAAG 1594
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1378 TTAAGGATGTGGCTTACTCCTTCAAAGAGGATGAAGAAGAAGAGAAACCACGCAAGAAAT 1437
Query 1595 CTAGGACCAGTGGTTCTGAGAACTACATTACCAAGACAGCTCTTAGATCAGATGATCATG 1654
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 CTAGGACCAGCGGTTCTGAGAACTACATTACCAAGACAGCTCTTAGATCAGATGATCATG 1497
Query 1655 TGGTGTCTAAAGAAGAGCTACGGAAGCAGCACCAGGCAGAGCTGGCACGCCAGAAAAATG 1714
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 TGGTGTCGAAAGAAGAGCTACGGAAGCAGCACCAGGCAGAGCTGGCACGCCAGAAAAATG 1557
Query 1715 AAGAAACTGCCAGAAGGCTTGCTGGTGACAGTTCTGGGGCGGGAGACAGCCGGTCTACTG 1774
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558 AAGAAACTGCCAGAAGGCTTGCTGGTGACAGGTCTGGGGCGGGAGACAGCCGGTCTACTG 1617
Query 1775 CAAAGACTTCAGCTGATGTGGTTGCCTACAAGAATGTTAACGACATGCCCCATAAGGAAT 1834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 1618 CAAAGACTTCAGCTGATGTGGTTGCCTACAAGAATGTTAACGACATGCCCCATCGGGATT 1677
Query 1835 TGATGATCCAGGTTGATACGAGAAACGAGGCTGTATTGTTACCCATCTATGGGAGCTTGG 1894
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1678 TGATGATCCAGGTTGATACGAGGAACGAGGCTGTATTGTTACCCATCTATGGTAGCTTGG 1737
Query 1895 TTCCATTCCATGTGGCTACAATAAGAACAGTGTCAGGCAATCAAGATACCAACCGAAACT 1954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1738 TTCCATTCCATGTGGCTACAATAAGAACAGTGTCAGGCAATCAAGATACCAACCGGAACT 1797
Query 1955 GCTACATCCGTATCATTTTCAATGTCCCGGGTACACCCTTCAACCCTCATGACTCAAACT 2014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1798 GCTACATCCGTATCATTTTCAATGTCCCGGGTACACCCTTCAACCCTCATGACTCAAACT 1857
Query 2015 CTTTGAAAAACCAGGGTGCTATCTACCTCAAGGAGGTTTCATTCCGGACCAAGGATTCAA 2074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1858 CTTTGAAAAACCAGGGTGCTATCTACCTCAAGGAGGTTTCATTCCGGACCAAGGATTCAA 1917
Query 2075 GGCATAGCAGCGAAGTAACTCAACAGATTAAGACCCTTAGACGGCAAGTCATGGCCAGGG 2134
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1918 GGCATAGCAGCGAAGTAACTCAGCAGATTAAGACCCTTAGACGGCAAGTCATGGCCCGGG 1977
Query 2135 AGTCAGAGAGAGCTGAAAGGGCGACATTGGTGACCCAAGAGAAACTTCAGCTTGCAGGGA 2194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1978 AGTCAGAGAGAGCTGAAAGGGCGACATTGGTGACCCAAGAGAAACTTCAGCTTGCAGGGA 2037
Query 2195 ACAAGTTCAAACCCCTCAGGTTGTCCGAGCTGTGGATCCGTCCGCCTTTTAGTGGGCGCA 2254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2038 ACAAGTTCAAACCCCTCAGGTTGTCCGAGCTGTGGATCCGTCCGCCTTTTAGTGGGCGCA 2097
Query 2255 AGAAGATTCCTGGGACACTCGAAGCTCATGCAAATGGTTTCAGGTATTCAACTACCAGGC 2314
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2098 AGAAGATTCCTGGGACACTCGAAGCTCATGCAAATGGTTTCAGGTATTCAACTACCAGAC 2157
Query 2315 CTGACGAGCGCGTGGATGTCCTGTTTGCAAACATAAAGCATGCGTTTTTCCAGCCTGCTG 2374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2158 CTGACGAGCGCGTGGATGTCCTGTTTGCAAACATAAAGCATGCGTTTTTCCAGCCTGCTG 2217
Query 2375 AGAAGGAGATGATCACCCTCCTTCATTTTCATTTGCACAACCACATCATGGTAGGAACTA 2434
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2218 AGAAGGAGATGATCACCCTCCTTCATTTTCATTTGCACAACCACATCATGGTAGGAACCA 2277
Query 2435 AGAAGACAAAGGACGTTCAATTCTATGTGGAGGTAATGGATGTTGTGCAGTCTTTAGGTG 2494
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2278 AGAAGACAAAGGACGTCCAATTCTATGTGGAGGTAATGGATGTTGTGCAGTCTTTAGGTG 2337
Query 2495 GTGGGAGGAGATCAGCCTATGATCCAGATGAGATTGACGAAGAACAGAGGGAGCGCGATA 2554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||
Sbjct 2338 GTGGGAGGAGATCAGCCTATGATCCAGATGAGATTGATGAAGAACAGCGAGAGCGCGATA 2397
Query 2555 GGAAGAACAAGATCAACATGGATTTCAATCATTTTGCAAACCGGGTGAATGATATGTGGC 2614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2398 GGAAGAACAAGATCAACATGGATTTCAATCATTTTGCAAACCGGGTGAATGATATGTGGC 2457
Query 2615 AACTACCACAGTTTGCAAGTCTGGACCTTGAGTTTGATCAACCTCTGAGAGAGCTTGGTT 2674
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2458 AACTACCCCAGTTTGCAAGTCTGGACCTTGAGTTTGATCAACCTCTGAGAGAGCTTGGTT 2517
Query 2675 TCCATGGTGTTCCGCACAAGACATCTGCATTCATAATACCGACCTCCAGCTGCTTAGTTG 2734
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2518 TCCATGGTGTTCCGCACAAGACATCTGCATTCATTATACCGACCTCTAGCTGCTTAGTTG 2577
Query 2735 AGCTGATAGAATACCCGTTCCTCGTGGTGAGTCTGAGTGAGATTGAGATTGTGAATCTTG 2794
|||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2578 AGCTGATAGAATTCCCGTTCCTGGTGGTCAGTCTTAGTGAGATTGAGATAGTGAATCTTG 2637
Query 2795 AGAGAGTTGGGTTTGGGCAGAAGAACTTTGACATGGCCATCATCTTCAAGGACTTCAAAA 2854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2638 AGAGAGTTGGGTTTGGGCAGAAGAACTTTGACATGGCCATCATCTTCAAGGACTTCAAAA 2697
Query 2855 AAGATGTTCTCAGGGTTGACTCAGTTCCCACAAGCTCCCTAGAGGGGATAAAGGAGTGGC 2914
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2698 AAGATGTTCTCAGGGTTGACTCAGTTCCCACAAGTTCGCTAGAGGGGATAAAGGAGTGGC 2757
Query 2915 TAGACACCACAGATATAAAGTACTACGAGAGCAAACTGAATCTGAACTGGAGACAGATCC 2974
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2758 TTGACACTACAGATATAAAGTACTACGAGAGCAAACTGAATCTGAACTGGAGACAGATCC 2817
Query 2975 TAAAGACGATCACAGATGATCCGCAGAGCTTTATAGATGATGGAGGATGGGAGTTTCTGA 3034
| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2818 TGAAGACGATCACGGATGACCCACAGAGCTTTATAGATGATGGAGGATGGGAGTTTTTGA 2877
Query 3035 ACCTGGACGGAAGCGATTCAGAATCTGGCGGGTCTGAGGAGTCAGACAAAGGATATGAAC 3094
| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 2878 ATCTGGATGGAAGCGACTCAGAATCTGGAGGCTCTGAGGAGTCGGACAAAGGTTATGAAC 2937
Query 3095 CATCAGATGTAGAGGTTGAGTCTGAGTCAGAGGACGAGGCTTCAGAGAGTGAGTCACTGG 3154
| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2938 CGTCAGATGTGGAGGTTGAGTCTGAGTCAGAGGATGAGGCTTCAGAGAGTGAGTCACTGG 2997
Query 3155 TGGAGTCAGACGATGATGAAGAAGA-G-G-ACTCAGAGCAAGAGTCAGAGGAAGAGAAAG 3211
||||||| || ||||| |||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2998 TGGAGTCCGATGATGAAGAAGAAGAAGAGGACTCAGAGCAAGAGTCGGAGGAAGAGAAAG 3057
Query 3212 GTAAGACTTGGGATGAACTGGAGAGAGAAGCTACTAATGCAGACAGAGAGCATGGAGTTG 3271
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3058 GTAAGACTTGGGATGAACTGGAGAGAGAAGCTACCAATGCAGACAGAGAGCATGGAGTTG 3117
Query 3272 AGTCTGATAGCGAGGAAGAGAGGAAGAGAAGAAAGATGAAAGCGTTTGGGAAATCGCGAC 3331
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3118 AGTCTGATAGCGAGGAAGAGAGGAAGAGAAGGAAGATGAAAGCGTTTGGGAAATCACGAC 3177
Query 3332 CTGGAACTAGCGGTGGAGGTGGTAGTAGCAGCATGAAGAACATGCCACCATCTAAACGCA 3391
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3178 CTGGAACTAGCGGTGGAGGCGGTCGTAGCAGCATGAAGAACATGCCACCATCCAAACGCA 3237
Query 3392 --A-GCACAGGTGAAGAAAC-TCAAAAAGTTCG 3420
| ||||||||||||||| | ||||| ||||
Sbjct 3238 GCAAGCACAGGTGAAGAAATATAAAAAATTTCG 3270
> Ahg895208 jgi|Araly1|895208|Al_scaffold_0006_3204
Length=1599
Score = 2036 bits (1102), Expect = 0.0
Identities = 1453/1618 (90%), Gaps = 42/1618 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1800 CTACAAGAATGTTAACGACATGCCCC-A--TAAGGAATTGATGATCCA-GGTTGATACGA 1855
|||||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||| || ||||||| | |
Sbjct 9 CTACAAGAATATTAACGACATTCCCCAACCTCGGGATTTGATGAT-CATGGTTGAT-C-A 65
Query 1856 GAA-A-CGAGGCTGTATTGTTACCCATCTATGGGAGCTTGGTTCCATTCCATGTGGCTAC 1913
|| | | | |||||||| ||||| || || || | | ||||||||||| | ||| ||||
Sbjct 66 TAAGAGCAACGCTGTATTATTACCAATATACGGCATCATGGTTCCATTCAACGTGACTAC 125
Query 1914 AATAAGAACAGTGTCAGGCAATCAAGATACCAACCGAAACTGCTACATCCGTATCATTTT 1973
|||||||||||| | ||| | | || | | ||| | | |||||||||||||||
Sbjct 126 AATAAGAACAGTCTTAGG----C-A-AT--C-A---AAA-TAC--CATCCGTATCATTTT 170
Query 1974 CAATGTCCCGGGTACACCCTTCAACCCTCATGACTCAAACTCTTTGAAAAACCAGGGTGC 2033
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||
Sbjct 171 CAATGTCCCGGGTACACCCTTCAACCCTCATGACTCCAACTCCTTGAAAAATCAGGACGC 230
Query 2034 TATCTACCTCAAGGAGGTTTCATTCCGGACCAAGGATTCAAGGCATAGCAGCGAAGTAAC 2093
||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 231 TATTTACATCAAGGAGGTTTCCTTCCGGACCAAGGATTCAAAGCATAGCAGCCAAGTAGT 290
Query 2094 TCA-ACAGATTAAGACCCTTAGACGGCAAGTCATGGCCAGGGAGTCAGAGAGAGCTGAAA 2152
||| | | |||||||||| | |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||
Sbjct 291 TCAGTC-GTTTAAGACCCTCAAACGGAAAGTCATGTCCCTGGAGTCAGAGAGAGCGGAAA 349
Query 2153 GGGCGACATTGGTGACCCAAGAGAAACTTCAGCTTGCAGGGAACAAGTTCAAACCCCTCA 2212
| || |||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||| ||||||| | |
Sbjct 350 GAACGTCATTGGTGACTCAAGAGAAACTTAAGATTGCAAGTAACAAGTCCAAACCCTTAA 409
Query 2213 GGTTGTCCG-AGCTGTGGATCCGTCCGCCTTTTAGTGGGCGCAAGAAGATTCCTGGGACA 2271
|||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 410 GGTTGT-TGAACCTGTGGATCCGTCCGCCTTTTAGTGGGCGCAAGAAGATTCGTGGGACA 468
Query 2272 CTCGAAGCTCATGCAAATGGTTTCAGGTATTCAACTACCAGGCCTGACGAGCGCGTGGAT 2331
|| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | | |||| |||| |||||||||
Sbjct 469 CTGGAAGCTCATGCCAATGGTTTCAGGTATTC-A--A-C-GGCC-AACGACCGCGTGGAT 522
Query 2332 GTCCTGTTTGCAAACATAAAGCATGCGTTTTTCCAGCCTGCTGAGAAGGAGATGATCACC 2391
||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||
Sbjct 523 GTCTTGTTTGCAAACATAAAGCATGCGTTTGTCCAACCGGCTGAGAAAGAGATGACCACC 582
Query 2392 CTCCTTCATTTTCATTTGCACAACCACATCATGGTAGGAACTAAGAAGACAAAGGACGTT 2451
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 583 CTTCTTCATTTTCATTTGCACAACCACATCATGGTAGGAACCAAGAAGACAAAGGACGTC 642
Query 2452 CAATTCTATGTGGAGGTAATGGATGTTGTGCAGTCTTTAGGTGGTGGGAGGAG---ATCA 2508
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 643 CAATTCTATGTGGAGGTAAGGGATGTTGTGCAGTCTTTAGGTAGTGGGAGGAGATCATCA 702
Query 2509 GCCTATGATCCAGATGAGATTGACGAAGAACAGAGGGAGCGCGATAGGAAGAACAAGATC 2568
|||||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 703 GCCTATGATCTAGATGAGATAGATGAAGAACAGCGAGAGCGAGATAGGAAGAACAAGATC 762
Query 2569 AACATGGATTTCAATCATTTTGCAAACCGGGTGAATGATATGTGGCAACTACCACAGTTT 2628
|||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||
Sbjct 763 AACATGGAGTTCAATCATTTTGCAAACCGGGTCAACGATATATGGAAACTACCCCAGTTT 822
Query 2629 GCAAGTCTGGACCTTGAGTTTGATCAACCTCTGAGAGAGCTTGGTTTCCATGGTGTTCCG 2688
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 GCAAGTCTGGACCTAGAGTTTGATCAACCTCTGAGAGAGCTTGGTTTCCATGGTGTTCCG 882
Query 2689 CACAAGACATCTGCATTCATAATACCGACCTCCAGCTGCTTAGTTGAGCTGATAGAATAC 2748
|| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 883 CATAAGACATCTGCATTCATTATACCGACCTCTAGCTGCTTAGTTGAGCTGATAGAACAC 942
Query 2749 CCGTTCCTCGTGGTGAGTCTGAGTGAGATTGAGATTGTGAATCTTGAGAGAGTTGGGTTT 2808
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 943 CCGTTCCTCGTGGTAAGTCTGAGTGAGATTGAGATAGTGAATCTTGAAAGAGTTGGGTTT 1002
Query 2809 GGGCAGAAGAACTTTGACATGGCCATCATCTTCAAGGACTTCAAAAAAGATG-TTCTCAG 2867
||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | ||
Sbjct 1003 GGGCAGAGGAGCTTTGACATGGTTATCATATTCAAGGACTTCAAAAAAGATGTTTAT-AG 1061
Query 2868 GGTTGACTCAGTTCCCACAAGCTCCCTAGAGGGGATAAAGGAGTGGCTAGACACCACAGA 2927
| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||
Sbjct 1062 GATTGACTCAGTTCCCACAAGTTCACTAGAGGGGATAAAGGAGTGGCTTGACACTATAGA 1121
Query 2928 TATAAAGTACTACGAGAGCAAACTGAATCTGAACTGGAGACAGATCCTAAAGACGATCAC 2987
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 1122 TATAAAGTACTACGAGAGCAAACTGAATCTGAACTGGAGACAGATCCTGAAGACAATCAC 1181
Query 2988 AGATGATCCGCAGAGCTTTATAGATGATGGAGGATGGGAGTTTCTGAACCTGGACGGAAG 3047
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 1182 TGATGATCCACAGAGCTTTATAGATGATGGAGGGTGGGAGTTTTTGAACCTGAACGGAAG 1241
Query 3048 CGATTCAGAATCTGGCGGGTCTGAGGAGTCAGACAAAGGATATGAACCATCAGATGTAGA 3107
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1242 CGATTCAGAATCTGGCGGCTCTGAGGAGTCAGACAAAGGATATGAACCATCAGATGTAGA 1301
Query 3108 GGTTGAGTCTGAGTCAGAGGACGAGGCTTCAGAGAGTGAGTCACTGGTGGAGTCAGACGA 3167
|| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||
Sbjct 1302 GGCTGAGTCTGAGTCAGAGGATGAGGATTCAGAGAGTGAGTCAATGATGGAGTCAGAGGA 1361
Query 3168 TGATGAAGAAGAGGACTCAGAGCAAGAGTCAGAGGAAGAGAAAGGTAAGACTTGGGATGA 3227
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1362 TGAAGAAGAAGAGGACTCAGAGCAAGAGTCAGAGGAAGAGAAAGGTAAGACTTGGGATGA 1421
Query 3228 ACTGGAGAGAGAAGCTACTAATGCAGACAGAGAGCATGGAGTTGAGTCTGATAGCGAGGA 3287
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1422 ACTTGAGAGAGAAGCTACTAATGCAGACAGAGAGCATGGAGTTGAGTCTGATAGCGAGGA 1481
Query 3288 AGAGAGGAAGAGAAGAAAGATGAAAGCGTTTGGGAAATCGCGACCTGGAACTAGCGGTGG 3347
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 1482 AGAGAGGAAGAGAAGGAAGATGAAAGCGTTTGGGAAATCGCGACCTGGAAGTAGTGGTGG 1541
Query 3348 AGGTGGTAGTAGCAGCATGAAGAACATGCCACCATCTAAACGCA--A-GCACAGGTGA 3402
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 1542 AGGCGGTAGTAGCAGCATGAAGAACATGCCACCATCTAAACGCAGCAAGCACAGGTGA 1599
> Ahg895136 jgi|Araly1|895136|Al_scaffold_0006_3132
Length=1710
Score = 1205 bits (652), Expect = 0.0
Identities = 748/796 (94%), Gaps = 0/796 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2592 AAACCGGGTGAATGATATGTGGCAACTACCACAGTTTGCAAGTCTGGACCTTGAGTTTGA 2651
||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 753 AAACCGGGTCAACGATATGTGGCAACTACCCCAGTTTGCAAGTCTTAACCTAGAGTTTGA 812
Query 2652 TCAACCTCTGAGAGAGCTTGGTTTCCATGGTGTTCCGCACAAGACATCTGCATTCATAAT 2711
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||
Sbjct 813 TCAACCTCTGAGAGAGCTTGGCTTCCATGGTGTTCCGTATAAGACATCTGTATTCATTAT 872
Query 2712 ACCGACCTCCAGCTGCTTAGTTGAGCTGATAGAATACCCGTTCCTCGTGGTGAGTCTGAG 2771
||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||
Sbjct 873 ACCAACCTCGAGCTGCTTAGTTGAGCTGATAGAAAACCCGTTCTTAGTGGTAAGTCTGAG 932
Query 2772 TGAGATTGAGATTGTGAATCTTGAGAGAGTTGGGTTTGGGCAGAAGAACTTTGACATGGC 2831
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 933 TGAGATTGAGATAGTGAATCTTGAGAGAGTTGGGTTTGGGCAGAAGAACTTTGACATGGC 992
Query 2832 CATCATCTTCAAGGACTTCAAAAAAGATGTTCTCAGGGTTGACTCAGTTCCCACAAGCTC 2891
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 993 CATCATCTTCAAGGACTTCAAAAAAGATGTTCTCAGAGTTGACTCAGTTCCCACAAGTTC 1052
Query 2892 CCTAGAGGGGATAAAGGAGTGGCTAGACACCACAGATATAAAGTACTACGAGAGCAAACT 2951
||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1053 ACTAGAGGGGATAAAGGAGTGGCTTGACACTATAGATATAAAGTACTACGAGAGCAAACT 1112
Query 2952 GAATCTGAACTGGAGACAGATCCTAAAGACGATCACAGATGATCCGCAGAGCTTTATAGA 3011
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113 GAATCTGAACTGGAGACAGATCCTGAAGACGATCACGGATGATCCGCAGAGCTTTATAGA 1172
Query 3012 TGATGGAGGATGGGAGTTTCTGAACCTGGACGGAAGCGATTCAGAATCTGGCGGGTCTGA 3071
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||
Sbjct 1173 TGATGGAGGATGGGAGTTTTTGAATCTGGACGGAAGCGACTCAGAATCTGGAGGCTCTGA 1232
Query 3072 GGAGTCAGACAAAGGATATGAACCATCAGATGTAGAGGTTGAGTCTGAGTCAGAGGACGA 3131
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1233 GGAGTCAGACAAAGGATATGAACCGTCAGATGTCGAGGTTGAGTCTGAGTCAGAGGATGA 1292
Query 3132 GGCTTCAGAGAGTGAGTCACTGGTGGAGTCAGACGATGATGAAGAAGAGGACTCAGAGCA 3191
|||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 1293 GGCTTCAGAGAGTGGGTCAATGGTTGAGTCAGAGGATGAAGAAGAAGAGGACTCAGAGAA 1352
Query 3192 AGAGTCAGAGGAAGAGAAAGGTAAGACTTGGGATGAACTGGAGAGAGAAGCTACTAATGC 3251
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1353 AGAGTCAGAAGAAGAGAAAGGTAAGACTTGGGATGAGCTGGAGAGAGAAGCTACTAATGC 1412
Query 3252 AGACAGAGAGCATGGAGTTGAGTCTGATAGCGAGGAAGAGAGGAAGAGAAGAAAGATGAA 3311
||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1413 AGATAGAGAGCATGGAGTTGAGTTTGATAGTGAGGAAGAGAGGAAGAGAAGGAAGATGAA 1472
Query 3312 AGCGTTTGGGAAATCGCGACCTGGAACTAGCGGTGGAGGTGGTAGTAGCAGCATGAAGAA 3371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 1473 AGCGTTTGGGAAATCGCGACCTGGAACTAGCGGTGGAGGCGGTAGTAGTAGCATGAAGAA 1532
Query 3372 CATGCCACCATCTAAA 3387
||||||||||||||||
Sbjct 1533 CATGCCACCATCTAAA 1548
Score = 791 bits (428), Expect = 0.0
Identities = 663/772 (86%), Gaps = 33/772 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 1800 CTACAAGAATGTTAACGACATGCCCC-A--TAAGGAATTGATGATCCA-GGTTGAT-ACG 1854
|||||||||| ||||||||||||||| | | ||| |||||||| || | ||||| ||
Sbjct 9 CTACAAGAATATTAACGACATGCCCCAACCTCGGGATTTGATGAT-CACGATTGATCACA 67
Query 1855 AGAAACGAGGCTGTATTGTTACCCATCTATGGGAGCTTGGTTCCATTCCATGTGGCTACA 1914
|| | | | |||||||| ||||| || || || ||| ||||||||||| | ||| |||||
Sbjct 68 AG-AGCAACGCTGTATTATTACCAATATACGGCAGCATGGTTCCATTCAACGTGACTACA 126
Query 1915 ATAAGAACAGTGTCAGGCAATCAAGATACCAACCGAAACTGCTACATCCGTATCATTTTC 1974
||||||||||| | ||| | | || | | ||| | | |||||||||||| |||
Sbjct 127 ATAAGAACAGTCTTAGG----C-A-AT--C-A---AAA-TAC--CATCCGTATCATCTTC 171
Query 1975 AATGTCCCGGGTACACCCTTCAACCCTCATGACTCAAACTCTTTGAAAAACCAGGGTGCT 2034
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 172 AATGTCCCGGGTACACCCTTAAACCCTAATGACTCAAACTCTTTGAAAAACCAGGATGCT 231
Query 2035 ATCTACCTCAAGGAGGTTTCATTCCGGACCAAGGATTCAAGGCATAGCAGCGAAGTAACT 2094
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 232 ATCTACCTCAAGGAGGTTTTTTTCCGGACCAAGGATTCAAGGCATAGCAGCCAAGTAGTT 291
Query 2095 CA-ACAGATTAAGACCCTTAGACGGCAAGTCATGGCCAGGGAGTCAGAGAGAGCTGAAAG 2153
|| | | |||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||
Sbjct 292 CAGTC-GTTTAAGACCCTCAAACGGCAAGTCATGTCCCGGGAGTCAGAGAGAGCGGAAAG 350
Query 2154 GGCGACATTGGTGACCCAAGAGAAACTTCAGCTTGCAGGGAACAAGTTCAAACCCCTCAG 2213
|| |||||||||| |||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||| | ||
Sbjct 351 AACGTCATTGGTGACTCAAGAGAAACTTAAGATTGCAAGTAACAAGGCCAAACCCTTAAG 410
Query 2214 GTTGTCCGAGCTGTGGATCCGTCCGCCTTTTAGTGGGCGCAAGAAGATTCCTGGGACACT 2273
||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 GTTGTCCAACCTATGGATCCGTCCGCCTTTTAGTGGGCGCAAGAAGATTCCTGGGACACT 470
Query 2274 CGAAGCTCATGCAAATGGTTTCAGGTATTCAACTACCAGGCCTGACGAGCGCGTGGATGT 2333
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||
Sbjct 471 GGAAGCTCATGCCAATGGTTTCAGGTATTCAACGACCA------ACGAGCGCGTAGATGT 524
Query 2334 CCTGTTTGCAAACATAAAGCATGCGTTTTTCCAGCCTGCTGAGAAGGAGATGATCACCCT 2393
||| |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 525 CCTCTTTGCAAACATAAAGCATGCGTTTGTACAACCGGCTGAGAAGGAGATGACCACTCT 584
Query 2394 CCTTCATTTTCATTTGCACAACCACATCATGGTAGGAACTAAGAAGACAAAGGACGTTCA 2453
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||
Sbjct 585 CCTTCATTTTCATTTGCACAATCACATCATGGTAGGAACCAAGAAAACAAAGGACGTCCA 644
Query 2454 ATTCTATGTGGAGGTAATGGATGTTGTGCAGTCTTTAGGTGGTGGGAGGAGAT---CAGC 2510
|| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 645 GTTTTACGTGCAGGTAATGGATGTTGTGCAGTCTTTAGGTGGTGGGAGGAGATGATCATC 704
Query 2511 CTATGATCCAGATGAGATTGACGAAGAACAGAGGGAGCGCGATAGGAAGAAC 2562
||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||
Sbjct 705 CTATGATCCAGATGAGATTGATGAAGAACAGCGAGAGCGCGATAGGAAAAAC 756
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 137463953676
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5