BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT4G12010.1

Length=3774
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg327329 jgi|Araly1|327329|fgenesh1_pm.C_scaffold_6002549          5044    0.0  


> Ahg327329 jgi|Araly1|327329|fgenesh1_pm.C_scaffold_6002549
Length=3639

 Score = 5044 bits (2731),  Expect = 0.0
 Identities = 3129/3320 (94%), Gaps = 32/3320 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  362   TCAAGTTACCA-GAATTGACTTTTCCCGGAGTTACGCCGGAAGAAATTTCATCGTGGAAG  420
             ||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct  329   TCAAGATA-CAGGAATTGACTTTTCCCGGAGTTTCACCGGAAGAGATTTCATCATGGAAG  387

Query  421   GCTGCTCTTGCCTCAGCATCCAACATCCTAGGTTATGTAGTCAAGGAAATTAGCACGTCT  480
             |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  388   GCTGCTCTTGCCTCAGCATCCAACATTCTCGGTTATGTAGTCAAGGAAATAAGCACGTCT  447

Query  481   GAGGCCAAACTTGTTGATGAAATAGCCGTTGACACATTCAAGAAGTTGAATGATTTGGCT  540
             |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  448   GAGGCCAACCTTGTTGATGAAATTGCTGTTGACACATTCAAGAAGCTGAATGATTTGGCT  507

Query  541   CCAAGCGGGAACGAAGGTCTCGTGGGGATAGAATCGCGTCTGAAGAATCTTGAAAAGTTG  600
             ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||
Sbjct  508   CCAAGTGGGAACGAAGGTCTCGTGGGAATAGAATCGCGTTTGAAGAATCTTGAAAAACTG  567

Query  601   TTATCATGGGAGGATTTGGATACCGTTCATATCATAGGCATTGTTGGAATGGTTGGGATT  660
             ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  568   TTATCATGGGAGGATTTGGATTCTGTTCATATCATAGGCATTGTTGGAATGGTTGGGATT  627

Query  661   GGGAAAACGACTCTTGCTGATTGTTTGTATGGACGTATGCGTGGTCAGTTCGACGGTAGC  720
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  628   GGGAAAACGACTCTTGCTGATTGTTTGTATGGACGTATGCGTGGTCAGTTCGACGGTAGC  687

Query  721   TGCTTCCTTACTAATATCCGCGAAAATTCAGGTAGAAGCGGGTTAGAATCTTTGCTGCAG  780
             ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct  688   TGCTTCCTTACAAATATTCGCGAAAATTCGGGTCGAAGCGGATTAGAATATTTGCTGCAG  747

Query  781   AAACTCTTTTCCACTGTACTTAATGATAGAGATTTGGAGATTGGAGCTCCTGGAAATGCA  840
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  748   AAACTCTTTTCCACTGTACTAAATGATAGAGATTTGGAGATTGGAGCTCCTGGAAATGCA  807

Query  841   CATGAGAGATTTGAGCGGCGGCTTAAGAGCAAGAGGCTACTTATTGTGCTTGATGATGTG  900
             ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  808   CATGAGAGATTTGAGCGCCGGCTTAAGAGCAAGAGGCTGCTTATTGTGCTTGATGATGTG  867

Query  901   AATGATGAAAAGCAAATCAGATATCTTATGGGGCATTGCAAATGGTATCAAGGAGGAAGT  960
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868   AATGATGAAAAGCAGATCAGATATCTTATGGGGCACTGCAAATGGTATCAAGGAGGAAGT  927

Query  961   AGAATTATCATTACTACTAGAGA-TAGTAAACTGATTGAGACGATCAAAGGCCGAAAATA  1019
             ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct  928   AGAATTATCATTACTACTAGAGACT-GTAAACTGATCGAGACAATCAAAGGCCGAAAATA  986

Query  1020  CGTGCTCCCGAAATTGAATGATAGAGAAGCCTTGAAGCTCTTTAGCTTGAATGCTTTTAG  1079
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| 
Sbjct  987   TGTGCTCCCGAAATTGAATGATAGAGAAGCCTTGAAGCTCTTTAGCTCGAATGCGTTTAA  1046

Query  1080  TAACTCTTTCCCTTTGAAAGAGTTCGAAGGTTTGACAAATATGGTTCTTGATTACGCTAA  1139
             | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1047  TGACTCTTGCCCTTCGAAAGAGTTCGAAGGTTTGACAAATATGGTTCTAGATTACGCTAA  1106

Query  1140  AGGCCACCCTTTGGCTCTTAAGGTGTTAGGATCTGATCTTTGTGAGAGGGATGATCTGTA  1199
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1107  AGGCCACCCTTTGGCTCTTAAGGTGTTAGGATCTGATCTTTGTGAGAGGGATAATCTGTA  1166

Query  1200  CTGGGAAGCTAAACTGGATAGACTGAAAAGTAGATCACATGGAGATATCTACGAAGTTCT  1259
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1167  CTGGGAAGCTAAACTGGATAGACTGAAAAGTAGATCACATGGAGATATCTACGAAGTTCT  1226

Query  1260  AGAAACAAGCTATGAGGAGCTTACCACTGAACAGAAGAATGTTTTTCTGGATATTGCATG  1319
              ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  1227  GGAAACAAGCTACGAGGAGCTTACCATTGAGCAGAAGAATGTTTTTCTCGATATTGCATG  1286

Query  1320  TTTCTTCAGATCAGAGAATGTGGATTACGTGACAAGCCTTCTCAACAGTCATGGTGTGGA  1379
             ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  1287  TTTTTTCAGATCAGAGAACGTGGATTACGTGACAAGCCTTCTTAACAGTCATGGTGTGGA  1346

Query  1380  CGTCTCTGGCGTGGTAAAGGATCTCGTTGACAAATGTCTGATCACTCTTTCTGATAATCG  1439
             ||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct  1347  CGTGTCTAGCGTGATAAAGGATCTTGTTGACAAATGTCTAATCACTGTTTCTGATAATCG  1406

Query  1440  CATCGAGATGCATGACATGTTGCAAACGATGGCCAAGGAGATTAGTTTAAAAGTAGAAAC  1499
             ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1407  CATTGAGATGCATGACATGTTGCAGACGATGGGCAAGGAGATTAGTTTAAAAGCAGAAAC  1466

Query  1500  AATAGGTATAAGAGACTGTAGGTGGCTATCACGACATGGTAACCAGTGCCAATGGCATAT  1559
             |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1467  AATAGGAATAAGAGACTTTACGTGGCTATCACGACATGGTAACCAGTGCCAATGGCATAT  1526

Query  1560  CAGATTATGGGACAGTGAAGATATTTGTGACCTGCTAACCGAAGGCCTGGGAACTGATAA  1619
             ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||| ||
Sbjct  1527  CAGATTATGGGACAGTGAAGATATTTGTGACATACTAACCAAAGGCCAGGGCACTGACAA  1586

Query  1620  GATAAGAGGCATTTTTCTCGACACATCAAAACTAAGAGCAATGCGTCTAAGTGCCAAAGC  1679
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1587  GATAAGAGGGATTTTTCTCGACACATCAAAACTAAGAGCAATGCGTCTAAGTGCCAAAGC  1646

Query  1680  CTTCCAAGGGATGTACAATCTCAAATACTTGAAAATTTATGATTCTCATTGTTCCCGTGG  1739
             |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1647  CTTAAAAGGGATGTACAATCTCAAATACTTGAAAATTTATGATTCTCATTGTTCCCGTGG  1706

Query  1740  ATGCGAAGCAGAGTTTAAACTACACTTGCGGA-GGGGACTTAGTTT-CCTTCCTAACGAG  1797
             ||| ||||| || |||||||| |||||||||| |||| ||| | || ||||||||| || 
Sbjct  1707  ATGTGAAGCGGAATTTAAACTGCACTTGCGGAAGGGG-CTT-GATTACCTTCCTAATGAA  1764

Query  1798  CTTACATATCTACACTGGCATGGTTATCCACTACAGAGTATCCCTCTAGACTTTGACCCT  1857
             |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| 
Sbjct  1765  CTTACATATCTACATTGGCATGGTTACCCACTACAGAGTATCCCTTTAGACTTTGACCCC  1824

Query  1858  AAGAATCTTGTAGACCTTAAATTGCCACATAGTCAATTAGAAGAAATTTGGGATGATGAA  1917
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  1825  AAGAATCTTGTAGACCTTAAATTGCCACATAGTCAATTAGCAGAAATTTGGGATGATGAA  1884

Query  1918  AAGGATGTTGGAATGCTCAAATGGGTCGACCTTAGTCATTC-TATAAATTTACGTCAGTG  1976
             ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| || | | ||||||| ||||||
Sbjct  1885  AAGGATGCTGGAATGCTCAAATGGGTTGATCTTAGTCACTCCT-TGAATTTACATCAGTG  1943

Query  1977  TTTGGGTTTGGCTAATGCTCATAATCTTGAGAGGTTGAATCTAGAAGGATGTACAAGTTT  2036
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1944  TTTGGGTTTGGCTAATGCTCATAATCTTGAGAGGTTGAATCTAGAAGGATGTACTAGTTT  2003

Query  2037  GAAAAAATTGCCGTCAACGATAAATTGTTTGGAGAAGCTTATATACCTCAATCTCAGGGA  2096
             ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct  2004  GAAAAAATTGCCGACAACGATAAATGGTTTGGAGAAGCTTGTTTACCTCAATCTCAGGGA  2063

Query  2097  TTGCACAAGCCTTAGGAGTCTTCCAAAAGGAATCAAAACTCAATCCTTGCAAACTCTTAT  2156
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2064  TTGCACAAGCCTTAGGAGTCTTCCAAAAGGACTCAAAACTCAATCCTTGCAAACTCTTAT  2123

Query  2157  TCTCAGTGGCTGCTCCAGCTTAAAGAAATTCCCACTGATCTCGGAAAATGTTGAAGTTCT  2216
             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct  2124  TCTCAGTGGCTGCTCCAGATTAAAGAAATTCCCACTGATCTCAGAAAATGTTGAAGTTTT  2183

Query  2217  ACTTTTAGATGGCACTGTTATAAAGAGCCTTCCCGAATCCATTCAAACCTTTAGAAGACT  2276
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct  2184  ACTTTTAGATGGCACTGCTATAAAGAGCCTTCCCGAATCCATTGAAACCTTGAGAAGACT  2243

Query  2277  TGCTTTGCTGAATCTGAAGAACTGCAAAAAGCTGA-AGCATCTTTCTTCTGATCTTTATA  2335
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct  2244  TGCTTTGCTGAATCTGAAGAATTGCAAAAAGCTGAGA-CATCTTTCTTCTGATCTTTATA  2302

Query  2336  AGCTGAAATGTCTTCAAGAGCTAATACTCTCAGGTTGCTCACAACTAGAGGTTTTTCCAG  2395
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct  2303  AGCTGAAATGTCTACAAGAGCTAATACTCTCAGGTTGCTCACGATTAGAGGTTTTTCCAG  2362

Query  2396  AAATTAAGGAAGACATGGAATCTTTGGAGATTTTACTTATGGATGATACATCCATCACAG  2455
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct  2363  AAATTAAGGAAGACATGGAATCTTTGGAGATTTTACTTATGGATGATACAGCCATCACTG  2422

Query  2456  AGATGCCAAAGATGATGCATTTGAGCAATATCAAGACATTTTCGTTATGTGGTACAAGCA  2515
             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  2423  AGATGCCAAAGATGATGCATTTGAGCAATATCCAGACATTTTCGTTATGTGGAACAAGCA  2482

Query  2516  GTCACGTTTCTGTTAGTATGTTCTTCATGCCACCTACATTGGGCTGCTCTCGGTTAACAG  2575
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  2483  GTCAAGTTTCTGTTAGTATGTTCTTCATGCCACCTACATTGGGCTGCTCTCAGTTAACAG  2542

Query  2576  ATCTTTACCTCTCAAGATGCAGTCTCTACAAACTCCCAGATAATATCGGTGGCCTATCCT  2635
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2543  ATCTTTACCTCTCAAGATGCAGTCTTTACAAACTCCCAGATAATATCGGTGGCCTATCCT  2602

Query  2636  CTTTGCAGTCTTTATGCTTAAGCGGAAACAACATCGAGAATCTTCCAGAAAGCTTCAACC  2695
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2603  CTTTGCAGTCTTTATGCTTAAGCGGAAACAACATCGAGAATCTTCCAGAAAGCTTCAACC  2662

Query  2696  AACTTAACAATCTGAAATGGTTTGATCTTAAGTTTTGCAAAATGCTCAAGTCTCTACCAG  2755
             | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2663  AGCTTCACAATCTGAAATGGTTTGATCTTAAGTTTTGCAAAATGCTCAAGTCTCTACCAG  2722

Query  2756  TCCTTCCACAAAACCTGCAGTATCTGGATGCACACGAATGCGAGTCACTTGAAACTTTGG  2815
             ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2723  TCCTTCCGCAAAACCTGCAGTATCTAGATGCACACGAATGCGAGTCACTTGAAACTTTGG  2782

Query  2816  CAAATCCATTGACGCCTTTGACAGTAGGAGAGAGAATCCATTCTATGTTCATCTTTAGCA  2875
             |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2783  CAAATCCATTGACGCCTTTGACGGTAGGAGAGAGGATCCATTCTATGTTCATCTTTAGCA  2842

Query  2876  ACTGTTACAAACTGAACCAAGACGCACAAGCGAGTCTCGTGGGTCATGCTCGAATCAAAA  2935
             |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2843  ACTGTTACAAACTGAACCAAGACGCACA-G--AGTCTCGTGGGTCATGCTCGAATCAAAA  2899

Query  2936  GTCAGTTAATGGCTAATGCTTCTGCAAAACGTTATTATCGGGGATTTGTTCC-GGAGCCT  2994
             ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||
Sbjct  2900  GTCAGTTGATGGCTAATGCTTCTGTAAAACGTTATTATCGGGG-TTTCATCCCGGAGCCT  2958

Query  2995  CTGGTTGGTATCTGTTACCCGGCCACTGAAATACCGAGTTGGTTCTGCCACCAAAGACTA  3054
             |||||||| ||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  2959  CTGGTTGGAATCTGTTATGCAGCGACTGAAATACCGAGCTGGTTCTGCCACCAAAGACTA  3018

Query  3055  GGACGTTCACTAGAAATCCCATTGCCTCCGCACTGGTGTGATATTAACTTTGTTGGACTT  3114
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||
Sbjct  3019  GGACGTTCACTAGAAATCCCATTGCCTCCGCACTGGAGTGACACTAACTTTGTTGGACTT  3078

Query  3115  GCGTTATCTGTAGTTGTCTCATTCAAGGACTATGAAGACAGTGCGAAACGTTTCTCGGTA  3174
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3079  GCGTTATCTGTAGTTGTCTCATTCATGGACTATGAAGACAGTGCGAAACGTTTCTCGGTA  3138

Query  3175  AAGTGTTGTGGCAACTTCGAGAACAAAGACAGTTCCTTCACGAGATTTGATTTCACTCTC  3234
             |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3139  AAGTGTTGTGGCAAATTCGAGAACCAAGACGGTTCCTTCACGAGATTTGATTTCACTCTC  3198

Query  3235  GCAGGCTGGAACGAACCATGTGGATCCCTTAGCCATGAATCAAGAAAGCTCACTTCTGAC  3294
             ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3199  GCAGGCTGGAACGAACCGTGTGGATCCCTTAGCCATGAACCAAGAAAGCTCACTTCTGAC  3258

Query  3295  CACGTTTTCATGGGATACAACAGTTGTTTTCTCGTCAAAAATGTCCATGGAGAGAGTAAC  3354
             |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||| |||||||||| | ||||
Sbjct  3259  CACGTTTTCATGGGATACAACAGTTGCTTCCACGTCAAGAATCTCCATGGAGAAAATAAC  3318

Query  3355  AGCTGTTGCTACACAAAGGCTTCGTTCGAATTCTATGTGACAGATGATGAAACAAGGAAG  3414
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3319  AACTGTTGCTACACAAAGGCTTCGTTCGAATTCTATGTGACAGATGATGAAACAAGGAAG  3378

Query  3415  AAGATAGAAACTTGTGAAGTGATAAAATGTGGGATGAGTTTAATGTATGTTCCTGAAGAT  3474
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct  3379  AAGATAGAAACTTGTGAAGTGATCAAATGTGGGATGAGTCTAGTGTATGTTCCTGAAGAT  3438

Query  3475  GATGATTGTATGTTGCTAAAGAAGACAAATATAGTTCAGCTGAGTTTGAAGAGCGGACCA  3534
             ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  3439  GATGATTGTATGTTGCTGAAGAAGACAAATCTAGTTCAGCTAAGTTTGAAGAGCGGACCA  3498

Query  3535  AG-T-T---G--------T-T-CCTACGATCTTGATGATGTTATGGATGACGTTAGACCC  3579
             || | |   |        | | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  3499  AGCTGTACCGAACCAACCTGTTCCTACGGTCTTGATGATGTTATGGATGATGTTAGACCC  3558

Query  3580  AAGAGAGGACTTTGCCAGTTTGTTGGTGGTGAAGAACCAGGTTGTAAGAGAAGGAAGGAG  3639
             |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||
Sbjct  3559  AAGAGAGGACTTTGCCAGTTTGGTGGTGGTGGAGAACTAGATTGTAAGAGAACGAAGGAG  3618

Query  3640  GAGAAGATCACAGTGAGATA  3659
             ||||||||||||||| ||||
Sbjct  3619  GAGAAGATCACAGTGCGATA  3638


 Score =  427 bits (231),  Expect = 3e-118
 Identities = 305/341 (89%), Gaps = 4/341 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1    ATGGAATCATCTTCTCCAT-CTTCAGCAGAGTTCGATGTGTTTCTCAGTTTCAGAGGCTT  59
            |||||||||||| |||| | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1    ATGGAATCATCTACTCC-TCCCTCTGCAGAATTCGATGTGTTTCTCAGTTTCAGAGGCTT  59

Query  60   TGACACACGCAACAACTTCACCGGTCATCTCCAAAAAGCACTTCGTCTAAGAGGAATCGA  119
            |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  60   TGACACACGCAACAACTTCACCGGTCATCTTCAAAAAGCACTTCGTCTGAGAGGAATCGA  119

Query  120  CTCATTCATCGACGACAGACTCCGTCGAGGAGACAATCTCACTGCGCTTTTCGATAGAAT  179
            |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct  120  CTCATTCATCGACGACAGGCTCCATCGAGGTGACAATCTCACCGCGCTTTTCGATCGAAT  179

Query  180  CGAGAAATCCAAGATTGCAATCATCGTCTTCTCCACGAACTATGCAAATTCTGCGTGGTG  239
             |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || || || ||||||||||| |||||
Sbjct  180  AGAGAAATCCAAGATCGCAATCATCATCTTCTCGACAAATTACGCAAATTCTGCTTGGTG  239

Query  240  TCTTCGAGAG-TTAGTGAAGATCCTCGAATGTAGGAACAGCAACCAACAGCTAGTGGTAC  298
             || || ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||
Sbjct  240  CCTCCGTGAGCTT-GTGAAGATCCTCGAATGTAGAAACAGAAACCAGCAGCTGGTTGTAC  298

Query  299  CAATCTTCTACAAAGTTGACAAATCGGACGTCGAGAAACAG  339
            | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||
Sbjct  299  CGATCTTCTACAAAGTTGAAAAATCGGATGTCAAGATACAG  339



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 142601726031


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5