BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G20850.1
Length=4357
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg492801 jgi|Araly1|492801|fgenesh2_kg.7__2234__AT4G20850.1 7005 0.0
> Ahg492801 jgi|Araly1|492801|fgenesh2_kg.7__2234__AT4G20850.1
Length=4326
Score = 7005 bits (3793), Expect = 0.0
Identities = 4143/4311 (96%), Gaps = 28/4311 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGATCTGAGTCTGCAGCTGCAGATTCACGGCGCGTTAATCAACAAAGGCCCGTCGTGT 60
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATCTGAGTCTGCAGCTGCAGGTCCACGGCGCGTTAAT---CAAAGGCCCGTCGTGT 57
Query 61 Acttcttattgggc-t--tcttcttcttcact-t-tc-tcttcctcgcgatttcatttct 114
||||||||||||| | |||||||||||||| | || ||||||||| | ||||||||||
Sbjct 58 CCTTCTTATTGGGCTTCCTCTTCTTCTTCACTCTCTCTTCTTCCTCGTGGTTTCATTTCT 117
Query 115 tcttctacgtttcttcttcATCGAAGACTCAGAAGAAGAAGCTGCTCTCGTTCTCGTGGA 174
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 TCTTCTCCGTTTCTTCTTCATCGAAGACTC---AGAAGAAGCTGCTCTCGTTCTCGTGGA 174
Query 175 ATCCGATTAAGACGGAGTGGTTTCTCGGCGATGCCTTGTTCTTCTTCTGATACTCTTACG 234
|| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 175 ATTCGATTAAGGCGGAGTCGTTTCTCGGCGATGCCTTGTTCTTCTTCTGATACTCTTACG 234
Query 235 GCTTCTCGCGTCGGTTGTGGCGGAGGAGGTGGTGGTGGAGCCGTTGGCGGTGGAGCTGAG 294
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||
Sbjct 235 GCTTCTCGCGTCGGTTGTGGCGGAGGAGGTGGTGGTGGTG--G-TGGCGGTGGAGCTGAT 291
Query 295 AATGCTTCTGTCGCTAATTTCAAGCTGAACGAATCTACCTTT-ATTGCTTCTCTCATGCC 353
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||
Sbjct 292 AATGCTTCTGTCGCTAATTTCAAGCTCAACGAATCTA-CTTTCCTTGCTTCTCTCATGCC 350
Query 354 TAAGAAAGAAATCCGTGCGGATTGCTTCATCGAAGCTCATCCTGAGTACGACGGTCGTGG 413
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 TAAGAAAGAAATCCGTGCGGATCGCTTCATCGAAGCTCATCCTGAGTACGACGGTCGTGG 410
Query 414 CGTTGTTATAGCTATCTTTGATTCTGGTTTTGATCCTTCTGCTGCTGGCTTGCATGTAAC 473
||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 CGTCGTCATCGCTATCTTTGATTCTGGTTTTGATCCTTCTGCTGCTGGCTTGCATGTAAC 470
Query 474 TTCTGATGGAAAACCCAAGGTTTTGGACGTCATTGACTGCACTGGAAGTGGAGATATAGA 533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 471 TTCTGATGGAAAACCCAAGGTTTTGGACGTCATTGACTGCACTGGAAGTGGGGATATAGA 530
Query 534 TACATCCACAGTGGTGAAAGCCAATGAAGATGGTCATATTCGTGGAGCATCAGGGGCAAC 593
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 531 TACATCCACAGTGGTGAAAGCCAATGAAGATGGTCAAATTCGTGGAGCATCAGGAGCACC 590
Query 594 TTTGGTTGTCAATTCTTCATGGAAAAATCCCACTGGAGAGTGGCGTGTAGGTTCCAAGTT 653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 TTTGGTTGTCAATTCTTCATGGAAAAATCCCACTGGAGAGTGGCGTGTAGGTTCCAAGTT 650
Query 654 GGTTTATCAGTTATTTACAGATGACTTGACTTCTCGTGTGAAGAAAGAGAGAAGGAAATC 713
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 GGTTTATCAGTTATTTACAGATGACTTAACTTCTCGTGTGAAGAAAGAGAGAAGGAAATC 710
Query 714 CTGGGATGAAAAGAATCAGGAGGAAATTGCCAAGGCTGTAAATAATCTGTATGATTTCGA 773
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 711 TTGGGATGAAAAGAATCAGGAAGAAATTGCAAAGGCTGTAAACAATCTATATGATTTCGA 770
Query 774 TCAGAAGCACAGCAAGGTGGAAGATGCGAAATTGAAGAAAACTCGTGAAGACCTCCAAAG 833
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 771 TCAGAAGCACAGCAAGGTGGAAGATGCGAAATTGAAGAAAACCCGTGAAGACCTCCAAAG 830
Query 834 CAAAGTTGATTTTCTGAAAAAACAAGCTGATAAATATGAAGACAAAGGGCCTGTTATTGA 893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 831 CAAAGTTGATTTTCTGAAAAAACAAGCTGATAAATATGAAGACAAAGGGCCTGTTATTGA 890
Query 894 TGCTGTTGTGTGGCATGATGGAGAAGTATGGAGGGTTGCACTTGATACACAGAGTCTGGA 953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 TGCTGTTGTGTGGCATGATGGAGAAGTATGGAGGGTTGCACTTGATACACAGAGTCTGGA 950
Query 954 AGAGGATCCAGATAGCGGGAAACTAGCAGACTTCTCCCCACTGACTAACTACCGAATTGA 1013
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 951 AGAGGATCCAGATAGCGGGAAACTAGCAGACTTCTCCCCCCTGACTAACTACCGAATTGA 1010
Query 1014 ACGGAAGTATGGCGTGTTTAGCCGACTAGATGCATGCTCCTTTGTTGCTAACGTGTATGA 1073
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 GCGGAAGTATGGCGTGTTTAGCCGACTAGATGCATGCTCCTTTGTTGCTAACGTGTATGA 1070
Query 1074 TGAGGGAAAGGTTCTAAGCATTGTAACTGATAGTTCTCCTCACGGCACTCATGTTGCTGG 1133
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1071 TGAGGGGAAGGTTCTAAGCATTGTAACTGATAGTTCTCCTCATGGCACTCATGTTGCTGG 1130
Query 1134 AATAGCTACTGCACACCACCCTGAGGAGCATTTGTTAAATGGTGTGGCACCTGGTGCACA 1193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1131 AATAGCTACTGCACACCACCCTGAGGAGCATTTGTTAAATGGTGTGGCACCTGGTGCACA 1190
Query 1194 AATAATATCTTGCAAAATTGGAGACTCGCGATTAGGTTCAATGGAGACCGGAACTGGATT 1253
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191 GATAATATCTTGCAAAATTGGAGACTCGCGATTAGGTTCAATGGAGACCGGAACTGGATT 1250
Query 1254 GACTCGGGCATTGATAGCTGCCCTAGAGCATAACTGTGATCTTGTCAACATGAGCTATGG 1313
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251 GAGTCGGGCATTGATAGCTGCCCTGGAGCATAACTGTGATCTTGTCAACATGAGCTATGG 1310
Query 1314 AGAGCCAGCATTACTTCCAGACTATGGGCGCTTTGTTGATCTTGTTACTGAAGCTGTGAA 1373
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 AGAGCCAGCATTACTTCCAGACTATGGGCGCTTTGTTGATCTTGTTACTGAAGCTGTGAA 1370
Query 1374 CAAGAGACGTCTAATTTTTGTAAGTAGTGCTGGCAACAGTGGTCCAGCTTTGACAACAGT 1433
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1371 CAAGAGACGCCTAATATTTGTAAGTAGTGCTGGCAACAGTGGTCCAGCTTTGACAACGGT 1430
Query 1434 CGGAGCACCGGGTGGAACAACGTCCAGTATCATTGGGGTTGGTGCGTATGTTTCTCCTGC 1493
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1431 AGGAGCACCGGGTGGAACGACGTCCAGTATCATCGGGGTTGGTGCATATGTTTCTCCTGC 1490
Query 1494 AATGGCAGCAGGTGCCCATTCAGTGGTGGAACCTCCCAGTGAGGGGCTTGAATACACTTG 1553
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1491 AATGGCAGCCGGTGCCCATTCAGTGGTGGAACCTCCCAGTGAGGGGCTTGAATACACTTG 1550
Query 1554 GTCAAGCCGGGGGCCAACATCTGATGGAGATCTTGGTGTCTGCATAAGTGCACCTGGTGG 1613
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 GTCAAGCCGGGGGCCAACATCTGATGGGGATCTTGGTGTCTGCATAAGTGCACCTGGTGG 1610
Query 1614 GGCTGTTGCTCCTGTTCCTACATGGACGCTTCAAAGACGCATGCTCATGAATGGAACATC 1673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1611 GGCTGTTGCTCCTGTTCCTACATGGACGCTTCAAAGACGCATGCTCATGAATGGAACATC 1670
Query 1674 AATGGCATCTCCTTCTGCCTGTGGGGCAATTGCGTTACTTCTAAGTGCTATGAAGGCTGA 1733
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671 AATGGCATCTCCTTCTGCCTGTGGAGCAATTGCGTTACTTCTAAGTGCTATGAAGGCTGA 1730
Query 1734 GGGCATCCCAGTTAGCCCGTACAGTGTGAGAAGGGCCCTTGAAAATACATCTACACCAGT 1793
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1731 GGGCATCCCAGTTAGCCCGTACAGTGTGAGAAGGGCCCTTGAGAATACATCTACACCTGT 1790
Query 1794 AGGTGATCTACCTGAAGATAAACTAACTACTGGACAAGGGCTTATGCAAGTTGATAAGGC 1853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1791 AGGTGATCTACCTGAAGATAAACTAACTACTGGACAAGGGCTTATGCAAGTTGATAAGGC 1850
Query 1854 ATATGAATACTTAAAACAGTTTCAGGACTATCCATGCGTATTTTATCAGATAAAGGTCAA 1913
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ATATGAATACTTAAAAAAGTTTCAGGACTATCCATGCGTATTTTATCAGATAAAGGTCAA 1910
Query 1914 TCTCTCCGGTAAAACAATTCCAACATCACGAGGCATCTACCTGCGGGAGGGTACTGCTTG 1973
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1911 TCTCTCCGGGAAAACAATTCCAACATCACGGGGCATCTACCTGCGGGAGGGTACTTCTTG 1970
Query 1974 CAGACAGTCTACTGAGTGGACAATACAAGTTGATCCGAAA-TTCCATGAAGGTGCAAGTA 2032
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1971 CAGACAGTCTACTGAGTGGACGGTACAAGTTGATCC-AAAGTTCCATGAAGGTGCAAGTA 2029
Query 2033 ATTTAAAGGAACTTGTCCCTTTCGAGGAATGTCTTGAGTTGCACTCCACAGATGAAGGAG 2092
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2030 ATTTAAAGGAACTTGTCCCTTTTGAGGAATGTCTTGAGTTGCACTCCACAGATGAAGGAG 2089
Query 2093 TTGTACGGGTTCCTGACTATCTCCTTCTCACTAATAATGGACGTGGCTTCAACGTTGTTG 2152
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct 2090 TTGTACGGGCTCCTGACTATCTCCTTCTCACTCATAACGGACGTAGCTTCAACGTTGTTG 2149
Query 2153 TGGATCCCACAAATCTTGGGGATGGTGTGCATTACTTTGAAGTTTATGGGATTGATTGCA 2212
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2150 TGGATCCCACAAATCTTGGTGATGGTGTGCATTACTTTGAAGTTTATGGGATTGATTGCA 2209
Query 2213 AAGCACCAGAGCGTGGTCCCCTTTTCAGAATCCCAGTAACAATAATAATTCCCAAGACTG 2272
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2210 AAGCACCAGAGCGTGGTCCTCTTTTCAGAATCCCAGTAACAATAATAATTCCCAAGACTG 2269
Query 2273 TGGCAAATCAACCTCCAGTTATTTCATTTCAGCAAATGTCTTTCATCTCAGGCCACATTG 2332
||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2270 TGGCAAATCGACCTCCTGTTATCTCATTTCAGCAAATGTCTTTCATCTCAGGCCACATTG 2329
Query 2333 AACGAAGATATATCGAGGTACCACATGGAGCAACATGGGCTGAGGCTACAATGCGAACTT 2392
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2330 AACGAAGATATATTGAGGTACCACAAGGAGCAACATGGGCTGAGGCTACAATGCGAACTT 2389
Query 2393 CGGGGTTTGATACTACACGACGATTTTACATTGATACACTTCAGGTTTGCCCATTGCGAA 2452
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2390 CAGGGTTTGATACTACACGACGATTTTATATTGATACACTTCAGCTTTGCCCATTGCGAA 2449
Query 2453 GGCCTATCAAGTGGGAGAGCGCACCAACTTTCGCATCTCCGTCTGCTAAAAGCTTTGTGT 2512
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 2450 GGCCTATCAAGTGGGAGAGCGCATCAACTTTCGCATCTCCGTCTGCGAAAAGCTTTGCGT 2509
Query 2513 TCCCTGTGGTTAGTGGTCAAACGATGGAACTAGCTATAGCTCAATTTTGGTCAAGTGGCC 2572
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2510 TTCCTGTGGTTAGTGGTCAAACGATGGAACTAGCTATAGCTCAATTCTGGTCAAGTGGCC 2569
Query 2573 TCGGAAGTCGTGAACCAACTATCGTTGACTTTGAGATTGAATTCCATGGAGTTGGTGTCG 2632
| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2570 TTGGAAGTCGTGAACCAACTATCGTTGATTTTGAGATTGAATTCCATGGAGTTGGTGTCG 2629
Query 2633 ATAAAGAAGAATTGTTACTTGATGGAAGTGAAGCACCAATAAAAGTTGAAGCTGAAGCAC 2692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2630 ATAAAGAAGAATTGTTACTTGATGGAAGTGAAGCACCAATAAAAGTTGAAGCTGAAGCAC 2689
Query 2693 TATTGGCATCTGAAAAACTTGTTCCCATAGCTGTCCTGAACAAGATACGAGTTCCATATC 2752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||
Sbjct 2690 TATTGGCATCTGAAAAACTTGTTCCCATAGCTGTCCTGAACAAGATAAGAGTCCCGTATC 2749
Query 2753 AGCCTATTGATGCACAACTGAAGACTCTATCAACTGGCCGTGATAGACTACTGTCGGGCA 2812
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2750 AACCTATTGATGCACAACTGAAGACTCTATCAACTGGCCGTGATAGACTACTGTCGGGCA 2809
Query 2813 AACAGATACTAGCATTGACCTTAACCTACAAGTTCAAATTAGAAGATTCAGCTGAAGTGA 2872
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2810 AACAGATACTAGCATTGACCTTAACCTACAAGTTCAAATTAGAAGATTCAGCTGAAGTAA 2869
Query 2873 AACCGTATATACCATTATTGAACAATCGCATATATGACACAAAATTTGAGTCCCAGTTTT 2932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2870 AACCGTATATACCATTATTGAACAATCGCATATATGACACAAAATTTGAGTCCCAGTTTT 2929
Query 2933 TTATGATCTCTGATACTAACAAGCGTGTATATGCAATGGGTGACGTTTATCCTGAGTCTT 2992
||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2930 ATATGATCTCTGATGCCAACAAGCGTGTATATGCCATGGGTGATGTTTATCCTGAGTCTT 2989
Query 2993 CAAAACTTCCCAAGGGAGAGTATAAACTTCAGCTGTATCTGAGGCATGAAAATGTGGAGC 3052
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2990 CTAAACTTCCCAAGGGAGAATATAAACTTCAGCTGTATCTGAGGCATGAAAATGTGCAGC 3049
Query 3053 TGCTGGAAAAGTTGAAGCAGCTCACTGTGTTTATTGAAAGAAATATGGGGGAGATTCGGC 3112
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3050 TGCTGGAAAAGTTGAAGCAGCTCATTTTGTTTATTGAAAGAAATATGGGGGAGATTCGGC 3109
Query 3113 TGAATTTACATTCTGAACCAGATGGTCCGTTCACTGGAAATGGTGCCTTTAAGTCCTCTG 3172
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3110 TGAATTTACATTCTGAACCAGATGGTCCGTTCACAGGAAATGGTGCCTTTAAGTCCTCTA 3169
Query 3173 TTCTAATGCCAGGGGTGAAGGAAGCATTTTATCTGGGCCCACCAACAAAGGACAAGCTAC 3232
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 3170 TTCTAATGCCAGGGGTGAAGGAAGCGTTTTATCTGGGCCCACCAACAAAAGACAAGTTAC 3229
Query 3233 CCAAGAATACCCCCCAAGGATCTATGTTGGTGGGAGAAATCTCATATGGGAAATTGTCAT 3292
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3230 CCAAGAATACTCCCCAAGGATCTGTGTTGGTGGGAGAAATCTCATATGGCAAATTGTCAT 3289
Query 3293 TTGATGAAAAAGAAGGGAAGAATCCAAAGGATAATCCGGTATCTTATCCGATATCATATG 3352
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3290 TTGATGATAAAGAAGGGAAGAATCCAAAGGATAATCCTGTATCTTATCCGATATCATATG 3349
Query 3353 TGGTTCCACCAAATAAGCCTGAGGAAGATAAGAAGGCAGCTTCTGCCCCT-ACTTGCTCT 3411
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||
Sbjct 3350 TGGTTCCACCAAATAAGCCTGAGGAAGATAAAAAGGCAGCTTCTGCTCCAGA-TTGCTCT 3408
Query 3412 AAATCAGTATCAGAACGCTTGGAACAAGAGGTTCGCGACACAAAGATCAAATTTCTTGGG 3471
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||
Sbjct 3409 AAATCAGTATCAGAACGCTTGGAACAAGAGGTTCGTGATACAAAAATCAAATTTCTTGGG 3468
Query 3472 AATCTAAAACAAGAAACTGAGGAAGAGCGTTCAGAGTGGAGAAAGTTGTGTACCTGTCTC 3531
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct 3469 AACCTAAAACAAGAAACTGAGGAAGAGCGTTCAGAGTGGAAAAAGTTGTGTGCCTGTCTC 3528
Query 3532 AAGTCTGAATACCCAGACTATACTCCATTACTAGCTAAGATCCTGGAAGGTTTACTGTCT 3591
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3529 AAGTCTGAATACCCAAACTACACTCCATTACTAGCTAAGATCCTGGAAGGTTTACTGTCT 3588
Query 3592 CGGTCTGATGCTGGGGACAAAATCAGCCATCACGAAGAGATTATAGAAGCTGCAAACGAA 3651
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3589 CGATCTGATGCTGGGGACAAAATCAGCCATCACGAAGAGATTATAGAAGCTGCAAACGAA 3648
Query 3652 GTAGTACGCAGTGTTGACGTAGATGAGCTAGCAAGATTCTTGCTAGACAAAACTGAACCA 3711
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3649 GTAGTACGCAGTGTTGACGTAGATGAGTTAGCAAGATTCTTGCTAGACAAAACTGAACCA 3708
Query 3712 GAAGATGATGAAGCAGAGAAATTGAAGaaaaaaaTGGAGGTGACACGTGATCAACTGGCG 3771
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3709 GAAGATGCTGAAGCAGAGAAATTGAAGAAAAAAATGGAGATGACACGTGATCAACTGGCA 3768
Query 3772 GATGCACTATACCAGAAAGGGTTAGCCATGGCGAGAATCGAGAATCTgaagggtgagaag 3831
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3769 GATGCACTATACCAGAAAGGATTAGCCATGGCGAGAATCGAGAATCTGAAAGGTGAGAAG 3828
Query 3832 gaaggtgaaggagaagaagaaagtagccagaaggataaattcgaagagaaTTTCAAAGAA 3891
| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3829 GGAGATGAAGGAGAAGAAGAAAGTAGTCAGAGGGATAAATTCGAAGAGAACTTCAAAGAA 3888
Query 3892 CTGACAAAATGGGTAGACGTGAAATCATCTAAATACGGTACTCTCACTGTTCTAAGAGAG 3951
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3889 CTGACAAAATGGGTAGACGTGAAATCATCTAAATATGGTACTCTCACTGTTCTAAGAGAG 3948
Query 3952 AAACGGCTATCACGACTCGGGACCGCATTGAAGGTACTTGATGACTTGATCCAAAACGAG 4011
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3949 AAACGGCTCTCACGACTCGGGACCGCATTGAAGGTACTTGATGACTTGATCCAAAACGAG 4008
Query 4012 AACGAGACTGCGAATAAGAAACTCTACGAACTTAAACTGGATTTGCTGGAGGAAATAGGT 4071
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 4009 AACGAGACTGCGAATAAGAAACTCTACGAACTGAAACTGGGTTTGCTGGAGGAACTAGGT 4068
Query 4072 TGGAGCCATTTGGTTACGTATGAGAAGCAATGGATGCAGGTTCGTTTCCCTAAAAGCCTA 4131
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||
Sbjct 4069 TGGAGCCATTTGGTTACGTATGAGAAGCAATGGATGCAGGTTAGTTTCCCTACAAGCTTA 4128
Query 4132 CCCCTCTTTTAGTAGTTGTTGCTACCTTCTTGTTCAATAAAAGCTTATCCAGAACATATA 4191
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4129 CCCCTCTTTTAGTAGTTGTTTCTACCTTCTTGTCCAATAAAAGCTTGTCCAGAACATATA 4188
Query 4192 GTTGC-AAGTTCTTGTTCAATAAAAGCTTGTCCAGAACAAATAGTTCGTTGTTTTTCGAA 4250
|| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 4189 GT-GCTAAGTTCTTGTTCAATAAAAGCTTGTCCAGAACATTTAGTTCGTTGTTTTTCTAA 4247
Query 4251 A-CCCAAACTACTGTCTT-ATTTTCT--GTCCGTATAAACTGTATGTTCTT 4297
| ||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||||
Sbjct 4248 AACCCAAACTACTGT-TTGATTTTCTCTGTCTTTAGAAACTGTATGTTCTT 4297
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 164789291090
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5