BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G24280.1 Length=2456 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg492423 jgi|Araly1|492423|fgenesh2_kg.7__1856__AT4G24280.1 3742 0.0 Ahg495046 jgi|Araly1|495046|fgenesh2_kg.8__862__AT5G49910.1 2218 0.0 > Ahg492423 jgi|Araly1|492423|fgenesh2_kg.7__1856__AT4G24280.1 Length=2340 Score = 3742 bits (2026), Expect = 0.0 Identities = 2251/2358 (95%), Gaps = 21/2358 (1%) Strand=Plus/Plus Query 102 GAAAAATGGCATCTTCAGCCGCCCAAATCCACGTTCTCGGCGGAATTGGATTCGCTTCTT 161 |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 1 GAAAAATGGCATCTTCCGCCGCCCAAATTCACGTCCTTGGCGGAATTGGATTCGCTTCTT 60 Query 162 CTTCTTCTTCCAAGAGAAATCTCAATGGTAAAGGCGGTACCTTTATGCCGAGAAGTGCCT 221 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CTTCTTCTTCCAAGAGAAATCTTAATGGTAAAGGCGGTACCTTTATGCCGAGAAGTGCCT 120 Query 222 TCTTCGGTACAAGAACCGGTCCTTTCTCCACACCCACTTCTGCTTTTCTCAGAATGGGCA 281 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TCTTCGGTACAAGAACCGGTCCTTTCTCAACACCCACTTCTGCTTTTCTCAGAATGGGCA 180 Query 282 CCAGAAATGGCGGCGGCGCTTCTAGATACGCGGTTGGTCCGGTTCGTGTGGTTAACGAGA 341 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 181 CCAGAAATGGCGGCGGCGCTTCTAGATACGCGGTTGGTCCGGTTCGTGTGGTTAACGAGA 240 Query 342 AGGTTGTTGGAATTGATTTGGGTACGACTAACTCTGCAGTAGCTGCTATGGAAGGAGGTA 401 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| Sbjct 241 AGGTTGTTGGAATTGATTTGGGTACGACTAACTCCGCCGTTGCTGCTATGGAAGGAGGTA 300 Query 402 AGCCTACGATTGTGACTAACGCTGAAGGTCAGAGGACAACGCCTTCTGTTGTGGCTTACA 461 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| Sbjct 301 AGCCTACGATTGTTACTAACGCTGAAGGTCAGAGGACGACGCCGTCTGTGGTGGCTTACA 360 Query 462 CGAAGAGTGGTGATAGGCTTGTTGGGCAGATTGCGAAGAGGCAAGCTGTTGTTAATCCCG 521 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CGAAGAGTGGTGATAGGCTTGTTGGGCAGATTGCGAAGAGGCAAGCTGTTGTTAATCCCG 420 Query 522 AGAATACTTTCTTCTCAGTGAAGAGGTTTATTGGTAGGAAGATGAACGAGGTTGATGAAG 581 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | Sbjct 421 AGAATACTTTCTTCTCCGTGAAGAGGTTTATTGGTAGGAAGATGAATGAGGTTGCTGAGG 480 Query 582 AGTCTAAGCAGGTTTCTTACAGAGTTGTTAGAGATGAGAACAATAATGTTAAGCTTGAGT 641 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct 481 AGTCTAAGCAGGTTTCTTATAGAGTTGTTAGAGATGAGAACGGGAATGTTAAGTTTGAGT 540 Query 642 GTCCTGCCATTAACAAACAATTTGCTGCTGAGGAGATTTCAGCTCAGGTTCTAAGGAAAC 701 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| Sbjct 541 GTCCTGCCATTAACAAACAATTTGCTGCTGAGGAGATTTCAGCTCAGGTTTTGAGGAAAC 600 Query 702 TTGTGGATGATGCATCAAGATTCTTGAACGACAAAGTAACCAAGGCTGTCATCACTGTGC 761 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 601 TTGTGGATGATGCCTCAAGATTCTTGAACGACAAAGTAACCAAGGCTGTCATTACTGTGC 660 Query 762 CTGCTTACTTCAACGATTCACAGAGGACAGCTACAAAAGATGCTGGTCGAATTGCTGGGT 821 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 CTGCTTACTTCAACGACTCACAGAGGACAGCTACAAAAGATGCTGGTCGAATTGCTGGGT 720 Query 822 TGGAAGTTCTTCGTATTATCAATGAGCCCACAGCTGCTTCATTGGCTTATGGGTTTGACA 881 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 721 TGGAAGTTCTTCGTATTATTAATGAGCCCACAGCTGCTTCGTTGGCTTATGGGTTTGACA 780 Query 882 G-AAAAGCCAATGAAACAATCCTAGTCTTCGATCTTGGTGGTGGTACCTTTGATGTCTCA 940 | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 781 GAAAAAG-CAATGAAACAATCCTAGTCTTTGATCTTGGTGGCGGTACCTTTGATGTCTCA 839 Query 941 GTGCTTGAGGTTGGTGATGGTGTGTTTGAAGTGCTTTCCACTTCTGGCGACACACACTTG 1000 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 840 GTGCTTGAGGTTGGTGATGGTGTGTTTGAAGTGCTTTCCACTTCTGGGGACACACATTTG 899 Query 1001 GGTGGTGATGACTTTGACAAGAGAGTTGTTGATTGGCTTGCTGCAGAATTCAAGAAAGAC 1060 |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 GGTGGTGATGACTTCGACAAGAGAGTGGTTGATTGGCTTGCTGCAGAATTCAAGAAAGAT 959 Query 1061 GAAGGGATAGATCTTCTGAAAGACAAGCAAGCTCTTCAGAGGTTAACAGAGGCAGCAGAA 1120 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 960 GAAGGGATAGATCTTCTGAAAGACAAGCAAGCACTTCAGAGGTTAACAGAGGCAGCAGAA 1019 Query 1121 AAAGCTAAAATTGAGCTTTCTTCACTGACTCAGACAAATATGAGCTTACCTTTTATCACG 1180 |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct 1020 AAAGCTAAAATTGAGCTTTCCTCGCTGACTCAGACAAATATGAGCTTGCCATTTATCACC 1079 Query 1181 GCCACAGCTGATGGACCTAAACACATAGAAACCACCCTCACACGTGCCAAGTTCGAAGAA 1240 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1080 GCCACAGCCGATGGACCTAAACACATAGAAACCACCCTCACACGTGCCAAGTTCGAAGAA 1139 Query 1241 TTGTGTTCAGATTTACTTGACAGGGTCAGGACTCCTGTCGAGAATTCCCTGCGGGATGCA 1300 |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||| Sbjct 1140 TTGTGTTCAGATTTACTTGACAGGGTCAAGACTCCCGTCGAAAATTCCCTGAGGGATGCA 1199 Query 1301 AAGCTCAGCTTCAAAGATATTGATGAAGTCATCCTTGTCGGTGGATCCACACGTATTCCT 1360 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1200 AAGCTCAGCTTCAAAGATATTGATGAAGTTATCCTTGTTGGTGGATCCACACGTATTCCT 1259 Query 1361 GCTGTTCAGGAACTCGTGAGGAAGGTGACTGGGAAAGAACCTAATGTTACAGTAAATCCT 1420 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 1260 GCTGTTCAAGAACTCGTGAGGAAGGTGACTGGGAAAGAACCGAATGTCACAGTAAATCCT 1319 Query 1421 GACGAGGTTGTAGCGTTAGGTGCTGCAGTCCAGGCTGGTGTTCTTGCTGGAGATGTGAGT 1480 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 1320 GATGAGGTTGTAGCTTTAGGTGCTGCAGTCCAGGCTGGTGTGCTTGCCGGAGATGTGAGT 1379 Query 1481 GACATTGTGCTTCTTGATGTGACACCGCTTTCGATTGGTTTGGAGACCCTAGGTGGTGTT 1540 |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1380 GACATTGTGCTTCTCGATGTGACACCGCTTTCCATTGGTTTGGAGACCCTTGGTGGTGTT 1439 Query 1541 ATGACTAAGATTATTCCAAGGAACACCACACTGCCTACTTCTAAATCAGAAGTCTTTTCA 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1440 ATGACTAAGATTATTCCAAGGAACACCACACTGCCTACTTCTAAATCAGAAGTCTTTTCA 1499 Query 1601 ACTGCTGCTGATGGACAGACAAGTGTTGAGATTAATGTGTTGCAGGGTGAGAGGGAGTTT 1660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1500 ACTGCTGCTGATGGACAGACAAGTGTTGAGATTAATGTGTTGCAGGGTGAGAGGGAGTTT 1559 Query 1661 GTTAGGGATAACAAGTCTCTTGGTAGCTTCCGTCTAGATGGTATCCCCCCTGCACCACGT 1720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| Sbjct 1560 GTTAGGGATAACAAGTCTCTTGGTAGCTTCCGTCTAGATGGTATTCCACCGGCACCACGT 1619 Query 1721 GGAGTTCCACAAATCGAAGTCAAATTTGACATTGATGCCAATGGAATTCTATCTGTCAGT 1780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1620 GGAGTTCCACAAATCGAAGTCAAATTTGACATTGATGCCAATGGAATTTTATCTGTCAGT 1679 Query 1781 GCTGTTGACAAGGGCACAGGAAAGAAGCAAGACATCACCATTACTGGCGCAAGTACATTG 1840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1680 GCTGTTGACAAGGGCACAGGAAAGAAGCAAGACATCACCATTACTGGCGCGAGTACATTG 1739 Query 1841 CCCAAGGATGAGGTAGACCAAATGGTCCAGGAGGCAGAAAGATTTGCAAAAGATGACAAA 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1740 CCCAAGGATGAGGTAGACCAAATGGTCCAGGAAGCAGAAAGATTTGCAAAGGATGACAAG 1799 Query 1901 GAGAAGAGAGACGCAATCGACACGAAA-AACCAAGCAGATTCAGTGGTGTACCAGACAGA 1959 ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| Sbjct 1800 GAGAAGAGAGATGCAATCGACAC-AAAGAACCAGGCAGACTCAGTGGTGTATCAGACAGA 1858 Query 1960 GAAGCAACTGAAAGAACTAGGAGAGAAAATTCCAGGTGAAGTGAAAGAGAAGGTGGAGGC 2019 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1859 GAAGCAACTGAAAGAACTTGGAGAGAAAATTCCAGGTGAAGTGAAAGAGAAGGTGGAGGC 1918 Query 2020 TAAGCTACAAGAGCTGAAAGACAAGATAGGAAGTGGATCAACCCAAGAAATCAAAGACGC 2079 ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| Sbjct 1919 TAAGCTACAAGAGCTGAAAGACAAGATAGGAAGCGAATCAACTCAGGAAATCAAAGACGC 1978 Query 2080 CATGGCTGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTCAGTCTCTATACAACCAGCCTGG 2139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1979 CATGGCTGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTCAGTCTCTATACAACCAGCCTGG 2038 Query 2140 AGCTGGAGGTCCAGGTGCAGGTCCTTCCCCGGGAGGCGAAGGTGCTTCATCAGGAGATTC 2199 |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| Sbjct 2039 AGCTGGAGCACCAGGTGCAGGTCCTTCCCCGGGAGGTGAAGGTGCTTCTTCAGCAGATTC 2098 Query 2200 ATCTTCAAGTAAAGGAGGAGATGGTGATGATGTGATCGATGCTGACTTCACAGACAGCCA 2259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2099 ATCTTCAAGTAAAGGAGGAGATGGTGATGATGTGATCGATGCTGACTTCACAGACAGCAA 2158 Query 2260 ATGAGAAAACAAACTAGGAAGGCTTTGGAATTCATACATGGGATGCGATGGGAGAGACAA 2319 |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || | Sbjct 2159 ATGAGAAAGCAAACTAGGACGGCTTTGAAATTTATACATGGGATG---TG--A------- 2206 Query 2320 ATGATTTTGTAGGTTGGATTTGAGAACACAAATGAATTTAAGCAATGCTTGTGGACAACA 2379 | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2207 -T--TTT-GTAGGTTGGATTTGAGAACACAAATGAATTTAAGCAATGCTTGTGGACAACA 2262 Query 2380 TTTATTTGTCGTTAGAAGGAAGCAGTGTGGTTACA-GAGGATGATGTTTAATACATAATA 2438 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2263 TTTATTTGTCGTTAGAAGGAAGCAGTGTGGTTACAAGAGGATGATGTTTAATACATAATA 2322 Query 2439 ATATGCAAGCCTTCTCTT 2456 |||||||||||||||||| Sbjct 2323 ATATGCAAGCCTTCTCTT 2340 > Ahg495046 jgi|Araly1|495046|fgenesh2_kg.8__862__AT5G49910.1 Length=2339 Score = 2218 bits (1201), Expect = 0.0 Identities = 1789/2071 (86%), Gaps = 47/2071 (2%) Strand=Plus/Plus Query 213 GAAGTGCCTTCTTCGG-TACAAGAACCGGTCCTTTCTCCACACCCACTTCTGCTTTTC-T 270 |||| | ||||||||| || ||||| |||||||||| || || || || || || | | Sbjct 122 GAAGCGTCTTCTTCGGCAAC-AGAACAAGTCCTTTCTCTACTCCAACCTCCGCCTTCCTT 180 Query 271 CAGAATGGGCAC-CAGAAATGGCGGCGGCGCTTCTAGATACGCGGTTGGTCCGGTTCGTG 329 | | ||||| || ||||| | | |||||| | ||| | |||||||| || |||| Sbjct 181 C-GTATGGG-ACGAAGAAA---CAACAACGCTTCCCGTTACACCGTTGGTCCAGTCCGTG 235 Query 330 TGGTTAACGAGAAGGTTGTTGGAATTGATTTGGGTACGACTAACTCTGCAGTAGCTGCTA 389 | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||| Sbjct 236 TTGTTAACGAGAAAGTCGTCGGAATCGATTTAGGTACGACGAACTCAGCCGTAGCTGCTA 295 Query 390 TGGAAGGAGGTAAGCCTACGATTGTGACTAACGCTGAAGGTCAGAGGACAACGCCTTCTG 449 ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| Sbjct 296 TGGAAGGAGGTAAACCAACGATTGTGACTAACGCTGAAGGTCAAAGAACTACGCCTTCTG 355 Query 450 TTGTGGCTTACACGAAGAGTGGTGATAGGCTTGTTGGGCAGATTGCGAAGA-GGCAAGCT 508 |||| ||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | | |||||| Sbjct 356 TTGTTGCTTATACTAAGAGTAAAGATAGACTTGTTGGTCAGATTGCGAA-ACGTCAAGCT 414 Query 509 GTTGTTAATCCCGAGAATACTTTCTTCTCAGTGAAGAGGTTTATTGGTAGGAAG-ATGAA 567 ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| Sbjct 415 GTTGTTAATCCGGAGAATACTTTCTTCTCTGTTAAGAGGTTTATTGGTAGG-AGAATGAA 473 Query 568 CGAGGTTGATGAAGAGTCTAAGCAGGTTTCTTACAGAGTTGTTAGAGATGAGAACAATAA 627 || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||| Sbjct 474 TGAAGTTGCTGAAGAGTCGAAGCAGGTTTCTTATAGAGTTATTAAAGATGAGAATGGTAA 533 Query 628 TGTTAAGCTTGAGTGTCCTGCCATTAACAAACAATTTGCTGCTGAGGAGATTTCAGCTCA 687 |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 534 TGTTAAGCTTGATTGTCCTGCTATTGGTAAACAATTTGCTGCTGAGGAGATTTCTGCTCA 593 Query 688 GGTTCTAAGGAAACTTGTGGATGATGCATCAAGATTCTTGAACGACAAAGTAACCAAGGC 747 |||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || Sbjct 594 GGTTTTGAGGAAGCTTGTGGATGATGCTTCGAGATTCTTGAATGATAAAGTAACCAAAGC 653 Query 748 TGTCATCACTGTGCCTGCTTACTTCAACGATTCACAGAGGACAGCTACAAAAGATGCTGG 807 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 654 TGTTATCACTGTGCCTGCTTACTTCAATGATTCACAGAGGACAGCTACTAAAGATGCTGG 713 Query 808 TCGAATTGCTGGGTTGGAAGTTCTTCGTATTATCAATGAGCCCACAGCTGCTTCATTGGC 867 ||| |||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||| ||||| Sbjct 714 TCGTATTGCTGGATTGGAAGTTCTTAGGATTATTAATGAGCCTACTGCTGCTTCTTTGGC 773 Query 868 TTATGGGTTTGACA-GAAAAGCCAATGAAACAATCCTAGTCTTCGATCTTGGTGGTGGTA 926 |||||||||||| | |||||| ||||||||| || || ||||| |||||||||||||||| Sbjct 774 TTATGGGTTTGAGAGGAAAAG-CAATGAAACTATTCTTGTCTTTGATCTTGGTGGTGGTA 832 Query 927 CCTTTGATGTCTCAGTGCTTGAGGTTGGTGATGGTGTGTTTGAAGTGCTTTCCACTTCTG 986 |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| Sbjct 833 CCTTCGATGTCTCAGTCCTTGAGGTTGGTGATGGTGTTTTTGAAGTGCTTTCTACATCTG 892 Query 987 GCGACACACACTTGGGTGGTGATGACTTTGACAAGAGAGTTGTTGATTGGCTTGCTGCAG 1046 | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 893 GTGATACACATTTGGGAGGTGATGACTTTGACAAGAGAGTTGTTGATTGGCTTGCTTCA- 951 Query 1047 AATT-CAAGAAAGACGAAGGGATAGATCTTCTGAAAGACAAGCAAGCTCTTCAGAGGTTA 1105 | || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 952 ACTTTCAAGAAAGATGAAGGTATAGATCTTCTCAAAGACAAGCAAGCGCTTCAGAGGTTA 1011 Query 1106 ACAGAGGCAGCAGAAAAAGCTAAAATTGAGCTTTCTTCACTGACTCAGACAAATATGAGC 1165 || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1012 ACTGAGGCAGCTGAAAAAGCTAAAATTGAGCTTTCCTCACTGACTCAGACAAACATGAGT 1071 Query 1166 TTACCTTTTATCACGGCCACAGCTGATGGACCTAAACACATAGAAACCACCCTCACACGT 1225 || ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || Sbjct 1072 TTGCCTTTTATCACTGCAACGGCTGATGGGCCTAAGCACATTGAAACTACTCTCACCCGG 1131 Query 1226 GCCAAGTTCGAAGAATTGTGTTCAGATTTACTTGACAGGGTCAGGACTCCTGTCGAGAAT 1285 |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct 1132 GCCAAGTTTGAAGAATTGTGCTCTGACTTACTCGACAGGGTCAGGACACCTGTGGAGAAT 1191 Query 1286 TCCCTGCGGGATGCAAAGCTCAGCTTCAAAGATATTGATGAAGTCATCCTTGTCGGTGGA 1345 |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| Sbjct 1192 TCCCTGAGGGATGCAAAACTCAGCTTCAAAGATATTGATGAGGTGATCCTTGTTGGTGGA 1251 Query 1346 TCCACACGTATTCCTGCTGTTCAGGAACTCGTGAGGAAGGTGACTGGGAAAGAACCTAAT 1405 ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||| Sbjct 1252 TCCACACGTATTCCTGCTGTTCAGGAACTTGTAAGGAAGCTGACAGGGAAAGAACCCAAT 1311 Query 1406 GT-TACAGTAAATCCTGACGAGGTTGTAGCGTTAGGTGCTGCAGTCCAGGCTGGTGTTCT 1464 || | |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1312 GTCT-CAGTCAATCCTGATGAAGTTGTAGCTTTAGGTGCTGCAGTTCAGGCTGGTGTTCT 1370 Query 1465 -TGCTGGAGATGTGAGTGACATTGTGCTTCTTGATGTGACACCGCTT-TCGATTGGTTTG 1522 | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||||||| Sbjct 1371 AT-CTGGAGATGTGAGTGACATTGTTCTTCTTGATGTGACGCCG-TTATCGCTTGGTTTG 1428 Query 1523 GAGACCCTAGGTGGTGTTATGACTAAGATTATTCCAAGGAACACCACACTGCCTACTTCT 1582 || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| Sbjct 1429 GAAACTCTTGGTGGTGTCATGACCAAGATTATACCAAGAAACACCACACTTCCAACTTCT 1488 Query 1583 AAATCAGAAGTCTTTTCAACTGCTGCTGATGGACAGACAAGTGTTGAGATTAATGTGTTG 1642 || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1489 AAGTCAGAAGTCTTCTCAACCGCTGCAGATGGACAGACAAGCGTTGAGATTAATGTGTTA 1548 Query 1643 CAGGGTGAGAGGGAGTTTGTTAGGGATAACAAGTCTCTTGGTAGCTTCCGTCTAGATGGT 1702 ||||||||||| ||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| Sbjct 1549 CAGGGTGAGAGAGAGTTCGTAAGAGATAACAAGTCTATTGGTAGCTTCCGTCTTGATGGT 1608 Query 1703 ATCCCCCCTGCACCACGTGGAGTTCCACAAATCGAAGTCAAATTTGACATTGATGCCAAT 1762 || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1609 ATTCCGCCTGCACCACGTGGAGTTCCACAAATCGAGGTCAAATTCGACATTGATGCCAAT 1668 Query 1763 GGAATTCTATCTGTCAGTGCTGTTG-ACAAGGGCACAGGAAAGAAGCAAGACATCACCAT 1821 ||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1669 GGAATTCTATCTGTCAGTGCT-TCGGACAAAGGCACAGGAAAGAAGCAGGACATCACCAT 1727 Query 1822 TACTGGCGCAAGTACATTGCCCAAGGATGAGGTAGAC-CAAATGGTCCAGGAGGCAGAAA 1880 |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| | Sbjct 1728 TACTGGTGCTAGTACCTTGCCTAAGGATGAGGTAGACACAA-TGGTGCAAGAAGCAGAGA 1786 Query 1881 GATTTGCAAAAGATGACAAAGAGAAGAGAGACGCAATCGACACGAAA-AACCAAGCAGAT 1939 | |||||||| || |||||||| |||||||| | || ||||| ||| ||||| || ||| Sbjct 1787 GGTTTGCAAAGGAAGACAAAGAAAAGAGAGATGTGATTGACAC-AAAGAACCAGGCTGAT 1845 Query 1940 TCAGTGGTGTACCAGACAGAGAAGCAACTGAAAGAACTAGGAGAGAAAATTCCAGGTGAA 1999 || || || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | Sbjct 1846 TCCGTAGTTTACCAGACGGAGAAGCAGCTTAAAGAACTTGGAGAGAAAATTCCAGGTCCA 1905 Query 2000 GTGAAAGAGAAGGTGGAGGCTAAGCTACAAGAGCTGAAAGACAAGATAGGAAGTGGATCA 2059 |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| Sbjct 1906 GTGAAAGAAAAGGTTGAGGCTAAGCTCCAAGAGCTGAAGGAAAAGATAGGAAGCGGATCA 1965 Query 2060 ACCCAAGAAATCAAAGACGCCATGGCTGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTCAG 2119 || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1966 ACTCAAGAAATCAAAGACACCATGGCAGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGCCAG 2025 Query 2120 TCTCTATACAACCAGCCTGGAGCTGGAGGTCCAGGTGCAGGTCCTTCC-CCGGGAGGCGA 2178 ||||| |||||||| || | | |||| ||||| ||| || || || ||||| || Sbjct 2026 TCTCTGTACAACCAACCCCAACC---AGGT---GGTGCTGGTTCT-CCTCCTGGAGGTGA 2078 Query 2179 AGGTGCTTCATCAGGA-GA-T--TCATCTTCAAGT-AAAGGAGGAGAT---GGTGATGAT 2230 || | | || || | || | ||||||||| | ||||| ||||| |||| |||| Sbjct 2079 AGCTTCCTCGTC-GTCTGACTCATCATCTTCA-GCCAAAGGTGGAGACAACGGTGGTGAT 2136 Query 2231 GTGATCGATGCTGACTTCACAGACAGCCAAT 2261 ||||| || |||||||||||||||||| ||| Sbjct 2137 GTGATTGACGCTGACTTCACAGACAGCAAAT 2167 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 92559295350 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5