BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G24450.1
Length=4150
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg492401 jgi|Araly1|492401|fgenesh2_kg.7__1834__AT4G24450.1 6119 0.0
> Ahg492401 jgi|Araly1|492401|fgenesh2_kg.7__1834__AT4G24450.1
Length=3995
Score = 6119 bits (3313), Expect = 0.0
Identities = 3793/4017 (94%), Gaps = 64/4017 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 15 TAATTGATGCTGTTTACAAAAAGTTTTTTCTTTGATGCAGGAAACTACTTGTGTGT-ATT 73
||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||
Sbjct 1 TAATTGATGCTGTTTACAAGAAG--TTTT-TTTGATGCAGGAAACTACCTGTGTATAATT 57
Query 74 TTGAAGAGCTTCTATAGATTTGATACGTTTAACGCATAAAAACAGCTCAAGTTTGTGAAG 133
||||||||||||| |||||||| |||| |||| | || |||| || |||
Sbjct 58 TTGAAGAGCTTCTGTAGATTTGCTACG-TTAA-G-AT------AGCT-AA-------AAG 100
Query 134 TGGAACAAGCTGCCATGGCAACCTCTAAATCCCAACAATTCCAGCTAATTGAAGGGATGG 193
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 101 TGGAACAAGCTGCCATGGCAACCTCTAAAGCCCAACAATTCCAGCTAATTGAAGGGATGG 160
Query 194 AGCTTCAGATCACCGTCACTGGATTGCCGAATGGGAGCAGTGTAAGAGCTGAGTTTCACC 253
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 161 AGCTTCAGATCACTGTCACTGGGTTGCCGAATGGGAGCAGTGTAAGTGCTGAGTTTCACC 220
Query 254 TGAAGAACTGCACTCGCGCATGGATTCTTCATTGGGGTTGTATTTACCAAGGAAATAACC 313
| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 TTAAGAACTGCACTCGCACATGGATTCTTCATTGGGGTTGTATTTACCAAGGAAATAACA 280
Query 314 ATTGGTATATCCCATCTGAACATTCCTCGAAGCAAGGTGCATTGCAGACTACCTTTGTGA 373
| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 281 ACTGGTTTGTCCCATCTGAACATTCCTCGAAGCAAGGTGCATTGCAGACTCCCTTTGTGA 340
Query 374 AGAGTGGGGATGCATATGTAGTGATCCTTGAGTTGCGGGATCCAAGGGTACGCGCAATTG 433
|||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||
Sbjct 341 AGAGTGGGAATGCTTATGTAGTGATCCTTGAGTTGCGTGATCCAAGAGTACGTGCCGTTG 400
Query 434 AATTTGTTTTGAAAGATGGTAGCCATAACAGATGGTTGAGACAGCATAATGGAAACTTCC 493
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 401 AATTTGTTTTGAAAGATGGTAGTCACAACAGATGGTTGAAACAGCATAATGGAAACTTCC 460
Query 494 GTGTTGAGATTCCCTGGAATGATCTGCATGCTCATCATCGGATACCGAAGACTCTGATAG 553
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 461 GTGTTGAGATTCCCTGGAATGATCTGCATGTTCATCATCAGATACCGAAGAATCTGATAG 520
Query 554 AAAGAAGAGCACATAAGATATGGGACCGGAAGGGACGACCACAAAGCTCTGCACGTGAAC 613
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 521 AAAGAAGAGCACATAAGATATGGGACCGGAAGGGCCGACCACAAAGCTCTGCACGTGAAC 580
Query 614 AACAGATAGACTATGACAATGCAGTAAGAGAGCTCCACGCCGAGCTCGCTAGAGGAATAT 673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 581 AACAGATAGACTATGACAATGCAGTAAGAGAGCTCCAAACCGAGCTCGCTAGAGGAATAT 640
Query 674 CTTTAGACGAACTTCAGGCTAACTCTACAGTACCAGTGGAGAAAGAAGAAACCAGTGAGC 733
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 641 CTTTAGACGACCTTCAGGCTAACTCTACAGTACCAGTGGAGAAAGAAGTAACCAGTGAGC 700
Query 734 CACATCACACAATG---ATCCAATCATATCGCCGGAAGCATGATGTTCAGAAATGGTTAC 790
||||||| || ||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 CACATCAAACTATGAACAACCAATCATATCGTCGTAAGCATGATGTTCAGAAATGGTTAC 760
Query 791 AGAAATATACGGAACCAATCAACAGAAGTGGAAGTGTGAAAAGTTCAGCCCTTGCAGAAC 850
|||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||
Sbjct 761 AGAAATATGCCGAACCAATCAACAGAAATGGAAGTGTTCAAAGTTCAACTCTTGTTGAAC 820
Query 851 TCTCCAAGAGATCTGTGGGCCAAGAAAATCTAGTTTCACAGAAAAGCTTTCATGTCAGAA 910
| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 821 TTTCCAAGAGATCTGTAGGCCAAGAAAATGTAATTTCACAAAAAAGCTTTCATGTCAGAA 880
Query 911 ACTACGAGATCACGGTCCTCCAAAGGGATGTTAAGGGAGATTGTCGCTTATGGATTGCCA 970
||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct 881 ACTACGAAATCACGGTCCTCCAGAGGAATGTTAAGGGAGGTTGTCGCTTATGGGTTGCCA 940
Query 971 CGAACATGGCAGGTCCAACAGTTCTCCATTGGGGAGTCGCAAAGTCATCTGCAGGAGAGT 1030
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 CAAACATGGCAGGTCCAACAGTTCTCCATTGGGGAGTCGCAAAGTCATCTGCAGGAGAGT 1000
Query 1031 GGTTGATACCACCACCTGACGTGTTACCTGAGAAATCAAAATTTGTTCACGGAGCATGTC 1090
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 GGTTGATTCCACCACCTGATGTGTTACCTGAGAAATCAAAATTTGTTCACGGAGCATGTC 1060
Query 1091 AAACACAATTTACCGATATGTCGAGCAGAGAACACTCTTATCAGTTTATTGATATAAATT 1150
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1061 AAACACATTTTACCGATATGTCGAGCAGAGAACACTATTATCAGTTTATTGATATAAATT 1120
Query 1151 TAAAACGAGGTGGTTTTGTTGGTATCCAATTTGTAATATGGTCGGGAGGCTACTGGGTGA 1210
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |
Sbjct 1121 TAAAACGAGGCGGTTTTGTTGGTATCCAATTTGTAATATGGTCTGGAGGCTACTGGTTAA 1180
Query 1211 ACAATAACGGAGCCAACTTCGTTGTAAACCTGAAGTCAGCAGACAGTACCAGTGGTAAGC 1270
||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 1181 ACAATAATGGAGCCAACTTCATTGTAAACCTGAAATCAGCAGACAGTACTAGTGATAAGC 1240
Query 1271 TTGACGTGGATGAAAAGTATGTTCTCAAATGGTTACTTGATGAAATATCTGAGCGAGAGA 1330
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1241 TTGACGTGGATGGAAAGTATATTCTCAAATGGTTACTTGATGAAATATCTGAGCGAGAGA 1300
Query 1331 AAGAGGCTGAGAGATCATTGATGCACAGGTTCAACATTGCAACAGAGTTGACCGAGCGTT 1390
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1301 TAGAGGCTGAGAGATCATTGATGCACAGGTTCAACATTGCAACAGAGTTGACCGACCGTT 1360
Query 1391 GTAAGGATGAAGGAGAAGGTGGATGTATTGGTATAATGGTGTGGATGAGATTCATGGCCA 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361 GTAAGGATGAAGGAGAAGGTGGATGTATTGGTATAATGGTGTGGATGAGATTCATGGCCA 1420
Query 1451 CCAGACATCTCACCTGGAATAAGAACTATAACGTGAAACCTCGGGAAATTAGTGAAGCAC 1510
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1421 CCAGACATCTAACCTGGAATAAGAACTATAATGTGAAACCTCGGGAAATTAGTGAAGCGT 1480
Query 1511 TAGAAAGATTCACCAATTTGATGGAGAAAATATATTTGCAGCAACCAAATAAGAGAGAAA 1570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TAGAAAGATTCACCAATTTGATGGAGAAAATATATTTGCAGCAACCAAATAAGAGAGAAA 1540
Query 1571 TTGTGAGACTAACTATGGCACTTGTGGGTCGTGGAGGTCAAGGTGATGTTGGGCAGAGAA 1630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1541 TTGTGAGACTAACTATGGCACTTGTGGGTCGTGGAGGTCAAGGTGATGTTGGGCAGAGAA 1600
Query 1631 TCCGTGACGAAATCCTTGTTATTCAGAGAAATAACCACTGCAAATCCGGCATGATGGAAG 1690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601 TCCGTGACGAAATCCTTGTTATTCAGAGAAATAACCACTGCAAATCCGGCATGATGGAAG 1660
Query 1691 AGTGGCACCAAAAGTTGCACAACAACAGTAGCGCAGATGATGTGATAATTTGTGAGGCTC 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1661 AGTGGCACCAAAAGTTGCACAACAACAGTAGCGCAGATGATGTGATAATTTGTGAGGCTC 1720
Query 1751 TCTTGAACTATGTGAGATCTGACTTCAGGATCGATGCATACTGGCAAACACTACAGACCA 1810
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1721 TCTTAAACTATGTGAGATCTGACTTTAGGATCGATGCCTACTGGCAAACACTAAAGACCA 1780
Query 1811 ATGGTCTCACAAAAGAAAGGCTTGCAAGTTATGACCGCCCCATAGTATCAGAGCCTCGTT 1870
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1781 ATGGTATCACAAAAGAAAGGCTTGCAAGTTATGACCGCCCCATAGTATCAGAACCTCGTT 1840
Query 1871 TCAGAAGTGATTCTAAAGAAGGACTCATCCGTGACCTTACAATGTACTTGAAAACATTAA 1930
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1841 TCAGAAGTGATGCTAAAGAAGGACTCATCCGTGACCTTACAATGTACTTGAAAACATTAA 1900
Query 1931 AGGCAGTTCATTCAGGTGCAGACCTTGAGTCTGCTATTGATACGTTCCTTTCTCCATCTA 1990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1901 AGGCAGTTCATTCAGGTGCAGACCTTGAGTCTGCTATTGATACGTTCCTTTCTCCATCTA 1960
Query 1991 AGGGTCATCATGTCTTTGCTGTCAATGGTTTATCACCAAAATTGCAGGATCTACTGAATT 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1961 AGGGTCATCATGTCTTTGCTGTCAATGGTTTATCACCAAAATTTCAGGATCTACTGAATT 2020
Query 2051 TAGTTAAGAGGCTTGTTCGCGAAGAGAACACTGAGCCCCTAATAGAGAAGTTAGTTGATG 2110
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2021 TAATTAAGAGGCTTGTTCGCGAAGAGAACACTGAGTCCCTAATAGAGAAGTTAGTTGATG 2080
Query 2111 CTCGCATTCAGTTACACCCTGCACTACGAGCACCTCGCACGAGGGCAAAAGATTTACTAT 2170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081 CTCGCATTCAGTTACACCCTGCACTACGAGCACCTCGTACGAGGGCAAAAGATTTACTAT 2140
Query 2171 TTTTGGACATTGCGTTGGAGTCATGTTTTAAAACAACAATAGAGAAGAGACTCATCTCTT 2230
|| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2141 TTCTGGACATTGCGTTGGAGTCGTGTTTTAAAACAACAATAGAGAAGAGACTCATCTCTT 2200
Query 2231 TAAACTTCAATAACCCACCGGAAATTATATATGTCATCTGCGTGGTGCTTGAGAATCTGT 2290
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2201 TAAACTTCAATAACCCACCGGAAATTATATTTGTCATCTGCGTGGTGCTTGAGAATCTGT 2260
Query 2291 GCTTATCTATAGTTAACAATGAAGAAATCATATTCTGTACA----A-------------- 2332
||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || | |
Sbjct 2261 GCTTATCTACAGTTAACAATGAAGAAATCATCTTCT-TAAATTTTATTCTCTTTTGCGTC 2319
Query 2333 -AGGATTGGTACCGTGTCAGCGAGGCTTACAGACCTCATGATGTTCAGTGGGCATTGCAA 2391
|||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2320 CAGGATTGGTACCGTATCAGTGAGGCTTACAAACCTCATGATGTTCAGTGGGCATTGCAA 2379
Query 2392 ACAAAAGCGGTCCTTGACCGTTTACAACTAGTACTTGCTGATAGATGTCAGCATTATTTT 2451
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2380 ACAAAAGCGGTTCTTGACCGTTTACAACTAGTACTTGCTGATAGATGTCAGCATTATTTT 2439
Query 2452 ACAATAATACAGCCTACTGCAAAATATCTTGGTCAACTGTTACGTGTTGACAAGCATGGG 2511
||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2440 ACATTAATACAGCCTTCTGCAAGATATCTTGGTCGACTGTTACGTATTGACAAGCATGGG 2499
Query 2512 ATTGATGTTTTCACTGAAGAGGTTATAAGAGCAGGGCCAGGAGCCGTTTTATCAACTCTT 2571
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2500 ATTGATGTTTTCACTGAAGAGGTTATAAGATCAGGGCCAGGAGCCGTTCTATCAACTCTT 2559
Query 2572 GTAAACAGATTTGATCCTTCTCTAAGGAAAATCGCGAATTTAGGCTGTTGGCAGGTTATC 2631
| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2560 ATGAACAGATTTGATCCTTCTCTCAGGAAAATCGCGAATTTAGGCTGTTGGCAGGTTATC 2619
Query 2632 AGCTCGGCTGATGCATATGGGTTTGTGGTTTGTGTGAATGAGTTAATTGTTGTTCAGAAC 2691
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2620 AGCTCGGCTGATGCATATGGGTTTTTGGTTTGTGTCAATGAGTTAATAGTTGTTCAGAAT 2679
Query 2692 AAATTCTACTCGAAGCCAACTGTAATTATTGCAAGTAAAGTCACAGGAGAAGAGGAGATC 2751
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2680 AAAGTCTACTCGAAGCCAACTGTAATTATTGCAAGTAAAGTCACAGGAGAAGAGGAGATC 2739
Query 2752 CCTGCTGGTGTTGTAGCCGTGCTGACTCCTAGTATGATTGATGTCTTGTCTCATGTATCT 2811
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2740 CCTGCTGGTGTTGTAGCTGTGCTGACTCCTAGTATGATTGATGTCTTGTCTCATGTCTCT 2799
Query 2812 ATTAGAGCAAGAAACAGCAAG--AT--------ATGC---T-T--T--GCTACATGCTTC 2853
||||||||||||||||||||| || |||| | | | ||||||||||||
Sbjct 2800 ATTAGAGCAAGAAACAGCAAGGCATTTCTTCTGATGCAGATATGCTTTGCTACATGCTTC 2859
Query 2854 GATCAGAATGTTCTCAGCAATCTGAAGTCGAAGGAAGGGAGAGCAATATCTATTCATACA 2913
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2860 GATCAGAATGTTCTCAGAAATCTGAGGTCGAAGGAAGGGAGAGCAATATCTATTCATACA 2919
Query 2914 AAGTCTACTGGTTTAGTTATCAGTGATGGCAACAACTCTGATGTCT-CTGTTCGTCATAT 2972
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
Sbjct 2920 AAGTCTACTGGTTTAGTTATCAGTGATGGCAACAACTCTGATGTCTAC-GTTCGTCATGT 2978
Query 2973 TTTTATTTCCTCTGTTCCACGGGGAGTGATCTCTAAGGGGAAGAAGTTTTGTGGCCACTA 3032
|| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2979 TTATATTTCCTCTGTTCCACGGGGAGTGATCTCCAAGGGGAAGAAGTTTTGTGGCCAATA 3038
Query 3033 TGTGATTTCATCTAAGGAATTCACTGATGAAAGGGTTGGCTCAAAATCATACAATATAAA 3092
|||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||
Sbjct 3039 TGTGATTTCAGCTAAGGAATTTACCGATGAAAGGGTCGGTTCAAAATCATACAATATCAA 3098
Query 3093 ATTTCTACGTGAAAGAGTTCCATCATGGATCAAGATACCTACCTCAGCTGCTCTTCCATT 3152
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3099 ATTTCTACGAGAAAGAGTTCCATCATGGATCAAGATACCTACCTCAGCTGCTCTTCCATT 3158
Query 3153 CGGAACATTTGAGAATATACTCTCAGATGATTCCAATAAGGATGTAGCACGCAGGATTTC 3212
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3159 CGGAACATTTGAGAATGTACTCTCAGATGATTCCAACAAGGAAGTAGCACGCAGGATTTC 3218
Query 3213 TGTCCTTAAAGATTCTCTTAACAGAGGAGACCTGACAAAACTTAAGTCCATTCAAGAAGC 3272
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 3219 TACCCTTAAAGATTCTCTTAACAGAGGAGACCTGACAAAACTTAAGGCGATTCAAGAAGC 3278
Query 3273 TATCTTACAAATGAGTGCTCCAATGGCTCTGAGAAATGAACTGATCACAAAATTGAGAAG 3332
||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3279 TATATTACAAATGTGTGCTCCAATGGCTCTGAGAAATGAACTGATGACAAAATTGAGAAG 3338
Query 3333 TGAAAGAATGCCTTATCTTGGTGATGAATCAGGCTGGAACCGCTCCTGGGTGGCAATTAA 3392
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3339 TGAAAGAATGCCTTATCTTGGGGATGAATCAGGCTGGAACCAATCCTGGGTGGCAATTAA 3398
Query 3393 GAAGGTCTGGGCTTCAAAGTGGAACGAGAGAGCTTATGTCAGTTGCaaaaaaaaTAAGCT 3452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3399 GAAGGTCTGGGCTTCAAAGTGGAACGAGAGAGCTTATGTCAGTTGCAAAAAAACTAAGCT 3458
Query 3453 TGATCATGATGCGGTCTGCATGGCTGTGCTGATTCAAGAAGTCATTTGTGGCGATTATGC 3512
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3459 TGATCATGATGAGGTCTGCATGGCGGTGCTGATTCAAGAAGTCATATGTGGCGATTATGC 3518
Query 3513 TTTCGTCATTCACACAAACAATCCGGTCTCTGGTGACTCTTCAGAAATATACACAGAGAT 3572
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3519 TTTCGTCATTCACACAAACAATCCGGTCTCTGGTGATTCTTCAGAAATATACACAGAGAT 3578
Query 3573 TGTGAAGGGTTTGGGAGAGACCTTGGTTGGAGCATATCCAGGACGAGCAATGAGCTTCAT 3632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3579 TGTGAAGGGTTTGGGAGAGACCTTGGTTGGAGCATATCCTGGACGAGCAATGAGCTTCAT 3638
Query 3633 CACCAAGAAAACAAACCTCAAGTCTCCAACCGTGATCAGTTACCCAAGTAAGAGGATAGG 3692
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3639 CACCAAGAAAACAAACCTCAAGTCTCCAACGGTGATCAGTTACCCAAGTAAGAGGATAGG 3698
Query 3693 TCTGTATTCTAAACCCTCAATCATATTCAGATCAGATTCAAACAACGAGGATCTCGAAGG 3752
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3699 TCTGTATTCTAAACCCTCAATCATATTCCGATCAGATTCAAACAACGAGGATCTTGAAGG 3758
Query 3753 CAACGCAGGCGCTGGACTTTACGACAGTGTGATAATGGATGAAGCAGAGGAAGTAGTGGT 3812
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3759 CAACGCAGGAGCTGGACTTTACGACAGTGTGATAATGGATGAAGCAGAGGAAGTTGTGGT 3818
Query 3813 GGATTACTCAAGGGAGCCACTAATAATGGACAAATCCTTTCGAGTGCGTCTATTCTCAGC 3872
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3819 GGACTACTCAAGGGAGCCGCTAATAATGGACAAATCCTTTCAAGTGCGTCTATTCTCAGC 3878
Query 3873 GATTGCAGAAGCTGGAAATGTGATAGAGTCAATCTATGGTTGTCCTCAAGACATTGAAGG 3932
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3879 GATTGCAGAAGCTGGAAATGTGATAGAGACACTCTATGGTTGTCCTCAAGACATTGAAGG 3938
Query 3933 TGTTGTCAAAGGTGGACATATCTACATCGTCCAAGCTAGACCCCAAGTTTAAGCTCT 3989
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3939 TGTTGTCAAAGGTGGACATATCTACATCGTCCAAGCTAGACCCCAAGTTTAAGCTCT 3995
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 156911373479
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5