BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G24680.1
Length=4763
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg329195 jgi|Araly1|329195|fgenesh1_pm.C_scaffold_7001422 3530 0.0
> Ahg329195 jgi|Araly1|329195|fgenesh1_pm.C_scaffold_7001422
Length=4416
Score = 3530 bits (1911), Expect = 0.0
Identities = 2216/2360 (94%), Gaps = 34/2360 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2116 ACAAACACAGAAAGCTTTCG-CGAGGTTAATGTCGATGACTCTTTGGATACCGAGTCCAT 2174
|||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2065 ACAAACACAGAAAGCTTT-GACGAGGTTAATGTGGATGACTCTTTGGATACCGATTCCAT 2123
Query 2175 CAGGAGGCCTGGGTCGGGAATATCAGCAGACCCAAAGGATAACCAGCGTTCTACGATGAG 2234
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||
Sbjct 2124 CAGGAGGCCTGGGTCTGGAATATCAGCAGACCCAAACGACAATCAGCGTTCTACGATGAG 2183
Query 2235 AGAGTTAGCCAGGCAGCGTGCTCAACAGAGGCAGAAAGAGGAGGAAGAAAGAGCGAGAGA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2184 AGAGTTAGCCAGGCAGCGTGCTCAACAGAGGCAAAAAGAGGAGGAAGAAAGAGCAAGAGA 2243
Query 2295 TCAGCGGGCTAAGGCTCTTGCAAAACTAGAAGAGTTAAATAGACGTTCCCAAATATATGA 2354
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 2244 TCAGCGGGCTAAGGCTCTCGCAAAACTAGAAGAGTTGAATAGACGTTCCCAAGTATCTGA 2303
Query 2355 GGAGGGTTCAGTTAAGAA-CATGGAAGCTGCATCT-A-ATG-C---TTCTCC-GGCTGAC 2406
|||||||||||||||||| || | || | || | ||| | ||| || | |
Sbjct 2304 GGAGGGTTCAGTTAAGAATAAT-GCTTCTCCCCCTGACATGCCAGAAGATCCTGGGTCTC 2362
Query 2407 ATGCCAACAGATCCTG-GATCTCA-TTCATCTAATGC---TACAAATTCCGTAGAACCTA 2461
|| || | | || || ||| | || || ||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 2363 AT-TCATCCGCTCTTGAGAT-GAAGAACA-CTGTTGCAGTTGCAAATTCCGTAGAACCTA 2419
Query 2462 CTGGAGGATCAGGAAAAAACACAACGCAAAACACGAGGACTTCAACAGAATATGCAAATA 2521
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2420 CTGGAGGATCAGGAAAAAACACGATGCAAAACACGAAGACTTCAACAGAATATGCAAATA 2479
Query 2522 ATGTGGGCCCTTCCCAACAGGATAATCTTCCAC--G----TGATGGCGGTGCCTCAAAAC 2575
|||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||
Sbjct 2480 ATGTAGGCCCTACCCAACAGGATAATCTTCCACGTGATCATGATGGCGGTGGCTCAAAAC 2539
Query 2576 AGAAGCGCTTGGGTTATAAGCAG-A--AGCAAAATATTATATTTGAGAAAAAACCGACAG 2632
||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2540 AGAAGCGCTTGGGTTATAAGCAGAAGCAGCAAAATATAATATTTGAGAAAAAAACGACAG 2599
Query 2633 GGAGCTCTGTTGCTACTGCAGAGGTGTTTGATGTTGTCCCGTCTCCTGAGGTTGTTAATG 2692
||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||| || |||||||||||
Sbjct 2600 GGAGCTCTGTTGCTACTACAGATGTGTTTGATATTGTTCCATCTCTTGTGGTTGTTAATG 2659
Query 2693 AAGGTGTCTCAAGCAATAACTCAGACATGCCAGCGACGTCAACCGTTTCAGCTGAGTCAA 2752
|||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2660 AAGGTGTCTCAAGCCATAACTCAGAAATGCCAGCAATGTCAAGCGTTTCAGCTGAGTCAA 2719
Query 2753 CTTTCCCGAAAAGAAAAAATAACAGGAATGGTAAGAAAAAACACAAGGCTGAGGAGACAG 2812
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2720 CTTTCCCGAAAAGAAAAAATAACAGGAATGGTAAGAAAAAGCACAAGGCTGAGGAGACAG 2779
Query 2813 CAACTATGAATACTACAAGAGTTGCCGTTGGAAAAGAAACAAAATCGGGAGATGAGTCAA 2872
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2780 CAACGATGAATACGACAAGAGTTGCCGTTGGAAAAGAAACAAAATCGGGAGATGAGTCAA 2839
Query 2873 TTGAGACTGCTAGGGCAAGGGCAGCTGAAATTGAGTTGGGGTCTGTTTCAGTTCCAAGCC 2932
||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2840 TTGAGACTGGTAGGGCAAGGGCAGCTGAAATGGAGTCGGGGTCTGTTTCAGTTCCAAGCC 2899
Query 2933 TGGATATCAAAGTGTCTGGTGATTCGTCTGAACAAATCAGTTCCTTCACTAATGAAGAGT 2992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2900 TGGATATCAAAGTGTCTGGTGATTCGTCTGAACAAATCAGTTCCTTCACTAATGAAGAGT 2959
Query 2993 CTCAAAACAGAGCTAAAAACAACTGGAAATCTCAACATGTGCGTAGGACTCAAAGAAACT 3052
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2960 CTCAAAACAGGGGAAAAAACAACTGGAAATCTCAACATTTGCGTAGGACTCAAAGAAACT 3019
Query 3053 CACTGGTAAATAAGCCT-GCAGAGAAATTTTCTGGCAACAATGCTGTTATTTGGGCTCCA 3111
||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3020 CACTGGTAAATAAGCCTGGC-GAGAAATTTTCTGGCAACAATGCTGTTATATGGGCTCCA 3078
Query 3112 GTACATCCACAGCAAAAAGCTGATGTTTCCACTGGTGGAGGGAGTCAGACTACTGTCCCT 3171
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3079 GTACATCCACAGCAAAAAGCTGATGTTTCCACAGGTGGAGGGAGTCAGACTACTGTCCCT 3138
Query 3172 GAGTTTGGCACCTCTTCAAAAAGTCAGCATCAAGGACAGACTAGTTCTAAAAGCAAAAGA 3231
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3139 GAGTTTGGCACCTCTTCAAAGAGTCAGCATCATGGACAGACTAGTTCTAAAAGCAAAAGA 3198
Query 3232 GTGGAAATTGAAAGATATGTACCGAAGCCTATAGTAAAGGAAATGGCTGAGCAAATCGTC 3291
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3199 GTGGAGATTGAAAGATATGTACCGAAGCCCATAGTAAAAGAAATGGCTGAGCAAATCGTC 3258
Query 3292 AGTAAAAATCTAGTAACCTCTGCTCCAGATATGTCGGAGAATGTAAACCAGAAAGAAAAT 3351
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3259 AGTAAAAATCTAGTAAACTCTGCTCCAGATATGTCGGAGAATGTAAACCAGAAAGAAAAT 3318
Query 3352 CGTGGAGGTGAGGGTACAGGAATTCTCCAACCTTCTGGTTCAACTGCAGGGAAA-TCTGG 3410
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3319 CGTGGAGGTGAGGGTACAGGAATTCTCGAACCTTCTGGTTCAACTGCA-GGAAATTCTGG 3377
Query 3411 GTCTCCTTCAAAGTCAAGACATGGGAATGGTAGGCAGGGAAAGCATGGTAGAGAACATGC 3470
||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3378 GTCTCCTTCAAGGTCAAGACACGGGAATGGTAGGCAGGGAAAGCATGGTAGAGAACATGG 3437
Query 3471 ATCATGGCACCAGAGAGGTTCTGGAGCACCTACTAAAGCTTTGGAGGATGGACAATTTGT 3530
||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||
Sbjct 3438 ATCATGGCACCAGAGGGGTTCTGGAGCACATACTAAACCTTTGGAGGATGGACAATATGT 3497
Query 3531 AACCTCAAATCAGCCCATCCGAGGAACAGTGAACTATCACTCTAGTAAGCAAACCGAACA 3590
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3498 AACCTCAAATCAGCCCATTCGAGGAACAGTTAACTATCACTCTAGTAACCAAACCGAACA 3557
Query 3591 AATTGCTGCCAAGGATCAAACCACATGTAATAAGGATGGATGGAACGATGGCTGGTATAT 3650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3558 AATTGCTGCCAAGGATCAAACCACATGTAATAAGGATGGATGGAACGATGGCTGGTATAT 3617
Query 3651 GACTCCTGAAACGCATTACTCTGCTGCCGAAGAAATGGAATCCAGTGCTGTTGGAAAAGA 3710
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3618 GACTCCTGAAACGCATTACTCTGCTGCTGAAGAAATGGAATCCAGTGCTGTTGGAAAAGA 3677
Query 3711 TCAAGGAATGAGCATGCACGGCAGGCAGCATGCTTCAAGAAGCAACAAGGATGGAGGAAG 3770
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3678 TCAAGGAATGAGCATGCACGGCAAGCAGCATGCTTCCAGAAGCAACAAGGATGGAGGAAG 3737
Query 3771 CAACTATGGTGACCCTAAAAAAGGCAATAAGAGGGATTTCAATAAAGCTCATACGCAGCA 3830
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3738 CAACTATGGTGACCCTAAAAAAGCCAATAAGAGGGATTTCAATAAAGCTCATATGCAGCA 3797
Query 3831 CTCTGGCCATGGGTTTAGCCAACCAGATTTGCCTGCTGCTTCAAAAGAAGGTCGTGTCCC 3890
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3798 CTCTGGCCATGGGTTTAACCAACCAGATTTGCCTGCTGCTTCAAAAGAAAGTCGTGTCCC 3857
Query 3891 TGGAGATCATGTGTGGCATACAGCTAATAGGACAGGTAAGTATGGTGGTCGTGAAAGTAC 3950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3858 TGGAGATCATGTGTGGCATACAGCTAATAGGACAGGTAAGTATGGTGGTCGTGAAAGTAC 3917
Query 3951 AAGGGACAAACCTTATGGATCTCAGGaaaaaa-aTGTTGTTGGATACGAGCATCAAGGGT 4009
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3918 GAGGGACAAACCTTATGGATCTCA-GAAAAAAGATGTTGCTGGATACGAGCATCAAGGGT 3976
Query 4010 TTACTACAGAACAAAAAACGACATCAGCTGATACACAAGCCCAGTTGCAAAACCGATCTA 4069
||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3977 TTACTACAGAACAGAAAACGACGTCTGCTGATACACAAGCCCAGTCGCAAAACCGATCTA 4036
Query 4070 CCAATAAGGAGGTCCAGGTTGAGCAAAATCCGAATAGTATGTTCCAAAAGAACACAGGGC 4129
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4037 CCAATAATGAGGTCCAGGTTGAGCAAAATCCGAATAGTATGTTCCAAAAGAACACAGGGC 4096
Query 4130 AGGGTCGACGGTTTGGAAGAGGGCAGGAGTCACAAGGAGGTTGGGGTTTACCGGCGCAAG 4189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4097 AGGGTCGACGGTTTGGAAGAGGGCAGGAGTCACAAGGAGGTTGGGGTTTACCGGCGCAAG 4156
Query 4190 AGAATATGCACCATCACCATCAGAGGCCACCTTCAAACAGAGATAGACAGAAGCAAAATC 4249
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4157 AAAATCTGCACCATCACCATCAGAGGCCACCTTCAAACAGAGATAGACAGAAGCAAAATA 4216
Query 4250 TGCATTATGAATACAAACCTGTTGGGTCTCATACTTATGATGGAGAACGTAGTCGAGAAC 4309
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4217 TGCATTATGAATACAAACCTGTTGGGTCTCATAATTATGATGGAGAACGTAGTGGAGAAC 4276
Query 4310 AATCGAAAGAGAGTTCTCAGACAGAAGGTCCAAGATACAGAGAGAAGGGACAGGGGCAGC 4369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4277 AATCGAAAGAGAGTTCTCAGACAGAAGGTCCAAGATACAGAGAGAAGGGACAGGGGCAGC 4336
Query 4370 AAAGGCAGGGTGGATACCAACAGCAAAGGGGTACTAGTGGGAGAAACGGTGGTCATGGAT 4429
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4337 AAAGGCAGGGTGGATACCAACAGCAAAGGGGTAATAGTGGGAGAAACACTGGTCATGGAT 4396
Query 4430 TCACTGGTGATAGAAACTAA 4449
|||| ||||| |||||||||
Sbjct 4397 TCACAGGTGAGAGAAACTAA 4416
Score = 1906 bits (1032), Expect = 0.0
Identities = 1126/1171 (96%), Gaps = 7/1171 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 912 AGAAGCTAATGACCGGATTGGGGATGCCAATTCCTGGAGAAGAGAGAATCAACCATACAG 971
|||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 903 AGAAGCTAATGAACGGATTGGAGAGGCCAATTCCTGGAGAAGAGATAATCAACCATACAG 962
Query 972 TGAAGATGCACCTAGACATTGTAGAGAGGAAGGGCAATTGGACTCACGTGGTTCACAATC 1031
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 963 TGAAGATGCACCTAGACATTGTAGAGAAGAAGGGCAATTGGACTCACGTGGTTCACAGTC 1022
Query 1032 TTATCCTAATGCTAATTTTCCTCCTCGGTATGATGCTTGGCGTGGTCCTCCAGTAAATAA 1091
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023 TTATCCTAATGCTAATTTTCCTCCTCAGTATGATGCTTGGCGTGGTCCTCCAGTAAATAA 1082
Query 1092 TCATCAAGGAGGTGGCTGGTACGGAGGGAACCACCCGTATGGTGCCCCAATGGGTCCTGG 1151
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083 TCATCAAGGTGGTGGCTGGTACGGAGGGAACCACCCGTATGGTGCCCCAATGGGTCCTGG 1142
Query 1152 GGGTTTTCACATGGATCCTTTTCCATTTTATCCTACGCAAGTTCCACCTGCTCCTGGACA 1211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1143 GGGTTTTCACATGGATCCTTTTCCATTTTATCCTACGCAAGTTCCACCTTCTCCTGGACA 1202
Query 1212 TGGGGCTGGTCCTAGGGGTAATCACGCTAATAATGAAAGAATGTTCAGACCTCCAATGCT 1271
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1203 TGGGGCTGGTCCTAGGGGCAATCACGCCAATAATGAAAGAATGTTCAGACCTCCAATGCT 1262
Query 1272 TGACTCTTATGTCCACCCAAGGATGCAGACTAGGCCTGGGTTTTATGTTGGTCCAGCGCC 1331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263 TGACTCTTATGTCCACCCAAGGATGCAGACTAGGCCTGGGTTTTATGTTGGTCCAGCGCC 1322
Query 1332 ACACGAAGGCTACTATGGTCCTCCCATGGGGTATGGCAGTCCCAGCAACAGAGACCTACC 1391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1323 ACACGAAGGCTACTATGGTCCTCCCATGGGGTATGGCAGTCCCAGCAACAGAGACCTGCC 1382
Query 1392 TTTTGCAGGTAGGCCTACTGGTCCGCATGCTTATAACAATCATTCTGGTCAAGGTGGATA 1451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1383 CTTTGCAGGTAGGCCTACTGGTCCGCATGCTTATAACAATCATTCTGGTCAAGGTGTATA 1442
Query 1452 TGATACGCCTGGAAGTTCAGTGTCTTTGGAACGGAACGAGTCATCACATTCTCAAGAAAC 1511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1443 TGATACGCCTGGAAGTTCAGTGTCTTTGGAACGGAACGAGTCATCACATTCTCAAGAAAC 1502
Query 1512 ACAAAGGCCATACAAGGTTCTCCTAAAGCACCAAGATGGGAGGTTTGGGGAAGATA-ATG 1570
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 1503 ACAAAGGCCATACAAGGTTATCCTAAAGCACCAAGATGGGAGGTTTGGGGAAGATAGA-G 1561
Query 1571 CAAAGCGGGAAGAATTTCTTGGAAATAGGCTCCCGAATGCAGAGAAGATAGCTCAACAGA 1630
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1562 CAAAGCGGGAAGAATTTCTAGGAAATAGGCTCCCGAATGCAGAGAAGATAGCTCAACAGA 1621
Query 1631 TGCAAACTTCAAGAAACGAGAGGAGAGAAATCAGAAATGACGCAAGTGGTGAAGTACAAC 1690
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1622 TGCAAACTTCAAGAAATGAGAGGAGAGAAATCCGAAATGAGGCAAGTGGTGAAGTACAAC 1681
Query 1691 CAGTCAAAGCAGAACTTGCTGCCCCTGGAGATCCTAGTTTGATTCAGAAAATCGAGGGCT 1750
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1682 CAATCAAAGCAGAACTTGCTGCCCCTGGAGATCCTAGTTTGATTCAGAAAATTGAGGGCT 1741
Query 1751 TAAATGCAAAAACTAGAACTAATGATGGTTGGCAAAATTCGTCATCTGTTGTTAATAGAG 1810
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||
Sbjct 1742 TAAATGCAAAAACTAGAACTAATGATGGTTGGCAAAATGCTTCATCTGTCGTCAATAGAG 1801
Query 1811 ATGAGCAGGAAAGCCAACCACGTACACTCAATTCTGGGAACTCTGCAAATAAAGTTTCAG 1870
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1802 ATGAGCAGGAAAGCAAACCACGTACAGTCAATTCTGGGAACTCTGTAAATAAAGTTTCAG 1861
Query 1871 CCAGAAATCATCGAACTGGTCATGCAAGTGACAGTAAGAACTCATCACACTATAATCAAG 1930
| | ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1862 CAAAAAATCCTCGAACTGGTCACGCAAGTGATAGTAAGAACT--T-ACACTATAATCAAG 1918
Query 1931 GTGATTCTGCCACAAACAAGAATGCTGAACCCGCAGCTATGGGTGGAACTAGC-ATATTC 1989
||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1919 GTGATTCTGCCACAAACAAAAATGCTGAACTGGCAGCTATGGGTGGAACT-GCCATATTC 1977
Query 1990 AGGAGACCTACTCAACAGACTCAAGGCAGAGCAGATCCGCAGACCAAACGAATAGTGAAC 2049
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1978 AGGAGATCTACTCAACAGACTCAAGGCAGAGCAGATCCTCAGACCAAACGAATAGTGAAC 2037
Query 2050 AGTGAAGGCAATGATGCTTGGCAGAAGACAA 2080
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2038 AGTGAAGGCAATGATGCTTGGCAGAAGACAA 2068
Score = 1094 bits (592), Expect = 0.0
Identities = 700/749 (93%), Gaps = 20/749 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 166 ATGACCTCTAGCACGACAGGAGATCGAAGCAGATGGGGTACTACAAGAAGAAGTGGCATG 225
||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACCTCTAGCACGGCAGGAGATCG-A--AGATGGGGTACTACAAGAAGAAGTGGCATG 57
Query 226 ACTATATTGGGAAAGGTTGCTGTTCCAAAACCGATTAACTTACCAAGCCAAAGGTTAGAG 285
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |
Sbjct 58 ACTATATTGGGAAAGGTTGCTGTTCCAAAACCGATTAACTTACCAAGCCAAA-GAT-G-G 114
Query 286 AACCAAGGCCTTGACCCAAATGTAGAAAT-TGTTCCAAAGGGAACACTTAGTTGGGGCAG 344
| ||| | | | || || | || | ||| || ||||||||||||||
Sbjct 115 --TTTA---CTT--TTC--TTCTGGACATCTATT-TTAGGGGGACCCTTAGTTGGGGCAG 164
Query 345 TAAATCATCACTGAATGCTTGGGGGACATCATCCTTGTCACCACGAACTGAAAGTGGCCC 404
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 165 TAAATCATCACTGAATGCTTGGGGG--A-CATCCTTGTCACCACGAACTGAAAGTGGCCC 221
Query 405 TGGTTCACCAAGCCACCTCAGTAATCGACCTTCTTCTGGTGGAAGTGTCACTCGACCTTC 464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 TGGTTCACCAAGCCACCTCAGTAATCGACCTTCTTCTGGTGGAAGTGTCACTCGACCTTC 281
Query 465 AACTGCCGATAGTAACAAAGCACATGACTCTTCTTCTTCTGTTGCATGGGATTCGAACTC 524
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 282 AACTGCTGATAGTAACAAAGCACATGACTCTTCTTCTTCTGCTGCATGGGATTCAAACTC 341
Query 525 GCGGCCTTCATCAGCATCTGGGGTGTTTCCATCTAATCAGCCATCAGTTGCACTACAGCG 584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 342 TCGGCCTTCATCAGCATCTGGGGTGTTTCCATCTAATCAGGCATCAGTTGCACTACAGCG 401
Query 585 TCCACATAGTGCAGACACAAGACCAGGAAGTTCCCAGTTATCCCGATTTGCTGAACCCGT 644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 402 TCCACATAGTGCAGACACAAGACCAGGAAGTTCCCAGTTATCCCGATTTGCTGAACCCGT 461
Query 645 GTCAGAGACTTCTGCAACATGGGGTCAACATGTGGCGCCAGAGAAGTTGGGAGTTGCTCC 704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 GTCAGAGACTTCTGCAACATGGGGTCAACATGTGGCGGCAGAGAAGTTGGGAGTTGCTCC 521
Query 705 ATCAAAGAATGATGGGTTTTCTTTGACTTCTGGAGATTTTCCTTCCCTTGGTGCTGAAAA 764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 522 ATCAAAGAATGATGGGTTTTCTTTGACTTCTGGAGATTTTCCTTCCCTTGGCGCTGAAAA 581
Query 765 GGACACTTCTGAAAAGAGTACAAGGCCACAAGGAGATACGTTAGACATGGCTCTTAGAAA 824
||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 582 GGAAACTTCTGAAAAGAGTACAAGGCCACATGTAAATACGTTAGACATGGCTCTTAGAAA 641
Query 825 CTACAAATTTGCAGATGCTGGACCTCACGCTCGTCCTCCATCTTCGTCTGGAAGATCTGT 884
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 642 CTGCAAATTTGCAGATGCTGGACCTCACGCTCGTCCTCCATCTTCGTCTGGAAGATCTGT 701
Query 885 GGAAGGGCAAGGTGTAGATTGCACAGAAG 913
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 702 GGAAGGGCAAGGTGTAGATTGCACAGAAG 730
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 180240665728
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5