BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G26300.1
Length=2352
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg329048 jgi|Araly1|329048|fgenesh1_pm.C_scaffold_7001275 3059 0.0
Ahg480296 jgi|Araly1|480296|fgenesh2_kg.3__2997__AT1G66530.1 2353 0.0
Ahg475759 jgi|Araly1|475759|fgenesh2_kg.2__889__AT1G66530.1 2292 0.0
Ahg925691 jgi|Araly1|925691|scaffold_201252.1 2257 0.0
Ahg904298 jgi|Araly1|904298|Al_scaffold_0003_1426 1685 0.0
Ahg349990 jgi|Araly1|349990|fgenesh1_pg.C_scaffold_6000583 577 1e-163
Ahg935985 jgi|Araly1|935985|scaffold_500176.1 569 2e-161
Ahg945445 jgi|Araly1|945445|scaffold_701674.1 418 9e-116
> Ahg329048 jgi|Araly1|329048|fgenesh1_pm.C_scaffold_7001275
Length=1773
Score = 3059 bits (1656), Expect = 0.0
Identities = 1734/1773 (98%), Gaps = 0/1773 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 157 ATGGCAGCTAATGAAGAATTTACGGGAAATCTGAAACGTCAACTCGCGAAGCTCTTTGAT 216
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGCTAATGAAGAGTTTACGGGAAATCTAAAACGCCAACTCGCTAAGCTCTTTGAT 60
Query 217 GTTTCTCTAAAATTAACGGTTCCTGATGAACCTAGTGTTGAGCCCTTGGTGGCTGCCTCC 276
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 GTGTCTCTAAAATTAACGGTTCCTGATGAACCTAGTGTTGAGCCCTTGGTGGCTGCCTCC 120
Query 277 GCTCTTGGAAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAACGCAATGGGACTATGGTCCATAATT 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GCTCTTGGAAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTCCATAATT 180
Query 337 AAAGGAAAGGGTACTCAGTTCAAGGGTCCTCCAGCTGTTGGACAGGCCCTTGTTAAGAGT 396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 AAAGGAAAGGGTACTCAGTTCAAGGGTCCTCCAGCTGTTGGACAGGCCCTTGTTAAGAGT 240
Query 397 CTCCCTACTTCTGAGATGGTAGAATCATGCTCTGTAGCTGGACCTGGCTTTATTAATGTT 456
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 CTCCCTACTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTGTAGCTGGACCTGGCTTTATTAATGTT 300
Query 457 GTACTATCAGCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTCATCGATGGAGTTGAC 516
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 301 GTACTATCAGCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTCATCAATGGAGTTGAC 360
Query 517 ACATGGGCACCTACTCTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATT 576
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 ACATGGGCACCTACTCTTTCCGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATT 420
Query 577 GCAAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTAAGATCAACTATCATTGGTGACACTCTAGCTCGC 636
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 421 GCAAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTTAGATCAACTATCATTGGTGACACGCTAGCTCGC 480
Query 637 ATGCTCGAGTACTCACATGTTGAAGTTCTACGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACA 696
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 ATGCTCGAGTACTCAAATGTTGAAGTTCTACGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACA 540
Query 697 CAGTTTGGCATGCTAATTGAGTACCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGATAGTGTGACC 756
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CAGTTTGGCATGCTAATTGAGTACCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGATAGTGTGACT 600
Query 757 GAGACAGCAATTGGAGATCTTCAGGTGTTTTACAAGGCATCAAAACATAAATTTGATCTG 816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GAGACAGCAATTGGAGATCTTCAGGTGTTTTACAAGGCATCAAAACATAAATTTGATCTG 660
Query 817 GACGAGGCCTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTACAGGGTGGTGATCCT 876
|| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 661 GATGAGGACTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCCGTTTACAGGGTGGTGATCCT 720
Query 877 GTTTACCGTAAGGCTTGGGCTAAGATCTGTGACATCAGCCGAACTGAGTTTGCCAAGGTT 936
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 GTTTACCGTAAGGCTTGGGCTAAGATCTGTGACATCAGCCGAACTGAGTTTGCCAAGGTT 780
Query 937 TACCAACGCCTTCGAGTTGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTCATATT 996
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 781 TACCAACGCCTTCGAGTTGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTTATATT 840
Query 997 GCTAAAGTAATTGAGGAATTGAATAGCAAGGGGTTGGTTGAAGAAAGTGAAGGTGCTCGT 1056
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GCTAAAGTAATTGAGGAATTGAATAGCAAGGGATTGGTTGAAGAAAGTGAAGGTGCTCGT 900
Query 1057 GTGATTTTCCTTGAAGGCTTCGACATCCCACTCATGGTTGTAAAGAGTGATGGTGGTTTT 1116
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 GTGATTTTCCTTGAAGGCTTTGACATCCCACTCATGGTTGTAAAGAGTGATGGTGGTTTT 960
Query 1117 AACTATGCCTCAACAGATCTGACTGCTCTTTGGTACCGGCTCAATGAAGAGAAAGCTGAG 1176
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 961 AACTATGCCTCAACAGATCTGACTGCTCTTTGGTACCGGCTCAACGAAGAGAAAGCTGAG 1020
Query 1177 TGGATCATATATGTGACCGATGTTGGCCAGCAGCAGCACTTTAATATGTTCTTCAAAGCT 1236
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TGGATTATATATGTGACCGATGTTGGCCAGCAGCAGCACTTTAATATGTTCTTCAAAGCT 1080
Query 1237 GCCAGAAAAGCAGGTTGGCTTCCAGACAATGATAAAACTTACCCTAGAGTTAACCATGTT 1296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GCCAGAAAAGCAGGTTGGCTTCCAGACAATGATAAAACTTACCCTAGAGTTAACCATGTT 1140
Query 1297 GGTTTTGGTCTCGTCCTTGGGGAAGATGGCAAGCGATTTAGAACTCGGGCAACAGATGTA 1356
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1141 GGTTTTGGTCTCGTCCTCGGGGAAGATGGCAAGCGATTTAGAACTCGTGCAACAGATGTA 1200
Query 1357 GTCCGCCTAGTTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGACTCGCAGTAAACTTGCCCTTATTGAG 1416
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201 GTCCGCCTAGTTGATTTGTTAGATGAGGCCAAGACTCGCAGTAAACTTGCCCTTATTGAG 1260
Query 1417 CGCGGTAAGGACAAAGAATGGACACCGGAAGAACTGGACCAAACAGCTGAGGCAGTTGGA 1476
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 CGCGGCAAGGACAAAGAATGGACACCGGAGGAACTGGACCAAACAGCTGAGGCAGTTGGA 1320
Query 1477 TATGGTGCGGTCAAGTATGCTGACCTGAAGAACAACAGATTAACAAATTATACTTTCAGC 1536
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 TATGGTGCGGTAAAGTATGCTGACCTGAAGAACAACAGATTAACAAATTATACTTTCAGC 1380
Query 1537 TTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAAATACAGCCGTTTACCTTCTTTACGCCCATGCT 1596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1381 TTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAAATACAGCCGTTTACCTTCTTTACGCTCATGCT 1440
Query 1597 CGGATCTGTTCAATCATCAGAAAGTCTGGCAAAGACATAGATGAGCTGAAAAAGACAGGA 1656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1441 CGGATCTGTTCAATCATCAGAAAGTCTGGCAAAGACATAGATGAGCTGAGAAAGACAGGA 1500
Query 1657 AAATTAGCATTGGATCATGCAGATGAACGAGCACTGGGGCTTCACTTGCTTCGATTTGCT 1716
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 AAACTAGCATTGGATCATGCAGATGAACGAGCACTGGGGCTTCACTTGCTTCGATTTGCT 1560
Query 1717 GAGACGGTGGAGGAAGCTTGTACCAACTTATTACCGAGTGTTCTGTGCGAGTACCTCTAC 1776
|||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct 1561 GAGACGGTTGAGGAAGCTTGCACCAACTTGTTACCGAGCGTGCTGTGCGAGTACCTCTAC 1620
Query 1777 AATTTATCTGAACACTTTACCAGATTCTACTCCAATTGTCAGGTCAATGGTTCACCAGAG 1836
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621 AATTTATCTGAACACTACACCAGATTCTACTCCAATTGTCAGGTCAATGGTTCACCAGAG 1680
Query 1837 GAGACAAGCCGTCTCCTACTTTGTGAAGCAACGGCCATAGTCATGCGGAAATGCTTCCAC 1896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1681 GAGACAAGCCGTCTCCTACTTTGTGAAGCAACGGCCATAGTTATGCGGAAATGCTTCCAC 1740
Query 1897 CTTCTTGGAATCACTCCGGTTTACAAGATTTGA 1929
||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1741 CTTCTTGGAATCACTCCTGTTTACAAGATTTGA 1773
> Ahg480296 jgi|Araly1|480296|fgenesh2_kg.3__2997__AT1G66530.1
Length=1790
Score = 2353 bits (1274), Expect = 0.0
Identities = 1615/1778 (91%), Gaps = 29/1778 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 162 AGCTAATGAAGAATTTACGGGAAATCTGAA-ACGTCAACTCGCGAAGCTCTTTGATGTTT 220
||||||| |||||||||||||||||| || | | ||||| || |||||||||||||| |
Sbjct 32 AGCTAATAAAGAATTTACGGGAAATC-CAAGAAGACAACTGGCTAAGCTCTTTGATGTGT 90
Query 221 CTCTAAAATTAACGGTTCCTGATGAACCTAGTGTTGAGCCCTTGGTGGCTGCCTCCGCTC 280
|||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || || |
Sbjct 91 CTCTTAAATTAACAGTTCCTGATGAACCTAATGTTGAGCCCTTGAT---TG----AGC-C 142
Query 281 TTGGAAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAACGCAATGGGACTATGGTCCATAATTAAAG 340
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 143 -TGGCAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTCCATTATCAAAG 201
Query 341 GAAAGGGTACTCAGTTCAAGGGTCCTCCAGCTGTTGGACAGGCCCTTGTTAAGAGTCTCC 400
|||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 202 GAAAGGGTACGCAGTTTAAGGGTCCTCCCGCTGTTGGACAGGCTCTTATTAAGAGTCTCC 261
Query 401 CTACTTCTGAGATGGTAGAATCATGCTCTGTAGCTGGACCTGGCTTTATTAATGTTGTAC 460
|||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 262 CTACTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGGACCTGGATTTGTTAATGTTGTAC 321
Query 461 TATCAGCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTCATCGATGGAGTTGACACAT 520
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||
Sbjct 322 TATCGGCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTTATCGATGGAATTGATACAT 381
Query 521 GGGCACCTACTCTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGCAA 580
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 382 GGGCGCCTACTCTTTCAGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGCTA 441
Query 581 AAGAAATGCATGTTGGTCATCTAAGATCAACTATCATTGGTGACACTCTAGCTCGCATGC 640
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||
Sbjct 442 AAGAAATGCATGTTGGTCATCTAAGATCAACTATTATCGGTGATACGCTTGCTCGTATGC 501
Query 641 TCGAGTACTCACATGTTGAAGTTCTACGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACAGT 700
||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 502 TCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTACGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACAGT 561
Query 701 TTGGCATGCTAATTGAGTACCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGATAGTGTGACCGAGA 760
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 562 TTGGCATGCTGATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGATAGTGTGACCGAGA 621
Query 761 CAGCAATTGGAGATCTTCAGGTGTTTTACAAGGCATCAAAACAT-AAATTTGATCTGGA- 818
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||
Sbjct 622 CAGCAATTGGAGATCTTCAGATGTTTTACAAGAAATCAAAAT-TGAAATTTGATTTGGAT 680
Query 819 CGAGGCCTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTACAGGGTGGTGATCCTGT 878
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 681 CC-GGAGTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTACAGGGTGGAGATCCTGT 739
Query 879 TTACCGTAAGGCTTGGGCTAAGATCTGTGACATCAGCCGAA-CTGAGTTTGCCAAGGTTT 937
|||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||| |
Sbjct 740 TTACCGCAAGGCTTGGGCTAAGATTTGTGAAATCAGCCGAAAC-GAGTTTGCCAAGGTGT 798
Query 938 ACCAACGCCTTCGAGTTGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTCATATTG 997
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 799 ACCAACGCCTTCGAGTCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTTATATCG 858
Query 998 CTAAAGTAATTGAGGAATTGAATAGCAAGGGGTTGGTTGAAGAAAGTGAAGGTGCTCGTG 1057
|||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 859 CTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTGAAGAAAGTAAAGGTGCTCGTG 918
Query 1058 TGATTTTCCTTGAAGGCTTCGACATCCC-ACTCATGGTTGTAAAGAGTGATGGTGGTTTT 1116
|||| ||| | |||||||| | | ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 919 TGATATTCATCGAAGGCTTTAA-AGCCCCACTCATTGTTGTAAAGAGTGACGGTGGTTTT 977
Query 1117 AACTATGCCTCAACAGATCTGACTGCTCTTTGGTACCGGCTCAATGAAGAGAAAGCTGAG 1176
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 978 AACTATGCCTCAACAGATCTGACTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATGAAGAGAAAGCTGAG 1037
Query 1177 TGGATCATATATGTGACCGA-TGTTGGCCAGCAGCAGCACTTTAATATGTTCTTCAAAGC 1235
||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1038 TGGATAATATATTTGACCGACT-TTGGCCAGCAGCAGCACTTTCATATGTTCTTCAAAGC 1096
Query 1236 TGCCAGAAAAGCAGGTTGGCTTCCAGACAATGATAAAACTTACCCTAGAGTTAACCATGT 1295
||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1097 TGCCAGAAAAGCAGGCTGGCTTCCAGACGATGATAAAACTTACCCTAGAGTTAATCATGT 1156
Query 1296 TGGTTTTGGTCTCGTCCTTGGGGAAGATGGCAAGCGATTTAGAACTCGGGCAACAGATGT 1355
|||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||
Sbjct 1157 TGGTTTTGGTCTTGTTCTTGGAGATGATAACAAGCGATTTAGAACTCGGTCAACAGAGGT 1216
Query 1356 AGTCCGCCTAGTTGATTTGCTAGATGAGGCCAAG-ACTCGCAGTAAA-CTTGCCCTTATT 1413
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||
Sbjct 1217 AGTCCGCCTAGTCGATTTACTAGATGAGGCCAAGGA-TCGCAGTAAAGCT-GCCCTTATT 1274
Query 1414 GAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGACACCGGAAGAACTGGACCAAACAGCTGAGGCAGTT 1473
||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1275 GAGCGTGGTAAGGACAAAGAATGGACACCCGAGGAGCTGGACCAAACAGCTGAGTCAGTT 1334
Query 1474 GGATATGGTGCGGTCAAGTATGCTGACCTGAAGAACAACAGATTAACAAATTATACTTTC 1533
||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1335 GGATACGGTGCGCTGAAGTATGCTGACCTGAAGACCAACAGATTGACGGGTTATACTTTC 1394
Query 1534 AGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAAATACAGCCGTTTACCTTCTTTACGCCCAT 1593
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395 AGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGTTTACCTTCTTTACGCCCAT 1454
Query 1594 GCTCGGATCTGTTCAATCATCAGAAAGTCTGGCAAAGACATAGATGAGCTGAAAAAGACA 1653
||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1455 GCTCGGATCTGCTCAATCATAAGAAAGTCTGGCAAAGACATAGATGAGCTGAAAAAGACA 1514
Query 1654 GGAAA-ATTAGCATTGGATCATGCAGATGAACGAGCACTGGGGCTTCACTTGCTTCGATT 1712
||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| |||
Sbjct 1515 GGAAAGAT-AGCATTGGATCATGCAGCGGAACGGGCACTGGGGCTTCACCTACTTCAATT 1573
Query 1713 TGCTGAGACGGTGGAGGAAGCTTGTACCA-ACTTATTACCGAGTGTTCTGTGCGAGTACC 1771
||||||||||||||||||||| || |||| | || ||||||| ||| |||||| | ||||
Sbjct 1574 TGCTGAGACGGTGGAGGAAGCATGCACCACA-TTGTTACCGAATGTGCTGTGCAAATACC 1632
Query 1772 TCTACAATTTATCTGAACACTTTACCAGATTCTACTCCAATTGTCAGGTCAATGGTTCAC 1831
| ||| | ||||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 1633 TTTACTACTTATCTGAAGAGTTCACCAAATTCTACTCCAGTTGTCAGGTGAATGGTTCAG 1692
Query 1832 CAGAGGAGACAAGCCGTCTCCTACTTTGTGAAGCAACGGCCATAGTCATGCGGAAATGCT 1891
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1693 CAGAGGAGACAAGCCGTCTCCTACTATGTGAAGCAACAGCCATAGTCATGCGGAAATGCT 1752
Query 1892 TCCACCTTCTTGGAATCACTCCGGTTTACAAGATTTGA 1929
||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||
Sbjct 1753 TCCACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGA 1790
> Ahg475759 jgi|Araly1|475759|fgenesh2_kg.2__889__AT1G66530.1
Length=1825
Score = 2292 bits (1241), Expect = 0.0
Identities = 1622/1804 (90%), Gaps = 34/1804 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 162 AGCTAATGAAGAATTTACGGGAAATCTGAA-ACGTCAACTCGCGAAGCTCTTTGATGTTT 220
||||||| |||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||| || |
Sbjct 18 AGCTAATAAAGAATTTACGGGAAA-CCCAAGACGCCAACTCGCTAAGCTCTTTGAGGTGT 76
Query 221 CTCTAAAATTAACGGTTCCTGATGAACCTAGTGTTGAGCCCTTGGTGGCTGCCTCCGCTC 280
|||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | || || |
Sbjct 77 CTCTTAAATTAACAGTTCCTGATGAACCTAATGTTGAGCCCTTGAT---TG----AGC-C 128
Query 281 TTGGAAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAACGCAATGGGACTATGGTCCATAATTAAAG 340
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||
Sbjct 129 -TGGAAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTCCTTTATCAAAG 187
Query 341 GAAAGGGTACTCAGTTCAAG-GGTCCTCCAGCTGTTGGACAGGCCCTTGTTAAGAGTCTC 399
|||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||
Sbjct 188 GAAAGGGTACACAGTTC-CGTGGTCCTCCCGCTGTTGGACAGGCTCTTATTAAGAATCTC 246
Query 400 CCTACTTCTGAGATGGTAGAATCATGCTCTGTAGCTGGACCTGGCTTTATTAATGTTGTA 459
|||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 247 CCTAGTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTGGACCTGGATTTGTTAATGTTGTG 306
Query 460 CTATCAGCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTCATCGATGGAGTTGACACA 519
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||
Sbjct 307 CTATCAGCTAAGTGGATAGCTAAGAGTATTGAAAATATGCTTGTTGATGGAATTGATACA 366
Query 520 TGGGCACCTACTCTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGCA 579
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367 TGGGCGCCTACTCTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGCT 426
Query 580 AAAGAAATGCATGTTGGTCATCTAAGATCAACTATCATTGGTGACACTCTAGCTCGCATG 639
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||
Sbjct 427 AAAGAAATGCATGTTGGTCATCTAAGATCAACTATTATCGGTGACACGCTTGCTCGTATG 486
Query 640 CTCGAGTACTC-ACATGTTGAAGTTCTACGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACA 698
||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 487 CTCGAGTACTCTA-AGGTTGAAGTTCTACGTAGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACA 545
Query 699 GTTTGGCATGCTAATTGAGTACCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGATAGTGTGACCGA 758
|||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 546 GTTTGGCATGTTGATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGATAGTGTGACTGA 605
Query 759 GACAGCAATTGGAGATCTTCAGGTGTTTTACAAGGCATCAAAACATAA-ATTTGATCTGG 817
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||
Sbjct 606 GACAGCAATTGGAGATCTTCAGATGTTTTACAAGAAATCAAAAT-TGAGATTTGATTTGG 664
Query 818 A-CGAGGCCTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTACAGGGTGGTGATCCT 876
| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 665 ATCC-GGAGTTTAAGGAAAAGGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTACAGGGTGGAGATCCT 723
Query 877 GTTTACCGTAAGGCTTGGGCTAAGATCTGTGACATCAGCCGAACTGAGTTTGCCAAGGTT 936
|||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 724 GTTTACCGCAAGGCTTGGGCTAAGATTTGTGAAATCAGCCGAAATGAGTTTGCCAAGGTG 783
Query 937 TACCAACGCCTTCGAGTTGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTCATATT 996
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 784 TACCAACGCCTTCGAGTCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTTATATC 843
Query 997 GCTAAAGTAATTGAGGAATTGAATAGCAAGGGGTTGGTTGAAGAAAGTGAAGGTGCTCGT 1056
||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 844 GCTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGTTGAAGAAAATGAAGGTGCTCGT 903
Query 1057 GTGATTTTCCTTGAAGGCTTCGACATCCCACTCATGGTTGTAAAGAGTGATGGTGGTTTT 1116
||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 904 GTGATATTCGTCGAAGGCTTTAACATCCCACTCATGGTTGTAAAGAGTAACGGTGGTTTT 963
Query 1117 AACTATGCCTCAACAGATCTGACTGCTCTTTGGTACCGGCTCAATGAAGAGAAAGCTGAG 1176
||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 964 AACTATGCCTCTACCGATCTGACTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATGAAGAGAAAGCTGAG 1023
Query 1177 TGGATCATATATGTGACCGATGTTGGCCAGCAGCAGCACTTTAATATGTTCTTCAAAGCT 1236
||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1024 TGGATTATATATTTGACCGACCTTGGCCAGCAGCAGCACTTTCATATGTTCTTCAAAGCT 1083
Query 1237 GCCAGAAAAGCAGGTTGGCTTCCAGACAATGATAAAACTTACCCTAGAGTTAACCATGTT 1296
|||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084 GCCAGAAAAGCAGGCTGGCTTCCAGACGATGACAAAACTTACCCTAGAGTTAACCATGTT 1143
Query 1297 GGTTTTGGTCTCGTCCTTGGGGAAGATGGCAAGCGATTTAGAACTCGGGCAA-CAGATGT 1355
||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| | || ||
Sbjct 1144 GGTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGCTGATAACAAGCGATTTAGAACTCGGGCAAAC-GAGGT 1202
Query 1356 AGTCCGCCTAGTTGATTTGCTAGATGAGGCCAAG-ACTCGCAGTAAA-CTTGCCCTTATT 1413
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||
Sbjct 1203 AGTCCGACTAGTTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGA-TCGCAGTAAAGCT-GCCCTTATT 1260
Query 1414 GAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGACACCGGAAGAACTGGACCAAACAGCTGAGGCAGTT 1473
||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1261 GAGCGAGGTAAGGACAAAGAATGGACACCTGAGGAGCTGGACCAAATAGCTGAGGCAGTT 1320
Query 1474 GGATATGGTGCGGTCAAGTATGCTGACCTGAAGAACAACAGATTAACAAATTATACTTTC 1533
||||| |||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||
Sbjct 1321 GGATACGGTGCGCTGAAGTTTGCTGACCTGAAGACCAACAGATTGACGGGTTATACTTTC 1380
Query 1534 AGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAAATACAGCCGTTTACCTTCTTTACGCCCAT 1593
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 AGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGCCGTTTACCTTCTTTACGCCCAT 1440
Query 1594 GCTCGGATCTGTTCAATCATCAGAAAGTCTGGCAAAGACATAGATGAGCTGAAAAAG-AC 1652
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 1441 GCTCGGATCTGCTCAATCATAAGAAAGTCTGGCAAAGACATAGATGAGCT-AAAAAGGAC 1499
Query 1653 AGGAAA-ATTAGCATTGGATCATGCAGATGAACGAGCACTGGGGCTTCACTTGCTTCGAT 1711
|||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 1500 AGGAAAGAT-AGCATTGGATCATGCAGCGGAACGGGCACTGGGGCTTCACCTGCTTCAAT 1558
Query 1712 TTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCTTGTACCA-ACTTATTACCGAGTGTTCTGTGCGAGTAC 1770
||||||||||||| |||||||| || |||| | || ||||||| || |||||| |||||
Sbjct 1559 TTGCTGAGACGGTTGAGGAAGCGTGCACCACA-TTGTTACCGAACGTGCTGTGCAAGTAC 1617
Query 1771 CTCTACAATTTATCTGAACACTTTACCAGATTCTACTCCAATTGTCAGGTCAATGGTTCA 1830
|| ||| | ||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1618 CTTTACTACTTATCCGAAGAGTTCACCAAATTCTACTCCAATTGTCAGGTGAATGGTTCA 1677
Query 1831 CCAGAGGAGACAAGCCGTCTCCTACTTTGTGAAGCAACGGCCATAGTCATGCGGAAATGC 1890
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1678 GCAGAGGAGACAAGCCGTCTCTTACTTTGCGAAGCAACGGCTATAGTCATGCGGAAATGC 1737
Query 1891 TTCCACCTTCTTGGAATCACTCCGGTTTACAAGATTTGATCACATCACAA-GTAAACGAC 1949
||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| || | |||| ||
Sbjct 1738 TTCTACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGATC-CATCATAATG-AAACTAC 1795
Query 1950 CCAA 1953
||||
Sbjct 1796 CCAA 1799
> Ahg925691 jgi|Araly1|925691|scaffold_201252.1
Length=1913
Score = 2257 bits (1222), Expect = 0.0
Identities = 1588/1762 (90%), Gaps = 35/1762 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 197 AACTCGCGAAGCTCTTTGATGTTTCTCTAAAATTAACGGTTCCTGATGAACCTAGTGTTG 256
||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 179 AACTCGCTAAGCTCTTTGAGGTGTCTCTTAAATTAACTGTTCCTGATGAACCTAACGTTG 238
Query 257 AGCCCTTGGTGGCTGCCTCCGCTCTTGGAAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAACGCAA 316
|||||||| | | |||| || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 239 AGCCCTTGATTG-AGCCT--GC-C-----AAATTCGGAGATTACCAATGTAACAATGCAA 289
Query 317 TGGGACTATGGTCCATAATTAAAGGAAAGGGTACTCAGTTCAAGGGTCCTCCAGCTGTTG 376
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 290 TGGGACTATGGTCCATTATTAAAGGAAAGGGTACACAGTTCAAGGGTCCTCCCGCTGTTG 349
Query 377 GACAGGCCCTTGTTAAGAGTCTCCCTACTTCTGAGATGGTAGAATCATGCTCTGTAGCTG 436
||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 350 GACAGGCTCTTATTAAGAATCTCCCTAGTTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTATAGCTG 409
Query 437 GACCTGGCTTTATTAATGTTGTACTATCAGCTAAGTGGATGGCTAAGAGTATTGAAAATA 496
||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 410 GACCTGGATTTGTTAATGTTGTACTATCAGCTAAGTGGATAGCTAAGAGTATTGAAAATA 469
Query 497 TGCTCATCGATGGAGTTGACACATGGGCACCTACTCTTTCGGTTAAGAGAGCTGTAGTTG 556
|||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 470 TGCTTATCGATGGAATTGATACATGGGCGCCTACTCTTTCTGTTAAGAGAGCTGTAGTTG 529
Query 557 ATTTTTCCTCTCCCAACATTGCAAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTAAGATCAACTATCA 616
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 530 ATTTTTCCTCTCCCAACATTGCTAAAGAAATGCATGTTGGTCATCTAAGATCAACTATCA 589
Query 617 TTGGTGACACTCTAGCTCGCATGCTCGAGTACTCACATGTTGAAGTTCTACGCAGAAACC 676
||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 TTGGTGATACGCTTGCTCGTATGCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTACGCAGAAACC 649
Query 677 ATGTTGGTGACTGGGGAACACAGTTTGGCATGCTAATTGAGTACCTCTTTGAGAAATTTC 736
|||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 650 ATGTTGGTGACTGGGGAACACAGTTTGGCATGTTGATTGAGTTTCTCTTTGAGAAATTTC 709
Query 737 CTGATACAGATAGTGTGACCGAGACAGCAATTGGAGATCTTCAGGTGTTTTACAAGGCAT 796
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 710 CTGATACAGATAGTGTGACCGAGACAGCAATTGGAGATCTTCAGATGTTTTACAAGAAAT 769
Query 797 CAAAACATAA-ATTTGATCTGGA-CGAGGCCTTTAAGGAAAAAGCACAACAGGCTGTGGT 854
||||| | | ||||||| |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 770 CAAAAT-TGAGATTTGATTTGGATCC-GGAGTTTAAGGAAAAGGCACAACAGGCTGTGGT 827
Query 855 CCGTCTACAGGGTGGTGATCCTGTTTACCGTAAGGCTTGGGCTAAGATCTGTGACATCAG 914
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 828 CCGTCTACAGGGTGGAGATCCTGTTTACCGCAAGGCTTGGGCTAAGATTTGTGAAATCAG 887
Query 915 CCGAACTGAGTTTGCCAAGGTTTACCAACGCCTTCGAGTTGAGCTTGAAGAAAAGGGAGA 974
||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 888 CCGAAATGAGTTTGCCAAGGTGTACCAACGCCTTCGAGTCGAGCTTGAAGAAAAGGGAGA 947
Query 975 AAGCTTTTACAACCCTCATATTGCTAAAGTAATTGAGGAATTGAATAGCAAGGGGTTGGT 1034
|||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 948 AAGCTTTTACAACCCTTATATCGCTAACGTAATTGAGGAATTGAGCAGCAAGGGGTTAGT 1007
Query 1035 TGAAGAAAGTGAAGGTGCTCGTGTGATTTTCCTTGAAGGCTTCGACATCCCACTCATGGT 1094
|||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1008 TGAAGAAAATGAAGGTGCTCGTGTGATATTCGTCGAAGGCTTTAACATCCCACTCATGGT 1067
Query 1095 TGTAAAGAGTGATGGTGGTTTTAACTATGCCTCAACAGATCTGACTGCTCTTTGGTACCG 1154
|||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1068 TGTAAAGAGTAACGGTGGTTTTAACTATGCCTCTACCGATCTGACTGCTCTTTGGTATCG 1127
Query 1155 GCTCAATGAAGAGAAAGCTGAGTGGATCATATATGTGACCGATGTTGGCCAGCAGCAGCA 1214
||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1128 GCTTAATGAAGAGAAAGCTGAGTGGATTATATATTTGACCGACCTTGGCCAGCAGCAGCA 1187
Query 1215 CTTTAATATGTTCTTCAAAGCTGCCAGAAAAGCAGGTTGGCTTCCAGACAATGATAAAAC 1274
|||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||
Sbjct 1188 CTTTCATATGTTCTTTAAAGCTGCCAGAAAAGCAGGCTGGCTTCCAGACGATGACAAAAC 1247
Query 1275 TTACCCTAGAGTTAACCATGTTGGTTTTGGTCTCGTCCTTGGGGAAGATGGCAAGCGATT 1334
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||
Sbjct 1248 TTACCCTAGAGTTAACCATGTTGGTTTTGGTCTTGTCCTTGGAGCTGATAACAAGCGATT 1307
Query 1335 TAGAACTCGGGCAA-CAGATGTAGTCCGCCTAGTTGATTTGCTAGATGAGGCCAAG-ACT 1392
|||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 1308 TAGAACTCGGGCAAAC-GAGGTAGTCCGACTAGTTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGGA-T 1365
Query 1393 CGCAGTAAA-CTTGCCCTTATTGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGACACCGGAAGAACT 1451
||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||
Sbjct 1366 CGCAGTAAAGCT-GCCCTTATTGAGCGAGGTATGGACAAAGAATGGACACCTGAGGAGCT 1424
Query 1452 GGACCAAACAGCTGAGGCAGTTGGATATGGTGCGGTCAAGTATGCTGACCTGAAGAACAA 1511
||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 1425 GGACCAAACAGCTGAGGCAGTTG-ATA-----CGGT---GTATGCTGACCTGAAGACCAA 1475
Query 1512 CAGATTAACAAATTATACTTTCAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAAATACAGC 1571
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1476 CAGATTGACGGGTTATACTTTCAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAGATACAGC 1535
Query 1572 CGTTTACCTTCTTTACGCCCATGCTCGGATCTGTTCAATCATCAGAAAGTCTGGCAAAGA 1631
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1536 CGTTTACCTTCTTTACGCCCATGCTCGGATCTGCTCAATCATAAGAAAGTCTGGCAAAGA 1595
Query 1632 CATAGATGAGCTGAAAAAGACAGGAAA-ATTAGCATTGGATCATGCAGATGAACGAGCAC 1690
|||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 1596 CATAGATGAGCTAAAAAAGACAGGAAAGAT-AGCATTGGATCATGCAGCGGAACGGGCAC 1654
Query 1691 TGGGGCTTCACTTGCTTCGATTTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCTTGTACCA-ACTTATTA 1749
||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| | || |||
Sbjct 1655 TGGGGCTTCACCTGCTTCAATTTGCTGAGACGGTTGAGGAAGCGTGCACCACA-TTGTTA 1713
Query 1750 CCGAGTGTTCTGTGCGAGTACCTCTACAATTTATCTGAACACTTTACCAGATTCTACTCC 1809
|||| || |||||| ||||||| ||| | ||||| ||| | || |||| ||||||||||
Sbjct 1714 CCGAACGTGCTGTGCAAGTACCTTTACTACTTATCCGAAGAGTTCACCAAATTCTACTCC 1773
Query 1810 AATTGTCAGGTCAATGGTTCACCAGAGGAGACAAGCCGTCTCCTACTTTGTGAAGCAACG 1869
||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 1774 AATTGTCAGGTGAATGGTTCAGCAGAGGAGACAAGCCGTCTCTTACTTTGCGAAGCAACA 1833
Query 1870 GCCATAGTCATGCGGAAATGCTTCCACCTTCTTGGAATCACTCCGGTTTACAAGATTTGA 1929
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||
Sbjct 1834 GCTATAGTCATGCGGAAATGCTTCTACCTTCTTGGAATCACCCCTGTTTACAAGCTTTGA 1893
Query 1930 TCACATCACAA-GTAAACGACC 1950
|| ||||| || | |||| |||
Sbjct 1894 TC-CATCATAATG-AAACTACC 1913
> Ahg904298 jgi|Araly1|904298|Al_scaffold_0003_1426
Length=1740
Score = 1685 bits (912), Expect = 0.0
Identities = 1292/1470 (88%), Gaps = 48/1470 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 484 AGTATTGAAAATATGCTCATCGAT-GGAGTTGACACATGGGCACCTACTCTTTCGGTTAA 542
||||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 295 AGTATTGAAAATATGCTTATCAATGGGA-TTGAGACATGGGCGCCTACTCTTTCAGTTAA 353
Query 543 GAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGCAAAAG-AAATGCATGTTGGTCATC 601
||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 354 GAGAGCTGTAGTTGATTTTTCCTCTCCAAATATTGC-AAAGAAAATGCATGTTGGTCATT 412
Query 602 TAAGATCAACTATCATTGGTGACACTC-TAGCTCGCATGCTCGAGTACTC-ACATGTTGA 659
|||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| | |||||||
Sbjct 413 TAAGATCAACTATCATCGGTGACAC-CATAGCTCGTATGCTCGAGTACTCTA-ATGTTGA 470
Query 660 AGTTCTACGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACAGTTTGGCATGCTAATTGAGTA 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 471 AGTTCTACGCAGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACAGTTTGGCATGTTAATTGAGTA 530
Query 720 CCTCTTTGAGAAATTTCCTGATACAGATAGTGTGACCGAGACAGCAATTGGAGATCTTCA 779
|||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||| |||| ||||
Sbjct 531 CCTCTTTGAGAAATTTCCTGATTCAAATAGTGCGATGGAGACAGCAATTGAAGATATTCA 590
Query 780 GGT-GTTTTACAAGGCATC-AAAACATAAATTTGAT-CTGGA-CGAGGCCTTTAAG-GAA 834
|| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||| | || | | ||||||| | |
Sbjct 591 -GTCGTTATACAAGCCATCAAAAAC-GAAATTTGATGC-AGATTTA-GACTTTAAGCG-A 645
Query 835 AAAGCACAACAGGCTGTGGTCCGTCTACAGGGTGGTGATCCTGTTTACCGTAAGGCTTGG 894
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| |
Sbjct 646 AAGGCACAACAGGCCGTGGTCCGTCTACAGGGTGGAGATCCTGTATACCACAAGACTT-G 704
Query 895 GCTAAGA-TCTGTGACATCAGCCGAACTGAGTT-TGCCAAGGTTTACCAACGCCTTCGAG 952
|| || | | ||||| ||||||||| | || || |||| || |||| |||||||||||||
Sbjct 705 GCAAAAACTTTGTGAAATCAGCCGAGCCGA-TTATGCCGAGATTTATCAACGCCTTCGAG 763
Query 953 TTGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAACCCTCATATTGCTAA-AGTAATTGAG 1011
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||||||
Sbjct 764 TTGAGCTTGAAGAAAAGGGAGAAAGCTTTTACAAACCTTATATTGCTAACA-TGATTGAG 822
Query 1012 GAATTGAATAGCAAGGGGTTGGTTGAAGAAAGTGAAGGTGCTCGTGTGATTTTCCTTGAA 1071
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||
Sbjct 823 GAATTGAATAGCAAGGGTTTGGTTGAAGAAAGTGATGGTGCTCGTGTGATGTTCATCAAA 882
Query 1072 GGCTTC--GACATCCCACT-CATGGTTGTAAAGAGTGATGGTGGTTTTAACTATGCCTCA 1128
| |||| || || ||| | |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||
Sbjct 883 GACTTCAAGA-AT-CCA-TGCATGCTTGTTAAGAGTGATGGTGGTTTTACCTATGACACA 939
Query 1129 ACAGATC-TGACTGCTCTTTGGTACCGGCTCAATGAAGAGAAAGCTGAGTGGATCATATA 1187
||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 940 ACAGATCTTG-CTGCTCTTTGGTATCGGCTTAATGAAGAGAAAGCTGAGTGGATTATTTA 998
Query 1188 TGTGACCGATGTTGGCCAGCAGCAGCACTTTAATATGTTCTTCAAAGCTGCCAGAAAAGC 1247
|||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 999 TGTGACAGATGCTGGCCAGCAGGAGCACTTTGATAGGTTCTTCAAAGCTGCTAGACAAGT 1058
Query 1248 AGGTTGGCTTCCAGACAATGATAAAACTTACCCTAGAGTTAACCATGTT-GGTTTTGGTC 1306
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||
Sbjct 1059 AGGTTGGCTTCCAGACAATGATGAAACTTACCCTAGAGTTAGCCATGTTAAG-TTTGGTG 1117
Query 1307 TCGTCCTTGGGGAAGATGGCAAGCGATTTAGAACTCGGGCA-ACAGATGTAGTCCGC-CT 1364
| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| | | | ||| |||||| | ||
Sbjct 1118 TAGTCAAGGGGGAAGATGGCAAGCGGTTTAGAAATCGCG-ATAGAGAAATAGTCC-CTCT 1175
Query 1365 AGTTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGACTCGCAGTAAA-CTTGCCCTTATTGAGCGCGGTA 1423
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||
Sbjct 1176 AGCTGATTTGCTAGATGAGGCCAAGACTCGCAGTAAAGC-TGCCCTTATTGAGCGTGCTA 1234
Query 1424 AGGACAAAGAATGGACACCGGAAGAACTGGACCAAACAGCTGAGGCAGTTGGATATGGTG 1483
|||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1235 AGGAAAAAGAATGGACACCCGAGGAGCTGGACCAAACAGCTGAGGCAATTGGATATGGTG 1294
Query 1484 CGGTCAAGTATGCTGACCTGAAGAACAACAGAT-TAACAAATTATACTTTCAGCTTTGAT 1542
|||| |||||||||||| ||| |||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||
Sbjct 1295 CGGTGAAGTATGCTGACTTGATGAACAACATATCT-ACAGATTATAAGTTCAGCTACGAT 1353
Query 1543 CAAATGCTTAATGACAAGGGAAATACAGCCGTTTACCTTCTTTACGCCCATGCTCGGATC 1602
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1354 AAAATGCTTAATGACAAGGGAAATACAGCTGTGTACCTTCTTTACGCTCATGCTCGGATC 1413
Query 1603 TGTTCAATCATC-AGAAAGTCTGGCAAAGACATAGATGAGCTGAAAAAGACAGGAAAATT 1661
|| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||
Sbjct 1414 TGCTCAATCATCAAG-AAGTCTGGCAAAGACATAGATGAGCTTAAAAAAACTGGAAAGTT 1472
Query 1662 AGCATTGGATCATGC-AGATGAACGAGCACTGGGGCTTCACTTGCTTCGATTTGCTGAGA 1720
||||||||| ||||| | ||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 1473 AGCATTGGACCATGCTA-ATGAAAGAGCACTTGGACTTCATTTGCTTCAATTTGCTGAGA 1531
Query 1721 CGGTGGAGGAAGCTTGTACCAACTTATTACCG-AGTGTTCTGTGCGAGTACCTCTACAAT 1779
|||| |||||||| || ||||| || |||||| | | |||||||||||||||||| ||
Sbjct 1532 CGGTTGAGGAAGCATGCACCAAATTGTTACCGCA-CATACTGTGCGAGTACCTCTACGAT 1590
Query 1780 TTATCTGAACACTTTACCAGATTCTACTCCAATTGTCAGGTCAATGGTTCACCAGAGGAG 1839
||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1591 TTATCTGAACACTATACGAAATTCTACTCCAATTGTCAGGTCAATGGTTCAGCAGAGGAG 1650
Query 1840 ACAAGCCGTCTCCTACTTTGTGAAGCAACGGCCATAGTCATGCGGAAATGCTTCCACCTT 1899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1651 ACAAGCCGTCTCCTACTTTGTGAAGCAACGGCCATAGTCATGCGGAAATGCTTCCACCTT 1710
Query 1900 CTTGGAATCACTCCGGTTTACAAGATTTGA 1929
|||||||||||||| ||||||| ||| |||
Sbjct 1711 CTTGGAATCACTCCTGTTTACATGATATGA 1740
> Ahg349990 jgi|Araly1|349990|fgenesh1_pg.C_scaffold_6000583
Length=1254
Score = 577 bits (312), Expect = 1e-163
Identities = 430/486 (88%), Gaps = 12/486 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1450 CTGGACCAAACAGCTGAGGCAGTTGGATATGGTGCGGTCAAGTATGCTGACCTGAAGAAC 1509
||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||
Sbjct 775 CTGGACCTAACAGCTGAGGCAATTGGATACAGTGTGGTGAAGTTTGCTGACCTGAAGAAC 834
Query 1510 AACAGATTAACAAATTATACTTTCAGCTTTGATCAAATGCTTAATGACAAGGGAAATACA 1569
|||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 835 AACAGATTGTCAAGTTATACTTTCAGCTATGATCAAATGCTTTGTGACAAGGGAAAAACA 894
Query 1570 GCCGTTTACCTTCTTTACGCCCATGCTCGGATCTGTTCAATCATCAGAAAGTCTGGCAAA 1629
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 GCCGTTTACCTTCATTACGCCCATGCTCGGATCTGCTCAATCATCAGAAAGTCTGGCAAA 954
Query 1630 GACATAGATGAGCTGAAAAAGACAGGAAAATTAGCATTGGATCATGCAGATGAACGAGCA 1689
||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 955 GACATAGATGAGCTGAAAAAGGCAGGAAAGCTAGCATTGGATCATGCAGACGAACGGGCA 1014
Query 1690 CTGGGGCTTCACTTGCTTCGATTTGCTGAGACGGTGGAGGAAGCTTGTACCAA-CTTATT 1748
|||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||
Sbjct 1015 CTGGGGCTTCACCTGCTTCAATTTGCCGAGACGGTTGAGGAAGCGTGCACCAAACTG-TT 1073
Query 1749 ACCG-A-GTGTTCTGTGCGAGTACCTCTACAATTTATCTGAACACTT-TACCAGATTCTA 1805
|||| | ||| | || ||||||||||||| ||||| ||||| | | ||| ||||||
Sbjct 1074 ACCGCACGTGGTATG--CGAGTACCTCTACGGCTTATCCGAACAGTGCT-CCAAATTCTA 1130
Query 1806 CTC-CAATTGTCAGGTCAATGGTTCACCAGAGGAGACAAGCCGTCTCCTACTTTGTGAAG 1864
| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1131 C-CACAATTGTCAGGTCATTGGTTCAGCAGAGGAGACAAGCCGTCTCCTACTTTGTGAAG 1189
Query 1865 CAAC-GGCCATAGTCATGCGGAAATGCTTCCACCTTCTTGGAATCACTCCGGTTTACAAG 1923
|||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||
Sbjct 1190 CAACTGGC-ATAGTCATGCGGAAATGCTTCCACCTACTTGGAATCACCCCTGTTTATAAG 1248
Query 1924 ATTTGA 1929
|||||
Sbjct 1249 CTTTGA 1254
> Ahg935985 jgi|Araly1|935985|scaffold_500176.1
Length=1207
Score = 569 bits (308), Expect = 2e-161
Identities = 390/427 (91%), Gaps = 15/427 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 552 AGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGCAAAAGAAATGCATGTTGGTCATC-TAAGATCAA 610
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 418 AGTTGATTTTTCCTCTCCCAACATTGCAAAATAAATACATGTTGGTCATCTTAAGATCAA 477
Query 611 CTATCATTGGTGACACT-CTAGCTCGCATGCTCGAGTACTCACATGTTGAAGTTCTACGC 669
||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 478 CTATCATCGGTGACA-TGCTAGCTCGCATGCTCGAGTACTCAAAGGTTGAAGTTCTACGC 536
Query 670 AGAAACCATGTTGGTGACTGGGGAACACAGTTTGGCATGCTAATTGAGTACCTCTTTGAG 729
||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 537 AGAAACCATGTTGATGATTGGGGAACAAAGTTTGGCATGCTAATTGAGTACCTCTTTGAG 596
Query 730 AAATTTCCTGATACAGATAGTGTGACCGAGACAGCAATTGGAGATCTTCA--GGTGTTTT 787
||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | | | | || | ||||||||
Sbjct 597 AAATTTCCTGATACAGATAGTGTGATCGAGACAG-A-T-GTCGTTTTTGATAGGTGTTTT 653
Query 788 ACAAGGCATCAAAACAT-AAATTTGATCTGGACGAGGCCTTTAAGGAAAAAGCACAACAG 846
|||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 654 ACAAGGCATCAAAAAAAGAAATTTGATCTGGATGAGGACTTTAAGGAAAGAGCACAACAA 713
Query 847 GCTGTGGTCCGTCTACAGG-G-----TGGTGATCCTGTTTACCGTAAGGCTTGGGCTAAG 900
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 714 GCTGTGGTCCGTCTACAGGCGCAGGGTGGTGATCCTGTTTACCGTAAGGCTTGGGCTAAG 773
Query 901 ATCTGTGACATCAGCCGAACTGAGTTTGCCAAGGTTTACCAACGCCTTCGAGTTGAGCTT 960
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 774 ATCTGTGAAATCAGCCGAACTGAGTTTGCCAAGGTTTATCAACGCCTTCGAGTTGAGCTT 833
Query 961 GAAGAAA 967
|||||||
Sbjct 834 GAAGAAA 840
Score = 505 bits (273), Expect = 7e-142
Identities = 304/319 (95%), Gaps = 2/319 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 166 AATGAAGAATTTACGGGAAATCTGAAACGTCAACTCGCGAAGCTCTTTGATGTTTCTCTA 225
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| | ||||
Sbjct 102 AATGAAGAATTTACGGGAAATCTAAAACGCCAACTCGCGAAGCTCTTGGTTGTGTGTCTA 161
Query 226 AAATTAACGGTTCCTGATGAACCTAGTGTTGAGCCCTTGGTGGCTGCCTCCGCT-CTTGG 284
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 162 AAATTAACGGTTCCTGATGAACCTAGTTTTGAGCCCTTGGTGGCTGCCTCCGCTGC-TGG 220
Query 285 AAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAACGCAATGGGACTATGGTCCATAATTAAAGGAAA 344
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 AAAATTTGGAGATTACCAATGTAACAATGCAATGGGACTATGGTCCATAATTAAAGGAAA 280
Query 345 GGGTACTCAGTTCAAGGGTCCTCCAGCTGTTGGACAGGCCCTTGTTAAGAGTCTCCCTAC 404
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281 GGGTACTCAGTTCAAGGGTCCTCCAGCTGTTGGACTGGCCCTTGTTAAGAGTCTCCCTAC 340
Query 405 TTCTGAGATGGTAGAATCATGCTCTGTAGCTGGACCTGGCTTTATTAATGTTGTACTATC 464
|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 341 TTCTGAGATGGTGGAATCATGCTCTGTAGCTAGACCTGGCTATATTAATGTCGTACTATC 400
Query 465 AGCTAAGTGGATGGCTAAG 483
|||||||||||||||||||
Sbjct 401 AGCTAAGTGGATGGCTAAG 419
Score = 448 bits (242), Expect = 1e-124
Identities = 306/335 (91%), Gaps = 11/335 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1148 GGTACCGGCTCAATGAAGAGAAAGCTGAGTGGATCATATATGTGACCGATGTTGGCCAGC 1207
||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||
Sbjct 841 GGTACTGGCTCGATGAAGAGAAAGCTCAGTGGATGATATATAACACCGCTGCTGGCCAGG 900
Query 1208 AGCAGCACTTTAA-TATGTTCTTCAAAGCTGCCAGAAAAGCAGGTTGGCTTCCAGACAAT 1266
|||||||| |||| || ||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 901 AGCAGCAC-TTAAGTACGTTCTTC--A------A-AAAAGAAGGTTGGCTTCCAGGCAAT 950
Query 1267 GATAAAACTTACCCTAGAGTTAACCATGTTGGTTTTGGTCTCGTCCTTGGGGAAGATGGC 1326
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 GAGAAAACTTACCCTAGAGTTAACCATGTTGGTTTTGGTCTCGTCCTTGGGGAAGATGGC 1010
Query 1327 AAGCGATTTAGAACTCGGGCAACAGATGTAGTCCGCCTAGTTGATTTGCTAGATGAGGCC 1386
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1011 AAGCGATTTAGAACTCGGGCAACAGATGTAGTCCGCCTAGTTGATTTGGTAGATGAGGCC 1070
Query 1387 AAGACTCGCAGTAAACTTGCCCTTATTGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGACACCGGAA 1446
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1071 AAGACTCGCAGTAAACTTGCCCTTATTGAGCGCGGTAAGGACAAAGAATGGACACCAGAG 1130
Query 1447 GAACTGGACCAAACAGCTGAGGCAGTTGGATATGG 1481
||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1131 GAACTGGACCAAACAACTGAGGCAGTTGGATATGG 1165
> Ahg945445 jgi|Araly1|945445|scaffold_701674.1
Length=498
Score = 418 bits (226), Expect = 9e-116
Identities = 252/264 (95%), Gaps = 4/264 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 2091 CCAGAAGGTTGTTTTGTCATGTCATTGAACTGATTTGGGTGAATCATGAAATGG-TTTAA 2149
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 498 CCAGAAGGTTGTTTTGTCATGTCATTGAACTGATTTTGGTGAATCATGAAATGGTTTTAA 439
Query 2150 AGGTTAATCTTGAATTTGAATGTTTTGAGGATGTTCTCGTGGCTTTCATGGAGATTGTTG 2209
| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 438 A-GTTAATCTTGAATTGGAATGACTTGAGGATGTTCTTGTGGCTTTCATGGAGATTGTGG 380
Query 2210 CCTTTGGTCCATAGAAATAATCCCTTTTGCAGCATGACTTCGTTCTTGATCCTCTCTTCA 2269
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379 CCTTTGGTCCATATAAATAATCCCTTTTGCAGCATGACTTCGTTCTTGATCCTCTCTTCA 320
Query 2270 CAAGATCCTGTA-GACTTGTGACATTTGCTAGAGATGTGAATGATTGAGATTTGCCTTTA 2328
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 319 CAAGATCCTGTAAG-CTTGTGACATTTGCTAGAGATGTGAATGACTGAGATTTGCCTTTA 261
Query 2329 TAATACTTTGAAAGTCCTCCTTTC 2352
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 260 TAATACTTTGAAAGTCCTCCTTTC 237
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 88597909870
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5