BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G28470.1 Length=3071 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg945184 jgi|Araly1|945184|scaffold_701413.1 4588 0.0 Ahg480888 jgi|Araly1|480888|fgenesh2_kg.3__3589__AT2G20580.1 3027 0.0 > Ahg945184 jgi|Araly1|945184|scaffold_701413.1 Length=2913 Score = 4588 bits (2484), Expect = 0.0 Identities = 2780/2921 (95%), Gaps = 27/2921 (1%) Strand=Plus/Plus Query 169 AGGTGATAGTCTGACTTACAATGGCTCCAGTTCCGGATCCGAACAGTGTTGGCGGTGGTG 228 ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 AGGTGCTAGTCTGACTAACAATGGCTCCAGTTCCGGATCCGAACAGTGTTGGCGGTGGTG 60 Query 229 CGAAGCGGGACGAAGCTACGACGAAGATTCCTTCTAAGGATTCCAAGAAGAAAGATGATA 288 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| Sbjct 61 CGAAGCGGGACGAAGCTACGACGAAGGTTCCTTCTAAAGATTCCAAGAAGAAGGATGATA 120 Query 289 AAAAGGAAGAGGATCTGTCTGAAGAGGACTTGCAACTAAAGCAGAATCTGGAGCTCTATG 348 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 121 AGAAGGAAGAGGATCTGTCTGAAGAGGACTTGCAACTAAAGCAGAACCTGGAGCTCTATG 180 Query 349 TTGAGAGAGTTCAGGACCCCAATCCTGAGTTACAGAAGATTGCTCTTGAAAGCATGAGGA 408 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 181 TTGAGAGAGTTCAGGACCCCAATCCTGAGTTACAGAAGGCTGCTCTTGAAAGCATGAGGC 240 Query 409 AGGAAATTCGTGACTCAACAAGCTCCATGACATCAGTTCCAAAACCCCTCAAGTTTCTCC 468 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 AGGAAATTCGAGACTCAACAAGCTCCATGACATCAGTTCCAAAACCCCTCAAGTTTCTCC 300 Query 469 GCCCTCATTATGGAGTTCTTAAAGAATTTCATGCAAAAATGGCAGAGTCTGATCTCaaaa 528 | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 301 GTCCTCATTATGGAGTTCTTAAGGAATTTCATGTAAAAATGGCGGAGTCTGATCTCAAAA 360 Query 529 aaaTGTTGGCTGATATACTTTCTGTCCTGGCACTGACCATGTCTGCTGAAGGTGAAAGGG 588 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 AAATGTTGGCTGATATACTTTCTGTCCTGGCACTGACCATGTCTGCTGAAGGTGAAAGGG 420 Query 589 AAAGCTTAAACTATAGGTTGAATGGATCAGAGAGTGACATCGGATCGTGGGGTCACGAGT 648 ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 421 AAAGCTTAAACTATAGGTTGACTGGATCAGAGGGTGACATCGGATCGTGGGGTCACGAGT 480 Query 649 ATGTCAGGAATTTGGCTGGAGAGATTGCAAAAGAGTATACAATACGTCAGGGTGAAGAGT 708 |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 481 ATGTCAGGAATTTGGCCGGAGAGATTGCAGAAGAGTATACAATGCGTCAGGGTGAAGAGT 540 Query 709 CCTCTATTGAAGACTTAATGGATCTTGTGCAGCAAATTGTTTCTTTTCACATGAAGCATA 768 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CCTCTATTGAAGACTTAATGGATCTTGTGCAGCAAATTGTTTCTTTTCACATGAAGCATA 600 Query 769 ATGCCGAAACCGAAGCTGTTGACCTTTTAATGGATGTTGAGGATCTTGATCTCTTACTTG 828 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 ATGCCGAAACCGAAGCTGTTGACCTTTTAATGGATGTTGAGGATCTTGATCTCTTACTTG 660 Query 829 AGCATGTTGACAATACAAATTTCAGGAGGACGTGCAACTATCTCACGAGTGCAGCAAAGT 888 |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 AGCATGTTGACAGCACAAATTTCAGGAGGACATGCAACTATCTCACGAGTGCAGCAAAGT 720 Query 889 ATCTTCCAGGACCAGATGACATGTTGGTTCTAGATATTGCTTACATGATCTACATTAAGT 948 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 ATCTTCCAGGACCAGATGACATGTTGGTTCTAGATATTGCTTACATGATCTACATTAAGT 780 Query 949 TTGCAGAATATCCAAACGCGCTGCAAATTGCATTATTTCTTGATAACATGCAGTATGTGA 1008 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 781 TTGCAGAATATCCAAACGCGCTGCAAATTGCATTATTTCTTGACAACATGCAGTATGTGA 840 Query 1009 AGCAAGTATTTACCTCATGTACCGATCTGGTAAAAAAGAAACAGTTCTGCTACATGATTG 1068 ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 841 AGCAAGTTTTTACCTCATGTACCGATCTGCTAAAAAAGAAACAGTTCTGCTACATGATTG 900 Query 1069 CACGTCATGGTATGACCTTTGAGCTTGACCAAGAGATGGTTGCAAATGACGAAG-ACAAA 1127 ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| | Sbjct 901 CACGTCATGGTATCACCTTTGTGCTTGACCAGGAGATGGTTGCAAATGA-GCAGGACAGA 959 Query 1128 GAAGCGCTACAGGATATTGTTAACAACT-CTAAGTTGAGTGAAGGATATCTGACGCTTGC 1186 ||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 960 GAAGCCCTACAGGATATTGTTAACAA-TACTAAGCTGAGTGAAGGATATCTGACACTTGC 1018 Query 1187 TAGGGATATTGAGGTCATGGAGGCCAAGACGCCTGAAGACATCTACAAGGCTCACTTGCT 1246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1019 TAGGGATATTGAGGTCATGGAGGCCAAGACGCCTGAAGACATCTACAAGGCTCACTTGCT 1078 Query 1247 TGATGGTAGGGCTAGCTCTGGTCCAAGTGTGGACTCAGCTAGGCAAAATCTATCTGCGAC 1306 |||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| Sbjct 1079 TGATGGCAGGGTTAGCTCTGGTGCAAGTGTGGATTCAGCTAGACAAAATCTGTCTGCGAC 1138 Query 1307 TTTTGTGAATGCATTTGTAAATGCTGGATTCGGCCAGGACAAATTAATGACAGTACCATC 1366 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1139 TTTTGTGAATGCATTTGTAAATGCTGGATTCGGCCAGGACAAATTAATGACAGTGCCATC 1198 Query 1367 TGACTCAACCAGTGGATCGGCTGGAAACTGGCTCTTCAAAAATAAAGAACATGGAAAGAC 1426 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1199 TGACTCAACCAGTGGATCAGCTGGAAACTGGCTCTTCAAAAATAAAGAACATGGCAAGAC 1258 Query 1427 CAGTGCAGTTGCTAGTCTGGGTATGATTCAATTGTGGGATGTGGAGACCGGACTAGGTCA 1486 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||| Sbjct 1259 CAGTGCAGCTGCTAGTCTGGGTATGATTCAATTGTGGGATGTGAACACTGGACTAGCTCA 1318 Query 1487 TCTCGACAAATATTTCCATAGTAACGATAATCCCGTCGTTGCTGGAGCTCTGCTGGGAGT 1546 |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1319 ACTCGACAAATATTTCCATAGTAGTGATAATCCCGTCATTGCTGGAGCTCTGCTGGGAGT 1378 Query 1547 TGGGATTGTTAATTGTGGCATTAAGAATGATTGTGACCCTGCATTTGCCCTTCTTTCAGG 1606 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||| Sbjct 1379 TGGGATTGTTAATTGTGGCATTAAGGATGATTGTGAACCTGCATTCGCCCTTCTCGCAGA 1438 Query 1607 TTATATTGACAATGAGGATTCATCTGTCCGAATTGGTGCTATTATGGGTCTCGGGATTGC 1666 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1439 CTATATTGACAATGAGGATTCATCTGTCCGAATTGGTGCTATTATGGGTCTCGGGATTGC 1498 Query 1667 ATATGCGGGTTCCCAAAATGATCAGATAAAAATCAGGTTGTCTCCAATACTAAATGATGC 1726 |||||||||||||||||| |||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1499 ATATGCGGGTTCCCAAAAAGATCAGATAAGAAGCCGTTTGTCTCCAATACTAAATGATGC 1558 Query 1727 CAACGCACCTCTCGATGTGATTGCATTTGCTGCACTTAGTTTGGGGATGATTTATGTTGG 1786 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1559 AAAAGCACCTCTCGATGTGATTGCATTTGCTGCACTTAGTTTGGGGATGATTTACGTTGG 1618 Query 1787 TTCGTGTAACGAAGAGGTTGCACAATCTATTATATTTGCTTTGATGGATCGGAGCGAGGC 1846 ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1619 TTCATGTAACGAAGAGGTTGCGCAATCTATTATATTTGCTTTGATGGATCGGAGCGAGGC 1678 Query 1847 AGAGCTGGGTGAAGCCCTCACTCGTTTCTTGCCTCTTGGACTTGGTCTTTTGTACCTTGG 1906 ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1679 AGAACTGGGTGAAGCCCTTACTCGATTCTTGCCTCTTGGACTTGGACTTTTGTACCTTGG 1738 Query 1907 CAAACAGGAAAGTGTGGAGGCTACTGCAGAAGTTTCAAAGACGTTCAATGAGAAAATCAG 1966 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1739 TAAACAGGAAAGTGTGGAGGCTACTGCGGAAGTTTCAAAGACGTTCAATGAGAAAATCAG 1798 Query 1967 AAAGTATTGTGATATGACACTTCTTTCATGTGCATATGCTGGAACCGGGAATGTCCTTAA 2026 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1799 AAAGTATTGTGATATGACACTTCTTTCATGTGCATATGCTGGAACCGGGAATGTCCTTAA 1858 Query 2027 GGTCCAAGACCTTCTGGCTCAGTGTGGAGAGCATCTGGTGAAAGGTGATATCCACCAGGG 2086 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1859 GGTCCAAGACCTTCTGGCTCAGTGTGGAGAGCATCTGGAGAAAGGTGATATCCACCAGGG 1918 Query 2087 TCCAGCTGTGATTGGATTAGCTATGGTTGCTATGTCTGAGGAATTGGGTCTGGATATGGA 2146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1919 TCCAGCTGTGATTGGATTAGCTATGGTTGCTATGTCTGAGGAATTGGGTCTGGATATGGA 1978 Query 2147 GATCCGTTCTTTGGAGCGCGTACTACAGTATGGAGAGCAGAACATTCGACGTGCAGTGCC 2206 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| Sbjct 1979 GATCCGTTCTTTGGAGCGCGTGCTACAGTATGGAGAACCGAACATTCGGCGTGCAGTGCC 2038 Query 2207 TTTGGCTCTTGGTCTCCTATGTATATCAAACCCAAAGGTGACTGTTATGGACACTTTGAG 2266 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2039 TTTGGCTCTTGGTCTCCTATGTATATCAAACCCAAAGGTGACTGTTATGGACACTTTGAG 2098 Query 2267 CAGACTAAGCCATGACACAGATTCAGAAGTTGCAATGGCAGCAATTATCTCCCTTGGATT 2326 ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2099 CAGGCTAAGCCATGACACAGATTCAGAAGTTGCCATGGCAGCTATTATCTCCCTTGGATT 2158 Query 2327 GATAGGCGCTGGAACCAACAATGCAAGGATAGCTGGCATGCTTAGAAATCTCTCCAGCTA 2386 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2159 GATAGGCGCTGGAACCAACAATGCAAGGATAGCTGGGATGCTTAGAAATCTCTCCAGCTA 2218 Query 2387 TTATTACAAGGATGCCAGCCTTCTTTTCTGTGTGCGCATCGCTCAAGGGTTTGTGCATAT 2446 ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| Sbjct 2219 TTATTACAAGGATGCCAACCTTCTCTTCTGTGTGCGAATTGCTCAAGGGTTTGTGCATAT 2278 Query 2447 GGGAAAGGGTCTCTTAACTCTCAATCCTTTCCACTCCGAACGGCTCTTGCTATCGCCAAC 2506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 2279 GGGAAAGGGTCTCTTAACTCTCAATCCTTTCCACTCCGAACGGCTCTTGCTATCACCAAC 2338 Query 2507 CGCACTTGCTGGTATAGTGACATTGTTGCATGCATGCCTTGACATGAAATCCATTATACT 2566 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2339 CGCACTTGCTGGTATAGTGACATTGTTGCATGCATGCCTTGACATGAGATCCATTATACT 2398 Query 2567 GGGGAAATATCACTATGTGCTCTACTTCCTTGTTTTGGCGATGCAGCCAAGGATGATGCT 2626 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2399 GGGGAAATACCACTATGTGCTCTACTTCCTTGTTTTGGCGATGCAGCCAAGGATGATGCT 2458 Query 2627 GACGGTGGATCAGAGCCTGAAGCCCATCTCGGTGCCAGTGCGGGTAGGACAAGCGGTTGA 2686 ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2459 GACAGTGGATGAGAACCTGAAGCCCATCTCGGTGCCAGTACGGGTAGGACAAGCGGTTGA 2518 Query 2687 TGTGGTTGGACAGGCAGGCCGACCTAAGACAATCACTGGGTTCCAAACGCACTCAACACC 2746 ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2519 TGTGGTTGGACAGGCTGGTCGACCAAAGACAATCACTGGGTTCCAAACGCACTCAACACC 2578 Query 2747 TGTTCTCCTTGCTGCTGGGGAGAGAGCTGAACTCGCAACCGAGAAGTACATTCCGTTGTC 2806 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2579 TGTTCTCCTTGCTGCTGGGGAGAGAGCCGAACTCGCAACCGAGAAGTACATTCCGTTGTC 2638 Query 2807 GCCCATATTAGAAGGTTTCGTCATATTGAAGGAAAATCCAGACTACAGAGAGGAGTAAAT 2866 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2639 GCCCATATTAGAAGGTTTCATCATATTGAAGGAAAATCCAGACTACAGAGAGGAGTAAAT 2698 Query 2867 CCAAAGTTGCAAGCATTTGAAGAAAGAGAGAGAGCCTTTGAATACTTTCACTACGGTT-- 2924 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2699 TCAAAGTTGCAAGCATTTGAAGAAAGAGATAGAGCCTTTGAATACTTTCACTATGGTTTT 2758 Query 2925 --GT-CAAA---AGT----TTTTT---AGTTT-ATTCCCGTCTGTTCCCAGGAAATGGTT 2970 || || | ||| ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| Sbjct 2759 ATGTGCACATTCAGTCAAATTTTTCTTAGTTTTACTCGAGTCTGTTCCCAGGAAATGGTT 2818 Query 2971 CACAA-TCTCTCCTTTTAAAAGAAAAAATAGCTTCATTGCAATATATAGGAACTTCTTGT 3029 ||||| ||||||||||| || |||||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 2819 CACAAATCTCTCCTTTTTAA-GAAAAAGTCGTTTCATTGCAATATGTAGGAGCTTCTTGT 2877 Query 3030 GCACTACTTTAATATCGCATTCTAAAAGCTGGATAAGTTTC 3070 ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2878 GCACTTC---AATATC--ATTCTAAAAGCTGGATAAGTTTC 2913 > Ahg480888 jgi|Araly1|480888|fgenesh2_kg.3__3589__AT2G20580.1 Length=3023 Score = 3027 bits (1639), Expect = 0.0 Identities = 2344/2689 (87%), Gaps = 30/2689 (1%) Strand=Plus/Plus Query 189 ATGGCTCCAGTTCCGGATCCGAACAGTGTTGGCGGTGGTGCGAAGCGGGACGAAGCTACG 248 ||||||||| ||||||||| |||||||| || || |||||||||| || |||||||| Sbjct 166 ATGGCTCCAACTCCGGATCCCAACAGTGTCGGAGGCGGTGCGAAGCAAGATGAAGCTACC 225 Query 249 ACGAAGATTCCTTCTAAGGATTCCAAGAAGAAAGATGATAAAAAGGAAGAGGATC-TGTC 307 |||| |||| ||||||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| | |||| Sbjct 226 TTGAAGGTTCCGTCTAAGGATCCCAAGAAGAAGGACGAGAAAAAAGATGAGGA-CTTGTC 284 Query 308 TGAAGAGGACTTGCAACTAAAGCAGAATCTGGAGCTCTATGTTGAGAGAGTTCAGGACCC 367 ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || Sbjct 285 TGAAGAGGACTTGGAACTAAAGCAGAACCTTGAGCTCTATGTTGAGAGGGTTCAGGATCC 344 Query 368 CAATCCTGAGTTACAGAAGATTGCTCTTGAAAGCATGAGGAAGGAAATTCGTGAC-TCAA 426 ||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || | | |||| Sbjct 345 TAATCCCGACTTGCAGAAGGCTGCTCTTGAAAGCATGAGGCAGGAAATCCGAG-CTTCAA 403 Query 427 CAAGCTCCATGACATCAGTTCCAAAACCCCTCAAGTTTCTCCG-CCCTCATTATGGAGTT 485 ||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| | Sbjct 404 CAAGCTCAATGACGTCAGTTCCCAAACCACTAAAGTTTCTCCGTCCC-CATTATGGAACT 462 Query 486 CTTAAAGAATTTCATGCAAA-AATGGCAGAGTCTGATCTCaaaaaaaT-GTTGGCTGATA 543 ||||||| ||||||| ||| |||||| || ||||||||| || || | || |||||| Sbjct 463 CTTAAAGCGTTTCATG-AAACAATGGCCGATTCTGATCTC-AAGAAGTACCTGTCTGATA 520 Query 544 TACTTTCTGTCCTGGCACTGACCATGTCTGCTGAAGGTGAAAGGGAAAGCTTAAACTATA 603 | || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || Sbjct 521 TCCTGTCTGTCCTGGCCCTTACCATGTCTGCGGAAGGTGAAAGGGAAAGCTTAAGTTTTA 580 Query 604 GGTTGAATGGATCAGAGAGTGACATCGGATCGTGGGGTCACGAGTATGTCAGGAATTTGG 663 |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 581 GGTTGATTGGAACAGAGGGTGACATTGGATCGTGGGGTCACGAGTATGTCAGGAATTTAG 640 Query 664 CTGGAGAGATTGCAAAAGAGTATACAATA-CGTCAGGGTGAAGAGTCCTCTATTGAAGAC 722 ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||||| || Sbjct 641 CTGGAGAGATTGCTCAAGAGTATACAA-AGCGTCAGAGTGAGGAGGCCTCTATTGACGAT 699 Query 723 TTAATGGATCTTGTGCAGCAAATTGTTTCTTTTCACATGAAGCATAATGCCGAAACCGAA 782 |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| Sbjct 700 TTAATGGAGCTTGTGCAGCAAATTGTCGCTTTTCATATGAAGCATAATGCAGAAACCGAA 759 Query 783 GCTGTTGACCTTTTAATGGATGTTGAGGATCTTGATCTCTTACTTGAGCATGTTGACAAT 842 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 760 GCTGTTGACCTTTTAATGGATGTTGAGGATCTTGATCTCTTACTTGAGCATGTAGACAAA 819 Query 843 ACAAATTTCAGGAGGACGTGCAACTATCTCACGAGTGCAGCAAAGTATCTTCCAGGACCA 902 |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||| Sbjct 820 ACAAATTTCAAGAGGACATGCAACTATCTCACAAGTGCAGCAAAGTACCTCCCTGGACCA 879 Query 903 GATGACATGTTGGTTCTAGATATTGCTTACATGATCTACATTAAGTTTGCAGAATATCCA 962 ||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| Sbjct 880 GATGACATGTTGGTTTTAGATATTTCCTACATGATTTACATGAAGTTTGAAGAATATCCA 939 Query 963 AACGCGCTGCAAATTGCATTATTTCTTGATAACATGCAGTATGTGAAGCAAGTATTTACC 1022 ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| Sbjct 940 AACGCTCTGCAGATTGCACTATTTCTTGATAACACGCAGTATGTTAAACAAGTATTTACC 999 Query 1023 TCATGTACCGATCTGGTAAAAAAGAAACAGTTCTGCTACATGATTGCACGTCATGGTATG 1082 |||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1000 TCATGTACGGATCTGCTGAAGAAGAAACAGTTCTGCTACATGATTGCTCGTCATGGTATA 1059 Query 1083 ACCTTTGAGCTTGACCAAGAGATGGTTGCAAATGACGAAGACAAAGAAGCGCTACAGGAT 1142 |||||||| |||||| | |||||||||||| |||| || ||| |||||| ||||||||| Sbjct 1060 ACCTTTGACCTTGACGATGAGATGGTTGCAGATGATGATGACCGAGAAGCCCTACAGGAT 1119 Query 1143 ATTGTTAACAACTCTAAGTTGAGTGAAGGATATCTGACGCTTGCTAGGGATATTGAGGTC 1202 |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| Sbjct 1120 ATTGTTAACAACACTAAGTTAAGTGAAGGATATCTGACTCTTGCAAGGGATATTGAGGTC 1179 Query 1203 ATGGAGGCCAAGACGCCTGAAGACATCTACAAGGCTCACTTGCTTGATGGTAGGGCTAGC 1262 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| Sbjct 1180 ATGGAGGCCAAAACGCCTGAAGACATCTACAAGGCTCACTTGCTCGACGGCAGGGCTAGC 1239 Query 1263 TCTGGTCCAAGTGTGGACTCAGCTAGGCAAAATCTATCTGCGACTTTTGTGAATGCATTT 1322 |||||| |||| | ||| || ||||| || ||| | |||| || ||||| ||||||||| Sbjct 1240 TCTGGTGCAAGCGCGGATTCTGCTAGACAGAATTTGGCTGCTACCTTTGTCAATGCATTT 1299 Query 1323 GTAAATGCTGGATTCGGCCAGGACAAATTAATGACAGTACCATCTGACTCAACCAGTGGA 1382 ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||| Sbjct 1300 GTAAATGCTGGTTTTGGTCAGGACAAACTAATGACAGTACCTTCAGACTCGACCACCGGA 1359 Query 1383 TCGGCTGGAAACTGGCTCTTCAAAAATAAAGAACATGGAAAGACCAGTGCAGTTGCTAGT 1442 || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| Sbjct 1360 TCTTCTGGAAATTGGCTCTTCAAAAATAAAGAACATGGCAAGACTAGTGCAGCTGCTAGT 1419 Query 1443 CTGGGTATGATTCAATTGTGGGATGTGGAGACCGGACTAGGTCATCTCGACAAATATTTC 1502 ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| Sbjct 1420 CTGGGTATGATTCAACTGTGGGATGTGGACTCAGGACTTTCTCAACTCGACAAATATTTC 1479 Query 1503 CATAGTAACGATAATCCCGTCGTTGCTGGAGCTCTGCTGGGAGTTGGGATTGTTAATTGT 1562 |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1480 CATAGTAATGATAATCCTATCATTGCTGGAGCACTGCTGGGAGTTGGGATTGTAAATTGT 1539 Query 1563 GGCATTAAGAATGATTGTGACCCTGCATTTGCCCTTCTTTCAGGTTATATTGACAATGAG 1622 ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| || ||||| ||||| ||| Sbjct 1540 GGCATTAAGAACGATTGTGATCCTGCATTGGCACTTCTTGGAGACTATATAGACAAAGAG 1599 Query 1623 GATTCATCTGTCCGAATTGGTGCTATTATGGGTCTCGGGA-TTGCATATGCGGGTTCCCA 1681 |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||| || |||||||| Sbjct 1600 GATTCATCTGTCAGAATTGGTGCTATCATGGGTCT-GGGAATTTCATACGCAGGTTCCCA 1658 Query 1682 AAATGATCAGATAAAAATCAGGTTGTCTCCAATACTAAATGATGCCAACGCACCTCTCGA 1741 |||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || || |||||||| Sbjct 1659 AAATGACCAGATTCGAAGCAAATTGTCCCCGATACTGAATGATGCGAAAGCGCCTCTCGA 1718 Query 1742 TGTGATTGCATTTGCTGCACTTAGTTTGGGGATGATTTATGTTGGTTCGTGTAACGAAGA 1801 ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1719 TGTTATTGCATTTGCTTCACTTTCTTTGGGAATGATATATGTTGGTTCCTGTAACGAAGA 1778 Query 1802 GGTTGCACAATCTATTATATTTGCTTTGATGGATCGGAGCGAGGCAGAGCTGGGTGAAGC 1861 || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || Sbjct 1779 AGTAGCACAATCTATTATATTTGCTTTGATGGATCGAAGTGAGGCAGAACTGGGAGATGC 1838 Query 1862 CCTCACTCGTTTCTTGCCTCTTGGACTTGGTCTTTTGTACCTTGGCAAACAGGAAAGTGT 1921 ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1839 CCTCACTCGATTCTTGCCACTTGGTCTTGGACTTCTATACCTGGGCAAACAGGAAAGTGT 1898 Query 1922 GGAGGCTACTGCAGAAGTTTCAAAGACGTTCAATGAGAAAATCAGAAAGTATTGTGATAT 1981 |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct 1899 AGAGGCTACAGCTGAAGTTTCAAAGACGTTCAATGAGAAGATTAGAAAGTATTGTGATAT 1958 Query 1982 GACACTTCTTTCATGTGCATATGCTGGAACCGGGAATGTCCTTAAGGTCCAAGACCTTCT 2041 |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1959 GACACTTCTTTCTTGTGCTTATGCTGGAACTGGGAATGTCCTAAAGGTCCAAGACCTTCT 2018 Query 2042 GGCTCAGTGTGGAGAGCATCTGGTGAAAGGTGATATCCACCAGGGTCCAGCTGTGATTGG 2101 ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2019 TGCTCAGTGTGGCGAGCATCTTGAGAAAGGTGACATCCACCAGGGTCCAGCTGTGCTTGG 2078 Query 2102 ATTAGCTATGGTTGCTATGTCTGAGGAATTGGGTC-TGGATATGGAGATCCGTTCTTTGG 2160 ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | | ||||||||||| |||||||||| Sbjct 2079 GTTAGCAATGGTTGCTATGTCTGAAGAACTGGG-CGTTGATATGGAGATTCGTTCTTTGG 2137 Query 2161 AGCGCG-TACTACAGTATGGAGAGCAGAACATTCGACGTGCAGTGCCTTTGGCTCTTGGT 2219 |||| | | ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||| Sbjct 2138 AGCG-GATGCTACAATATGGAGAACAAAACATTCGGCGTGCTGTACCTTTGGCCCTTGGT 2196 Query 2220 CTCCTATGTATATCAAACCCAAAGGTGACTGTTATGGACACTTTGAGCAGACTAAGCCAT 2279 ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||| Sbjct 2197 CTCCTTTGTATATCCAATCCAAAGGTGACTGTAATGGACACCTTGAGCCGACTTAGCCAT 2256 Query 2280 GACACAGATTCAGAAGTTGCAATGGCAGCAATTATCTCCCTTGG-ATTGATAGGCGCTGG 2338 ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| | |||| |||||||| Sbjct 2257 GACACAGATTCGGAAGTTGCCATGGCAGCAATTATATCA-TTGGGACTGATTGGCGCTGG 2315 Query 2339 AACCAACAATGCAAGGATAGCTGGCATGCTTAGAAATCTCTCCAGCTATTATTACAAGGA 2398 ||| || || |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 2316 AACTAATAACGCAAGGATAGCTGGGATGCTTCGGAACCTCTCCAGCTATTATTACAAGGA 2375 Query 2399 TGCCAGCCTTCTTTTCTGTGTGCGCATCGCTCAAGGGTTTGTGCATATGGGAAAGGGTCT 2458 |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||||| Sbjct 2376 CGCCAATCTTCTCTTCTGTGTGCGTATTGCTCAAGGGCTGGTGCACATGGGAAAGGGTCT 2435 Query 2459 CTTAACTCTCAATCCTTTCCACTCCGAACGGCTCTTGCTATCGCCAACCGCACTTGCTGG 2518 |||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2436 CTTAACACTCAGCCCCTTCCACTCTGAACGGTTCTTGCTATCGCCAACCGCACTTGCTGG 2495 Query 2519 TATAGTGACA-TTGTTGCATGCATGCCTTGACATGAAATCCATT-ATACTGGGGAAATAT 2576 |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| || Sbjct 2496 TATAGTGACACTT-TTGCATGCATGCCTTGACATGAAA-CCAATCATACTCGGGAAGTAC 2553 Query 2577 CACTATGTGCTCTACTTCCTTGTTTTGGCGATGCAGCCAAGGATGATGCTGACGGTGGAT 2636 || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| Sbjct 2554 CATTATGTGCTGTACTTCCTCGTTTTGGCGATGCAACCAAGGATGATGTTGACAGTGGA- 2612 Query 2637 C-AGAGCCTGAAGCCCATC-TCGGTGCCAGTGCGGGTAGGACAAGCGGTTGATGTGGTTG 2694 | | | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2613 CGAAAACCTGAAGCC-ATTGTCAGTGCCAGTGCGGGTAGGACAAGCAGTTGATGTGGTTG 2671 Query 2695 GACAGGCAGGCCGACCTAAGACAATCACTGGGTTCCAAACGCACTCAACACCTGTTCTCC 2754 |||| || || || || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||||||| Sbjct 2672 GACAAGCGGGTCGGCCCAAGACCATAACCGGTTTCCAGACACACTCCACACCTGTTCTCC 2731 Query 2755 TTGCTGCTGGGGAGAGAGCTGAACTCGCAACCGAGAAGTACATTCCGT-TGTCGCCCATA 2813 | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| | ||||||| ||| Sbjct 2732 TGGCTGCTGGAGAGAGAGCCGAACTAGCCACCGACAAATACATTCC-TCTGTCGCCGATA 2790 Query 2814 TTAGAAGGTTTCGTCATATTGAAGGAAAATCCAGACTACAGAGAGGAGT 2862 | ||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2791 CTGGAAGGATTCATCATCTTAAAGGAGAATCCAGACTACAGAGAGGAGT 2839 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 115984796025 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5