BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G29380.1 Length=4652 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg491819 jgi|Araly1|491819|fgenesh2_kg.7__1252__AT4G29380.1 7795 0.0 > Ahg491819 jgi|Araly1|491819|fgenesh2_kg.7__1252__AT4G29380.1 Length=4611 Score = 7795 bits (4221), Expect = 0.0 Identities = 4501/4634 (97%), Gaps = 27/4634 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGGAAACAAAATCGCTCGTACGACACAAGTCTCGGCGACGGAGTACTATCTCCACGAC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGGAAACAAAATCGCTCGTACGACACAAGTCTCGGCGACGGAGTACTATCTCCACGAC 60 Query 61 TTGCCGTCTTCATACAATCTGGTCTTAAAAGAGGTTTTAGGTCGAGGAAGATTCCTAAAG 120 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 61 TTGCCGTCTTCTTACAATCTGGTCTTAAAAGAGGTTTTAGGTCGAGGAAGATTCTTAAAG 120 Query 121 TCGATTCAATGTAAGCACGATGAAGGATTGGTTGTTGTTAAGGTTTACTTCAAGCGTGGT 180 ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 121 TCGATCCAATGTAAGCACGACGAAGGATTGGTCGTTGTTAAGGTTTACTTCAAGCGTGGT 180 Query 181 GACTCGATCGATCTCAGAGAGTATGAGCGTCGTCTCGTTAAGATCAAAGATGTGTTTTTG 240 ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct 181 GACTCGATCGATCTCAGAGAGCACGAGCGTCGTCTCGTGAAGATCAAGGATGTGTTTTTG 240 Query 241 TCTCTAGAACATCCTCACGTTTGGCCTTTTCAGTTTTGGCAAGAGACTGATAAAGCAGCG 300 ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 241 TCTCTTGAACATCCTCACGTTTGGCCTTTCCAGTTTTGGCAAGAGACTGATAAAGCAGCA 300 Query 301 TATCTAGTGAGGCAATACTTTTACAGTAATCTACATGATCGCTTGAGTACGAGGCCTTTC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| Sbjct 301 TATCTAGTGAGGCAATACTTTTACAGTAATCTGCATGATCGGTTGAGTACTCGGCCTTTC 360 Query 361 CTCAGTCTTGTAGAGAAGAAGTGGTTGGCGTTTCAGTTGCTTCTTGCTGTGAAGCAATGT 420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 361 CTCAGTCTTGTAGAGAAGAAGTGGTTGGCGTTTCAGTTGCTTCTTGCTGTGAAGCAATGC 420 Query 421 CATGAGAAGGATATATGTCATGGTGATATCAAGTGCGAGAACGTATTGTTGACTTCCTGG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 421 CATGAGAAGGATATATGTCATGGTGATATCAAGTGCGAGAACGTATTGCTGACTTCCTGG 480 Query 481 AACTGGCTTTACCTTGCTGATTTTGCATCCTTCAAACCTACATACATTCCTTATGATGAT 540 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 481 AACTGGCTGTACCTTGCTGATTTTGCATCCTTCAAACCCACATACATTCCTTATGATGAT 540 Query 541 CCTTCAGACTTCTCGTTCTTCTTTGACACAAGGGGACAAAGACTTTGTTATCTGGCTCCA 600 ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 541 CCTTCAGACTTTTCCTTCTTCTTTGACACAAGGGGACAAAGACTTTGTTATCTGGCTCCA 600 Query 601 GAGAGATTCTATGAGCATGGAGGTGAGACACAAGTAGCACAAGATGCTCCATTAAAGCCC 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 601 GAGAGATTCTATGAGCATGGAGGTGAGACACAAGTAGCACAAGATGCTCCATTAAAGCCC 660 Query 661 TCCATGGATATATTTGCTGTGGGGTGTGTGATAGCCGAACTTTTTCTTGAGGGTCAGCCA 720 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 661 TCCATGGATATATTTGCTGTGGGGTGTGTGATAGCAGAACTTTTTCTTGAGGGTCAGCCA 720 Query 721 CTATTTGAACTGGCGCAGCTTCTCGCTTATCGTAGAGGGCAACATGATCCTAGCCAACAC 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 721 CTATTTGAACTGGCGCAGCTTCTCGCTTATCGTAGAGGGCAACATGATCCTAGCCAACAC 780 Query 781 CTTGAAAAGATTCCTGATCCGGGAATTCGCAAGATGATTCTTCATATGATTCAGTTAGAA 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 781 CTTGAAAAGATTCCTGATCCGGGAATTCGCAAGATGATTCTTCATATGATTCAGTTAGAA 840 Query 841 CCCGAAGCACGCCTATCTGCTGAAGACTACCTGCAAAATTATGTGGGAGTTGTTTTCCCA 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 841 CCCGAAGCACGCCTATCTGCTGAAGACTACCTGCAAAATTATGTCGGAGTTGTTTTCCCA 900 Query 901 AACTACTTCTCACCATTTCTGCACACTTTATATTGTTGTTGGAATCCACTTCCTTCAGAC 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 901 AACTACTTCTCACCATTTCTGCACACTTTATATTGTTGTTGGAATCCACTTCCTTCAGAC 960 Query 961 ATGAGGGTAGCAACTTGCCAGGGGATATTTCAAGAAATACTTAAAAAGATGATGGAAAAT 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 961 ATGAGGGTAGCAACTTGCCAGGGGATATTTCAAGAAATTCTTAAAAAGATGATGGAAAAT 1020 Query 1021 AAGTCAGGTGATGAGATCGGCGTTGATTCTCCTGTAACTTCAAATCCAATGAACGCAAGC 1080 ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 1021 AAGCCAGGTGATGAGATCGGCGTTGATCCTCCTGTAACTTCAGATCCAGTGAACGCAAGC 1080 Query 1081 ACAGTACAGGAAACTTTTGCAAATCACAAATTGAACTCATCTAAGGATTTGATAAGGAAT 1140 || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 1081 ACGGTACAGGAAACATTTGCAAATCACAAATTGAACTCATCGAAGGACTTGATAAGGAAT 1140 Query 1141 ACTGTGAACTCTAAGGATGAGATCTTTTACTCTATTTCTGATGCACTCAAGAAAAATCGC 1200 ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1141 ACTGTAAACTCTAAGGATGAGATCCTTTACTCTATTTCTGATGCACTCAAGAAAAATCGC 1200 Query 1201 CATCCTTTCTTGAAAAAGATAACAATGGACGATTTGGGTACACTGATGTCTCTCTATGAT 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1201 CATCCTTTCTTGAAAAAGATAACAATGGACGATTTGGGTACACTAATGTCTCTCTATGAT 1260 Query 1261 AGCCGTTCTGACACTTATGGCACGCCTTTTCTACCGGTAGAGGGTAACATGAGATGTGAG 1320 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1261 AGCCGTTCTGACACTTATGGTACGCCTTTTCTACCGGTAGAGGGTAACATGAGATGTGAG 1320 Query 1321 GGAATGGTTCTGATTGCATCTATGCTCTGTTCTTGTATCCGCAATATCAAGTTGCCTCAT 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1321 GGAATGGTTCTGATTGCATCTATGCTCTGTTCTTGTATCCGCAATATCAAGTTGCCTCAT 1380 Query 1381 TTGAGGAGGGAAGCTATACTTCTATTGAGATCTTGCTCTTTGTATATTGATGATGATGAT 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1381 TTGAGGAGGGAAGCTATACTTCTATTGAGATCTTGCTCTTTGTATATTGATGATGATGAT 1440 Query 1441 CGCTTACAGCGTGTACTTCCATACGTCGTTGCCTTGCTTTCTGATCCAACAGCAATCGTG 1500 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1441 CGCTTACAGCGTGTACTTCCATACGTCGTTGCCTTACTTTCTGATCCAACAGCAATCGTG 1500 Query 1501 CGGTGCGCTGCCATGGAAACTTTGTGTGACATTCTGCCGCTTGTCCGAGATTTTCCTCCT 1560 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1501 CGGTGCGCTGCCATGGAAACTTTGTGTGATATTCTGCCGCTTGTCCGAGATTTTCCTCCT 1560 Query 1561 AGTGATGCAAAGATTTTCCCAGAGTACATATTTCCGATGCTCTCCATGCTTCCTGAAGAT 1620 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1561 AGTGATGCGAAGATTTTCCCAGAGTACATATTTCCGATGCTCTCCATGCTTCCTGAAGAT 1620 Query 1621 ACGGAAGAGAGTGTGAGGATATGCTATGCCAGCAATATTGCAAAACTCGCTCTTACTGCT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1621 ACGGAAGAGAGTGTGAGGATATGCTATGCCAGCAATATTGCAAAACTCGCTCTTACTGCT 1680 Query 1681 TATGGATTCTTGATACATTCTTTCCAGTTGAGCGATGTAGGGGTTCTTAATGAATTGAAT 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1681 TATGGATTCTTGATACATTCTTTCCAGTTGAGCGATGTAGGGGTTCTTAATGAATTGAAT 1740 Query 1741 TCCCAGCAGATCTCCAC-TACACCTGCTAGTGAGACCCCTAGTCATTTGCAAAAGGCAAA 1799 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1741 TCCCAGCAGATCTC-ACCTACACCTGCTAGTGAGACCCCTAGTCATTTGCAAAAGGCAAA 1799 Query 1800 TGGCAATGCGCAGCTT-CAACAGCTTAGAAAAACTATAGCTGAAGTTGTTCAAGAGCTTG 1858 |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1800 TGGCAATGCGCAGCTTGCA-CAGCTTAGAAAAACTATAGCTGAAGTTGTTCAAGAGCTTG 1858 Query 1859 TTATGGGTCCAAAACAAACTCCAAATGTTAGAAGAGCACTCCTTCAGGACATAGGGGAGC 1918 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1859 TTATGGGTCCAAAACAAACTCCAAATGTTAGAAGAGCACTCCTTCAGGACATAGGGGAGC 1918 Query 1919 TCTGCTTTTTCTTTGGTCAGAGGCAGAGTAATGACTTTCTACTACCGATCCTCCCTGCCT 1978 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1919 TCTGCTTTTTCTTTGGTCAGAGGCAGAGTAATGACTTTCTACTACCGATCCTCCCTGCCT 1978 Query 1979 TTCTAAACGACAGAGATGAGCAGCTAAGATCTGTATTCTTTGAGAAGATTGTTTATGTAT 2038 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1979 TTCTAAACGACAGAGATGAACAGCTAAGATCTGTATTCTTTGAGAAGATTGTTTATGTAT 2038 Query 2039 GCTTTTTTGTTGGCCAGAGAAGTGTGGAGGAGTATCTATTGCCTTATATCGATCAAGCTT 2098 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2039 GCTTTTTTGTTGGTCAGAGAAGTGTGGAGGAGTATCTATTGCCTTATATCGATCAAGCTT 2098 Query 2099 TGAGTGATCAGACGGAGGCTGTTATTGTCAATGCATTGGAGTGCTTATCCACATTATGCA 2158 ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2099 TGAGTGATCAGACAGAGGCTGTCATTGTCAATGCATTGGAGTGCTTATCCACATTATGCA 2158 Query 2159 AGAGTAGTTTCTTGCGGAAGAGAGCTCTCCTCCAAATGATAGAGTGTGTTTATCCTTTGT 2218 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2159 AGAGTAGTTTCTTGCGGAAGAGAGCTCTCCTCCAAATGATAGAGTGTGTTTATCCTTTGT 2218 Query 2219 TGTGCTATCCATCTCAATGGGTAAGGAGGGCAGTTGTCACTTTCATTGCCGCAAGTAGTG 2278 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2219 TGTGCTATCCATCTCAATGGGTAAGGAGGGCAGTTGTCACTTTCATTGCCGCAAGTAGTG 2278 Query 2279 AATGCTTAGGTGCAGTCGACTCTTATGCTTTTATTGCCCCAGTAATACGCTCTTATCTTA 2338 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2279 AATACTTAGGTGCAGTCGACTCTTATGCTTTTATTGCCCCAGTAATACGCTCTTATCTTA 2338 Query 2339 GTAGACTGCCTGCGTCAATTGCTTCTGAGGAAGGTCTACTTTCATGTTTGAAGCCCCCTG 2398 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2339 GTAGACTGCCTGCGTCAATTGCTTCTGAGGAAGGTCTACTTTCATGTTTGAAGCCCCCAG 2398 Query 2399 TCACAAGGGAGGTAGTTTATCGTATCTTTGAAAAAACCAGGAACCCAGAATTCATGGCGA 2458 ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2399 TCACAAGGGAGGTAGTTTACCGTATCTTTGAAAAAGCCAGGAACCCAGAATTCATGGCGA 2458 Query 2459 AACAGCGAAAGATGTGGTATAGTTCTTCACCTCAGTCCAAAGATTGGGAATCTGTTGATT 2518 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2459 AACAGCGAAAGATGTGGTATAGTTCTTCACCTCAATCCAAAGATTGGGAAACTGTTGATT 2518 Query 2519 TGTTTGACAAAGATGCTGGGGAGTTGAATTCAGTAGAATGCAGGGCCGAACAGAAGCAAA 2578 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2519 TGTTTGACAAAGATGCTGGGGAGTTGAATTCAATAGAATGCAGGGCCGAACAGAAGCAAA 2578 Query 2579 GTGTGGAAGGaaaaaaaCAGATTAAGAGTGCATCAAAGCAACCAGAAGTTCAAGGAAAGT 2638 ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2579 GTGTGGAAGGACAGAAACAGATTAAGAGTGCATCGAAGCAACAAGAAGTTCAAGGAAAGT 2638 Query 2639 ATGCAGAAAAGGATGCTAAATTAAGAATCCCGAGAAACCCAAGACCTAATGCTTCTAACA 2698 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2639 ATGCAGAAAAGGATGCTAAATTAAGAATCCCGAGAAACCCAAGACCTAATGCTTCTAACA 2698 Query 2699 CTGTTGAGCTACGTGATCCCGTGTATCCAGAGAAGTTACAGTTCTCTGGGTTTATGGCAC 2758 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2699 CTGTTGAGCTACGTGATCCCGTGTATCCAGAGAAGTTACAGTTCTCTGGGTTTATGGCAC 2758 Query 2759 CATATGTATCTGGTGCGAATAGCTTTATTGAACCAGAGAACATACCTCTCTATTCGTTTA 2818 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2759 CATATGTATCTGGTATGAATAGCTTTATTGAACCAGAGAACATACCTCTCTATTCGTTTA 2818 Query 2819 GCATGGACAAACGAGCAGCTACAAATCCTCCTGTGGCTTCTGAGTCTTCATTGCAGATGA 2878 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2819 GCATGGACAAACGAGCAGCTACAAATCCTCCTGTGGCTTCTGAGTCTTCATTGCAGATGA 2878 Query 2879 ACTCTCTGGGAATGGGTTCATTGTCTGTGCCATGGATGGATTCCATGAGTAAATCATTTA 2938 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2879 ACTCTCTGGGAATGGGTTCATTGTCTGTGCCATGGATGGATTCCATGAGTAAATCATTTA 2938 Query 2939 ACTTGGCTAGTTCGGTCCCAGTGCCTAAGCTGATTTCTGGGTCATTCCATGTCGGTACCA 2998 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2939 ACTTGGCTAGTTCGGTCCCTGTGCCTAAGCTGATTTCTGGGTCATTCCATGTCGGTACCA 2998 Query 2999 ATCCTAAACAATTTTACAGAGTGGTACATGAGCCAGAAAGCAGAGAAAATGATCAAATCT 3058 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2999 ATCCTAAACAATTTTACAGAGTGGTACATGAGCCAGAAAGCAGAGAAAATGACCAAATCT 3058 Query 3059 CCTCAGCCATCAGTAAATTTCAAGACCTCGGAGTATCAAGCTCCTCAAAAAGTGCTTCTG 3118 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3059 CCTCAGCTATCAGTAAATTTCAAGACCTCGGAGTATCAAGCTCCTCAAAAAGTGCTTCTG 3118 Query 3119 TAACTTCAGAAGATGCTTCTTCTCCAGCGGATCTTGTAGGAGAGCCATCTCTGTCAAGGA 3178 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3119 TAACTTCAGAAGATGCTTCTTCTCCAGCGGATCTTGTAGGAGAACCATCTCTGTCAAGGA 3178 Query 3179 CATCGGTTCCGGATTCAGGGTGGAAGCCTCGTGGAGTATTAGTTGCTCATCTACAAGAGC 3238 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3179 CATCGGTTCCGGATTCAGGGTGGAAGCCTCGTGGAGTATTAGTTGCTCATCTACAGGAGC 3238 Query 3239 ATCGCTCTGCGGTCAATGACATTGCCACTTCAAGCGATCATAGCTTTTTTGTTAGTGCAT 3298 |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3239 ATCGCTCTGCGGTCAACGACATCGCCACTTCAAGCGACCATAGCTTTTTTGTTAGTGCAT 3298 Query 3299 CAGATGATTCCACAGTGAAGGTGTGGGACTCTAGAAAACTGGAAAAGGACATCTCTTTTA 3358 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3299 CAGATGATTCCACAGTGAAGGTGTGGGACTCTAGAAAACTGGAAAAGGACATCTCTTTTA 3358 Query 3359 GGTCAAGGCTAACATATCATCTCGAGGGAAGCAGAGGGATGTGCACAACAATGCTTCGGA 3418 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3359 GGTCAAGGCTAACATATCATCTCGAGGGAAGCAGAGGGATGTGCACAACAATGCTTCGGA 3418 Query 3419 ATTCAACGCAAGTTGTAGTTGGAGCCTCTGATGGTGTGATACATATGTTTTCAATTGACC 3478 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3419 ATTCAACACAAGTTGTAGTTGGAGCCTCTGATGGTGTGATACATATGTTTTCAATCGACC 3478 Query 3479 ATATCTCCAGAGGCTTGGGGAACGTAGTGGAGAAGTATTCAGGCATTGTTGATATTAAAA 3538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3479 ATATCTCCAGAGGCTTGGGGAACGTAGTGGAGAAGTATTCAGGCATTGTTGATATTAAAA 3538 Query 3539 AGAAAGATGTTAAAGAAGGCGCTCTAGTTTCTCTCTTGAATTATACTGCTGATAGCCTTT 3598 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3539 AGAAGGATGTTAAAGAAGGCGCTCTAGTTTCTCTCTTGAATTATACCGCTGATAGCCTTT 3598 Query 3599 CTGGTCCGATGGTAATGTATAGTACCCAAAACTGCGGAATCCACCTTTGGGATACAAGGT 3658 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3599 CTGGTCCGATGGTAATGTATAGTACCCAAAACTGCGGAATCCACCTTTGGGATACAAGAT 3658 Query 3659 CAGATTTAGATGCATGGACACTGAAAGCAAATCCTGAAGAAGGATATGTGTCTTCATTGG 3718 ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3659 CAGATTTAGATGCATGGACACTGAAAGCAAACCCCGAAGAAGGATATGTGTCTTCATTGG 3718 Query 3719 TTACAAGTCCTTGTGGGAATTGGTTTGTCTCTGGGTCTTCAAGGGGAGTGCTTACTCTTT 3778 ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3719 TTACAAGCCCTTGCGGGAATTGGTTTGTCTCTGGGTCTTCAAGGGGATTGCTTACTCTTT 3778 Query 3779 GGGATTTGAGATTTCGTGTTCCTGTAAATTCGTGGCAATACCCCATCATATGTCCCATAG 3838 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| Sbjct 3779 GGGATTTGAGATTTCGTGTTCCTGTAAATTCGTGGCGATACCCTATCATATGCCCCATAG 3838 Query 3839 AGAAGATGTGCCTCTGCTTTCTTCCTCCAAGCGTCTCAGTGTCCACCACTATGAAACCTT 3898 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3839 AGAAGATGTGCCTCTGCTTTCTTCCTCCAAGCGTCTCAGTGTCCACCACTATGAAACCTT 3898 Query 3899 TAATTTATGTTGCTGCCGGTTGCAACGAAGTTTCACTCTGGAATGCAGAGGGAGGTAGCT 3958 | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3899 TTATTTATGTTGCTGCAGGTTGCAACGAAGTTTCACTCTGGAATGCAGAGGGAGGTAGCT 3958 Query 3959 GTCACCAGGTATTGAGAGTAGCCAATTATGAAAATGAGACGGATGTTTCCGAGTTTCAAT 4018 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3959 GTCACCAGGTATTGAGAGTAGCCAACTATGAAAATGAGACGGATGTTTCCGAGTTTCAAT 4018 Query 4019 GGAAGTTACCAAGCAATAAGGTAAATCCGAAGCCGAATCATCGTCAGAACATGAGCTCCA 4078 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct 4019 GGAAGTTACCAAGCAATAAGGTAAATCCCAAGCCGAATCTTCGCCAGAACATGAGCTCCA 4078 Query 4079 AGTACAGAATCGAAGAGTTGAACGAGCCTCCTCCTCGTCTTCCTGGTATCCGCTCTTTGC 4138 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4079 AGTACAGAATCGAAGAGTTGAACGAGCCTCCTCCTCGTCTTCCTGGTATCCGCTCTTTGC 4138 Query 4139 TCCCTTTACCTGGAGGTGACTTGTTAACAGGTGGTACTGACTTGAAGATTCGGCGTTGGG 4198 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4139 TTCCTTTACCTGGAGGTGACTTGTTAACAGGTGGTACTGACTTGAAGATTCGGCGTTGGG 4198 Query 4199 ATTACTCCAGCCCTGAGAGAAGTTATTGTATATGCGGTCCGAGTTTGAAAGGAGTCGGAA 4258 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4199 ATTACTCCAGCCCTGAGAGAAGTTATTGTATATGCGGTCCGAGTTTGAAAGGAGTCGGAA 4258 Query 4259 ATGATGATTTCTATGAACTAAAAACCAACACGGGCGTGCAATTTGTTCAGGAGACAAAGA 4318 |||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4259 ATGATGATTTTTATGAAGTAAAAACCAACTCCGGCGTGCAATTTGTTCAGGAGACAAAGA 4318 Query 4319 GACGGCCTCTGGCTACTAAACTGACGGCAAAGGCGGTACTTGCGGCTGCTGCGACAGACA 4378 ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 4319 GACGGCCTCTGGCAACCAAACTGACAGCAAAGGCAGTACTTGCGGCTGCTGCCACAGACA 4378 Query 4379 CAGCGGGTTGTCATCGTGACTCAGTTCAGTCTCTGGCATCTGTGAAGCTGAACCAGAGAC 4438 |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 4379 CAGCAGGTTGTCACCGTGACTCAGTTCAGTCTCTGGCATCTGTGAAACTGAACCAGAGAC 4438 Query 4439 TGTTGATATCAAGCAGCAGAGATGGAGCCATAAAGGTCTGGAAGTAAAGAAACCCTGACG 4498 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | || Sbjct 4439 TGTTGATATCAAGCAGCAGAGATGGAGCCATTAAGATCTGGAAGTAA-G------TG--- 4488 Query 4499 GTCTTTCGTGTACAGTGTTATAGTGTTTATTTTAT--TTTACCTTGTCATTGTACCATCA 4556 | |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| Sbjct 4489 -T---------ACAGTGTTATAGTGTTTATTTTTTAGTTTACCTTTTCATTGTAACATCA 4538 Query 4557 AATGCTAAAAGAAATTTTTTAGCCTTGTATCCTTTTTACTCGATAAACTTCCTTGTACAG 4616 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| Sbjct 4539 AATGCTAAAAGAAATTTTTTAGCCTTGTATCCTTTT-ACTCGATAAACTTTCTTGTGCAG 4597 Query 4617 ATTTTTCCATTGTA 4630 |||| ||| ||||| Sbjct 4598 ATTTCTCCTTTGTA 4611 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 176016275125 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5