BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G31160.1 Length=5871 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg491627 jgi|Araly1|491627|fgenesh2_kg.7__1060__AT4G31160.1 4922 0.0 > Ahg491627 jgi|Araly1|491627|fgenesh2_kg.7__1060__AT4G31160.1 Length=5805 Score = 4922 bits (2665), Expect = 0.0 Identities = 2995/3150 (95%), Gaps = 39/3150 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 AAtttct-ttttctttttccgtgatcccaacgtttgaattgatcgccgtttctgggtttt 59 ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1 AATTTCTATTTT-TTTTTCCGCGATCCCAACGTCTGAATTGATCGTCGTTTCTGGGTTTT 59 Query 60 tcttttAAAAGAGAGGTATTCATCATGGACGGGCAAGAGCATGCCGAGGTCCCTAATTC- 118 ||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 60 TCTTTGAAAAGAGAGGTA-TC-T-ATGGACGGGCAAGAGCATGCCGAGGTCCCTAA-TCA 115 Query 119 GATGGTTGAGGATGACCAATCAGTTGTTGCGGCGGAGGCGATTGCAGAGTTGGCGAATTC 178 ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct 116 GATGGTTGAGGATGAACAATCGGTTGTTGCGGCGGAGGCAATTACAGAGTTGGCGAATTC 175 Query 179 AACCGGCGAACCTAATCCT----------G---A-A-GAAGGAGAAGAACAGAGTGTTGA 223 || |||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||| || Sbjct 176 AAATAACGAAGCTAATCCTGAAGAAGGAGGACAACAGGAAGGAGAAGAACAGAGTGTGGA 235 Query 224 AGACGAGCTTATAGCGAAGGCGCAGAAGCTTATGGAAGATATTACTTCCGTTGCCAATAA 283 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 236 GGACGAGCTTATAGCGAAGGCGCAGAAGCTTATGGATGATATTACTTCCGTTGCTAATAA 295 Query 284 CCCTAATCCTAATATCCTTCACGCTCTTAGTCAGCTTCTCGAATCTCAGGAGTCTCTGTT 343 ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 296 CCCTAATCCTAATTTCCTTCACGCTCTTAGTCATCTTCTCGAATCTCAGGAGTCTCTGTT 355 Query 344 CTTAGAGGAGAATGGGCATTTCTCCAATGCTCGTGGTAGTCATAACAGTGGCAAGCTGTG 403 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 356 CTTAGAGGAGAATGGGCATTTCTCCAATGCTCGCGGTAGTCATAACAGTGGCAAGCTGTG 415 Query 404 TATTCTCATCCGAGAAAACGATGAGTTTTTTGAATTGATATCGTCGACTTTTCTATCTGA 463 || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 416 TACTCTCATCCGAGAAAATGATGAGTTTTTTGAATTGATATCGTCAACTTTTCTATCTGA 475 Query 464 GAATTCTTACTCAACCGCAGTAAAGGCAGCCTCTGCAAGGTTGCTAATGAACTGTTCGCT 523 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 476 GAATTCTTACTCAACCGCCGTAAAGGCAGCCTCTGCAAGATTGCTAATGAACTGTTCGCT 535 Query 524 TACGTGGATGTATCCTCATGTTTTCGACGATGCTGTAACGGAAAACTTTAAAAATTGGGT 583 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 536 TACTTGGATGTATCCTCATGTTTTCGACGATGCTGTTACGGAAAACTTTAAAAATTGGGT 595 Query 584 TATGGAAGAGGCAGTCAAGTTTCCTGGTGAAGACTCTGCCAAGAAGGAAGCCTCAGATTT 643 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct 596 TATGGAAGAAGCAGTCAAGTTTCCTGGTGAAGACTCTGGCAGGAAGGAAGCCTCAGATTC 655 Query 644 TGAAATGTTAAAAACTTATTCTACAGGACTTCTTGCTCTCTCTCTGGCGAGTCGTGGGCA 703 |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 656 TGAAATGTTAAAGACTTATTCTACAGGACTTCTTGCTCTCTCTCTCGCCAGTCGTGGGCA 715 Query 704 AATAGTTGAAGACGTTTTGACATCAGGACTATCTGCTAAGCTTATGCATTATCTTCGAGT 763 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 716 AATAGTTGAAGACGTTTTGACATCAGGACTATCTGCTAAGCTTATGCATTATCTTCGAGT 775 Query 764 ACGAGTTCTTAAAGAGCCAAGCACAAGCCGT----A-----TACACACAACTGAGACTAA 814 ||||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| Sbjct 776 ACGAGTTATTGGAGAGCCAAGCACAAGCCGTAGAGATGCCCTTCACACAACTGAGACTAA 835 Query 815 GCACGTCTCCTTAAAAACCAAAGAAGAAGGTCGAAGTAGGGTGCGTAAGATTGTGGATAC 874 ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 836 GCATGTGTCCTTAAAAACAAAAGAAGAAGGTCGGAGTAGGGTGCGTAAGGTTGTGGATAC 895 Query 875 AGTTGAAGGTGACCATGTTCTTGAGACGGACTCCGGAAGAGAGATGGGACAAACTGATGT 934 ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 896 AGTTGAAGGTGACCATGTTTTTGAGATGGACTCTGGCAGAGAGATGGGACAAACTGATGT 955 Query 935 ACAGCCTGATGGCGAATTCGAAATCGATGGCAGAGATGTATTTAATGTTTCAGGTGTTGT 994 |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 956 ACAGTCTGATGGTGAATTCGAAATCGATGGCAGAGAAATATTTAATGTTTCAGGTGTTGT 1015 Query 995 TGATTGTAAAATTAAACCTGGAGATGACAATAGTGTTAGAGATGACCCTTCAAGACACAG 1054 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1016 TGATTGTAAAATTAAACCTGGAGATGACAATAGTGGAAGAGATGACCCTTCAAGACACAG 1075 Query 1055 ACTGAACCGATCAAAATCAAGGGGGAGAGGAAGGGTTCACGAAGGTGCACCTGATACAGA 1114 |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 1076 ACTGAACCGATCAAAATCGAGGGGGAGAGGAAGGGTTAACGAAGGTGCAACTGATACAGA 1135 Query 1115 AGTTCTCTTGGCATCTCCTAGATTAGGTCGTCTACTTGTCAGAGATAGGGATCTATCAAA 1174 ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1136 AGTTCTCTTGGCATCTCCTAGATCAGGTCGTCTAGTTGTCAGAGATAAGGATCTATCAAA 1195 Query 1175 AATTTCAGATGGCAGAAATGCAGAAGACGTGACCGTATGTCTTGGGAAAATGAAGTCTGG 1234 | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1196 ATTTTCAGATGGCAGAAATGCAGAAGATGTGACCATATGTCTGGGGAAAATGAAGTCTGG 1255 Query 1235 TATTATGGAGATAGAAAGAGAGGATAACGATGAGTGCTTTCAAGGTTGCATAATAGGAAC 1294 ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1256 TATTATGGAGATAGAAAGAGAGGATGACGATGAATGCTTTCAAGGTTGCATAATAGGAAC 1315 Query 1295 TAAAAACATAACTGATCTAGTAAAGAGAGCCGTTGGAGCTGCTGAAACCGAAGCTAGAGC 1354 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| Sbjct 1316 GAAAAACATAATTGATCTAGTAAAGAGAGCCGTTGGAGCTGCAGAAACGGAAGCTAGAGC 1375 Query 1355 TGCCCATGCTCCTGATGACGCAGCTAAAGCAGCTGGCGATGCTGCTGCAGAGCTTGTTAA 1414 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1376 TGCCCATGCTCCTGATGACGCAGCTAAAGCAGCTGGCGATGCTGCAGCAGAGCTTGTTAA 1435 Query 1415 AACTGCTGCTTTGGAGGAATTCAAGTCTTCTGGCAGTGAAGAAGCTGCTGTGTCTGCTGC 1474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1436 AACTGCTGCTTTGGAGGAATTCAAGTCTTCTGGCAGTGAAGAAGCTGCTGTGTCGGCTGC 1495 Query 1475 TACTCGAGCAGCTATTACAGTCATAGATGCCGCAGAGGTTTCAAGAAATCCTACTTGTGT 1534 |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1496 TACTCGAGCAGCTATTACAGTCATAGATGCTGCAGAGGTTTCAAGAAATCCTACTTGTGT 1555 Query 1535 CACATCTGATCAGACAACGGATGTTAGTGAAGTTTCCCTTCCAGATATCGAATCATTGGC 1594 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1556 CACATCTGATCAGACAACAGATGTTAGTGAAGTTTCACTTCCAGATATCGAATCTTTGGC 1615 Query 1595 TCAGTTACAAGAAAAATATTGCATCCAGTGCCTTGAGATACTGGGAGAATATGTTGAGGT 1654 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1616 TCAGTTACAAGAAAAATATTGCATCCAGTGCCTTGAGATACTGGGAGAATATGTCGAGGT 1675 Query 1655 TCTCGGGCCTGTACTCCATGAAAAAGGTGTTGATGTATGCATTGTGCTGCTGGAACGTAC 1714 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| Sbjct 1676 TCTCGGGCCTGTACTCCATGAAAAAGGTGTTGATGTATGCATTATGCTACTGGAACGTAC 1735 Query 1715 ATCCCAGTTAGATGATCGTTCGACAGTGTCTCCTTTGTTACCTGATGTCATGAAGTTAAT 1774 ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1736 ATCCCAGTTTGATGATAGTTCTACAGTGTCTCCTTTGTTACCTGATGTCATGAAGTTAAT 1795 Query 1775 TTGCGCTTTGGCTGCGCACCGGAAGTTTGCAGCAATGTTTGTTGAACGGCGTGGCATACT 1834 |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| Sbjct 1796 TTGCGCTTTGGCTGCGCACCGGAAGTTTGCTGCGATGTTTGTTGACCGGGGTGGCATACA 1855 Query 1835 AAAATTACTTGCTGTTCCAAGGGTCTCTGAGACTTTTTATGGTCTCTCATCTTGCTTATA 1894 |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1856 AAAATTACTTGCTGTTCCAAGGGTTTCTGAGACGTTTTATGGTCTCTCATCTTGCTTATA 1915 Query 1895 CACCATTGGCTCTCTTCAGGGTATAATGGAGCGTGTCTGTGCACTTCCATTGGTTGTCAT 1954 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| Sbjct 1916 CACCATTGGCTCTCTTCAGGGTATAATGGAGCGTGTCTGTGCACTTCCATCGGATCTCAT 1975 Query 1955 ACATCAAGTTGTTAAATTAGCTATCGAACTTCTCGACTGTTCCCAGGATCAAGCCAGAAA 2014 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1976 ACATCAAGTTGTTAAATTAGCTATCGAACTTCTCGACTGTTCCCAGGATCAAGCCAGAAA 2035 Query 2015 AAATTCAGCTTTATTCTTTGCTGCTGCTTTTGTCTTCAGAGCCATTTTAGATGCATTTGA 2074 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2036 AAATTCAGCTTTATTCTTTGCTGCTGCTTTTGTCTTCAGAGCCATTTTAGATGCATTTGA 2095 Query 2075 TGCTCAGGATAGTTTGCAGAAACTCCTTGCAATTCTTAAAGATGCAGCCTCAGTTAGAAC 2134 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2096 TGCTCATGATAGTTTGCAGAAACTCCTTGCAATTCTTAAAGATGCAGCCTCAGTTAGAAC 2155 Query 2135 TGGTGCTAATACTGACCGATCAGCTCCTGAAGTCATGACGTCCTCAGAGAAGCAGATGGC 2194 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2156 TGGTGCTAATTCTGACCGATCAGCTCCTGAAGTCATGACGTCCTCAGAGAAACAGATGGC 2215 Query 2195 TTTTCACACCTGTTTTGCTTTACGCCAGTATTTTAGAGCTCATCTCCTTTTGCTTGTTGA 2254 ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2216 TTTCCACACGTGTTTTGCTTTGCGCCAGTATTTTAGAGCTCATCTTCTTTTGCTTGTTGA 2275 Query 2255 TTCAATCCGTCCTAGCAGAATTAGCCGGGGTGGTGTGCCATCTTCAATGAAGCCTAATAT 2314 |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||||| Sbjct 2276 TTCAATCCGTCCTAGCAGAAGTAGCCGAGGTGGTGTGCGA-----AATGTT-CCTAATAT 2329 Query 2315 AAGGGCAGCCTATAAGCCCCTTGACATCAGCAATGAAGCTGTTGATGCCATCTTCCTTCA 2374 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2330 AAGGGCAGCCTATAAGCCCCTTGACATCAGCAATGAAGCTGTTGATGCCATCTTCCATCA 2389 Query 2375 GTTACAGAAGGATAGGAGGTTGGGTCCGACCTTTGTGA-AAGCTCAGTGGCCTGCTGTCA 2433 |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct 2390 GTTACAGAAGGACAGGAAGTTGGGTCCGACCTTTGTGAGAA-CTCAGTGGCCTGCTGTCA 2448 Query 2434 ATAATTTTTTGGCCTCCTCTGGACATGTTACCATGTTGGAACTTTGTCAGACTCCACCAG 2493 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2449 ATAACTTTTTGGCCTCCTCTGGACATGTTACCATGTTGGAACTTTGTCAGACTCCACCAG 2508 Query 2494 TAGATCGTTATCTGCATGATCTTCTTCAGTATGCTTTTGGGGTTCTTCACATAGTTACAT 2553 |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2509 TAGACCGTTATCTGCATGATCTACTTCAGTATGCTTTTGGGGTTCTTCACATAGTTACAT 2568 Query 2554 CAATACCTGATGGCCGCAAAGCAATTGCACATGCCACACTCAGCAACAATCGTGCTGGCA 2613 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2569 CAATACCTGATGGCCGCAAAGCAATTGCGCATGCCACACTCAGCAACAATCGTGCTGGCA 2628 Query 2614 TTGCTGTCATTCTGGATGCAGCAAATATTTCCAACAGCATAGTAGACCCTGAGATCATCC 2673 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2629 TTGCTGTCATTCTGGATGCAGCAAATATTTCCAACAGCATAGTAGACCCTGAGATCATTC 2688 Query 2674 AGCCTGCACTAAATGTCCTAATCAATCTGGTGTGCCCACCACCATCATTAAGCAATAAGC 2733 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2689 AGCCTGCACTAAATGTCCTAATCAATCTGGTGTGCCCACCACCATCATTAAGCAATAAGC 2748 Query 2734 CGCCCCTTGCACAAAATCATCAACCTGTTCCTGGCCAAGCCACTACCCGTCCCTCTACTG 2793 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2749 CGCCCCTTGCACAAAATCATCAACCTGTTCCCGGCCAAGCCACTACCCGTCCCTCTACTG 2808 Query 2794 ATGTTGCTGTAGGTACTCAGTCCACTGGTAATGCTCCGCAAACTCCTGTTGCACCAGCAT 2853 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2809 ATGTTGCTGTAGGTACTCAGTCCACTGGTAATGCTCCGCAAACTCCTGTTGCACCAGCAT 2868 Query 2854 CTTCAGGTTTGGTTGGGGATCGGAGAATTTTCTTAGGAGCAGGAACTGGTTCTGCTGGCC 2913 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2869 CTTCAGGTTTGGTTGGGGATCGGAGAATTTTCTTAGGAGCAGGAACTGGTTCTGCTGGCC 2928 Query 2914 TTGCTGCTAAGTTGGAGCAGGTTTATCGTCAAGCCCGTGAAGCTGTTCGTGGGAATGATG 2973 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2929 TTGCTGCTAAGTTGGAGCAGGTTTATCGTCAAGCCCGTGAAGCTGTTCGTGGGAATGATG 2988 Query 2974 GTATAAAAATTCTTTTAAAACTTCTTCAGCCCAGAATATATGTAAATCCTCCTGCTACCC 3033 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct 2989 GTATAAAAATTCTTTTAAAACTTCTTCAGCCCAGAATATATGTGAATCCCCCTGCTACCC 3048 Query 3034 CAGATTGTCTACGAGCGCTAGCTTGCAGGGTACTTCTTGGTCTGGCTAGAGATGATACAA 3093 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3049 CAGATTGTCTACGAGCGCTGGCTTGCAGGGTACTTCTTGGTCTGGCTAGAGATGATACAA 3108 Query 3094 TTGCACAAATACTGACTAAACTTGAGGTTG 3123 |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3109 TTGCACAAATACTGACTAAACTTGAGATTG 3138 Score = 2730 bits (1478), Expect = 0.0 Identities = 1705/1810 (94%), Gaps = 34/1810 (2%) Strand=Plus/Plus Query 4061 GCGAAGGAATTCAACCTTTGCGGATGGCTCAGGTTTGCAAACACCAGCTTCAGCTTTAGA 4120 ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4013 GCGTAGGAATTCAACCATTGCGGAAAGCTCAGGTTTGCAAACACCAGCTTCAGCTTTAGA 4072 Query 4121 TGCCAACCAATCTGGGAGTTCCAGACTGGGCCAAATGACACCTGCTTCTCAGCTACGGCT 4180 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 4073 TGCCAACCAATCTGGGAGTTCCAGACTGGGCCAGATGACACCTGCTTCTCAGCTAAGGCT 4132 Query 4181 TCCAAGTGATCCCCAGCCTTCAAATCCAGAACGGTTATCACTAGACTCCCTTGTGGTTCA 4240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4133 TCCAAGTGATCCCCAGCCTTCAAATCCAGAACGGTTATCACTAGACTCCCTTGTGGTTCA 4192 Query 4241 GTATCTAAAGCACCAACACAGGCAGTGTCTGGCTCCAATCACAACTCTTCCCCCTGTGTC 4300 |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4193 GTATTTGAAGCACCAACACAGGCAGTGCCTGGCTCCAATCACAACTCTTCCCCCTGTGTC 4252 Query 4301 TCTCCTACATCCACATGTCTGTCCTGAACCTAAACGGTTACTTGAAGCTCCACTAAACAT 4360 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4253 TCTCCTACATCCGCATGTCTGTCCTGAACCTAAACGGTTACTTGAAGCTCCACTAAACAT 4312 Query 4361 GACTGGCCGTCTTGGGACCCGTGAGCTTCAAAGTTTCTACAGTGGAGTCCATGGGAATCG 4420 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4313 CACTGGCCGTCTTGGGACCCGTGAGCTTCAAAGTTTCTACAGTGGAGTCCATGGGAATCG 4372 Query 4421 CAGGGATCGTCAGTTTGTTTTCAGCAGATTCAAATCTTGGAGATCTTTCCGGGATGAGAC 4480 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4373 CAGGGATCGTCAATTTGTTTTCAGCAGATTCAAATCTTGGAGATCTTTCCGGGATGAGAC 4432 Query 4481 TGCTCTCTTTACATGCATTGCACTTCTTGGCGGTACTAATCATATAGCAGTCGGTAGTCA 4540 |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 4433 TGCTCTCTTTACATGCATTGCACTTCTTGGTGGTACTAATCATTTAGCAGTCGGTAGTCA 4492 Query 4541 TGCTGGAGAAATCAAGATATTTGAAGCTAGCAGCGGTAGCATGCTTGAGAGTGTCTCAGG 4600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| Sbjct 4493 TGCTGGAGAAATCAAGATATTTGAAGCTAGCAGCGGTACCTTGCTTGAGAGTTTCTCAGG 4552 Query 4601 TCACCAGGCTCCGGTTACACTTGTTCAGCCGTATGTCTCTCGTGATACTCAGTTGTTACT 4660 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| Sbjct 4553 TCACCAGGCTCCGGTTACGCTTGTTCAGCCGTATGTCTCTGGGGATACTCAGTTGTTACT 4612 Query 4661 TTCTTCGAGCTCCAGTGATGTACAGTTGTGGGACGCGTCTTCTATAACTGGTGGGCCTAG 4720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4613 TTCTTCGAGCTCCAGTGATGTACAGTTGTGGGACGCGTCTTCTATAACTGGTGGGCCTAG 4672 Query 4721 ACACTCCTTTGATGGATGCAAGGCTGCAAAATTCAGCAACTCTGGGCTACAATTTGCAGC 4780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4673 ACACTCCTTTGATGGATGCAAGGCTGCAAAATTCAGCAACTCTGGGCTACAATTTGCAGC 4732 Query 4781 GCTTTCTTGTGAAGCATCT-AGAAAAGATGTTCTTCTATATGACGTACAGACCTGCAGCC 4839 |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 4733 ACTTTCTTGTGAAGCAT-TGACAAAAGATGTTCTTCTATATGATGTACAGACCTGCAGTC 4791 Query 4840 CTTGCCAAAAACTCACTGACACAGTCACATCCTCTCGAAGTAATCCCTATTCTCTTGTGC 4899 ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 4792 CTTGCGATAAACTCACTGACACAGTCACATCTTCTCGAAGTAATCCCTATTCTCTTGTAC 4851 Query 4900 ACTTCAGCCCTTGCGATACACTGATTTTGTGGAATGGTGTTCTCTGGGACCGCCGTATCC 4959 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4852 ACTTCAGCCCTTGTGATACACTGATTTTGTGGAATGGTGTTCTCTGGGACCGCCGTATCC 4911 Query 4960 CCGAGAAGGTCAGACGGTTTGATCAATTTACTGATTATGGCGGAGGTGGGTTTCATCCTT 5019 ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct 4912 CCGAGTCTGTCAGTCGGTTTGATCAATTTACTGATTATGGCGGCGGTGGTTTTCATCCTT 4971 Query 5020 CTAGGAACGAGGTGATCATAAACTCAGAGATCTGGGACATGAGGACTTTCAAACTTCTTC 5079 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| Sbjct 4972 CTAGGAACGAGGTGATCATAAACTCAGAGGTCTGGGACATGAGGAATTTCAAGCTTCTTC 5031 Query 5080 GGAGTGTACCATCACTGGACCAGACAGCTATTACGTTCAACTCTAGGGGAGATGTTATAT 5139 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 5032 GAAGTGTACCATCACTGGACCAGACAGCTATTACGTTCAACTCCAGGGGAGATGTTATAT 5091 Query 5140 ACGCAATGCTGAGGAGAAACATCGAGGACGTTATGTCAGCGGTTCACACACGCCGTGTGA 5199 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| Sbjct 5092 ACGCAATGCTGAGGAGAAACATCGAAGACGTTATGTCTGCAGTTCACACACGCCGTGTGA 5151 Query 5200 AACATCCCTTGTTTGCTGCTTTCCGCACTCTTGATGCGATCAACTACTCAGACATTGCCA 5259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5152 AACATCCCTTGTTTGCTGCTTTCCGCACTCTTGATGCGATCAACTACTCAGACATTGCCA 5211 Query 5260 CTATACCTGTAGACCGGTGTCTTCTTGACTTTGCCACAGAACCAACAGATTCGTTCCTTG 5319 |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5212 CTATACCTGTGGACCGATGTCTTCTTGACTTTGCCACAGAACCAACAGATTCGTTCCTTG 5271 Query 5320 GGCTGATCACAATGGAAGACCAAGAAGATATGTTTTCCTCGGCCAGGATGTATGAGATTG 5379 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5272 GACTGATCACAATGGAAGACCAAGAAGATATGTTTTCCTCGGCCAGGATGTATGAGATTG 5331 Query 5380 GTAGAAGGAGACCAACagatgatgactcggatcccgatgatgatgatgagacggaagatg 5439 ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 5332 GTAGACGGAGGCCAACAGATGATGACTCGGATCCCGATGATGATGATGAGACGGACGATG 5391 Query 5440 aagatgaagatgatgaaga--ag-aagatgaCCTGGACCGAATTCTGGGACTAGCTGGAG 5496 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 5392 AAGATGAAGATGATGAAGACGAGGAAGATGACCTGGACCGAATTCTGGGACTAGGTGTAG 5451 Query 5497 ACAATAGCGATAGTGGGGATGATGACCTTAGCAGCGAGGACAATGAAGATAGTGTGAGCG 5556 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 5452 ACGATAGCGATAGTGGGGATGATGACCTTAGCAGCGACGACAATGAAGATAGTGTGAGCG 5511 Query 5557 ATTTTGATGAAGAAGCAGATATTCT-C---A---T-T-GACGGTGACTTTATGGAGGAGC 5607 |||||||||||| || ||| ||||| | | | | ||||||| |||||||| ||| Sbjct 5512 ATTTTGATGAAGGAGGAGAGATTCTTCTTGACGGTCTTGACGGTGGCTTTATGG-GGA-- 5568 Query 5608 TTATAGAAGGTGAAAATGAAGACGATGGTAATGGTGAG-GATG---AGGATGATGATGAC 5663 ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| Sbjct 5569 TTATAGAAGGTGAGGATGAAGACGATGATAATGGTG-GTGATGGTGAGGATGATGATGAT 5627 Query 5664 GACGGTGAGATGCAGGATTTCATGAGCAGTGGGGAAGAGGATGATTATAGAGACAACATT 5723 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct 5628 GACGGTGAGATGCAGGATTTCATGAGCAGTGGCGAAGAAGATGATTATAGAGACAATATT 5687 Query 5724 CGTTCTTCCTAAGtttttttttGTTTTATAAATTTTATTTACTTCTGGGCTCTCTACAGA 5783 ||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||| || | | |||||||| Sbjct 5688 CGTTCTTCCTAAGGTTTTTT-------ATA--TCTTGTTTACTTTTGAG-T-TCTACAGA 5736 Query 5784 TCACTAAGATGGATTTTTACTATCCAAAATTTTGATGATAAGTTCTTGTATTATTTTTTC 5843 || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5737 TCTCTAAGATGGATTTTTACTATCCAAAGTTTTGATGATAAGTTCTTGTATTATTTTTTC 5796 Query 5844 TTTGTTCAAG 5853 |||||| ||| Sbjct 5797 TTTGTT-AAG 5805 Score = 1310 bits (709), Expect = 0.0 Identities = 797/839 (95%), Gaps = 8/839 (1%) Strand=Plus/Plus Query 3230 GATTGTGACAAATTCAGGGCATGCAACTACACTAACAGCCAGTGATGCTGCTACTCCAAC 3289 |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3134 GATTGTGACAAATTCAGGGCATGCGACTACACTGACAGCCAGCGATGCTGCTACTCCAAC 3193 Query 3290 ACTGAGGCGCATTGAAAGAGCTGCCATTGCAGCAGCAACGCCTATAACTTATGATTCTAA 3349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3194 ACTGAGGCGCATTGAAAGAGCTGCCATTGCAGCAGCAACGCCTATAACTTATGATTCTAA 3253 Query 3350 GGAGCTTTTACTGCTTATCCATGAGCATCTCCAGGCATCAGGTCTTGGTGATACAGCTTC 3409 ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| Sbjct 3254 GGAGCTTTTGCTGCTTATCCATGAGCACCTCCAGGCATCAGGTCTTGGTGAAACTGCTTC 3313 Query 3410 AGCACTGTTAAAAGAGGCTCAATTAACTCCTCTACCTTCATCGGCTTCCCCTTCTTCTAT 3469 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3314 AGCACTGTTAAAAGAAGCTCAATTAACTCCTCTACCTTCATTGGCTTCCCCTTCTTCTAT 3373 Query 3470 TGCATATTCCACTACACAGGAGATGTCTACGCCGCTAGCTCAGGAACAATGGCCCTCTGG 3529 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3374 TGCATATTCCTCTACACAGGAGATGTCTACGCCGCTAGCTCAAGAACAATGGCCCTCTGG 3433 Query 3530 CCGTGCTAACAGTGGATTTTTCACCAGCAAACCCAAGGTCTGTGCACATGACGAAGATCC 3589 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 3434 CCGTGCTAACAGTGGATTTTTCACCAGCAAACCCAAAGTCTGTGCACATGACGAAGATCC 3493 Query 3590 AAATTCTAGATCTAATGCAGCTCTATCTGCCAAGAAGAAGCATTTGGCTTCCTCGACACT 3649 |||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3494 TAATTCTAGATGTAATGCGGCTATATCTGCCAAAAAGAAGCATTTGGCTTCCTCGACACT 3553 Query 3650 GGAGATGCCCACACCAGTAGCACAGCAACAATGGCCATCAGGCCGTGCTAACTGTGGTTT 3709 |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3554 GGAGATACCCACACCAGTAGCACAGCAACAGTGGCCATCAGGCCGTGCTAACAGTGGTTT 3613 Query 3710 TTGT-CCCAGCATACCCAAAATCAATGCACGTGATGAAGATCCTAGTTCGAGAGGTAACG 3768 || | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3614 TT-TCCCCAGCATACCCAGAATCAATGCACTTGATGAAGATCCTAGTTCGAGAGGTAACG 3672 Query 3769 CAGCTCCATCTGCAAAGAAGAAACAGTTGACTTTCTCACCCAGTTTTAGTTCGCAGTCAA 3828 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3673 CAGCTCCATCTGCAAAGAAGAAGCAGTTGACTTTCTCACCCAGTTTTAGTTTGCAGTCAC 3732 Query 3829 GAAAACAATCTTTCTCCCATGACGCTCTACCTCAGTCTACACAGAGAATAAATTGTTGTT 3888 |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 3733 GAAAGCAATCTCTCTCCCATGACGCTCAACCTCAGTCTACACAGAGAATAAATAGTAGTT 3792 Query 3889 CGAATTCAGATCCTGCTTTGGCAGATACATCAGAAACTGCTGCAGAATTAGTTTTGAAGA 3948 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3793 CGAATTCAGATCCTGCTTGGGCAGATACATCAGAAACTGCTGCAGAATTAGTTTTGAAGA 3852 Query 3949 ACGACCTTGATGCCGATGCTCAATTTAAGACCCCGATTTCCTTTCCAAGAAAACGGAAGT 4008 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3853 ACGACCTTGATGCCGATGCTCAATTTAAGACCCCGATTTCCTTTCCAAGAAAACGGAAAT 3912 Query 4009 TGTCTGAGCTTAGAGACTC-G--T---CAGTTCCGGGTAAAAGAATCGATTTGGGTGAG 4061 ||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3913 TGTCTGAGCTTAGAGACCCAGAGTTGTCAGTTCCGGGTAAAAGAATCAATTTGGGTGAG 3971 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 222408456612 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5