BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT4G31160.1

Length=5871
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg491627 jgi|Araly1|491627|fgenesh2_kg.7__1060__AT4G31160.1        4922    0.0  


> Ahg491627 jgi|Araly1|491627|fgenesh2_kg.7__1060__AT4G31160.1
Length=5805

 Score = 4922 bits (2665),  Expect = 0.0
 Identities = 2995/3150 (95%), Gaps = 39/3150 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     AAtttct-ttttctttttccgtgatcccaacgtttgaattgatcgccgtttctgggtttt  59
             ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1     AATTTCTATTTT-TTTTTCCGCGATCCCAACGTCTGAATTGATCGTCGTTTCTGGGTTTT  59

Query  60    tcttttAAAAGAGAGGTATTCATCATGGACGGGCAAGAGCATGCCGAGGTCCCTAATTC-  118
             ||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || 
Sbjct  60    TCTTTGAAAAGAGAGGTA-TC-T-ATGGACGGGCAAGAGCATGCCGAGGTCCCTAA-TCA  115

Query  119   GATGGTTGAGGATGACCAATCAGTTGTTGCGGCGGAGGCGATTGCAGAGTTGGCGAATTC  178
             ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct  116   GATGGTTGAGGATGAACAATCGGTTGTTGCGGCGGAGGCAATTACAGAGTTGGCGAATTC  175

Query  179   AACCGGCGAACCTAATCCT----------G---A-A-GAAGGAGAAGAACAGAGTGTTGA  223
             ||    |||| ||||||||          |   | | |||||||||||||||||||| ||
Sbjct  176   AAATAACGAAGCTAATCCTGAAGAAGGAGGACAACAGGAAGGAGAAGAACAGAGTGTGGA  235

Query  224   AGACGAGCTTATAGCGAAGGCGCAGAAGCTTATGGAAGATATTACTTCCGTTGCCAATAA  283
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct  236   GGACGAGCTTATAGCGAAGGCGCAGAAGCTTATGGATGATATTACTTCCGTTGCTAATAA  295

Query  284   CCCTAATCCTAATATCCTTCACGCTCTTAGTCAGCTTCTCGAATCTCAGGAGTCTCTGTT  343
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296   CCCTAATCCTAATTTCCTTCACGCTCTTAGTCATCTTCTCGAATCTCAGGAGTCTCTGTT  355

Query  344   CTTAGAGGAGAATGGGCATTTCTCCAATGCTCGTGGTAGTCATAACAGTGGCAAGCTGTG  403
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  356   CTTAGAGGAGAATGGGCATTTCTCCAATGCTCGCGGTAGTCATAACAGTGGCAAGCTGTG  415

Query  404   TATTCTCATCCGAGAAAACGATGAGTTTTTTGAATTGATATCGTCGACTTTTCTATCTGA  463
             || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  416   TACTCTCATCCGAGAAAATGATGAGTTTTTTGAATTGATATCGTCAACTTTTCTATCTGA  475

Query  464   GAATTCTTACTCAACCGCAGTAAAGGCAGCCTCTGCAAGGTTGCTAATGAACTGTTCGCT  523
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  476   GAATTCTTACTCAACCGCCGTAAAGGCAGCCTCTGCAAGATTGCTAATGAACTGTTCGCT  535

Query  524   TACGTGGATGTATCCTCATGTTTTCGACGATGCTGTAACGGAAAACTTTAAAAATTGGGT  583
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  536   TACTTGGATGTATCCTCATGTTTTCGACGATGCTGTTACGGAAAACTTTAAAAATTGGGT  595

Query  584   TATGGAAGAGGCAGTCAAGTTTCCTGGTGAAGACTCTGCCAAGAAGGAAGCCTCAGATTT  643
             ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| 
Sbjct  596   TATGGAAGAAGCAGTCAAGTTTCCTGGTGAAGACTCTGGCAGGAAGGAAGCCTCAGATTC  655

Query  644   TGAAATGTTAAAAACTTATTCTACAGGACTTCTTGCTCTCTCTCTGGCGAGTCGTGGGCA  703
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct  656   TGAAATGTTAAAGACTTATTCTACAGGACTTCTTGCTCTCTCTCTCGCCAGTCGTGGGCA  715

Query  704   AATAGTTGAAGACGTTTTGACATCAGGACTATCTGCTAAGCTTATGCATTATCTTCGAGT  763
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  716   AATAGTTGAAGACGTTTTGACATCAGGACTATCTGCTAAGCTTATGCATTATCTTCGAGT  775

Query  764   ACGAGTTCTTAAAGAGCCAAGCACAAGCCGT----A-----TACACACAACTGAGACTAA  814
             ||||||| ||  |||||||||||||||||||    |     | |||||||||||||||||
Sbjct  776   ACGAGTTATTGGAGAGCCAAGCACAAGCCGTAGAGATGCCCTTCACACAACTGAGACTAA  835

Query  815   GCACGTCTCCTTAAAAACCAAAGAAGAAGGTCGAAGTAGGGTGCGTAAGATTGTGGATAC  874
             ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  836   GCATGTGTCCTTAAAAACAAAAGAAGAAGGTCGGAGTAGGGTGCGTAAGGTTGTGGATAC  895

Query  875   AGTTGAAGGTGACCATGTTCTTGAGACGGACTCCGGAAGAGAGATGGGACAAACTGATGT  934
             ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct  896   AGTTGAAGGTGACCATGTTTTTGAGATGGACTCTGGCAGAGAGATGGGACAAACTGATGT  955

Query  935   ACAGCCTGATGGCGAATTCGAAATCGATGGCAGAGATGTATTTAATGTTTCAGGTGTTGT  994
             |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||
Sbjct  956   ACAGTCTGATGGTGAATTCGAAATCGATGGCAGAGAAATATTTAATGTTTCAGGTGTTGT  1015

Query  995   TGATTGTAAAATTAAACCTGGAGATGACAATAGTGTTAGAGATGACCCTTCAAGACACAG  1054
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||
Sbjct  1016  TGATTGTAAAATTAAACCTGGAGATGACAATAGTGGAAGAGATGACCCTTCAAGACACAG  1075

Query  1055  ACTGAACCGATCAAAATCAAGGGGGAGAGGAAGGGTTCACGAAGGTGCACCTGATACAGA  1114
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct  1076  ACTGAACCGATCAAAATCGAGGGGGAGAGGAAGGGTTAACGAAGGTGCAACTGATACAGA  1135

Query  1115  AGTTCTCTTGGCATCTCCTAGATTAGGTCGTCTACTTGTCAGAGATAGGGATCTATCAAA  1174
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  1136  AGTTCTCTTGGCATCTCCTAGATCAGGTCGTCTAGTTGTCAGAGATAAGGATCTATCAAA  1195

Query  1175  AATTTCAGATGGCAGAAATGCAGAAGACGTGACCGTATGTCTTGGGAAAATGAAGTCTGG  1234
             | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  1196  ATTTTCAGATGGCAGAAATGCAGAAGATGTGACCATATGTCTGGGGAAAATGAAGTCTGG  1255

Query  1235  TATTATGGAGATAGAAAGAGAGGATAACGATGAGTGCTTTCAAGGTTGCATAATAGGAAC  1294
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1256  TATTATGGAGATAGAAAGAGAGGATGACGATGAATGCTTTCAAGGTTGCATAATAGGAAC  1315

Query  1295  TAAAAACATAACTGATCTAGTAAAGAGAGCCGTTGGAGCTGCTGAAACCGAAGCTAGAGC  1354
              |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct  1316  GAAAAACATAATTGATCTAGTAAAGAGAGCCGTTGGAGCTGCAGAAACGGAAGCTAGAGC  1375

Query  1355  TGCCCATGCTCCTGATGACGCAGCTAAAGCAGCTGGCGATGCTGCTGCAGAGCTTGTTAA  1414
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  1376  TGCCCATGCTCCTGATGACGCAGCTAAAGCAGCTGGCGATGCTGCAGCAGAGCTTGTTAA  1435

Query  1415  AACTGCTGCTTTGGAGGAATTCAAGTCTTCTGGCAGTGAAGAAGCTGCTGTGTCTGCTGC  1474
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1436  AACTGCTGCTTTGGAGGAATTCAAGTCTTCTGGCAGTGAAGAAGCTGCTGTGTCGGCTGC  1495

Query  1475  TACTCGAGCAGCTATTACAGTCATAGATGCCGCAGAGGTTTCAAGAAATCCTACTTGTGT  1534
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1496  TACTCGAGCAGCTATTACAGTCATAGATGCTGCAGAGGTTTCAAGAAATCCTACTTGTGT  1555

Query  1535  CACATCTGATCAGACAACGGATGTTAGTGAAGTTTCCCTTCCAGATATCGAATCATTGGC  1594
             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1556  CACATCTGATCAGACAACAGATGTTAGTGAAGTTTCACTTCCAGATATCGAATCTTTGGC  1615

Query  1595  TCAGTTACAAGAAAAATATTGCATCCAGTGCCTTGAGATACTGGGAGAATATGTTGAGGT  1654
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  1616  TCAGTTACAAGAAAAATATTGCATCCAGTGCCTTGAGATACTGGGAGAATATGTCGAGGT  1675

Query  1655  TCTCGGGCCTGTACTCCATGAAAAAGGTGTTGATGTATGCATTGTGCTGCTGGAACGTAC  1714
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct  1676  TCTCGGGCCTGTACTCCATGAAAAAGGTGTTGATGTATGCATTATGCTACTGGAACGTAC  1735

Query  1715  ATCCCAGTTAGATGATCGTTCGACAGTGTCTCCTTTGTTACCTGATGTCATGAAGTTAAT  1774
             ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1736  ATCCCAGTTTGATGATAGTTCTACAGTGTCTCCTTTGTTACCTGATGTCATGAAGTTAAT  1795

Query  1775  TTGCGCTTTGGCTGCGCACCGGAAGTTTGCAGCAATGTTTGTTGAACGGCGTGGCATACT  1834
             |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| 
Sbjct  1796  TTGCGCTTTGGCTGCGCACCGGAAGTTTGCTGCGATGTTTGTTGACCGGGGTGGCATACA  1855

Query  1835  AAAATTACTTGCTGTTCCAAGGGTCTCTGAGACTTTTTATGGTCTCTCATCTTGCTTATA  1894
             |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1856  AAAATTACTTGCTGTTCCAAGGGTTTCTGAGACGTTTTATGGTCTCTCATCTTGCTTATA  1915

Query  1895  CACCATTGGCTCTCTTCAGGGTATAATGGAGCGTGTCTGTGCACTTCCATTGGTTGTCAT  1954
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||
Sbjct  1916  CACCATTGGCTCTCTTCAGGGTATAATGGAGCGTGTCTGTGCACTTCCATCGGATCTCAT  1975

Query  1955  ACATCAAGTTGTTAAATTAGCTATCGAACTTCTCGACTGTTCCCAGGATCAAGCCAGAAA  2014
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1976  ACATCAAGTTGTTAAATTAGCTATCGAACTTCTCGACTGTTCCCAGGATCAAGCCAGAAA  2035

Query  2015  AAATTCAGCTTTATTCTTTGCTGCTGCTTTTGTCTTCAGAGCCATTTTAGATGCATTTGA  2074
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2036  AAATTCAGCTTTATTCTTTGCTGCTGCTTTTGTCTTCAGAGCCATTTTAGATGCATTTGA  2095

Query  2075  TGCTCAGGATAGTTTGCAGAAACTCCTTGCAATTCTTAAAGATGCAGCCTCAGTTAGAAC  2134
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2096  TGCTCATGATAGTTTGCAGAAACTCCTTGCAATTCTTAAAGATGCAGCCTCAGTTAGAAC  2155

Query  2135  TGGTGCTAATACTGACCGATCAGCTCCTGAAGTCATGACGTCCTCAGAGAAGCAGATGGC  2194
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  2156  TGGTGCTAATTCTGACCGATCAGCTCCTGAAGTCATGACGTCCTCAGAGAAACAGATGGC  2215

Query  2195  TTTTCACACCTGTTTTGCTTTACGCCAGTATTTTAGAGCTCATCTCCTTTTGCTTGTTGA  2254
             ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  2216  TTTCCACACGTGTTTTGCTTTGCGCCAGTATTTTAGAGCTCATCTTCTTTTGCTTGTTGA  2275

Query  2255  TTCAATCCGTCCTAGCAGAATTAGCCGGGGTGGTGTGCCATCTTCAATGAAGCCTAATAT  2314
             |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |     ||||   ||||||||
Sbjct  2276  TTCAATCCGTCCTAGCAGAAGTAGCCGAGGTGGTGTGCGA-----AATGTT-CCTAATAT  2329

Query  2315  AAGGGCAGCCTATAAGCCCCTTGACATCAGCAATGAAGCTGTTGATGCCATCTTCCTTCA  2374
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  2330  AAGGGCAGCCTATAAGCCCCTTGACATCAGCAATGAAGCTGTTGATGCCATCTTCCATCA  2389

Query  2375  GTTACAGAAGGATAGGAGGTTGGGTCCGACCTTTGTGA-AAGCTCAGTGGCCTGCTGTCA  2433
             |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||
Sbjct  2390  GTTACAGAAGGACAGGAAGTTGGGTCCGACCTTTGTGAGAA-CTCAGTGGCCTGCTGTCA  2448

Query  2434  ATAATTTTTTGGCCTCCTCTGGACATGTTACCATGTTGGAACTTTGTCAGACTCCACCAG  2493
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2449  ATAACTTTTTGGCCTCCTCTGGACATGTTACCATGTTGGAACTTTGTCAGACTCCACCAG  2508

Query  2494  TAGATCGTTATCTGCATGATCTTCTTCAGTATGCTTTTGGGGTTCTTCACATAGTTACAT  2553
             |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2509  TAGACCGTTATCTGCATGATCTACTTCAGTATGCTTTTGGGGTTCTTCACATAGTTACAT  2568

Query  2554  CAATACCTGATGGCCGCAAAGCAATTGCACATGCCACACTCAGCAACAATCGTGCTGGCA  2613
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2569  CAATACCTGATGGCCGCAAAGCAATTGCGCATGCCACACTCAGCAACAATCGTGCTGGCA  2628

Query  2614  TTGCTGTCATTCTGGATGCAGCAAATATTTCCAACAGCATAGTAGACCCTGAGATCATCC  2673
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  2629  TTGCTGTCATTCTGGATGCAGCAAATATTTCCAACAGCATAGTAGACCCTGAGATCATTC  2688

Query  2674  AGCCTGCACTAAATGTCCTAATCAATCTGGTGTGCCCACCACCATCATTAAGCAATAAGC  2733
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2689  AGCCTGCACTAAATGTCCTAATCAATCTGGTGTGCCCACCACCATCATTAAGCAATAAGC  2748

Query  2734  CGCCCCTTGCACAAAATCATCAACCTGTTCCTGGCCAAGCCACTACCCGTCCCTCTACTG  2793
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2749  CGCCCCTTGCACAAAATCATCAACCTGTTCCCGGCCAAGCCACTACCCGTCCCTCTACTG  2808

Query  2794  ATGTTGCTGTAGGTACTCAGTCCACTGGTAATGCTCCGCAAACTCCTGTTGCACCAGCAT  2853
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2809  ATGTTGCTGTAGGTACTCAGTCCACTGGTAATGCTCCGCAAACTCCTGTTGCACCAGCAT  2868

Query  2854  CTTCAGGTTTGGTTGGGGATCGGAGAATTTTCTTAGGAGCAGGAACTGGTTCTGCTGGCC  2913
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2869  CTTCAGGTTTGGTTGGGGATCGGAGAATTTTCTTAGGAGCAGGAACTGGTTCTGCTGGCC  2928

Query  2914  TTGCTGCTAAGTTGGAGCAGGTTTATCGTCAAGCCCGTGAAGCTGTTCGTGGGAATGATG  2973
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2929  TTGCTGCTAAGTTGGAGCAGGTTTATCGTCAAGCCCGTGAAGCTGTTCGTGGGAATGATG  2988

Query  2974  GTATAAAAATTCTTTTAAAACTTCTTCAGCCCAGAATATATGTAAATCCTCCTGCTACCC  3033
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct  2989  GTATAAAAATTCTTTTAAAACTTCTTCAGCCCAGAATATATGTGAATCCCCCTGCTACCC  3048

Query  3034  CAGATTGTCTACGAGCGCTAGCTTGCAGGGTACTTCTTGGTCTGGCTAGAGATGATACAA  3093
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3049  CAGATTGTCTACGAGCGCTGGCTTGCAGGGTACTTCTTGGTCTGGCTAGAGATGATACAA  3108

Query  3094  TTGCACAAATACTGACTAAACTTGAGGTTG  3123
             |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  3109  TTGCACAAATACTGACTAAACTTGAGATTG  3138


 Score = 2730 bits (1478),  Expect = 0.0
 Identities = 1705/1810 (94%), Gaps = 34/1810 (2%)
 Strand=Plus/Plus

Query  4061  GCGAAGGAATTCAACCTTTGCGGATGGCTCAGGTTTGCAAACACCAGCTTCAGCTTTAGA  4120
             ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4013  GCGTAGGAATTCAACCATTGCGGAAAGCTCAGGTTTGCAAACACCAGCTTCAGCTTTAGA  4072

Query  4121  TGCCAACCAATCTGGGAGTTCCAGACTGGGCCAAATGACACCTGCTTCTCAGCTACGGCT  4180
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  4073  TGCCAACCAATCTGGGAGTTCCAGACTGGGCCAGATGACACCTGCTTCTCAGCTAAGGCT  4132

Query  4181  TCCAAGTGATCCCCAGCCTTCAAATCCAGAACGGTTATCACTAGACTCCCTTGTGGTTCA  4240
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4133  TCCAAGTGATCCCCAGCCTTCAAATCCAGAACGGTTATCACTAGACTCCCTTGTGGTTCA  4192

Query  4241  GTATCTAAAGCACCAACACAGGCAGTGTCTGGCTCCAATCACAACTCTTCCCCCTGTGTC  4300
             |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4193  GTATTTGAAGCACCAACACAGGCAGTGCCTGGCTCCAATCACAACTCTTCCCCCTGTGTC  4252

Query  4301  TCTCCTACATCCACATGTCTGTCCTGAACCTAAACGGTTACTTGAAGCTCCACTAAACAT  4360
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4253  TCTCCTACATCCGCATGTCTGTCCTGAACCTAAACGGTTACTTGAAGCTCCACTAAACAT  4312

Query  4361  GACTGGCCGTCTTGGGACCCGTGAGCTTCAAAGTTTCTACAGTGGAGTCCATGGGAATCG  4420
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4313  CACTGGCCGTCTTGGGACCCGTGAGCTTCAAAGTTTCTACAGTGGAGTCCATGGGAATCG  4372

Query  4421  CAGGGATCGTCAGTTTGTTTTCAGCAGATTCAAATCTTGGAGATCTTTCCGGGATGAGAC  4480
             |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4373  CAGGGATCGTCAATTTGTTTTCAGCAGATTCAAATCTTGGAGATCTTTCCGGGATGAGAC  4432

Query  4481  TGCTCTCTTTACATGCATTGCACTTCTTGGCGGTACTAATCATATAGCAGTCGGTAGTCA  4540
             |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  4433  TGCTCTCTTTACATGCATTGCACTTCTTGGTGGTACTAATCATTTAGCAGTCGGTAGTCA  4492

Query  4541  TGCTGGAGAAATCAAGATATTTGAAGCTAGCAGCGGTAGCATGCTTGAGAGTGTCTCAGG  4600
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||
Sbjct  4493  TGCTGGAGAAATCAAGATATTTGAAGCTAGCAGCGGTACCTTGCTTGAGAGTTTCTCAGG  4552

Query  4601  TCACCAGGCTCCGGTTACACTTGTTCAGCCGTATGTCTCTCGTGATACTCAGTTGTTACT  4660
             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct  4553  TCACCAGGCTCCGGTTACGCTTGTTCAGCCGTATGTCTCTGGGGATACTCAGTTGTTACT  4612

Query  4661  TTCTTCGAGCTCCAGTGATGTACAGTTGTGGGACGCGTCTTCTATAACTGGTGGGCCTAG  4720
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4613  TTCTTCGAGCTCCAGTGATGTACAGTTGTGGGACGCGTCTTCTATAACTGGTGGGCCTAG  4672

Query  4721  ACACTCCTTTGATGGATGCAAGGCTGCAAAATTCAGCAACTCTGGGCTACAATTTGCAGC  4780
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4673  ACACTCCTTTGATGGATGCAAGGCTGCAAAATTCAGCAACTCTGGGCTACAATTTGCAGC  4732

Query  4781  GCTTTCTTGTGAAGCATCT-AGAAAAGATGTTCTTCTATATGACGTACAGACCTGCAGCC  4839
              |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct  4733  ACTTTCTTGTGAAGCAT-TGACAAAAGATGTTCTTCTATATGATGTACAGACCTGCAGTC  4791

Query  4840  CTTGCCAAAAACTCACTGACACAGTCACATCCTCTCGAAGTAATCCCTATTCTCTTGTGC  4899
             ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  4792  CTTGCGATAAACTCACTGACACAGTCACATCTTCTCGAAGTAATCCCTATTCTCTTGTAC  4851

Query  4900  ACTTCAGCCCTTGCGATACACTGATTTTGTGGAATGGTGTTCTCTGGGACCGCCGTATCC  4959
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4852  ACTTCAGCCCTTGTGATACACTGATTTTGTGGAATGGTGTTCTCTGGGACCGCCGTATCC  4911

Query  4960  CCGAGAAGGTCAGACGGTTTGATCAATTTACTGATTATGGCGGAGGTGGGTTTCATCCTT  5019
             |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct  4912  CCGAGTCTGTCAGTCGGTTTGATCAATTTACTGATTATGGCGGCGGTGGTTTTCATCCTT  4971

Query  5020  CTAGGAACGAGGTGATCATAAACTCAGAGATCTGGGACATGAGGACTTTCAAACTTCTTC  5079
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||
Sbjct  4972  CTAGGAACGAGGTGATCATAAACTCAGAGGTCTGGGACATGAGGAATTTCAAGCTTCTTC  5031

Query  5080  GGAGTGTACCATCACTGGACCAGACAGCTATTACGTTCAACTCTAGGGGAGATGTTATAT  5139
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  5032  GAAGTGTACCATCACTGGACCAGACAGCTATTACGTTCAACTCCAGGGGAGATGTTATAT  5091

Query  5140  ACGCAATGCTGAGGAGAAACATCGAGGACGTTATGTCAGCGGTTCACACACGCCGTGTGA  5199
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct  5092  ACGCAATGCTGAGGAGAAACATCGAAGACGTTATGTCTGCAGTTCACACACGCCGTGTGA  5151

Query  5200  AACATCCCTTGTTTGCTGCTTTCCGCACTCTTGATGCGATCAACTACTCAGACATTGCCA  5259
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5152  AACATCCCTTGTTTGCTGCTTTCCGCACTCTTGATGCGATCAACTACTCAGACATTGCCA  5211

Query  5260  CTATACCTGTAGACCGGTGTCTTCTTGACTTTGCCACAGAACCAACAGATTCGTTCCTTG  5319
             |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5212  CTATACCTGTGGACCGATGTCTTCTTGACTTTGCCACAGAACCAACAGATTCGTTCCTTG  5271

Query  5320  GGCTGATCACAATGGAAGACCAAGAAGATATGTTTTCCTCGGCCAGGATGTATGAGATTG  5379
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5272  GACTGATCACAATGGAAGACCAAGAAGATATGTTTTCCTCGGCCAGGATGTATGAGATTG  5331

Query  5380  GTAGAAGGAGACCAACagatgatgactcggatcccgatgatgatgatgagacggaagatg  5439
             ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  5332  GTAGACGGAGGCCAACAGATGATGACTCGGATCCCGATGATGATGATGAGACGGACGATG  5391

Query  5440  aagatgaagatgatgaaga--ag-aagatgaCCTGGACCGAATTCTGGGACTAGCTGGAG  5496
             |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct  5392  AAGATGAAGATGATGAAGACGAGGAAGATGACCTGGACCGAATTCTGGGACTAGGTGTAG  5451

Query  5497  ACAATAGCGATAGTGGGGATGATGACCTTAGCAGCGAGGACAATGAAGATAGTGTGAGCG  5556
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  5452  ACGATAGCGATAGTGGGGATGATGACCTTAGCAGCGACGACAATGAAGATAGTGTGAGCG  5511

Query  5557  ATTTTGATGAAGAAGCAGATATTCT-C---A---T-T-GACGGTGACTTTATGGAGGAGC  5607
             |||||||||||| || ||| ||||| |   |   | | ||||||| |||||||| |||  
Sbjct  5512  ATTTTGATGAAGGAGGAGAGATTCTTCTTGACGGTCTTGACGGTGGCTTTATGG-GGA--  5568

Query  5608  TTATAGAAGGTGAAAATGAAGACGATGGTAATGGTGAG-GATG---AGGATGATGATGAC  5663
             |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| | ||||   ||||||||||||| 
Sbjct  5569  TTATAGAAGGTGAGGATGAAGACGATGATAATGGTG-GTGATGGTGAGGATGATGATGAT  5627

Query  5664  GACGGTGAGATGCAGGATTTCATGAGCAGTGGGGAAGAGGATGATTATAGAGACAACATT  5723
             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct  5628  GACGGTGAGATGCAGGATTTCATGAGCAGTGGCGAAGAAGATGATTATAGAGACAATATT  5687

Query  5724  CGTTCTTCCTAAGtttttttttGTTTTATAAATTTTATTTACTTCTGGGCTCTCTACAGA  5783
             ||||||||||||| ||||||       |||  | || ||||||| || | | ||||||||
Sbjct  5688  CGTTCTTCCTAAGGTTTTTT-------ATA--TCTTGTTTACTTTTGAG-T-TCTACAGA  5736

Query  5784  TCACTAAGATGGATTTTTACTATCCAAAATTTTGATGATAAGTTCTTGTATTATTTTTTC  5843
             || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5737  TCTCTAAGATGGATTTTTACTATCCAAAGTTTTGATGATAAGTTCTTGTATTATTTTTTC  5796

Query  5844  TTTGTTCAAG  5853
             |||||| |||
Sbjct  5797  TTTGTT-AAG  5805


 Score = 1310 bits (709),  Expect = 0.0
 Identities = 797/839 (95%), Gaps = 8/839 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  3230  GATTGTGACAAATTCAGGGCATGCAACTACACTAACAGCCAGTGATGCTGCTACTCCAAC  3289
             |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  3134  GATTGTGACAAATTCAGGGCATGCGACTACACTGACAGCCAGCGATGCTGCTACTCCAAC  3193

Query  3290  ACTGAGGCGCATTGAAAGAGCTGCCATTGCAGCAGCAACGCCTATAACTTATGATTCTAA  3349
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3194  ACTGAGGCGCATTGAAAGAGCTGCCATTGCAGCAGCAACGCCTATAACTTATGATTCTAA  3253

Query  3350  GGAGCTTTTACTGCTTATCCATGAGCATCTCCAGGCATCAGGTCTTGGTGATACAGCTTC  3409
             ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct  3254  GGAGCTTTTGCTGCTTATCCATGAGCACCTCCAGGCATCAGGTCTTGGTGAAACTGCTTC  3313

Query  3410  AGCACTGTTAAAAGAGGCTCAATTAACTCCTCTACCTTCATCGGCTTCCCCTTCTTCTAT  3469
             ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  3314  AGCACTGTTAAAAGAAGCTCAATTAACTCCTCTACCTTCATTGGCTTCCCCTTCTTCTAT  3373

Query  3470  TGCATATTCCACTACACAGGAGATGTCTACGCCGCTAGCTCAGGAACAATGGCCCTCTGG  3529
             |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  3374  TGCATATTCCTCTACACAGGAGATGTCTACGCCGCTAGCTCAAGAACAATGGCCCTCTGG  3433

Query  3530  CCGTGCTAACAGTGGATTTTTCACCAGCAAACCCAAGGTCTGTGCACATGACGAAGATCC  3589
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  3434  CCGTGCTAACAGTGGATTTTTCACCAGCAAACCCAAAGTCTGTGCACATGACGAAGATCC  3493

Query  3590  AAATTCTAGATCTAATGCAGCTCTATCTGCCAAGAAGAAGCATTTGGCTTCCTCGACACT  3649
              |||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3494  TAATTCTAGATGTAATGCGGCTATATCTGCCAAAAAGAAGCATTTGGCTTCCTCGACACT  3553

Query  3650  GGAGATGCCCACACCAGTAGCACAGCAACAATGGCCATCAGGCCGTGCTAACTGTGGTTT  3709
             |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  3554  GGAGATACCCACACCAGTAGCACAGCAACAGTGGCCATCAGGCCGTGCTAACAGTGGTTT  3613

Query  3710  TTGT-CCCAGCATACCCAAAATCAATGCACGTGATGAAGATCCTAGTTCGAGAGGTAACG  3768
             || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3614  TT-TCCCCAGCATACCCAGAATCAATGCACTTGATGAAGATCCTAGTTCGAGAGGTAACG  3672

Query  3769  CAGCTCCATCTGCAAAGAAGAAACAGTTGACTTTCTCACCCAGTTTTAGTTCGCAGTCAA  3828
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| 
Sbjct  3673  CAGCTCCATCTGCAAAGAAGAAGCAGTTGACTTTCTCACCCAGTTTTAGTTTGCAGTCAC  3732

Query  3829  GAAAACAATCTTTCTCCCATGACGCTCTACCTCAGTCTACACAGAGAATAAATTGTTGTT  3888
             |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct  3733  GAAAGCAATCTCTCTCCCATGACGCTCAACCTCAGTCTACACAGAGAATAAATAGTAGTT  3792

Query  3889  CGAATTCAGATCCTGCTTTGGCAGATACATCAGAAACTGCTGCAGAATTAGTTTTGAAGA  3948
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3793  CGAATTCAGATCCTGCTTGGGCAGATACATCAGAAACTGCTGCAGAATTAGTTTTGAAGA  3852

Query  3949  ACGACCTTGATGCCGATGCTCAATTTAAGACCCCGATTTCCTTTCCAAGAAAACGGAAGT  4008
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  3853  ACGACCTTGATGCCGATGCTCAATTTAAGACCCCGATTTCCTTTCCAAGAAAACGGAAAT  3912

Query  4009  TGTCTGAGCTTAGAGACTC-G--T---CAGTTCCGGGTAAAAGAATCGATTTGGGTGAG  4061
             ||||||||||||||||| | |  |   |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  3913  TGTCTGAGCTTAGAGACCCAGAGTTGTCAGTTCCGGGTAAAAGAATCAATTTGGGTGAG  3971



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 222408456612


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5