BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G32640.1 Length=3942 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg491448 jgi|Araly1|491448|fgenesh2_kg.7__881__AT4G32640.2 5515 0.0 Ahg484854 jgi|Araly1|484854|fgenesh2_kg.5__846__AT3G44340.1 1746 0.0 > Ahg491448 jgi|Araly1|491448|fgenesh2_kg.7__881__AT4G32640.2 Length=3458 Score = 5515 bits (2986), Expect = 0.0 Identities = 3246/3371 (96%), Gaps = 19/3371 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 TGTGAATTTTCTGTCTTCTCTTACGGACAACAAAATTTTAGTTTTTATCAGTCGTCTGAA 60 ||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| Sbjct 1 TGTGAATTTTCTGTC-T-TC-TACGGACAACAAATTTTTAGTTTTGATTGGTCGTCTGAA 57 Query 61 TCCTGTGACAGACACCGACGCCGTTAACCGTCGTCGCTGTCG-CTGTGTCTCTCTTTCTC 119 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||| Sbjct 58 TCCTGTGACACACACCGACGCCGTTAACCGTCGTCGCTGT-GTATCTCTCTCTCTTTCTC 116 Query 120 ACTCTGTTCCATAGATCTGAGCTTCTATCAATA-TTCTCGGATCGCTATCAGTCAAATCT 178 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| Sbjct 117 ACTCTGTTCCATAGATCTGAGCTTCTACCAATATTTC-CCGATCGCTATCAGTCAAATCT 175 Query 179 T---AAGAATTTCGTCGCTTTAGCTCAATTCGGACTTTAGATTGTGGAGGAA-GTTTTAG 234 | ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| || ||||| | Sbjct 176 TAAGAAGAATTTCCACGCTTTAGCTCAATT----C---AGATTGTTGAGCAAGGTTTT-G 227 Query 235 GATTTGATCTCCATCTCGTATCCAAGCATGGTTGCTCCTGTGCCTCCAGGGGCACCTAGA 294 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 228 GGTTTGATCTCCATCTCGTATCCAAGCATGGTTGCTCCTGTGCCTCCAGGGCCACCTAGA 287 Query 295 CCCAACAGCCAGCAAAATTCCGGGCCACCTAATTTCTACCCGGGTTCACAAGGGAACTCA 354 |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 288 CCCAACAGTCAGCAAAATTCCGGGCCACCAAATTTCTACCCGGGTTCACAAGGGAACTCA 347 Query 355 AATGCTTTAGCCGACAATATGCAGAACTTGAGCTTGAATCGACCACCTCCGATGATGCCT 414 ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 348 AATTCTTTAGCCGACAATATCCAGAATTTGAGCTTGAATCGACCACCTCCGATGATGCCT 407 Query 415 GGCTCAGGTCCTAGACCACCTCCTCCTTTTGGTCAGTCACCACAGCCTTTCCCTCAGCAA 474 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 408 GGCTCAGGTCCTAGACCACCTCCTCCTTTTGGTCAGTCTCCACAGCCTTTCCCTCAGCAA 467 Query 475 TCCCCTTCTTATGGAGCTCCGCAACGTGGGCCTTCACCCATGTCCCGGCCTGGACCTCCA 534 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 468 TCCCCTTCTTATGGAGCTCCTCAACGTGGGCCTTCACCCATGTCCCGGCCTGTACCTCCT 527 Query 535 GCTGGCATGGCGAGACCAGGTGGTCCGCCTCCTGTATCACAACCAGCTGGGTTTCAGTCA 594 ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 528 GCTGGGATGGCGAGGCCAGGTGGTCCCCCTCCGGTATCACAACCAGCTGGATTTCAGTCA 587 Query 595 AATGTACCCTTGAACAGACCCACTGGTCCACCTTCTCGTCAGCCATCATTTGGGTCTAGA 654 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| Sbjct 588 AATGTACCCTTGAACAGACCCACTGGTCCACCTTCTAGTCAGCCACCATTTGGCTCTAGA 647 Query 655 CCTTCAATGCCTGGAGGACCAGTGGCGCAGCCTGCCGCCTCTTCTAGTGGTTTTCCAGCT 714 || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 648 CCGTCAATGCCTGGAGGACCAGTGCCGCAGCCTGCCGCCTCATCTAGTGGTTTTCCAGCT 707 Query 715 TTTGGTCCATCAGGTAGTGTAGCTGCAGGTCCTCCTCCAGGATCTCGCCCAATGGCATTT 774 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 708 TTTGGTCCATCAGGTAGTGTAGCTGCAGGTCCTCCTCCAGGAGCTCGCCCAATGGCATTT 767 Query 775 GGTTCACCTCCACCTGTCGGATCTGGCATGTCTATGCCTCCCTCAGGCATGATTGGTGGT 834 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 768 GGTTCACCTCCACCTATCGGATCTGGCATGTCTATGCCTCCCTCAGGCATGCTTGGTGGT 827 Query 835 CCAGTCAGTAATGGGCATCAAATGGTTGGTTCAGGGGGATTTCCGAGGGGAACCCAGTTC 894 ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 828 CCAGTCAGTAATGGGCATCAAATGGCTGCTTCAGGGGGATTTCCGAGGGGAACCCAGTTC 887 Query 895 CCCGGTGCTGCTGTTACAACTCCACAGGCACCCTATGTGCGGCCTCCTTCAGCACCTTAC 954 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | Sbjct 888 CCCGGTGCTGCTGTTACAACTCCACAGTCACCCTATATGCGGCCTCCCTCAGCACCTTTC 947 Query 955 GCTCGGACTCCTCCGCAGCCACTAGGTTCACATTCTCTTTCCGGAAATCCACCATTAACT 1014 |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | Sbjct 948 GCTCGGGCTCCTCCGCAGCCACTAGGTACACATTCTCTTTCTGGAAATCCACCATTAAAT 1007 Query 1015 CCGTTTACTGCTCCTTCAATGCCCCCACCAGCAACCTTTCCTGGAGCCCCTCATGGCAGG 1074 | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1008 CTGTCTACTGCTCCTTCAATGCCCCCACCGGCAACCTTTCCTGGAGCCCCTCATGGCAGG 1067 Query 1075 CCAGCGGTATCAGGCTTGCCTTATGGTCCACCATCAGCGCAGGTTGCCCCACCTCTAGGC 1134 |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| Sbjct 1068 CCAGCGGTATCAAACTTGCCTTACGGTCCACCATCAGCGCAGGTCCCCCCTCCTCTAGGC 1127 Query 1135 TTTCCTGGTCAAATGCAACCACCAAGATATGGGATGGGTCCTTTGCCAAATCAGTCGATG 1194 |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1128 TTTCCTGGCCCAATGCAACCACCAAGATATGGCATGGGTCCTTTGCCAAATCAGTCGATG 1187 Query 1195 ACCAACATACCCACTGCCATGGGCCAACCTGGTGCCACTGTTCCTGGACCCTCAAGAATT 1254 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1188 ACCAACATACCCACTGCCATGGGCCAACCCGGTGCCTCTGTTCCTGGACCCTCAAGAATT 1247 Query 1255 GATCCTAATCAAATCCCAAGGCCAGGTTCAAGCTCCAGCCCAACTGTATTTGAAACTCGC 1314 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1248 GATCCTAATCAAATCCCAAGGCCAGGTTCAAGCTCCAGCCCAACTGTGTTTGAAACTCGC 1307 Query 1315 CAGAGTAATCAGGCTAATCCTCCCCCGCCTGCTACTAGTGATTATGTTGTTCGAGACACC 1374 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1308 CAGAATAATCAGGCTAATCCTCCCCCGCCTGCTACTAGTGATTATGTTGTTCGAGACACT 1367 Query 1375 GGAAATTGTAGTCCCCGTTACATGAGGTGTACCATCAATCAGATCCCATGTACAGTTGAT 1434 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1368 GGAAATTGTAGTCCCCGTTACATGAGGTGTACGATCAATCAGATCCCATGTACAGTTGAT 1427 Query 1435 CTTCTATCTACATCTGGAATGCAACTGGCGTTGATGGTCCAACCGCTGGCGCTTTCTCAT 1494 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1428 CTTCTATCTACATCTGGAATGCAACTGGCGTTGATGGTCCAACCTCTGGCGCTTTCTCAT 1487 Query 1495 CCATCTGAAGAGCCTATACAAGTTGTGGACTTTGGTGAGGGTGGGCCTGTTCGATGTTCA 1554 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1488 CCATCTGAAGAGCCTATACAAGTTGTGGACTTTGGTGAGGGTGGGCCTGTTCGATGTTCA 1547 Query 1555 CGCTGTAAGGGTTACATAAATCCTTTCATGAAGTTCATTGACCAAGGAAGGAAGTTCATC 1614 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1548 CGCTGTAAGGGTTACATAAATCCTTTCATGAAGTTCATTGACCAAGGAAGGAAGTTCATC 1607 Query 1615 TGTAATTTCTGTGGATACACTGATGAGACTCCCCGTGACTATCACTGTAATCTGGGTCCA 1674 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1608 TGTAATTTCTGTGGATACACTGATGAGACTCCCCGTGACTATCACTGTAATCTGGGTCCA 1667 Query 1675 GATGGTAGACGTAGGGATGTTGATGAAAGACCTGAGCTGTGTAGGGGAACCGTTGAGTTT 1734 ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1668 GATGGTAGACGCAGGGACGTTGATGAAAGACCTGAGCTGTGTAGGGGAACCGTTGAGTTT 1727 Query 1735 GTTGCTACAAAAGAATACATGGTACGGGATCCAATGCCAGCAGTATATTTTTTCCTCATT 1794 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1728 GTTGCTACAAAAGAATACATGGTACGGGATCCAATGCCAGCAGTGTATTTTTTCCTCATT 1787 Query 1795 GATGTCTCAATGAATGCGATACAAACAGGTGCTACTGCCGCTGCTTGCAATGCAATCCAG 1854 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1788 GATGTCTCAATGAATGCGATACAAACAGGTGCTACTGCCGCTGCTTGCAATGCAATCCAG 1847 Query 1855 CAAGTACTTTCAGACCTTCCTGAAGGTCCTAGGACATTTGTTGGGATTGCTACATTTGAC 1914 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1848 CAAGTACTTTCAGACCTTCCTGAAGGTCCTAGGACATTTGTTGGGATTGCTACGTTTGAC 1907 Query 1915 TCAACAATCCACTTCTATAATTTGAAACGTGCACTGCAGCAGCCATTGATGCTCATTGTC 1974 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1908 TCAACAATCCACTTCTATAATTTGAAACGTGCACTGCAGCAGCCATTGATGCTCATTGTC 1967 Query 1975 CCTGATGTACAAGATGTCTATACACCTTTAGAAACAGATGTTGTAGTTCAGCTATCTGAG 2034 ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| Sbjct 1968 CCTGATGTACAAGATGTTTATACACCATTAGAAACAGATGTCATTGTTCAGCTATCTGAG 2027 Query 2035 TGCCGTCAACACCTAGAGCTTTTGCTGGATAGTATCCCAACGATGTTTCAGGAAAGTAAA 2094 ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2028 TGCCGTCAACATCTGGAGCTTTTGCTGGATAGTATCCCAACGATGTTTCAGGAAAGTAAA 2087 Query 2095 ATTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTTAAGGCTGCTTTCTTGGCGATGAAGAGCAAA 2154 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2088 ACTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTTAAGGCTGCTTTCTTGGCGATGAAGAGCAAA 2147 Query 2155 GGAGGGAAGCTTATGGTATTTCAATCAATTTTGTGTTCTGTTGGTGTTGGAGCACTTTCT 2214 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2148 GGAGGGAAGCTTATGGTATTTCAATCAATTTTGTGTTCTGTTGGTGTTGGAGCACTTTCT 2207 Query 2215 TCTAGAGAGGCCGAAGGGAGAGCTAATATGTCTGCTGGTGAAAAGGAGGCCCATAAATTA 2274 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2208 TCTAGAGAGGCTGAAGGGAGAGCTAATATGTCTGCTGGTGAAAAGGAGGCCCATAAATTA 2267 Query 2275 CTACAACCAGCAGACAAAACTCTAAAGACCATGGCTATTGAATTTGCTGAATACCAGGTC 2334 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2268 CTACAACCGGCAGACAAAACTCTAAAGACCATGGCTATTGAATTTGCTGAATACCAGGTC 2327 Query 2335 TGTGTAGATATATTTATCACAACTCAGGCCTATGTTGACATGGCTTCAATTTCCGTTATT 2394 ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2328 TGTGTTGATATATTTATCACAGCTCAGGCCTATGTTGACATGGCTTCAATTTCCGTCATT 2387 Query 2395 CCAAGAACTACTGGAGGACAGGTGTATTGTTATTACCCTTTCTCAGCTCTCTCAGATCCT 2454 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2388 CCAAGAACTACTGGAGGACAGGTGTATTGTTATTACCCTTTCTCAGCTCTCTCAGATCCT 2447 Query 2455 CCCAAGCTTTACAATGATCTTAAATGGAATATTACTAGGCCACAGGGTTTTGAGGCTGTC 2514 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2448 CCCAAGCTTTACAATGATCTTAAATGGAATATTACTAGGCCACAGGGTTTTGAGGCTGTC 2507 Query 2515 ATGCGAGTCAGATGCAGCCAGGGTATTCAAGTGCAAGAATACTCTGGGAATTTCTGCAAA 2574 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2508 ATGCGAGTCAGATGCAGCCAGGGTATTCAAGTGCAAGAATACTCGGGGAATTTCTGCAAA 2567 Query 2575 CGCATTCCAACTGACATTGATCTACCAGCGCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCGGAA 2634 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2568 CGCATTCCAACTGACATTGATCTACCAGCGCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCTGAA 2627 Query 2635 TGTGCTTTCCAGTGCGCCCTTCTGTATACTACAATATATGGAGAAAGAAGAATTAGGGTT 2694 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2628 TGTGCTTTCCAGTGCGCCCTTCTGTATACTACAATATATGGAGAAAGAAGAATTAGGGTT 2687 Query 2695 ACCACATTATCACTCTCCTGTACAAACATGCTCAGTAATTTGTTTCGCGCAGCTGACTTA 2754 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2688 ACCACATTATCACTCTCCTGTACGAACATGCTCAGTAATTTGTTTCGCGCAGCTGACTTA 2747 Query 2755 GATTCTCAATTTGCTTGTATGCTGAAACAAGCGGCTAATGAAATTCCTTCGAAGGCACTT 2814 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2748 GATTCTCAATTTGCTTGTATGCTGAAACAAGCGGCGAATGAAATTCCTTCGAAGGCACTT 2807 Query 2815 CCACTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAATAGTTGCATAAATGCACTCTATGCCTACCGTAAA 2874 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2808 CCACTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAATAGTTGCATAAATGCACTCTATGCCTACCGTAAA 2867 Query 2875 TTTTGTGCTACAGTGACATCATCTGGACAACTTATTCTTCCCGAGGCGCTCAAGCTATTT 2934 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2868 TTTTGTGCTACAGTGACATCATCTGGACAACTTATTCTTCCCGAGGCGCTCAAGCTATTT 2927 Query 2935 CCATTATACACTCTCGCATTGACCAAAAGTGTGGGTTTAAGGACGGATGGAAGAATTGAT 2994 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2928 CCATTATATACTCTCGCATTGACCAAAAGTGTGGGTTTAAGGACGGATGGGAGAATTGAT 2987 Query 2995 GATCGATCATTCTGGATCAACTATGTGTCTTCCCTTTCTACTCCTTTGGCAATCCCATTG 3054 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2988 GATCGATCATTCTGGATTAACTATGTATCTTCCCTTTCTACTCCTTTGGCAATCCCATTG 3047 Query 3055 GTTTATCCGAGAATGATTTCTGTTCACGACCTTGATGTGAAGGACACTGAGGGATCGGTC 3114 |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| Sbjct 3048 GTTTATCCCAGGATGATTTCTGTTCACGACCTTGATGCGAAGGACAATGAGGGATCGGTT 3107 Query 3115 CTTCCTCCTCCAATCCCATTGTCAGGTGAACACATTAGCAATGAGGGAGTTTATTTTCTT 3174 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3108 CTTCCTCCTCCAATCCCATTGTCAAGTGAACACATTAGCAATGAGGGAGTTTATTTTCTT 3167 Query 3175 GAGAATGGTGAAGACGGTCTACTATTTGTTGGCGAATCAGTAGACTCTGATATTCTGCAG 3234 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3168 GAGAATGGTGAAGACGGTCTACTATATGTTGGCGAATCAGTAGACTCTGATATTCTGCAG 3227 Query 3235 AAACTTTTTGCTGTTTCTTCAGCTGCTGAAATTCCTAACCAGTTTGTGCTGCAGCAGTAT 3294 |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| Sbjct 3228 AAACTTTTTGGTGTTCCTTCAGCTGCTGAAATTCCTAGCCAGTATGTGCTGCAGCAGTAT 3287 Query 3295 GATAATCAGTTATCAAAGAAATTCAATGATGCGGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGATGT 3354 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3288 GATAATCAGTTATCAAAGAAGTTCAATGATGCTGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGATGT 3347 Query 3355 TCTTACCTAAG 3365 ||||||||||| Sbjct 3348 TCTTACCTAAG 3358 Score = 139 bits (75), Expect = 1e-31 Identities = 98/108 (91%), Gaps = 6/108 (6%) Strand=Plus/Plus Query 3518 AGGAGTCCTTACAGAAGTTTCCTCCCATCTGCATCTGTGTCATGTTCGGAATTTGCGGTA 3577 ||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||| |||| Sbjct 3357 AGGAGTCCTTACAGAAGTTTCGT--C--C--CATCTGTGTCATGTACGGAATTTGTGGTA 3410 Query 3578 GAAAAGCATAGCAGAAGGGGAAAGGGCATCGGTCTTATGGCTGCTTGA 3625 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3411 GAAAAGCATAGCAGAAGGGGAAAGGGCATTGGTCTTATGGCTGCTTGA 3458 > Ahg484854 jgi|Araly1|484854|fgenesh2_kg.5__846__AT3G44340.1 Length=3669 Score = 1746 bits (945), Expect = 0.0 Identities = 1232/1371 (90%), Gaps = 18/1371 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1243 CCCTC-AAGAATTGATCCT-AATCAAATCCCAAGGCCAGGTTCAAGCTCCAGCCCAA-C- 1298 ||||| ||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| | Sbjct 1087 CCCTCAAAG-ATTGAT-CTGAATCAGATACCAAGGCCAGGTTCAAGCTCCAGTCCAATCA 1144 Query 1299 TGTATTTGAAACTCGCCAG-AGTAATCAGGCTAATCCTCCCCCGCCTGCTACTAG-TGAT 1356 |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||| Sbjct 1145 TGTA--TGAAACTCGTGTGCAG-AATCAGGCTAATCCTCCACCACCTACTACT-GTTGAT 1200 Query 1357 TATGTTGTTCGAGACACCGGAAATTGTAGTCCC-CGTTACATGAGGTGTACCATCAATCA 1415 ||| || | | ||||| ||||||| || ||| ||||||||| | || || |||||||| Sbjct 1201 TATATTACTAGGGACACTGGAAATTCCAG-CCCGCGTTACATGCGATGCACAATCAATCA 1259 Query 1416 GATCCCATGTACAGTTGATCTTCTATCTACATCTGGAATGCAACTGGCGTTGATGGTCCA 1475 |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| Sbjct 1260 GATCCCTTGCACTGTTGATCTTCTATCTACATCTGGTATGCAACTGGCGTTAATAGTCCA 1319 Query 1476 ACCGCTGGCGCTTTCTCATCCATCTGAAGAGCCTATACAAGTTGTGGACTTTGGTGAGGG 1535 ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | Sbjct 1320 ACCAATGGCACTTTCTCATCCATCTGAAGAGCCTATCCAAGTTGTGGACTTTGGTGAGAG 1379 Query 1536 TGGGCCTGTTCGATGTTCACGCTGTAAGGGTTACATAAATCCTTTCATGAAGTTCATTGA 1595 ||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 1380 TGGCCCTGTTAGATGTTCACGTTGTAAGGGCTACATGAATCCTTTTATGAAGTTCATTGA 1439 Query 1596 CCAAGGAAGGAAGTTCATCTGTAATTTCTGTGGATACACTGATGAGACTCCCCGTGACTA 1655 |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1440 CCAAGGAAGGAAGTTCATATGTAACTTGTGTGGATACACTGATGAGACTCCTCGTGACTA 1499 Query 1656 TCACTGTAATCTGGGTCCAGATGGTAGACGTAGGGATGTTGATGAAAGACCTGAGCTGTG 1715 || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct 1500 CCAATGTAATCTGGGTCCAGATGGTAGACGTAGGGATGCTGATGAAAGGCCTGAGCTGTG 1559 Query 1716 TAGGGGAACCGTTGAGTTTGTTGCTACAAAAGAATACATGGTACGGGATCCAATGCCAGC 1775 ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| Sbjct 1560 TAGGGGAACTGTTGACTTTGTTGCTACAAAAGAATATATGGTACGAGATCCAATGCCAGC 1619 Query 1776 AGTATATTTTTTCCTCATTGATGTCTCAATGAATGCGATACAAACAGGTGCTACTGCCGC 1835 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || Sbjct 1620 AGTATATTTCTTCCTCATTGATGTCTCAATGAATGCGATTCAAACAGGTGCAACTGCAGC 1679 Query 1836 TGCTTGCAATGCAATCCAGCAAGTACTTTCAGACCTTCCTGAAGGTCCTAGGACATTTGT 1895 | |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1680 TACTTGCAGTGCAATCCAGCAAGTCCTCTCAGACCTTCCTGAAGGTCCTAGGACATTTGT 1739 Query 1896 TGGGATTGCTACATTTGACTCAACAATCCACTTCTATAATTTGAAACGTGCACTGCAGCA 1955 ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1740 TGGAATTGCCACATTTGATTCAACAATTCACTTTTATAATTTGAAGCGTGCACTGCAGCA 1799 Query 1956 GCCATTGATGCTCATTGTCCCTGATGTACAAGATGTCTATACACCTTTAGAAACAGATGT 2015 ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1800 GCCGTTGATGCTCATTGTTCCTGATGTTCAAGATGTGTATACACCTTTAGAAACAGATGT 1859 Query 2016 TGTAGTTCAGCTATCTGAGTGCCGTCAACACCTAGAGCTTTTGCTGGATAGTATCCCAAC 2075 | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| Sbjct 1860 CATTGTTCAGCTATCTGAGTGCCGTCAACACCTAGAGATTTTGCTGGAAAGTATCCCAAC 1919 Query 2076 GATGTTTCAGGAAAGTAAAATTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTTAAGGCTGCTTT 2135 ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || Sbjct 1920 AATGTTTCAGGAAAGTAAGAGTCCTGAATCTGCTTTTGGTGCAGCAGTTAAGGCCGCATT 1979 Query 2136 CTTGGCGATGAAGAGCAAAGGAGGGAAGCTTATGGTATTTCAATCAATTTTGTGTTCTGT 2195 ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||| Sbjct 1980 CTTAGCGATGAAGAGCACTGGAGGAAAGCTCATGGTGTTTCAATCAGTTTTGCCTTCTGT 2039 Query 2196 TGGTGTTGGAGCACTTTCTTCTAGAGAGGCCGAAGGGAGAGCTAATATGTCTGCTG-GTG 2254 ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| Sbjct 2040 TGGCATTGGAGCACTTTCTTCTAGAGAGGCCGATGGGAGAGCTAATGCCTCTGC-GAGTG 2098 Query 2255 AAAAGGAGGCCCATAAATTACTACAACCAGCAGACAAAACTCTAAAGACCATGGCTATTG 2314 |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| Sbjct 2099 AAAAGGAGGCCCATAAATTACTTCAACCCGCAGACAAAACTTTAAGGACCATGGCTATTG 2158 Query 2315 AATTTGCTGAATACCAGGTCTGTGTAGATATATTTATCACAACTCAGGCCTATGTTGACA 2374 ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2159 AATTTGCTGAATACCAGGTCTGTGTAGATTTGTTTATCACAACTCAAGCCTATGTTGACA 2218 Query 2375 TGGCTTCAATTTCCGTTATTCCAAGAACTACTGGAGGACAGGTGTATTGTTATTACCCTT 2434 ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| Sbjct 2219 TGGCTTCAATTTCCGAGATCCCAAGAACAACTGGAGGACAGGTTTATTGCTATTACCCTT 2278 Query 2435 TCTCAGCTCTCTCAGATCCTCCCAA-GCTTTACAATGATCTTAAATGGAATATTACTAGG 2493 |||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||| Sbjct 2279 TCTCAGCTCTTTCAGACCC-CCCAAAGCTATACAACGATCTTAGATGGAATATCACGAGG 2337 Query 2494 CCACAGGGTTTTGAGGCTGTCATGCGAGTCAGATGCAGCCAGGGTATTCAAGTGCAAGAA 2553 || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| Sbjct 2338 CCCCAAGGTTTTGAGGCTGTCATGCGAGTCAGATGCAGTCAGGGTATTCAAGTGCATGAA 2397 Query 2554 TACTCTGGGAATTTCTGCAAACGCATTCCAACTGACATTGATCTACCAGCG 2604 ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| Sbjct 2398 TACTCAGGGAATTTCTGTAAACGCATACCAACTGACATCGATCTACCAGCG 2448 Score = 791 bits (428), Expect = 0.0 Identities = 759/917 (83%), Gaps = 29/917 (3%) Strand=Plus/Plus Query 2604 GCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCGGAATGTGCTTTCCAGTGCGCCCTTCTGTATAC 2663 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2484 GCATGATGACAAACTACAAGATGGAGCTGAATGTGGTTTCCAGTGTGCCCTTCTGTATAC 2543 Query 2664 TACAATATATGGAGAAAGAAGAATTAGGGTTAC--CACATTATCACTCTCC-TGTACAAA 2720 || |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| || |||||||| Sbjct 2544 CACCATATCTGGAGAAAGAAGAATTAGGGTT-CTTAAC-TTATCGCTC-CCTTGTACAAA 2600 Query 2721 CATGCTCAGTAATTTGTTTCGCGCAGCTGACTTAGATTCTCAATTTGCTTGTATGCTGAA 2780 |||||||||||| ||||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2601 CATGCTCAGTAACTTGTTCCGCTCAGCTGACCTGGATTCCCAATTTGCTTGTATGCTGAA 2660 Query 2781 ACAAGCGGCTAATGAAATTCCTTCGAAGGCACTTCCACTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAA 2840 ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 2661 ACAAGCGGCTAATGAGATCCCTTCCAAGGCACTTCCGTTGGTAAAGGAGCAAGCAACTAA 2720 Query 2841 TAGTTGCATAA--ATGCACT-CTATGCCTACCGTAAATTTTGTGCTACAGTGACATCATC 2897 || |||||| | || ||| | || |||| |||||||| || |||||||| |||||| | Sbjct 2721 TAATTGCATCACCAT--ACTAC-ATTCCTATCGTAAATTCTGCGCTACAGTTACATCAAC 2777 Query 2898 TGGACAACTTATTCTTCCCGAGGCGCTCAAGCTATTT-CCATTATACACTCTCGCATTGA 2956 ||||||||||||||||| || || |||||||| ||| || ||||| |||||||| || | Sbjct 2778 CGGACAACTTATTCTTCCTGAAGCACTCAAGCT-TTTGCCTTTATATACTCTCGCCTTAA 2836 Query 2957 CCAAAAGTGTGGGTTTAAGGACGGATGGAAGAATTGATGATCGATCATTCTGGATCAACT 3016 ||||| ||||||| ||| | | ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||| Sbjct 2837 CCAAAGGTGTGGGGTTACGAATGGACGGGAGAATTGATGACCGATCATTTTGGATAAACC 2896 Query 3017 ATGTGTCTTCCCTT-TCTACTCCTTTGGCAATCCCATTGGTTTATCCGAGAATGATTTCT 3075 |||||||||| || || ||||||||||| || || | |||||||| || |||||| || Sbjct 2897 ATGTGTCTTCA-TTGTCCACTCCTTTGGCTATTCCGCTAGTTTATCCAAGGATGATTGCT 2955 Query 3076 GTTCACGACCTTGATGTGAAGGACACTGAGGGATCGGTCCTTCCTCCTCCAATCCCATTG 3135 || || ||||||||||| || || | ||| | | || ||||| |||||||||||| Sbjct 2956 GTCCATGACCTTGATGTAAACGATAATGAAGAAAATGTGGTTCCTTGTCCAATCCCATTA 3015 Query 3136 TCAG-GTGAACACATTAGCAATGAGGGAGTTTATTTTCTTGAGAATGGTGAAGACGGTCT 3194 || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | Sbjct 3016 -CAAAGTGAACACCTTAGCGATGAGGGAGTATATTTTCTTGAGAACGGTGAAGATGGTTT 3074 Query 3195 -ACTATTTGTTGGCGAATCAGTAGACTCTGATATTCTGCAGAAACTTTTTGCTGTTT-CT 3252 | ||| | |||| ||||||||| | || ||||| || ||||| || ||| |||| || Sbjct 3075 GA-TATATATTGGGGAATCAGTAAATTCAGATATCCTACAGAAGCTCTTTAATGTTCACT 3133 Query 3253 TCAGCTGCTGAAATTCCTAACCAGTTTGTGCTGCAGCAGTATGATAATCAGTTATCAAAG 3312 ||||||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| Sbjct 3134 -CAGCTGCTGAACTTCAAAATCAGTATGTGCTGCAAAAGTATGATAATCAGCTATCAAAG 3192 Query 3313 AAATTCAATGATGCGGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGATGTTCTTACCTAAGAATAAAA 3372 || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||| Sbjct 3193 AAGTTCAATGACGTGGTGAATGAAATAAGGAGGCAAAGAAGTTCTTACCTACGCCTTAAA 3252 Query 3373 TTGTGCAAGAAGGGAGAACCATCAGGAA-T--GTTGTTTCTCTCGTATATGGTAGAGGAC 3429 ||||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||| | ||||||||||| |||||| Sbjct 3253 TTGTGCAAGAAAGGAGATCCAGCAGGAAATATGTTGTTCCAATCGTATATGGTGGAGGAC 3312 Query 3430 AGGACAGCAAGCGGCCCGTCGTATGTGGAGTTTCTCGTG-CAAGTCCATCGCCAAATCCA 3488 ||| | | || || || ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| Sbjct 3313 AGGGGATCGAGTGGGCCTTCGTACGTGGAGTTTCTCGTTTCA-GTTCACCGTCAAATCCA 3371 Query 3489 GCTAAAAA-TGAACTGA 3504 | | ||| |||||||| Sbjct 3372 AC-ACAAACTGAACTGA 3387 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 148995398295 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5