BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G33010.1
Length=3478
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg491390 jgi|Araly1|491390|fgenesh2_kg.7__823__AT4G33010.1 5422 0.0
Ahg481465 jgi|Araly1|481465|fgenesh2_kg.4__525__AT2G26080.1 3133 0.0
> Ahg491390 jgi|Araly1|491390|fgenesh2_kg.7__823__AT4G33010.1
Length=3427
Score = 5422 bits (2936), Expect = 0.0
Identities = 3257/3409 (96%), Gaps = 33/3409 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 72 CTAGCTTCTACCTCCTCCTTTCATTCATGGCGaaaaactaaaaaaGACATCCATCTTTCT 131
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | | ||| |||
Sbjct 48 CTAGCTTCTACCTCCTCCTCTCATTCATGGCTAAAAACTAAAAAAG-C-T--ATC-ATCT 102
Query 132 CAAAACATCTCTCTTACTCTCTTCGTTTTCTGACTGCAACCTTTTTTCCCAATGGAGCGC 191
| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 103 -------T-TCTC-TACTCTCTTCCTTTTCTGACTGCAACC-CATTTCCCAATGGAGCGC 152
Query 192 GCAAGGAGACTTGCTTACAGAGGAATCGTCAAACGTCTCGTTAACGACACAAAACGACAC 251
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 153 GCAAGGAGACTTGCTTACAGAGGAATCGTCAGACGTCTCGTTAACGACACAAAACGACAC 212
Query 252 CGTAACGCTGAAACACCTCACCTTGTTCCTCACGCTCCGGCGAGGTATGTCTCTTCCCTT 311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 213 CGTAACGCTGAAACACCTCACCTTGTTCCTCACGCTCCGGCGAGGTATGTCTCCTCTCTT 272
Query 312 TCCCC-TTTCATCTCCACCCCTCGATCTGTCAA-CCACACGGCGGCTTTCGGGAGGCACC 369
||||| |||| |||| |||| |||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||
Sbjct 273 TCCCCTTTTC-TCTCGACCCATCGATCCGTCAATCC-CGCGGCGGCTTTCGAGAGGCACC 330
Query 370 AGCAGACGCGTTCCATCTCCGTCGATGCTGTTAAACCCAGCGATACTTTCCCTCGTCGTC 429
|||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 331 AGCAAACGCGTTCGATCTCCGTCGATGCTCTTAAACCCGGCGATACTTTCCCGCGTCGTC 390
Query 430 ACAACTCTGCAACACCAGACGAACAAACCCACATGGCTAAATTCTGTGGCTTTGACCATA 489
| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 391 ATAACTCTGCAACACCAGAAGAACAATCCCACATGGCTAAATTCTGTGGCTTTGACCATA 450
Query 490 TCGATTCACTCATCGATGCTACGGTGCCCAAATCGATTCGATTAGATTCCATGAAGTTCT 549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 451 TCGATTCACTCATCGATGCTACGGTGCCCAAATCGATTCGATTAGATTCGATGAAGTTCT 510
Query 550 CCAAATTCGACGCTGGTTTAACCGAGAGCCAAATGATTCAACACATGGTTGATTTAGCTT 609
|||||||||||| || |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 511 CCAAATTCGACGGAGGCTTAACCGAGAGCCAGATGATTGACCACATGGTTGATTTAGCTT 570
Query 610 CCAAGAACAAGGTTTTCAAATCCTTCATCGGGATGGGTTACTACAACACTCATGTCCCTA 669
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 571 CCAAGAACAAGGTTTTCAAATCCTTTATCGGGATGGGTTACTACAACACGCATGTCCCTA 630
Query 670 CTGTCATTCTCCGTAACATCATGGAGAATCCAGCTTGGTACACTCAATACACTCCTTATC 729
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 CTGTCATTCTCCGTAATATCATGGAGAATCCAGCTTGGTACACTCAATACACTCCTTATC 690
Query 730 AAGCTGAGATCTCTCAAGGTCGTCTCGAATCGCTCCTCAATTTCCAGACCGTGATCACAG 789
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 691 AAGCTGAGATCTCTCAGGGTCGTCTCGAATCGCTGCTCAATTTCCAGACGGTGATCACCG 750
Query 790 ATCTCACGGGTCTTCCTATGTCCAATGCGTCGCTTCTGGATGAAGGCACTGCTGCTGCGG 849
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 751 ATCTCACGGGGCTTCCTATGTCGAATGCGTCGCTTCTGGATGAAGGGACCGCTGCTGCGG 810
Query 850 AGGCAATGGCCATGTGTAACAACATTCTTAAGGGTAAAAAGAAGACCTTTGTCATTGCTA 909
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 811 AGGCAATGGCCATGTGTAACAACATTCTTAAGGGTAAAAAGAAGACCTTTGTGATTGCTA 870
Query 910 GTAACTGTCACCCTCAGACTATTGATGTTTGTAAGACTAGAGCTGATGGGTTTGATTTGA 969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 871 GTAACTGTCACCCTCAGACTATTGATGTTTGTAAGACTAGAGCTGATGGGTTTGATTTGA 930
Query 970 AAGTTGTCACCTCTGATCTTAAGGATATAGATTACAGCTCTGGTGATGTTTGTGGGGTTC 1029
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 931 AAGTTGTTACCGCTGATCTTAAGGATATAGATTACAGCTCTGGTGATGTTTGTGGGGTTC 990
Query 1030 TTGTTCAGTATCCTGGTACTGAAGGTGAAGTCTTGGATTATGCTGAGTTTGTTAAGAATG 1089
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 991 TTGTTCAGTATCCTGGTACTGAAGGTGAAGTCTTGGATTATGCTGAGTTTGTCAAGAATG 1050
Query 1090 CTCATGCTAATGGTGTTAAGGTTGTGATGGCTACGGATTTGCTGGCTTTGACTGTGTTGA 1149
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1051 CTCATGCTAATGGTGTTAAGGTTGTTATGGCTACGGATTTGCTGGCTTTGACCATGTTGA 1110
Query 1150 AACCTCCTGGAGAATTTGGGGCGGATATTGTTGTTGGCTCTGCTCAAAGGTTTGGTGTTC 1209
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AACCCCCTGGGGAATTTGGGGCGGATATTGTTGTTGGTTCAGCTCAAAGGTTTGGTGTTC 1170
Query 1210 CGATGGGTTATGGTGGTCCTCATGCTGCGTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAAGAGAA 1269
| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1171 CCATGGGTTATGGAGGCCCTCATGCTGCGTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAAGAGAA 1230
Query 1270 TGATGCCTGGGAGGATTATTGGTATTAGTGTTGATTCTTCAGGAAAGCAAGCTCTGCGTA 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231 TGATGCCTGGGAGGATTATTGGTATTAGTGTTGATTCTTCAGGAAAGCAAGCTCTGCGTA 1290
Query 1330 TGGCTATGCAGACTAGAGAACAGCATATTAGGAGGGACAAAGCCACTAGCAACATCTGTA 1389
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1291 TGGCTATGCAGACTAGGGAGCAGCATATTAGGAGGGACAAAGCCACTAGCAACATCTGTA 1350
Query 1390 CTGCTCAAGCGTTGCTTGCCAACATGGCTGCCATGTATGCTGTTTACCATGGACCTGCAG 1449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1351 CTGCTCAAGCGTTGCTTGCCAACATGGCTGCCATGTATGCTGTTTACCATGGACCTGCAG 1410
Query 1450 GTCTAAAATCTATTGCCCAGCGTGTCCATGGTCTCGCTGGTATATTTTCCTTAGGGTTGA 1509
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 1411 GTCTAAAATCTATTGCCCAGCGTGTTCATGGTCTTGCTGGCATATTTTCCTTAGGGTTAA 1470
Query 1510 ACAAGCTTGGGGTTGCAGAAGTTCAAGAACTTCCTTTCTTTGACACTGTTAAAATTAAGT 1569
| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1471 AGAAGCTTGGGGTCGCAGAAGTCCAAGAACTTCCCTTCTTTGACACTGTAAAAATTAAGT 1530
Query 1570 GTTCGGATGCACATGCAATTGCTGATGCAGCTTCCAAAAGTGAAATTAATCTGCGTGTTG 1629
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1531 GTTCGGATGCACATGCAATTGCTGATGCAGCTTCCAAAAGTGAAATTAATCTGCGTGTTG 1590
Query 1630 TGGACTCAACCACTATTACTGCTTCCTTTGACGAAACAACCACCTTGGATGATGTCGATA 1689
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1591 TGGACTCAACCACTATTACTGCTTCCTTTGACGAAACAACCACCTTGGATGATGTCGACA 1650
Query 1690 AACTTTTCAAAGTTTTTGCTTCTGGCAAGCCTGTTCCATTTACGGCTGAATCTCTAGCAC 1749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1651 AACTTTTCAAAGTTTTTGCTTCTGGCAAGCCTGTTCCATTTACGGCTGAATCTCTAGCAC 1710
Query 1750 CCGAGGTTCAGAATTCCATTCCTTCTAGCCTAACAAGAGAGAGTCCTTATCTTACCCACC 1809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1711 CCGAGGTTCAGAATTCCATTCCTTCTAGCCTAACAAGAGAGAGTCCTTATCTTACCCACC 1770
Query 1810 CAATCTTCAACATGTACCACACAGAGCATGAGTTGCTTAGGTACATCCACAAGTTACAGT 1869
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1771 CAATCTTCAACATGTACCACACAGAGCATGAGTTGCTTAGGTACATCCACAAGTTACAGT 1830
Query 1870 CAAAGGATCTATCACTGTGCCACAGCATGATTCCGTTGGGATCTTGTACGATGAAACTAA 1929
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1831 CTAAGGATCTATCACTGTGCCACAGCATGATTCCATTGGGATCTTGTACGATGAAACTAA 1890
Query 1930 ATGCAACAACTGAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACTGACATTCACCCTTTTG 1989
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 1891 ATGCGACAACTGAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACCGACATTCACCCATTTG 1950
Query 1990 CTCCTGTTGAACAAGCACAAGGTTATCAGGAAATGTTCGAAAATTTGGGTGACCTCTTGT 2049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951 CTCCTGTTGAACAAGCACAAGGTTATCAGGAAATGTTCGAAAATTTGGGTGACCTCTTGT 2010
Query 2050 GTACGATCACTGGGTTTGACTCTTTCTCGTTGCAACCTAATGCTGGTGCTGCTGGTGAGT 2109
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2011 GTACAATCACTGGGTTTGACTCTTTCTCATTGCAACCTAATGCTGGTGCTGCTGGTGAGT 2070
Query 2110 ATGCCGGGCTTATGGTTATCCGCGCATATCACATGTCAAGAGGAGATCATCACCGTAATG 2169
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2071 ATGCTGGGCTTATGGTTATCCGCGCATATCACATGTCAAGAGGAGATCATCACCGAAATG 2130
Query 2170 TGTGTATCATACCTGTCTCTGCACACGGTACAAACCCTGCAAGTGCTGCTATGTGCGGGA 2229
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2131 TGTGTATCATACCTGTCTCTGCACATGGGACAAACCCTGCAAGTGCTGCTATGTGCGGTA 2190
Query 2230 TGAAAATTATTACAGTTGGAACTGATGCTAAGGGAAACATTAACATTGAGGAGGTGAGAA 2289
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 2191 TGAAAATTATTACGGTTGGAACTGATGCTAAGGGAAACATCAACATCGAGGAGGTGAGAA 2250
Query 2290 AAGCTGCAGAAGCCAACAAAGACAACTTAGCTGCTCTTATGGTTACATACCCTTCAACTC 2349
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2251 AAGCTGCAGAAGCCAACAAAGACAACTTAGCCGCTCTTATGGTTACATACCCTTCAACTC 2310
Query 2350 ATGGAGTCTATGAAGAGGGCATCGACGAGATTTGCAACATAATACACGAAAATGGAGGTC 2409
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2311 ATGGAGTCTATGAAGAGGGTATCGACGAGATTTGCAACATAATACATGAAAATGGAGGTC 2370
Query 2410 AAGTGTACATGGATGGTGCCAACATGAATGCACAGGTTGGTTTGACGAGCCCTGGTTTTA 2469
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2371 AAGTGTACATGGATGGTGCGAACATGAATGCACAGGTTGGCTTGACGAGCCCTGGTTTTA 2430
Query 2470 TTGGAGCGGATGTGTGCCATCTCAATCTCCACAAGACCTTCTGTATTCCTCATGGAGGTG 2529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2431 TTGGAGCGGATGTGTGCCATCTCAATCTCCACAAGACCTTCTGTATTCCTCATGGAGGTG 2490
Query 2530 GTGGTCCTGGTATGGGTCCCATTGGTGTGAAGAATCATTTGGCACCATTTCTTCCTTCTC 2589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2491 GTGGTCCTGGTATGGGTCCCATTGGTGTGAAGAATCATTTGGCACCATTTCTTCCTTCTC 2550
Query 2590 ACCCCGTGATACCGACTGGTGGTATCCCACAACCCGAGAAGACAGCACCTTTGGGTGCAA 2649
||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 2551 ACCCCGTGATACCTACTGGTGGAATCCCGCAACCCGAGAAGACAGCACCGTTAGGTGCAA 2610
Query 2650 TATCCGCTGCACCATGGGGATCTGCGCTTATCTTGCCTATATCTTATACTTACATTGCCA 2709
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2611 TATCCGCTGCACCATGGGGATCTGCGCTTATCTTACCAATATCTTATACTTACATTGCCA 2670
Query 2710 TGATGGGATCTGGTGGGCTCACTGATGCCTCTAAGATTGCAATTTTGAATGCCAATTACA 2769
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2671 TGATGGGATCTGGTGGACTCACTGATGCCTCTAAGATTGCAATTTTGAATGCCAATTACA 2730
Query 2770 TGGCAAAGCGCCTAGAGAAACACTACCCAGTTCTTTTCCGTGGTGTTAACGGAACAGTAG 2829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2731 TGGCAAAGCGCCTAGAGAAACACTACCCAGTTCTTTTCCGTGGTGTTAATGGAACAGTAG 2790
Query 2830 CACACGAATTCATCATAGACTTGAGAGGCTTCAAGAACACTGCTGGAATAGAACCAGAGG 2889
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2791 CACACGAATTCATCATAGACTTAAGAGGCTTCAAGAGCACTGCTGGAATAGAACCAGAGG 2850
Query 2890 ATGTGGCGAAACGGCTAATGGACTATGGATTCCATGGACCCACAATGTCTTGGCCTGTCC 2949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2851 ATGTGGCGAAACGGCTAATGGACTATGGATTCCATGGACCCACAATGTCTTGGCCTGTCC 2910
Query 2950 CTGGAACTCTTATGATTGAGCCAACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAGCTAGACAGGTTCT 3009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2911 CTGGAACTCTTATGATTGAGCCAACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAGCTAGACAGGTTCT 2970
Query 3010 GCGATGCTCTCATTTCAATCAGGGAAGAAATTGCACAGATTGAAAAAGGAAATGCAGATG 3069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2971 GCGATGCTCTCATTTCAATCAGGGAAGAAATTGCACAGATTGAAAAAGGAAATGCAGATG 3030
Query 3070 TCCAGAACAACGTTCTCAAGGGAGCTCCACATCCCCCATCGTTGCTAATGGCAGACACAT 3129
||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3031 TCCAGAACAACGTCCTTAAGGGAGCTCCACATCCTCCATCGTTGCTAATGGCAGACACAT 3090
Query 3130 GGAAAAAGCCGTATTCTCGAGAGTATGCTGCTTTCCCTGCGCCTTGGCTCCGCTC-CTCC 3188
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||
Sbjct 3091 GGAAAAAGCCGTATTCTCGAGAGTACGCTGCTTTCCCTGCCCCGTGGCTCCG-TAACTCA 3149
Query 3189 AAGTTCTGGCCCACCACAGGGCGTGTGGACAATGTATATGGAGACAGGAAACTGGTGTGC 3248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3150 AAGTTCTGGCCCACCACAGGGCGTGTGGACAATGTATATGGAGACAGGAAACTGGTGTGC 3209
Query 3249 ACTCTCCTCCCAGAGGAAGAACAAGTCGCAGCTGCAGTGTCTGCTTGATTACTGCTCTGT 3308
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3210 ACTCTCCTCCCAGAGGAAGAACAAGTTGCAGCTGCAGTATCTGCTTGATTACTGCTCTGT 3269
Query 3309 CCCATTGTGTTGTGTCCCTTTCTCTCACCACGCACTCTTCTCTTTCACATTCTGTCCATA 3368
| || ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3270 CTCAATGTGTTGTGGCCCCTTCTCTCACCATGCTCTCTTCTCTTTCACATTCTGTCCATA 3329
Query 3369 GTGTTCTCATTATACGCTTTCTGTCTCTTACTCTATTATTTCATTCGAATACATCTT-CT 3427
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| || || |
Sbjct 3330 GTGTTCTCATTATACGCTTTCTGTCTCTTACTCTGTTATTT--T-C-AAT-CAA-TTAC- 3382
Query 3428 ATAAATTATATATTCCACAATTGACCGAAAACAAAACACAAACTTTGGT 3476
|| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3383 ATG--TTCCACA--CCACAATTGACCGAAAACAAAACACAAACTTTGGT 3427
> Ahg481465 jgi|Araly1|481465|fgenesh2_kg.4__525__AT2G26080.1
Length=3453
Score = 3133 bits (1696), Expect = 0.0
Identities = 2689/3164 (85%), Gaps = 86/3164 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 183 ATGGAGCGCGCAAGGAGACTTGCTTACAGAGGAATCGTCAAACGTCTCGTTAACGACACA 242
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||
Sbjct 34 ATGGAGCGTGCAAGGAGACTTGCTTACAGAGGGATCGTGAAACGTCTCGTCAACGAGACA 93
Query 243 AAACGACACCGTAAC-GCTGAA-ACAC--CTCACCTTGTTCCTC-AC-G---CTCCGGCG 293
||||| ||||||||| || || | | ||| || | | | || | |||| |
Sbjct 94 AAACGCCACCGTAACGGC-CAATCCTCTTCTCTCC-CG-GCGACGACGGTTACTCCCTCA 150
Query 294 AGGTATGTCTCTTCCCTTTCC-CCTTTCATCTCCA-C-CCCTC--GA----TCT-G-TCA 342
||||||||||| ||| | ||| || || |||||| | || || || ||| | ||
Sbjct 151 AGGTATGTCTCCTCCGTCTCCTCC-TT--TCTCCATCACCGTCGTGATGTCTCTGGATCG 207
Query 343 AC-CACACGGCGGCTTTCGGGAGGCACCAGCAGACGCGTTCCATCTCCGTCGATGCTGTT 401
|| ||| | | | ||| || | || || || || || |||||||||||||| |||
Sbjct 208 ACTTTCAC--C-ACCTCCGGTAGAAATCAACAAACACGATCAATCTCCGTCGATGC-GTT 263
Query 402 AAA-CCCAGCGATACTTTCCCTCGTCGTCACAACTCTGCAACACCAGACGAACAAACCCA 460
||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||
Sbjct 264 AAAGCCAAGCGACACTTTCCCGCGCCGTCACAACTCTGCTACACCGGAGGAACAAACACA 323
Query 461 CATGGCTAAATT-CTGTGGCTTTGACCATATCGATTCAC--TCATCGATGCTACGGTGCC 517
||||| |||| ||| || || || ||| || | ||| | || ||| | || || ||
Sbjct 324 GATGGC-GAATTACTGCGGATTCGATCATCTC-A-ACACGTTGATTGATTCAACTGTTCC 380
Query 518 CAAATCGATTCGATTAGATTCCATGAAGTTCTC---CAAATTCGACGCTGGTTTAACCGA 574
||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | || ||||| ||
Sbjct 381 GAAATCGATTCGGTTAGATTCGATGAAGTTCTCTGGGAAATTTGATGAAGGATTAACAGA 440
Query 575 GAGCCAAATGATTCAACACATG-GTTGATTTAGCTTCCAAGAACAAGGTTTTCAAATCCT 633
||| || |||||| | || ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
Sbjct 441 GAGTCAGATGATTGAGCATATGAG-TGATTTAGCTTCGAAGAACAAAGTTTTCAAATCAT 499
Query 634 TCATCGGGATGGGTTACTACAACACTCATGTCCCTACTGTCATTCTCCGTAACATCATGG 693
|||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||| | ||||| || ||||
Sbjct 500 TCATTGGTATGGGATACTATAACACTCATGTTCCTCCTGTGATTTTGCGTAATATTATGG 559
Query 694 AGAATCCAGCTTGGTACACTCAATACACTCCTTATCAAGCTGAGATCTCTCAAGGTCGTC 753
||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |
Sbjct 560 AGAATCCTGCTTGGTATACTCAATATACTCCTTATCAAGCTGAGATTTCTCAAGGAAGGC 619
Query 754 TCGAATCGCTCCTCAATTTCCAGACCGTGATCACAGATCTCACGGGTCTT-CCTATGTCC 812
| ||||| | ||||||| |||||| || || || ||||| || ||| || || |||||
Sbjct 620 TTGAATCTTTGCTCAATTACCAGACGGTTATTACTGATCTTACCGGT-TTACCGATGTCG 678
Query 813 AATGCGTCGCTT-CTGGATGAAGGCACTGCTGCTGCGGAGGCAATGGCCATGTGTAACAA 871
|| || ||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||
Sbjct 679 AACGCTTCG-TTGCTCGATGAAGGTACGGCGGCTGCGGAAGCGATGGCTATGTGTAATAA 737
Query 872 CATTCTT-AAGGGTAAAAAGAAGACCTTTGTCATTGCTAGTAACTGTCACCCTCAGACTA 930
| |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |
Sbjct 738 TA-TCTTAAAGGGGAAGAAGAAGACGTTTGTTATTGCTAGTAATTGTCATCCTCAGACGA 796
Query 931 TTGATGTTTGTAAGACTAGAGCTGATGGGTTT-GATTTGAAAGTTGTCAC-CTCTGATCT 988
|||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||
Sbjct 797 TTGATGTTTGCAAGACTAGAGCGGAT-GGTTTCGATTTGAAAGTTGTGACGGT-TGATCT 854
Query 989 TAAGGATATAGATTACAGCTCTGGTGATGTTTGTGGGGTTCTT-GTTCAGTATCCTGGTA 1047
||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| | | || ||||||||||| || |
Sbjct 855 TAAGGATGTGGATTATAGCTCGGGGGATGTGTGTGGAG-TGTTGGTTCAGTATCCGGGGA 913
Query 1048 CTGAAGGTGAAGTCTTGGATTATGCTGAGTTTGTTAAGAATGCTCATGCTAATGGTGTTA 1107
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 914 CTGAAGGTGAAGTGTTGGATTATGGTGAGTTTGTTAAGAATGCTCATGCTAATGGTGTTA 973
Query 1108 AGGTTGTGATGGCTACGGATTTGCTGGCTTTGACTGTGTTGAAACCTCCTGGAGAATTTG 1167
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || || || ||||
Sbjct 974 AGGTTGTGATGGCTACGGATTTGTTGGCTTTGACAATGTTGAAACCGCCGGGGGAGTTTG 1033
Query 1168 GGGCGGATATTGTTGTTGGCTCTGCTCAAAGGTTTGGTGTTCCGATGGGTTATGGTGGTC 1227
|||| |||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1034 GGGCTGATATTGTCGTTGGGTCGGGTCAGAGGTTTGGTGTTCCCATGGGTTATGGTGGTC 1093
Query 1228 CTCATGCTGCGTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAAGAGAATGATGCCTGGGAGGATTA 1287
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1094 CTCATGCTGCTTTCTTGGCTACTTCACAAGAGTATAAGAGAATGATGCCTGGGAGAATTA 1153
Query 1288 TTGGTATTAGTGTTGATTCTTCAGGAAAGCAAGCTCTGCGTATGGCTATGCAGACTAGAG 1347
||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1154 TTGGTGTTAGTGTTGATTCTTCCGGGAAGCAAGCTTTGCGTATGGCTATGCAGACTAGGG 1213
Query 1348 AACAGCATATTAGGAGGGACAAAGCCACTAGCAACATCTGTACTGCTCAAGCGTTGCTTG 1407
|||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||
Sbjct 1214 AACAGCATATCCGTAGGGATAAAGCTACCAGCAACATCTGTACCGCTCAGGCATTGCTTG 1273
Query 1408 CCAACATGGCTGCCATGTATGCTGTTTACCATGGACCTGCAGGTCT-AAAATCTATTGCC 1466
| |||||| |||||||||||||||| || |||||||| | ||| || ||||||||||||
Sbjct 1274 CAAACATGACTGCCATGTATGCTGTCTATCATGGACCAGAAGG-CTTAAAATCTATTGCA 1332
Query 1467 CAGCGTGTCCATGGTCTCGCTGGTATATTTTCCTTAGGGTTGAACAAGCTTGGGGT-TGC 1525
|| || || |||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||| || || ||| |||
Sbjct 1333 CAACGGGTTCATGGTCTAGCTGGTGTATTTACTTTAGGATTGAAGAAACT-GGGAACTGC 1391
Query 1526 AGAAGTTCAAGAACTTCCTTTCTTTGACACTGTTAAAATTAAGTGTT-CGGATGCACATG 1584
| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||
Sbjct 1392 ACAAGTCCAAGATCTTCCCTTCTTTGACACTGTCAAAGTTACG-GTTTCGGATGCACATG 1450
Query 1585 CAATTGCTGATGCAGCTTCCAAAAGTGAAATTAATCTGCGTGTTGTGGACTC-AACCACT 1643
|||||| |||||| ||| |||||| || || ||| ||||| |||||||||| ||| |||
Sbjct 1451 CAATTGTTGATGCGGCTGCCAAAAAAGAGATCAATTTGCGTCTTGTGGACTCCAAC-ACT 1509
Query 1644 ATTACTGCTTCC-TTTGACGAAACAACCACCTTGGATGATGTCGATAAACTTTTCAAAGT 1702
||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 1510 ATTACTG-TTGCGTTTGATGAAACAACCACCTTGGATGATGTCGACAAACTTTTTGAAGT 1568
Query 1703 TTTTGCTTCTGGCAAGCCTGTTCCATTTACGGCTGAATCTCTAGCACCCGAGGTTCAGAA 1762
||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||| || | ||
Sbjct 1569 TTTTGCTTCCGGCAGGCCGGTTCAATTCACGGCTGAGTCTCTCGCACCGGAGTTTAACAA 1628
Query 1763 TTCCATTCCTTCTAGCCTAACAAGAGAGAGTCCTTATCTTACCCACCCAATCTTCAACAT 1822
| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGCTATTCCTTCTAGCTTAACAAGACAGAGCCCTTATCTGACCCACCCAATCTTCAACAT 1688
Query 1823 GTACCACACAGAGCATGAGTTGCTTAGGTACATCCACAAGTTACAG--TCAAAGGATCTA 1880
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||
Sbjct 1689 GTACCACACGGAGCATGAGTTACTTAGGTACATCCACAAGTTACAAAAT-AAAG-ATCTA 1746
Query 1881 TCACTGTGCCACAGCATGATTCCGTTGGGATCTTGTACGATGAAACTAAATGCAACAACT 1940
||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| | ||||| || ||
Sbjct 1747 TCATTGTGCCACAGCATGATTCCACTAGGATCATGTACAATGAAATTGAATGCCACGACC 1806
Query 1941 GAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACTGACATTCACCCTTTTGCTCCTGTTGAA 2000
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 1807 GAAATGATGCCAGTCACATGGCCAAGTTTCACCAACATGCACCCTTTTGCTCCTGTAGAA 1866
Query 2001 CAAGCACAAGGTTATCAGGAAATGTTCGA-AAATTTGGGTGACCTCTTGTGTACGATCAC 2059
||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 1867 CAAGCCCAAGGTTATCAGGAAATGTTT-ACAAACTTGGGTGAGCTCTTGTGTACTATCAC 1925
Query 2060 TGGGTTTGACTCTTTCTCGTTGCAACCTAATGCTGGTGCTGCTGGTGAGTATGCCGGGCT 2119
|||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1926 TGGGTTCGACTCTTTCTCATTGCAACCTAATGCCGGTGCTGCTGGCGAGTATGCCGGGCT 1985
Query 2120 TATGGTTATCCGCGCATATCACATGTCAAGAGGAGATCATCACCGTAATGTGTGTATCAT 2179
|||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||
Sbjct 1986 CATGGTTATTCGTGCATATCATATGTCAAGAGGAGATCATCACCGAAATGTATGCATCAT 2045
Query 2180 ACCTGTCTCTGCACACGGTACAAACCCTGCAAGTGCTGCTATGTGCGGGATGAAAATTAT 2239
|||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 2046 ACCTGTTTCTGCACACGGGACAAACCCTGCTAGTGCTGCTATGTGCGGAATGAAAATTGT 2105
Query 2240 TACAGTTGGAACTGATGCTAAGGGAAACATTAACATTGAGGAGGTGAGAAAAGCTGCAGA 2299
| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| || ||
Sbjct 2106 TGCCGTTGGAACTGATGCCAAGGGAAACATTAACATCGAAGAGTTGAGGAAAGCCGCCGA 2165
Query 2300 AGCCAACAAAGACAACTTAGCTGCTCTTATGGTTACATACCCTTCAACTCATGGAGTCTA 2359
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||
Sbjct 2166 AGCCAACAAGGACAACTTGGCTGCTCTTATGGTTACATACCCGTCAACCCATGGAGTTTA 2225
Query 2360 TGAAGAGGGCATCGACGAGATTTGCAACATAATACACGAAAATGGAGGTCAAGTGTACAT 2419
||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||
Sbjct 2226 TGAAGAGGGTATCGATGAGATTTGCAACATAATTCATGAAAATGGAGGCCAAGTTTATAT 2285
Query 2420 GGATGGTGCCAACATGAATGCACAGGTTGGTTTGACGAGCCCTGGTTTTATTGGAGCGGA 2479
||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2286 GGACGGTGCTAATATGAATGCACAGGTGGGGTTGACAAGCCCTGGTTTTATTGGAGCGGA 2345
Query 2480 TGTGTGCCATCTCAATCTCCACAAGACCTTCTGTATTCCTCATGGAGGTGGTGGTCCTGG 2539
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||
Sbjct 2346 TGTTTGCCATCTCAATCTCCACAAAACCTTCTGTATCCCTCACGGAGGTGGAGGTCCCGG 2405
Query 2540 TATGGGTCCC-ATTGGTGTGAAG-AATCATTTGGCACCATTTCTTCCTTCTCACCCCGTG 2597
|||||| ||| || ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||
Sbjct 2406 TATGGG-CCCTATCGGTGTGAAGCAA-CATTTGGCTCCATTCCTACCTTCTCACCCTGTG 2463
Query 2598 ATACCGACTGGTGGTATCCCACAACCCGAGAAGACAGCACCTTTGGGTGCAATATCCGCT 2657
||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| | || || ||
Sbjct 2464 ATACCTACCGGTGGTATCCCTGAACCCGAGCAGACATCACCGTTGGGAACCATTTCTGCA 2523
Query 2658 GCACCATGGGGATCTGCGCTTATCTTGCCTATATCTTATACTTACATTGCCATGATGGGA 2717
||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2524 GCACCATGGGGGTCTGCGCTAATCTTGCCCATCTCTTATACATACATTGCCATGATGGGA 2583
Query 2718 TCTGGTGGG-CTCACTGATGCCTCTAAGATTGCAATTTTGAATGCCAATTACATGGCAAA 2776
||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 2584 TCTGG-GGGACTCACAGACGCCTCAAAGATCGCAATTTTGAATGCTAACTACATGGCAAA 2642
Query 2777 GCGCCTAGAGAAACACTACCCAGTTCTTTTCCGTGGTGTTAACGGAACAGTAGCACACGA 2836
||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||
Sbjct 2643 GCGTCTGGAGAGCCACTACCCAGTTCTATTCCGTGGTGTCAATGGAACAGTCGCTCACGA 2702
Query 2837 ATTCATCATAGACTTGAGAGGCTTCAAGAACACTGCTGGAATAGAACCAGAGGATGTGGC 2896
||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2703 ATTCATCATTGACTTGAGAGGATTCAAGAACACTGCTGGAATTGAACCAGAGGATGTGGC 2762
Query 2897 GAAACGGCTAATGGACTATGGATTCCATGGACCCACAATGTCTTGGCCTGTCCCTGGAAC 2956
|||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2763 CAAACGGCTGATGGATTATGGGTTCCATGGACCGACAATGTCTTGGCCTGTCCCTGGAAC 2822
Query 2957 TCTTATGATTGAGCCAACCGAGAGTGAAAGCAAGGCGGAGCTAGACAGGTTCTGCGATGC 3016
|||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||
Sbjct 2823 ACTTATGATCGAGCCAACCGAAAGCGAAAGCAAGGCTGAGTTAGATAGGTTCTGTGATGC 2882
Query 3017 TCTCATTTCAATCAGGGAAGAAATTGCACAGATTGAAAAAGGAAATGCAGATGTCC-AG- 3074
|||||| || |||||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||| || |
Sbjct 2883 TCTCATCTCGATCAGGGACGAAATTTCCCAGATTGAGAAAGGAAACGCAGAT--CCTAAC 2940
Query 3075 AACAACGTTCTCAAGGGAGCTCCACATCCCCCATCGTTGCTAATGGCAGACACATGGAAA 3134
||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2941 AACAACGTTCTCAAGGGAGCTCCACATCCTCCTTCATTGCTGATGGCAGACACATGGAAA 3000
Query 3135 AAGCCGTATTCTCGAGAGTATGCTGCTTTCCCTGCGCCTTGGCTCCGCTCCTCCAAGTTC 3194
||||||||||| || || || || || ||||| || || |||||||||||||||||||||
Sbjct 3001 AAGCCGTATTCCCGTGAATACGCAGCCTTCCCCGCTCCATGGCTCCGCTCCTCCAAGTTC 3060
Query 3195 TGGCCCACCACAGGGCGTGTGGACAATGTATATGGAGACAGGAAACTGGTGTGCACTCTC 3254
|||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| | || |||||||| ||||||
Sbjct 3061 TGGCCCACTACAGGGCGCGTGGACAACGTGTATGGAGACCGTAATCTGGTGTGTACTCTC 3120
Query 3255 CTCCCAGAG---GAAGAACAAG-TCGCAGCTGCAGTGTCTGCTT 3294
| || | | |||||||| | | ||||| |||||||||||||
Sbjct 3121 CAACCGGCGAACGAAGAACAGGCT-GCAGCCGCAGTGTCTGCTT 3163
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 131336684423
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5