BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: halleri_transcript_ahg.fa
           32,672 sequences; 38,939,717 total letters



Query= AT4G33240.1

Length=5786
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  Ahg491361 jgi|Araly1|491361|fgenesh2_kg.7__794__AT4G33240.2         9382    0.0  
  Ahg478844 jgi|Araly1|478844|fgenesh2_kg.3__1545__AT3G14270.1        52.8    3e-05


> Ahg491361 jgi|Araly1|491361|fgenesh2_kg.7__794__AT4G33240.2
Length=5668

 Score = 9382 bits (5080),  Expect = 0.0
 Identities = 5485/5682 (97%), Gaps = 22/5682 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  95    TCTTGAATCAAGCATAAATTCTGGA-TTTTGAAGTTTGAGAGTGACCCAGTGACTTTGGT  153
             ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct  1     TCTTGAATCGAGCATAAATTCTGGATTTTTGAAGTTTGAGAGTGATCCAGTGAC-TTGGT  59

Query  154   CTGAATCTCGGAGGTATCTTATTCCAGGGATCAAGGATTAGACTTAATGCGATTAAGCAA  213
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  60    CTCAATCTCGGAGGTATCTTATTCCAGGGATCAAGGATTAGACTTAATGCGATTTAGCAA  119

Query  214   ATGGGTTTTTCACGATGACTCTCCTTGTTGTTGGGGAGATTCAATAAATGGACTCACAAG  273
             |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  120   ATGGGTTTTTCATGAAGACTCTCCTTGTTGTTGGGGAGATTCAATAAATGGACTCACCAG  179

Query  274   ATCACAAAGCACCTGGCTTTGTTGACATAGTCAAATCTTGGATCCCTAGAAAGAGTGAGT  333
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180   ATCACAAAGCACCTGGCTTTGTTGACATAGTCAAATCTTGGATCCCTAGAAAGAGTGAGT  239

Query  334   CCTCAAATATGTCGAGGGATTTTTGGATGCCTGACCAAAGCTGTCCTGTGTGTTATGAGT  393
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||
Sbjct  240   CCTCAAATATGTCGAGGGATTTTTGGATGCCTGACCAGAGTTGTCCTGTGTGTTACGAGT  299

Query  394   GTGATGCTCAGTTCACTGTGTTTAATCGAAGACATCATTGCCGCCTTTGTGGTCGAGTTT  453
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct  300   GTGATGCTCAGTTCACTGTGTTTAATCGAAGACATCATTGCCGGCTTTGTGGTCGAGTGT  359

Query  454   TTTGTGCCAAATGCGCTGCAAATTCCATTCCATCTCCATCAGATGAAACAAAGGATAGTC  513
             ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360   TTTGTGCCAAATGCGCTGCAAATTCTATCCCATCTCCATCAGATGAAACAAAGGATAGTC  419

Query  514   ATGAGGAACCAGAAAGGATTAGGGTGTGTAATTACTGCTACAAACAGTGGGAACAGGGGA  573
             ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420   ATGAGGAGCCAGAAAGGATTAGGGTTTGTAATTACTGCTACAAACAGTGGGAACAGGGGA  479

Query  574   TAGTTCCCCCTGATAATGGGGCTTCTATTATTAGCCTTCATTTTAGTTCATCGCCTTCTG  633
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  480   TAGTTCCCCCTGATAATGGGGCTTCTATTATTAGCCTTCATTTTAGTTCATCCCCTTCTG  539

Query  634   CTAGAAGCGTCGCAAGTACTACCTCTAATAGTAGCAACTGCACCATTGATTCAACTGCTG  693
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  540   CTAGAAGCGTGGCAAGTACTACCTCTAATAGTAGCAATTGCACCATTGATTCAACTGCTG  599

Query  694   GACCTTCCCCTAGACCCAAAATGAATCCCCGAGCTAGCCGTCGTGTCTCGTCAAACATGG  753
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
Sbjct  600   GACCTTCCCCTAGACCCAAAATGAATCCCCGAGCTAGCCGTCGCGTCTCGTTAAACATAG  659

Query  754   ATTCTGAAAAGTCTGAGCAGCAGAATGCAAAATCGCGTAGGAG-CTCAGATCATTATGGG  812
             ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||
Sbjct  660   ATTCTGAAAAGTCTGAGAAGCAGAATGCAACATCGCGTAGGAGCCT-GGATCCTTATGGG  718

Query  813   CATGTGTTAGATTCTTCTGATAATCAAGTTGAATTCTTTGTCAACAGTAGTGGCAGGAGT  872
             |||||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||
Sbjct  719   CATGTGCTAGA---TTCTGAAAATCAAGTTGAATTCTTTGTGAAC---AGTGGCAGGAGT  772

Query  873   GATGGTGAAGCTGATGACGATGACGATTATCAATCTGATTTTGCACAATCTTACGCTCAA  932
             ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  773   GATGGTGAAGCTGATGATGATGACGATTATCACTCTGATTTTGCACAATCTTACGCTCAA  832

Query  933   GGAAATGACTACTATGGTGCCATCAACCTCGATGAAGTAGACCATATCTATGGGTCACAT  992
             ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  833   GGAAATGACTACTATGGTGCCATCAGCCTCGATGAAGTAGACCAGATCTATGGGTCACAT  892

Query  993   GAAGCTCATGACGTTGGTGTAAAAATAGAACCAAACATAAGTGGCTTTCCCCCTGATCAA  1052
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  893   GAAGCTCATGACGTTGGTGTAAAAATAGAACCAAACATAAGTTGCTTTCCCCCTGATCAA  952

Query  1053  GATCTTGACTCACTGAATACAGAGACGATAGATAAAACCAGACAACAAGAAAATGGATGG  1112
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953   GATCTTGACTCACTGAATACAGATACGATAGATAAAACCAGACAACAAGAAAATGGATGG  1012

Query  1113  AACGATGTAAAGGAGGGAAGCCCTCCTTGTGAAGAGTCCTTTGAGCCCGAAGTTGTTGAT  1172
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||
Sbjct  1013  AACGATGTGAAGGAGGGAAGCCCTCCTTGTGAAGAGTCTTTTGAGCCCGAAGTAGTGGAT  1072

Query  1173  TTTGAGAGTGATGGGCTCTTATGGCTACCACCAGAGCCAGAGAACGAAGAAGATGAAAGA  1232
             |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1073  TTTGAGAGCGATGGCCTGTTATGGCTACCGCCAGAGCCAGAGAACGAAGAAGATGAAAGA  1132

Query  1233  GAAGCAGTGCTATCTGATGATGACGGTGATGAAGGTGATAGAGGTGATTGGGGGTACCTT  1292
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct  1133  GAAGCAGTGCTATCTGATGATGACGGTGATGAAGGTGATAGAGGTGACTGGGGCTACCTT  1192

Query  1293  CGCCCATCAAATAGCTTTAACGAGAAGGATTTCCACTCTAAGGACAAGTCCAGTGGTGCT  1352
             |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1193  CGCCCATCAAATAGCTTTAATGATAAGGACTTCCACTCTAAGGATAAGTCCAGTGGTGCT  1252

Query  1353  ATGAAAAATGTTGTTGAAGGGCACTTTAGGGCTTTGGTAGCACAACTTTTGGAGGTTGAT  1412
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1253  ATGAAAAATGTTGTTGAAGGGCACTTTAGGGCTTTGGTAGCCCAACTTTTGGAGGTTGAT  1312

Query  1413  AATCTACCTATGGTCAACGAAGGTGATGAAGAGGGCTGGCTTGATATAATTACATCATTA  1472
             |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1313  AATCTACCCATGGTCAATGAAGGGGATAAAGAGGGCTGGCTTGATATAATTACATCATTA  1372

Query  1473  TCTTGGGAGGCTGCAACGCTTCTCAAGCCAGATACAAGTAAAAGTGGAGGAATGGATCCA  1532
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1373  TCTTGGGAGGCTGCAACGCTTCTCAAGCCAGATACAAGTAAAAGTGGAGGAATGGATCCA  1432

Query  1533  GGAGGATACGTGAAGGTTAAATGCATCCCTTGTGGACGTCGCAGTGAGAGTATGGTCGTG  1592
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  1433  GGAGGATACGTGAAGGTTAAATGCATCCCTTGTGGACGTCGCAGTGAAAGTATGGTCGTG  1492

Query  1593  AAAGGAGTTGTTTGTAAGAAAAATGTGGCTCATCGGCGAATGACTTCAAAGATCGAGAAG  1652
             ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1493  AAAGGAGTTGTTTGTAAAAAAAATGTGGCCCATCGGCGAATGACTTCAAAGATTGAGAAG  1552

Query  1653  CCGCGTCTGCTAATCCTTGGAGGAGCTCTGGAGTATCAGCGCATCTCTAACCAGCTGTCT  1712
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1553  CCACGTCTGCTAATCCTTGGAGGAGCTCTGGAGTATCAGCGCATCTCTAACCAGCTGTCT  1612

Query  1713  AGTTTTGACACTTTGTTGCAACAGGAAATGGACCATTTGAAGATGGCTGTTGCCAAAATT  1772
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1613  AGTTTTGACACTTTGTTGCAACAGGAAATGGACCATTTGAAGATGGCTGTTGCCAAAATT  1672

Query  1773  GATTCTCACAATCCTGACATTCTCTTGGTGGAGAAATCTGTCTCGCGGTTTGCGCAGGAA  1832
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct  1673  GATTCTCACAATCCTGACATTCTCTTGGTGGAGAAATCTGTATCGCGATTTGCGCAGGAA  1732

Query  1833  TATCTTCTCGCGAAGGACATATCTCTCGTGTTAAATATTAAAAGGTCCCTTCTAGAGCGC  1892
             |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1733  TATCTTCTTGCGAAGGACATATCTCTTGTGTTAAATATTAAAAGGTCCCTTCTAGAGCGC  1792

Query  1893  ATATCCCGCTGTACTGGTGCGCAGATTGTCCCTTCGATCGACCAGCTCACATCACCAAAG  1952
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1793  ATATCTCGCTGTACTGGTGCGCAGATTGTCCCTTCGATCGACCAGCTCACATCACCAAAG  1852

Query  1953  CTAGGTTATTGTGACCTGTTCCATGTGGAAAAGTTTGTGGAGACACATGTTAGTCCTTGT  2012
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||
Sbjct  1853  CTGGGTTATTGTGACCTGTTCCATGTGGAAAAGTTTGTCGAGAAACATGTTAGTCCTTGT  1912

Query  2013  CAAGTTGCGAAGAAAATGGCCAAGACTTTAATGTTTTTTGATGGCTGCCCGAAACCTTTG  2072
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1913  CAAGTTGCGAAGAAAATGGCCAAGACTTTAATGTTTTTTGATGGCTGCCCGAAACCTTTG  1972

Query  2073  GGTTGTACAATATTGCTCAAGGGGGCACATGAAGATGAGCTAAAGAAGGTGAAACATGTG  2132
             ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1973  GGTTGTACAATATTGCTTAAGGGGGCGCATGAAGATGAGCTAAAGAAGGTGAAACATGTG  2032

Query  2133  ATTCAGTATGGAGTTTTTGCAGCATATCACTTGGCTCTTGAGACATCCTTCCTAGCAGAT  2192
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2033  ATTCAGTATGGAGTTTTTGCAGCATATCACTTGGCTCTTGAGACATCCTTCCTAGCAGAT  2092

Query  2193  GAAGGTGCTTCCATT-CACGAACTTCCTCTGCAGACCCCAATTACTGTGGCGTTACCTGA  2251
             |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct  2093  GAAGGTGCTTCCCTTCCA-GAACTTCCTCTGCAGACCCCAATTACAGTGGCTTTACCTGA  2151

Query  2252  TAAACCATCAATGGTTAACAGATCAATATCCACAATACCTGGTTTTACTGTGTCAAGTGC  2311
             ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2152  TAAACCATCAACGATTAACAGATCAATATCGACAATACCTGGTTTTACTGTGTCAAGTGC  2211

Query  2312  TGAAAAGTCTCCAACTACTGAGTTAAGGGGTGAGCCACATAAAGCCAATGGCGACCTTAC  2371
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2212  TGAAAAGTCTCCAACTACTGAGTTAAGGGGTGAGCCACATAAAGCCAATGGCGACCTTAC  2271

Query  2372  TGGTAATTTCACTTCTAGTAAGACTCATTTCCAAGGGAAATTGGATGGAAACGACAGGAT  2431
              ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2272  CGGTAATTTCACTTCTAGTAAGACTCATTTGCAAGGGAAATTGGATGGAAACGACAGGAT  2331

Query  2432  TGACCCATCTGAAAGACTGCTTCACAACTTGGATACTGTTTACTGTAAGCCTCCAGAAAC  2491
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  2332  TGACCCATCTGAAAGACTGCTTCACAACTTGGATACTGTTTACTGTAAGCCTCCAGAAAT  2391

Query  2492  TATTACCTCTAAGGACGATGGGTTAGTTCCTACTCTAGAATCCAGGCAGCTATCATTTCA  2551
             ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct  2392  TATTACCACTAAGGTCGATGGGTTAGTTCCTACTCTAGAACCCAGGCAGCTATCGTTTCA  2451

Query  2552  CGTGGAAGAACCTTCTGTTCAAAAAGATCAGTGGTCTGTTTTATCCGGTGCCACAGAACA  2611
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct  2452  CGTGGAAGAACCTTCTGTTCAAAAAGATCAGTGGTCTGTTTTACCCGGTGCCACAGAAAA  2511

Query  2612  AGTAACAGATGGTGGTTACACGAATGACTCCGCAGTAATAGGAAATCAAAATTTTAATAG  2671
             |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct  2512  AGTAACCGAGGGTGCTTACACGAATGACTCCGCAGTAATAGGAAATCAAAATTGTAGTAG  2571

Query  2672  ACAGGAACAAATGGAATCTTCAAAAGGAGACTTTCATCCGTCAGCTTCTGACCATCAAAG  2731
             ||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  2572  ACAGGAACAGATAGACTCTTCAAAAGGAGACTTTCTTCCATCAGCTTCTGACCATCAAAG  2631

Query  2732  TATATTGGTTTCCTTATCAACAAGATGCGTATGGAAAGGATCTGTGTGTGAGCGGGCTCA  2791
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2632  TATATTGGTTTCCTTATCAACAAGATGTGTATGGAAAGGATCTGTGTGTGAGCGGGCTCA  2691

Query  2792  TCTACTCCGTATCAAATACTATGGGAGCTTTGACAAGCCTTTAGGACGGTTTTTAAGGGA  2851
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  2692  TCTACTCCGTATCAAATACTATGGGAGCTTTGACAAGCCTTTAGGACGGTTCTTAAGGGA  2751

Query  2852  TAATCTCTTTGATCAGGATCAGTGCTGCCCGTCATGTACGATGCCAGCGGAAGCACACAT  2911
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2752  TAATCTCTTTGATCAGGATCAGTACTGCCCGTCATGTACGATGCCAGCGGAAGCACACAT  2811

Query  2912  TCATTGTTATACTCATAGGCAAGGTAGTCTGACAATATCTGTTAAGAAACTGCCTGAATT  2971
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2812  TCATTGTTATACTCATAGGCAAGGTAGCCTGACAATATCTGTTAAGAAACTGCCTGAATT  2871

Query  2972  GCTACCTGGGCAACGTGAAGGGAAGATTTGGATGTGGCATCGGTGCCTGAAATGTCCTCG  3031
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2872  GCTACCTGGGCAACGTGAAGGGAAGATTTGGATGTGGCATCGGTGCCTGAAATGTCCTCG  2931

Query  3032  GATCAATGGCTTTCCTCCAGCCACACGCAGAATTGTAATGTCAGATGCTGCGTGGGGCCT  3091
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2932  GATCAATGGCTTTCCTCCAGCCACACGCAGAATTGTAATGTCAGATGCTGCGTGGGGCCT  2991

Query  3092  GTCTTTTGGCAAATTTTTGGAGCTGAGCTTTTCTAACCATGCAGCGGCTAGTCGTGTGGC  3151
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2992  GTCTTTTGGCAAATTTTTGGAACTGAGCTTTTCTAACCATGCAGCGGCTAGTCGTGTGGC  3051

Query  3152  CAACTGTGGTCATTCCCTTCACAGAGACTGTCTCCGGTTCTACGGTTTTGGGAGAATGGT  3211
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  3052  CAACTGTGGTCATTCCCTTCACAGAGACTGTCTCCGGTTCTATGGTTTTGGGAGAATGGT  3111

Query  3212  TGCTTGCTTCCGCTATGCTTCAATCAATATTTACGCAGTGACTCTGCCACCAGCAAAGCT  3271
              ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||
Sbjct  3112  GGCTTGCTTCCGCTATGCTTCAATCAATATTTTCGCAGTGTTTCTGCCACCAGCAAAACT  3171

Query  3272  TTATTTTAACTATGAGAACCAGGAATGGCTCCAAAAGGAATCAAAAGAGGTGATTAAAAA  3331
             | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3172  TGAGTTTAACTATGAGAACCAGGAATGGCTCCAAAAGGAATCAAAAGAGGTGATTAAAAA  3231

Query  3332  AGCGGAAGTCCTTTTTAATGAGGTTCAGGAGGCTCTTAGTCAAATTTCAGC-GAAAACTA  3390
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
Sbjct  3232  AGCGGAAGTCCTTTTTAATGAGGTTCAGGAGGCTCTTAGTCAAATTTCA-CTGAAAACAA  3290

Query  3391  TGGGCGCAGGTTCCAAGGGCAGCACTCCCAACAAGATCAAGCTTTCTCTTGAAGAACTTG  3450
             ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  3291  TGGGTACAGGTTCCAAGGGCAGCACTCTCAACAAGATAAAGCTTTCTCTTGAAGAACTTG  3350

Query  3451  CAGGACTTCTTGAGCAACGTAAAAAGGAATATAAGGATTCATTGCAGCAAATGTTAAATG  3510
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  3351  CAGGACTTCTTGAGCAACGTAAAAAGGAATATAAGGAATCATTGCAGCAAATGTTAAATG  3410

Query  3511  TGGTTAAGGATGGACAACCTACTATTGATATCCTTCTGATAAATAAACTTCGAAGGCTGA  3570
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3411  TGGTTAAGGATGGACAACCTACTATTGATATCCTTCTGATAAATAAACTTCGAAGGCTGA  3470

Query  3571  TAATTTTCGATTCATATGCTTGGGATGAATGCCTAGCAGGGGCGGCCAATATGGTAAGAA  3630
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
Sbjct  3471  TACTTTTCGATTCATATGCTTGGGATGAATGCCTAGCAAGGGCGGCCAGTATGGTAAGAA  3530

Query  3631  ATAACTATT-TGGAAGCTCCGAAGAATTCAGCCCCAAAAGTTATGGGTCGTAACGTCTCC  3689
             ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3531  ATAACTATTCT-GAAGCTCCGAAGAATTCTGCCTCAAAATTTATGGGTCGTAACGTCTCC  3589

Query  3690  TTAGAGAAGCTCAGTGATGAAAAAGTAAAGTCGATACCGACCCATGTTGCAATTTGTAAT  3749
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | | |||||
Sbjct  3590  TTAGAGAAGCTCAGTGATGAAAAAATAAAGTCGATACCGTCCCATGTTGCCAGTAGTAAT  3649

Query  3750  GACTCTCTTCTCCAGGATGCAGACTACGAAACGTGTCTTAACCAAGGTAAATCATTTGCT  3809
             ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  3650  GACTCTCTTCTCCAGGATGCAGAGTACGAAACATGTCCTAACCAAGGTAAATCATTTGCT  3709

Query  3810  GATACTAGTGGCAAATTTGCTATTCCTGAAGATGTAGGCTCAGACAGACCCCCAGATTGT  3869
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||
Sbjct  3710  GATACTAGTGGCAAATTTGCTATTCCTGAAGATGTAGGCCCAGACATACCCCCAGAATGT  3769

Query  3870  AGGATGGAGTTCGACCCTAGTGAAGGTGGTAAAGATAATTTTGTAGAGTCTTCGCAGGTG  3929
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||
Sbjct  3770  AGGATGGAGTTCGACCCTAGTGAAGGTGGTAAAGATAACTTTGTGGAGTCTTCACAGGTG  3829

Query  3930  GTTAAACCAGCACACACCGAGAGCCAGTTTCAAGCAACAGACTTATCTGATACTCTTGAT  3989
             |||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3830  GTTAAAGCAGTACACTCCGAGAGCCAGTATCAAGCAACAGACTTATCTGATACTCTTGAT  3889

Query  3990  GCAGCATGGATAGGTGAACAAACTACTTCAGAGAATGGTATTTTCCGTCCGCCTAGCAGA  4049
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||
Sbjct  3890  GCAGCATGGATAGGTGAACAAACTACTTCAGAGAATGGTCTTTCCCGTCCGCCTAACAGA  3949

Query  4050  GCTGCTTCAACAAATGGAACTCAGATCCCTGATTTAAGGCTGTTGGGTTCAGAAAGTGAG  4109
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3950  GCTGCTTCAACAAATGGAACTCAGATCCCTGATTTAAGGCTGTTGGGTTCAGAAAGTGAG  4009

Query  4110  CTGAACTTTAAAGGAGGCCCTACCAATGATGAACATACAACACAAGTTCAGTTGCCTTCT  4169
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4010  CTGAACTTTAAAGGAGGCCCTACCAATGATGAACATACAACACAAGTTCAGTTGCCTTCT  4069

Query  4170  CCTAGTTTCTACTATTCACTCAACAAGAATTATTCGCTTAATTCTCGCAAGCATATCATG  4229
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  4070  CCTAGTTTCTACTATTCACTCAACAAGAATTATTCGCTTAATTCTCGCAAGCATATTATG  4129

Query  4230  GCTGAAGACCGGCCTGTTTATGTTTCTTCATATAGAGAGCTTGAATGGCGAAGTGGTGCA  4289
             |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  4130  GCTGAAGACCGGCCGGTTTATGTTTCTTCATATAGAGAGCTTGAATGGCGAAGTGGTGCG  4189

Query  4290  AGGCTGCTGCTTCCTCTGGGATGTAATGACTTAGTACTGCCAGTTTATGATGACGAACCT  4349
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4190  AGGTTGCTGCTTCCTCTGGGATGTAATGACTTAGTACTGCCAGTTTATGATGACGAACCT  4249

Query  4350  ACTAGTATCATAGCTTATGCCCTTACATCATCAGAATATAAAGCTCAGATGTCTGGATCA  4409
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4250  ACTAGTATCATAGCTTATGCCCTTACGTCATCAGAATATAAAGCTCAGATGTCTGGATCA  4309

Query  4410  GATAAGTCAAGAGATCGCTTGGATAGTGGAGGTTCCTTTTCACTTTTTGATTCTGTTAAT  4469
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4310  GATAAGTCAAGAGATCGCTTGGATAGTGGAGGTTCCTTTTCACTTTTTGATTCTGTTAAT  4369

Query  4470  CTTCTCTCATTGAACTCTTTGAGTGATTTGTCGGTCGACATGAGTAGAAGTCTTAGCTCT  4529
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4370  CTTCTCTCATTGAACTCTTTGAGTGATTTGTCGGTCGACATGAGTAGAAGTCTTAGCTCT  4429

Query  4530  GCTGATGAACAAGTCTCGCAGCTGCTACATTCATCACTGTATTTGAAAGATCTGCATGCG  4589
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4430  GCTGATGAACAAGTCTCGCAGCTGCTACATTCATCACTGTATTTGAAAGATCTGCATGCG  4489

Query  4590  AGGATTTCGTTTACAGATGAAGGTCCTCCTGGGAAAGTGAAGTACTCTGTGACGTGTTAT  4649
             ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4490  AGGGTTTCGTTTACAGATGAAGGTCCTCCTGGGAAAGTGAAGTACTCTGTGACGTGTTAT  4549

Query  4650  TATGCTAAGGAGTTTGAAGCCCTGAGGATGATTTGCTGTCCTTCAGAAACAGATTTCATT  4709
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4550  TATGCTAAGGAGTTTGAAGCCCTGAGGATGATTTGCTGTCCTTCAGAAACAGATTTCATT  4609

Query  4710  AGATCTCTTGGTCGTTGTAGAAAATGGGGAGCCCAGGGTGGAAAGAGCAACGTCTTCTTT  4769
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4610  AGATCTCTTGGTCGTTGTAGAAAATGGGGAGCCCAGGGTGGAAAGAGCAACGTCTTCTTT  4669

Query  4770  GCAAAAAGTTTGGATGACCGTTTTATCATCAAGCAAGTTACAAAGACAGAGCTTGAGTCC  4829
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4670  GCAAAAAGTTTGGATGACCGTTTTATAATCAAGCAAGTTACAAAGACAGAGCTTGAGTCC  4729

Query  4830  TTCATCAAATTTGGGCCAGCTTACTTCAAATACCTGACTGAGTCCATCAGTACTAAAAGC  4889
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4730  TTCATCAAATTTGGGCCAGCTTACTTCAAATACCTGACTGAGTCCATCAGTACTAAAAGC  4789

Query  4890  CCTACAAGCCTTGCAAAGATCTTGGGAATCTATCAGGTTTCATCCAAACACCTTAAAGGA  4949
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4790  CCTACAAGCCTTGCAAAGATCTTGGGAATCTATCAGGTTTCATCCAAACACCTTAAAGGA  4849

Query  4950  GGAAAAGAGTTCAAAATGGACGTCTTGGTGATGGAGAATCTTCTGTTCAAGCGAAACTTC  5009
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  4850  GGAAAAGAGTTCAAAATGGACGTCTTGGTGATGGAAAATCTTCTGTTCAAGCGGAACTTC  4909

Query  5010  ACTAGGCTTTATGACCTAAAAGGCTCCACTCGGGCTCGTTACAATCCCGATACAAGTGGT  5069
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4910  ACTAGGCTTTATGACCTAAAAGGCTCCACTCGTGCTCGTTACAATCCCGATACAAGTGGT  4969

Query  5070  AGCAATACAGTTTTGCTGGATCAGAATCTTGTCGAAGCAATGCCAACATCTCCAATATTT  5129
             |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  4970  AGCAATACAGTTTTGCTGGACCAGAATCTGGTCGAAGCAATGCCGACATCTCCAATATTT  5029

Query  5130  GTTGGGAGCAAGGCAAAACGGCTTCTTGAAAGAGCAGTCTGGAATGATACATCATTTCTT  5189
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  5030  GTTGGGAGCAAGGCAAAACGTCTTCTTGAAAGAGCAGTCTGGAATGATACATCCTTTCTT  5089

Query  5190  GCTTCGATTCACGTAATGGATTACTCCTTACTAGTCGGGGTAGATGAGGAAAGAAACGAG  5249
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5090  GCTTCGATTCACGTAATGGATTACTCCTTACTAGTCGGGGTAGATGAGGAAAGAAACGAG  5149

Query  5250  CTGGTTCTAGGAATTATCGATTTCATGAGGCAATACACTTGGGACAAACATCTGGAGACT  5309
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct  5150  CTGGTTTTAGGAATTATCGATTTCATGAGGCAATACACTTGGGACAAACATTTGGAGACT  5209

Query  5310  TGGGTCAAGACTTCAGGGCTCCTTGGAGGACCCAAGAACTCAACTCCCACAGTGATATCG  5369
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct  5210  TGGGTCAAGACTTCAGGGCTCCTTGGAGGACCCAAGAACTCAACTCCAACAGTAATATCG  5269

Query  5370  CCGCAGCAATACAAGAAAAGATTCAGGAAAGCGATGACGGCTTATTTTCTGATGGTTCCT  5429
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  5270  CCTCAGCAATACAAGAAAAGATTCAGGAAAGCGATGACGGCTTATTTTGTGATGGTTCCT  5329

Query  5430  GACCAGTGGTCGCCTGCCGCGGTTGTGCCAAGCAACAGTTCTTCAGCAGAGGTGAAGGAG  5489
             ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  5330  GACCAATGGTCGCCTGCCACGGTTGTGCCAAGCAACAGTTCTGCAGCAGAGGTGAAGGAG  5389

Query  5490  GAAGAAGAGAAAGACAATCCTCAAGCTGTTGGTAACAAGTCCTGAAGTATTTTCAGCAA-  5548
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| 
Sbjct  5390  GAAGAAGAGAGAGACAATCCTCAAGCTGTTGGTAACAAGTCCTGAAGCATTTTCTGCAAG  5449

Query  5549  A--CATACACAATATTCAGTTAGCAAATATAGtttttattttttttGGTTGGAATGGTCT  5606
             |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  5450  AGACATACACGATATTCAGTTAGCAGATATAGTTTTTATTCTTTTTGGTTGGAATGGTCT  5509

Query  5607  TTTGGGTAATTTGTGTTTATGTATTACCCTTGGCCTTAAGTGTGGCATATGCCTCTTCCA  5666
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
Sbjct  5510  TTTGGGTAATTTGTGTTTATGTATTACCCTTGGCCTTAGGTGTGGCCTATGCCTCTTCCA  5569

Query  5667  TCGCCTTTGCATCAGAATTAATAAAAGAAAGATGCAATTGTACAGACACTGCTTCTATCT  5726
             |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  5570  TCGCCTTTGCATCAGAATTAATGAAAGCAAGATGCAATTGTACATACACTGCTTCTATCT  5629

Query  5727  TTTAGTGTTTGTTATTCGTCGTAACTTATGTTTTTATCAACA  5768
             |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||
Sbjct  5630  TTTAGTGTTTGTTATTCGT--TA-CTTATGTTTTTATCAACA  5668


> Ahg478844 jgi|Araly1|478844|fgenesh2_kg.3__1545__AT3G14270.1
Length=5702

 Score = 52.8 bits (28),  Expect = 3e-05
 Identities = 28/28 (100%), Gaps = 0/28 (0%)
 Strand=Plus/Plus

Query  3981  ACTCTTGATGCAGCATGGATAGGTGAAC  4008
             ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4100  ACTCTTGATGCAGCATGGATAGGTGAAC  4127



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 219173562907


  Database: halleri_transcript_ahg.fa
    Posted date:  Sep 25, 2014  2:02 AM
  Number of letters in database: 38,939,717
  Number of sequences in database:  32,672



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5