BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G33240.1 Length=5786 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg491361 jgi|Araly1|491361|fgenesh2_kg.7__794__AT4G33240.2 9382 0.0 Ahg478844 jgi|Araly1|478844|fgenesh2_kg.3__1545__AT3G14270.1 52.8 3e-05 > Ahg491361 jgi|Araly1|491361|fgenesh2_kg.7__794__AT4G33240.2 Length=5668 Score = 9382 bits (5080), Expect = 0.0 Identities = 5485/5682 (97%), Gaps = 22/5682 (0%) Strand=Plus/Plus Query 95 TCTTGAATCAAGCATAAATTCTGGA-TTTTGAAGTTTGAGAGTGACCCAGTGACTTTGGT 153 ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| Sbjct 1 TCTTGAATCGAGCATAAATTCTGGATTTTTGAAGTTTGAGAGTGATCCAGTGAC-TTGGT 59 Query 154 CTGAATCTCGGAGGTATCTTATTCCAGGGATCAAGGATTAGACTTAATGCGATTAAGCAA 213 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 60 CTCAATCTCGGAGGTATCTTATTCCAGGGATCAAGGATTAGACTTAATGCGATTTAGCAA 119 Query 214 ATGGGTTTTTCACGATGACTCTCCTTGTTGTTGGGGAGATTCAATAAATGGACTCACAAG 273 |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 120 ATGGGTTTTTCATGAAGACTCTCCTTGTTGTTGGGGAGATTCAATAAATGGACTCACCAG 179 Query 274 ATCACAAAGCACCTGGCTTTGTTGACATAGTCAAATCTTGGATCCCTAGAAAGAGTGAGT 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 ATCACAAAGCACCTGGCTTTGTTGACATAGTCAAATCTTGGATCCCTAGAAAGAGTGAGT 239 Query 334 CCTCAAATATGTCGAGGGATTTTTGGATGCCTGACCAAAGCTGTCCTGTGTGTTATGAGT 393 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| Sbjct 240 CCTCAAATATGTCGAGGGATTTTTGGATGCCTGACCAGAGTTGTCCTGTGTGTTACGAGT 299 Query 394 GTGATGCTCAGTTCACTGTGTTTAATCGAAGACATCATTGCCGCCTTTGTGGTCGAGTTT 453 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 300 GTGATGCTCAGTTCACTGTGTTTAATCGAAGACATCATTGCCGGCTTTGTGGTCGAGTGT 359 Query 454 TTTGTGCCAAATGCGCTGCAAATTCCATTCCATCTCCATCAGATGAAACAAAGGATAGTC 513 ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 360 TTTGTGCCAAATGCGCTGCAAATTCTATCCCATCTCCATCAGATGAAACAAAGGATAGTC 419 Query 514 ATGAGGAACCAGAAAGGATTAGGGTGTGTAATTACTGCTACAAACAGTGGGAACAGGGGA 573 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 ATGAGGAGCCAGAAAGGATTAGGGTTTGTAATTACTGCTACAAACAGTGGGAACAGGGGA 479 Query 574 TAGTTCCCCCTGATAATGGGGCTTCTATTATTAGCCTTCATTTTAGTTCATCGCCTTCTG 633 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 480 TAGTTCCCCCTGATAATGGGGCTTCTATTATTAGCCTTCATTTTAGTTCATCCCCTTCTG 539 Query 634 CTAGAAGCGTCGCAAGTACTACCTCTAATAGTAGCAACTGCACCATTGATTCAACTGCTG 693 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 540 CTAGAAGCGTGGCAAGTACTACCTCTAATAGTAGCAATTGCACCATTGATTCAACTGCTG 599 Query 694 GACCTTCCCCTAGACCCAAAATGAATCCCCGAGCTAGCCGTCGTGTCTCGTCAAACATGG 753 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | Sbjct 600 GACCTTCCCCTAGACCCAAAATGAATCCCCGAGCTAGCCGTCGCGTCTCGTTAAACATAG 659 Query 754 ATTCTGAAAAGTCTGAGCAGCAGAATGCAAAATCGCGTAGGAG-CTCAGATCATTATGGG 812 ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||| Sbjct 660 ATTCTGAAAAGTCTGAGAAGCAGAATGCAACATCGCGTAGGAGCCT-GGATCCTTATGGG 718 Query 813 CATGTGTTAGATTCTTCTGATAATCAAGTTGAATTCTTTGTCAACAGTAGTGGCAGGAGT 872 |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| Sbjct 719 CATGTGCTAGA---TTCTGAAAATCAAGTTGAATTCTTTGTGAAC---AGTGGCAGGAGT 772 Query 873 GATGGTGAAGCTGATGACGATGACGATTATCAATCTGATTTTGCACAATCTTACGCTCAA 932 ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 773 GATGGTGAAGCTGATGATGATGACGATTATCACTCTGATTTTGCACAATCTTACGCTCAA 832 Query 933 GGAAATGACTACTATGGTGCCATCAACCTCGATGAAGTAGACCATATCTATGGGTCACAT 992 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 833 GGAAATGACTACTATGGTGCCATCAGCCTCGATGAAGTAGACCAGATCTATGGGTCACAT 892 Query 993 GAAGCTCATGACGTTGGTGTAAAAATAGAACCAAACATAAGTGGCTTTCCCCCTGATCAA 1052 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 893 GAAGCTCATGACGTTGGTGTAAAAATAGAACCAAACATAAGTTGCTTTCCCCCTGATCAA 952 Query 1053 GATCTTGACTCACTGAATACAGAGACGATAGATAAAACCAGACAACAAGAAAATGGATGG 1112 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 953 GATCTTGACTCACTGAATACAGATACGATAGATAAAACCAGACAACAAGAAAATGGATGG 1012 Query 1113 AACGATGTAAAGGAGGGAAGCCCTCCTTGTGAAGAGTCCTTTGAGCCCGAAGTTGTTGAT 1172 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| Sbjct 1013 AACGATGTGAAGGAGGGAAGCCCTCCTTGTGAAGAGTCTTTTGAGCCCGAAGTAGTGGAT 1072 Query 1173 TTTGAGAGTGATGGGCTCTTATGGCTACCACCAGAGCCAGAGAACGAAGAAGATGAAAGA 1232 |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1073 TTTGAGAGCGATGGCCTGTTATGGCTACCGCCAGAGCCAGAGAACGAAGAAGATGAAAGA 1132 Query 1233 GAAGCAGTGCTATCTGATGATGACGGTGATGAAGGTGATAGAGGTGATTGGGGGTACCTT 1292 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct 1133 GAAGCAGTGCTATCTGATGATGACGGTGATGAAGGTGATAGAGGTGACTGGGGCTACCTT 1192 Query 1293 CGCCCATCAAATAGCTTTAACGAGAAGGATTTCCACTCTAAGGACAAGTCCAGTGGTGCT 1352 |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1193 CGCCCATCAAATAGCTTTAATGATAAGGACTTCCACTCTAAGGATAAGTCCAGTGGTGCT 1252 Query 1353 ATGAAAAATGTTGTTGAAGGGCACTTTAGGGCTTTGGTAGCACAACTTTTGGAGGTTGAT 1412 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1253 ATGAAAAATGTTGTTGAAGGGCACTTTAGGGCTTTGGTAGCCCAACTTTTGGAGGTTGAT 1312 Query 1413 AATCTACCTATGGTCAACGAAGGTGATGAAGAGGGCTGGCTTGATATAATTACATCATTA 1472 |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1313 AATCTACCCATGGTCAATGAAGGGGATAAAGAGGGCTGGCTTGATATAATTACATCATTA 1372 Query 1473 TCTTGGGAGGCTGCAACGCTTCTCAAGCCAGATACAAGTAAAAGTGGAGGAATGGATCCA 1532 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1373 TCTTGGGAGGCTGCAACGCTTCTCAAGCCAGATACAAGTAAAAGTGGAGGAATGGATCCA 1432 Query 1533 GGAGGATACGTGAAGGTTAAATGCATCCCTTGTGGACGTCGCAGTGAGAGTATGGTCGTG 1592 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1433 GGAGGATACGTGAAGGTTAAATGCATCCCTTGTGGACGTCGCAGTGAAAGTATGGTCGTG 1492 Query 1593 AAAGGAGTTGTTTGTAAGAAAAATGTGGCTCATCGGCGAATGACTTCAAAGATCGAGAAG 1652 ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1493 AAAGGAGTTGTTTGTAAAAAAAATGTGGCCCATCGGCGAATGACTTCAAAGATTGAGAAG 1552 Query 1653 CCGCGTCTGCTAATCCTTGGAGGAGCTCTGGAGTATCAGCGCATCTCTAACCAGCTGTCT 1712 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1553 CCACGTCTGCTAATCCTTGGAGGAGCTCTGGAGTATCAGCGCATCTCTAACCAGCTGTCT 1612 Query 1713 AGTTTTGACACTTTGTTGCAACAGGAAATGGACCATTTGAAGATGGCTGTTGCCAAAATT 1772 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1613 AGTTTTGACACTTTGTTGCAACAGGAAATGGACCATTTGAAGATGGCTGTTGCCAAAATT 1672 Query 1773 GATTCTCACAATCCTGACATTCTCTTGGTGGAGAAATCTGTCTCGCGGTTTGCGCAGGAA 1832 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| Sbjct 1673 GATTCTCACAATCCTGACATTCTCTTGGTGGAGAAATCTGTATCGCGATTTGCGCAGGAA 1732 Query 1833 TATCTTCTCGCGAAGGACATATCTCTCGTGTTAAATATTAAAAGGTCCCTTCTAGAGCGC 1892 |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1733 TATCTTCTTGCGAAGGACATATCTCTTGTGTTAAATATTAAAAGGTCCCTTCTAGAGCGC 1792 Query 1893 ATATCCCGCTGTACTGGTGCGCAGATTGTCCCTTCGATCGACCAGCTCACATCACCAAAG 1952 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1793 ATATCTCGCTGTACTGGTGCGCAGATTGTCCCTTCGATCGACCAGCTCACATCACCAAAG 1852 Query 1953 CTAGGTTATTGTGACCTGTTCCATGTGGAAAAGTTTGTGGAGACACATGTTAGTCCTTGT 2012 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| Sbjct 1853 CTGGGTTATTGTGACCTGTTCCATGTGGAAAAGTTTGTCGAGAAACATGTTAGTCCTTGT 1912 Query 2013 CAAGTTGCGAAGAAAATGGCCAAGACTTTAATGTTTTTTGATGGCTGCCCGAAACCTTTG 2072 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1913 CAAGTTGCGAAGAAAATGGCCAAGACTTTAATGTTTTTTGATGGCTGCCCGAAACCTTTG 1972 Query 2073 GGTTGTACAATATTGCTCAAGGGGGCACATGAAGATGAGCTAAAGAAGGTGAAACATGTG 2132 ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1973 GGTTGTACAATATTGCTTAAGGGGGCGCATGAAGATGAGCTAAAGAAGGTGAAACATGTG 2032 Query 2133 ATTCAGTATGGAGTTTTTGCAGCATATCACTTGGCTCTTGAGACATCCTTCCTAGCAGAT 2192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2033 ATTCAGTATGGAGTTTTTGCAGCATATCACTTGGCTCTTGAGACATCCTTCCTAGCAGAT 2092 Query 2193 GAAGGTGCTTCCATT-CACGAACTTCCTCTGCAGACCCCAATTACTGTGGCGTTACCTGA 2251 |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| Sbjct 2093 GAAGGTGCTTCCCTTCCA-GAACTTCCTCTGCAGACCCCAATTACAGTGGCTTTACCTGA 2151 Query 2252 TAAACCATCAATGGTTAACAGATCAATATCCACAATACCTGGTTTTACTGTGTCAAGTGC 2311 ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2152 TAAACCATCAACGATTAACAGATCAATATCGACAATACCTGGTTTTACTGTGTCAAGTGC 2211 Query 2312 TGAAAAGTCTCCAACTACTGAGTTAAGGGGTGAGCCACATAAAGCCAATGGCGACCTTAC 2371 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2212 TGAAAAGTCTCCAACTACTGAGTTAAGGGGTGAGCCACATAAAGCCAATGGCGACCTTAC 2271 Query 2372 TGGTAATTTCACTTCTAGTAAGACTCATTTCCAAGGGAAATTGGATGGAAACGACAGGAT 2431 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2272 CGGTAATTTCACTTCTAGTAAGACTCATTTGCAAGGGAAATTGGATGGAAACGACAGGAT 2331 Query 2432 TGACCCATCTGAAAGACTGCTTCACAACTTGGATACTGTTTACTGTAAGCCTCCAGAAAC 2491 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2332 TGACCCATCTGAAAGACTGCTTCACAACTTGGATACTGTTTACTGTAAGCCTCCAGAAAT 2391 Query 2492 TATTACCTCTAAGGACGATGGGTTAGTTCCTACTCTAGAATCCAGGCAGCTATCATTTCA 2551 ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| Sbjct 2392 TATTACCACTAAGGTCGATGGGTTAGTTCCTACTCTAGAACCCAGGCAGCTATCGTTTCA 2451 Query 2552 CGTGGAAGAACCTTCTGTTCAAAAAGATCAGTGGTCTGTTTTATCCGGTGCCACAGAACA 2611 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | Sbjct 2452 CGTGGAAGAACCTTCTGTTCAAAAAGATCAGTGGTCTGTTTTACCCGGTGCCACAGAAAA 2511 Query 2612 AGTAACAGATGGTGGTTACACGAATGACTCCGCAGTAATAGGAAATCAAAATTTTAATAG 2671 |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 2512 AGTAACCGAGGGTGCTTACACGAATGACTCCGCAGTAATAGGAAATCAAAATTGTAGTAG 2571 Query 2672 ACAGGAACAAATGGAATCTTCAAAAGGAGACTTTCATCCGTCAGCTTCTGACCATCAAAG 2731 ||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2572 ACAGGAACAGATAGACTCTTCAAAAGGAGACTTTCTTCCATCAGCTTCTGACCATCAAAG 2631 Query 2732 TATATTGGTTTCCTTATCAACAAGATGCGTATGGAAAGGATCTGTGTGTGAGCGGGCTCA 2791 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2632 TATATTGGTTTCCTTATCAACAAGATGTGTATGGAAAGGATCTGTGTGTGAGCGGGCTCA 2691 Query 2792 TCTACTCCGTATCAAATACTATGGGAGCTTTGACAAGCCTTTAGGACGGTTTTTAAGGGA 2851 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 2692 TCTACTCCGTATCAAATACTATGGGAGCTTTGACAAGCCTTTAGGACGGTTCTTAAGGGA 2751 Query 2852 TAATCTCTTTGATCAGGATCAGTGCTGCCCGTCATGTACGATGCCAGCGGAAGCACACAT 2911 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2752 TAATCTCTTTGATCAGGATCAGTACTGCCCGTCATGTACGATGCCAGCGGAAGCACACAT 2811 Query 2912 TCATTGTTATACTCATAGGCAAGGTAGTCTGACAATATCTGTTAAGAAACTGCCTGAATT 2971 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2812 TCATTGTTATACTCATAGGCAAGGTAGCCTGACAATATCTGTTAAGAAACTGCCTGAATT 2871 Query 2972 GCTACCTGGGCAACGTGAAGGGAAGATTTGGATGTGGCATCGGTGCCTGAAATGTCCTCG 3031 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2872 GCTACCTGGGCAACGTGAAGGGAAGATTTGGATGTGGCATCGGTGCCTGAAATGTCCTCG 2931 Query 3032 GATCAATGGCTTTCCTCCAGCCACACGCAGAATTGTAATGTCAGATGCTGCGTGGGGCCT 3091 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2932 GATCAATGGCTTTCCTCCAGCCACACGCAGAATTGTAATGTCAGATGCTGCGTGGGGCCT 2991 Query 3092 GTCTTTTGGCAAATTTTTGGAGCTGAGCTTTTCTAACCATGCAGCGGCTAGTCGTGTGGC 3151 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2992 GTCTTTTGGCAAATTTTTGGAACTGAGCTTTTCTAACCATGCAGCGGCTAGTCGTGTGGC 3051 Query 3152 CAACTGTGGTCATTCCCTTCACAGAGACTGTCTCCGGTTCTACGGTTTTGGGAGAATGGT 3211 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3052 CAACTGTGGTCATTCCCTTCACAGAGACTGTCTCCGGTTCTATGGTTTTGGGAGAATGGT 3111 Query 3212 TGCTTGCTTCCGCTATGCTTCAATCAATATTTACGCAGTGACTCTGCCACCAGCAAAGCT 3271 ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || Sbjct 3112 GGCTTGCTTCCGCTATGCTTCAATCAATATTTTCGCAGTGTTTCTGCCACCAGCAAAACT 3171 Query 3272 TTATTTTAACTATGAGAACCAGGAATGGCTCCAAAAGGAATCAAAAGAGGTGATTAAAAA 3331 | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3172 TGAGTTTAACTATGAGAACCAGGAATGGCTCCAAAAGGAATCAAAAGAGGTGATTAAAAA 3231 Query 3332 AGCGGAAGTCCTTTTTAATGAGGTTCAGGAGGCTCTTAGTCAAATTTCAGC-GAAAACTA 3390 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | Sbjct 3232 AGCGGAAGTCCTTTTTAATGAGGTTCAGGAGGCTCTTAGTCAAATTTCA-CTGAAAACAA 3290 Query 3391 TGGGCGCAGGTTCCAAGGGCAGCACTCCCAACAAGATCAAGCTTTCTCTTGAAGAACTTG 3450 |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3291 TGGGTACAGGTTCCAAGGGCAGCACTCTCAACAAGATAAAGCTTTCTCTTGAAGAACTTG 3350 Query 3451 CAGGACTTCTTGAGCAACGTAAAAAGGAATATAAGGATTCATTGCAGCAAATGTTAAATG 3510 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3351 CAGGACTTCTTGAGCAACGTAAAAAGGAATATAAGGAATCATTGCAGCAAATGTTAAATG 3410 Query 3511 TGGTTAAGGATGGACAACCTACTATTGATATCCTTCTGATAAATAAACTTCGAAGGCTGA 3570 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3411 TGGTTAAGGATGGACAACCTACTATTGATATCCTTCTGATAAATAAACTTCGAAGGCTGA 3470 Query 3571 TAATTTTCGATTCATATGCTTGGGATGAATGCCTAGCAGGGGCGGCCAATATGGTAAGAA 3630 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| Sbjct 3471 TACTTTTCGATTCATATGCTTGGGATGAATGCCTAGCAAGGGCGGCCAGTATGGTAAGAA 3530 Query 3631 ATAACTATT-TGGAAGCTCCGAAGAATTCAGCCCCAAAAGTTATGGGTCGTAACGTCTCC 3689 ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3531 ATAACTATTCT-GAAGCTCCGAAGAATTCTGCCTCAAAATTTATGGGTCGTAACGTCTCC 3589 Query 3690 TTAGAGAAGCTCAGTGATGAAAAAGTAAAGTCGATACCGACCCATGTTGCAATTTGTAAT 3749 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | | ||||| Sbjct 3590 TTAGAGAAGCTCAGTGATGAAAAAATAAAGTCGATACCGTCCCATGTTGCCAGTAGTAAT 3649 Query 3750 GACTCTCTTCTCCAGGATGCAGACTACGAAACGTGTCTTAACCAAGGTAAATCATTTGCT 3809 ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 3650 GACTCTCTTCTCCAGGATGCAGAGTACGAAACATGTCCTAACCAAGGTAAATCATTTGCT 3709 Query 3810 GATACTAGTGGCAAATTTGCTATTCCTGAAGATGTAGGCTCAGACAGACCCCCAGATTGT 3869 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| Sbjct 3710 GATACTAGTGGCAAATTTGCTATTCCTGAAGATGTAGGCCCAGACATACCCCCAGAATGT 3769 Query 3870 AGGATGGAGTTCGACCCTAGTGAAGGTGGTAAAGATAATTTTGTAGAGTCTTCGCAGGTG 3929 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| Sbjct 3770 AGGATGGAGTTCGACCCTAGTGAAGGTGGTAAAGATAACTTTGTGGAGTCTTCACAGGTG 3829 Query 3930 GTTAAACCAGCACACACCGAGAGCCAGTTTCAAGCAACAGACTTATCTGATACTCTTGAT 3989 |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3830 GTTAAAGCAGTACACTCCGAGAGCCAGTATCAAGCAACAGACTTATCTGATACTCTTGAT 3889 Query 3990 GCAGCATGGATAGGTGAACAAACTACTTCAGAGAATGGTATTTTCCGTCCGCCTAGCAGA 4049 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| Sbjct 3890 GCAGCATGGATAGGTGAACAAACTACTTCAGAGAATGGTCTTTCCCGTCCGCCTAACAGA 3949 Query 4050 GCTGCTTCAACAAATGGAACTCAGATCCCTGATTTAAGGCTGTTGGGTTCAGAAAGTGAG 4109 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3950 GCTGCTTCAACAAATGGAACTCAGATCCCTGATTTAAGGCTGTTGGGTTCAGAAAGTGAG 4009 Query 4110 CTGAACTTTAAAGGAGGCCCTACCAATGATGAACATACAACACAAGTTCAGTTGCCTTCT 4169 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4010 CTGAACTTTAAAGGAGGCCCTACCAATGATGAACATACAACACAAGTTCAGTTGCCTTCT 4069 Query 4170 CCTAGTTTCTACTATTCACTCAACAAGAATTATTCGCTTAATTCTCGCAAGCATATCATG 4229 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4070 CCTAGTTTCTACTATTCACTCAACAAGAATTATTCGCTTAATTCTCGCAAGCATATTATG 4129 Query 4230 GCTGAAGACCGGCCTGTTTATGTTTCTTCATATAGAGAGCTTGAATGGCGAAGTGGTGCA 4289 |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4130 GCTGAAGACCGGCCGGTTTATGTTTCTTCATATAGAGAGCTTGAATGGCGAAGTGGTGCG 4189 Query 4290 AGGCTGCTGCTTCCTCTGGGATGTAATGACTTAGTACTGCCAGTTTATGATGACGAACCT 4349 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4190 AGGTTGCTGCTTCCTCTGGGATGTAATGACTTAGTACTGCCAGTTTATGATGACGAACCT 4249 Query 4350 ACTAGTATCATAGCTTATGCCCTTACATCATCAGAATATAAAGCTCAGATGTCTGGATCA 4409 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4250 ACTAGTATCATAGCTTATGCCCTTACGTCATCAGAATATAAAGCTCAGATGTCTGGATCA 4309 Query 4410 GATAAGTCAAGAGATCGCTTGGATAGTGGAGGTTCCTTTTCACTTTTTGATTCTGTTAAT 4469 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4310 GATAAGTCAAGAGATCGCTTGGATAGTGGAGGTTCCTTTTCACTTTTTGATTCTGTTAAT 4369 Query 4470 CTTCTCTCATTGAACTCTTTGAGTGATTTGTCGGTCGACATGAGTAGAAGTCTTAGCTCT 4529 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4370 CTTCTCTCATTGAACTCTTTGAGTGATTTGTCGGTCGACATGAGTAGAAGTCTTAGCTCT 4429 Query 4530 GCTGATGAACAAGTCTCGCAGCTGCTACATTCATCACTGTATTTGAAAGATCTGCATGCG 4589 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4430 GCTGATGAACAAGTCTCGCAGCTGCTACATTCATCACTGTATTTGAAAGATCTGCATGCG 4489 Query 4590 AGGATTTCGTTTACAGATGAAGGTCCTCCTGGGAAAGTGAAGTACTCTGTGACGTGTTAT 4649 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4490 AGGGTTTCGTTTACAGATGAAGGTCCTCCTGGGAAAGTGAAGTACTCTGTGACGTGTTAT 4549 Query 4650 TATGCTAAGGAGTTTGAAGCCCTGAGGATGATTTGCTGTCCTTCAGAAACAGATTTCATT 4709 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4550 TATGCTAAGGAGTTTGAAGCCCTGAGGATGATTTGCTGTCCTTCAGAAACAGATTTCATT 4609 Query 4710 AGATCTCTTGGTCGTTGTAGAAAATGGGGAGCCCAGGGTGGAAAGAGCAACGTCTTCTTT 4769 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4610 AGATCTCTTGGTCGTTGTAGAAAATGGGGAGCCCAGGGTGGAAAGAGCAACGTCTTCTTT 4669 Query 4770 GCAAAAAGTTTGGATGACCGTTTTATCATCAAGCAAGTTACAAAGACAGAGCTTGAGTCC 4829 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4670 GCAAAAAGTTTGGATGACCGTTTTATAATCAAGCAAGTTACAAAGACAGAGCTTGAGTCC 4729 Query 4830 TTCATCAAATTTGGGCCAGCTTACTTCAAATACCTGACTGAGTCCATCAGTACTAAAAGC 4889 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4730 TTCATCAAATTTGGGCCAGCTTACTTCAAATACCTGACTGAGTCCATCAGTACTAAAAGC 4789 Query 4890 CCTACAAGCCTTGCAAAGATCTTGGGAATCTATCAGGTTTCATCCAAACACCTTAAAGGA 4949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4790 CCTACAAGCCTTGCAAAGATCTTGGGAATCTATCAGGTTTCATCCAAACACCTTAAAGGA 4849 Query 4950 GGAAAAGAGTTCAAAATGGACGTCTTGGTGATGGAGAATCTTCTGTTCAAGCGAAACTTC 5009 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| Sbjct 4850 GGAAAAGAGTTCAAAATGGACGTCTTGGTGATGGAAAATCTTCTGTTCAAGCGGAACTTC 4909 Query 5010 ACTAGGCTTTATGACCTAAAAGGCTCCACTCGGGCTCGTTACAATCCCGATACAAGTGGT 5069 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4910 ACTAGGCTTTATGACCTAAAAGGCTCCACTCGTGCTCGTTACAATCCCGATACAAGTGGT 4969 Query 5070 AGCAATACAGTTTTGCTGGATCAGAATCTTGTCGAAGCAATGCCAACATCTCCAATATTT 5129 |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 4970 AGCAATACAGTTTTGCTGGACCAGAATCTGGTCGAAGCAATGCCGACATCTCCAATATTT 5029 Query 5130 GTTGGGAGCAAGGCAAAACGGCTTCTTGAAAGAGCAGTCTGGAATGATACATCATTTCTT 5189 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 5030 GTTGGGAGCAAGGCAAAACGTCTTCTTGAAAGAGCAGTCTGGAATGATACATCCTTTCTT 5089 Query 5190 GCTTCGATTCACGTAATGGATTACTCCTTACTAGTCGGGGTAGATGAGGAAAGAAACGAG 5249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5090 GCTTCGATTCACGTAATGGATTACTCCTTACTAGTCGGGGTAGATGAGGAAAGAAACGAG 5149 Query 5250 CTGGTTCTAGGAATTATCGATTTCATGAGGCAATACACTTGGGACAAACATCTGGAGACT 5309 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 5150 CTGGTTTTAGGAATTATCGATTTCATGAGGCAATACACTTGGGACAAACATTTGGAGACT 5209 Query 5310 TGGGTCAAGACTTCAGGGCTCCTTGGAGGACCCAAGAACTCAACTCCCACAGTGATATCG 5369 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| Sbjct 5210 TGGGTCAAGACTTCAGGGCTCCTTGGAGGACCCAAGAACTCAACTCCAACAGTAATATCG 5269 Query 5370 CCGCAGCAATACAAGAAAAGATTCAGGAAAGCGATGACGGCTTATTTTCTGATGGTTCCT 5429 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 5270 CCTCAGCAATACAAGAAAAGATTCAGGAAAGCGATGACGGCTTATTTTGTGATGGTTCCT 5329 Query 5430 GACCAGTGGTCGCCTGCCGCGGTTGTGCCAAGCAACAGTTCTTCAGCAGAGGTGAAGGAG 5489 ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 5330 GACCAATGGTCGCCTGCCACGGTTGTGCCAAGCAACAGTTCTGCAGCAGAGGTGAAGGAG 5389 Query 5490 GAAGAAGAGAAAGACAATCCTCAAGCTGTTGGTAACAAGTCCTGAAGTATTTTCAGCAA- 5548 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| Sbjct 5390 GAAGAAGAGAGAGACAATCCTCAAGCTGTTGGTAACAAGTCCTGAAGCATTTTCTGCAAG 5449 Query 5549 A--CATACACAATATTCAGTTAGCAAATATAGtttttattttttttGGTTGGAATGGTCT 5606 | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 5450 AGACATACACGATATTCAGTTAGCAGATATAGTTTTTATTCTTTTTGGTTGGAATGGTCT 5509 Query 5607 TTTGGGTAATTTGTGTTTATGTATTACCCTTGGCCTTAAGTGTGGCATATGCCTCTTCCA 5666 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| Sbjct 5510 TTTGGGTAATTTGTGTTTATGTATTACCCTTGGCCTTAGGTGTGGCCTATGCCTCTTCCA 5569 Query 5667 TCGCCTTTGCATCAGAATTAATAAAAGAAAGATGCAATTGTACAGACACTGCTTCTATCT 5726 |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 5570 TCGCCTTTGCATCAGAATTAATGAAAGCAAGATGCAATTGTACATACACTGCTTCTATCT 5629 Query 5727 TTTAGTGTTTGTTATTCGTCGTAACTTATGTTTTTATCAACA 5768 ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| Sbjct 5630 TTTAGTGTTTGTTATTCGT--TA-CTTATGTTTTTATCAACA 5668 > Ahg478844 jgi|Araly1|478844|fgenesh2_kg.3__1545__AT3G14270.1 Length=5702 Score = 52.8 bits (28), Expect = 3e-05 Identities = 28/28 (100%), Gaps = 0/28 (0%) Strand=Plus/Plus Query 3981 ACTCTTGATGCAGCATGGATAGGTGAAC 4008 |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4100 ACTCTTGATGCAGCATGGATAGGTGAAC 4127 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 219173562907 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5