BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G34310.1
Length=3880
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg944474 jgi|Araly1|944474|scaffold_700703.1 6106 0.0
> Ahg944474 jgi|Araly1|944474|scaffold_700703.1
Length=3727
Score = 6106 bits (3306), Expect = 0.0
Identities = 3570/3701 (96%), Gaps = 4/3701 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATTCGTCTCCGTTTCAATATTCTCCGATCTT-CACACCGTCGTCTCTTCCACCGTCT 59
||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 21 ATGATTCGTCTCCGTTTCAATCTTCTCCGATCTTGTA-ACCGTCGTCTCTTCCACCGTCT 79
Query 60 TCCTCGATTTTTCTCCTCCTCTTCTGCGCCAACCAACGGTTCCTCAGGTCCTTCCTTGAA 119
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 80 TCCTCGAGTTTTCTCCTCCTCTTCTCCGCCAACCACCGGTTCTTCAGGTCCTTCCTTGAA 139
Query 120 TCTCATTAAACCTAAACTCACACCGTCTCCGCCGCCACACCAATCACGAGGTCTTCTCCG 179
||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 140 TCTTATTAAACCTAAATTCACACATTCTCCGCCGCCACACCAATCACGAGGTCTTCTCCG 199
Query 180 GTCAATTTATACCGTCTCGCCTTCTTCCTCCTTCTCTAAGAAATCCGTTTTTGTTCTCTC 239
||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 200 GTCGATTTACACCGTCTCGCCTTCTTCGTCCTTCTCTAAGAAATCCGTTTTTGTTCTCTC 259
Query 240 CGCCGCCGCTTTATCCACCGCTATTGCGTATTCCGCTGTTATCCCTTCTGATCATGATCA 299
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 260 CGCCGCCGCTTTATCCACCGCAATTGCGTATTCCGCTGTTTTCCCTTCTGATCATGACCA 319
Query 300 ATCAAATCGTAGCCCTAGCGGAAACAGCCGTATATACGAGTCTATCGAGGACGCTGTTCA 359
||| || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 320 ATCGGATTGTAACCCTAGCGGAAACAGACGTATCTACGAGTCTATCGAGGAAGCTTTTCA 379
Query 360 GAAATCCGGTAATTCGTTGAGGAGAGTGGTTCATCATGCTAGACAGACCGGTGTTGCGGT 419
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 380 GAAATCCGGAAATTCGTTGAGGAGAGTGGTTCACCATGCTAGACAAACCGGTGTTGCGGC 439
Query 420 ATCGGTTCTGTGGCAGTCGCTTAGGTCTGTGCTCTCTTCAGCTAATCATGAGGTGCGTGC 479
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 440 CTCGGTTCTGTGGCAGTCGCTTAGGTCGGTGCTCTCTTCAGCTAATCACGAGGTGCGTGC 499
Query 480 GGGATTCGAGCTGCGTGTGGCTGCTCTTTTAGCCGATATAGCGTCCGCAAATGCTGCTCG 539
|||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 500 GGGATTCGAGCTACGGGTGGCTGCTCTTTTAGCCGATATAGCATCCGCAAATGCTGCTCG 559
Query 540 TAGAGCCGCTCTCGTTGGAGCTGGCAGTGGTGCGGTGGTTGATTGGTTACTGGAGACGGT 599
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 560 TAGAGCCGCTCTCGTTGGAGCTGGCAGTGGTGCGGTGGTTGATTGGTTGCTGGAGACGGT 619
Query 600 GGCCATTCCCGGCGACAGAATTGGGGCACAGGACGAAGCGGCTAGGGCTCTAGCTTATCT 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 620 GGCCATTCCCGGCGACAGAATTGGGGCACAGGACGAAGCGGCTAGGGCTCTGGCTTATCT 679
Query 660 TATTGCTGATCCAACGGTGAGGAAAGACGCTCTAGGAAGGCCCGATGCAGTGCCCAAGTT 719
|||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 680 TATTGCTGATCCGACTGTCAGGAAAGACGCTCTGGGAAGGCCCGATGCAGTGCCCAAGTT 739
Query 720 ACTGAAGTTCGTATTCTCGTGTCAACCaaaaaacaaaaaGCATTCAAGACGTAGTTCATT 779
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 ACTGAAGTTCATATTCTCGTGTCAACCAAAAAACAAAAAGCATTCAAGACGTAGTTCATT 799
Query 780 CGATATTTCTGATTCTTTGAAAGGTAGGAGCATGCTTGTGGCTGCCATAATGGATATCGT 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 800 CGATATTTCTGATTCTTTGAAAGGTAGGAGCATGCTTGTGGCTGCCATAATGGATATTGT 859
Query 840 CACTTCCAACTGTGACACTATAGAAAAGACACCTTTCAAGTCATCCTTGCCTGGAAATGC 899
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 860 CACTTCCAACTGTGACACTATAGAAAAGACACCTTTTAAGTCATCATTGCCAGGAAATGC 919
Query 900 TACGATGAGAGATATTGCTGCTGCAATTCAAGTAATTGAGGAAGGTGGTATGTATTTTGA 959
||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 920 TACAATGAGAGATATTGCTGCGGCAATACAAGTAATTGAGGAAGGTGGTATGTATTTTGA 979
Query 960 TGAGCCAGAAAAAGATGATGACAGTGACGATGGAAGAAGTGGGATTAAGGGAATTGGAAT 1019
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 980 TGAGCCAGAAAAAGATGATGATAGTGACGATGGAAGAAGTGGGATTAAGGGAATTGGAAT 1039
Query 1020 TAAAATCCTTGAAGGAACCACAGTTCTGGGATTATCAAGAACCAGTGGGCTTGCACCGTT 1079
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1040 TAAAATCCTTGAAGGAACCACAGTTCTGGGATTATCAAGAACCAGTGGGCTTGCGCCGTT 1099
Query 1080 GGGTGACCTTAATGCTAATGCGGGAGAGGAGACTCCTAAAACATTTGCATTGCTTAGTAA 1139
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100 GGGTGACCTTAATGCTAATGTGGGAGAGGGGACTCCTAAAACATTTGCATTGCTTAGTAA 1159
Query 1140 ACATGATAATTCTTCACAAGCTAATTTGTCATCTGCCGTCATTCCTGGCCTTTGGGATGA 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1160 ACATGATAATTCTTCACAAGCTAATTTGTCATCTGCCGTCATTCCTGGCCTTTGGGATGA 1219
Query 1200 TTTACATTGTCAACATGTCGCAGTGCCATTTGCTGCGTGGGCACTGGCAAACTGGGCAAT 1259
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1220 TTTACATTGTCAACATGTCGCAGTGCCATTTGCTGCGTGGGCGCTGGCAAACTGGGCAAT 1279
Query 1260 GGCTTCTGATACAAATAGATCTCATATTCAAGAACTCGATCGTGATGGGCAAGTTGTCAT 1319
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1280 GGCTTCTGATACAAATAGATCTCATATTCAAGAACTTGATCGTGATGGGCAAGTTGTCAT 1339
Query 1320 GACAGCTTTAATGGCACCAGAGAGGACTGTGAAGTGGCATGGGAGTTTGGTGGCTCGGCT 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1340 GACAGCTTTAATGGCACCAGAGAGGACTGTGAAGTGGCATGGGAGTTTGGTGGCTCGGCT 1399
Query 1380 GTTGTTAGAGGATCTCAAGCTTCCATTAAGTGATTCTGTTTCCGACTGGAGTTCCAGTTT 1439
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400 GTTGTTAGAGGATCTCAATCTTCCATTAAGCGATTCTGTTTCCGACTGGAGTTCCAGTTT 1459
Query 1440 ACTTGCCACTGTTTCACATGCCAGTAAAACTGAGGATATCTCTCTGGCTCAAGTTGCGTT 1499
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1460 GCTTGCCACTGTTTCACATGCCAGTAAAACTGATGATATCTCTTTGGCTCAAGTTGCGTT 1519
Query 1500 GTCTGCCTTTTTAGTTTCTGTCGACAGAAGTGACAAAGCACAGAAGATGGTAATGGAGAA 1559
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1520 GTCTGCCTTTTTAGTTTCTGTTGACAGAAGTGACAAAGCACAGAAGATGGTAATGGAGAA 1579
Query 1560 GGGTCTTCATCTGATGAGAGATAGTGCTAGGAAAACGAGAAAACACAAAGCAGTGCAAGA 1619
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1580 GGGTCTTCATCTGATGAGAGATAGTGCTAGGAAAACAAGAAAACACAAAGCAGTGCAAGA 1639
Query 1620 AGGTTTGTCAAAGGCTCTTGAATTACTCTGTGCTGGTGACATGCATTTATCTCTTGAAGA 1679
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1640 AGGTTTGTCAAAGGCTCTAGAATTACTATGTGCTGGTGACATGCATTTATCTCTTGAAGA 1699
Query 1680 GAGTCAGAAATGGTCCGGCATACTACTTTCATGGGTTCTTGGAAAAGTTGCATCTGATAC 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700 GAGTCAGAAATGGTCCGGCATACTACTTTCATGGGTTCTTGGAAAAGTTGCATCTGATAC 1759
Query 1740 TGTTCAATCTTCAGCAAGAAGAATCCTTTCACGCACCTTTGAAGACTATGGACCACACTC 1799
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1760 TGTTCAATCTTCAGCAAGAAGAATCCTTTCACGCACTTTTGAGGACTATGGACCACACTC 1819
Query 1800 TGTCCCGATATCTCAGGGATGGTTGACCCTTATAATGAATGAGATTTTGAACCACAGTAA 1859
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1820 TGTCCCGATATCCCAGGGATGGTTAACCCTTATAATGAATGAGATTTTGAACCACAGTAA 1879
Query 1860 GACGGTGTCAGCTAAAGGAGCTAGCCTACCTAAAAACGAGAAACCTAAGGTAGATCAGTC 1919
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1880 GACGTTGTCAGCTAAAGGAGCTAGCCTACCTAAAAACGAGAAACCTAAGGTAGATCAGTC 1939
Query 1920 CAAAGTTACTTCTGCTACTCAGTCAACCAATCTGTTAGCAGTTGCTGTTGTTAATCTTGC 1979
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1940 CAAAGTTACTTCTGCTACTCAGTCAACCAACCAGTTAGCAGGGGCTGTTGTTAATCTTGC 1999
Query 1980 CATGGCTCAACTGGGTACAGTCCCAGAGTCTGTCAATAATGTTCCACTGGCAGATCTGCT 2039
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2000 CATGGCGCAACTGGGTACAGTCCCAGATTCTGTCAATAATGTTCCACTGGCAGATCTACT 2059
Query 2040 CCTTTCAGAGCCTTTTGCGGTACCAATTAAGAATTTAAAGAAGGATAGCCCCCCTAAATT 2099
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2060 CCTTTCAGAGCCTTTTGCGGTACCGATTAAGAATTTAAAGAAGGATAGCCCCCCTAAATT 2119
Query 2100 TAATGCTGCTGAGTCTGCATTGGCAACCATTAAGGCAATCAAGTCACTGACGGATGTTTG 2159
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2120 TAATGCTGCTGAGTCTGCATTGGCAACCCTTAAGGCAATTAAGTCACTGACGGATGTTTG 2179
Query 2160 TGCTGAAGATTCTGTATGCCAGAACAAAATAGTTGATTTTGGTATTCTTTGTTTACTAAG 2219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2180 TGCTGAAGATTCTGTATGCCAGAACAAAATAGTTGATTTTGGTATTCTTTGTTTACTAAG 2239
Query 2220 GCGCTTTCTGTTAAGTGATGATTATGAGAAGCTAGGTGCAATAGAAGCTTATGATGCATC 2279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2240 GCGCTTTCTGTTAAGTGATGATTATGAGAAGCTAGGTGCAATAGAAGCTTATGATGCATC 2299
Query 2280 CAGAGCCCTTGAGGCTCGAGACCGAACTCCAGATAGTCTTGGTGAATCTTCAATCACAGA 2339
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2300 CAGAGCCCTAGAGGCTCGAGAGCGAACTCCAGATAGTCTGGGTGAATCTTCAATCACAGA 2359
Query 2340 TATTCAGGATCCATGTAGTGTCAGAGTCCCAGCTAGTGCGCACATCCGAAGGCATGCTGC 2399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2360 TATTCAGGATCCATGTAGTGTCAGAGTCCCAGCTAGTGCGCACATCCGAAGGCATGCTGC 2419
Query 2400 GAGATTGCTAACTATTCTTTCGCTTCTACCGCAAGTCCAGAAAATCATTTTAGCTGATGA 2459
||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2420 TAGATTGCTAACCATTCTTTCACTTCTTCCGCAAGTCCAGAAAATCATTTTAGCTGATGA 2479
Query 2460 GACATGGTGCAAATGGCTTGATGATTGTGCAAAAGGAAATATTTCCTG-TTGCAATGACC 2518
|| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||
Sbjct 2480 AACTTGGTGCAAATGGCTTGATGATTGTGCAAGAGGAAATATTTC-TGGTTGCAACGACC 2538
Query 2519 CTAAGACACAAAGTTATGCAAGAGCTTCTCTGTTAAATGTATATTGCAATCAGCAAGATG 2578
||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2539 CTAAGACACAAAGTTATGCGAGGGCGTCTCTGTTAAATGTATATTGCAATCAGCAAGATG 2598
Query 2579 GTAGTGGATCAGGAGACGGTGGCAGTTCCAAGCCAGACATCTCTAACATGAACAGCAACT 2638
|||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 2599 GTAGTGGATCTGGAAACGGTGGCAGCTCCAAGCCAGACATCTCAAACATGAACACCAACT 2658
Query 2639 GTCCTCGCTATGGAGACATGATATTTTTAATTAATCCCGGCCTACCCCATTGGAAGTGTC 2698
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2659 GTCCTCGCTATGGAGACATGATATTTTTAATTAATCCCGGACTACCCCATTGGAAGTGTC 2718
Query 2699 ATGAAAAAGAACGTCAAAGTGGTAAGAAGAACGAATCCTCAAGTGAAGGTGAACCAGCAA 2758
||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2719 CTGAAAAAGAACATCAAAATGGTAAGAAGAATGAATCCTCAAGTGAAGGTGAACCAGCAA 2778
Query 2759 ATGTTACTGATACAGTCGGAGACCATGTTGTTGATGCTAGCAATCTGTCTAGCTCCATAG 2818
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2779 ATGTTACTGATACAGTCAGAGACCATGTTGTTGATGCTAGCAATCTGTCTAGCTCCATGG 2838
Query 2819 ATCCTTCCAGTAGTGGTTCGCATGTACATGATCCTGAATTTGATGTTATCTTTCTTCATG 2878
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2839 ATCCTTCCTGTAGTGGTTCGCGTGTACATGATCCTGAATTTGATGTTATCTTTCTTCATG 2898
Query 2879 GCTTGCGTGGTGGGCCCTTTAAAACTTGGCGAATTGCTGAGGATAAATCTTCTACCAAAT 2938
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 2899 GCTTGCGTGGTGGGCCCTTTAAAACTTGGCGAATTGCTGAGGATAAGTCCTCTACCAAAT 2958
Query 2939 CTGGCTTGGTGGAGAAGATTGACCAGGAAGCAGGAAAGCTGGGAACATTTTGGCCGAGCG 2998
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2959 CTGGCTTGGTGGAGAAGATTGACCAGGAAGCAGGAAAGCTGGGAACATTTTGGCCGAGTG 3018
Query 2999 AGTGGCTTTCAAATGATTTCCCTCAAGCTCGCTTGTTTACCCTTAAATACAAGACAAACC 3058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3019 AGTGGCTTTCAAATGATTTCCCTCAAGCTCGCTTGTTTACCCTTAAATACAAGACAAACC 3078
Query 3059 TCACGGAATGGTCTGGAGCTAGCTTGCCACTTCAGGAAGTTAGTTCTATGATATTGGAAA 3118
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3079 TCACGGAATGGTCTGGAGCTAGCTTGCCTCTTCAGGAAGTTAGTTCTATGATATTGGAAA 3138
Query 3119 AGCTCGTCTCAGCAGGCATTGGAGACCGACCTGTTGTTTTTGTGACTCACAGTATGGGAG 3178
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3139 AGCTTGTCTCGGCAGGCATTGGAGACCGACCTGTTGTTTTTGTGACTCACAGTATGGGAG 3198
Query 3179 GTCTTGTCGTGAAGCAGATTCTACACAAAGCAAAGGAAGAAAAACTTGATAAACTAGTCA 3238
| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3199 GCCTTGTGGTGAAGCAGATTCTACACAAAGCAAAGGAAGAAAAACTTGATAAACTAGTGA 3258
Query 3239 ATAACACTGCTGGAGTTGTATTCTACAGTTGCCCACATTTTGGCAGCAAGCTAGCAGATA 3298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3259 ATAACACTGCTGGAGTTGTATTCTACAGTTGCCCACATTTTGGCAGCAAGCTAGCAGATA 3318
Query 3299 TGCCGTGGAGAATGGGTCTTGTGTTACGCCCGGCTCCATCTATAGGAGAGCTACGAAGTG 3358
|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3319 TGCCCTGGCGAATGGGTCTTGTGTTACGCCCGGCTCCATCTATAGGAGAGCTACGAAGTG 3378
Query 3359 GTTCTCCAAGACTAGTTGAGCTCAATGACTTGCTTCGCCAGCTCCATAAGAAAGGGGTTG 3418
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3379 GTTCTCCAAGACTAGTTGAGCTCAATGACTTGCTTCGCCAGCTCCACAAGAAAGGGGTTG 3438
Query 3419 TTGAAGTCCTTAGTTTCTGTGAGACAAAAGTAACCCCAATCGTGGAAGGCTATGGAGGAT 3478
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3439 TTGAAGTCCTTAGTTTCTGTGAGACAAAAGTAACCCCAATTGTGGAAGGCTATGGAGGAT 3498
Query 3479 GGGCTTTTCGGATGGAAATCGTGCCAATTGAATCAGCATACCCAGGATTTGGTGAACTTG 3538
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3499 GGGCTTTTCGAATGGAAATCGTGCCAATTGAATCAGCCTACCCAGGATTTGGTGAACTTG 3558
Query 3539 TTGTGTTGGAGTCAACAGACCATATAAATTCATGTAAACCACTGAGCCGCTCGGATCCTT 3598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3559 TTGTGTTGGAGTCAACAGACCATATAAATTCATGTAAACCACTGAGCCGCTCGGATCCTT 3618
Query 3599 CGTATACAGAGGCGTTGCAGTTCCTGCGCAAGCTCAGCGCACAGCGATTAAAACCTCATG 3658
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||
Sbjct 3619 CGTATACTGAGGCGTTGCAGTTCCTGCGCAAGCTCAGCACACATCGATCAAAACCTCATG 3678
Query 3659 TTAAACGGGAACCTGGGATACATGATTGATTAACCATGGTT 3699
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3679 TTAAACGGGAATCTGGGATACATGATTGATTAACCACGGTT 3719
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 146635828769
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5