BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G34890.1
Length=4323
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg491165 jgi|Araly1|491165|fgenesh2_kg.7__598__AT4G34890.1 7162 0.0
Ahg943517 jgi|Araly1|943517|scaffold_604061.1 4774 0.0
Ahg944101 jgi|Araly1|944101|scaffold_700330.1 58.4 4e-07
> Ahg491165 jgi|Araly1|491165|fgenesh2_kg.7__598__AT4G34890.1
Length=4316
Score = 7162 bits (3878), Expect = 0.0
Identities = 4181/4328 (97%), Gaps = 17/4328 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTGACTTGGCGTAATCAACTTCGCCATCTTCG-TTTTT-GTTTCGATCCCAATCGAGTTT 58
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1 TTGACTTGGCGTAATCAACTTCGCCATCTTCGTTTTTTAGTTTCGATCCCAATCGAGTTT 60
Query 59 TCTCTCAATTTGAGAAATGGGTTCACTGAAAAAGGACGGCGAGATCGGAGATGAGTTTAC 118
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TCTCTCAGTTTGAGAAATGGGTTCACTGAAAAAGGACGGAGAGATCGGAGATGAGTTTAC 120
Query 119 GGAGGCGTTACTGTACGTTAACGGCGTTCGTAGAGTCTTGCCTGATGGATTGGCTCATAT 178
||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GGAGGCGATACTATACGTTAATGGCGTTCGTAGAGTCTTGCCTGATGGATTGGCTCATAT 180
Query 179 GACACTTCTCGAATATCTCAGAGATTTAGGATTGACCGGTACAAAGCTGGGATGCGGCGA 238
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||
Sbjct 181 GACACTTCTCGAATATCTCAGAGATTTAGGATTGACTGGGACTAAGCTGGGCTGCGGCGA 240
Query 239 AGGTGGTTGTGGGGCTTGCACGGTGATGGTGTCTAGTTATGACAGGAAGTCAAAGACCTC 298
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |
Sbjct 241 AGGTGGTTGCGGGGCTTGCACGGTGATGGTGTCTAGTTATGATAGAAATTCAAAGACATG 300
Query 299 TGTGCATTATGCTGTCAACGCTTGCCTAGCACCTCTCTATTCTGTAGAAGGGATGCATGT 358
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TGTGCATTATGCTGTCAATGCTTGCCTAGCGCCTCTCTATTCTGTAGAAGGGATGCATGT 360
Query 359 AATATCCATTGAGGGACTTGGGCATCGCAAACTTGGCTTGCACCCTGTCCAGGAGTCTTT 418
||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 361 AATATCCATCGAGGGAGTTGGGCATCGCAAGCTTGGCTTGCACCCAGTCCAGGAGTCTTT 420
Query 419 GGCATCTTCCCATGGTTCCCAATGTGGGTTTTGTACTCCCGGGTTTATCATGTCCATGTA 478
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 421 GGCATCTTCTCATGGTTCCCAATGTGGGTTTTGTACTCCCGGGTTTATCATGTCAATGTA 480
Query 479 TTCGTTGTTGAGGTCAAGTAAAAACTCACCTTCTGAGGAGGAGATTGAAGAATGTCTTGC 538
|||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 TTCGTTATTGAGGTCAAGTAAAAACTCACCTTGTGAGGAGGAGATTGAAGAATGTCTTGC 540
Query 539 AGGAAATCTATGTCGTTGTACTGGTTATCGACCCATTGTTGATGCGTTTCGGGTTTTTGC 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 AGGAAATCTATGTCGTTGTACTGGTTATCGACCCATTGTTGATGCGTTTCGGGTTTTTGC 600
Query 599 AAAATCTGATGATGCTCTCTACTGTGGTGTATCTTCACTTAGCCTTCAAGATGGTTCTAC 658
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||
Sbjct 601 AAAATCTGATGATGCTCTCTACTGTGGTGTATCTTCACTTAGCCTTCAGGACGGTTCAAC 660
Query 659 TATTTGCCCATCTACTGGCAAACCTTGCTCTTGTGGATCAAAAACAACAAATGAAGTTGC 718
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 661 TATTTGCCCATCTACTGGCAAACCTTGTTCTTGTGGATCAAAAACAACTAATGAAGTGGC 720
Query 719 CAGTTGTAATGAAGATAGATTTCAGTCAATCTCTTATAGTGATATAGATGGAGCTAAGTA 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CAGTTGTAATGAAGATAGATTTCAGTCAATCTCTTATAGTGATATAGATGGAGCTAAGTA 780
Query 779 TACAGATAAGGAGCTTATTTTCCCCCCTGAACTTTTGCTGAGGAAGTTAACTCCCTTAAA 838
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 781 TACAGAAAAGGAGCTTATTTTCCCCCCTGAACTTTTGCTGAGGAAGTTAGCTACCTTAAA 840
Query 839 GTTAAGGGGAAATGGGGGGATTACCTGGTATAGACCCGTATGTCTTCAGAACTTGCTTGA 898
||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 841 GTTAAGGGGGAATGGGGGGCTTACCTGGTATAGACCCGTAAGTCTTCAGAACTTGCTTGA 900
Query 899 GCTCAAAGC-AAATTATCCTGATGCAAAACTACTGGTAGGTAATACAGAGGTGGGAATCG 957
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 901 GCTCAAAGCAAAATT-TCCTGATGCAAAACTACTGGTAGGTAATACGGAGGTGGGAATCG 959
Query 958 AAATGAGATTGAAGAGGTTACAGTATCAGGTGCTGATCTCTGTTGCTCAAGTCCCAGAAC 1017
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 960 AAATGAGACTGAAGAGGTTACAGTATCAGGTGCTAATCTCTGTAGCTCAAGTCCCAGAAC 1019
Query 1018 TCAACGCATTGAATGTCAATGACAATGGGATAGAGGTTGGTTCAGCTTTGAGACTTTCTG 1077
|||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1020 TCAATGCGTTGAATGTCAGTGACAATGGGATAGAGGTTGGTTCAGCTTTGAAACTTTCTG 1079
Query 1078 AACTCCTGAGGTTATTCAGGAAGATAGTAAAGGAGCGTCCTGCACATGAAACATCAGCAT 1137
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 AACTCCTGAGGTTATTCAGGAAGCTAGTAAAGGAGCGTCCTGCACATGAAACATCAGCAT 1139
Query 1138 GCAAGGCTTTTATCGAACAGCTGAAGTGGTTTGCTGGGACACAAATAAGAAATGTTGCTT 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 GCAAGGCTTTTATCGAACAGCTGAAGTGGTTTGCTGGGACACAAATAAGAAATGTTGCTT 1199
Query 1198 GCATTGGTGGAAACATCTGTACAGCTAGTCCAATATCTGATTTAAATCCTCTTTGGATGG 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 GCATTGGTGGAAACATCTGTACAGCTAGTCCAATATCTGATTTAAATCCTCTTTGGATGG 1259
Query 1258 CTTCAAGAGCAGAGTTTCGGATAACCAACTGCAATGGAGATGTTAGGTCTATACCTGCAA 1317
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 1260 CTTCAAGAGCAGAGTTTCGGATAACTAACTGCAATGGAGTTGTTAGATCTATACCTGCAA 1319
Query 1318 AAGATTTCTTCCTCGGTTATCGTAAAGTGGATATGGGGAGCAACGAGATCTTGTTGTCGG 1377
||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1320 AAGATTTCTTCCTTGGTTACCGTAAAGTGGATATAGGGAGCAAAGAGATCTTGTTGTCGG 1379
Query 1378 TATTCCTTCCATGGACAAGACCCTTAGAGTATGTGAAAGAATTTAAGCAGGCCCATCGCA 1437
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 TATTCCTTCCATGGACAAGGCCCTTAGAGTATGTGAAAGAATTTAAGCAGGCCCATCGCA 1439
Query 1438 GGGATGATGATATAGCTATTGTCAATGGTGGAATGCGTGTGTTTCTTGAAGACAAGGGTC 1497
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 1440 GGGATGATGATATAGCTATTGTCAATGGTGGAATGCGTGTGTTTCTTGAAGAGAAGGGAC 1499
Query 1498 AACAATTGTTCGTTTCTGATGCATCCATTGCTTATGGAGGTGTGGCTCCTCTTTCTTTGT 1557
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1500 AACAATTGTTCGTTTCTGATGCATCCATTGCCTACGGAGGTGTGGCTCCTCTTTCCTTGT 1559
Query 1558 GTGCGAGAAAGACTGAAGAGTTTCTAATTGGAAAGAATTGGAATAAAGATCTTCTGCAGG 1617
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1560 GTGCGAGAAAGACTGAAGAATTTCTAATTGGAAAGAATTGGAATAAAGATCTTCTGCAAG 1619
Query 1618 ATGCGCTTAAGGTCATACAGAGCGATGTCGTGATTAAGGAAGATGCTCCTGGGGGAATGG 1677
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 ATGCGCTTAGGGTCATACAGAGCGATGTCTTGATTAAGGAAGATGCTCCTGGGGGAATGG 1679
Query 1678 TGGAGTTTCGGAAATCTCTAACCCTAAGCTTCTTCTTTAAATTTTTCTTATGGGTTTCTC 1737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 TGGAGTTTCGGAAATCTCTAACCCTAAGCTTCTTCTTTAAATTTTTCTTATGGGTTTCTC 1739
Query 1738 ATAATGTCA-ATAATGCAAATTCTGCGATAGAGACCTTCCCACCCTCCCATATGTCAGCT 1796
||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 ATAATGT-ACATAATGTAAATTCTGCGATAGAGACCTTCCCACCCTCCCATATGTCAGCT 1798
Query 1797 GTGCAACCTGTTCCTCGGTTATCTAGAATTGGAAAACAAGACTATGAGACAGTAAAGCAG 1856
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1799 GTTCAACCTGTTCCTCGGTTATCTAGAATTGGAAAACAAGACTATGAGACAGTAAAACAG 1858
Query 1857 GGAACATCTGTTGGCTCGTCGGAGGTGCATCTTTCAGCGAGAATGCAGGTCACAGGGGAA 1916
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 GGAACATCTGTTGGCTCGTCGGAGGTCCATCTTTCAGCGAGAATGCAGGTCACAGGGGAA 1918
Query 1917 GCGGAATATACTGATGATACTCCAGTACCTCCTAATACCTTACATGCTGCCTTTGTGCTA 1976
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 GCAGAATATACTGATGATACCCCAGTACCTCCTAATACCTTACATGCTGCCTTTGTGCTA 1978
Query 1977 AGCAAAGTGCCACATGCCCGCATCCTTTCAATCGATGATTCGGCAGCCAAATCTTCATCT 2036
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 AGCAAAGTGCCACATGCCCGCATCCTTTCAATTGATGATACGGCAGCCAAATCTTCATCT 2038
Query 2037 GGTTTTGTTGGTCTGTTTCTTGCCAAAGATATTCCTGGGGATAATATGATTGGACCAATT 2096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 GGTTTTGTTGGTCTGTTTCTTGCCAAAGATATTCCTGGGGATAATATGATTGGACCAATT 2098
Query 2097 GTTCCCGACGAAGAATTATTTGCTACAGATGTGGTCACGTGTGTGGGACAAGTCATTGGT 2156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099 GTTCCCGACGAAGAATTATTTGCTACAGATGTGGTCACGTGTGTGGGACAAGTCATTGGT 2158
Query 2157 GTGGTCGTCGCGGATACACATGAAAATGCAAAAACTGCAGCAGGAAAAGTTGACGTTAGG 2216
||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 GTGGTTGTCGCGGATACGCATGAAAATGCAAAAACTGCAGCAGGAAAAGTTGACGTTAGG 2218
Query 2217 TATGAGGAACTACCAGCAATATTATCAATCAAGGAGGCTATTAATGCTAAAAGTTTCCAT 2276
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2219 TATGAGGAACTAGAAGCGATATTATCAATCAAGGAGGCGATTAATGCTAAAAGTTTCCAT 2278
Query 2277 CCGAACACAGAGAAAAGGCTAAGAAAAGGGGATGTCGAGCTGTGTTTTCAATCTGGTCAG 2336
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 2279 CCGAACACACAGAAAAGGCTAAGAAAAGGGGATGTCGAGTTGTGCTTTCAATCTGGTCAG 2338
Query 2337 TGTGACAGGGTAATAGAGGGAGAGGTTCAAATGGGTGGTCAGGAACACTTCTACTTGGAG 2396
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2339 TGTGACAGGATAATAGAGGGAGAGGTTCAAATGGGTGGTCAGGAACACTTTTACTTGGAG 2398
Query 2397 CCTAATGGTAGTTTGGTTTGGACAGTAGATGGGGGCAGCGAAGTTCATATGATTTCATCC 2456
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2399 CCTAATGGTAGTTTGGTTTGGACAGTAGATGGAGGCAGCGAAGTTCATATGATTTCATCC 2458
Query 2457 ACACAGGCTCCTCAAAAGCACCAGAAATATGTGTCGCATGTTCTTGGTCTTCCGATGTCT 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2459 ACACAGGCTCCTCAAAAGCACCAGAAATATGTGTCCCATGTTCTTGGTCTTCCAATGTCC 2518
Query 2517 AAAGTGGTATGCAAAACCAAACGAATTGGTGGTGGCTTTGGTGGTAAAGAAACAAGATCA 2576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2519 AAAGTGGTATGCAAAACCAAACGAATTGGTGGTGGCTTTGGTGGTAAAGAAACAAGATCA 2578
Query 2577 GCTTTCATTGCTGCGGCAGCTTCTGTTCCTTCCTACCTATTGAATCGACCTGTGAAACTC 2636
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2579 GCTTTCATTGCTGCTGCAGCTTCTGTTCCTTCCTATCTATTGAATCGACCCGTGAAACTC 2638
Query 2637 ATACTGGACCGAGATGTGGACATGATGATAACTGGTCATCGTCATAGTTTTCTTGGAAAG 2696
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2639 ATACTGGACAGAGATGTGGACATGATGATAACTGGTCATCGTCATAGTTTCCTTGGAAAG 2698
Query 2697 TACAAGGTTGGATTTACGAACGAAGGAAAAATATTGGCGTTGGACCTTGAAATTTACAAC 2756
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||
Sbjct 2699 TACAAGGTTGGATTTACGAACGAAGGAAAAATATTGGCTTTAGACCTTGAAATCTACAAC 2758
Query 2757 AATGGTGGCAACTCTTTGGATCTCTCCCTTTCTGTTCTTGAACGTGCCATGTTTCACTCG 2816
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2759 AATGGTGGAAACTCTTTGGATCTCTCCCTTTCTGTTCTTGAACGTGCCATGTTTCACTCG 2818
Query 2817 GATAACGTTTATGAGATCCCGCATGTAAGGATTGTTGGGAATGTTTGCTTTACTAATTTT 2876
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2819 GATAACGTTTATGAGATCCCGCATGTAAGGATTGTAGGGAACGTTTGCTTTACTAATTTT 2878
Query 2877 CCTAGCAACACTGCTTTCCGAGGGTTTGGAGGCCCCCAAGGTATGCTTATAACTGAAAAC 2936
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2879 CCCAGCAACACTGCTTTCCGAGGGTTTGGAGGCCCCCAAGGTATGCTTATAACAGAAAAC 2938
Query 2937 TGGATTCAAAGAATCGCAGCTGAGCTTAATAAAAGCCCTGAAGAAATCAAAGAGATGAAC 2996
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2939 TGGATTCAAAGAATCGCAGCGGAGCTTGATAAAAGCCCTGAAGAAATCAAAGAGATGAAC 2998
Query 2997 TTTCAAGTGGAAGGATCAGTCACCCATTACTGTCAGACTCTTCAGCACTGCACATTGCAT 3056
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2999 TTTCAAGTGGAAGGATCAGTCACACATTACTCTCAGTCTCTTCAGCACTGCACACTGCAT 3058
Query 3057 CAGCTCTGGAAAGAGCTGAAAGTATCGTGCAACTTCTTAAAGGCCCGCAGAGAAGCTGAC 3116
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3059 CAGCTCTGGAAAGAGCTGAAAGTATCCTGCAACTTCTTAAAGGCCCGCAGAGAAGCTGAC 3118
Query 3117 GAATTTAATAGTCATAATCGGTGGAAAAAGCGTGGTGTAGCTATGGTTCCCACAAAATTT 3176
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3119 GAATTTAATAGTCATAACCGGTGGAAAAAGCGTGGTGTAGCTATGGTTCCCACAAAATTT 3178
Query 3177 GGCATATCATTTACCACAAAGTTCATGAATCAGGCCGGAGCTCTTGTTCATGTTTACACT 3236
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3179 GGCATATCATTTACCACAAAGTTCATGAATCAGGCTGGAGCTCTTGTTCATGTTTACACT 3238
Query 3237 GACGGGACTGTTTTAGTGACTCATGGTGGTGTGGAGATGGGTCAAGGATTGCATACAAAG 3296
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3239 GACGGGACTGTTTTGGTGACTCATGGAGGTGTGGAGATGGGTCAAGGATTGCATACAAAG 3298
Query 3297 GTCGCTCAAGTTGCTGCATCCGCCTTTAACATTCCACTTAGCTCAGTTTTCGTGTCAGAG 3356
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3299 GTCGCTCAAGTTGCTGCGTCCGCCTTTAACATTCCACTTAGTTCAGTTTTCGTGTCAGAG 3358
Query 3357 ACAAGCACTGACAAGGTTCCTAATGCGTCACCAACTGCTGCTTCTGCGAGCTCTGATATG 3416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3359 ACAAGCACTGACAAGGTTCCTAATGCGTCACCAACTGCTGCTTCTGCGAGCTCTGATATG 3418
Query 3417 TATGGTGCTGCAGTTTTAGACGCTTGTGAGCAGATTATAGCAAGAATGGAACCTGTTGCA 3476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3419 TATGGTGCTGCAGTTTTAGACGCTTGTGAGCAGATTATAGCAAGAATGGAACCTGTTGCA 3478
Query 3477 TCTAAGCACAATTTCAACACATTTACTGAGCTAGTAAGTGCCTGCTACTTTCAACGGATA 3536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 TCTAAGCACAATTTCAACACATTTACTGAGCTAGTAAGTGCCTGCTACTTTCAACGGATA 3538
Query 3537 GACCTATCAGCTCATGGTTTTCACATAGTTCCTGATCTTGGGTTTGACTGGATATCTGGA 3596
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 3539 GACCTATCAGCTCATGGTTTTCACATTGTTCCTGATCTTGGATATGACTGGATATCTGGA 3598
Query 3597 AAAGGGAACGCCTTTAGATATTACACATATGGAGCTGCCTTTGCGGAAGTTGAGATAGAT 3656
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3599 AAAGGGAATGCCTTTAGATATTACACATATGGAGCTGCCTTTGCTGAAGTTGAGATAGAT 3658
Query 3657 ACATTGACTGGTGATTTCCACACAAGAGCAGCTGATATAATGTTGGACCTCGGATATTCT 3716
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3659 ACATTAACTGGTGATTTCCACACAAGAGCAGCTGATATAATGTTGGACCTCGGATATTCT 3718
Query 3717 CTTAACCCAGCCATTGATGTTGGACAAATAGAAGGAGCGTTTGTACAAGGACTGGGTTGG 3776
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3719 CTTAACCCAGCCATTGATGTTGGACAAATAGAAGGAGCGTTTGTACAAGGTCTGGGTTGG 3778
Query 3777 GTAGCTTTAGAAGAACTCAAATGGGGAGATGCAGCTCATAAATGGATTAAACCAGGAAGT 3836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3779 GTAGCTTTAGAAGAACTCAAATGGGGAGATGCAGCTCATAAATGGATTAAACCAGGAAGT 3838
Query 3837 TTACTCACTTGCGGACCCGGAAACTACAAAATACCTTCCATCAACGACATGCCGTTCAAC 3896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3839 TTACTCACTTGCGGACCCGGAAACTACAAAATACCTTCCATCAACGACATGCCGTTCAAC 3898
Query 3897 CTCAATGTTTCGCTTCTCAAGGGGAATCCGAATACAAAGGCAATACATTCATCTAAAGCA 3956
||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3899 CTCAATGTTTCTCTTCTCAAGGGGAATCCGAATAAAAAGGCAATACATTCATCTAAAGCA 3958
Query 3957 GTGGGTGAGCCACCATTCTTTCTTGCATCATCGGTTTTCTTTGCGATAAAGGAAGCTATT 4016
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3959 GTGGGTGAGCCACCATTCTTTCTTGCATCATCGGTTTTCTTTGCGATAAAGGAAGCTATT 4018
Query 4017 AAAGCGGCTAGAACCGAGGTGGGTCTCACAGACTGGTTCCCTCTAGAGAGTCCAGCCACT 4076
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4019 AAAGCGGCTAGAACCGAGGTGGGTCTCACAGACTGGTTCCCTCTAGAGAGTCCAGCCACG 4078
Query 4077 CCAGAGCGTATCAGGATGGCTTGTTTCGACGAATTTTCAGCTCCTTTTGTAAATTCAGAT 4136
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4079 CCAGAGCGTATCAGGATGGCTTGTTTCGACGAGTTTTCAGCTCCTTTTGTAAGTTCAGAT 4138
Query 4137 TTCTACCCTAATCTTAGTGTTTGAGCTTTGAACATCATCAGAGGGG-AAACAGATCGATC 4195
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 4139 TTCTACCCTAATCTTAGTGTTT-AGCTTTGAACTTCATCAGAGGGGGAAA-AGATCGATC 4196
Query 4196 AATCTATTGTGAGAAAGTCATATCTGTAACTTATTTTCAGTCTCCATATAAATGTAACAT 4255
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 4197 AATCTATTGTGAGAACGTCATATCTGTAACTTATTTCCAGTCTCCATATAAATGTAA--T 4254
Query 4256 ATCTGTAAAGATACATTTACCAAGCAGTATACACTATATATATTTATAAAGATATGTTTC 4315
|| | ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 4255 AT-TACAAAGATACATTTACCAAGCAGTATA---TAT-T-TATTTATAAAGATATGTTTC 4308
Query 4316 TCACAAGC 4323
|| |||||
Sbjct 4309 TCCCAAGC 4316
> Ahg943517 jgi|Araly1|943517|scaffold_604061.1
Length=4143
Score = 4774 bits (2585), Expect = 0.0
Identities = 3608/4104 (88%), Gaps = 62/4104 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 105 GGAGATGAGTTTACGGAGGCGTTACTGTACGTTAACGGCGTTCGTAGAGTCTTGCCTGAT 164
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||
Sbjct 62 GGAGATGAGTTTATGGAGGCGATACTGTACGTTAATGGTGTTCGTAGAGTGTTGCCTGAT 121
Query 165 GGATTGGCTCATATGACACTTCTCGAATATCTCAGAGATTTAGGA-TTGACCGGTACAAA 223
|| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||
Sbjct 122 GGCTTGGCTCATATGACTCTTCTTGAATATCTCAGAGATTTAGGACTT-ACCGGGACGAA 180
Query 224 GCTGGGATGCGGCGAAGGTGGTTGTGGGGCTTGCACGGTGATGGTGTCTAGTTATGACAG 283
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 181 GCTGGGTTGCGGCGAAGGTGGTTGTGGAGCTTGCACGGTGATGGTCTCTTCCTATGACAG 240
Query 284 GAAGTCAAAGACCT-CTGTGCATTATGCTGTCAACGCTTGCCTAGCACCTCTCTATTCTG 342
|| | ||| | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAAATTAAACAGATGC-GTGCATTATGCTGTCAACGCTTGCTTAGCACCTCTCTATTCTG 299
Query 343 TAGAAGGGATGCATGTAATATCCATTGAGGGACTTGGGCATCGCAAACTTGGCTTGCACC 402
||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 TAGAAGGAATGCATGTAATATCCATTGAGGGAGTTGGTCATCGCAAACTTGGCTTGCACC 359
Query 403 CTGTCCAGGAGTCTTTGGCATCTTCCCATGGTTCCCAATGTGGGTTTTGTACTCCCGGGT 462
| | |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 360 CACTTCAGGAGTCATTGGCATCTTCTCATGGTTCTCAGTGTGGGTTTTGTACTCCTGGGT 419
Query 463 TTATCATGTCCATGTATTCGTTGTTGAGGTCAAGTAAAAACTCACCTTCTGAGGAGGAGA 522
|||||||||| |||||| | || |||| |||| |||||||||||||| ||| || ||||
Sbjct 420 TTATCATGTCGATGTATGCATTACTGAGATCAAATAAAAACTCACCTTGTGAAGAAGAGA 479
Query 523 TTGAAGAATGTCTTGCAGGAAATCTATGTCGTTGTACTGGTTATC-GACCCATTGTTGAT 581
|||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||
Sbjct 480 TTGAAGAATGTCTTGCGGGAAATTTATGTCGTTGTACTGGTTA-CAGGCCGATTGTTGAT 538
Query 582 GCGTTTCGGGTTTTTG-CAAAATCTGATGATGCTCTCTACTGTGGTGTATCTTCACTTAG 640
|| ||||| ||||||| ||||| || |||| ||| | ||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 539 GCCTTTCGAGTTTTTGCCAAAA-CTAATGACGCTTTATACAGTGGTTTATCTTCACTTAG 597
Query 641 CCTTCAAGATGGTTCT-ACTATTTGCCCATCTACTGGCAAACCTTGCTCTTGTGGATCAA 699
|||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||
Sbjct 598 CCTTCAAGATGGTT-TAAGTATCTGCCCATCTACTGGCAAGCCCTGTTCATGTGGATCAA 656
Query 700 AAACAACAAATGAAGTTGCCAGTTGTAATGAAGATAGATTTCAGTCAATCTCTTATAGTG 759
|||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||| | ||||| ||| |||
Sbjct 657 CAACAACAAATGAAGCGGCCACTTGTAACGACGCTAGATTTCAGCCTATCTCATATTGTG 716
Query 760 ATATAGATGGAGCTAAGTATACAGATAAGGAGCTTATTTTCCCCCCTGAACTTTTGCTGA 819
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||
Sbjct 717 ATATAAATGGAGCTAAGTATACAGAAAAGGAGCTTATATTCCCCCCTGAGCTTTTAATGA 776
Query 820 GGAAGTTAACTCCCTTAAAGTTAAGGGGAAATGGG-GGGATTACCTGGTATAGACCCGTA 878
|||| ||| |||| |||||| | || ||||| ||| ||| ||| |||||| |||||||||
Sbjct 777 GGAAATTAGCTCCTTTAAAGCTGAGAGGAAA-GGGAGGGCTTATCTGGTACAGACCCGTA 835
Query 879 TGTCTTCAGAACTTGCTTGAGCTCAAAGCAAATTATCCTGATGCAAAACTACTGGTAGGT 938
| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 836 AGACTTCAGTACTTGCTTGATCTCAAAGCAAAACATCCGGATGCAAAACTAGTGGTAGGT 895
Query 939 AATACAGAGGTGGGAATCGAAATGAGATTGAAGAGGTTACAGTATCAGGTGCTGATCTCT 998
||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || |||
Sbjct 896 AATACAGAGGTGGGAATCGAAATGAGACTGAAGAAGTTACAGTATCGGGTGCTAATATCT 955
Query 999 GTTGCTCAAGTCCCAGAACTCAACGCATTGAATGTCAATGACAATGGGA-TAGAGGTTGG 1057
|| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 956 GTGGCTCAAGTCCCAGAACTCAACACAGTGAATGTCAATGACAAT-GGAGTAGAGGTTGG 1014
Query 1058 TTCAGCTTTGAGACTTTCTGAACTCCTGAGGTTATTCAGGAAGATAGTAAAGGAGCGTCC 1117
||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1015 TTCTGCTCTGAGACTTTCTGAACTCCTGAGACTATTCAGGAAGGTTGTAAAGGAGCGTCC 1074
Query 1118 TGCACATGAAACATCAGCATGCAAGGCTTTTATCGAACAGCTGAAGTGGTTTGCTGGGAC 1177
|||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1075 TGCACATGAAACATCAGCTTGTAAGGCTTTTATTGAACAATTGAAGTGGTTTGCTGGGAC 1134
Query 1178 ACAAATAAGAAATGTTGCTTGCATTGGTGGAAACATCTGTACAGCTAGTCCAATATCTGA 1237
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1135 ACAAATAAGGAATGTTGCTTGCATTGGTGGAAACATCTGTACAGCTAGTCCAATATCTGA 1194
Query 1238 TTTAAATCCTCTTTGGATGGCTTCAAGAGCAGAGTTTCGGATAACCAACTGCAATGGAGA 1297
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1195 TTTAAATCCTCTTTGGATGGCTTCAAGAGCAGAATTTCGGATAATCAACTGCAATGGAGA 1254
Query 1298 TGTTAGGTCTATACCTGCAAAAGATTTCTTCC-TCGGTTATCGTAAAGTGGATATGGGGA 1356
| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1255 TATTAGGTCCATACCTGCAAAAGATTTCTTCCGT-GGTTATCGTAAAGTGGATATGGGAA 1313
Query 1357 GCAACGAGATCTTGTTGTCGGTATTCCTTCCATGGACAAGACCCTTAGAGTATGTGAAAG 1416
|| | || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||
Sbjct 1314 GCGATGAAATCTTGTTGTCAGTATTCCTACCATGGACAAGGCCTTTGGAGTATGTGAAAG 1373
Query 1417 AATTTAAGCAGGCCCATCGCAGGGATGATGATATAGCTATTGTCAATGGTGGAATGCGTG 1476
||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1374 AATTTAAACAAGCCCACCGTAGGGATGATGATATAGCTATTGTTAATGGTGGAATGCGTG 1433
Query 1477 TGTTTCTTGAAGACA-AGGGTCAACAATTGT-TCGTTTCTGATGCATCCATTGCTTATGG 1534
||||||||||||| | ||| |||| |||||| | |||||||| | ||| ||||||| |||
Sbjct 1434 TGTTTCTTGAAGAGAGAGG-TCAAGAATTGTGT-GTTTCTGACGTATCGATTGCTTTTGG 1491
Query 1535 AGGTGTGGCTCCTC-TTTCTTTGTGTGCGAGAAAGACTGAAGAGTTTCTAATTGGAAAGA 1593
|||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||
Sbjct 1492 TGGTGTGGC-CGAGGTTTCTCTGTGTGCCAGAAAGACTGAGGAATTTCTAATCGGAAAGA 1550
Query 1594 ATTGGAATAAAGATCTTCTGCAGGATGCGCTT-AAGGTCATACAGAGCGATGTCGTGATT 1652
||||||||| || ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| | |||
Sbjct 1551 ATTGGAATAGAGGTCTTCTGCAAGATGCG-TTGAAGGTCATACAAAGCGATGTATTAATT 1609
Query 1653 AAGGAAGATGCTCCTGGGGGAATGGTGGAGTTTCGGAAATCTCTAACCCTAAGCTTCTTC 1712
||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1610 AAGGAAGATTCTCCTGGTGGAATGGTGGAGTTCCGGAAATCTCTAACCCTAAGCTTCTTC 1669
Query 1713 TTTAAATTTTTCTTATGGGTTTCTCATAATGT-CAATAATGCAAATTCTGCGATAGAGAC 1771
||||||||||||||||||||||||||| || | || | || ||| | | ||||||||
Sbjct 1670 TTTAAATTTTTCTTATGGGTTTCTCATCATATACA-TGATATAAAGCCAACTATAGAGAC 1728
Query 1772 CTTCCCACCCTCCCATATGTCAGCTGTGCAACC-TGTTCCTCGGTTATC-TAGAATTGGA 1829
||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||| || | || ||||||||||
Sbjct 1729 CTTCCCATCCTCCCATATGTCAGCTATGCAATCATTTTC-TCAGC-ATTGTAGAATTGGA 1786
Query 1830 AAACAAGACTATGAGACAGTAAAGCAGGGAACATCTGTTGGCTCGTCGGAGGTGCATCTT 1889
| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||| || ||||||
Sbjct 1787 AGACAAGACTATGAGACCGTAAAACAGGGAACATCTATTGGCTTGCCGGAAGTCCATCTT 1846
Query 1890 TCAGCGAGAATGCAGGTCACAGGGGAAGCGGAATATACTGATGATACTCCAGTACCTCCT 1949
||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1847 TCAGCGAGAATACAGGTCACAGGAGAGGCAGAATATACTGATGATACCCCAGTGCCTCCT 1906
Query 1950 AATACCTTACATGCTGCCTTTGTGCTAAGC-AAAGTGCCACATGCCCGCATCCTTTCAAT 2008
|||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1907 AATACCTTGCATGCTGCCTTAGTGCTAAGCCAAA-TGCCACATGCCCGCATACTTTCAAT 1965
Query 2009 CGATGATTCGGC-AGCCAAATCTTCATCTGGTTTTGTTGGTCTGTTTCTTGCCAAAGATA 2067
|| ||||| | | |||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1966 TGACGATTCCGATA-CCAAATATTCACCTGGTTTTGCTGGTCTATTTCTTGCTAAAGATG 2024
Query 2068 TTCCTGGGGATAATATGATTGGACCAATTGTTCCCGACGAAGAATTATTTGCTACAGATG 2127
|||| | |||||||||||||||||| ||||| | || || ||| ||||||| || || |
Sbjct 2025 TTCCCGCAGATAATATGATTGGACCAGTTGTTGCTGATGAGGAACTATTTGCCACGGACG 2084
Query 2128 TGGTCACGTGTGTGGGACAAGTCATTGGTGTGGTCGTCGCGGATACACATGAAAATGCAA 2187
||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||
Sbjct 2085 TGGTCACGTGTGTAGGACAAGTCATTGGTGTGGTTGTTGCTGATACACATGAAAATGCAA 2144
Query 2188 AAACTGCAGCAGGAAAAGTTGACGTTAG-GTATGAGGAACTACCAGCAATATTATCAATC 2246
|||| || |||||||||||| | || || |||||| ||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 2145 AAACGGCGGCAGGAAAAGTTAAAGT-AGAGTATGAAGAATTACCAGCGATATTATCAATC 2203
Query 2247 AAGGAGGCTATTAATGCTAAAAGTTTCCATCCGAACACAGAGAAAAGGCTAAGAAAAGGG 2306
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||
Sbjct 2204 AAGGAGGCTATTGATGCTAAAAGTTTCCACCCGAACACAGATAAAAGGTTAACAAAAGGG 2263
Query 2307 GATGTCGAGCTGTGTTTTCAATCTGGTCAGTGTGACAGGGTAATAGAGGGAGAGGTTCAA 2366
||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 2264 GATGTAGAGCTATGCTTTCGATCAGGTCAGTGTGATAGGATAATAGAGGGCGAGGTTCAA 2323
Query 2367 ATGGGTGGTCAGGAACACTTCTACTTGGAGCCTAATGGTAGTTTGGTTTGGACAGTAGAT 2426
|||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| || ||||||||| | |||
Sbjct 2324 ATGGGTGGTCAGGAACACTTTTACATGGAACCTCATGGTAGCTTAGTTTGGACAATTGAT 2383
Query 2427 GGGGGCAGCGAAGTTCATATGATTTCATCCACACAGGCTCCTCAAAAGCACCAGAAATAT 2486
|| |||| ||||||||||||| | |||||||| || | |||||| | ||||||||| |||
Sbjct 2384 GGAGGCAACGAAGTTCATATGCTCTCATCCACTCAAGATCCTCATAGGCACCAGAACTAT 2443
Query 2487 GTGTCGCATGTTCTTGGTCTTCCGATGTCTAAAGTGGTATGCAAAACCAAACGAATTGGT 2546
|| || | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2444 GTTTCTCGTGTGCTTGGTCTGCCAATGTCTAAAGTGGTATGCAAAACCAAACGAATTGGT 2503
Query 2547 GGTGGCTTTGGTGGTAAAGAAACAAGATCAG-CTTTCATTGCTGCGGCAGCTTCTGTTCC 2605
||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2504 GGTGGCTTTGGTGGTAAGGAAACGAGATCGGGCTT-CATAGCTGCTGCAGCTTCTGTTCC 2562
Query 2606 TTCCTACCTATTGAATCGACCTGTGAAACTCATACTGGACCGAGATGTGGACATGATGAT 2665
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2563 TTCCTACCTGTTGAATCGACCTGTGAAACTCATACTGGACAGAGATGTGGACATGATGAT 2622
Query 2666 AACTGGTCATCGTCATAGTTTTCTTGGAAAGTACAAGGTTGGATTTACGAACGAAGGAAA 2725
| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2623 ATCTGGTCATCGTCATAGTTTTGTTGGAAAGTACAAGGTTGGATTTACAAACGAAGGAAA 2682
Query 2726 AATATTGGCGT-TGGACCTTGAAATTTACAACAATGGTGGCAACTCTTTGGATCTCTCC- 2783
||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||
Sbjct 2683 AATATTGGCGTATG-ACCTTGAAATCTACAACAATGGTGGAAACTCATTGGATCTTTCCT 2741
Query 2784 CTTTCTGTTCTTGAACGTGCCATGTTTCACTCGGATAACGTTTATGAGATCCCGCATGTA 2843
|| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||
Sbjct 2742 CTG-CTATTCTCGAAATTGCCATGTTTCACTCGGATAATGTTTACGAGATCCCACATGTG 2800
Query 2844 AGGATTGTTGGGAATGTTTGCTTTACTAATTTTCCTAGCAACACTGCTTTCCGAGGGTTT 2903
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2801 AGGATCACAGGGAGCGTTTGCTTTACTAATTTTCCTAGCAACACTGCTTTCCGAGGGTTT 2860
Query 2904 GGAGGCCCCCAAGGTATGCTTATAACTGAAAACTGGATTCAAAGAATCGCAGCTGAGCTT 2963
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 2861 GGAGGGCCTCAAGGTATGCTTATAACTGAAAACTGGATTCAGAGAATCGCAGCTGAACTT 2920
Query 2964 AATAAAAGCCCTGAAGAAATCAAAGAGATGAACTTTCAAGTGGAAGGATC-AGTCACCCA 3022
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||
Sbjct 2921 GATCGAAGCCCTGAAGAAATCAAAGAGATGAACTTTCAAGTGGAAGGTTCTA-TCACACA 2979
Query 3023 TTACTGTCAG-ACTCTTCAGCACTGCACATTGCATCAGCTCTGGAAAGAGCTGAAAGTAT 3081
||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 2980 TTACTCTCAGTA-TCTTCAGCATTGCACATTGCATCAGCTGTGGAAGGAGCTGAAAGTAT 3038
Query 3082 CGTGCAACTT-CTTAAAGGCCCGCAGAGAAGCTGAC-GAATTTAATAGTCATAATCGGTG 3139
| |||||||| | |||||| || || |||| | | || ||||||||||||||||||||
Sbjct 3039 CCTGCAACTTTCC-AAAGGCTCGTAGCGAAG-TCAATGAGTTTAATAGTCATAATCGGTG 3096
Query 3140 GAAAAAGCGTGGTGTAGCTATGGTTCCCACAAAATTTGGCATATCATTTACCACAAAGTT 3199
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||
Sbjct 3097 GAAAAAGCGTGGTGTGGCTATGATTCCCACAAAATTTGGCGTATCATTTACAAAAAAGTT 3156
Query 3200 CATGAATCAGGCCGGAGCTCTTGTTCATGTTTACACTGACGGGACTGTTTTAGTGACTCA 3259
|||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||
Sbjct 3157 CATGAACCAGGCTGGTGCTCTTGTTCATGTTTACACAGACGGTACTGTTTTGGTGACACA 3216
Query 3260 TGGTGGTGTGGAGATGGGTCAAGGATTGCATACAAAGGTCGCTCAAGTTGCTGCATCCGC 3319
||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||
Sbjct 3217 TGGAGGCGTGGAAATGGGTCAAGGATTGCATACAAAGGTTGCCCAAGTTGCCGCATCTGC 3276
Query 3320 CTTTAACATTCCACTTAGCTCAGTTTTCGTGTCAGAGACAAGCACTGACAAGGTTCCTAA 3379
|||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||
Sbjct 3277 CTTTAACATTCCCCTTAGTTCGGTTTTTGTGTCAGAGACGAGTACCGACAAGGTTCCAAA 3336
Query 3380 TGCGTCACCAACTGCTGCTTCTGCGAGCTCTGATATGTATGGTGCTGCAGTTTTAGACGC 3439
||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||
Sbjct 3337 TGCGTCACCAACTGCTGCTTCTGTGAGCTCTGACATGTACGGTGCTGCAGTTTTGGATGC 3396
Query 3440 TTGTGAGCAGATTATAG-CAAGAATGGAACCTGTTGCATCTAAGCACAATTTCAACACAT 3498
|||||||||||| | || || ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| | |
Sbjct 3397 TTGTGAGCAGATCA-AGGCACGAATGGAGCCTGTTGCATCTAAGCTCAATACCAACTCTT 3455
Query 3499 TTACTGAGCTAGTAAGTGCCTGCTACTTTCAACGGATAGACCTATCAGCTCATGGTTTTC 3558
|| ||||||| | | | || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||
Sbjct 3456 TTGCTGAGCTGGCAGGCGCGTGCTATTTTCAACGCATAGACCTCTCTGCTCACGGTTTTC 3515
Query 3559 ACATAGTTCCTGATCTTGGGTTTGACTGGATATCTGGAAAAGGGAACGCC-TTTAGATAT 3617
|||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||
Sbjct 3516 ACATCGTTCCCGATATTGGCTTTGACTGGATATCTGGAAAAGGGAAC-CCATTTAGGTAT 3574
Query 3618 TACACATATGGAGCTGCCTTTGCGGAAGTTGAGATAGATACATTGACTGGTGATTTCCAC 3677
|| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3575 TATACATATGGAGCCGCATTTGCTGAAGTTGAGATCGATACATTGACTGGTGATTTTCAG 3634
Query 3678 ACAAGAGCAGCTGATATAATGTTGGACCTCGGATATTCTCTTAACCCAGCCATTGATGTT 3737
|||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 3635 ACAAGAATGGTTGATATAATATTGGACCTCGGATATTCTCTTAACCCAGCCATCGATATT 3694
Query 3738 GGACAAATAGAAGGAGCGTTTGTACAAGGACTGGGTTGGGTAGCTTTAGAAGAACTCAAA 3797
||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3695 GGACAAATAGAAGGAGCATTTGTACAAGGGCTAGGTTGGGTAGCTTTAGAAGAACTCAAA 3754
Query 3798 TGGGGAGATGCAGCTCATAAATGGATTAAACCAGGAAGTTTACTCACTTGCGGACCCGGA 3857
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||
Sbjct 3755 TGGGGAGATGCAGCTCATAAATGGATTAAACCGGGAAATCTACTCACTTGCGGACCTGGA 3814
Query 3858 AACTACAAAATACCTTCCATCAACGACATGCCGTTCAACCTCAATGTTTCGCTTCTCAAG 3917
||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||
Sbjct 3815 AACTACAAAATACCTACCATTAACGACATTCCATTCAACTTCAAGGTTTCTCTTCTCAAG 3874
Query 3918 GGGAATCCGAATACAAAGGCAATACATTCATCTAAAGCAGTGGGTGAGCCACCATTCTTT 3977
|||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||
Sbjct 3875 GGGAATCCAAATTCAAAGGGGATACATTCATCAAAAGCAGTTGGTGAGCCTCCGTTTTTT 3934
Query 3978 CTTGCATCATCGGTTTTCTTTGCGAT-AAAGGAAGCTATTAAAGCGGCTAGAACCGAGGT 4036
|| ||||||||||| ||||||||||| |||| | | || |||||||||||| ||||| |
Sbjct 3935 CTAGCATCATCGGTCTTCTTTGCGATTAAAG-ATGGAATCAAAGCGGCTAGAGCCGAGAT 3993
Query 4037 GGGTCTCA-CAG-AC-TGGTTCCCTCTAGAGAGTCCAGCCACTCCAGAGCGTATCAGGAT 4093
|||||| | ||| | ||||| || || || | ||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 3994 GGGTCTTAGCAGCAAATGGTTTCCACTGGACACTCCTGCGACTCCAGAGCGTATCAGGAT 4053
Query 4094 GGCTTGTTTCGACGAATTTTCA-GCTCCTTTTGTAAATTCAGATTTCTACCCTAATCTTA 4152
||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| | |||||||| ||| || ||||
Sbjct 4054 GGCTTGTTTCGACGAGTTTACTTG-TCCTTTTGTAAGTAAAGATTTCTGCCCCAAGCTTA 4112
Query 4153 GTGTTTGAGCTTTGAACAT-CATC 4175
||||||||||||| ||| | ||||
Sbjct 4113 GTGTTTGAGCTTTTAACTTTCATC 4136
> Ahg944101 jgi|Araly1|944101|scaffold_700330.1
Length=382
Score = 58.4 bits (31), Expect = 4e-07
Identities = 33/34 (97%), Gaps = 0/34 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 347 AGGGATGCATGTAATATCCATTGAGGGACTTGGG 380
|||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 298 AGGGATGCATGTAATATCCATTGAGGGAGTTGGG 265
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 163495333608
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5