BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: halleri_transcript_ahg.fa 32,672 sequences; 38,939,717 total letters Query= AT4G38600.1 Length=6139 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Ahg943823 jgi|Araly1|943823|scaffold_700052.1 9439 0.0 > Ahg943823 jgi|Araly1|943823|scaffold_700052.1 Length=5696 Score = 9439 bits (5111), Expect = 0.0 Identities = 5515/5705 (97%), Gaps = 48/5705 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGAAACTCGGAGCCGCAAGCGGGCGGAGGCGACCTCAGCTGCCCCAtcttcttcttct 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 21 ATGGAAACTCGGAGCCGCAAGCGGGCGGAGGCGACCTCAGCTGCCCCATCTTCTTCTCCT 80 Query 61 tcttctcctcctcctcctccctctgcctctGGTCCCACCACCCGCAGCAAACGCGCTCGt 120 ||||| ||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 81 TCTTCACCT-C-CCT-CTGCCTCTG---CTGGTCCCACCACCCGCAGCAAACGCGCTCG- 133 Query 121 ctttcttcttcttcttcttcctcacttgcccccactcctccttcttcctccaccaccacc 180 || | |||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| Sbjct 134 ---TC-T-TTCTTCTTCTTCCTCACTTG---------C-CC--CTTCCT---CCACCACC 173 Query 181 cgctctcGTTCTTCTCGCTCTGCCGCCG-C-C-GCT---GCTCCCATGGACACCTCCACC 234 |||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||| Sbjct 174 CGCTCTCGTTCTTCTCGCTCTGCCGCCGCCACTGCTCCAGCTCCCATGGACACCTCCACT 233 Query 235 GA--C-TCTTCTGGATTTCGCCGAGGCGGACGTGGTAACAGGGGAAACA---ACAACGA- 287 || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | Sbjct 234 GACTCTTCTTCTGGATTTCGCCGAGGCGGTCGTGGTAACAGGGGAAACACCGATAAC-AC 292 Query 288 TAATTCTGACAAAGGTAAGGAGAAGGAACATGACGTTAGGATTAGGGAGC-GTGAAAGAG 346 || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| Sbjct 293 CAACTCTGACAAGGGTAAGGAGAAGGAACATGACGTTAGGATTAGGGA-CAGAGAAAGAG 351 Query 347 AAAGAGACCGAGCCAGAGAACAACTCAACATGGATGCTGCCGCCGCCGCTGCTAGGAGCG 406 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 352 AAAGAGACCGAGCCAGAGAACAACTCAACATGGATGCTGCTGCCGCCGCTGCTAGGAGCG 411 Query 407 CTGACGAGGATGACGACAATGACAGTGAGGATGGCAACGGCGGTTTCATGCATCCTAACA 466 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 412 CTGACGAGGATGACGACAATGACAGTGAGGATGGCAACGGCGGATTCATGCATCCTAACA 471 Query 467 TGAGCTCTGCGAGCAGTGCTTTACAAGGCTTGCTCAGGAAGCTCGGTGCTGGATTGGATG 526 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| Sbjct 472 TGAGCTCTGCCAGCAGTGCTTTACAAGGCTTGCTCAGGAAGCTTGGAGCTGGATTGGATG 531 Query 527 ACTTGCTTCCTTCTTCCGGTATCGGCTCTGCTTCTTCCTCCCACTTGAATGGAAGGATGA 586 |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| Sbjct 532 ACTTGCTTCCTTCTTCCGGTATCGGCTCTGCTTCATCTTCCCACTTGAATGGAAGGATGA 591 Query 587 AGAAGATTCTCTCTGGCTTGCGCGCTGAAGGAGAAGAGGGAAAACAGGTCGAGGCTTTAA 646 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| Sbjct 592 AGAAGATTCTCTCTGGCTTGCGCTCTGAAGGAGAAGAGGGAAAGCAGGTCGAGGCCTTAA 651 Query 647 CCCAGCTTTGTGAGATGTTATCCATTGGGACCGAAGACTCGCTTAGCACCTTCTCTGTTG 706 ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 652 CCCAGCTGTGTGAGATGTTATCCATTGGAACCGAAGACTCGCTAAGCACCTTCTCTGTTG 711 Query 707 ATTCCTTCGTCCCAGTTCTTGTCGGTCTACTTAACCATGAAAGCAATCCCGACATTATGC 766 |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 712 ATTCCTTCGTGCCAGTTCTTGTGGGTCTACTTAACCATGAAAGCAATCCCGACATTATGC 771 Query 767 TTCTTGCTGCCAGGGCTCTTACCCATCTATGTGATGTCTTGCCGTCTTCTTGTGCTGCTG 826 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 772 TTCTTGCAGCCAGGGCTCTTACCCATCTATGTGATGTCTTGCCGTCTTCTTGTGCTGCTG 831 Query 827 TTGTACATTACGGGGCAGTTTCATGCTTGGTGGCCAGATTGCTAACCATAGAATACATGG 886 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| Sbjct 832 TTGTACATTACGGGGCAGTTTCATGCTTAGTGGCTAGATTGCTAACCATTGAATACATGG 891 Query 887 ACTTGGCGGAACAGTCTCTGCAAGCTCTCAAAAAGATATCTCAGGAGCACCCAACTGCCT 946 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 892 ACTTGGCGGAGCAGTCTCTGCAAGCTCTCAAAAAGATATCTCAGGAGCACCCAACTGCCT 951 Query 947 GTTTGCGAGCTGGTGCTCTTATGGCTGTGCTCTCGTATCTGGATTTCTTCTCCACTGGTG 1006 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 952 GTTTGCGAGCTGGCGCTCTTATGGCTGTGCTCTCGTATCTGGATTTCTTCTCCACTGGTG 1011 Query 1007 TTCAGCGCGTAGCACTATCTACTGCTGCCAACATGTGCAAGAAACTACCTTCTGATGCAT 1066 |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| Sbjct 1012 TTCAGCGCGTAGCACTATCTACTGCTGCAAACATGTGTAAGAAACTGCCTTCGGATGCAT 1071 Query 1067 CTGATTATGTTATGGAAGCTGTACCTTTGCTGACAAACCTACTTCAGTATCATGATTCGA 1126 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1072 CTGATTATGTTATGGAAGCTGTACCATTGCTGACAAACCTACTTCAGTATCATGATGCGA 1131 Query 1127 AGGTTTTGGAATATGCTTCTATCTGTCTGACTCGAATTGCTGAAGCATTTGCACCGTATC 1186 |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1132 AGGTTTTGGAATATGCTTCTATATGTCTGACTCGGATTGCTGAAGCATTTGCACCGTATC 1191 Query 1187 CCGAGAAATTAGATGAATTATGTAACCATGGCCTGGTGACGCAAGCTGCGTCTCTTATTT 1246 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1192 CTGAGAAATTAGATGAATTATGTAACCATGGCCTGGTGACGCAAGCTGCGTCTCTTATTT 1251 Query 1247 CCACGAGCAATTCAGGAGGTGGGCAAGCATCTCTTAGTGTGTCAACATACACGGGGTTAA 1306 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1252 CCACGAGCAATTCAGGAGGTGGGCAAGCATCTCTTAGTGTGTCAACATACACGGGGTTAA 1311 Query 1307 TCCGATTACTTTCTACCTGTGCGAGCGGGTCACCTCTTGGATTCAGGACATTACTTCTTC 1366 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1312 TCCGATTACTTTCTACCTGTGCGAGTGGGTCACCTCTTGGATTCAGGACATTACTTCTTC 1371 Query 1367 TTGGTATTAGTAGCATTCTTAAGGATATTCTGTTGGGTTCTGGGGTCTCTGCTAATGCAT 1426 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1372 TTGGTATTAGTAGCATTCTTAAGGATATTCTGTTGGGTTCTGGGGTCTCTGCTAATACAT 1431 Query 1427 CTGTATCCCCAGCACTGAGCCGGCCTGCAGATCAGATTTATGAGATAGTCAACCTAGCGA 1486 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1432 CTGTATCCCCAGCACTGAGCCGGCCTGCAGATCAGATTTTTGAGATAGTCAACCTAGCGA 1491 Query 1487 ATGAGCTCCTCCCTCCATTGCCAGAAGGAGTTATCTCTCTTCCTACTAGCACAAACGCTC 1546 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1492 ATGAGCTACTCCCTCCATTGCCAGAAGGAGTTATCTCTCTTCCTACTAGCACAAACGCTT 1551 Query 1547 TTGTGAAAGGTTCATGCCAAAAGAAATCTAGTCCAAGTACTTCAGGAAAACAAGAAGATA 1606 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1552 TTGTGAAAGGTTCATGCCAAAAGAAATCTTGTCCAAGTACTTCAGGAAAACAAGAAGATG 1611 Query 1607 TTCTAAAAATTTCACCAAGAGAAAAATTACTTGGTGATCAACCTGAACTTCTGCAGCAGT 1666 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1612 CTCTAAAAATTTCACCAAGAGAAAAATTACTTGGTGATCAACCTGAACTTCTGCAGCAAT 1671 Query 1667 TTGGATTGGATCTTCTTCCAGTTTTAGTGCAGATCTATGGTTCTAGTGTCAATGGTACGA 1726 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 1672 TTGGATTGGATCTTCTTCCAGTTTTAGTGCAGATCTATGGTTCTAGTGTCAATGGTACTA 1731 Query 1727 TTCGCCATAAATGTCTCTCAGTCATTGGAAAGTTGATGTATTTCAGCAGTTCAGAAATGA 1786 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1732 TTCGCCATAAATGTCTCTCAGTCATCGGAAAGTTGATGTATTTCAGCAGTTCAGAGATGA 1791 Query 1787 TTCAATCTCTAATTGGTGACACAAATATTTCGAGCTTCTTGGCTGGTGTCTTGGCATGGA 1846 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1792 TTCAATCTCTAATTGGTGACACAAATATTTCGAGCTTCTTGGCTGGTGTCTTGGCATGGA 1851 Query 1847 AAGACCCACAGGTCTTGGTTCCTGCTCTACAAGTTGCAGAGATTTTGATGGAAAAGCTTC 1906 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1852 AAGACCCACAGGTCTTGGTTCCTGCTCTACAAGTTGCAGAGATATTGATGGAAAAGCTTC 1911 Query 1907 CTGAAACATTCTCGAAAGTGTTTGTGAGGGAAGGGGTAGTCCATGCTGTAGATCAACTTG 1966 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1912 CTGAAACATTCTCGAAAGTGTTTGTGAGGGAAGGGGTGGTCCATGCTGTAGATCAACTTG 1971 Query 1967 TCTTGGTTGGTAAACCATCCCATGCCTCACCTACTGATAAGGACAATGACTGTGTACCCG 2026 |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1972 TCTTGGTTGGTAAATCTTCTCATGCCTCACCTACTGATAAGGACAATGACTGTGTGCCCG 2031 Query 2027 GATCTGCACGATCTAGGCGTTATAGACGGCGCAGTAGTAATGCCAATTCCGATGGAAACC 2086 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2032 GATCTGCACGATCTAGGCGTTATAGACGGCGAAGTAGTAATGCCAATTCCGATGGAAACC 2091 Query 2087 AGTCGGAAGAGCCTAAGAATCCTGCGTCCCTTACCATAGGGGCAAACCATAATTCCCTTG 2146 |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | Sbjct 2092 AGTCGGAAGAGCCTAAGAATTCTGCGTCCCTTAACATAGGTGCAAACCATAATTCCCTGG 2151 Query 2147 ATACTCCTACAGCTAGCTTCATGCTAAGGGAAACAGTTAGTTCCTGCGCCAAAGCATTCA 2206 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2152 ATACTCCTACAGCTAGCTTCATGCTAAGGGAAACAGTTAGTTCCTGTGCCAAAGCATTCA 2211 Query 2207 AAGACAAGTACTTCCCGTCTGATGGTGGGGATGTTGATGTTGGAGTTACAGATGATCTTT 2266 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 2212 AAGACAAGTACTTCCCGTCTGATGGTGGGGATCTTGATGTTGGAGTTACAGATGATCTCT 2271 Query 2267 TACATCTGAAGAATCTTTGCACGAAGCTAACTGCTGGTATAGATGATCATAAAGTGAAAG 2326 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2272 TACATCTGAAGAATCTTTGCACGAAGCTAACTGCTGGTATAGATGATCATAAAGTGAAAG 2331 Query 2327 GAAAGGGAAAATCTAAAGCCTCTGGGCCATTCCTTGGCGATTTCTCTGCTAGCAAGGAAG 2386 | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2332 GGAAGGGAAAATCTAAAGCCTCTGGGCCATGCCTTGGCGATTTCTCTGCTAGCAAGGAAG 2391 Query 2387 AGTACTTGATTGGTGTCATTTCTGAGATACTTGGCGAGATAAGTAAAGGGGATGGTGTCT 2446 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2392 AGTACTTGATTGGTGTCATTTCTGAGATACTTGGCGAGCTAAGTAAAGGGGATGGTGTCT 2451 Query 2447 CAACTTTTGAGTTTATTGGCAGTGGTGTGGTTGCAGCATTGCTTAACTATTTTTCTTGTG 2506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2452 CAACTTTTGAGTTTATTGGCAGTGGTGTGGTTGCAGCATTGCTTAACTATTTTTCTTGTG 2511 Query 2507 GATACTTTTCCAAAGAGAAGATCTCCGAACTTAAT-TTGCCCAAACTTCGCCAGGAGGGA 2565 |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2512 GATACTTTTCCAAAGAGAAGATCTCCGAACTT-ATATTGCCCAAACTTCGCCAGGAGGGA 2570 Query 2566 CTCAGAAGGTTTAAAGCTTTTCTAGAAGTCGCTCTTCCTTTTGATGGTAATGAGGGAAAG 2625 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2571 CTCAGAAGGTTCAAAGCTTTTCTAGAAGTCGCTCTTCCTTTTGATGGTAATGAGGGAAAG 2630 Query 2626 GTCCCTCCTATGACAGTTTTGATTCAGAAACTTCAAAATGCTTTATCGTCACTGGAGCGC 2685 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2631 GTCCCTCCTATGACAGTTTTGATTCAGAAACTTCAAAATGCTTTATCGTCACTGGAACGC 2690 Query 2686 TTTCCTGTTGTCCTTAGCCATCCCTCAAGGTCACTAAGTGGAAGTGCTCGGCTCTCCTCG 2745 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2691 TTTCCCGTTGTCCTTAGCCATCCCTCAAGGTCACTAAGTGGAAGTGCTCGGCTCTCCTCT 2750 Query 2746 GGTTTGAGTGCTTTGGCACATCCTTTAAAGTTGCGATTATGCCGAGCATCTGGAGAGAAA 2805 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| Sbjct 2751 GGATTGAGTGCTTTGGCACATCCTTTAAAGTTGCGATTATGCCGTGCACCTGGAGAGAAA 2810 Query 2806 ACACTACGTGATTACTCCTCCAATATTGTACTTATAGATCCATTGGCAAGCTTAGCAGCA 2865 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2811 ACACTACGTGATTACTCCTCCAATATTGTACTTATAGATCCATTGGCAAGCATAGCAGCG 2870 Query 2866 GTGGAGGAATTTCTGTGGCCCCGAGTTCAACGGAGTGAATCTGCTCTGAAGCCGGCAGCG 2925 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2871 GTGGAGGAATTTCTGTGGCCCCGAGTTCAACGCAGTGAATCTGCTCTGAAGCCGGCAGCG 2930 Query 2926 CCTATTGGCAATACAGAGCCAGGCACGTTACCTAGCGGTGCTGGTGTTTCATCACCATCT 2985 ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2931 CCTGCTGGAAATACAGAGCCAGGCACGTTACCTAGCGGTGCTGGTGTTTCATCACCATCT 2990 Query 2986 TCGTCAACTCCAGCTTCAACCACTCGTCGTCATTCTTCTAGATCTCGATCGGCAATTAAC 3045 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2991 TCGTCAACTCCAGCTTCCACCACTCGTCGTCATTCTTCTAGATCTCGATCGGCAATTAAC 3050 Query 3046 ATCGGTGATACTTCAAAGAAAGATCCTGTGCATGAGAAAGGTACCAGCTCATCGAAAGGA 3105 || |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3051 ATAGGTGATGCCTCAAAGAAAGATCCTGTGCCTGAGAAAGGTACCAGCTCATCGAAAGGA 3110 Query 3106 AAAGGTAAAGGCGTTATGAAACCGGCTCAGGCGGATAAGGGGCCTCAAACAAGGAGCAAT 3165 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 3111 AAAGGTAAAGGCGTTATGAAACCGGCTCAGGCGGATAAGGGGCCTCAAACAAGGAGCAGT 3170 Query 3166 GCTCAAAAGAGAGCTGTTCTTGACAAAGATACTCAAATGAAACCAGCTAGCGGAGACTCC 3225 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3171 GCTCAAAAGAGAGCTGTCCTTGACAAAGATACTCAAATGAAACCAGCTAGCGGAGACTCC 3230 Query 3226 AGTTCTGAGGATGAGGAATTGGAAATATCCCCAGTCGACATtgatgatgccttggtgatt 3285 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3231 AGTTCTGAGGATGAGGAATTGGATATATCCCCAGTCGACATTGATGATGCCTTGGTGATT 3290 Query 3286 gaagaggatgacatttctgatgatgaagatgatgataatgaagatgttttggatgaCAGT 3345 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3291 GAAGAGGATGACATTTCTGATGATGAAGATGATGATAATGAAGATGTTTTGGATGACAGT 3350 Query 3346 CTTCCCATGTGCACGCCTGATAAAGTCCATGATGTGAAATTGGCGGACTCAGTGGATGAT 3405 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3351 CTTCCCATGTGCACGCCTGATAAAGTGCATGATGTGAAATTGGCGGACTCAGTGGATGAT 3410 Query 3406 GATGGTCTAGCAACCAGCGGCCGACAAATGAATCCAGCTTCTGGAGGCACTAGTGGAGCC 3465 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3411 GATGGTCTAGCAACCAGTGGCCGACAAATGAATCCAGCTTCTGGAGGCACTAGTGGAGCA 3470 Query 3466 GCAGCAGCAAGGGCATCTGATTCTATTGATACTGGCATTGGGAATTCCTATGGTTCTAGA 3525 ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 3471 GCAGCAGCACGGGGATCTGATTCTACTGATACTGGCATTGGGAATTCTTATGGTTCTAGG 3530 Query 3526 GGTGCACTCTCCTTTGCTGCTGCAGCGATGGCTGGGCTTGGAGCTGCCAGTGGTAGAGGT 3585 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3531 GGTGCACTCTCCTTTGCTGCTGCAGCGATGGCTGGGCTTGGAGCTGCCAGTGGTAGAGGT 3590 Query 3586 ATCAGGGGAAGTAGGGACTTGCATGGACGTACCCTAAATCGAAGTTCAGATGAGCCCTCT 3645 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3591 ATCAGGGGAAGTAGGGACTTGCATGGACGTACCCTAAATCGAAGTTCAGATGAGCCCTCT 3650 Query 3646 AAGTTGATATTTACTGCGGCAGGAAAACAACTTAGTAGGCATTTGACGATTTATCAGGCT 3705 ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3651 AAGTTGATATTTACTGCGGGAGGAAAGCAACTTAGTAGGCATTTGACGATTTATCAGGCT 3710 Query 3706 GTACAGCGACAACTTATGCTAGATGAAGATGATGATGACAGGTTTGGTGGCAGTGATCTA 3765 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3711 GTACAGCGACAACTTATGCTAGATGAAGATGATGATGACAGGTTTGGTGGCAGTGATCTA 3770 Query 3766 GTCTCAAGTGATGGAAGCAGATTCAATGATATTTACACCATCATGTACCAGAGGCCAGAC 3825 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3771 ATCTCAAGTGATGGAAGCAGATTCAATGATATTTACACCATCATGTACCAGAGGCCAGAT 3830 Query 3826 AGCCAAGTGAATAGGTTGTCTGTTGGTGGAGCAAGTTCTACCACACCGTCAAAATCCACG 3885 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3831 AGCCAAGTGAATAGGTTGTCTGTTGGTGGAGCAAGTTCTACCACACCGTCAAAATCCACG 3890 Query 3886 AAATCTG---CTACTACCAATTCCAGTGTAGAATCTCAGTCACATAGGGCATCTCTTTTG 3942 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3891 AAATCTGCTACTACTACCAATTCCAGTGTAGAATCTCAGTCACATAGGGCATCTCTTTTG 3950 Query 3943 GATAGTATCTTACAAGGGGAGCTTCCATGCGACCTTGAGAAGTCGAATTCTACATATAAT 4002 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3951 GATAGTATCTTACAAGGGGAGCTTCCATGCGACCTTGAGAAGTCGAATTCTACATATAAT 4010 Query 4003 GTTCTGGCACTGTTACGTGTATTAGAGGGTTTAAATCAGCTTTGCCCTCGTTTAAGAGCC 4062 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4011 GTTCTGGCACTGTTACGTGTATTAGAGGGTTTAAATCAGCTTTGCCCTCGTTTAAGAGCC 4070 Query 4063 CAAACTCTTTCCGATCGTTTTGCAGAGGGTAAAATTACAAGTCTAGATGATCTGAGTACA 4122 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4071 CAAACTCTTTCCGATCGTTTTGCAGAGGGTAAAATTACAAGTCTAGATGATCTGAGTACA 4130 Query 4123 ACTGCTGCTAAGGTTCCTCTTGATGAATTTGTCAATAGCAAACTTACACCCAAATTGGCT 4182 ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 4131 ACTGCTGCTAAGGTTCCTCATGAAGAATTCGTCAATAGCAAACTTACACCCAAATTAGCT 4190 Query 4183 CGACAAATCCAGGATGCGCTTGCTTTGTGCAGTGGAAGTCTTCCCTCTTGGTGCTACCAG 4242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4191 CGACAAATCCAGGATGCGCTTGCTTTGTGCAGTGGAAGTCTTCCCTCTTGGTGCTACCAG 4250 Query 4243 TTGACTAGAGCATGCCCATTTTTGTTTCCGTTTCAAACCCGGAGACAGTATTTCTACTCG 4302 ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4251 TTGACTAGAGCATGCCCATTTCTATTCCCGTTTCAAACCCGGAGACAGTATTTCTACTCA 4310 Query 4303 ACTGCTTTTGGGTTGTCTCGTGCATTGAATCGTTTGCAGCAGCAGCAAGGTGCTGACGGC 4362 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4311 ACTGCTTTTGGGTTGTCTCGTGCATTGAATCGTTTGCAGCAGCAGCAAGGTGCTGACGGC 4370 Query 4363 AGTGGGTCTACAAATGAACGAGAGATGAGAATAGGGAGATTGCAGCGCCAGAAAGTCCGT 4422 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4371 AGTGGGTCTACAAATGAACGAGAGATGAGAATAGGGAGATTGCAGCGCCAGAAAGTCCGT 4430 Query 4423 GTATCCCGAAATAGGATATTAGATTCTGCTGCAAAAGTTATGGAGATGTATTCTAGCCAG 4482 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4431 GTATCCCGAAATAGGATATTAGATTCTGCTGCGAAAGTTATGGAGATGTATTCTAGCCAG 4490 Query 4483 AAAGCTGTGCTTGAAGTAGAATATTTTGGTGAAGTTGGTACTGGTCTAGGCCCTACCCTT 4542 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 4491 AAAGCTGTTCTTGAAGTAGAATATTTTGGTGAAGTTGGTACTGGTCTAGGACCTACCCTT 4550 Query 4543 GAGTTTTACACACTTCTAAGCCATGATCTGCAAAAGGCTTCCCTAGGGATGTGGAGATCA 4602 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 4551 GAGTTTTACACACTTTTAAGCCATGATCTGCAAAAGGTTTCCCTAGGGATGTGGAGATCA 4610 Query 4603 AGTTCTGGTGACAAGGTATCTATGCAAATTGGTAGAGATGAGATTGAAGACGGAAAACCA 4662 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || Sbjct 4611 AGTTCTGGTGACAAGGTATCTATGCAAATTGATAGAGATGAGATTGAAGATGGAAAATCA 4670 Query 4663 TCTGCAGCTAACAGAGATATAGTTCTGGCACCACTTGGATTGTTTCCTCGGCCTTGGCCC 4722 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| Sbjct 4671 TCTGCAGCTAACAGAGATATAGTTCTGGCACCACTTGGGTTGTTTCCTCGACCTTGGCCC 4730 Query 4723 TCAACAGCTGACATATCTGAAGGTGGTCAGTTTCATAAAGTCATTGAATATTTCCGCCTT 4782 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4731 TCAACAGCTGACATATCTGAAGGTGGTCAGTTTCATAAAGTCATTGAATATTTCCGCCTT 4790 Query 4783 TTAGGGCGTGTGATGGCCAAAGCACTTCAAGATGGACGGCTATTGGACGTCCCATTGAGT 4842 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4791 TTAGGGCGTGTGATGGCCAAAGCACTTCAAGATGGACGGCTATTGGACGTCCCATTGAGT 4850 Query 4843 ACAGCGTTTTATAAACTTATTCTTGGTCAAGAGCTTGATTTGCATGATATTGTATTATTT 4902 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4851 ACAGCGTTTTATAAACTTATTCTTGGTCAAGAGCTTGATTTGCATGATATTGTATTATTT 4910 Query 4903 GACGCTGAACTTGGCAAGACCTTGCAAGAGCTGCGTGTTGTTGTTGCCCGCAAGCACTAT 4962 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| Sbjct 4911 GACGCTGAACTTGGCAAGACCTTGCAAGAGCTGCGTGTTCTCGTTGCCCGCAAGCACTAT 4970 Query 4963 CTGGAGGGAGTAGGTGGTGACAATAGCAGCACGATTTCTGATTTATGTTTACGTGGATGC 5022 ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | Sbjct 4971 CTGGAGGCAGTAGGTGGTGACAATAGCAGCACGGTTTCTGATTTATGTTTACGTGGATCC 5030 Query 5023 CGAATAGAAGATCTCTCCTTGGAATTCACGCTACCTGGCTATCCTGAGTACATCCTGAGA 5082 |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 5031 CGAATAGAAGATCTCTTCTTGGACTTCACGCTACCTGGCTATCCTGAGTACATTCTGAGA 5090 Query 5083 TCAGGAGATGAAATTGTTGATATTACTAATCTTGAGGAGTATATATCCCTTGTCGTTGAT 5142 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5091 TCAGGAGATGAAATTGTTGATATTACTAATCTTGAGGAGTATATATCCCTTGTCGTTGAG 5150 Query 5143 GCTACTGTCAAGAGAGGAGTCACTCGGCAGATCGAAGCCTTCAGATCTGGATTCAATCAG 5202 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5151 GCTACTGTGAAGAGAGGAGTCACTCGGCAGATCGAAGCCTTCAGATCTGGATTCAATCAG 5210 Query 5203 GTGTTTGACATAACATCTCTACAAATATTCACCCCTTCTGAGCTGGACTATTTGCTGTGT 5262 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 5211 GTGTTTGACATAACATCTCTACAAATATTCACCCCTTCTGAGCTGGACTACTTGCTGTGT 5270 Query 5263 GGTCGTAGAGAGTTGTGGGAGGTGGAGACTCTTGCTGAACATATCAAATTTGATCATGGG 5322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 5271 GGTCGTAGAGAGTTGTGGGAGGTGGAGACTCTTGCTGAACATATCAAATTTGATCACGGT 5330 Query 5323 TATAATGCCAAAAGTCCGGCAATCATTAACTTACTGGAGATCATGGGAGAACTTACAGCA 5382 || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5331 TACACTGCCAAAAGTCCGGCAATCATTAACTTACTGGAGATCATGGGAGAACTTACAGCA 5390 Query 5383 GATCAGCAGAGGGCTTTCTGCCAATTTGTAACTGGAGCTCCTAGGCTTCCTCCTGGTGGC 5442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5391 GATCAGCAGAGGGCTTTCTGCCAATTTGTAACTGGAGCTCCTAGGCTTCCTCCTGGTGGC 5450 Query 5443 TTAGCTGTTCTGAACCCAAAGCTTACGATTGTGAGAAAGCACTCATCGACCTCAAGTGCA 5502 ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5451 TTAGCTGTTCTGAACCCAAAGCTCACGATTGTAAGAAAGCACTCATCGACCTCAAGTGCA 5510 Query 5503 GCAGCCAACGGAGCAGGGGCTTCGGAGACAGCAGATGATGATTTGCCCAGTGTCATGACT 5562 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5511 GCAGCCAATGGAGCAGGGGCTTCGGAGACAGCAGATGATGATTTGCCCAGTGTCATGACT 5570 Query 5563 TGCGCAAACTACCTTAAACTCCCTCCTTATTCTACAAAGGAAATCATGTACAAGAAACTG 5622 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 5571 TGCGCAAACTACCTTAAACTCCCTCCTTATTCTACAAAGGAAATAATGTACAAGAAACTG 5630 Query 5623 CTCTACGCCATCAACGAAGGGCAAGGATCGTTCGACCTCTCATAAGCAACATATGGCTGT 5682 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | Sbjct 5631 CTCTACGCCATCAACGAAGGGCAAGGATCGTTTGACCTCTCATAAGCAACAGATGGCTCT 5690 Query 5683 GTTTC 5687 ||||| Sbjct 5691 GTTTC 5695 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 232607886176 Database: halleri_transcript_ahg.fa Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM Number of letters in database: 38,939,717 Number of sequences in database: 32,672 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5