BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: halleri_transcript_ahg.fa
32,672 sequences; 38,939,717 total letters
Query= AT4G39420.2
Length=10189
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
Ahg490723 jgi|Araly1|490723|fgenesh2_kg.7__156__AT4G39450.1 6663 0.0
Ahg888149 jgi|Araly1|888149|Al_scaffold_0007_135 3493 0.0
Ahg943920 jgi|Araly1|943920|scaffold_700149.1 2202 0.0
Ahg490721 jgi|Araly1|490721|fgenesh2_kg.7__154__AT4G39430.1 1524 0.0
Ahg943918 jgi|Araly1|943918|scaffold_700147.1 87.9 1e-15
> Ahg490723 jgi|Araly1|490723|fgenesh2_kg.7__156__AT4G39450.1
Length=5009
Score = 6663 bits (3608), Expect = 0.0
Identities = 3914/4061 (96%), Gaps = 23/4061 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 6092 GGCATCGAAGGAGTTTGGTGATCAACGTTTAAAAGCTCACATACTGACTGTTTTGAGATA 6151
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 GGCATCGAAGGAGTTTGGTGATCAACGTTTAAAAGCTCACATACTGACTGTTTTGAGATA 1019
Query 6152 TGCCAACTCAAAAAAGAAAGCCACCACATCGTTCTCAGATGACCCAAGCAGAGGACTTTC 6211
||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1020 TGCCAACTCAAAAAAGAAAGCCAGCATATTGTACTCAGATGACCCAAGCAGAGGTTTTTC 1079
Query 6212 ATGTTCCCCCTCAGAGGGTGGAGCTTATGTCTCTGCTGAACTCTTTCGTGTTTTGGCATA 6271
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1080 ATGTTCCTCCTCAGAGGGTGGAGCTTATGTCTCTGCTGAACTCTTTCGTGTTTTGGCTTA 1139
Query 6272 CTCTGAGAAGCTAAAGAATCCTGGGGAATACCTTTTGTCAAAAGCTAAGGAATTCTCGTG 6331
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||
Sbjct 1140 CTCTGAGAAGCTAAAGAATCCTGGGGGATACCTTTTATCGAAAGCTAAGGAATTATCGTG 1199
Query 6332 GTCTATTTTGGCTCTCATAGCATCATGCTTTCCGGATGTTTCTCCTTTATCATGCCTAAC 6391
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1200 GTCTATTTTGGCTCTCATAGCATCATGCTTTCCGGATGTTGCTCCTTTATCATGCCTAAC 1259
Query 6392 AATTTGGTTGGAAATTACCGCAGCCAGGGAAACGTCGTCTATCAAGGTGAACGATATAAC 6451
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 AATTTGGTTGGAAATTACCGCAGCCAGGGAAACGTCGTTTATCAAGGTGAACGATATAAC 1319
Query 6452 GACTAAAATAGCTGAAAATATAGGAGCAGCTGTTGTATCTACAAATTCCTTGCCGACGGA 6511
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1320 AACTAAAATAGCAGAAAATATAGGAGCAGCTGTTGTATCTACAAATTCCTTGCCAACGGA 1379
Query 6512 TGCTAGAGGTGTCCAGTTTCATTACAATAGGAGGAATCCCAAACGGAGACGACTTACTGC 6571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 TGCTAGAGGTGTCCAGTTTCATTACAATAGGAGGAATCCCAAACGGAGACGACTTACTGC 1439
Query 6572 ACATACATCTGTGGATTTATTGGCTTCAGCCAATAGTTTAAACATCTCTGCTGGTAAAAC 6631
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||
Sbjct 1440 ACATACATCTGTGGATTTATTGGCTTCAGCCGATAGTGTATACACCTCTGCTGGTAAAAC 1499
Query 6632 ATTTTGTTCTCATAGAACAGAAGCTGCAGAAGATGAAAAAGCGGAAGATAGCAGTGTTAT 6691
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1500 ATTTTGTTCTCTTAGAACAGAAGCTGCAGAAGATGAAAAAGTTGAAGATAGCAGTGTTAC 1559
Query 6692 TGATGATTCGTCTGATGAGCATGCGTCTCTATCAAAAATGGTCGCAGTGCTTTGTGAACA 6751
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 TAATGATTCGTCTGATGAGCATGCGTCTCTATCAAAAATGGTCGCAGTGCTTTGTGAACA 1619
Query 6752 ACGCTTGTTTCTTCCTCTGCTAAAAGCTTTTGACTTGTTCCTCCCGTCCTGCTCTCTACT 6811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1620 ACGCTTGTTTCTTCCTCTGCTAAAAGCTTTTGACTTGTTCCTCCCGTCCTGCTCTCTGTT 1679
Query 6812 GCCATTTTTCCGTGCTCTTCAGGCATTTTCTCAAATGCGCCTGTCTGAAGCTTCAGCACA 6871
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 GCCATTTTTTCGTGCTCTTCAGGCATTTTCTCAAATGCGCCTGTCTGAAGCTTCAGCACA 1739
Query 6872 TCTGGGTTCTTTTTGGGGTAGAGTTAAAGAGGAATCAATGCATTTTCAGTCAAATACAGC 6931
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1740 TCTGGGTTCTTTTTGGGCTAGAGTTAAAGAGGAATCAATGCATTTTCAGTCAAATATAGC 1799
Query 6932 CAAAGATGTCAATTTTGGGGCATCTTGGATCAGCAGAACAGCTGTTAAGGCTGCTGATGC 6991
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1800 CAAAGATGTCAATTTTGGAGCATCTTGGATCAGCAGAACAGCTGTTAAAGCTGCTGATGC 1859
Query 6992 TGTTTTGTCAGCTTGTCCATCTCCATATGAGAAAAGATGCTTACTACAACTTCTTGCTGC 7051
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1860 TGTTTTGTCAACTTGTCCATCTCCATATGAGAAAAGATGCTTACTGCAACTTCTTGCTGC 1919
Query 7052 AACTGATTTTGGTGATGGGGGATCTGCGGCAACATATTATCGGCGTCTTTATTGGAAAGT 7111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 AACTGATTTTGGTGATGGGGGATCTGCGGCAACATATTATCGGCGTCTTTATTGGAAAGT 1979
Query 7112 TAACTTGGCTGAGCCATCACTCCGGGAGAATGATCTTGACTTAGGAAATGAGTCCCTTGA 7171
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980 TAACTTGTCTGAGCCATCACTCCGGGAGAATGATCTTGACTTAGGAAATGAGTCCCTTGA 2039
Query 7172 TGATGGCTCTCTTCTGACAGCTTTAGAAAAGAACAGGCAATGGGAGCAAGCAAGAAACTG 7231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040 TGATGGCTCTCTTCTGACAGCTTTAGAAAAGAACAGGCAATGGGAGCAAGCAAGAAACTG 2099
Query 7232 GGCCAAGCAACTTGAAACCATTGGTGCCACTTGGACATCCTCTGTACATCATGTTACTGA 7291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 GGCCAAGCAACTTGAAACCATTGGTGCCACTTGGACATCCTCTGTACATCATGTTACTGA 2159
Query 7292 AACACAGGCAGAATCCATGGTTGCAGAATGGAAAGAATTCCTTTGGGATGTTCCAGAAGA 7351
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 AACGCAGGCAGAATCCATGGTTGCAGAATGGAAAGAATTCCTTTGGGATGTTCCAGAAGA 2219
Query 7352 GAGAATCGCATTGTGGGGTCACTGCCAAACTCTGTTCATCAGATACTCTTTCCCTGCTTT 7411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 GAGAATCGCATTGTGGGGTCACTGCCAAACTCTGTTCATCAGATACTCTTTCCCTGCTTT 2279
Query 7412 ACAGGCAGGTTTATTTTTCCTTAGGCATGCAGAAGTGGTGGAGAAAGATCTTCCTGCAAG 7471
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 ACAGGCAGGCTTATTTTTCCTTAGGCACGCAGAAGTGGTGGAGAAAGATCTTCCTGCAAG 2339
Query 7472 AGAGATCTATGAGCTGTTACTGCTATCCCTTCAGTGGCTAAGTGGGCTAACAACTCTGTC 7531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 AGAGATCTATGAGCTGTTACTGCTATCCCTTCAGTGGTTGAGTGGGCTAACAACTCTGTC 2399
Query 7532 GCACCCGGTTTATCCTTTGCATCTTCTCCGAGAAATCGAGACTAGGGTATGGTTACTGGC 7591
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2400 GCACCCGGTTTATCCTTTGCATCTTCTCCGAGAAATCGAGACTAGGGTGTGGTTACTGGC 2459
Query 7592 TGTAGAAGCAGAATCACATGTGAAAAATGTCGGAGCATTTAGTCCGAGTAGTATCGGAAA 7651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2460 TGTAGAAGCAGAATCACATGTGAAAAATGTCGGAGCATTTAGTTCGAGTAGTATCGGAAA 2519
Query 7652 AGACATGGTGAATGGATATAGTTCAAATCTTATAGATCGAACTGCAAGTATCATAACAAA 7711
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2520 AGACATGGTGAATGGAAATAGTTCAAATCTTATAGACCGAACTGCAAGTATCATAACAAA 2579
Query 7712 AATGGACAGCCATATTTCTTCAGCAACGAAAAATAGAATTGGAGAAAAACATGACGCCAG 7771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2580 AATGGACAGCCATATTTCTTCAGCAACGAAAAATAGAATTGGAGAAAAACATGACTCCAG 2639
Query 7772 GGCCGCTGGCCAAGGAAATCAAAGGAACCAAGACACGAGCACTTCAATATTTGGTGCTAG 7831
|||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2640 GGCCGCTGGCCATGGACATCAAAGGAACCAAGACACGAGCACTTCAATCTTTGGTGCTAG 2699
Query 7832 CACTAAGCCCAAGAGGAGAGCAAAAGGAAATGTCCCACAAATAAGACATTTTGTGGATTC 7891
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2700 CACAAAGCCCAAGAGGAGAGCAAAAGGAAATGTCCCACAAATAAGACATTTTGTGGATTC 2759
Query 7892 TTCAGATAGGAATACTGACTTTGAAGATTCTTCATCTCTTATAAACATCAAAAGCGAGTT 7951
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 2760 TTCAGATAGGAATACTGATTTTGAAGATTCTTCATCTCTTCTAAACATCAAAAGTGAGTT 2819
Query 7952 CCAGCTTCAAGAGGAGAGCACGGGTTTGGAAATATCCTTATCGAAGTGGGAAGAAAGTAT 8011
||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2820 CCAGCTTCAAGAGGAAAACATGGGTTTGGAAATATCCTTATCAAAGTGGGAAGAAAGTAT 2879
Query 8012 AGAACCTGCAGAGTTGGAAAGAGCTGTTCTGTCCTTACTGGAGTTCGGACAAGTAACAGC 8071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880 AGAACCTGCAGAGTTGGAAAGAGCTGTTCTGTCCTTACTGGAGTTCGGACAAGTAACAGC 2939
Query 8072 TGCTAAGCAGCTCCAACTTAAGCTTGCTCCAGGGAATCTACCTTCTGAGCTGATAATTTT 8131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2940 TGCTAAGCAGCTCCAACTTAAGCTTGCTCCAGGGAATTTACCTTCTGAGCTGATAATTTT 2999
Query 8132 GGATGCTGTTATGAAGCTAGCAATGCTTTCTACGCCTTGCAGACAAGTACTATTGTCAAT 8191
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||
Sbjct 3000 GGATGCTGTTATGAAGCTAGCAATGCTTTCTACGCCTTGCTGTCAAGTACCATTGTCAAT 3059
Query 8192 GTTAGATGATGAAGTTCGCTCTGTCATTCAATCACACAGTCTAAAAATAGACCAACCTAT 8251
||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 3060 GTTGGATGATGAAGTTCGTTCAGTCATTCAATCACAGAGTCTAAGAATAGACCAACCTCT 3119
Query 8252 GATTGAACCGCTGCAGATTTTGGAGAATCTATC-AACCATTTTAAATGAAGGCAGTGGAC 8310
|||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 GATTGAACCGCTGCAGGTTTTGGAGAATCTATCGAAC-ATTTTAAATGAAGGCAGTGGAC 3178
Query 8311 GAGGGCTGGCAAGAAAAATCATCGCAGTTATAAAAGCTGCTAACATACTGGGCCTTACAT 8370
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3179 GTGGGCTGGCAAGAAAAATCATTGCAGTTATAAAAGCTGCTAACATACTGGGCCTTACAT 3238
Query 8371 TCACTGAGGCATATCAAAAGCAGCCGATAGAGTTGTTACGATTACTTTCTCTTAAAGCAC 8430
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3239 TCACTGAGGCATATCAAAAGCAGCCAATAGAGTTGTTACGATTACTTTCTCTTAAAGCAC 3298
Query 8431 AAGATTCTTTTGAGGAAGCATGTCTCCTTGTCCAAACGCATTCAATGCCCGCTGCTAGTA 8490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3299 AAGATTCTTTTGAGGAAGCATGTCTCCTTGTCCAAACGCATTCAATGCCCGCTGCTAGTA 3358
Query 8491 TCGCTCAAATACTTGCAGAATCCTTTCTAAAGGGTTTATTGGCTGCTCATCGTGGAGGAT 8550
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3359 TCGCTCAAATACTTGCAGAATCCTTTTTAAAGGGTTTATTGGCAGCTCATCGTGGAGGAT 3418
Query 8551 ATATAGATTCTCAAAAGGAGGAAGGGCCTGCTCCACTTTTGTGGAGATTTTCAGACTTTT 8610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3419 ATATAGATTCTCAAAAGGAGGAAGGGCCTGCTCCACTTTTGTGGAGATTTTCAGACTTTT 3478
Query 8611 TGAAGTGGGCGGAGCTTTGTCCATCTGAACAAGAAATTGGTCATGCATTAATGCGTCTTG 8670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 TGAAGTGGGCGGAGCTTTGTCCATCTGAACAAGAAATGGGTCATGCATTAATGCGTCTTG 3538
Query 8671 TAATAACCGGGCAGGAAATACCACACGCGTGTGAGGTTGAGCTTCTTATTCTGTCTCATC 8730
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3539 TAATTACCGGGCAGGAAATACCACACGCGTGTGAGGTTGAGCTTCTTATTCTGTCTCATC 3598
Query 8731 ACTTCTACAAGTCATCCACGTGCCTTGATGGAGTAGATGTTCTTGTGGCACTTGCTGCCA 8790
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3599 ACTTCTACAAGTCATCCACGTGCCTTGATGGAGTTGATGTTCTTGTTGCACTTGCTGCCA 3658
Query 8791 CAAGGGTTGAGGCTTATGTTGCTGAGGGAGATTTCTCATGCCTGGCTCGTCTAATAACTG 8850
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3659 CAAGGGTTGAGGCTTATGTTGCCGAGGGCGATTTCTCATGCCTGGCTCGTCTAATAACTG 3718
Query 8851 GAGTTGGAAACTTTCATGCTCTTAATTTCATTCTCAATATTCTAATCGAAAACGGGCAGC 8910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3719 GAGTTGGAAACTTTCATGCTCTTAATTTCATTCTCAATATTCTAATCGAAAACGGGCAGC 3778
Query 8911 TTGATCTTTTACTACAAAAATTTTCTGCTGCTGCTG---ATGCAAACACTGGCACCGCTC 8967
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3779 TTGATCTTTTACTACAGAAATTTTCTGCTGCTGCTGCTGATGCAAACACTGGCACCGCTC 3838
Query 8968 AGGCTGTCAGAAGTTTCCGGATGGCTGTTCTGACCTCGTTGAATCTGTATAACCCAAATG 9027
||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3839 AGGCTGTCAGAAGTTTCCGAATGGCTGTTTTGACCTCGTTGAATCTGTTTAACCCAAATG 3898
Query 9028 ACCATGATGCATTCGCAATGGTATATAAACACTTTGACATGAAGCATGAAACGGCTACTT 9087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3899 ACCATGATGCATTCGCAATGGTATATAAACACTTTGACATGAAGCATGAAACGGCTACTT 3958
Query 9088 TGCTAGAGGCACGTGCAGATCAGGCTGCACAGCAGTGGTTTCTACGGTATGACAAGGATC 9147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3959 TGCTAGAGGCACGTGCAGATCAGGCTGCACAGCAGTGGTTTCTACGGTATGACAAGGATC 4018
Query 9148 AAAATGAAGATCTCCTTGATTCTATGCGCTATTACATTGAAGCTGCCGAAGTTCACACTT 9207
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4019 AAAATGAAGATCTCCTTAATTCTATGCGCTATTACATTGAAGCTGCGGAAGTTCACACTT 4078
Query 9208 CTATTGATGCTGGAAACAAAGCGCGAAAGGCTTGTGGTCAGGCTTCCCTTGTCTCCCTTC 9267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4079 CTATTGATGCTGGAAACAAAGCGCGAAAGGCTTGTGGTCAGGCTTCCCTTGTCTCCCTTC 4138
Query 9268 AGATAAGGATGCCAGATTCCAAGTGGCTCTGTTTATCTGAAACAAACGCAAGAAGAGCAC 9327
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4139 AAATAAGGATGCCAGATTCCAAGTGGCTCTGTTTATCTGAAACAAACGCCAGAAGAGCAC 4198
Query 9328 TTGTAGATCAATCCCGTTTCCAGGAGGCTCTGATTGTAGCAGAAGCTTATGGTCTTAACC 9387
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4199 TTGTTGATCAATCCCGTTTCCAGGAGGCTCTGATTGTAGCAGAAGCTTATGGTCTTAACC 4258
Query 9388 AGCCAAGCGAATGGGCGCTGGTGCTTTGGAATCTGATGCTCAAACCTGAACTAGCGGAAG 9447
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4259 AGCCAAGCGAATGGGCGCTTGTGCTTTGGAATCTGATGCTCAAACCCGAACTAGCGGAAG 4318
Query 9448 ATTTTGTGGCTGAATTTGTAGCGGTGCTTCCCCTACAGGCTTCAATGCTTCTGGAACTGG 9507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4319 ATTTTGTGGCTGAATTTGTAGCGGTGCTTCCCCTACAGGCTTCAATGCTTCTGGAACTGG 4378
Query 9508 CTAGATTCTACAGAGCGGAAATGGCAGCTAGGGGAGACCAGTCTCAGTTCTCAGTCTGGC 9567
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4379 CTAGATTCTACAGAGCGGAAATGGCAGCTAGGGGAGACCAGTCTCAGTTCTCGGTCTGGC 4438
Query 9568 TCACAGGAGGAGGCTTACCAGCTGAGTGGGCCAAATATATGTGGAGGTCATTCAGGTGTT 9627
||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 4439 TCACAGGAGGAGGCTTACCGGGTGAGTGGGCCAAATACATGTGGAGATCATTCAGGTGTT 4498
Query 9628 TGTTGAAAAGAACACGGGATTTGAGGTTGCGGTTACAGCTTGCTACAACAGCAACGGGAT 9687
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4499 TGTTGAAGAGAACACGGGATTTGAGGTTACGGTTACAGCTTGCTACAACAGCAACGGGAT 4558
Query 9688 TTGCTGACATGGTAGATGTGTGTATGAATGCGTTGGATAAGGTCCCGGAAAATGCTGGAC 9747
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4559 TTGCTGACATGGTAGATGGGTGTATGAATGCGTTGGATAAGGTCCCGGAAAATGCTGGAC 4618
Query 9748 CACTTGTACTAAAGAAAGGACATGGAGGAGGATACTTACCACTCATGTGAGTGAGTGAAC 9807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4619 CACTTGTACTAAAGAAAGGACATGGAGGAGGATACTTACCACTCATGTGAGTGAGTGAAC 4678
Query 9808 TCAGAGATCATCTCAAAGTATGCAATGTTAAGTATCTCTCTCTCT----GCTTCATCGTT 9863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4679 TCAGAGATCATCTCAAAGTATGCAATGTTAAGTATCTCTCTCTCTCTCTGCTTCATCGTT 4738
Query 9864 GTAAAGAGGTCGATGGGGCTGTAAATTAGCCAAAGAAATCGGAAAAGGttttttttGATT 9923
|| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||
Sbjct 4739 GTGA-GAGGTCGATGGGGCTGTAAATTAGCCGAAGAAATTGGAAAAGGGGTTTTC-GATT 4796
Query 9924 GCTATCTTTTTGGTGTTGTGGAAGAGACACAAACTTAAGTCttttttttATAGGGTTTAG 9983
| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||
Sbjct 4797 GATATATTTTTGATGTTGTGGAAGAGACACAAACTTGAGTCTTTTTT--ATAGGGATTAG 4854
Query 9984 TATTTATGTGTATGTTTTGTTGCTGGCTCTCACAATTCTTCAAtttttg-tttttgacct 10042
||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||
Sbjct 4855 TATTTGTCTGT--GTTTTGTTGTTGGCTCTCACAATTCTTCTATTTTTTCTTTTTCTCCT 4912
Query 10043 tatattttttttGTCCCGGCTATTA--AA-TGGCAGTCCTGCGAGATACATAGAGATAGA 10099
| || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||| | ||||| ||
Sbjct 4913 TGTAATTTTTTTGTCCCGGCTATTATTAAATGGCAGTCTTGAGAGATAGAGAGAGA--GA 4970
Query 10100 GAGACTACAGTGTACAGTGTAATAACTGTCTTTGGTATAAG 10140
|| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4971 GA-A-TAGAGTGTACAGTGTAATAACTGTCTTCGGTATAAG 5009
Score = 1550 bits (839), Expect = 0.0
Identities = 905/937 (97%), Gaps = 3/937 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5100 GGACCTCTTGGATGGCTGTCTTTCTCAGGATATCCTACAGGGGAATATCTACTGCATAGA 5159
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 25 GGACCTCTAGGATGGCTGTCTTTCTCAGGATATCCTACAGGGGAATACCTACTGCATAGA 84
Query 5160 GGTGTTGAGTTCTTTATAAATGTCGACGATCCGACAGAGATAAGTGCCATATCTTGGGAA 5219
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 85 GGTGTTGAGTTCTTTATAAACGTCGATGATCCGACAGAGATAAGTGCCATATCTTGGGAA 144
Query 5220 GCAATCATCCAGAAGCACATCGAAGAGGAACTTCATCACACAAAAACTGAGGGAACCGAG 5279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 145 GCAATCATCCAGAAGCACATCGAAGAGGAACTTCATCACACAAAAACTGAGGGAACCGAG 204
Query 5280 CTTGGACTTGAGCACTTCCTGCATCGTGGACGGCCACTCGCAGCTTTTAATGCTTTTCTG 5339
||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 205 CTTGGACTTGAGCACTTCCTGTATCGCGGACGGCCACTTGCAGCTTTTAATGCTTTCCTG 264
Query 5340 GAACATAGAGTTGAAAAGTTAAAACTGGAAGATCAATCTGGCTCTTCGATACATGGACAA 5399
||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
Sbjct 265 GAACAGAGAGTTGAAAAGCTAAAACTGGAAGATCAATCTGGCTCTTGGACACATGGACAA 324
Query 5400 AGAAATATGCAGTCAGATGTTCCGATGCTACTTGCACCTCTGACGCAGAGTGATGAGTCA 5459
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 325 AGAAATATGCAGTCAGATGTTCCAATGCTACTTGCACCTCTGACGCAGAGTGATGAGTCA 384
Query 5460 CTTCTTTCATCTGTCATACCACTTGCTATCACACACTTTGGGGATTCTGTGTTGGTGGCT 5519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385 CTTCTTTCATCTGTCATACCACTTGCTATCACACACTTTGGGGATTCTGTGTTGGTGGCT 444
Query 5520 TCGTGTGCCTTCCTTCTTGAGCTTTGTGGTTTATCTGCTAGCATGCTTCGGATAGACGTT 5579
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCGTGTGCCTTCCTTCTTGAGCTTTGTGGTTTATCTGCCAGCATGCTTCGGATAGACGTG 504
Query 5580 GCATCCTTGAGAAGAATATCATCCTTCTATAAATCAAATGGTAATGCGGATATGGCACAT 5639
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 505 GCATCCTTGAGAAGAATATCATCCTTCTATAAATCAAATGATAATGCGGATATGGCACAA 564
Query 5640 CAGAAATCGCTGAAGCGCTCAATGTTTCATAGTGTATCTAGTGAAGATGATCTAATGGGG 5699
|| |||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 565 CAAAAATCGCTTAAGGGCTCTATGTTTCATAGGGTATCTAGTGAAGATGATCTAATGGGG 624
Query 5700 TCACTAGCTAGGGCCCTTGCTAACGAATACGCTTATCCTGATATTTCAAGTGTCCCTAAG 5759
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 625 TCACTAGCTAGGGCCCTTGCTAACGAATACGCTTATCCTGATATCTCAAGTGTCTCTAAG 684
Query 5760 CAAAAACAGAATCCAA---GTATTTCTGGTAGTCAACCCGGTCTTCCGCTAATGCTTGTT 5816
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 685 CAAAAACAGAATCCAAACAGTATTTCTGGTACTCAACCTGGTCTTCCGCTAATGCTTGTT 744
Query 5817 CTTCATCATTTGGAACAAGCTAGTCTTCCAGAGATTGGAGTAGGTAGAAAAACAAGTGGA 5876
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 745 CTTCATCATCTGGAACAAGCTAGTCTTCCAGAGATTGGAGTAGATAGAAAAACAAGTGGA 804
Query 5877 TACTGGCTGTTAACAGGTGATGGTGATGGGTCTGAACTGCGGTCTCAACAGACATCTGCT 5936
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 TACTGGCTGTTAACAGGTGATGGTGATGGGTCTGAACTGCGGTCTCAACAGACATCTGCT 864
Query 5937 AGCTTGCATTGGAGTTTAGTTACTCTTTTTTGTCAGATGCATAAGATTCCTCTGAGCACC 5996
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 865 AGCTTGCATTGGAGTTTAGTTACGCTTTTTTGTCAGATGCATAAGATTCCTCTGAGCACC 924
Query 5997 AAATATCTTGCCATGCTAGCAAGAGACAATGATTGGG 6033
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 925 AAATATCTTGCCATGCTAGCAAGAGACAATGATTGGG 961
> Ahg888149 jgi|Araly1|888149|Al_scaffold_0007_135
Length=2313
Score = 3493 bits (1891), Expect = 0.0
Identities = 2173/2307 (94%), Gaps = 27/2307 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 243 ATGGAAAAGTTGGTGAAGGAAGGCCCAACTCTGCTGCAACTGCACAAGTGGGAACCTTCT 302
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAAAAGTTGGTGAATGAAGGCCCAACTCTGCTGCAATTGCACAAGTGGGAACCTTCT 60
Query 303 CAATTTCAACTCAAGCTATCAGAATTTCGCGAGGCGTTTATTTCTCCGTCGAGGCAGTTG 362
||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CAATTGCAACTGAAGCTCTCAGAATTTCGTGAGGCGTTTATTTCTCCGTCGAGGCAGTTG 120
Query 363 TTATTACTACTCTCTTACCACTCCGAAGCTTTACTGCTTCCTTTGGTTGCAGGGAGGTCC 422
||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CTATTACTACTCTCGTACCACTCCCAAGCTTTGCTGCTTCCTTTGGTTGCAGGGAGGTCC 180
Query 423 ATTGGCAGTGAGGTTTCGTTAAG-TGGTGATAATGAAGAGTTGAATAGTCCTTCATGCTC 481
|||||||||||||||||| |||| | || ||| ||||||| |||||||||| ||| |||
Sbjct 181 ATTGGCAGTGAGGTTTCGGTAAGCT-GTCATAGTGAAGAGCCGAATAGTCCTACATTCTC 239
Query 482 TGGTGGGTCAGATCCAGAGAAAATTGAATCTCCTTGTGGATCAGGAGTTGGTTCTGGTGA 541
||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 240 TGGTGGGTCAGATCC------------A---CCTTCTGGATCAGGTGTTGGTTCTGGTGA 284
Query 542 GCCTGGTTTTGTAGATAATTGCAGTTCTAGTTGCAATAGTTTCCCTTTTATCTTTGATGC 601
||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 GCCAGGTTTTGTAGATAATTTCAGTTCTAGTTGCAATAGTTTCCCTTTTATCTTTGATGT 344
Query 602 AAAGTCTGTTGCTTGGGGTAGTTGTGGGGATACTTACAATCGGCACAAAGATCCTTTGTT 661
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 345 AAAGTCTGTTGCTTGGGGTAGTTGTGGAGATACTTACAATCGGCACAAAGATCCTTTGTT 404
Query 662 TAGGGAATTGTTGTTTGTATCTGGAAATCATGGTGTTACGGTCCACGCTTTTTGCTGTAC 721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 405 TAGGGAATTGTTGTTTGTATCTGGAAATCATGGTGTTACGGTCCATGCTTTTTGCTGTAC 464
Query 722 AAAAGATTTAAGTGACAAAGCCAAAGGCAAACCAAATGGTGAGCTGAGGCATGGGGAGTG 781
|||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 465 AAAAGATTCAAGTGACAGAGCCAAAGACAAACCTAATGGTGAGCTGAGGCATGGGGAGTG 524
Query 782 GGTTGAGTGGGGACCTTCTAGGCTTAGTCAGAAATCAGAACCGGAAAGAGTCTCTTCTTC 841
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 525 GGTTGAATGGGGACCTTCTAGGCTTAATCAGAAATCAGAACATGAAAGAGTCTCTTCTTT 584
Query 842 TGATGGCTCAAAGCAGTGGATGCAATCTTTTTTGATTGATTTGGAAACTACTGTAATTGA 901
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 585 TGATGGCGCAAAGCAGTGGATGCAATCTTTTTTGATTGATTTGGAAACTACTGAAATTGA 644
Query 902 TGGTACAAGACAGTCGAGGTTCCCTGAGAAGTCAGCGTTTCCGGGTTCTGCAGAGGTTGT 961
|||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 645 GGGTATAAGACAGTCAAGGTTCCCTGAGAAGTCAGCGTTTCCTGCTTCTGCAGAGGTTGT 704
Query 962 TTCATTCAGCATATTAAATACTGATTTACCTTTCTCGAATCTTCTTTTCCAAGACAACTC 1021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 TTCATTCAGCATATTAAATACTGATTTACCTTTCTCGAATCTTCTTTTCCAAGACAACTC 764
Query 1022 CATACTTCCGAAGGATAATATGCCTGAGGATGGTAATGTAAATGACAATAATTTTCTCGT 1081
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 765 CATACTTCAGAAGGATAATATGCCTGAGGATGGTAATGTAAATGACAATAATTTTCTCGT 824
Query 1082 AGCATCTGATCCAACTGCTTTGGATGAAAAATCTCGAGCTGATATGCCCGTAAACAATGT 1141
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 825 AGCATCAGATCCAGCTGCTTTGGATGAAAAATCTCGAGCTGATATGCCCATAAACAATGC 884
Query 1142 CAGTGTAAACAGTTTGTACAGGTGCATCAAAGTTTTCTCCAGCGATGCTCATTCTCTGAT 1201
|||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 885 CAGTGTAAGCAGCTTGTACAGGTGCATCAAAGTTTTCTCCAGCGATTCTCATTCTCTGAT 944
Query 1202 TGGATTTGTTATGGAGTTATCGGATTGTGCATCTACGCCTAGAAGGAATGAAAACGAAAG 1261
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 945 TGGATTTGTTATGGAGTTATCGGATTGTGCATCTACCCCTACAAGCAATGAAAACGAAAG 1004
Query 1262 AAGCAAGGGTAAGAGAAATATCTTTGTTGCCAAGCTGTTTAGCTGGGGGATAGAATGGGT 1321
||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005 AAGCAAGGGTAAGAGAATTGTCTTTGTTGCCAAGCTGTTTAGCTGGGGGATAGAATGGGC 1064
Query 1322 CTCCCTTGTGAAGTTTGGTGAGTCAAGTATTGGACCTACAAATGAGTGGGCAGATTTCCG 1381
||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065 CTCCCTTGTGAAGTTCGGGGAATCAAGTATTGGACCTACAAATGAGTGGGCAGATTTCCG 1124
Query 1382 GCTATCCGATAACTTTGTTATCTGCCTCAGTGTTTCTGGTTTGATCTTTCTATATGATGT 1441
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1125 GCTATCTGATAAATTTGTTATCTGCCTCAGTGTTTCTGGTTTGATCTTTCTATATGATGT 1184
Query 1442 GAATTCTGGGGATTTTATTTCTCATGGGGATATCTTACAGACATGCGGTCGTGGATTGCA 1501
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1185 GAATTCTGGGGATTTTATTTCTCATGGGGATATCTTACAGACATGCAGTCGTGGATTGCA 1244
Query 1502 TTCTTCATCAGATAGGCAAGAAGCAACTGCAGAAGCAGATCAGCTAAGTGACTTTCAAAA 1561
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||
Sbjct 1245 TTCTTCATCAGATATGCAAGAAGCAACTGCAGAAGTAGATCAGCGAAGTAACTTTCAAAA 1304
Query 1562 TCGTGCTCCATCCATGTCTAAGACTTGTATTGTTGGTTCCACGGACAGAAGAAAGTTTAG 1621
||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||
Sbjct 1305 TCGTGTTCCATCCATGTCTAAGACTTGCATTGTTGGTTCCGCAGACAGAAGAAAGTTTAG 1364
Query 1622 AAAGCTTATTGTAGCTTCTCATACACCACTCATAGCTGCAGTTGACGAAAATGGTTTGGT 1681
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1365 AAAGCTTATCGTAGCTTCTCATACACCACTCATAGCTGCAGTTGACGAAAATGGTTTGGT 1424
Query 1682 ATATGTATTATGTGTCAATGACTTTGTTTCCAAGGAATACCACATGGCCGCGGAACCTAT 1741
|||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 1425 ATATGTATCATGTGTTGATGACTTTGTTTCCAAGGAATACCACATGTCCGTGGAACCTAT 1484
Query 1742 TCCTGATTTACTTCATCTTGGGCTTGGAAGTCTGGTTGGGTGGAAAATCGGCGGCATGGA 1801
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485 TCCTGATTTACGTCATCTTGGGCTTGGAAGTCTGGTTGGGTGGAAAATCGGCGGCATGGA 1544
Query 1802 CATTGGCCAGAAAAAAGTGCACCACCCTAGTTCCTCTGGGTCTCGAGGTGAAGATGCTTT 1861
| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1545 CGTTGGCCAGAAAAAAGTGCACCATCCTAGCTCCTCTGGCTCTCGAGGTGAAGATGCTTT 1604
Query 1862 TTCCAGGCGTGATCTTAGCTTTTCTGCTTCGGAAATCTCGATGTCTGACCCATGTTTGGA 1921
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1605 TTCCAGGTGTGATCCTAGCTTTTCTGCTTCGGAAATCTCGATATCTGACCCATGTTTGGA 1664
Query 1922 AAGACAACAGAACAATTTTGATCGAAGAGCTGGTTACTCTGGTTCATGGTTGAGTGGTTT 1981
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1665 AAGAAAACATAACAATTTTGATCGAAGAGCTGGTTACTCTGGTTCATGGTTGAGTGGTTT 1724
Query 1982 TTCTGCACAGCCTAAAACAAATGGGCTGAAACTTGAAAAATTTC-GAAGAGACTCGCATG 2040
||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 1725 TTCTGTTCAGCCTAAAACGAATTTGCTGAGACTTGAAAA-TTTCCGAAGAGACTCGCATG 1783
Query 2041 TCACGCGGAAGATGTTTCTATCCGCCGAAAAATTAGGATTGGATGATAACATATGTTTTT 2100
||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1784 TCATGCGGAAGATGTTTCTATCCACTGAAAAATTAGGATTGGATGATAACATATGTTTTT 1843
Query 2101 CTCCATATGG-ATTCACTCATTTCTCTAGAAAGTATACAAATAAGGATGATCGAAGCTGT 2159
|||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1844 CTCCAT-TGGGATTTACTCATTTCTCTAGAAAGTATACAAATAAGGACGATCGAAGCTGT 1902
Query 2160 AAGATTTTTCATTATAGTCTGCAGACGCATATGACTGCGAGAGATGATAGTTATTTGAAT 2219
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1903 AAGATTTTTCATTATAGTCTGCAGACGCATATGACTACGAGAGATGATAGTTATTTGAAT 1962
Query 2220 TACGATGTCAACAA-GAATTCTATTCAAGGTGCAGAGGAGAATTTCATAGGAGAATCAGT 2278
||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1963 TACAATGTCAACAATGA-TTCTATTCAAGGTGCAGAAGAGAGTTTCATAGGAGAATCAGT 2021
Query 2279 TGGTTGCTCTTTCCAAGGATTTCtttttttGGTGACTTGT-GATGGTCTTTCGGTTTTTC 2337
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||
Sbjct 2022 TGGTTGCTCTTTCCAAGGATTTCTTTATTTGGTGACTTGTAG-TGGTCTTTCAGTTTTTC 2080
Query 2338 TCCCTTCTATCTCAATAACCTCAAATTACCCAACTATTGAGGCCATTGAATATCTGCAGC 2397
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081 TCCCTTCTATCTCAATAACCTCAAATTACCCAACTGTTGAGGCCATTGAATATCTGCAGC 2140
Query 2398 CATTCCAGACCACTGTCATGGGATACCGGGGAAGAGACGATTTG-GCAGCAGGGGAATCA 2456
|| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 2141 CACTCCAGACCACTGTCATGGGATACCAGGAAAGAGACGATTTGAG-AGCAGGGGAATCA 2199
Query 2457 CGTTTTCCTTGGCAAGTTGAGGTCATAGATAGAGTTATCTTGTTTGAAGGCCCTGAAGTT 2516
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2200 CGTTTTCCTTGGCAAGTTGAGGTCATAGATAGAGTTATCTTGTTTGAAGGCCCTGAAGTA 2259
Query 2517 GCAGATCATTTATGCTTGGAAAATGGT 2543
||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2260 GCAGATCATGTATGCTTGGAAAATGGT 2286
> Ahg943920 jgi|Araly1|943920|scaffold_700149.1
Length=2558
Score = 2202 bits (1192), Expect = 0.0
Identities = 1293/1341 (96%), Gaps = 9/1341 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3760 AGCATCTCAAGATTGAGTGTGGTGAGGTTGATGGTGTTGTTCTAGGTTCTTGGACTAAAA 3819
||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033 AGCATCTCAAGCTTGATTGTGGTGAGGTTGATGGTGTTGTTCTAGGTTCTTGGACTAAAA 1092
Query 3820 TCAATGAGAGTGCATCTGAGCATGCACCTGATGAAACCGATGCAGTTGCTGGCTACTGGG 3879
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093 TCAATGAGAGTGCATCTGAGCATGCGCCTGATGAAACCGATGCAGTTGCTGGCTACTGGG 1152
Query 3880 CTGCAGCAGCTGTGTGGTCAAATGCTTGGGATCAGAGAACATTTGATCATATAGTCTTGG 3939
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153 CTGCAGCAGCCGTGTGGTCAAATGCTTGGGATCAGAGAACATTTGATCATATAGTCTTGG 1212
Query 3940 ATCAGCCCTTAGTCATGGGTGTTCATGTTCCATGGGATTCTCAGCTGGAGTATTATATGT 3999
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213 ATCAACCCTTAGTCATGGGTGTTCATGTTCCATGGGATTCTCAGCTGGAGTATTATATGT 1272
Query 4000 GTCACAATGACTGGGATGAAGTTCTTAAGCTGTTGGATCTCATTCCTGAGGATGTTTTAT 4059
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1273 GTCACAATGATTGGGATGAAGTCCTTAAGCTGTTGGATCTCATTCCTGAGGATGTTTTAT 1332
Query 4060 ATGATGGAAGTTTGCAAATTGCTTTGGATGGTCCGAAACAGTCTTCTGGCGTAAATTATT 4119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATGATGGAAGTTTGCAAATTGCTTTGGATGGTCCGAAACAGTCTTCTGGCGTAAATTATT 1392
Query 4120 CAGTTTCTTCCCGTAGCGAGTATATATGCTCCATCGAAGAAGTGGATGCTGTACTTATGG 4179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1393 CAGTTTCTTCCCGTAGCGAGTATATATGCTCCATCGAAGAAGTGGATGCTGTACTTATGG 1452
Query 4180 ATGTTCCTTATATCAAGATATTTAGATTGCCTGGAGATATCCGGTGCTCCTTGTGGCTAA 4239
|||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1453 ATGTTCCTTATATCAAGATATTTAGATTACCTGCAGATATTCGGTGCTCCTTGTGGCTAA 1512
Query 4240 CAACACTCATGGAGCAGGAACTAGCAAGAAAACTTATATTTTTAAAAGAATATTGGGAAA 4299
|| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1513 CAGCACTCATGGAGCAGGAACTTGCAAGAAAACTTATATTCTTAAAAGAATATTGGGAAA 1572
Query 4300 ACGCTCTAGATGTAGTATATCTTCTGGCCCGGGCAGGTGTCATCCTTGGTAATTGTGAAG 4359
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 1573 ACGCTCTAGATGTAGTATATCTTCTGGCTCGGGCAGGTGTTATCCTTAGTAATTGTGAAG 1632
Query 4360 TTTCATTTAAGGAGGAAACTTGTACGCCATCGTTAGATCTTTGTTTGTCCATAAAGAAGG 4419
|||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633 TTTCATTTAAGGAGGAAACTTGTAGGCCATCCTTAGATCTTTGTTTGTCCATAAAGAAGG 1692
Query 4420 GAGGAGCAAATGTTGATACCCTGAATGCTGTACACAAGCTATTCATACATTACTGCACAC 4479
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1693 GAGGGGCAAATGTTGATACCCTGAGTGCTGTACACAAGCTATTCATACATTATTGCACAC 1752
Query 4480 AGTATAATCTGCCAAACCTTCTGGATCTGTACCTTGATCATCACGAATTGGTCCTAGATA 4539
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1753 AATATAATCTGCCAAACCTTCTGGATCTGTACCTTGATCATCACGAATTGGTCCTAGATA 1812
Query 4540 ATGATTCACTCAGTTCATTGCAGGAAGCTGTGGGTGATTCTCACTGGGCAAAATGGTTGC 4599
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1813 ATGATTCACTCAGTGCATTGCAGGAAGCTGTTGGTGATTCTCACTGGGCAAAATGGTTGC 1872
Query 4600 TACTCTCCAGGATCAAGGGCCGGGAGTATGATGCTTCATTTTCAAACGCACGCTCAATTA 4659
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1873 TACTCTCCAGGATCAAGGGCCGGGAGTATGATGCTTCATTTTCAAATGCACGCTCAATTA 1932
Query 4660 TGTCACGTAACGGGGCACCAAATAGTGAACCCAGTGTTCCAGAGATTGATGAAATGGTTT 4719
||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
Sbjct 1933 TGTCACGTAGTGGGGCACCAAATGGTGAACCCAGTGTTCCAGAGACTGATGAAATTGTTT 1992
Query 4720 GTACTGTTGATGACATTGCCGATGGGGCAGGAGAAATGGCAGCTTTAGCAACTATGATGT 4779
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1993 GTACTGTTGATGATATTGCCGAAGGGGCAGGAGAAATGGCAGCTTTAGCAACTATGATGT 2052
Query 4780 GTGCTCCAGTGCCAATTCAAAAATCCTTGAGTACTGGCAGTGTGAACAGGCACACTAACT 4839
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2053 GTGCTCCGGTGCCAATTCAAAAATCCTTGAGTACTGGCAGTGTGAACAGGCACACTAACT 2112
Query 4840 CTTCTGCGCAGTGCACTTTGGAGAATTTGAGATCATTTCTTCAGAGATTCCCTACCTTAT 4899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2113 CTTCTGCGCAGTGCACTTTGGAGAATTTGAGATCATTTCTTCAGAGATTCCCTACCTTAT 2172
Query 4900 GGAGTAAGCTTGTTAGTGCTTGTCTTGGGGAAGATATATCCGGGAACCTTTTGCGGACCA 4959
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2173 GGAGTAAGCTTGTTACTGCTTGTCTTGGGGAAGATATATCTGGGAACCTTTTGCGGACCA 2232
Query 4960 AGACTAAGAATGTCTTGTCAGAGTATTTGAATTGGCGTGACGGTGTATTCTTCTCAACGG 5019
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2233 AGACTAAGAATG-------AG--TATTTGAATTGGCGTGACGGTGTATTCTTTTCAACTG 2283
Query 5020 CACGTGATACCTCACTCCTCCAGATGTTGCCTTGTTGGTTTCCTAAGGCGGTTCGTAGAT 5079
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2284 CACGTGATACCTCACTCCTGCAGATGTTGCCTTGTTGGTTTCCTAAGGCGGTTCGTAGAT 2343
Query 5080 TAGTTCAGCTTTATATTCAGG 5100
|||||||||||||||| ||||
Sbjct 2344 TAGTTCAGCTTTATATCCAGG 2364
Score = 1653 bits (895), Expect = 0.0
Identities = 983/1025 (96%), Gaps = 8/1025 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2618 GTCTTTGAAGATGCTTGGTAATGTGAAGCTGGCAGAGGAAGGCATGCTGAGGGTGCTCTT 2677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 11 GTCTTTGAAGATGCTTGGTAATGTGAAGCTGGCAGAGGAAGGCATGCTGAGGGTGCTCTT 70
Query 2678 TTCTGCTGTGTATCTATTGTCGCGCAAGGATAGAAACGATAATGAGATTTCTGCTGTATC 2737
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 71 TTCTGCTGTGTATCTATTGTCGCACAAGAATAGAAACGATAATCAGATTTCTGCTGTATC 130
Query 2738 TAGGCTCCTTGGATTGGCTACAATGTTTGCGACTGAGATGATTCGCAGATATGGGTTACT 2797
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 131 TAGGCTCCTTGGATTGGCTACAAGGTTTGCGACTGAGATGATTCGCATATATGGGTTACT 190
Query 2798 TGAATATCGGAAAGATGTTTACATGTTTGACAGCAAACCTAGGACACAGATACTTTCACT 2857
|||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 191 TGAATATCAGAAAGATGGATACATGTTGGACAGCAAACCTAGGACACAAATACTTTCACT 250
Query 2858 TCCAGCAGTTTCACTTAATATCGATGTAATGGAAAATTCAAGGAGGCTGTCAGAGATGGG 2917
|||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 251 TCCACCAGTTTCACTTCATATTGATGTAATGGAAAATTCAAGGAGGTTGTCAGAGATGGG 310
Query 2918 TTATCTATTGGAAATCACCAGGAATATTCAATCCCGTATTACCAGAAAGTTTAAGAAGCT 2977
|||||| || || |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 311 TTATCTTTTAGAGATCACCCGAAATTTTCAATCCCGTATTACCAGAAAGTTTAAGAAGCT 370
Query 2978 AGGAAAGGGAAATAATGAGAAGTCACTGAACCTGGTAGACCCAAATTCTTTGCAGGATGA 3037
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGAAAGGGAAAGAATGAAAAGTCACTGAACCTGGTAGACCCAAATTCTTTGCAGGATGA 430
Query 3038 TTCTCAGCTTGAAATTGTTCCAGATCCAGCATCTGCAGAGTCAAGACAACTTGACACTTC 3097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 431 TTCTCAGCTTGAAATTGTTCCAGATCCAGCATCTGCAGAGTCAAGACAACTTGACACGTC 490
Query 3098 TTTATTTGATACCAATGAGGAGCTTGCTTTGACGCCTATGGGTATGATGACAGC------ 3151
|||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491 TTTATTCGATACCAATGGGGAGCTTGCTTTGACGCCTATGGGTATGATGACAGCCAAAGC 550
Query 3152 TGGTCAAATCATTGACGAAAGAAGTTATGCATCTGGCCTTGTACCCCAAG-GGATAGTTG 3210
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 551 TGGTCAAATCATTGGCGAAAGAAGTTATGCATCTGGCCTTGTACCCCAAGTGG-TAGTTG 609
Query 3211 AAGAAAAGAAAGTTCTTCCTCTGGAAAATCCCAAGGAGATGATGGCTCGTTGGAAGGCTA 3270
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610 AAGAGAAGAAAGTTCTTCCTCTGGAAAATCCCAAGGAGATGATGGCTCGTTGGAAGGCTA 669
Query 3271 ACAATTTGGATTTAAAAACTGTGGTTAAGGATGCCTTGCTCTCTGGTCGACTCCCTTTAG 3330
||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 670 ACAATCTGGATTTGAAAACTGTGGTTAAGGATGCCTTGCTCTCTGGTCGACTCCCTTTAG 729
Query 3331 CTGTTCTTCAATTGCATCTTCAACATTCTAAAGACGTGGTTGAAGATGGAGAGCATCATG 3390
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 730 CTGTTCTCCAATTGCATCTTCAACATTCAAAAGACGTGGTTGAAGATGGAGAGCATCATG 789
Query 3391 ATACATTTACTGAAGTTCGTGATATCGGAAGAGCTATTGCTTATGACCTATTTTTGAAGG 3450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 790 ATACATTTACTGAAGTTCGTGATATCGGAAGAGCTATTGCTTATGACCTATTTTTGAAGG 849
Query 3451 GTGAACCTGGGGTTGCCATTGCCACTCTGCAAAGGCTCGGAGAGGATGTAGAAGCATGTC 3510
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 850 GTGAACCTGGGGTTGCCATTGCGACTCTGCAAAGGCTCGGAGAGGATGTAGAAGCGTGTC 909
Query 3511 TCAATCAGTTGGTATTTGGCACAGTGAGAAGATCTCTTCGATATCAAATTGCTGAAGAAA 3570
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 910 TCAATCAGTTGGTATTTGGCACAGTGAGAAGATCTATTCGATATCAAATTGCTGAAGAAA 969
Query 3571 TGAGAAAACTTGGTTTCTTAAGACCATATGAAGACAATGTACTGGAGAGGATATCTCTTA 3630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 970 TGAGAAAACTTGGTTTCTTAAGACCATATGAAGACAATGTACTGGAGAGGATATCTCTTA 1029
Query 3631 TCGAG 3635
|||||
Sbjct 1030 TCGAG 1034
> Ahg490721 jgi|Araly1|490721|fgenesh2_kg.7__154__AT4G39430.1
Length=1216
Score = 1524 bits (825), Expect = 0.0
Identities = 973/1039 (94%), Gaps = 32/1039 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 2628 ATGCTTGGTAATGTGAAGCTGGCAGAGGAAGGCATGCTGAGGGTGCTCTTTTCTGCTGTG 2687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTTGGTAATGTGAAGCTGGCAGAGGAAGGCATGCTGAGGGTGCTCTTTTCTGCTGTG 60
Query 2688 TATCTATTGTCGCGCAAGGATAGAAACGATAATGAGATTTCTGCTGTATCTAGGCTCCTT 2747
||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 TATCTATTGTCGCACAAGAATAGAAACGATAATCAGATTTCTGCTGTATCTAGGCTCCTT 120
Query 2748 GGATTGGCTACAATGTTTGCGACTGAGATGATTCGCAGATATGGGTTACTTGAATATCGG 2807
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 121 GGATTGGCTACAAGGTTTGCGACTGAGATGATTCGCATATATGGGTTACTTGAATATCAG 180
Query 2808 AAAGATGTTTACATGTTTGACAGCAAACCTAGGACACAGATACTTTCACTTCCAGCAGTT 2867
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct 181 AAAGATGGATACATGTTGGACAGCAAACCTAGGACACAAATACTTTCACTTCCACCAGTT 240
Query 2868 TCACTTAATATCGATGTAATGGAAAATTCAAGGAGGCTGTCAGAGATGGGTTATCTATTG 2927
|||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 241 TCACTTCATATTGATGTAATGGAAAATTCAAGGAGGTTGTCAGAGATGGGTTATCTTTTA 300
Query 2928 GAAATCACCAGGAATATTCAATCCCGTATTACCAGAAAGTTTAAGAAGCT-----AGG-A 2981
|| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 301 GAGATCACCCGAAATTTTCAATCCCGTATTACCAGAAAGTTTAAGAAGCTAGGAAAGGTA 360
Query 2982 --A-A-G--------------GGAAATAATGAGAAGTCACTGAACCTGGTAGACCCAAAT 3023
| | | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTATATGATATTAATACTAATGGAAAGAATGAAAAGTCACTGAACCTGGTAGACCCAAAT 420
Query 3024 TCTTTGCAGGATGATTCTCAGCTTGAAATTGTTCCAGATCCAGCATCTGCAGAGTCAAGA 3083
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TCTTTGCAGGATGATTCTCAGCTTGAAATTGTTCCAGATCCAGCATCTGCAGAGTCAAGA 480
Query 3084 CAACTTGACACTTCTTTATTTGATACCAATGAGGAGCTTGCTTTGACGCCTATGGGTATG 3143
||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 CAACTTGACACGTCTTTATTCGATACCAATGGGGAGCTTGCTTTGACGCCTATGGGTATG 540
Query 3144 ATGACAGC------TGGTCAAATCATTGACGAAAGAAGTTATGCATCTGGCCTTGTACCC 3197
|||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 ATGACAGCCAAAGCTGGTCAAATCATTGGCGAAAGAAGTTATGCATCTGGCCTTGTACCC 600
Query 3198 CAAG-GGATAGTTGAAGAAAAGAAAGTTCTTCCTCTGGAAAATCCCAAGGAGATGATGGC 3256
|||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CAAGTGG-TAGTTGAAGAGAAGAAAGTTCTTCCTCTGGAAAATCCCAAGGAGATGATGGC 659
Query 3257 TCGTTGGAAGGCTAACAATTTGGATTTAAAAACTGTGGTTAAGGATGCCTTGCTCTCTGG 3316
||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TCGTTGGAAGGCTAACAATCTGGATTTGAAAACTGTGGTTAAGGATGCCTTGCTCTCTGG 719
Query 3317 TCGACTCCCTTTAGCTGTTCTTCAATTGCATCTTCAACATTCTAAAGACGTGGTTGAAGA 3376
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 720 TCGACTCCCTTTAGCTGTTCTCCAATTGCATCTTCAACATTCAAAAGACGTGGTTGAAGA 779
Query 3377 TGGAGAGCATCATGATACATTTACTGAAGTTCGTGATATCGGAAGAGCTATTGCTTATGA 3436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 TGGAGAGCATCATGATACATTTACTGAAGTTCGTGATATCGGAAGAGCTATTGCTTATGA 839
Query 3437 CCTATTTTTGAAGGGTGAACCTGGGGTTGCCATTGCCACTCTGCAAAGGCTCGGAGAGGA 3496
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 CCTATTTTTGAAGGGTGAACCTGGGGTTGCCATTGCGACTCTGCAAAGGCTCGGAGAGGA 899
Query 3497 TGTAGAAGCATGTCTCAATCAGTTGGTATTTGGCACAGTGAGAAGATCTCTTCGATATCA 3556
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 900 TGTAGAAGCGTGTCTCAATCAGTTGGTATTTGGCACAGTGAGAAGATCTATTCGATATCA 959
Query 3557 AATTGCTGAAGAAATGAGAAAACTTGGTTTCTTAAGACCATATGAAGACAATGTACTGGA 3616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 AATTGCTGAAGAAATGAGAAAACTTGGTTTCTTAAGACCATATGAAGACAATGTACTGGA 1019
Query 3617 GAGGATATCTCTTATCGAG 3635
|||||||||||||||||||
Sbjct 1020 GAGGATATCTCTTATCGAG 1038
Score = 292 bits (158), Expect = 3e-77
Identities = 166/170 (98%), Gaps = 0/170 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3760 AGCATCTCAAGATTGAGTGTGGTGAGGTTGATGGTGTTGTTCTAGGTTCTTGGACTAAAA 3819
||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGCATCTCAAGCTTGATTGTGGTGAGGTTGATGGTGTTGTTCTAGGTTCTTGGACTAAAA 1096
Query 3820 TCAATGAGAGTGCATCTGAGCATGCACCTGATGAAACCGATGCAGTTGCTGGCTACTGGG 3879
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097 TCAATGAGAGTGCATCTGAGCATGCGCCTGATGAAACCGATGCAGTTGCTGGCTACTGGG 1156
Query 3880 CTGCAGCAGCTGTGTGGTCAAATGCTTGGGATCAGAGAACATTTGATCAT 3929
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157 CTGCAGCAGCCGTGTGGTCAAATGCTTGGGATCAGAGAACATTTGATCAT 1206
> Ahg943918 jgi|Araly1|943918|scaffold_700147.1
Length=271
Score = 87.9 bits (47), Expect = 1e-15
Identities = 49/50 (98%), Gaps = 0/50 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1 GACGGAGGAAACCACCAATGATTTCTCCATCTCACGTCGTCAAATGTTTC 50
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50 GACGGAGGAAACCACCAACGATTTCTCCATCTCACGTCGTCAAATGTTTC 1
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 386371019061
Database: halleri_transcript_ahg.fa
Posted date: Sep 25, 2014 2:02 AM
Number of letters in database: 38,939,717
Number of sequences in database: 32,672
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5